AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014903.01


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MsG0380014903.01.T01 AT1G11300 27.474 768 443 25 1 727 79 773 4.47e-70 245
MsG0380014903.01.T01 AT1G11280 28.758 765 442 31 1 727 79 778 4.79e-70 245
MsG0380014903.01.T01 AT4G11900 29.271 796 430 30 1 730 83 811 5.96e-70 246
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MsG0380014903.01.T01 AT1G11280 27.937 766 435 29 1 727 89 776 1.38e-69 244
MsG0380014903.01.T01 AT5G35370 41.914 303 157 7 436 724 503 800 2.22e-69 244
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MsG0380014903.01.T01 AT1G68690 42.268 291 155 6 438 724 365 646 9.43e-64 226
MsG0380014903.01.T01 AT1G26150 43.493 292 151 6 438 724 418 700 1.46e-63 226
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MsG0380014903.01.T01 AT4G34440 41.946 298 158 7 438 730 300 587 7.48e-62 220
MsG0380014903.01.T01 AT1G61500 27.105 760 448 28 1 727 81 767 8.08e-62 222
MsG0380014903.01.T01 AT3G24540 38.012 342 191 8 398 727 124 456 9.91e-62 215
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MsG0380014903.01.T01 AT1G61430 26.623 770 438 29 1 727 52 737 2.28e-61 220
MsG0380014903.01.T01 AT1G61430 26.623 770 438 29 1 727 52 737 2.28e-61 220
MsG0380014903.01.T01 AT3G26940 41.391 302 153 8 438 727 62 351 2.77e-61 212
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MsG0380014903.01.T01 AT1G61360 28.553 767 418 31 13 727 2 690 8.71e-61 218
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MsG0380014903.01.T01 AT2G18470 41.584 303 160 7 432 727 264 556 9.26e-61 216
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MsG0380014903.01.T01 AT1G61430 27.632 684 386 25 1 645 75 688 5.30e-60 216
MsG0380014903.01.T01 AT1G54820 37.736 318 160 7 432 728 129 429 5.45e-60 209
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MsG0380014903.01.T01 AT1G17230 40.066 302 157 8 436 727 785 1072 1.87e-59 218
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MsG0380014903.01.T01 AT1G17230 40.066 302 157 8 436 727 785 1072 2.35e-59 218
MsG0380014903.01.T01 AT1G11410 28.178 763 463 30 1 724 50 766 2.35e-59 215
MsG0380014903.01.T01 AT1G11410 28.178 763 463 30 1 724 81 797 2.43e-59 216
MsG0380014903.01.T01 AT1G56120 38.040 347 188 9 396 732 636 965 2.60e-59 217
MsG0380014903.01.T01 AT1G56120 38.040 347 188 9 396 732 654 983 2.75e-59 217
MsG0380014903.01.T01 AT3G17420 40.924 303 155 7 438 731 142 429 3.31e-59 207
MsG0380014903.01.T01 AT1G61420 26.178 764 456 28 1 727 75 767 3.62e-59 214
MsG0380014903.01.T01 AT1G61420 26.178 764 456 28 1 727 75 767 3.62e-59 214
MsG0380014903.01.T01 AT2G13800 39.073 302 163 6 435 727 143 432 4.95e-59 207
MsG0380014903.01.T01 AT2G13800 39.073 302 163 6 435 727 143 432 4.95e-59 207
MsG0380014903.01.T01 AT5G45780 37.126 334 182 8 406 727 212 529 5.26e-59 210
MsG0380014903.01.T01 AT5G06740 34.667 375 225 8 364 727 241 606 5.34e-59 211
MsG0380014903.01.T01 AT4G21400 41.333 300 149 9 440 727 339 623 5.79e-59 212
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MsG0380014903.01.T01 AT1G79620 41.613 310 142 11 434 727 648 934 6.56e-56 207
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MsG0380014903.01.T01 AT1G06700 38.742 302 162 5 438 727 56 346 6.74e-56 196
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MsG0380014903.01.T01 AT2G30740 39.735 302 159 5 438 727 59 349 7.09e-56 196
MsG0380014903.01.T01 AT2G30740 39.735 302 159 5 438 727 59 349 7.09e-56 196
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MsG0380014903.01.T01 AT5G18610 39.867 301 156 8 438 727 71 357 1.08e-54 196
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MsG0380014903.01.T01 AT5G38240 38.272 324 184 9 403 724 272 581 2.32e-54 198
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MsG0380014903.01.T01 AT5G18500 39.414 307 155 10 438 732 154 441 2.49e-54 195
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MsG0380014903.01.T01 AT1G51890 38.065 310 173 6 422 727 272 566 3.14e-54 197
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MsG0380014903.01.T01 AT3G13690 38.411 302 165 9 436 730 397 684 3.25e-54 200
MsG0380014903.01.T01 AT5G38240 38.272 324 184 9 403 724 290 599 3.33e-54 198
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MsG0380014903.01.T01 AT1G61490 26.115 762 427 29 1 727 75 735 4.17e-54 200
MsG0380014903.01.T01 AT2G19210 39.073 302 155 8 436 727 564 846 4.41e-54 201
MsG0380014903.01.T01 AT4G23200 37.124 299 171 6 435 727 321 608 4.87e-54 197
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MsG0380014903.01.T01 AT2G07180 40.645 310 154 12 438 731 78 373 5.29e-54 192
MsG0380014903.01.T01 AT4G23230 37.374 297 168 6 437 727 324 608 5.61e-54 197
MsG0380014903.01.T01 AT2G01950 38.509 322 165 8 435 733 823 1134 5.68e-54 202
MsG0380014903.01.T01 AT1G52540 37.134 307 172 6 429 728 19 311 5.95e-54 190
MsG0380014903.01.T01 AT4G23240 37.013 308 169 7 430 727 315 607 6.25e-54 197
MsG0380014903.01.T01 AT4G23190 34.132 334 202 8 403 727 222 546 6.86e-54 196
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MsG0380014903.01.T01 AT5G10290 33.918 342 196 7 408 731 238 567 7.33e-54 196
MsG0380014903.01.T01 AT1G70520 40.717 307 157 8 438 732 313 606 8.51e-54 197
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MsG0380014903.01.T01 AT1G55610 38.487 304 157 10 435 724 844 1131 1.69e-53 200
MsG0380014903.01.T01 AT1G51890 38.065 310 173 6 422 727 480 774 1.72e-53 198
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MsG0380014903.01.T01 AT4G23320 35.714 308 173 7 430 727 163 455 3.27e-53 192
MsG0380014903.01.T01 AT1G51890 38.065 310 173 6 422 727 544 838 3.58e-53 198
