AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004120.01


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MsG0180004120.01.T01 AT4G18710 33.670 297 173 8 24 311 46 327 4.32e-49 168
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MsG0180004120.01.T01 AT3G05840 32.082 293 183 6 24 311 79 360 9.72e-47 162
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MsG0180004120.01.T01 AT5G26751 32.082 293 183 6 24 311 75 356 3.90e-46 161
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MsG0180004120.01.T01 AT1G18150 34.967 306 174 12 22 314 108 401 1.27e-39 147
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MsG0180004120.01.T01 AT3G53930 27.835 291 171 9 23 310 25 279 1.18e-24 104
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MsG0180004120.01.T01 AT1G73460 28.115 313 185 11 22 308 862 1160 1.85e-24 104
MsG0180004120.01.T01 AT1G73450 28.115 313 185 11 22 308 845 1143 2.45e-24 103
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MsG0180004120.01.T01 AT4G24740 26.946 334 181 13 24 308 1 320 4.96e-24 100
MsG0180004120.01.T01 AT4G24740 26.946 334 181 13 24 308 1 320 4.96e-24 100
MsG0180004120.01.T01 AT4G24740 26.946 334 181 13 24 308 1 320 4.96e-24 100
MsG0180004120.01.T01 AT4G24740 27.164 335 181 13 23 308 103 423 5.35e-24 101
MsG0180004120.01.T01 AT2G40120 28.526 312 183 11 22 307 265 562 9.98e-24 101
MsG0180004120.01.T01 AT5G35980 35.776 232 119 10 24 243 128 341 1.15e-23 102
MsG0180004120.01.T01 AT5G35980 35.776 232 119 10 24 243 93 306 1.36e-23 101
MsG0180004120.01.T01 AT5G25110 29.316 307 161 12 11 308 38 297 1.44e-23 100
MsG0180004120.01.T01 AT5G35980 34.894 235 127 9 24 248 128 346 2.01e-23 101
MsG0180004120.01.T01 AT4G04700 27.645 293 170 9 22 307 32 289 3.65e-23 99.8
MsG0180004120.01.T01 AT2G45490 27.740 292 170 8 18 308 22 273 3.93e-23 97.1
MsG0180004120.01.T01 AT3G51850 27.243 301 169 9 23 314 59 318 6.85e-23 98.6
MsG0180004120.01.T01 AT3G53570 26.243 362 196 15 2 308 84 429 1.05e-22 98.2
MsG0180004120.01.T01 AT3G53570 26.243 362 196 15 2 308 84 429 1.05e-22 98.2
MsG0180004120.01.T01 AT3G53570 26.243 362 196 15 2 308 98 443 1.09e-22 98.2
MsG0180004120.01.T01 AT3G53570 26.243 362 196 15 2 308 98 443 1.09e-22 98.2
MsG0180004120.01.T01 AT3G53570 26.243 362 196 15 2 308 98 443 1.09e-22 98.2
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MsG0180004120.01.T01 AT3G51850 27.243 301 169 9 23 314 59 318 4.65e-22 96.7
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MsG0180004120.01.T01 AT5G19450 27.597 308 159 8 23 314 62 321 1.02e-21 95.9
MsG0180004120.01.T01 AT4G14580 30.493 223 131 8 2 216 7 213 2.09e-21 94.4
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MsG0180004120.01.T01 AT3G01090 30.508 295 147 15 24 308 25 271 2.09e-21 94.7
MsG0180004120.01.T01 AT3G01090 30.640 297 144 15 24 308 48 294 2.45e-21 94.7
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MsG0180004120.01.T01 AT1G53570 25.081 307 184 12 13 313 209 475 2.29e-20 92.0
MsG0180004120.01.T01 AT1G53570 25.081 307 184 12 13 313 209 475 2.52e-20 92.0
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MsG0180004120.01.T01 AT4G28980 34.969 163 85 5 18 173 21 169 5.45e-18 84.7
MsG0180004120.01.T01 AT4G28980 32.558 129 84 1 183 308 290 418 3.33e-20 91.3
MsG0180004120.01.T01 AT4G28980 34.969 163 85 5 18 173 21 169 5.45e-18 84.7
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MsG0180004120.01.T01 AT5G39440 29.153 295 154 13 24 310 25 272 4.20e-20 90.9
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MsG0180004120.01.T01 AT4G24740 28.514 249 136 8 23 243 103 337 1.49e-19 88.2
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MsG0180004120.01.T01 AT4G24740 28.226 248 136 8 24 243 1 234 1.68e-19 86.3
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MsG0180004120.01.T01 AT4G04720 26.531 294 170 10 22 308 84 338 3.25e-19 88.6
MsG0180004120.01.T01 AT3G25840 27.628 333 182 15 18 308 617 932 3.51e-19 88.6
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MsG0180004120.01.T01 AT2G35890 26.471 306 173 9 15 310 129 392 4.67e-19 87.8
MsG0180004120.01.T01 AT1G49180 31.818 220 135 7 22 238 11 218 6.13e-19 87.0
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MsG0180004120.01.T01 AT4G21940 26.441 295 169 11 22 308 106 360 9.82e-19 87.0
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MsG0180004120.01.T01 AT3G29160 28.713 303 154 15 24 316 26 276 2.62e-18 85.9
MsG0180004120.01.T01 AT1G08650 24.068 295 186 11 18 310 15 273 3.00e-18 83.6
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MsG0180004120.01.T01 AT1G54960 25.685 292 173 10 24 307 74 329 1.38e-17 84.0
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MsG0180004120.01.T01 AT4G04740 26.316 285 160 9 33 308 84 327 1.52e-17 83.6
MsG0180004120.01.T01 AT4G04740 26.316 285 160 9 33 308 84 327 1.52e-17 83.6
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MsG0180004120.01.T01 AT4G04740 26.316 285 160 9 33 308 84 327 1.52e-17 83.6
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MsG0180004120.01.T01 AT1G50700 25.633 316 181 12 1 308 62 331 2.28e-17 83.2
MsG0180004120.01.T01 AT1G50700 25.633 316 181 12 1 308 62 331 2.29e-17 82.8
MsG0180004120.01.T01 AT2G38490 32.178 202 111 8 24 216 34 218 2.42e-17 82.4
