AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044210.01


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MsG0880044210.01.T01 AT4G04570 51.418 282 118 5 381 650 114 388 3.17e-78 258
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MsG0880044210.01.T01 AT1G70520 40.793 353 187 6 427 761 296 644 1.44e-76 260
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MsG0880044210.01.T01 AT4G04570 51.418 282 118 5 381 650 278 552 3.45e-76 257
MsG0880044210.01.T01 AT4G00960 58.019 212 74 3 447 644 46 256 3.15e-75 245
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MsG0880044210.01.T01 AT1G07650 39.444 360 186 4 387 732 630 971 1.45e-72 256
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MsG0880044210.01.T01 AT3G16030 32.470 579 284 18 56 549 84 640 2.04e-71 246
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MsG0880044210.01.T01 AT1G29730 40.000 325 176 5 437 745 618 939 7.92e-65 233
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MsG0880044210.01.T01 AT5G13160 41.438 292 151 5 444 718 73 361 1.43e-64 223
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MsG0880044210.01.T01 AT4G04540 53.744 227 97 4 383 608 284 503 3.49e-64 223
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MsG0880044210.01.T01 AT5G18610 39.934 303 168 3 443 731 69 371 4.31e-62 217
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MsG0880044210.01.T01 AT4G21400 48.760 242 94 3 394 608 301 539 5.75e-59 210
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MsG0880044210.01.T01 AT5G01560 35.519 366 189 10 370 717 296 632 1.78e-58 211
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MsG0880044210.01.T01 AT2G18470 37.217 309 164 6 439 726 266 565 2.51e-58 210
MsG0880044210.01.T01 AT3G59110 37.879 330 168 5 445 747 178 497 2.81e-58 207
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MsG0880044210.01.T01 AT4G11890 41.053 285 146 6 445 714 30 307 3.89e-58 202
MsG0880044210.01.T01 AT5G35580 37.349 332 172 6 431 729 50 378 5.27e-58 206
MsG0880044210.01.T01 AT5G35580 37.349 332 172 6 431 729 62 390 5.78e-58 206
MsG0880044210.01.T01 AT4G11890 41.053 285 146 6 445 714 27 304 6.39e-58 201
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MsG0880044210.01.T01 AT2G42960 40.136 294 145 4 445 717 171 454 1.81e-57 204
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MsG0880044210.01.T01 AT3G15890 33.882 304 187 2 443 732 25 328 1.48e-52 187
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MsG0880044210.01.T01 AT3G28690 36.513 304 157 7 442 717 11 306 1.88e-52 187
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MsG0880044210.01.T01 AT4G33430 38.614 303 164 5 434 717 311 610 2.45e-52 193
MsG0880044210.01.T01 AT1G07570 35.043 351 196 8 395 717 15 361 2.81e-52 188
MsG0880044210.01.T01 AT1G34210 38.816 304 162 6 434 717 280 579 2.83e-52 192
MsG0880044210.01.T01 AT1G34210 38.816 304 162 6 434 717 280 579 2.83e-52 192
