AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene43086


Find 209 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr2.4 gene 14386705 14395040 14386705 ID=MS.gene43086
chr2.4 mRNA 14386705 14395040 14386705 ID=MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086
chr2.4 exon 14386705 14387309 14386705 ID=MS.gene43086.t1.exon1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14386705 14387309 14386705 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14388346 14388417 14388346 ID=MS.gene43086.t1.exon2;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14388346 14388417 14388346 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14389850 14389939 14389850 ID=MS.gene43086.t1.exon3;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14389850 14389939 14389850 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14390035 14390208 14390035 ID=MS.gene43086.t1.exon4;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14390035 14390208 14390035 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14390320 14390410 14390320 ID=MS.gene43086.t1.exon5;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14390320 14390410 14390320 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14390997 14391059 14390997 ID=MS.gene43086.t1.exon6;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14390997 14391059 14390997 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14391162 14391228 14391162 ID=MS.gene43086.t1.exon7;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14391162 14391228 14391162 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14392292 14392395 14392292 ID=MS.gene43086.t1.exon8;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14392292 14392395 14392292 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14392480 14392606 14392480 ID=MS.gene43086.t1.exon9;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14392480 14392606 14392480 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14393046 14393767 14393046 ID=MS.gene43086.t1.exon10;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14393046 14393767 14393046 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 exon 14394621 14395040 14394621 ID=MS.gene43086.t1.exon11;Parent=MS.gene43086.t1
chr2.4 CDS 14394621 14395040 14394621 ID=cds.MS.gene43086.t1;Parent=MS.gene43086.t1
Gene Sequence