MsG0180004120.01.T01 AT5G55090 27.953 254 141 13 64 313 46 261 2.63e-17 82.4
MsG0180004120.01.T01 AT5G40540 30.769 221 132 8 23 233 31 240 2.85e-17 80.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G24430 27.668 253 139 10 64 310 193 407 3.01e-17 82.8
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MsG0180004120.01.T01 AT5G40540 30.769 221 132 8 23 233 31 240 4.51e-17 81.3
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MsG0180004120.01.T01 AT5G01850 31.674 221 130 8 23 233 23 232 4.83e-17 80.9
MsG0180004120.01.T01 AT3G07980 25.694 288 176 10 22 308 24 274 4.99e-17 82.4
MsG0180004120.01.T01 AT1G48490 26.524 328 172 15 16 312 827 1116 5.28e-17 82.4
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MsG0180004120.01.T01 AT1G48490 26.524 328 172 15 16 312 826 1115 5.33e-17 82.4
MsG0180004120.01.T01 AT1G48490 26.524 328 172 15 16 312 826 1115 5.33e-17 82.4
MsG0180004120.01.T01 AT1G73500 26.263 297 180 8 18 310 47 308 5.75e-17 80.5
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MsG0180004120.01.T01 AT2G25880 27.027 296 167 11 18 308 25 276 8.07e-17 79.7
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MsG0180004120.01.T01 AT3G20410 26.246 301 162 12 22 308 95 349 8.20e-17 81.3
MsG0180004120.01.T01 AT1G30270 27.027 296 159 13 24 308 37 286 8.24e-17 81.3
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MsG0180004120.01.T01 AT1G13350 29.362 235 140 10 16 238 440 660 8.65e-17 81.6
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MsG0180004120.01.T01 AT3G08720 31.064 235 147 10 2 234 125 346 1.14e-16 80.9
MsG0180004120.01.T01 AT3G08720 31.064 235 147 10 2 234 125 346 1.14e-16 80.9
MsG0180004120.01.T01 AT3G08720 31.064 235 147 10 2 234 125 346 1.14e-16 80.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G57630 30.144 209 123 8 18 220 12 203 1.16e-16 80.5
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MsG0180004120.01.T01 AT2G26980 27.891 294 159 12 24 308 30 279 1.28e-16 80.5
MsG0180004120.01.T01 AT5G57630 30.144 209 123 8 18 220 12 203 1.29e-16 80.1
MsG0180004120.01.T01 AT1G09000 26.756 299 175 13 17 307 68 330 1.29e-16 80.9
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MsG0180004120.01.T01 AT1G01140 30.435 207 121 10 18 216 19 210 2.86e-16 79.3
MsG0180004120.01.T01 AT2G38910 25.987 304 171 12 15 307 131 391 2.90e-16 79.7
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MsG0180004120.01.T01 AT3G59410 26.984 252 128 7 18 219 426 671 3.17e-16 80.1
MsG0180004120.01.T01 AT3G59410 26.984 252 128 7 18 219 425 670 3.23e-16 80.1
MsG0180004120.01.T01 AT3G59410 26.984 252 128 7 18 219 425 670 3.23e-16 80.1
MsG0180004120.01.T01 AT5G19360 26.710 307 167 10 15 308 65 326 3.61e-16 79.3
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MsG0180004120.01.T01 AT3G08730 30.317 221 140 9 16 234 132 340 1.02e-15 77.8
MsG0180004120.01.T01 AT5G21326 32.159 227 128 10 18 235 13 222 1.08e-15 77.8
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MsG0180004120.01.T01 AT3G10660 25.566 309 166 11 15 307 183 443 1.49e-15 77.8
MsG0180004120.01.T01 AT3G17510 30.328 244 143 11 24 257 26 252 1.82e-15 77.0
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MsG0180004120.01.T01 AT3G45240 25.658 304 171 13 18 308 108 369 2.00e-15 76.6
MsG0180004120.01.T01 AT3G63260 31.818 220 112 11 27 215 92 304 2.18e-15 76.3
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MsG0180004120.01.T01 AT3G21220 25.325 308 184 13 8 308 57 325 2.63e-15 75.9
MsG0180004120.01.T01 AT4G38230 27.832 309 165 13 13 308 19 282 3.92e-15 76.3
MsG0180004120.01.T01 AT4G38230 27.832 309 165 13 13 308 19 282 3.92e-15 76.3
MsG0180004120.01.T01 AT4G38230 27.832 309 165 13 13 308 49 312 4.28e-15 76.3
MsG0180004120.01.T01 AT3G63260 30.909 220 114 10 27 215 92 304 4.59e-15 75.5
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MsG0180004120.01.T01 AT5G66850 24.055 291 174 11 24 305 352 604 1.48e-14 74.7
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MsG0180004120.01.T01 AT1G53165 25.962 208 143 5 13 220 10 206 4.88e-14 73.2
MsG0180004120.01.T01 AT1G53570 22.476 307 166 11 13 313 209 449 5.56e-14 72.8
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MsG0180004120.01.T01 AT5G21222 30.594 219 130 10 24 235 19 222 8.32e-14 72.4
MsG0180004120.01.T01 AT5G21222 30.594 219 130 10 24 235 19 222 8.32e-14 72.4
MsG0180004120.01.T01 AT5G21222 30.594 219 130 10 24 235 19 222 8.32e-14 72.4
MsG0180004120.01.T01 AT5G21222 30.594 219 130 10 24 235 19 222 8.32e-14 72.4
MsG0180004120.01.T01 AT4G04710 24.291 247 146 8 65 308 70 278 1.03e-13 72.0
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MsG0180004120.01.T01 AT2G17290 26.756 299 161 12 23 308 90 343 1.08e-13 72.0
MsG0180004120.01.T01 AT5G66710 28.958 259 157 10 24 268 77 322 1.19e-13 71.6
MsG0180004120.01.T01 AT1G29740 30.357 224 138 11 14 231 673 884 1.26e-13 72.0
MsG0180004120.01.T01 AT1G29740 30.660 212 131 10 14 221 673 872 1.29e-13 72.0
MsG0180004120.01.T01 AT3G01490 29.032 217 123 10 24 215 114 324 2.06e-13 70.5
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MsG0180004120.01.T01 AT5G57035 32.906 234 106 14 11 221 418 623 2.36e-13 71.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G35310 24.832 298 168 9 23 308 102 355 2.98e-13 70.5
MsG0180004120.01.T01 AT4G35310 24.832 298 168 9 23 308 102 355 2.98e-13 70.5