MsG0880044210.01.T01 AT1G29730 46.330 218 102 3 445 650 661 875 2.88e-52 196
MsG0880044210.01.T01 AT2G26290 35.535 318 174 7 430 723 61 371 3.33e-52 187
MsG0880044210.01.T01 AT3G28690 36.513 304 157 7 442 717 60 355 4.20e-52 187
MsG0880044210.01.T01 AT5G60320 37.241 290 168 3 445 723 336 622 4.40e-52 193
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MsG0880044210.01.T01 AT5G60270 37.377 305 172 6 445 734 329 629 6.87e-52 192
MsG0880044210.01.T01 AT1G69790 36.455 299 162 5 442 717 69 362 6.92e-52 186
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MsG0880044210.01.T01 AT2G18470 39.852 271 123 6 439 695 266 510 7.88e-52 189
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MsG0880044210.01.T01 AT2G13800 39.249 293 156 5 443 717 261 549 1.03e-51 191
MsG0880044210.01.T01 AT2G19130 37.667 300 170 6 442 727 480 776 1.07e-51 194
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MsG0880044210.01.T01 AT1G55200 36.076 316 185 4 439 742 361 671 1.14e-51 192
MsG0880044210.01.T01 AT1G55200 36.076 316 185 4 439 742 361 671 1.14e-51 192
MsG0880044210.01.T01 AT1G55200 36.076 316 185 4 439 742 361 671 1.14e-51 192
MsG0880044210.01.T01 AT3G28690 36.513 304 157 7 442 717 111 406 1.37e-51 187
MsG0880044210.01.T01 AT5G16500 37.329 292 168 3 442 718 59 350 1.48e-51 191
MsG0880044210.01.T01 AT5G18910 35.739 291 156 6 445 717 180 457 1.48e-51 188
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MsG0880044210.01.T01 AT1G07570 36.634 303 162 6 441 717 52 350 1.53e-51 185
MsG0880044210.01.T01 AT1G07570 36.634 303 162 6 441 717 52 350 1.53e-51 185
MsG0880044210.01.T01 AT3G59750 36.770 291 171 3 445 723 291 580 1.63e-51 190
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MsG0880044210.01.T01 AT4G34500 37.755 294 160 5 453 730 141 427 2.76e-51 186
MsG0880044210.01.T01 AT5G15080 36.755 302 159 6 442 717 127 422 2.78e-51 187
MsG0880044210.01.T01 AT1G71830 38.158 304 164 6 434 717 277 576 2.89e-51 190
MsG0880044210.01.T01 AT5G48740 36.519 293 171 3 443 723 594 883 3.06e-51 193
MsG0880044210.01.T01 AT1G34300 26.934 698 382 27 104 723 115 762 3.82e-51 192
MsG0880044210.01.T01 AT5G39000 36.228 334 193 5 443 757 504 836 3.93e-51 192
MsG0880044210.01.T01 AT2G07180 35.691 311 173 6 429 717 62 367 4.08e-51 185
MsG0880044210.01.T01 AT2G07180 35.691 311 173 6 429 717 62 367 4.08e-51 185
MsG0880044210.01.T01 AT5G57670 38.000 300 155 6 442 722 252 539 4.19e-51 188
MsG0880044210.01.T01 AT5G65530 35.238 315 171 7 434 724 114 419 4.54e-51 185
MsG0880044210.01.T01 AT5G61350 37.282 287 165 2 443 714 511 797 7.46e-51 191
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MsG0880044210.01.T01 AT4G39110 39.649 285 155 4 443 714 512 792 9.29e-51 191
MsG0880044210.01.T01 AT3G25560 33.514 370 220 7 362 717 225 582 9.48e-51 188
MsG0880044210.01.T01 AT5G24010 33.521 355 205 5 384 714 409 756 1.05e-50 191
MsG0880044210.01.T01 AT3G25560 33.514 370 220 7 362 717 224 581 1.07e-50 188
MsG0880044210.01.T01 AT4G30520 36.257 342 194 7 390 717 241 572 1.10e-50 188