MsG0380014903.01.T01 AT5G56790 39.073 302 163 9 436 730 376 663 3.78e-53 195
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MsG0380014903.01.T01 AT2G02800 35.938 320 166 12 429 727 62 363 4.27e-53 190
MsG0380014903.01.T01 AT2G18890 35.374 294 166 8 438 723 56 333 4.39e-53 187
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MsG0380014903.01.T01 AT1G34110 39.789 284 153 7 454 729 778 1051 5.39e-53 199
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MsG0380014903.01.T01 AT1G61370 26.622 601 346 19 164 727 79 621 6.54e-53 194
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MsG0380014903.01.T01 AT4G11470 36.455 299 169 7 437 727 331 616 1.07e-52 194
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MsG0380014903.01.T01 AT1G29750 36.812 345 189 10 395 727 625 952 2.11e-52 197
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MsG0380014903.01.T01 AT2G42960 38.235 306 165 8 438 734 171 461 3.17e-52 189
MsG0380014903.01.T01 AT2G42960 38.235 306 165 8 438 734 171 461 3.17e-52 189
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MsG0380014903.01.T01 AT2G47060 36.527 334 155 8 438 727 61 381 5.27e-52 186
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MsG0380014903.01.T01 AT1G78530 38.078 281 150 8 454 727 81 344 1.01e-51 184
MsG0380014903.01.T01 AT5G37450 37.829 304 156 9 436 727 617 899 1.06e-51 194
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MsG0380014903.01.T01 AT1G29720 37.705 305 170 7 430 727 651 942 1.12e-51 194
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MsG0380014903.01.T01 AT5G37450 37.829 304 156 9 436 727 641 923 1.17e-51 194
MsG0380014903.01.T01 AT1G66920 34.682 346 195 10 400 727 247 579 1.21e-51 190
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MsG0380014903.01.T01 AT3G62220 39.597 298 155 7 442 727 61 345 1.34e-51 184
MsG0380014903.01.T01 AT5G38210 39.672 305 157 9 433 727 343 630 1.39e-51 191
MsG0380014903.01.T01 AT2G19230 39.322 295 163 6 436 727 558 839 1.44e-51 194
MsG0380014903.01.T01 AT3G24240 37.168 339 176 11 415 732 746 1068 1.50e-51 194
MsG0380014903.01.T01 AT4G11480 36.808 307 165 7 437 727 308 601 1.58e-51 191
MsG0380014903.01.T01 AT3G55450 36.810 326 162 12 429 729 77 383 1.59e-51 185
MsG0380014903.01.T01 AT1G18390 38.658 313 163 9 433 733 327 622 1.61e-51 191
MsG0380014903.01.T01 AT5G38210 34.750 400 192 12 380 727 242 624 1.70e-51 191
MsG0380014903.01.T01 AT5G10520 36.977 311 172 9 428 731 131 424 1.78e-51 186
MsG0380014903.01.T01 AT1G73080 37.160 331 184 8 413 730 790 1109 1.81e-51 194
MsG0380014903.01.T01 AT4G00970 36.268 284 164 8 377 645 264 545 2.23e-51 188
MsG0380014903.01.T01 AT5G11020 32.181 376 208 12 382 728 54 411 2.32e-51 185
MsG0380014903.01.T01 AT2G43230 37.748 302 165 5 438 727 99 389 2.60e-51 184
MsG0380014903.01.T01 AT2G29000 36.842 323 180 8 414 727 527 834 2.65e-51 192
MsG0380014903.01.T01 AT5G11020 32.181 376 208 12 382 728 16 373 2.76e-51 184
MsG0380014903.01.T01 AT5G38210 34.750 400 192 12 380 727 260 642 2.80e-51 191
MsG0380014903.01.T01 AT1G51850 33.604 369 207 10 382 727 494 847 3.07e-51 192
MsG0380014903.01.T01 AT4G23210 36.610 295 169 5 437 727 347 627 3.09e-51 190
MsG0380014903.01.T01 AT1G51850 33.604 369 207 10 382 727 474 827 3.12e-51 192
MsG0380014903.01.T01 AT5G11020 32.181 376 208 12 382 728 20 377 3.16e-51 184
MsG0380014903.01.T01 AT5G48380 38.585 311 171 7 437 734 290 593 3.23e-51 189
MsG0380014903.01.T01 AT5G63710 36.545 301 171 7 435 727 239 527 3.41e-51 188
MsG0380014903.01.T01 AT5G63710 36.545 301 171 7 435 727 239 527 3.41e-51 188
MsG0380014903.01.T01 AT3G20530 42.975 242 122 7 438 670 70 304 3.70e-51 181
MsG0380014903.01.T01 AT2G43230 37.748 302 165 5 438 727 133 423 3.73e-51 185
MsG0380014903.01.T01 AT1G24030 41.423 239 128 6 438 667 50 285 3.78e-51 180
MsG0380014903.01.T01 AT1G66930 35.583 326 182 9 415 727 521 831 4.01e-51 192
MsG0380014903.01.T01 AT5G01560 34.320 338 194 9 405 731 316 636 4.36e-51 190
MsG0380014903.01.T01 AT4G00960 42.326 215 116 4 437 644 43 256 4.46e-51 179
MsG0380014903.01.T01 AT4G13190 44.215 242 118 7 436 668 57 290 5.33e-51 180
MsG0380014903.01.T01 AT1G18390 38.658 313 163 9 433 733 321 616 5.39e-51 189
MsG0380014903.01.T01 AT1G66910 36.278 317 184 9 417 727 314 618 5.88e-51 189
MsG0380014903.01.T01 AT5G63710 36.545 301 171 7 435 727 274 562 5.89e-51 188
MsG0380014903.01.T01 AT1G66910 36.278 317 184 9 417 727 317 621 6.55e-51 189
MsG0380014903.01.T01 AT5G63710 36.545 301 171 7 435 727 275 563 6.92e-51 188
MsG0380014903.01.T01 AT1G61590 37.417 302 165 8 438 727 87 376 7.57e-51 183
MsG0380014903.01.T01 AT4G20270 35.962 317 182 7 424 732 685 988 8.34e-51 192
MsG0380014903.01.T01 AT1G01540 43.182 220 115 4 436 648 140 356 9.02e-51 182
MsG0380014903.01.T01 AT2G41890 26.087 736 425 24 13 727 94 731 1.17e-50 189
MsG0380014903.01.T01 AT1G28440 33.908 348 195 8 400 727 627 959 1.24e-50 191
MsG0380014903.01.T01 AT1G61420 26.545 550 322 18 205 727 121 615 1.30e-50 188
MsG0380014903.01.T01 AT1G25390 34.783 414 218 17 349 727 168 564 1.31e-50 187
MsG0380014903.01.T01 AT1G25390 34.783 414 218 17 349 727 168 564 1.31e-50 187
MsG0380014903.01.T01 AT1G51910 34.853 373 207 10 372 727 486 839 1.45e-50 190
MsG0380014903.01.T01 AT5G38260 34.483 348 208 8 388 727 259 594 1.52e-50 187
MsG0380014903.01.T01 AT3G09830 38.188 309 165 9 432 725 66 363 1.57e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT3G09830 38.188 309 165 9 432 725 66 363 1.57e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT3G09830 38.188 309 165 9 432 725 66 363 1.57e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT1G07570 34.639 332 178 11 418 727 47 361 1.62e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT4G32000 35.621 306 177 7 430 728 151 443 1.71e-50 183