>MS.gene43086

ATGTTTCTCCTTCGCCGCTTCCAAAAACCACCACCACCCTCCGACTCCAAAAACCCCTCCGATTCCGACTCCGACTCATCCTCCGACGCAGAATCAGAAACCCAAGACGACCTCGATGTCGAATCTTATCTCAACTCATTCATCGCCCAAAACACTGAAGCACCAGTCCCAGCCTCCGAATTCGACCCAGAACAAAACTTCAAAGACGTAATCGAAGCTTATCATTCCGAAAAAGTTCAAAAATACTACGACAAAAAAGCTCGTCGCAAGGTTAAACATCGTAACCCGTTTGATTTTCCACCTGATGATGAGAATTGGAAAGAAGAAGATTTGAGAGAGCTTTGGGATAATGGGAATAACACCATTACTGGTACTGGTTGGGACCCTGCTTTTGCTACGCCTGAGGAATGGGAATATGTGAAGTGGAAGCATTATAAGGGACAAGATGTTCCTATTGCTCCTTTTTATCTTCCTTATAGGAAACCTATTCCTCCTGTACCTACTAATCATTCTGCTATTAAAGGTCCTAAAGATGTTATTGAAGAATTGGATAGGATTGAAGAGTTTCTCAAATGGGTTAGCTATGTTTTTGAAGATGGTAGCACGTATGTTATAAAAATTCTTCTTTTCATTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTTAGTATATAGTTTGTCCCGTAAGTACAACTTAGTTGTTAGCTGCATTGACGTTAATATGGATGGGTCTGAGCAGACCGAGATTGAACATGTGATTCTCTACTTCTCCACATTTAAGGTGTGTGAGTCTAGGACTGAGATTCACTGACTTTAAGACGGGAAAGTCAAGTGACTTTACTCTTTAGTGTAATTTTTGTTTTATGAAAGAGAAACCATAAATAAGATGAGAGAGAGATAGACACAGAGTCTCTCTGACTTTCCCGCTTTAAAGTCACTGGATGCCAATTTGTGAGTATAGCCACTAGACTATTTGACCAGAACACAATATTTATCTATGTAGGGCGGCTCAAATAATAAACATGCTTGGCTTTGTAGGGTGCTCTAAAATAGGTCACTGAGATTATGAATACTTCATAAATGGCCCGACTCTGGTTAATTTTACTCATATTTATCATTCTGAAAGTATGTTAGAGACTAAATTGATAGTAAGTGGTTAAAAATAGAGACCAAATTTATAGTAAGTTGTTAAAATACAAGGACCTAATTGATAATGAGTGGTTAAACATAGTAAACTTGACAGCTTGATAGAGATAAGGACCTTTTCGAAATATTTATAATCTTAGGGACATGTTTGAGAGCATTCTACAAAATAAGAGACTAGTTTGGTGGTTTACTCATAGTTTGTCTCTGTTTTGTTCAGTGTTGGTAAATAGAGGCTATTGCAAGGTGGAATTTAAGCAAATAGTTATTGTTCGGCAATAAGGTGTTTAGTACAATATTGTCGAATGGTGGCGTTGTAGTAGTGTTGCATAGAAGAATTTAAACAAGGGAAATGCTAACAAGTGCCCGAAGGACACTTGATAAGAAGCTTAAAGTTAGCATAACCCTTTAAAAACAAATGCCTATTTTGTGCCGGCTGCGATTGACAATACTGGTTTTGTTTGTTATTCATTAATGTTTTGTGTTGCTAAATTTTTAGATATGAAGGAACTCTTTGGGATGATATTGCTCAAGGAAAAGGTGTTTATACTTCTCCAGATGGACTTGTCAGGTTTGTTTTTGCTACATTGTTTTGGCATGCAGTTGGTGCTGTTAGTTATGCTTAAATGGTTTAGGTGGTAGTGGAAGTGGTAAATAGAACAAGATAGAATGAGATACAGGCCCTGTTTGGGTAAACAGCTTAGTTAAGCACTTATTGCATGATCACTTATCATATACGTGCTTATGTATAAGCCATTATTTTAATAAAAGGTAAAGTAGAGTTAAATTTTTGCATAAGCTATCATAGCGAACTTATGAAAATAAGCTGAAAACAATTTATGGACACGTCATAAACTGTTTATATCAGCTCTCCCAAACAGTACCGTAATTGTCTGTGTGTGTTGGGGTTGGAGGGGACTTTTAGGATGTTACGACAATGGCATTCACAATCGTGAATGTATTTCCGTAGGGGCGTAGTCAAAAGGTGACTTTAGAGAAATCTTTCTTGACCATTGATAGTAATCTGATCGTTGAAATTGATTTGCTAAATTCATGATACAAGCCATCACTGATGTTGGTGATTTGCCTGGTTGTGTGACCATAGGGGACTGCTACCGTAGGCAATACAAGTTTTGTTAGTTAAACACAGGACTGATAGGGGAGCTGGAAAAACAAAAATCATTCATACCTGATAGTACATATGCTATGTCTCCACATGCAAAAGCCAATTGGGCCTGATGCACAAACAAACCGCTGACCAACACATTACTTGGAAATTTGATATAGGCGGCAAACAAAGGACCAAGCTTTTGGTCTTTGACGAGGTTTTGTTACTGTATCAATGAATTGACTATCCTACTTTGACAAACTTAGTTACAGAGAAGGAGGAAACAATCTTGAAATTGAAAGAAAACTTTGATGATGATATATTTGGGTGTATATATAGTTTTATTATTTTATTTTTCTTCTGATGAATAAATAGTTTTATTGAGTATATTTGTCTCAGTTGGGAGCTGCAAGGACAATAATATGCCGGGGTCGGGGTTCGAAACCTAGATTCCCGACTAAGCTACGCGACCAAAAACAAATAAATAAATTATATTTATAATAGTTTATATATAATACAATATACTAATATACATGTTTTGGTGGGGGGTGGCTGGGTTGGAGCCCCTGCTTCCCCCTTCAATATGTCCCTGTTGGAGAGGTTTTCGTAATTAACCATTGAATACGAAGTGTTATCCAAGTTGGCTAACTACCCAAAAAAAAATGACAGAACTTGATTAAAATGAGTTAAATAATGCATCTATTTGTCATGTTTTCTGCGGCTTCATGGTAATGATCGAGGCCTTTGACTTTGTTTGATAATGGTTTTAATTGCTGTGAGTATTTGCTTGTGTTCCTGCATTAGATGTATTAGCTTCATCATATCTTTTTATGCCACTGCATTGTGTAACACTTTCTTGTCACGGATATTTTACAGTGTATTTTCTATATCATAGGTATGAAGGTGAATGGTTTCGAAACGACCCAGAGGGTCATGGTGTTATTGAAGTTGAAGTACCTGTTATAGAACCTGTTCCCGGGTCCAAGTATGTATATCTGAAGTCTTAGATTGTACCACAGTTTAAAATTGTGTTCAATTTATTGCATACAAAACTTTGAATGCTTTTATCGATGTCATCAGACTTGAAGAAGCAATGCGAGCTGAAGGGAAGATAATAAAAAGGGATTTTATGTCCCCAGAAGAGAGAGAATGGCTTGATAAGGATATTGAAGATAGTTATCTTCTTGCAAATGGCAACTTTGAAGTCCCCTATTATGAGAGGGATGAATGGGTTAAGGAGTTTGGAGAAAAGCCGTAAGTTCAATTCTTGATTCTCGCTCTAGACATCATGCTGCATTGTCTCTATTTTGGTTTCTCTCTGATACGTTGTAACTGGTCTGAAAAAAACTGTATTTTCGTGGCCAGGGAGAAAGGTCGCTATCGTTATGCTGGTCAGATGAAGCATGGGAGGATGCATGGATGTGGTGTATATGAAATTAATGACCGTATCATATATGTAGGTCCATGGAGTAGATAAAGTTTATGTGTCACTGTTAACTCCAATCAACAACTTACTTTTCAAATTTATAAAAAAAGGGGGAGAGGAAGCTGGACTTTTTTAAGATAAAAATAAGGTTTTAAATAGTATACACTGTTAGTTTAAAAGTTTTTTACACGGTCAATCAATTATAATCGTCAGATCATTAAAAACGTTTGACTCTAATAATAATAATTACTTGTAAAATCACACACATGCTTGATTATGATTTGTTATCAGTGTAAAACTTTTTACATTGACAGTGTATTAAAATTAAACTCAAAACATAATTGTAGAAAATAACACGATTTGCTTTAGCTTTCTGGAAAGTGTCAGTAAATTAATTATGCTTATGGAGACCTTTATACATTTTTAACTCAAAATATTGCAATTTAAAGTATAAGATGTACCACCTGATTTATGTGATTGAACCTTGCAACTAAATTCAAAGGTTAGGAAATGCTAGTCATCTCAACATAAGGGAAAAATACATTTTCATCTTACTTGACTCACATATAGGATTCCTCTTTTCTTTTATATTTATTACATTATCTGTGCCATGCAGGGTAGATTTTATTTTGGAGAAATATTGGATGATGATGAGGGATGTGATGACCAAACTTCAGCGGTATTAAATACTCTTCACATATGAAAATTAAAAAATAATATTAGTAATTTGAGAGGTGTGGCAATATCTCATTCTGACTGTCTGACATTCTGTCAATTTCAGCTGCACGCTGGTATAGGTGAAGTTGCTGCTGCCAAGGCTCGCATGTTTGTGAACAAGCCAGATGGAAGTATGATGTTTAGTCTAGACGAAACTTGAAATTGAAAGCCTCGTATTCATGGTTTTGTTTTTGGTCATTGACTTTCCTCTGTCTGTTTGATAGATCCATTCATTAGCACACATGTTACTACGTATTAAGATGTACTCCCTCCGGAATGAAATATAAGCAAAAGTGCTAGTTGAAAAGTCAATGTATGTGGTTAAAAATTTAGTCTGCATACATCAACTTTTCAACTACCTTTTTTGCTTATATTTCATTCCGGATGGAGTACAGATTCATGTTCTACTATCTTATCCTTCCTCCGACATCTCCTTCTTGCCATTTAAACATATCAATACCAAGTAAGATTTAAGAACACCCATCACCAGTGTTCTTTTCCAATTTGTGGCTAAGTCATGATATAAAGACCAATTGGAACTTTACATCATATTTATTGATAACACTCGATATGGCTGGAACTGCAAACATGAGATAAAACCTGTTAGCCCTTGGTCGGTGCAGCAGATATATGTTGTGGCCAATTGCTTTGTTCTGCATGTTTTTTTTCTACAAGCTAGTCCTTTTCATTACTCTTGGGTTTTGCCTTTGGTCTACCTCTGCTATGTAGCAGTGTTGTTCACCCTTTTTGGTTTTATGTTTTCTGTTAGGTGTATATTTATTCAATACCAATTGGCAATTATATACAAACCTTTATTTTCGGGTTTCTTCTTATCTTTTATACATTTGCACTTTTGCAGTATAAATTATTTGAGTTGTATATAAACTCCTAAGCGTGACAGACTTGCTACTATCGTTATTCCACTATAATTGTTTTGAGGTCGCTGTTCCATGCAGTTATCCTGGATGGAGAACTATGCATCACAAATATGTTAATGATCAGATTCACCTCTTTACCCTTTGACAATCATCTCAACAATTGATGATGGTTTAATATGCATGTTGATTATTGGCATACTAGTAGTCTTTCAACTTTTGTAATATGATATTTTCCATGTTTCCTTTTCCTGATTGGCACCATACTGTTTTTAATCTTGTTATTTTTCATTTATCATAAGATATTTTGTCTGTGCAGTGGTTAGAGAAAAGAGAGGTCCGTATAATGATCCACAGCATGCTTACTTGTATGAAGGAGAGGATGTGTGGATGGCACCTGGCTTCATTAACCAATTTTATGAAGTAAGGTTCACTAGAAAATCTTAAATGCATTGCTTATTTTCATTTTATGCAAGGAAACGAAACATGCATATGATTCTGTTACAGGTTCCTGATTACTGGAAAACATACGCGCATGAAGTAGATCAGGAAAGAGAAATGTGGTTGAACTCTTTCTATAGATCTCCCCTTAGGATACCTATGCCAGCTGAGTTGGAATACTGGTGGTCCAAAGGTATTTAGAGCCCATTTGTTACAGTTTTTTTTTTTTTGGTGAAAAAGTCACGTATTTATTATAAAAGATAATAACTTTTAGAAGTTTTGATCCGTTTGTTACAGATTTTCAAAAAATCATAATCTGAAAAGAAAAAAAAAAATACTTAAGATGAGAAGCTGTTTTCAGCAGTTCCTGTTAAAAATCATTTTTGATAATTGATTTTTTATTTTTAAAAAGTGATTTTCATTATGGTGAAAAATACATAAAATAGCTTATGTTTTTCTTTTAAAAAGCTCTAAAAACTAATCTCCAAATTATTGAATATTAAAATCACTTTTTTTATAATCCGTAACAAACAGACCTTAGTCTTTCTCTTTTTCTGTATGAACAAGTACACAATTGGAAACAACGAGTTTATTCTAAATAACTGATTTCTTCCTCCAAATCCCTTGACCAGAGGAGAATAACAAGCCTCCTGAATTTGTCCTGCTTAACAAGGAACCCGAGCCTGACCCTGAAGACCCGTCAAAACTCATATATACTGAGGATCCTCTCATCCTTCACACTCCAACCGGATTTATCATCAATTATGTCGAGGATGAGAAATATGGAATACGTATGTTCTGGCAACCACCTTTGCAAAAAGGTGAGAAAGTTGACCCTAAAAAGGCTATATTCCTACCCGATGGTTATGATGACTTTTTTGAGATAGATAAGAACAAAAAGACCGTATGGGAGCGTCTTAAGCTTGCAATTGAAAAAGTGTCCAAGCCATGGTTTGATAACCTAGGAAAATGGGCTGAAGAACAGAAGAAAATTAGTGAAATGAAAAAGGAGGCACTTGAGAAAGAACTTGAACTGATAGAAGCTGAATTATGTTTGGAAGAGGCCATTGGGGACATGGAAGAGTTATTGCGTAGAAGAGAGAAAGAGGAGAAAAAGAAGGCGGAATCGGGGTTGCCAGATGAAGATGATTCCGGTTCTGTAGTCAAACAAGATGAAAAAGCCCGTGTAGATGAAGAAGATGAAGATGATGAGGAAGACGAAGATGATATTGCACCATCGAGTTTTGGGTCTATTGAGCAGGAATCAAAGACAGATCAGCAGAAGGGAAAACCCGGCAAATCACCATTTTCTACAACTTCACTAGCATTTACTTCTAGCAGCCTTATCTCTGCGGTGAGTTGTGATTTTTCTCTTCTTCTACAACCATTGAGCAGTTTTATAAAGTTAAGACAACTAATATGCTACCAATTTTTGTATTATTCTTTGATTAAACAATTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGTTAGCTTACAGGTTATTTGACTCTTATTAACCCTTGTGTGTATGTGTGTTGACTTTTCTCACAATACAGATTTTAAGAATCACATGAGGCATGATGAATCATATTTTTGCAACAGAGAAATTATATTTTGACACAAAATTGACATACAAAATAATTGGTTAACGAACAACAAAGACATGGTGCATTATGTTCAGCAGATGGTTAACAGGTATAACAAGTATCGAAACTCATTAACCATTCATTGAATGTAATTAACCACAAATTCGATCAGTGGTTAATTACATTTAGTGAATGATTAATGAGTTTCATCATCTGTTATACTCATTAAACATTCATTGTACAGATAATTAACCACGTAGTTGAACTCAAGTGGTAACCAACTATTGGCATCAATTCTTGTGTCAAAGTATCATTCTTTTGCAATATTATTCAAATTACAATCACCAACTCTAAAGTTGAAATTAGGGTACTGCTTCACTGTCTGTTGCTCACAGATCATGTAACATTTCATTCCTTTAGTGTATATATGTTTTGTGAAGGCATATGAGATTGCTAGTGATTGTGTATAACTGTATATCTCGGTATGCTTGTAACACTGTGCCAAGGAGCAAAACATATGTCATGTTGGTCATCCTAATTGCACCTCATTTCAATATGTAGAATTGAAACTGTTTGAGTTGGTTATTAGCAAGTTCTTGAATATTTTATCGTTGTCATTTGGCTTTTCAGGTTCCATCAAAGCTGCAACAATCATTTCCATTCTGGAACAAGGTTGGATCAAAACCAGGGTTAGTTCCTGCGCAACACATTGATCACATCAGCGATGTGAAAACAGCTGGTTCAGTCAGTTTCCCTCCTGTGATTGGCCAAAAGGGTAGGCTGAAAGCCGTCGGTAAAGCACATGAAAAAGTTGAGTCAAGAAGTTATTCAGGTGGGAGATTTCTTGAGGCATCCTCTATGTCTCAGACTCGACCGTGTTATACGACTTCAAAAAGTAACTCAAAAGAGCGAAGAATGAGTGGCAACATGTGGCTGCATGCGGCACCAGAGAGGGATTTAGACAACATACTCTCTCTGCATTCAGCTTCATCAATGTACAATTTTTATCCAAACATCCAAAGAGAACCTCACTTCAAATTTAAGCTTTGA

Protein sequence

>MS.gene43086.t1

MFLLRRFQKPPPPSDSKNPSDSDSDSSSDAESETQDDLDVESYLNSFIAQNTEAPVPASEFDPEQNFKDVIEAYHSEKVQKYYDKKARRKVKHRNPFDFPPDDENWKEEDLRELWDNGNNTITGTGWDPAFATPEEWEYVKWKHYKGQDVPIAPFYLPYRKPIPPVPTNHSAIKGPKDVIEELDRIEEFLKWVSYVFEDGSTYEGTLWDDIAQGKGVYTSPDGLVRYEGEWFRNDPEGHGVIEVEVPVIEPVPGSKLEEAMRAEGKIIKRDFMSPEEREWLDKDIEDSYLLANGNFEVPYYERDEWVKEFGEKPEKGRYRYAGQMKHGRMHGCGVYEINDRIIYGRFYFGEILDDDEGCDDQTSALHAGIGEVAAAKARMFVNKPDGMVREKRGPYNDPQHAYLYEGEDVWMAPGFINQFYEVPDYWKTYAHEVDQEREMWLNSFYRSPLRIPMPAELEYWWSKEENNKPPEFVLLNKEPEPDPEDPSKLIYTEDPLILHTPTGFIINYVEDEKYGIRMFWQPPLQKGEKVDPKKAIFLPDGYDDFFEIDKNKKTVWERLKLAIEKVSKPWFDNLGKWAEEQKKISEMKKEALEKELELIEAELCLEEAIGDMEELLRRREKEEKKKAESGLPDEDDSGSVVKQDEKARVDEEDEDDEEDEDDIAPSSFGSIEQESKTDQQKGKPGKSPFSTTSLAFTSSSLISAVPSKLQQSFPFWNKVGSKPGLVPAQHIDHISDVKTAGSVSFPPVIGQKGRLKAVGKAHEKVESRSYSGGRFLEASSMSQTRPCYTTSKSNSKERRMSGNMWLHAAPERDLDNILSLHSASSMYNFYPNIQREPHFKFKL