MsG0880044210.01.T01 AT5G59700 37.143 280 162 2 447 714 472 749 1.10e-50 191
MsG0880044210.01.T01 AT5G35960 35.783 313 176 8 443 740 120 422 1.12e-50 184
MsG0880044210.01.T01 AT3G46290 33.898 354 195 8 387 714 412 752 1.21e-50 191
MsG0880044210.01.T01 AT3G01300 37.294 303 156 7 442 717 121 416 1.42e-50 185
MsG0880044210.01.T01 AT3G25560 33.514 370 220 7 362 717 224 581 1.44e-50 188
MsG0880044210.01.T01 AT1G15530 35.088 285 170 4 445 717 349 630 1.66e-50 188
MsG0880044210.01.T01 AT4G11900 29.918 488 271 17 106 543 157 623 1.68e-50 187
MsG0880044210.01.T01 AT4G11900 29.918 488 271 17 106 543 157 623 1.68e-50 187
MsG0880044210.01.T01 AT5G54380 37.979 287 164 2 440 714 493 777 2.00e-50 190
MsG0880044210.01.T01 AT5G63710 38.667 300 167 6 434 717 229 527 2.01e-50 186
MsG0880044210.01.T01 AT5G63710 38.667 300 167 6 434 717 229 527 2.01e-50 186
MsG0880044210.01.T01 AT2G28930 35.974 303 164 6 441 717 56 354 2.49e-50 182
MsG0880044210.01.T01 AT2G28930 35.974 303 164 6 441 717 53 351 2.94e-50 182
MsG0880044210.01.T01 AT5G01020 37.201 293 161 6 445 717 57 346 4.18e-50 181
MsG0880044210.01.T01 AT2G43700 34.708 291 175 4 445 723 300 587 4.49e-50 186
MsG0880044210.01.T01 AT2G43700 34.708 291 175 4 445 723 300 587 4.49e-50 186
MsG0880044210.01.T01 AT2G43700 34.708 291 175 4 445 723 300 587 4.49e-50 186
MsG0880044210.01.T01 AT2G43700 34.708 291 175 4 445 723 300 587 4.49e-50 186
MsG0880044210.01.T01 AT1G01540 41.704 223 116 2 445 656 142 361 5.23e-50 181
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MsG0880044210.01.T01 AT2G23200 34.670 349 189 8 396 714 416 755 5.78e-50 189
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MsG0880044210.01.T01 AT5G38990 35.629 334 195 5 443 757 511 843 7.06e-50 189
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MsG0880044210.01.T01 AT2G18890 36.184 304 167 8 435 720 46 340 8.90e-50 180
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MsG0880044210.01.T01 AT5G35960 36.268 284 160 5 443 713 120 395 1.27e-49 180
MsG0880044210.01.T01 AT1G26970 36.000 300 163 6 442 717 68 362 1.82e-49 180
MsG0880044210.01.T01 AT2G01820 32.620 374 199 9 396 719 495 865 2.54e-49 187
MsG0880044210.01.T01 AT4G39400 38.095 294 158 5 442 717 868 1155 2.66e-49 188
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MsG0880044210.01.T01 AT5G53890 32.231 363 220 4 374 715 666 1023 3.69e-49 187
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MsG0880044210.01.T01 AT5G56790 37.075 294 165 5 439 717 372 660 8.73e-49 183
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MsG0880044210.01.T01 AT4G35030 34.098 305 187 3 431 722 79 382 1.02e-48 179
MsG0880044210.01.T01 AT4G35030 34.098 305 187 3 431 722 79 382 1.02e-48 179
MsG0880044210.01.T01 AT3G46400 34.211 342 196 8 388 714 515 842 1.06e-48 185
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MsG0880044210.01.T01 AT2G28590 40.891 247 128 4 427 658 66 309 1.18e-48 175