MsG0180004120.01.T01 AT2G34290 27.660 235 149 9 24 246 7 232 3.13e-13 68.9
MsG0180004120.01.T01 AT3G01490 29.032 217 123 10 24 215 114 324 3.24e-13 70.1
MsG0180004120.01.T01 AT4G14480 23.779 307 198 10 16 310 13 295 4.34e-13 70.1
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MsG0180004120.01.T01 AT1G29730 27.615 239 150 11 14 243 669 893 5.10e-13 70.1
MsG0180004120.01.T01 AT1G29730 27.570 214 136 9 14 221 636 836 8.47e-13 69.7
MsG0180004120.01.T01 AT4G38830 28.151 238 150 11 8 236 334 559 9.33e-13 69.3
MsG0180004120.01.T01 AT5G42440 27.273 220 146 9 7 222 70 279 9.65e-13 68.6
MsG0180004120.01.T01 AT1G29730 28.037 214 134 10 14 221 669 868 9.79e-13 69.3
MsG0180004120.01.T01 AT4G36070 25.087 287 179 9 24 307 77 330 1.27e-12 68.6
MsG0180004120.01.T01 AT4G36070 25.087 287 179 9 24 307 77 330 1.64e-12 68.6
MsG0180004120.01.T01 AT5G07070 28.571 238 144 10 16 246 10 228 1.70e-12 68.2
MsG0180004120.01.T01 AT2G43690 26.512 215 135 11 11 214 294 496 1.82e-12 68.2
MsG0180004120.01.T01 AT2G43690 26.512 215 135 11 11 214 330 532 1.83e-12 68.6
MsG0180004120.01.T01 AT2G43690 26.512 215 135 11 11 214 330 532 1.83e-12 68.6
MsG0180004120.01.T01 AT4G33950 24.333 300 189 11 11 308 14 277 1.86e-12 67.4
MsG0180004120.01.T01 AT3G59740 28.767 219 135 11 11 220 326 532 1.91e-12 68.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G33950 24.333 300 189 11 11 308 14 277 1.93e-12 67.8
MsG0180004120.01.T01 AT5G27790 27.160 243 145 11 25 246 27 258 1.93e-12 67.4
MsG0180004120.01.T01 AT1G68830 27.358 212 112 8 126 309 256 453 2.24e-12 68.2
MsG0180004120.01.T01 AT5G57630 36.111 108 57 4 119 221 16 116 3.47e-12 66.6
MsG0180004120.01.T01 AT1G18390 28.638 213 134 10 14 221 340 539 3.47e-12 67.4
MsG0180004120.01.T01 AT1G70520 30.516 213 131 11 14 221 321 521 3.69e-12 67.4
MsG0180004120.01.T01 AT1G18390 28.505 214 135 10 14 222 334 534 4.08e-12 67.4
MsG0180004120.01.T01 AT5G28290 26.761 213 144 7 16 228 2 202 5.51e-12 66.6
MsG0180004120.01.T01 AT1G66460 28.319 226 134 10 11 221 149 361 5.52e-12 66.6
MsG0180004120.01.T01 AT1G66460 28.319 226 134 10 11 221 122 334 6.02e-12 66.6
MsG0180004120.01.T01 AT5G28290 26.761 213 144 7 16 228 2 202 6.77e-12 66.6
MsG0180004120.01.T01 AT5G28290 26.761 213 144 7 16 228 2 202 6.77e-12 66.6
MsG0180004120.01.T01 AT5G66210 24.567 289 178 8 24 307 68 321 7.20e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G23240 30.841 214 130 11 13 220 23 224 7.35e-12 65.9
MsG0180004120.01.T01 AT4G31170 27.174 276 172 13 25 288 138 396 7.68e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G31170 27.174 276 172 13 25 288 138 396 7.68e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G31170 27.174 276 172 13 25 288 138 396 7.68e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G31170 27.174 276 172 13 25 288 138 396 7.68e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G31170 27.174 276 172 13 25 288 138 396 7.68e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G31170 27.174 276 172 13 25 288 138 396 7.68e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G31170 27.174 276 172 13 25 288 138 396 7.68e-12 66.2
MsG0180004120.01.T01 AT5G66210 24.221 289 179 8 24 307 68 321 9.17e-12 65.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G55560 26.102 295 176 12 22 311 35 292 9.30e-12 65.1
MsG0180004120.01.T01 AT2G23450 30.698 215 127 12 14 221 344 543 1.15e-11 65.9
MsG0180004120.01.T01 AT2G23450 30.698 215 127 12 14 221 344 543 1.15e-11 65.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G66210 24.221 289 179 8 24 307 68 321 1.18e-11 65.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G66210 24.221 289 179 8 24 307 68 321 1.18e-11 65.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G66210 24.221 289 179 8 24 307 68 321 1.23e-11 65.5
MsG0180004120.01.T01 AT5G66210 24.221 289 179 8 24 307 68 321 1.23e-11 65.5
MsG0180004120.01.T01 AT1G70110 28.279 244 153 12 14 249 340 569 1.29e-11 65.9
MsG0180004120.01.T01 AT3G59750 29.224 219 131 13 11 220 296 499 1.60e-11 65.5
MsG0180004120.01.T01 AT5G40440 23.158 285 183 9 24 307 7 256 1.69e-11 65.1
MsG0180004120.01.T01 AT3G59730 30.457 197 115 12 11 197 328 512 1.73e-11 65.1
MsG0180004120.01.T01 AT3G21630 29.767 215 122 12 14 221 318 510 1.74e-11 65.5
MsG0180004120.01.T01 AT4G18950 27.820 266 155 16 18 267 160 404 1.76e-11 65.1
MsG0180004120.01.T01 AT1G07650 27.149 221 144 10 7 221 454 663 2.00e-11 65.5
MsG0180004120.01.T01 AT2G05060 26.977 215 132 10 20 221 15 217 2.15e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT1G07650 27.149 221 144 10 7 221 667 876 2.30e-11 65.1
MsG0180004120.01.T01 AT5G40440 23.158 285 183 9 24 307 89 338 2.30e-11 64.7
MsG0180004120.01.T01 AT5G40440 23.158 285 183 9 24 307 89 338 2.30e-11 64.7
MsG0180004120.01.T01 AT1G07650 27.149 221 144 10 7 221 673 882 2.41e-11 65.1
MsG0180004120.01.T01 AT4G18950 27.863 262 160 15 18 267 160 404 2.42e-11 64.7
MsG0180004120.01.T01 AT1G07650 27.149 221 144 10 7 221 641 850 2.62e-11 65.1
MsG0180004120.01.T01 AT4G23240 30.841 214 130 11 13 220 330 531 2.65e-11 64.7
MsG0180004120.01.T01 AT4G11530 27.586 261 165 14 7 255 341 589 2.67e-11 64.7