MsG0380014903.01.T01 AT1G67000 34.174 357 206 11 390 727 493 839 1.75e-50 190
MsG0380014903.01.T01 AT1G61490 27.193 570 339 21 179 727 97 611 1.75e-50 187
MsG0380014903.01.T01 AT2G05940 35.671 328 188 8 418 734 55 370 1.83e-50 183
MsG0380014903.01.T01 AT5G65710 35.942 345 188 11 410 727 648 986 1.90e-50 191
MsG0380014903.01.T01 AT1G07570 34.639 332 178 11 418 727 36 350 1.95e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT1G07570 34.639 332 178 11 418 727 36 350 1.95e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT1G07570 34.639 332 178 11 418 727 36 350 1.95e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT2G28930 35.000 320 171 10 429 727 48 351 2.08e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT1G51890 35.542 332 173 6 422 727 544 860 2.10e-50 190
MsG0380014903.01.T01 AT2G28930 35.000 320 171 10 429 727 51 354 2.21e-50 182
MsG0380014903.01.T01 AT2G04300 36.824 296 169 6 436 727 529 810 2.26e-50 189
MsG0380014903.01.T01 AT5G11020 35.906 298 165 9 440 728 70 350 2.43e-50 181
MsG0380014903.01.T01 AT4G29180 35.463 313 176 6 430 727 549 850 2.48e-50 190
MsG0380014903.01.T01 AT1G35710 33.425 365 200 11 379 723 774 1115 2.52e-50 191
MsG0380014903.01.T01 AT4G29180 35.463 313 176 6 430 727 546 847 2.59e-50 190

Find 151 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 181 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCATAATTTGATCCCAATTT+AGG 0.072784 3:+62223996 None:intergenic
ACAAATTGTTGACCCTAAAT+TGG 0.139576 3:-62224009 MsG0380014903.01.T01:CDS
CCGAAAATTCAGTTACTTAA+TGG 0.165041 3:-62225079 MsG0380014903.01.T01:CDS
CAACCTAAGGTAGCGGATTT+TGG 0.171275 3:-62224311 MsG0380014903.01.T01:CDS
ACCGGTTGTTGGACTCTTTC+CGG 0.201990 3:+62224130 None:intergenic
CTTTGGTTTGCAGGTGGTTT+AGG 0.227848 3:-62224878 MsG0380014903.01.T01:CDS
CGAGAGTTTCTAGCATTTAT+TGG 0.229117 3:-62225687 MsG0380014903.01.T01:CDS
CTGAATATGGTGGTGTTTAT+TGG 0.247863 3:-62225108 MsG0380014903.01.T01:CDS
GAACAGGGTTGGTTTGTTTC+GGG 0.251780 3:-62225454 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAGTTGTTGAGAGGCTATTA+AGG 0.260515 3:-62223893 MsG0380014903.01.T01:CDS
ATGAACTTGATTGGGGTAAA+AGG 0.262108 3:-62224448 MsG0380014903.01.T01:CDS
CATAATTTGATCCCAATTTA+GGG 0.274308 3:+62223997 None:intergenic
ACTCTTCTTTATCTTTGATT+TGG 0.279220 3:+62224105 None:intergenic
TGCCGGAGGAACTGTGTATA+AGG 0.287161 3:-62224687 MsG0380014903.01.T01:CDS
GGAACAGGGTTGGTTTGTTT+CGG 0.289377 3:-62225455 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAGTTCATGCTTTGGTTTGC+AGG 0.298193 3:-62224887 MsG0380014903.01.T01:CDS
GTTTATGAGTACATGGAAAA+TGG 0.314533 3:-62224497 MsG0380014903.01.T01:CDS
CTACAAGAAAGTTCAAAATT+TGG 0.314554 3:+62225286 None:intergenic
TGCATGTTGAAAACCCATTC+AGG 0.318538 3:+62224209 None:intergenic
CTTGTCTACCTGGTTATGTT+TGG 0.325014 3:-62225342 MsG0380014903.01.T01:CDS
CTCATCAAATGAACTTGATT+GGG 0.328362 3:-62224456 MsG0380014903.01.T01:CDS
TAGTAGAAAAGATGAGGAAC+AGG 0.338717 3:-62225470 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCTCATCAAATGAACTTGAT+TGG 0.341008 3:-62224457 MsG0380014903.01.T01:CDS
CGAGGTTCGTGAACCTCGTT+AGG 0.347197 3:+62225800 None:intergenic
AACTTTGGCAAATGTTGCTT+TGG 0.360789 3:-62223958 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTTAGGAGGAGTAGAGCTTT+TGG 0.368076 3:-62224861 MsG0380014903.01.T01:CDS
GATTATGTTCTAGCAGCAAC+AGG 0.372808 3:-62224779 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTCTAGCAGCAACAGGGTTT+AGG 0.373359 3:-62224772 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGAGGTTGGTAACATGGGTT+AGG 0.376226 3:-62224073 MsG0380014903.01.T01:CDS
GTCGGTTAAGACGAGGTTGC+CGG 0.376524 3:+62225999 None:intergenic
TTTATCTTTGATTTGGATAC+CGG 0.376716 3:+62224112 None:intergenic
GTTCATTGAAGTTCATGCTT+TGG 0.379372 3:-62224895 MsG0380014903.01.T01:CDS
CTTGCCGAAGTTAGCATCAT+TGG 0.379685 3:-62224587 MsG0380014903.01.T01:CDS
GCATTTATTGGCCGGATCCT+TGG 0.383116 3:-62225675 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAGGATTAGAAGTTGGTTGC+TGG 0.391650 3:-62224037 MsG0380014903.01.T01:CDS
CAAATTGTTGACCCTAAATT+GGG 0.405145 3:-62224008 MsG0380014903.01.T01:CDS
CGCTACCTTAGGTTGGTAAT+CGG 0.406583 3:+62224319 None:intergenic
TCATTACTACAAGTACTATT+AGG 0.411232 3:+62225388 None:intergenic
GTTTGTCCAAGCTATTGAAC+AGG 0.412054 3:-62224289 MsG0380014903.01.T01:CDS
GAACTACTATTACATGAAAC+AGG 0.416373 3:-62225925 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGAAGAAAAGGATTAGAAGT+TGG 0.417223 3:-62224044 MsG0380014903.01.T01:CDS
AATCGTGACCAACCGGTTAA+CGG 0.419948 3:-62226051 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGGTTACATGGCACCTGAAT+GGG 0.422465 3:-62224222 MsG0380014903.01.T01:CDS
GTCATCCCTGTTCAATAGCT+TGG 0.425706 3:+62224283 None:intergenic
GGGATGAGCAAAATTATTGA+TGG 0.429072 3:-62223872 None:intergenic
TCGTGAACCTCGTTAGGGTT+TGG 0.433525 3:+62225806 None:intergenic
TCGAGAAATTTGAATTATCA+AGG 0.442760 3:+62224261 None:intergenic
TTGATTTGGATACCGGTTGT+TGG 0.442785 3:+62224119 None:intergenic
ACACTTTCCCTTCTCAAAAC+CGG 0.443979 3:-62226018 MsG0380014903.01.T01:CDS
ACGCAGCTCAGTCCATTGTT+TGG 0.445774 3:-62225978 MsG0380014903.01.T01:CDS
ATCGCGTCGTTGGATTCATT+TGG 0.448182 3:-62225595 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGTTGTTGAGAGGCTATTAA+GGG 0.455177 3:-62223892 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGAGTTGTGTCATGAGAGGT+TGG 0.457394 3:-62224087 MsG0380014903.01.T01:CDS
TAAAAGGTATAACATTGCTA+TGG 0.457467 3:-62224432 MsG0380014903.01.T01:CDS
TGTAAAGAAGATGGAAACTT+TGG 0.461740 3:-62223973 MsG0380014903.01.T01:CDS