MsG0880044210.01.T01 AT1G24650 33.721 344 189 9 402 711 479 817 1.19e-48 185
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MsG0880044210.01.T01 AT5G62710 31.667 360 225 6 371 717 231 582 1.50e-48 181
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MsG0880044210.01.T01 AT3G45440 36.688 308 162 7 445 731 330 625 1.82e-48 182
MsG0880044210.01.T01 AT3G45440 36.688 308 162 7 445 731 330 625 1.82e-48 182
MsG0880044210.01.T01 AT5G37450 33.577 411 241 10 365 759 547 941 1.84e-48 185
MsG0880044210.01.T01 AT1G67720 36.499 337 187 7 404 723 556 882 2.40e-48 184
MsG0880044210.01.T01 AT5G63940 33.333 294 183 2 443 724 348 640 2.41e-48 182
MsG0880044210.01.T01 AT4G35030 34.797 296 179 3 431 713 79 373 2.47e-48 176
MsG0880044210.01.T01 AT5G16000 33.795 361 205 8 375 717 239 583 2.48e-48 181
MsG0880044210.01.T01 AT2G43690 34.708 291 175 4 445 723 289 576 2.68e-48 181

Find 150 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 352 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGCTTGGATTTCTACCTATT+TGG 0.182797 8:+37660284 MsG0880044210.01.T01:CDS
TCCCGTTTGCATTAAATTCT+TGG 0.194115 8:-37656659 None:intergenic
TTTGATTCCAACGATGAAAT+TGG 0.198609 8:+37656086 MsG0880044210.01.T01:CDS
CATAATTGGTCACTGGTTTC+AGG 0.220152 8:+37656129 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGACCCTGGTGAGGTGTTTC+AGG 0.231821 8:+37656521 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGCGAAGAGTAAATGATTAT+TGG 0.245395 8:-37655943 None:intergenic
ACTCCTTCCATTGCATATTC+TGG 0.250003 8:-37660828 None:intergenic
AATTGCTGAATCTATGTCTA+TGG 0.251377 8:-37655866 None:intergenic
AATATATTCTTTGTCCCATT+TGG 0.257478 8:-37656033 None:intergenic
TCAAAATAGAATTTCAAAAT+AGG 0.277940 8:+37655914 MsG0880044210.01.T01:CDS
TGTCTTGAATTCCACAAAAT+TGG 0.291378 8:+37655784 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACATAGAATGCTGGTCTTCT+TGG 0.291640 8:-37661237 None:intergenic
ATCAATCTTGGAAGCAACTA+TGG 0.296040 8:+37658878 MsG0880044210.01.T01:CDS
ATGTTCAATTCACCTTGTTT+TGG 0.297418 8:-37656201 None:intergenic
TCTACCTCTTGTGAAGTAGA+AGG 0.310097 8:+37661333 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTTAGAACATAGCTTGGAAT+TGG 0.310423 8:-37655749 None:intergenic
AGGCTATGGGCCCGTTTATA+AGG 0.337392 8:+37658932 MsG0880044210.01.T01:CDS
CACGTTAAATTGTCTATGTT+TGG 0.339154 8:-37656558 None:intergenic
TGGACTATTCGAGGACATTC+CGG 0.344135 8:+37656272 MsG0880044210.01.T01:CDS
GATCGTCCACTAAATCTAAT+AGG 0.344872 8:+37660939 MsG0880044210.01.T01:CDS
CGGGTGAATTTAGTCTTGAA+TGG 0.358452 8:+37656175 MsG0880044210.01.T01:CDS
TCAACATATTCTCACCAAAT+AGG 0.361054 8:-37660298 None:intergenic
TAGTCAATGCAGGTATAAAA+AGG 0.363780 8:+37658569 MsG0880044210.01.T01:intron
ATATATTCTTTGTCCCATTT+GGG 0.364028 8:-37656032 None:intergenic
ATGGGACAAAGAATATATTA+TGG 0.369046 8:+37656037 MsG0880044210.01.T01:CDS
CTTCAGGGAATCTTGGCAAC+AGG 0.383491 8:+37660089 MsG0880044210.01.T01:intron
CTTTGCAGTCACCTTATAAA+CGG 0.384513 8:-37658943 None:intergenic