MsG0180004120.01.T01 AT2G24360 25.556 270 180 12 25 286 137 393 2.71e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT5G66880 27.805 205 132 7 11 213 15 205 2.95e-11 63.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G66880 27.805 205 132 7 11 213 15 205 2.95e-11 63.9
MsG0180004120.01.T01 AT5G40440 23.158 285 183 9 24 307 71 320 3.01e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT5G40440 23.158 285 183 9 24 307 71 320 3.01e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT5G40440 23.158 285 183 9 24 307 71 320 3.01e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT4G29050 27.830 212 136 10 14 220 340 539 3.14e-11 64.7
MsG0180004120.01.T01 AT5G40540 32.090 134 81 3 107 233 13 143 3.45e-11 63.2
MsG0180004120.01.T01 AT4G29050 27.830 212 136 10 14 220 354 553 3.62e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT1G70130 28.723 188 118 9 14 196 330 506 3.66e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT1G14000 28.261 230 143 11 18 238 162 378 3.88e-11 63.9
MsG0180004120.01.T01 AT1G30570 27.111 225 130 12 7 214 509 716 3.91e-11 64.3
MsG0180004120.01.T01 AT5G12090 27.700 213 127 9 24 221 33 233 4.81e-11 63.5
MsG0180004120.01.T01 AT5G40540 32.090 134 81 3 107 233 34 164 5.01e-11 62.8
MsG0180004120.01.T01 AT3G50500 26.540 211 134 7 11 213 16 213 6.51e-11 63.2
MsG0180004120.01.T01 AT3G04810 23.841 302 193 10 16 316 2 267 6.97e-11 63.5
MsG0180004120.01.T01 AT3G04810 23.841 302 193 10 16 316 2 267 6.97e-11 63.5
MsG0180004120.01.T01 AT3G04810 23.841 302 193 10 16 316 2 267 6.97e-11 63.5
MsG0180004120.01.T01 AT4G04510 26.941 219 140 11 10 221 331 536 7.80e-11 63.5
MsG0180004120.01.T01 AT4G04510 26.941 219 140 11 10 221 333 538 8.02e-11 63.2
MsG0180004120.01.T01 AT3G51630 25.234 214 126 7 22 221 29 222 8.78e-11 63.2
MsG0180004120.01.T01 AT3G51630 25.234 214 126 7 22 221 29 222 8.78e-11 63.2

Find 105 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 173 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTGAATCGATTGAGAAAATT+AGG 0.145462 1:-73663123 None:intergenic
TGTTACCTATAATGAGTAAT+TGG 0.245252 1:+73665292 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR
AGGGAAAACTGTGTTGTATT+TGG 0.254189 1:+73663509 MsG0180004120.01.T01:CDS
AGTTGTGGATTGTAAGGATT+TGG 0.278772 1:+73665190 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR
TAGAGCACCTGAAGTCCTTT+TGG 0.299747 1:+73664495 MsG0180004120.01.T01:CDS
TTAGGTTCCAAATGTTGTTT+TGG 0.308137 1:+73665072 MsG0180004120.01.T01:exon
CTCCATATATTCAGGCTGTT+GGG 0.312010 1:+73664735 MsG0180004120.01.T01:CDS
CCTAAATCCAAAACAACATT+TGG 0.322764 1:-73665079 None:intergenic
TCCCCAACAGCCTGAATATA+TGG 0.326670 1:-73664737 None:intergenic
GAAGCCTCACAATCTCTTGA+TGG 0.351282 1:+73663895 MsG0180004120.01.T01:CDS
CCTGGACAAGACCCATCTTT+AGG 0.351715 1:+73665054 MsG0180004120.01.T01:CDS
ATGCTCAAAATTGCTGATCT+TGG 0.357134 1:+73663932 MsG0180004120.01.T01:CDS
AAGAAATTAACATACTTTGA+TGG 0.359794 1:-73663610 None:intergenic
CGATTGAGAAAATTAGGGTT+AGG 0.361330 1:-73663117 None:intergenic
GTTAGGGTTTGGTCTGAAAA+GGG 0.364750 1:-73663100 None:intergenic
CACTCCAGCCTCTTCCAAAC+CGG 0.371498 1:-73664853 None:intergenic
ATCCACAGCCATTGAGTAAT+GGG 0.373122 1:-73664524 None:intergenic
CGATAAAGTTGTGGATTGTA+AGG 0.374390 1:+73665184 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR
TGAATCGATTGAGAAAATTA+GGG 0.375132 1:-73663122 None:intergenic
AGTCTTTCAAAGGCTGTTCC+CGG 0.376313 1:+73664834 MsG0180004120.01.T01:CDS
TTCAAAGGCTGTTCCCGGTT+TGG 0.378251 1:+73664839 MsG0180004120.01.T01:CDS
GCGCATATCCTAGTCTGTTA+TGG 0.383269 1:+73665125 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR
TAGAACCAATTACTCATTAT+AGG 0.386710 1:-73665297 None:intergenic
GGATTGTAAGGATTTGGATT+TGG 0.388356 1:+73665196 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR
ATTAACATACTTTGATGGTT+GGG 0.393821 1:-73663605 None:intergenic
ACCAAGACAGCACTATTTCC+TGG 0.394698 1:+73664690 MsG0180004120.01.T01:CDS
CGCATATCCTAGTCTGTTAT+GGG 0.396274 1:+73665126 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR
AACAATCGCAGTAGTGTTAT+CGG 0.409220 1:+73663165 MsG0180004120.01.T01:CDS
AGAGCAAGAGAGAAAGCAAC+TGG 0.414266 1:+73663247 MsG0180004120.01.T01:CDS
CCTGGCCATACATCTTCATT+AGG 0.436852 1:-73664762 None:intergenic
TTTCTCAATCGATTCAATCA+TGG 0.437741 1:+73663129 MsG0180004120.01.T01:exon
GATTGAGAAAATTAGGGTTA+GGG 0.438611 1:-73663116 None:intergenic
GGTTAGGGTTTGGTCTGAAA+AGG 0.439775 1:-73663101 None:intergenic
AGAAAATTAGGGTTAGGGTT+TGG 0.442106 1:-73663111 None:intergenic
GAAACCTCACGAAGCGTAGT+AGG 0.445329 1:-73663325 None:intergenic
CTCGTGATCCACATGTTGTT+AGG 0.447501 1:+73663365 MsG0180004120.01.T01:CDS
AATTAACATACTTTGATGGT+TGG 0.452118 1:-73663606 None:intergenic
ACAGCCTTTGAAAGACTTTG+AGG 0.462530 1:-73664828 None:intergenic
CAACATTTGGAACCTAAAGA+TGG 0.462613 1:-73665066 None:intergenic
CCTCCATATATTCAGGCTGT+TGG 0.463474 1:+73664734 MsG0180004120.01.T01:CDS
CTTTGCAGATAGCCGCTTGG+AGG 0.464613 1:-73665002 None:intergenic
TTGTCCAGGTCATCAAAGTA+AGG 0.465733 1:-73665040 None:intergenic
TTAACATACTTTGATGGTTG+GGG 0.473395 1:-73663604 None:intergenic
ACCAGGAAATAGTGCTGTCT+TGG 0.474278 1:-73664691 None:intergenic
TCCATATATTCAGGCTGTTG+GGG 0.477775 1:+73664736 MsG0180004120.01.T01:CDS
GGCTGTTCCCGGTTTGGAAG+AGG 0.484179 1:+73664845 MsG0180004120.01.T01:CDS
TCATGAGTGTACTTCTTAAG+TGG 0.486847 1:-73663977 None:intergenic
AAGGGCGTTGCTTTCTGCCA+TGG 0.488451 1:+73663739 MsG0180004120.01.T01:CDS