CATGCAAATCACTTCAAAAG+TGG 0.467160 3:-62224192 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGGATTAGAAGTTGGTTGCT+GGG 0.471435 3:-62224036 MsG0380014903.01.T01:CDS
TGCTAGAAACTCTCGGTCCT+TGG 0.473935 3:+62225695 None:intergenic
GATGGCAAATCGTGACCAAC+CGG 0.476846 3:-62226058 MsG0380014903.01.T01:CDS
CAAGAGATCGGAAGAGGTGC+CGG 0.480587 3:-62224704 MsG0380014903.01.T01:CDS
GAGGTTACATGGCACCTGAA+TGG 0.482383 3:-62224223 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAACCAAAATCCGCTACCTT+AGG 0.483013 3:+62224308 None:intergenic
AGAGGGAAAACACAGATTGT+TGG 0.483229 3:-62224519 MsG0380014903.01.T01:CDS
GTGGTGTTGGAGATGATTAC+CGG 0.490359 3:-62224149 MsG0380014903.01.T01:CDS
ATTGCTATGGGAACTGCAAA+GGG 0.491186 3:-62224419 MsG0380014903.01.T01:CDS
AACCTCGTTAGGGTTTGGTC+TGG 0.493131 3:+62225811 None:intergenic
GTTAGGGAGAAAAGAAGAAA+AGG 0.496929 3:-62224056 MsG0380014903.01.T01:CDS
GCCGGAGGAACTGTGTATAA+GGG 0.497337 3:-62224686 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAATTATGATGTAAAGAAGA+TGG 0.500989 3:-62223982 MsG0380014903.01.T01:CDS
CATGAATTTGATCGGAATGT+GGG 0.501763 3:-62224552 MsG0380014903.01.T01:CDS
TAGCTACGGAGTTGTGGTGT+TGG 0.503855 3:-62224162 MsG0380014903.01.T01:CDS
TACTTGAAATTGCCGAAAAG+TGG 0.509394 3:-62225025 MsG0380014903.01.T01:CDS
TGGTTTGCAGGTGGTTTAGG+AGG 0.509576 3:-62224875 MsG0380014903.01.T01:CDS
CATTGCTATGGGAACTGCAA+AGG 0.509970 3:-62224420 MsG0380014903.01.T01:CDS
CTTCAAGAACAAAATACAAA+CGG 0.510132 3:-62225892 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAAGTGGATGTTTATAGCTA+CGG 0.513820 3:-62224176 MsG0380014903.01.T01:CDS
GAATTGAAACAAGCTACAAA+AGG 0.517578 3:-62224734 MsG0380014903.01.T01:CDS
CTTAATCACATGAATTTGAT+CGG 0.519152 3:-62224560 MsG0380014903.01.T01:CDS
TAGTAGTAGAATCGCGTCGT+TGG 0.519397 3:-62225605 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGTCAGACGAACTATTCGTC+TGG 0.525893 3:-62225766 MsG0380014903.01.T01:CDS
ATTGTTGGTTTATGAGTACA+TGG 0.526052 3:-62224504 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCGAGGGACAAGAGGTTACA+TGG 0.526801 3:-62224234 MsG0380014903.01.T01:CDS
GTATTTACACGAAGAATGTC+TGG 0.528905 3:-62224390 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGTTTCTAGCATTTATTGGC+CGG 0.530351 3:-62225683 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGCAATGGTGCTGCCGGTAG+TGG 0.531575 3:-62225646 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTGCTTGTAGTCCAAGGATC+CGG 0.534028 3:+62225664 None:intergenic
CAAATTTCTCGAGGATTCGA+GGG 0.535047 3:-62224250 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTTAGTCAAGAGATCGGAAG+AGG 0.535124 3:-62224710 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGAAAGTGTTCTTGTCTACC+TGG 0.535612 3:-62225352 MsG0380014903.01.T01:CDS
ACCGGAAAGAGTCCAACAAC+CGG 0.537855 3:-62224131 MsG0380014903.01.T01:CDS
TGTAGTAATGATCCTTTGAC+TGG 0.538732 3:-62225376 MsG0380014903.01.T01:CDS
GTCATGAGAGGTTGGTAACA+TGG 0.539651 3:-62224079 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCAAATTTCTCGAGGATTCG+AGG 0.539667 3:-62224251 MsG0380014903.01.T01:CDS
GAGGTTGGTAACATGGGTTA+GGG 0.541052 3:-62224072 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAAAGGTATAACATTGCTAT+GGG 0.541542 3:-62224431 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTGAAATTGCCGAAAAGTGG+TGG 0.546993 3:-62225022 MsG0380014903.01.T01:CDS
AATGATCAAGATAGTTCTCA+AGG 0.548811 3:-62225316 MsG0380014903.01.T01:CDS
ACCCTTATACACAGTTCCTC+CGG 0.549423 3:+62224685 None:intergenic
TCAACAAAATAGCAGTGGAA+TGG 0.551859 3:-62224978 MsG0380014903.01.T01:CDS
GCACAATTGTGTGATTGTGC+AGG 0.553337 3:-62225151 MsG0380014903.01.T01:CDS
TGATTCCGATTACCAACCTA+AGG 0.555471 3:-62224324 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTCATGCTTTGGTTTGCAGG+TGG 0.556515 3:-62224884 MsG0380014903.01.T01:CDS
ACATGAATTTGATCGGAATG+TGG 0.558554 3:-62224553 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCATGTAATAGTAGTTCAAG+TGG 0.558567 3:+62225931 None:intergenic
CTCAACAACTTGACTCATGG+TGG 0.559325 3:+62223905 None:intergenic
CGATTACCAACCTAAGGTAG+CGG 0.562865 3:-62224318 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTGATAATTCAAATTTCTCG+AGG 0.564179 3:-62224259 MsG0380014903.01.T01:CDS
CCGAAGTTAGCATCATTGGA+AGG 0.564552 3:-62224583 MsG0380014903.01.T01:CDS
CCTTCCAATGATGCTAACTT+CGG 0.567080 3:+62224583 None:intergenic
GAGGTTCGTGAACCTCGTTA+GGG 0.567939 3:+62225801 None:intergenic
CAATAAATGCTAGAAACTCT+CGG 0.568196 3:+62225688 None:intergenic
ACTACAAGCAATGGTGCTGC+CGG 0.568870 3:-62225652 MsG0380014903.01.T01:CDS
GAAAAGATGAGGAACAGGGT+TGG 0.576322 3:-62225465 MsG0380014903.01.T01:CDS
CAAAATCCGCTACCTTAGGT+TGG 0.578632 3:+62224312 None:intergenic
CCTCTCAACAACTTGACTCA+TGG 0.580851 3:+62223902 None:intergenic
TGTTTATAGCTACGGAGTTG+TGG 0.583071 3:-62224168 MsG0380014903.01.T01:CDS
CTGGCAAAAGTGTATCTGTT+GGG 0.587272 3:+62225830 None:intergenic
AGTACTTCTTGTACCACTAC+CGG 0.587904 3:+62225633 None:intergenic
ATGAATTTGATCGGAATGTG+GGG 0.592817 3:-62224551 MsG0380014903.01.T01:CDS
AACAATGGACTGAGCTGCGT+CGG 0.593110 3:+62225981 None:intergenic
GATCCTTGGACTACAAGCAA+TGG 0.595254 3:-62225661 MsG0380014903.01.T01:CDS
CGTCTGCATGAAGCAAATGA+AGG 0.597032 3:-62224629 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCGAGGATTCGAGGGACAAG+AGG 0.601003 3:-62224242 MsG0380014903.01.T01:CDS
AAGAAGAGTTGTGTCATGAG+AGG 0.601728 3:-62224091 MsG0380014903.01.T01:CDS
GCACCATTGCTTGTAGTCCA+AGG 0.604027 3:+62225658 None:intergenic
AGACTTACACTTGATCATGA+TGG 0.604123 3:-62225508 MsG0380014903.01.T01:CDS
GCAGTGGAATGGTTTGTGAG+AGG 0.607925 3:-62224967 MsG0380014903.01.T01:CDS
ATGTGGGGTTATTGTGCAGA+GGG 0.611632 3:-62224536 MsG0380014903.01.T01:CDS
GAACACTTTCTACCAGTCAA+AGG 0.612025 3:+62225364 None:intergenic