TTCACCAAGGTGTAATTTGT+TGG 0.385529 8:-37656759 None:intergenic
TTCCAAGAATTTAATGCAAA+CGG 0.388951 8:+37656657 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACATGTCCTATTAGATTTAG+TGG 0.389110 8:-37660945 None:intergenic
GAATTCCACAATTCCTTGTC+CGG 0.389928 8:-37660147 None:intergenic
ACTCCTTTGCTAGAAACTTC+GGG 0.393111 8:+37656156 MsG0880044210.01.T01:CDS
AAGTCTGACGTCTTTAGCTT+TGG 0.396711 8:+37660861 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTGATTCCAACGATGAAATT+GGG 0.402196 8:+37656087 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACCAAGGTGTAAAAGATATT+CGG 0.405727 8:-37656732 None:intergenic
TTCGCATTCAAAGTTAAAGA+TGG 0.405735 8:+37656351 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTTACGACTTCAGGGAATCT+TGG 0.406797 8:+37660082 MsG0880044210.01.T01:intron
CTTCAACAACTTCACCCAAA+TGG 0.407409 8:+37656018 MsG0880044210.01.T01:CDS
AAGTTAGGACAGGGAGGCTA+TGG 0.410129 8:+37658918 MsG0880044210.01.T01:CDS
AAGCGTTTCAACATAATAGA+AGG 0.410503 8:+37660515 MsG0880044210.01.T01:CDS
GACTCCTTTGCTAGAAACTT+CGG 0.413102 8:+37656155 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTTAACGTGGTGGTTTGAAC+GGG 0.413240 8:+37656572 MsG0880044210.01.T01:CDS
GAATTCGACAAAAGATGTTC+AGG 0.417461 8:+37656704 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGGAGGATATACCAACTTGC+AGG 0.423249 8:+37656499 MsG0880044210.01.T01:CDS
GAATTTAATGCAAACGGGAC+TGG 0.428396 8:+37656663 MsG0880044210.01.T01:CDS
CTGGATGTGAATTCTATTCA+TGG 0.430594 8:+37656682 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACTGAGGAGGGGAGGTTAGT+AGG 0.434939 8:+37656396 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGTGTCGGCGTCTTTCCCTT+TGG 0.440506 8:-37661292 None:intergenic
GGAAGGTAAGAGCAATGATT+TGG 0.441227 8:+37658785 MsG0880044210.01.T01:CDS
GTTGCATTCATGAAGAAGAA+AGG 0.441551 8:+37660231 MsG0880044210.01.T01:CDS
AGAAATTGTTGTCGTAGAAT+AGG 0.445993 8:-37661313 None:intergenic
AGAAAAGTGGCAAAGTGTAT+TGG 0.447357 8:+37656226 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGCAAAGTGTATTGGAAAAG+TGG 0.448233 8:+37656234 MsG0880044210.01.T01:CDS
CTAACCTCCCCTCCTCAGTT+AGG 0.454952 8:-37656392 None:intergenic
TGCTTCCAAGATTGATGTAA+AGG 0.458700 8:-37658871 None:intergenic
GTAAATGCAGATATGTGTTA+TGG 0.459089 8:+37656447 MsG0880044210.01.T01:CDS
TCCAAGAATTTAATGCAAAC+GGG 0.459170 8:+37656658 MsG0880044210.01.T01:CDS
AACAATGTCTGATGTCATAT+CGG 0.461560 8:+37661182 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTTGCAGTCACCTTATAAAC+GGG 0.463046 8:-37658942 None:intergenic
GGGTGAATTTAGTCTTGAAT+GGG 0.463141 8:+37656176 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTCAACAACTTCACCCAAAT+GGG 0.463790 8:+37656019 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTGCTACTTGAAATCATTTG+TGG 0.466270 8:+37660888 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTAACTCCCAATTTCATCGT+TGG 0.469817 8:-37656093 None:intergenic