TTCGAGAAGCTCGAGAAAGT+TGG 0.492147 1:+73663199 MsG0180004120.01.T01:CDS
CCTAAAGATGGGTCTTGTCC+AGG 0.498534 1:-73665054 None:intergenic
AAACAAGGGCAGAACAAAGA+AGG 0.504254 1:+73663489 MsG0180004120.01.T01:CDS
GTTGCTTTCTGCCATGGTCA+TGG 0.505140 1:+73663745 MsG0180004120.01.T01:CDS
CTCACAATCTCTTGATGGAC+CGG 0.505227 1:+73663900 MsG0180004120.01.T01:CDS
TTTGATGTATCAACTTTGCA+AGG 0.507138 1:+73663720 MsG0180004120.01.T01:CDS
GTGTTAGTAAACTAATGAAC+TGG 0.511341 1:+73664784 MsG0180004120.01.T01:CDS
CCTAATGAAGATGTATGGCC+AGG 0.513456 1:+73664762 MsG0180004120.01.T01:CDS
TATCCACAGCCATTGAGTAA+TGG 0.513492 1:-73664525 None:intergenic
AACAACTCCTCCATATATTC+AGG 0.513781 1:+73664727 MsG0180004120.01.T01:CDS
CTGATCTTAAGAAATTCATT+CGG 0.515537 1:+73663550 MsG0180004120.01.T01:CDS
TTAGGGTTTGGTCTGAAAAG+GGG 0.527053 1:-73663099 None:intergenic
CGCAGTAGTGTTATCGGCGA+AGG 0.529473 1:+73663171 MsG0180004120.01.T01:CDS
CTTCAGGTGCTCTATACCAC+AGG 0.530773 1:-73664486 None:intergenic
GTTCCCGGTTTGGAAGAGGC+TGG 0.534573 1:+73664849 MsG0180004120.01.T01:CDS
ACACCCTTACTTTGATGACC+TGG 0.537803 1:+73665036 MsG0180004120.01.T01:CDS
CGGTCCATCAAGAGATTGTG+AGG 0.543109 1:-73663899 None:intergenic
GGACTCCTAATGAAGATGTA+TGG 0.544602 1:+73664757 MsG0180004120.01.T01:CDS
ACTCAATGGCTGTGGATATG+TGG 0.550400 1:+73664530 MsG0180004120.01.T01:CDS
GCTATCTGCAAAGAAAGCTA+TGG 0.553690 1:+73665012 MsG0180004120.01.T01:CDS
TATATCCTTACCGAAAATGC+AGG 0.555044 1:-73664560 None:intergenic
AAAGTTGGAGAAGGAACGTA+CGG 0.556510 1:+73663214 MsG0180004120.01.T01:CDS
CGTCTTCATGAAGATGATGA+AGG 0.573237 1:+73663295 MsG0180004120.01.T01:CDS
TTCATTAGTTTACTAACACC+TGG 0.576045 1:-73664780 None:intergenic
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TTTGCAGATAGCCGCTTGGA+GGG 0.580816 1:-73665001 None:intergenic
AACATTTGGAACCTAAAGAT+GGG 0.581244 1:-73665065 None:intergenic
TCCTCCTACTACGCTTCGTG+AGG 0.581493 1:+73663321 MsG0180004120.01.T01:CDS
GGGTCCTCAAAGTCTTTCAA+AGG 0.583882 1:+73664824 MsG0180004120.01.T01:CDS
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ACCTCACGAAGCGTAGTAGG+AGG 0.589968 1:-73663322 None:intergenic
TTTCTTTGCAGATAGCCGCT+TGG 0.594183 1:-73665005 None:intergenic
GATTCAATCATGGAGAAACC+TGG 0.594726 1:+73663139 MsG0180004120.01.T01:exon
TTGATGTATCAACTTTGCAA+GGG 0.602836 1:+73663721 MsG0180004120.01.T01:CDS
CTAACTTACCTAACAACATG+TGG 0.603548 1:-73663373 None:intergenic
AACAAGGGCAGAACAAAGAA+GGG 0.608677 1:+73663490 MsG0180004120.01.T01:CDS
GACTTTGAGGACCCCACTGA+GGG 0.608862 1:-73664815 None:intergenic
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TAACATACTTTGATGGTTGG+GGG 0.617575 1:-73663603 None:intergenic
AAGCTCGAGAAAGTTGGAGA+AGG 0.620572 1:+73663205 MsG0180004120.01.T01:CDS
ACTACTGCGATTGTTTCACC+AGG 0.624752 1:-73663157 None:intergenic
AGGTTGTTGGATGTGAAACA+AGG 0.625183 1:+73663474 MsG0180004120.01.T01:intron
TGTTGCAGCTCAGAATCACC+AGG 0.633045 1:-73664708 None:intergenic
TGCAATATGAGCCCTCCAAG+CGG 0.645908 1:+73664990 MsG0180004120.01.T01:CDS
TGGAGAAGGAACGTACGGGA+AGG 0.646655 1:+73663219 MsG0180004120.01.T01:CDS
TGTCCAGGTCATCAAAGTAA+GGG 0.650303 1:-73665039 None:intergenic
TGTGCAAAATTCCATGACCA+TGG 0.663401 1:-73663756 None:intergenic
CCAACAGCCTGAATATATGG+AGG 0.669190 1:-73664734 None:intergenic
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GGTTGTTGGATGTGAAACAA+GGG 0.673189 1:+73663475 MsG0180004120.01.T01:intron
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AAGTTGGAGAAGGAACGTAC+GGG 0.694013 1:+73663215 MsG0180004120.01.T01:CDS
TTCAGGTGCTCTATACCACA+GGG 0.710381 1:-73664485 None:intergenic
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!!! AAGATTTAAGATATAAGATT+GGG + Chr1:73663851-73663870 MsG0180004120.01.T01:intron 15.0%
!!! CATTTCATTTATTTTGTAAA+TGG + Chr1:73663785-73663804 MsG0180004120.01.T01:intron 15.0%
!!! TAAGATTTAAGATATAAGAT+TGG + Chr1:73663850-73663869 MsG0180004120.01.T01:intron 15.0%
!! AACATCGTTAAAATAGAAAA+AGG - Chr1:73664937-73664956 None:intergenic 20.0%
!! AAGAAATTAACATACTTTGA+TGG - Chr1:73663613-73663632 None:intergenic 20.0%
!! AGAAAATGTTAAGTAATCAA+CGG - Chr1:73664902-73664921 None:intergenic 20.0%
!! ATTTCAGTTTCAATTTCAAT+TGG + Chr1:73663412-73663431 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!! CGAATACAAAAAAAATAAGA+CGG - Chr1:73665166-73665185 None:intergenic 20.0%
!! GAATACAAAAAAAATAAGAC+GGG - Chr1:73665165-73665184 None:intergenic 20.0%
!!! AATTTTGTGGATTTGATTTT+AGG + Chr1:73663696-73663715 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!!! ACTTAACATTTTCTATTAAC+TGG + Chr1:73664908-73664927 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTGGTAATTGATAATTTTG+TGG + Chr1:73663683-73663702 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTTGTGGATTTGATTTTA+GGG + Chr1:73663697-73663716 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!!! CAGTTTTTTATGCAATTAAT+TGG + Chr1:73663665-73663684 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!!! GTTGATTTTGTGAATTTTTT+TGG + Chr1:73663447-73663466 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTCAATTGGATTTGAAATT+AGG + Chr1:73663425-73663444 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTAATCTGATTTTTCATC+TGG + Chr1:73664647-73664666 MsG0180004120.01.T01:intron 20.0%
! AAAATGTTAAGTAATCAACG+GGG - Chr1:73664900-73664919 None:intergenic 25.0%