TCATCAAATGAACTTGATTG+GGG 0.612903 3:-62224455 MsG0380014903.01.T01:CDS
CAAATCCCATGAATAAAACA+AGG 0.619080 3:+62225415 None:intergenic
CCATGAGTCAAGTTGTTGAG+AGG 0.619983 3:-62223902 MsG0380014903.01.T01:CDS
CATTTATAGTAGAAAAGATG+AGG 0.620124 3:-62225476 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCAACAACTTGACTCATGGT+GGG 0.622861 3:+62223906 None:intergenic
AGTAGAAAAGATGAGGAACA+GGG 0.623228 3:-62225469 MsG0380014903.01.T01:CDS
TACACGAAGAATGTCTGGAG+TGG 0.634168 3:-62224385 MsG0380014903.01.T01:CDS
AGGATTCAACAAAATAGCAG+TGG 0.638505 3:-62224983 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCATTAATCCAAACATAACC+AGG 0.638983 3:+62225334 None:intergenic
GAGATCGGAAGAGGTGCCGG+AGG 0.643984 3:-62224701 MsG0380014903.01.T01:CDS
TTTGTCCAAGCTATTGAACA+GGG 0.647429 3:-62224288 MsG0380014903.01.T01:CDS
TGCCAGACCAAACCCTAACG+AGG 0.650977 3:-62225813 MsG0380014903.01.T01:CDS
ATTAGAAGTTGGTTGCTGGG+TGG 0.653389 3:-62224033 MsG0380014903.01.T01:CDS
GGAATGGTTTGTGAGAGGAA+TGG 0.658932 3:-62224962 MsG0380014903.01.T01:CDS
ATTATGTTCTAGCAGCAACA+GGG 0.659512 3:-62224778 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCTGGCAAAAGTGTATCTGT+TGG 0.659781 3:+62225829 None:intergenic
TCATGAGAGGTTGGTAACAT+GGG 0.662079 3:-62224078 MsG0380014903.01.T01:CDS
GGTGTCTGTGGACCAAACAA+TGG 0.669111 3:+62225966 None:intergenic
AATGTGGGGTTATTGTGCAG+AGG 0.673756 3:-62224537 MsG0380014903.01.T01:CDS
TCTGACTTATTGATGAAACG+AGG 0.686151 3:+62225782 None:intergenic
GAGCTGCGTCGGTTAAGACG+AGG 0.696761 3:+62225992 None:intergenic
GGTTTGTGAGAGGAATGGAG+TGG 0.777957 3:-62224957 MsG0380014903.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATTATGATGTAAAGAAGA+TGG - Chr3:62225950-62225969 MsG0380014903.01.T01:CDS 20.0%
!! TACATCAAAAAGAAAGAAAA+TGG - Chr3:62225015-62225034 MsG0380014903.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTTATGGATATGATTAC+GGG - Chr3:62224716-62224735 MsG0380014903.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATTTTTATGGATATGATTA+CGG - Chr3:62224715-62224734 MsG0380014903.01.T01:CDS 20.0%
! ACTCTTCTTTATCTTTGATT+TGG + Chr3:62225830-62225849 None:intergenic 25.0%
! CAAGAAAAAGAAACATTCTA+TGG - Chr3:62224065-62224084 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
! CATAATTTGATCCCAATTTA+GGG + Chr3:62225938-62225957 None:intergenic 25.0%
! CATTTATAGTAGAAAAGATG+AGG - Chr3:62224456-62224475 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
! CTACAAGAAAGTTCAAAATT+TGG + Chr3:62224649-62224668 None:intergenic 25.0%
! CTTAATCACATGAATTTGAT+CGG - Chr3:62225372-62225391 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
! CTTCAAGAACAAAATACAAA+CGG - Chr3:62224040-62224059 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
! TCATAATTTGATCCCAATTT+AGG + Chr3:62225939-62225958 None:intergenic 25.0%
! TCATTACTACAAGTACTATT+AGG + Chr3:62224547-62224566 None:intergenic 25.0%
! TCGAGAAATTTGAATTATCA+AGG + Chr3:62225674-62225693 None:intergenic 25.0%
!! AAAAGGTATAACATTGCTAT+GGG - Chr3:62225501-62225520 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!! CCATTAAGTAACTGAATTTT+CGG + Chr3:62224856-62224875 None:intergenic 25.0%
!! TAAAAGGTATAACATTGCTA+TGG - Chr3:62225500-62225519 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!! TATACTTTTACAGCTGAATA+TGG - Chr3:62224811-62224830 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!! TATTTTGTTCTTGAAGAACA+AGG + Chr3:62224036-62224055 None:intergenic 25.0%
!! TTGATAATTCAAATTTCTCG+AGG - Chr3:62225673-62225692 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACAACCTTGTTTTATTCAT+GGG - Chr3:62224512-62224531 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTTTAATACTGCTGATTA+TGG - Chr3:62224385-62224404 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCATGATGAGTTAAGTTTTT+TGG - Chr3:62224678-62224697 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTCTCATGTTGATTTTTA+TGG - Chr3:62224703-62224722 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTATCTTTGATTTGGATAC+CGG + Chr3:62225823-62225842 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTGGGATTTTTTATGGTT+TGG - Chr3:62225088-62225107 MsG0380014903.01.T01:CDS 25.0%
AAAGTGGATGTTTATAGCTA+CGG - Chr3:62225756-62225775 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
AATGATCAAGATAGTTCTCA+AGG - Chr3:62224616-62224635 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
ACAAATTGTTGACCCTAAAT+TGG - Chr3:62225923-62225942 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
AGAAGAAAAGGATTAGAAGT+TGG - Chr3:62225888-62225907 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
CAAATCCCATGAATAAAACA+AGG + Chr3:62224520-62224539 None:intergenic 30.0%
CAAATTGTTGACCCTAAATT+GGG - Chr3:62225924-62225943 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
CAATAAATGCTAGAAACTCT+CGG + Chr3:62224247-62224266 None:intergenic 30.0%
CCGAAAATTCAGTTACTTAA+TGG - Chr3:62224853-62224872 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
CTCATCAAATGAACTTGATT+GGG - Chr3:62225476-62225495 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
GAACTACTATTACATGAAAC+AGG - Chr3:62224007-62224026 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
GAATTGAAACAAGCTACAAA+AGG - Chr3:62225198-62225217 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
GTTTATGAGTACATGGAAAA+TGG - Chr3:62225435-62225454 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
TCATCAAATGAACTTGATTG+GGG - Chr3:62225477-62225496 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
TCATGTAATAGTAGTTCAAG+TGG + Chr3:62224004-62224023 None:intergenic 30.0%
TCATTAATCCAAACATAACC+AGG + Chr3:62224601-62224620 None:intergenic 30.0%
TCTCATCAAATGAACTTGAT+TGG - Chr3:62225475-62225494 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