TGGTGAGTATATAAAGCTAA+TGG 0.470676 8:+37661065 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGGAGGTTAGTAGGTGGTGA+TGG 0.474740 8:+37656405 MsG0880044210.01.T01:CDS
ATTAACAGGCATGGGAGCTA+TGG 0.474954 8:+37661037 MsG0880044210.01.T01:intron
ACAAATCTTGTACAACTACT+TGG 0.476240 8:+37660206 MsG0880044210.01.T01:CDS
ATAATTGGTCACTGGTTTCA+GGG 0.477500 8:+37656130 MsG0880044210.01.T01:CDS
ATTTAACGTGGTGGTTTGAA+CGG 0.478410 8:+37656571 MsG0880044210.01.T01:CDS
TGGTGAGGTGTTTCAGGAAA+AGG 0.480164 8:+37656527 MsG0880044210.01.T01:CDS
CCCCGAAAACAAGTTAGGAC+AGG 0.487573 8:+37658908 MsG0880044210.01.T01:CDS
GCCTTGTTTAGAACATAGCT+TGG 0.491187 8:-37655755 None:intergenic
GAATGCTGGTCTTCTTGGTA+AGG 0.494868 8:-37661232 None:intergenic
AGATCTTGAAGATGACTTCA+AGG 0.498652 8:+37658827 MsG0880044210.01.T01:CDS
TGATATACTTATGGATGTTG+TGG 0.500157 8:+37655659 None:intergenic
GGCAAGAATGTTTACACAGC+AGG 0.500524 8:+37660661 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTTCTTCCAACATAGAATGC+TGG 0.510511 8:-37661246 None:intergenic
ATATATGCCAAACAAAAGCT+TGG 0.511119 8:+37660268 MsG0880044210.01.T01:CDS
CTACCTCTTGTGAAGTAGAA+GGG 0.514744 8:+37661334 MsG0880044210.01.T01:CDS
AACCAGTGACCAATTATGTC+CGG 0.514966 8:-37656124 None:intergenic
GTTGGAAGAAAGACATTTGA+GGG 0.516905 8:+37661258 MsG0880044210.01.T01:CDS
CATAGTGGCGACAGTGTTGT+TGG 0.522884 8:-37655974 None:intergenic
TAAAAGCAATGGACTATTCG+AGG 0.522948 8:+37656263 MsG0880044210.01.T01:CDS
AACCGGACATAATTGGTCAC+TGG 0.534915 8:+37656122 MsG0880044210.01.T01:CDS
AGTGGAAAACTTAAAAGCAA+TGG 0.540469 8:+37656252 MsG0880044210.01.T01:CDS
TACATATGTTGAACATTCGC+CGG 0.545729 8:-37656291 None:intergenic
TGGCTAGGCATAAAATGAGC+GGG 0.551974 8:-37658639 None:intergenic
ACAAATGTGTCATTTAATGT+TGG 0.553011 8:-37661090 None:intergenic
AGGTAAGAGCAATGATTTGG+TGG 0.556298 8:+37658788 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACAGTGTTGTTGGTGGGTTG+AGG 0.557407 8:-37655964 None:intergenic
TGTTGGAAGAAAGACATTTG+AGG 0.557915 8:+37661257 MsG0880044210.01.T01:CDS
AACATCCGGACAAGGAATTG+TGG 0.569989 8:+37660142 MsG0880044210.01.T01:CDS
TCACCCGAAGTTTCTAGCAA+AGG 0.570194 8:-37656159 None:intergenic
GTGATTGCAAGGTGAGATGT+TGG 0.571708 8:+37656613 MsG0880044210.01.T01:CDS
CGATGGTACCTAACTGAGGA+GGG 0.572506 8:+37656384 MsG0880044210.01.T01:CDS
AGAAGACCAGCATTCTATGT+TGG 0.575785 8:+37661240 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACAAGTGATAGTTTGAAGCC+AGG 0.577293 8:+37655712 MsG0880044210.01.T01:CDS
ATTCTATCACTAGATTACTC+TGG 0.580038 8:+37655886 MsG0880044210.01.T01:CDS
CGTTGGAATCAAAACATCTG+TGG 0.582382 8:-37656076 None:intergenic
TTTCCCTTCTACTTCACAAG+AGG 0.582523 8:-37661337 None:intergenic
ATACCAACTTGCAGGGACCC+TGG 0.583981 8:+37656507 MsG0880044210.01.T01:CDS
GATATGACATCAGACATTGT+TGG 0.584030 8:-37661180 None:intergenic
GAATTGAACATCAAGAAAAG+TGG 0.585092 8:+37656213 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTATATTTACAGTGATTGCA+AGG 0.586776 8:+37656602 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTCAGGGAATCTTGGCAACA+GGG 0.588092 8:+37660090 MsG0880044210.01.T01:intron