! AATAGACAAGTATGTGTTAT+AGG + Chr1:73664101-73664120 MsG0180004120.01.T01:intron 25.0%
! ACTGAAATTGAAAGCAATTT+AGG - Chr1:73663400-73663419 None:intergenic 25.0%
! ATTGGGTCTTTATTATTGAA+GGG + Chr1:73663868-73663887 MsG0180004120.01.T01:intron 25.0%
! CTGAAATTGAAAGCAATTTA+GGG - Chr1:73663399-73663418 None:intergenic 25.0%
! CTGATCTTAAGAAATTCATT+CGG + Chr1:73663550-73663569 MsG0180004120.01.T01:CDS 25.0%
! GAAAATGTTAAGTAATCAAC+GGG - Chr1:73664901-73664920 None:intergenic 25.0%
! TAGAACCAATTACTCATTAT+AGG - Chr1:73665300-73665319 None:intergenic 25.0%
! TGAATCGATTGAGAAAATTA+GGG - Chr1:73663125-73663144 None:intergenic 25.0%
! TGTTACCTATAATGAGTAAT+TGG + Chr1:73665292-73665311 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! TTGAATCGATTGAGAAAATT+AGG - Chr1:73663126-73663145 None:intergenic 25.0%
!! AATTAACATACTTTGATGGT+TGG - Chr1:73663609-73663628 None:intergenic 25.0%
!! ATTAACATACTTTGATGGTT+GGG - Chr1:73663608-73663627 None:intergenic 25.0%
!! ATTTTGTTCAACCAAGTAAA+GGG + Chr1:73664582-73664601 MsG0180004120.01.T01:intron 25.0%
!! TATTTTGTTCAACCAAGTAA+AGG + Chr1:73664581-73664600 MsG0180004120.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTGTATTCGATAAAGTTG+TGG + Chr1:73665175-73665194 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! TTGTGAATTTTTTTGGTGTT+AGG + Chr1:73663454-73663473 MsG0180004120.01.T01:intron 25.0%
AAACTATTTCATCAAAGCTC+TGG - Chr1:73664035-73664054 None:intergenic 30.0%
CCTAAATCCAAAACAACATT+TGG - Chr1:73665082-73665101 None:intergenic 30.0%
GATTGAGAAAATTAGGGTTA+GGG - Chr1:73663119-73663138 None:intergenic 30.0%
GATTGGGTCTTTATTATTGA+AGG + Chr1:73663867-73663886 MsG0180004120.01.T01:intron 30.0%
GTAACAGAGTCATACATTAT+TGG + Chr1:73664001-73664020 MsG0180004120.01.T01:intron 30.0%
GTGTTAGTAAACTAATGAAC+TGG + Chr1:73664784-73664803 MsG0180004120.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTGTTTATCTTACAGCA+GGG + Chr1:73664620-73664639 MsG0180004120.01.T01:intron 30.0%
TTGATGTATCAACTTTGCAA+GGG + Chr1:73663721-73663740 MsG0180004120.01.T01:CDS 30.0%
TTGTGTTGTATAAGATGAGA+TGG + Chr1:73664236-73664255 MsG0180004120.01.T01:intron 30.0%
TTGTTTGTTTATCTTACAGC+AGG + Chr1:73664619-73664638 MsG0180004120.01.T01:intron 30.0%
TTTGATGTATCAACTTTGCA+AGG + Chr1:73663720-73663739 MsG0180004120.01.T01:CDS 30.0%
! AACATTTGGAACCTAAAGAT+GGG - Chr1:73665068-73665087 None:intergenic 30.0%
! GTGTTGTGTTTTACTATGTT+AGG + Chr1:73664138-73664157 MsG0180004120.01.T01:intron 30.0%
! TTAACATACTTTGATGGTTG+GGG - Chr1:73663607-73663626 None:intergenic 30.0%
! TTCATTAGTTTACTAACACC+TGG - Chr1:73664783-73664802 None:intergenic 30.0%
! TTTCTCAATCGATTCAATCA+TGG + Chr1:73663129-73663148 MsG0180004120.01.T01:exon 30.0%
! TTTTGAGCATCATTGTTTTC+CGG - Chr1:73663922-73663941 None:intergenic 30.0%
!! TTAGGTTCCAAATGTTGTTT+TGG + Chr1:73665072-73665091 MsG0180004120.01.T01:exon 30.0%
!!! CCAAATGTTGTTTTGGATTT+AGG + Chr1:73665079-73665098 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!!! GTATTTGGTTTTTGAGTACA+TGG + Chr1:73663524-73663543 MsG0180004120.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTTGGTGTTAGGTTGT+TGG + Chr1:73663461-73663480 MsG0180004120.01.T01:intron 30.0%
AACAACTCCTCCATATATTC+AGG + Chr1:73664727-73664746 MsG0180004120.01.T01:CDS 35.0%
AACAATCGCAGTAGTGTTAT+CGG + Chr1:73663165-73663184 MsG0180004120.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAATTAGGGTTAGGGTT+TGG - Chr1:73663114-73663133 None:intergenic 35.0%
AGGGAAAACTGTGTTGTATT+TGG + Chr1:73663509-73663528 MsG0180004120.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTCAAAATTGCTGATCT+TGG + Chr1:73663932-73663951 MsG0180004120.01.T01:CDS 35.0%
CGATTGAGAAAATTAGGGTT+AGG - Chr1:73663120-73663139 None:intergenic 35.0%
CTAACTTACCTAACAACATG+TGG - Chr1:73663376-73663395 None:intergenic 35.0%
CTAAGAAATAGCCCTTTACT+TGG - Chr1:73664596-73664615 None:intergenic 35.0%
GACAAGTATGTGTTATAGGA+TGG + Chr1:73664105-73664124 MsG0180004120.01.T01:intron 35.0%
GGATTGTAAGGATTTGGATT+TGG + Chr1:73665196-73665215 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TAATCATCCCATAACAGACT+AGG - Chr1:73665136-73665155 None:intergenic 35.0%
TATATCCTTACCGAAAATGC+AGG - Chr1:73664563-73664582 None:intergenic 35.0%
TCATGAGTGTACTTCTTAAG+TGG - Chr1:73663980-73663999 None:intergenic 35.0%
TGTGTTGTGTTTACTGTGTT+AGG + Chr1:73664268-73664287 MsG0180004120.01.T01:intron 35.0%
! ACTTAAGAAGTACACTCATG+AGG + Chr1:73663979-73663998 MsG0180004120.01.T01:CDS 35.0%
! AGTTGTGGATTGTAAGGATT+TGG + Chr1:73665190-73665209 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! ATTTTCAGATACTAACCCTG+TGG + Chr1:73664470-73664489 MsG0180004120.01.T01:intron 35.0%
! CAACATTTGGAACCTAAAGA+TGG - Chr1:73665069-73665088 None:intergenic 35.0%
! CGATAAAGTTGTGGATTGTA+AGG + Chr1:73665184-73665203 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! TAACATACTTTGATGGTTGG+GGG - Chr1:73663606-73663625 None:intergenic 35.0%
! TTTAGATTTTGCCTCCTTGT+TGG + Chr1:73664390-73664409 MsG0180004120.01.T01:intron 35.0%
AAACAAGGGCAGAACAAAGA+AGG + Chr1:73663489-73663508 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
AAAGTTGGAGAAGGAACGTA+CGG + Chr1:73663214-73663233 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
AACAAGGGCAGAACAAAGAA+GGG + Chr1:73663490-73663509 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