TGTAAAGAAGATGGAAACTT+TGG - Chr3:62225959-62225978 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
! GAATCAACAAGTATGTTTTG+CGG + Chr3:62225594-62225613 None:intergenic 30.0%
!! AAAGGTTTTAGTCAAGAGAT+CGG - Chr3:62225216-62225235 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGTTGGTTTATGAGTACA+TGG - Chr3:62225428-62225447 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTTATTCATGGGATTTGT+GGG - Chr3:62224521-62224540 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTTTTATTCATGGGATTTG+TGG - Chr3:62224520-62224539 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
!!! AGAGCTTTTGGGATTTTTTA+TGG - Chr3:62225083-62225102 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAACAACCTTGTTTTATTCA+TGG - Chr3:62224511-62224530 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGGTTTGGTTTTTCTTGTTT+AGG - Chr3:62225103-62225122 MsG0380014903.01.T01:CDS 30.0%
AAGTTGTTGAGAGGCTATTA+AGG - Chr3:62226039-62226058 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
ACATGAATTTGATCGGAATG+TGG - Chr3:62225379-62225398 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
AGACTTACACTTGATCATGA+TGG - Chr3:62224424-62224443 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
AGGATTCAACAAAATAGCAG+TGG - Chr3:62224949-62224968 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
AGTAGAAAAGATGAGGAACA+GGG - Chr3:62224463-62224482 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
AGTTGTTGAGAGGCTATTAA+GGG - Chr3:62226040-62226059 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
ATGAACTTGATTGGGGTAAA+AGG - Chr3:62225484-62225503 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
ATGAATTTGATCGGAATGTG+GGG - Chr3:62225381-62225400 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
ATTATGTTCTAGCAGCAACA+GGG - Chr3:62225154-62225173 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
CATGAATTTGATCGGAATGT+GGG - Chr3:62225380-62225399 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
CATGCAAATCACTTCAAAAG+TGG - Chr3:62225740-62225759 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
GTATTTACACGAAGAATGTC+TGG - Chr3:62225542-62225561 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
GTTAGGGAGAAAAGAAGAAA+AGG - Chr3:62225876-62225895 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
GTTCATTGAAGTTCATGCTT+TGG - Chr3:62225037-62225056 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
TACTTGAAATTGCCGAAAAG+TGG - Chr3:62224907-62224926 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
TAGTAGAAAAGATGAGGAAC+AGG - Chr3:62224462-62224481 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
TCAACAAAATAGCAGTGGAA+TGG - Chr3:62224954-62224973 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
TCTGACTTATTGATGAAACG+AGG + Chr3:62224153-62224172 None:intergenic 35.0%
TGTAGTAATGATCCTTTGAC+TGG - Chr3:62224556-62224575 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTCCAAGCTATTGAACA+GGG - Chr3:62225644-62225663 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
! AACTTTGGCAAATGTTGCTT+TGG - Chr3:62225974-62225993 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTTTACAGCTGAATATGG+TGG - Chr3:62224814-62224833 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
! CTGAATATGGTGGTGTTTAT+TGG - Chr3:62224824-62224843 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
! GTTCTTCGTCTTTTATACCA+AGG - Chr3:62224220-62224239 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
!! AGTTTCTAGCATTTATTGGC+CGG - Chr3:62224249-62224268 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
!! CGAGAGTTTCTAGCATTTAT+TGG - Chr3:62224245-62224264 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
!! TCAACAAAACCACCACTTTT+CGG + Chr3:62224922-62224941 None:intergenic 35.0%
!!! GTGGTTTTGTTGATGAGATT+AGG - Chr3:62224929-62224948 MsG0380014903.01.T01:CDS 35.0%
!!! TAGTTCAAGTGGTTTTGTTG+AGG + Chr3:62223993-62224012 None:intergenic 35.0%
AAACCAAAATCCGCTACCTT+AGG + Chr3:62225627-62225646 None:intergenic 40.0%
AAGAAGAGTTGTGTCATGAG+AGG - Chr3:62225841-62225860 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
ACACTTTCCCTTCTCAAAAC+CGG - Chr3:62223914-62223933 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
AGAGGGAAAACACAGATTGT+TGG - Chr3:62225413-62225432 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
AGTACTTCTTGTACCACTAC+CGG + Chr3:62224302-62224321 None:intergenic 40.0%
ATTGCTATGGGAACTGCAAA+GGG - Chr3:62225513-62225532 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
CAAATTTCTCGAGGATTCGA+GGG - Chr3:62225682-62225701 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
CCTTCCAATGATGCTAACTT+CGG + Chr3:62225352-62225371 None:intergenic 40.0%
CTTGTCTACCTGGTTATGTT+TGG - Chr3:62224590-62224609 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
GAACACTTTCTACCAGTCAA+AGG + Chr3:62224571-62224590 None:intergenic 40.0%
GATTATGTTCTAGCAGCAAC+AGG - Chr3:62225153-62225172 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
GTTTGTCCAAGCTATTGAAC+AGG - Chr3:62225643-62225662 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
TCAAATTTCTCGAGGATTCG+AGG - Chr3:62225681-62225700 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
TCAACAACTTGACTCATGGT+GGG + Chr3:62226029-62226048 None:intergenic 40.0%
TGATTCCGATTACCAACCTA+AGG - Chr3:62225608-62225627 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
TGCATGTTGAAAACCCATTC+AGG + Chr3:62225726-62225745 None:intergenic 40.0%
TGTTTATAGCTACGGAGTTG+TGG - Chr3:62225764-62225783 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
TTGAAATTGCCGAAAAGTGG+TGG - Chr3:62224910-62224929 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