GATCTTGAAGATGACTTCAA+GGG 0.590398 8:+37658828 MsG0880044210.01.T01:CDS
ATAATAGAAGGAATTGCTCA+AGG 0.593195 8:+37660527 MsG0880044210.01.T01:CDS
GCATGGGAGCTATGGAATGA+TGG 0.593901 8:+37661045 MsG0880044210.01.T01:CDS
CTTGAATGGGAACCAAAACA+AGG 0.593990 8:+37656189 MsG0880044210.01.T01:CDS
CCCGAAAACAAGTTAGGACA+GGG 0.595234 8:+37658909 MsG0880044210.01.T01:CDS
GTTGGAATCAAAACATCTGT+GGG 0.600202 8:-37656075 None:intergenic
TGGAAGAAAGACATTTGAGG+GGG 0.602509 8:+37661260 MsG0880044210.01.T01:CDS
GTTACCGTTGTCTAACATAG+TGG 0.604201 8:-37655989 None:intergenic
GTGGCGACAGTGTTGTTGGT+GGG 0.604500 8:-37655970 None:intergenic
ATTGCTGAATCTATGTCTAT+GGG 0.604703 8:-37655865 None:intergenic
TCCAAGCTATGTTCTAAACA+AGG 0.606436 8:+37655754 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTGGAATTCACTGTATCACC+TGG 0.607360 8:-37655730 None:intergenic
AGTTAGGACAGGGAGGCTAT+GGG 0.607680 8:+37658919 MsG0880044210.01.T01:CDS
TGTTATGGATATAATAGTGA+TGG 0.613097 8:+37656462 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACATAGACAATTTAACGTGG+TGG 0.615875 8:+37656562 MsG0880044210.01.T01:CDS
TCACCAGGGTCCCTGCAAGT+TGG 0.616521 8:-37656510 None:intergenic
TATGGATATAATAGTGATGG+AGG 0.618660 8:+37656465 MsG0880044210.01.T01:CDS
TCTCCAGAATATGCAATGGA+AGG 0.619723 8:+37660825 MsG0880044210.01.T01:CDS
CATGTCTCCAGAATATGCAA+TGG 0.619976 8:+37660821 MsG0880044210.01.T01:CDS
AGTGGCGACAGTGTTGTTGG+TGG 0.620468 8:-37655971 None:intergenic
TATCACTAGATTACTCTGGT+AGG 0.622648 8:+37655890 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTGGCTAGGCATAAAATGAG+CGG 0.632029 8:-37658640 None:intergenic
TTCGACAAAAGATGTTCAGG+TGG 0.635645 8:+37656707 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGAGGATATACCAACTTGCA+GGG 0.636612 8:+37656500 MsG0880044210.01.T01:CDS
AAATCAGCTCGGAATTCCCA+TGG 0.641971 8:+37656789 MsG0880044210.01.T01:CDS
GAGGTGTTTCAGGAAAAGGC+AGG 0.642526 8:+37656531 MsG0880044210.01.T01:CDS
ACGATGGTACCTAACTGAGG+AGG 0.647510 8:+37656383 MsG0880044210.01.T01:CDS
TGAAGCCAACAAAATCAGCT+CGG 0.650528 8:+37656778 MsG0880044210.01.T01:CDS
AACTTGCAGGGACCCTGGTG+AGG 0.662301 8:+37656512 MsG0880044210.01.T01:CDS
TGTTGTCGTAGAATAGGTGT+CGG 0.663270 8:-37661307 None:intergenic
GAGGAGGGGAGGTTAGTAGG+TGG 0.665236 8:+37656399 MsG0880044210.01.T01:CDS
GGTACCTAACTGAGGAGGGG+AGG 0.665972 8:+37656388 MsG0880044210.01.T01:CDS
GAAGCCAACAAATTACACCT+TGG 0.667097 8:+37656755 MsG0880044210.01.T01:CDS
AAGATGGAAAGTTTATACGA+TGG 0.669726 8:+37656367 MsG0880044210.01.T01:CDS
GATGGTACCTAACTGAGGAG+GGG 0.680356 8:+37656385 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTGGAAGAAAGACATTTGAG+GGG 0.681395 8:+37661259 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTTCCTGAAACACCTCACCA+GGG 0.682265 8:-37656524 None:intergenic
GGAAGAAAGACATTTGAGGG+GGG 0.695550 8:+37661261 MsG0880044210.01.T01:CDS
GTAATTTGTTGGCTTCACCA+AGG 0.702311 8:-37656748 None:intergenic
GTCGCCACTATGTTAGACAA+CGG 0.706641 8:+37655985 MsG0880044210.01.T01:CDS