AATGCAATCAGCCACAATTG+AGG - Chr1:73664439-73664458 None:intergenic 40.0%
AGGTTGTTGGATGTGAAACA+AGG + Chr1:73663474-73663493 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
ATCCACAGCCATTGAGTAAT+GGG - Chr1:73664527-73664546 None:intergenic 40.0%
CGCATATCCTAGTCTGTTAT+GGG + Chr1:73665126-73665145 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
CGTCTTCATGAAGATGATGA+AGG + Chr1:73663295-73663314 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
CTCCATATATTCAGGCTGTT+GGG + Chr1:73664735-73664754 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
GATTCAATCATGGAGAAACC+TGG + Chr1:73663139-73663158 MsG0180004120.01.T01:exon 40.0%
GCTATCTGCAAAGAAAGCTA+TGG + Chr1:73665012-73665031 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
GGACTCCTAATGAAGATGTA+TGG + Chr1:73664757-73664776 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
GGTTGTTGGATGTGAAACAA+GGG + Chr1:73663475-73663494 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
TATCCACAGCCATTGAGTAA+TGG - Chr1:73664528-73664547 None:intergenic 40.0%
TCCATATATTCAGGCTGTTG+GGG + Chr1:73664736-73664755 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
TGAATGCAAAACCAACAAGG+AGG - Chr1:73664404-73664423 None:intergenic 40.0%
TGTCCAGGTCATCAAAGTAA+GGG - Chr1:73665042-73665061 None:intergenic 40.0%
TGTGCAAAATTCCATGACCA+TGG - Chr1:73663759-73663778 None:intergenic 40.0%
TTGTCCAGGTCATCAAAGTA+AGG - Chr1:73665043-73665062 None:intergenic 40.0%
! ACAGCCTTTGAAAGACTTTG+AGG - Chr1:73664831-73664850 None:intergenic 40.0%
! ATGGTCATGGAATTTTGCAC+AGG + Chr1:73663758-73663777 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
! ATTAGCCTATGCCTAGGTTA+TGG + Chr1:73664182-73664201 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
! ATTCGGAGTTTTCGTCAAAC+TGG + Chr1:73663567-73663586 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
! CTAGGTTATGGTCTGAGATT+GGG + Chr1:73664194-73664213 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
! GATGAAATTAGCCTATGCCT+AGG + Chr1:73664176-73664195 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
! GTTAGGGTTTGGTCTGAAAA+GGG - Chr1:73663103-73663122 None:intergenic 40.0%
! GTTGAAATTAGCCTATGCCT+AGG + Chr1:73664315-73664334 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
! TTAGGGTTTGGTCTGAAAAG+GGG - Chr1:73663102-73663121 None:intergenic 40.0%
! TTCGGAGTTTTCGTCAAACT+GGG + Chr1:73663568-73663587 MsG0180004120.01.T01:CDS 40.0%
!!! CCTTGTTGGTTTTGCATTCA+GGG + Chr1:73664404-73664423 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
!!! TCCTTGTTGGTTTTGCATTC+AGG + Chr1:73664403-73664422 MsG0180004120.01.T01:intron 40.0%
AAGCTCGAGAAAGTTGGAGA+AGG + Chr1:73663205-73663224 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
AAGTTGGAGAAGGAACGTAC+GGG + Chr1:73663215-73663234 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
ACCAAGACAGCACTATTTCC+TGG + Chr1:73664690-73664709 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
ACCAGGAAATAGTGCTGTCT+TGG - Chr1:73664694-73664713 None:intergenic 45.0%
ACTACTGCGATTGTTTCACC+AGG - Chr1:73663160-73663179 None:intergenic 45.0%
ACTCAATGGCTGTGGATATG+TGG + Chr1:73664530-73664549 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
AGAGCAAGAGAGAAAGCAAC+TGG + Chr1:73663247-73663266 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
AGTCTTTCAAAGGCTGTTCC+CGG + Chr1:73664834-73664853 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
CCAACAGCCTGAATATATGG+AGG - Chr1:73664737-73664756 None:intergenic 45.0%
CCAATCTCAGACCATAACCT+AGG - Chr1:73664196-73664215 None:intergenic 45.0%
CCCTGAATGCAAAACCAACA+AGG - Chr1:73664407-73664426 None:intergenic 45.0%
CCTAATGAAGATGTATGGCC+AGG + Chr1:73664762-73664781 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
CCTCCATATATTCAGGCTGT+TGG + Chr1:73664734-73664753 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
CCTGGCCATACATCTTCATT+AGG - Chr1:73664765-73664784 None:intergenic 45.0%
CTCGTGATCCACATGTTGTT+AGG + Chr1:73663365-73663384 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCCTCACAATCTCTTGA+TGG + Chr1:73663895-73663914 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
GAGCAAGAGAGAAAGCAACT+GGG + Chr1:73663248-73663267 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
GCGCATATCCTAGTCTGTTA+TGG + Chr1:73665125-73665144 MsG0180004120.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GGGTCCTCAAAGTCTTTCAA+AGG + Chr1:73664824-73664843 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
TACCCATTACTCAATGGCTG+TGG + Chr1:73664522-73664541 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
TCAGACCATAACCTAGGCAT+AGG - Chr1:73664190-73664209 None:intergenic 45.0%
TCCCCAACAGCCTGAATATA+TGG - Chr1:73664740-73664759 None:intergenic 45.0%
TTCAGGTGCTCTATACCACA+GGG - Chr1:73664488-73664507 None:intergenic 45.0%
TTCGAGAAGCTCGAGAAAGT+TGG + Chr1:73663199-73663218 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTTTGCAGATAGCCGCT+TGG - Chr1:73665008-73665027 None:intergenic 45.0%
! ACACCCTTACTTTGATGACC+TGG + Chr1:73665036-73665055 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
! CCTAGGTTATGGTCTGAGAT+TGG + Chr1:73664193-73664212 MsG0180004120.01.T01:intron 45.0%
! CTCACAATCTCTTGATGGAC+CGG + Chr1:73663900-73663919 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
! GGTGTCATGATCCTCAATTG+TGG + Chr1:73664425-73664444 MsG0180004120.01.T01:intron 45.0%