TTTAGTCAAGAGATCGGAAG+AGG - Chr3:62225222-62225241 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGATTAGAAGTTGGTTGC+TGG - Chr3:62225895-62225914 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
! AGGATTAGAAGTTGGTTGCT+GGG - Chr3:62225896-62225915 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
! CTGGCAAAAGTGTATCTGTT+GGG + Chr3:62224105-62224124 None:intergenic 40.0%
! TCTGGCAAAAGTGTATCTGT+TGG + Chr3:62224106-62224125 None:intergenic 40.0%
! TTAGGAGGAGTAGAGCTTTT+GGG - Chr3:62225072-62225091 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
! TTTAGGAGGAGTAGAGCTTT+TGG - Chr3:62225071-62225090 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGTTCATGCTTTGGTTTGC+AGG - Chr3:62225045-62225064 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
!! AGAAAGTGTTCTTGTCTACC+TGG - Chr3:62224580-62224599 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
!! TCATGAGAGGTTGGTAACAT+GGG - Chr3:62225854-62225873 MsG0380014903.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGATTTGGATACCGGTTGT+TGG + Chr3:62225816-62225835 None:intergenic 40.0%
!!! TTCAAGTGGTTTTGTTGAGG+TGG + Chr3:62223990-62224009 None:intergenic 40.0%
AATCGTGACCAACCGGTTAA+CGG - Chr3:62223881-62223900 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
AATGTGGGGTTATTGTGCAG+AGG - Chr3:62225395-62225414 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
ACCCTTATACACAGTTCCTC+CGG + Chr3:62225250-62225269 None:intergenic 45.0%
AGAGTTGTGTCATGAGAGGT+TGG - Chr3:62225845-62225864 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
AGGTTACATGGCACCTGAAT+GGG - Chr3:62225710-62225729 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
AGTCAGACGAACTATTCGTC+TGG - Chr3:62224166-62224185 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
ATCGCGTCGTTGGATTCATT+TGG - Chr3:62224337-62224356 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
ATGTGGGGTTATTGTGCAGA+GGG - Chr3:62225396-62225415 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
CAAAATCCGCTACCTTAGGT+TGG + Chr3:62225623-62225642 None:intergenic 45.0%
CATTGCTATGGGAACTGCAA+AGG - Chr3:62225512-62225531 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
CCGAAGTTAGCATCATTGGA+AGG - Chr3:62225349-62225368 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
CCTCTCAACAACTTGACTCA+TGG + Chr3:62226033-62226052 None:intergenic 45.0%
CGATTACCAACCTAAGGTAG+CGG - Chr3:62225614-62225633 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
CGTCTGCATGAAGCAAATGA+AGG - Chr3:62225303-62225322 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
CTCAACAACTTGACTCATGG+TGG + Chr3:62226030-62226049 None:intergenic 45.0%
CTTGCCGAAGTTAGCATCAT+TGG - Chr3:62225345-62225364 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
GAAAAGATGAGGAACAGGGT+TGG - Chr3:62224467-62224486 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
GATCCTTGGACTACAAGCAA+TGG - Chr3:62224271-62224290 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
GCACAATTGTGTGATTGTGC+AGG - Chr3:62224781-62224800 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
GTCATCCCTGTTCAATAGCT+TGG + Chr3:62225652-62225671 None:intergenic 45.0%
TACACGAAGAATGTCTGGAG+TGG - Chr3:62225547-62225566 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
TAGTAGTAGAATCGCGTCGT+TGG - Chr3:62224327-62224346 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
TTCTAGCAGCAACAGGGTTT+AGG - Chr3:62225160-62225179 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
TTGCTTGTAGTCCAAGGATC+CGG + Chr3:62224271-62224290 None:intergenic 45.0%
! ATTAGAAGTTGGTTGCTGGG+TGG - Chr3:62225899-62225918 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
! CATCGTTCGCAGAGTTTTCT+TGG - Chr3:62224877-62224896 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
! CCATGAGTCAAGTTGTTGAG+AGG - Chr3:62226030-62226049 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
! GGAATGGTTTGTGAGAGGAA+TGG - Chr3:62224970-62224989 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
! GTGGTGTTGGAGATGATTAC+CGG - Chr3:62225783-62225802 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGAGCGTTTTCCGTTAAC+CGG + Chr3:62223896-62223915 None:intergenic 45.0%
! TTTTGTTGAGGTGGTGTCTG+TGG + Chr3:62223981-62224000 None:intergenic 45.0%
!! AGAGGTTGGTAACATGGGTT+AGG - Chr3:62225859-62225878 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
!! CGCTACCTTAGGTTGGTAAT+CGG + Chr3:62225616-62225635 None:intergenic 45.0%
!! CTTTGGTTTGCAGGTGGTTT+AGG - Chr3:62225054-62225073 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
!! GAACAGGGTTGGTTTGTTTC+GGG - Chr3:62224478-62224497 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGGTTGGTAACATGGGTTA+GGG - Chr3:62225860-62225879 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
!! GGAACAGGGTTGGTTTGTTT+CGG - Chr3:62224477-62224496 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
!! GTCATGAGAGGTTGGTAACA+TGG - Chr3:62225853-62225872 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
!! TTCATGCTTTGGTTTGCAGG+TGG - Chr3:62225048-62225067 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
!!! CAACCTAAGGTAGCGGATTT+TGG - Chr3:62225621-62225640 MsG0380014903.01.T01:CDS 45.0%
ACCGGAAAGAGTCCAACAAC+CGG - Chr3:62225801-62225820 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
ACCGGTTGTTGGACTCTTTC+CGG + Chr3:62225805-62225824 None:intergenic 50.0%
ACGCAGCTCAGTCCATTGTT+TGG - Chr3:62223954-62223973 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTTACATGGCACCTGAA+TGG - Chr3:62225709-62225728 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTTCGTGAACCTCGTTA+GGG + Chr3:62224134-62224153 None:intergenic 50.0%
GCACCATTGCTTGTAGTCCA+AGG + Chr3:62224277-62224296 None:intergenic 50.0%
GCATTTATTGGCCGGATCCT+TGG - Chr3:62224257-62224276 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
GCCGGAGGAACTGTGTATAA+GGG - Chr3:62225246-62225265 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
GGTGTCTGTGGACCAAACAA+TGG + Chr3:62223969-62223988 None:intergenic 50.0%
GGTTTGTGAGAGGAATGGAG+TGG - Chr3:62224975-62224994 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
TAGCTACGGAGTTGTGGTGT+TGG - Chr3:62225770-62225789 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
TCGAGGGACAAGAGGTTACA+TGG - Chr3:62225698-62225717 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
TCGTGAACCTCGTTAGGGTT+TGG + Chr3:62224129-62224148 None:intergenic 50.0%
TGCCGGAGGAACTGTGTATA+AGG - Chr3:62225245-62225264 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
TGCTAGAAACTCTCGGTCCT+TGG + Chr3:62224240-62224259 None:intergenic 50.0%
! AACCTCGTTAGGGTTTGGTC+TGG + Chr3:62224124-62224143 None:intergenic 50.0%
! AGCGTTTTCCGTTAACCGGT+TGG + Chr3:62223892-62223911 None:intergenic 50.0%
! GCAGTGGAATGGTTTGTGAG+AGG - Chr3:62224965-62224984 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
! TGGTTTGCAGGTGGTTTAGG+AGG - Chr3:62225057-62225076 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
!! AACAATGGACTGAGCTGCGT+CGG + Chr3:62223954-62223973 None:intergenic 50.0%
!! ACTACAAGCAATGGTGCTGC+CGG - Chr3:62224280-62224299 MsG0380014903.01.T01:CDS 50.0%
!!! GAGGTTGCCGGTTTTGAGAA+GGG + Chr3:62223924-62223943 None:intergenic 50.0%
CGAGGTTCGTGAACCTCGTT+AGG + Chr3:62224135-62224154 None:intergenic 55.0%
GTCGGTTAAGACGAGGTTGC+CGG + Chr3:62223936-62223955 None:intergenic 55.0%
TCGAGGATTCGAGGGACAAG+AGG - Chr3:62225690-62225709 MsG0380014903.01.T01:CDS 55.0%
TGCCAGACCAAACCCTAACG+AGG - Chr3:62224119-62224138 MsG0380014903.01.T01:CDS 55.0%
! CAAGAGATCGGAAGAGGTGC+CGG - Chr3:62225228-62225247 MsG0380014903.01.T01:CDS 55.0%
!!! CGAGGTTGCCGGTTTTGAGA+AGG + Chr3:62223925-62223944 None:intergenic 55.0%
!! AGCAATGGTGCTGCCGGTAG+TGG - Chr3:62224286-62224305 MsG0380014903.01.T01:CDS 60.0%
!! GAGCTGCGTCGGTTAAGACG+AGG + Chr3:62223943-62223962 None:intergenic 60.0%
!! GAGATCGGAAGAGGTGCCGG+AGG - Chr3:62225231-62225250 MsG0380014903.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 62223875 62226079 62223875 ID=MsG0380014903.01;Name=MsG0380014903.01
Chr3 mRNA 62223875 62226079 62223875 ID=MsG0380014903.01.T01;Parent=MsG0380014903.01;Name=MsG0380014903.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|734
Chr3 exon 62223875 62226079 62223875 ID=MsG0380014903.01.T01:exon:6523;Parent=MsG0380014903.01.T01
Chr3 CDS 62223875 62226079 62223875 ID=MsG0380014903.01.T01:cds;Parent=MsG0380014903.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380014903.01.T01

ATGGCAAATCGTGACCAACCGGTTAACGGAAAACGCTCAACACTTTCCCTTCTCAAAACCGGCAACCTCGTCTTAACCGACGCAGCTCAGTCCATTGTTTGGTCCACAGACACCACCTCAACAAAACCACTTGAACTACTATTACATGAAACAGGTAACCTTGTTCTTCAAGAACAAAATACAAACGGTTCAAGAAAAAGAAACATTCTATGGCAAAGTTTTGACTTCCCAACAGATACACTTTTGCCAGACCAAACCCTAACGAGGTTCACGAACCTCGTTTCATCAATAAGTCAGACGAACTATTCGTCTGGCTTCTACAAACTATTTTTTGACAATGATAACGTTCTTCGTCTTTTATACCAAGGACCGAGAGTTTCTAGCATTTATTGGCCGGATCCTTGGACTACAAGCAATGGTGCTGCCGGTAGTGGTACAAGAAGTACTTACAATAGTAGTAGAATCGCGTCGTTGGATTCATTTGGTAGTTTTAGTTCATCTGATGATTTTGTTTTTAATACTGCTGATTATGGAACTTTTTTGCAACGTAGACTTACACTTGATCATGATGGTAATGTTCGCATTTATAGTAGAAAAGATGAGGAACAGGGTTGGTTTGTTTCGGGTCAATTTCGTCAACAACCTTGTTTTATTCATGGGATTTGTGGGCCTAATAGTACTTGTAGTAATGATCCTTTGACTGGTAGAAAGTGTTCTTGTCTACCTGGTTATGTTTGGATTAATGATCAAGATAGTTCTCAAGGTTGTAGACCAAATTTTGAACTTTCTTGTAGTAACAAGACTCATGATGAGTTAAGTTTTTTGGCTTTGTCTCATGTTGATTTTTATGGATATGATTACGGGTTTTATACGAATAAAACTTACAAAGAATGTGAGACTTTGTGTGCACAATTGTGTGATTGTGCAGGATTTCAGTATACTTTTACAGCTGAATATGGTGGTGTTTATTGGTGTTATCCGAAAATTCAGTTACTTAATGGTCATCGTTCGCAGAGTTTTCTTGGATCGTTCTACTTGAAATTGCCGAAAAGTGGTGGTTTTGTTGATGAGATTAGGATTCAACAAAATAGCAGTGGAATGGTTTGTGAGAGGAATGGAGTGGTAAAGCTTGACAGAGAATACATCAAAAAGAAAGAAAATGGTTCATTGAAGTTCATGCTTTGGTTTGCAGGTGGTTTAGGAGGAGTAGAGCTTTTGGGATTTTTTATGGTTTGGTTTTTCTTGTTTAGGAGCAGCAAAAATTCAGATGAGAATCATGATTATGTTCTAGCAGCAACAGGGTTTAGGAAATTCAGTTACTCTGAATTGAAACAAGCTACAAAAGGTTTTAGTCAAGAGATCGGAAGAGGTGCCGGAGGAACTGTGTATAAGGGTGTTTTATCTGATAATCGAGTTGCTGCGATAAAGCGTCTGCATGAAGCAAATGAAGGTGAGAGTGAAAGTGAGTTTCTTGCCGAAGTTAGCATCATTGGAAGGCTTAATCACATGAATTTGATCGGAATGTGGGGTTATTGTGCAGAGGGAAAACACAGATTGTTGGTTTATGAGTACATGGAAAATGGTACTTTAGCTGATAATCTCTCATCAAATGAACTTGATTGGGGTAAAAGGTATAACATTGCTATGGGAACTGCAAAGGGTCTTGCGTATTTACACGAAGAATGTCTGGAGTGGATTTTGCATTGCGATATAAAGCCGCAAAACATACTTGTTGATTCCGATTACCAACCTAAGGTAGCGGATTTTGGTTTGTCCAAGCTATTGAACAGGGATGACCTTGATAATTCAAATTTCTCGAGGATTCGAGGGACAAGAGGTTACATGGCACCTGAATGGGTTTTCAACATGCAAATCACTTCAAAAGTGGATGTTTATAGCTACGGAGTTGTGGTGTTGGAGATGATTACCGGAAAGAGTCCAACAACCGGTATCCAAATCAAAGATAAAGAAGAGTTGTGTCATGAGAGGTTGGTAACATGGGTTAGGGAGAAAAGAAGAAAAGGATTAGAAGTTGGTTGCTGGGTGGAACAAATTGTTGACCCTAAATTGGGATCAAATTATGATGTAAAGAAGATGGAAACTTTGGCAAATGTTGCTTTGGATTGTGTACAAGAAGATAAAGATGTTAGACCCACCATGAGTCAAGTTGTTGAGAGGCTATTAAGGGATGAGCAAAATTATTGA

Protein sequence

>MsG0380014903.01.T01

MANRDQPVNGKRSTLSLLKTGNLVLTDAAQSIVWSTDTTSTKPLELLLHETGNLVLQEQNTNGSRKRNILWQSFDFPTDTLLPDQTLTRFTNLVSSISQTNYSSGFYKLFFDNDNVLRLLYQGPRVSSIYWPDPWTTSNGAAGSGTRSTYNSSRIASLDSFGSFSSSDDFVFNTADYGTFLQRRLTLDHDGNVRIYSRKDEEQGWFVSGQFRQQPCFIHGICGPNSTCSNDPLTGRKCSCLPGYVWINDQDSSQGCRPNFELSCSNKTHDELSFLALSHVDFYGYDYGFYTNKTYKECETLCAQLCDCAGFQYTFTAEYGGVYWCYPKIQLLNGHRSQSFLGSFYLKLPKSGGFVDEIRIQQNSSGMVCERNGVVKLDREYIKKKENGSLKFMLWFAGGLGGVELLGFFMVWFFLFRSSKNSDENHDYVLAATGFRKFSYSELKQATKGFSQEIGRGAGGTVYKGVLSDNRVAAIKRLHEANEGESESEFLAEVSIIGRLNHMNLIGMWGYCAEGKHRLLVYEYMENGTLADNLSSNELDWGKRYNIAMGTAKGLAYLHEECLEWILHCDIKPQNILVDSDYQPKVADFGLSKLLNRDDLDNSNFSRIRGTRGYMAPEWVFNMQITSKVDVYSYGVVVLEMITGKSPTTGIQIKDKEELCHERLVTWVREKRRKGLEVGCWVEQIVDPKLGSNYDVKKMETLANVALDCVQEDKDVRPTMSQVVERLLRDEQNY*