! GGTTAGGGTTTGGTCTGAAA+AGG - Chr1:73663104-73663123 None:intergenic 45.0%
! TGGTCTGTTGCCTGCATTTT+CGG + Chr1:73664550-73664569 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
! TGTTGCCTGCATTTTCGGTA+AGG + Chr1:73664555-73664574 MsG0180004120.01.T01:intron 45.0%
!! AGAGCACCTGAAGTCCTTTT+GGG + Chr1:73664496-73664515 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
!! TAGAGCACCTGAAGTCCTTT+TGG + Chr1:73664495-73664514 MsG0180004120.01.T01:CDS 45.0%
CCTGGACAAGACCCATCTTT+AGG + Chr1:73665054-73665073 MsG0180004120.01.T01:CDS 50.0%
CGGTCCATCAAGAGATTGTG+AGG - Chr1:73663902-73663921 None:intergenic 50.0%
CTTCAGGTGCTCTATACCAC+AGG - Chr1:73664489-73664508 None:intergenic 50.0%
GAAACCTCACGAAGCGTAGT+AGG - Chr1:73663328-73663347 None:intergenic 50.0%
TGCAATATGAGCCCTCCAAG+CGG + Chr1:73664990-73665009 MsG0180004120.01.T01:CDS 50.0%
TGTTGCAGCTCAGAATCACC+AGG - Chr1:73664711-73664730 None:intergenic 50.0%
TTCAAAGGCTGTTCCCGGTT+TGG + Chr1:73664839-73664858 MsG0180004120.01.T01:CDS 50.0%
TTTGCAGATAGCCGCTTGGA+GGG - Chr1:73665004-73665023 None:intergenic 50.0%
! AGCACCTGAAGTCCTTTTGG+GGG + Chr1:73664498-73664517 MsG0180004120.01.T01:CDS 50.0%
! CATACTTTGATGGTTGGGGG+TGG - Chr1:73663603-73663622 None:intergenic 50.0%
! CCTAAAGATGGGTCTTGTCC+AGG - Chr1:73665057-73665076 None:intergenic 50.0%
! GAGCACCTGAAGTCCTTTTG+GGG + Chr1:73664497-73664516 MsG0180004120.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGCTTTCTGCCATGGTCA+TGG + Chr1:73663745-73663764 MsG0180004120.01.T01:CDS 50.0%
!! AGTAATGGGTAGCCCCCAAA+AGG - Chr1:73664513-73664532 None:intergenic 50.0%
ACCTCACGAAGCGTAGTAGG+AGG - Chr1:73663325-73663344 None:intergenic 55.0%
ACTCCAGCCTCTTCCAAACC+GGG - Chr1:73664855-73664874 None:intergenic 55.0%
ACTGGCATGAGTACCCTCAG+TGG + Chr1:73664802-73664821 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
CACTCCAGCCTCTTCCAAAC+CGG - Chr1:73664856-73664875 None:intergenic 55.0%
CGCAGTAGTGTTATCGGCGA+AGG + Chr1:73663171-73663190 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
CTGGCATGAGTACCCTCAGT+GGG + Chr1:73664803-73664822 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
CTTTGCAGATAGCCGCTTGG+AGG - Chr1:73665005-73665024 None:intergenic 55.0%
GGGGGCTACCCATTACTCAA+TGG + Chr1:73664516-73664535 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
GTAGCCCCCAAAAGGACTTC+AGG - Chr1:73664505-73664524 None:intergenic 55.0%
TCCTCCTACTACGCTTCGTG+AGG + Chr1:73663321-73663340 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
TGGAGAAGGAACGTACGGGA+AGG + Chr1:73663219-73663238 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
TGGCATGAGTACCCTCAGTG+GGG + Chr1:73664804-73664823 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
! AGACTTTGAGGACCCCACTG+AGG - Chr1:73664819-73664838 None:intergenic 55.0%
! GACTTTGAGGACCCCACTGA+GGG - Chr1:73664818-73664837 None:intergenic 55.0%
!! AAGGGCGTTGCTTTCTGCCA+TGG + Chr1:73663739-73663758 MsG0180004120.01.T01:CDS 55.0%
!! GGCTGTTCCCGGTTTGGAAG+AGG + Chr1:73664845-73664864 MsG0180004120.01.T01:CDS 60.0%
!! GTTCCCGGTTTGGAAGAGGC+TGG + Chr1:73664849-73664868 MsG0180004120.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 73663077 73665325 73663077 ID=MsG0180004120.01;Name=MsG0180004120.01
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Chr1 exon 73663077 73663386 73663077 ID=MsG0180004120.01.T01:exon:31395;Parent=MsG0180004120.01.T01
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Chr1 exon 73663718 73663779 73663718 ID=MsG0180004120.01.T01:exon:31397;Parent=MsG0180004120.01.T01
Chr1 exon 73663889 73664000 73663889 ID=MsG0180004120.01.T01:exon:31398;Parent=MsG0180004120.01.T01
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Chr1 exon 73664983 73665325 73664983 ID=MsG0180004120.01.T01:exon:31401;Parent=MsG0180004120.01.T01
Chr1 five_prime_UTR 73663077 73663147 73663077 ID=MsG0180004120.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0180004120.01.T01
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Chr1 three_prime_UTR 73665076 73665325 73665076 ID=MsG0180004120.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0180004120.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180004120.01.T01

ATGGAGAAACCTGGTGAAACAATCGCAGTAGTGTTATCGGCGAAGGAAGCATTCGAGAAGCTCGAGAAAGTTGGAGAAGGAACGTACGGGAAGGTTTACAGAGCAAGAGAGAAAGCAACTGGGAAAATTGTTGCGTTGAAGAAGACTCGTCTTCATGAAGATGATGAAGGTGTTCCTCCTACTACGCTTCGTGAGGTTTCGATTTTGAGAATGCTCTCTCGTGATCCACATGTTGTTAGGTTGTTGGATGTGAAACAAGGGCAGAACAAAGAAGGGAAAACTGTGTTGTATTTGGTTTTTGAGTACATGGATACTGATCTTAAGAAATTCATTCGGAGTTTTCGTCAAACTGGGCAAAATATTCCACCCCCAACCATCAAAGGTTTGATGTATCAACTTTGCAAGGGCGTTGCTTTCTGCCATGGTCATGGAATTTTGCACAGGGATTTGAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGGAAAACAATGATGCTCAAAATTGCTGATCTTGGACTTGCTAGAGCTTTTACTGTGCCACTTAAGAAGTACACTCATGAGATACTAACCCTGTGGTATAGAGCACCTGAAGTCCTTTTGGGGGCTACCCATTACTCAATGGCTGTGGATATGTGGTCTGTTGCCTGCATTTTCGCTGAACTTGTTACCAAGACAGCACTATTTCCTGGTGATTCTGAGCTGCAACAACTCCTCCATATATTCAGGCTGTTGGGGACTCCTAATGAAGATGTATGGCCAGGTGTTAGTAAACTAATGAACTGGCATGAGTACCCTCAGTGGGGTCCTCAAAGTCTTTCAAAGGCTGTTCCCGGTTTGGAAGAGGCTGGAGTGAATTTACTCTCTCAAATGCTGCAATATGAGCCCTCCAAGCGGCTATCTGCAAAGAAAGCTATGGAACACCCTTACTTTGATGACCTGGACAAGACCCATCTTTAG

Protein sequence

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