TATACGATGGTACCTAACTG+AGG 0.711766 8:+37656380 MsG0880044210.01.T01:CDS
GAAAACAAGTTAGGACAGGG+AGG 0.747415 8:+37658912 MsG0880044210.01.T01:CDS
CAAACATAGACAATTTAACG+TGG 0.753280 8:+37656559 MsG0880044210.01.T01:CDS
CTAATATCAATACACCACTG+TGG 0.756748 8:+37655824 MsG0880044210.01.T01:CDS
TTTCTGTCATACATCCACAG+TGG 0.757879 8:-37655838 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTTGATTAAAATATTAAC+AGG + Chr8:37661023-37661042 MsG0880044210.01.T01:intron 10.0%
!! TTAAATTACTAGTATAATTA+TGG + Chr8:37659017-37659036 MsG0880044210.01.T01:intron 10.0%
!!! GTTAATATTTTAATCAAATT+AGG - Chr8:37661023-37661042 None:intergenic 10.0%
!!! TCACTTTAAATTTTAAAATA+AGG + Chr8:37657204-37657223 MsG0880044210.01.T01:intron 10.0%
!!! TTAAATATTTATTTTGCATA+GGG - Chr8:37657772-37657791 None:intergenic 10.0%
!!! TTTAAATATTTATTTTGCAT+AGG - Chr8:37657773-37657792 None:intergenic 10.0%
!! AAAAAATTCAATCAAAAGTA+TGG - Chr8:37657671-37657690 None:intergenic 15.0%
!! AAAGTAAAAAAATACTAACA+CGG - Chr8:37657316-37657335 None:intergenic 15.0%
!! AACTAAAAATACCTTAAAAA+AGG - Chr8:37659157-37659176 None:intergenic 15.0%
!! AATTTAGGCTTATTAAAATA+TGG - Chr8:37659434-37659453 None:intergenic 15.0%
!! TAAAGATCTTAATATGAAAT+AGG + Chr8:37657567-37657586 MsG0880044210.01.T01:intron 15.0%
!! TAATTAGTATACTAACATTT+GGG - Chr8:37656986-37657005 None:intergenic 15.0%
!! TCAAAATAGAATTTCAAAAT+AGG + Chr8:37655914-37655933 MsG0880044210.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAAAAAAATCTTGATAATTG+TGG + Chr8:37659829-37659848 MsG0880044210.01.T01:intron 15.0%
!!! ATCTCAAACATTTAATTTTT+TGG - Chr8:37658512-37658531 None:intergenic 15.0%
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AAGATGGAAAGTTTATACGA+TGG + Chr8:37656367-37656386 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
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ACAAATCTTGTACAACTACT+TGG + Chr8:37660206-37660225 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
ACATGTCCTATTAGATTTAG+TGG - Chr8:37660948-37660967 None:intergenic 30.0%
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CACGTTAAATTGTCTATGTT+TGG - Chr8:37656561-37656580 None:intergenic 30.0%
CATTATAACTTACGTACCAT+GGG - Chr8:37656808-37656827 None:intergenic 30.0%
CCAAAAAGAAACAAGGTATA+TGG + Chr8:37658659-37658678 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
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GATAATCTAATTTATCGAGG+AGG - Chr8:37657177-37657196 None:intergenic 30.0%
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GGCTTATTAAAATATGGCAT+AGG - Chr8:37659428-37659447 None:intergenic 30.0%
GTAAATACCAACAGAATTGT+TGG + Chr8:37660692-37660711 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
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GTAACCGTATAAGTCATATA+AGG + Chr8:37657597-37657616 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
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TAATCTTGTATAGTCAATGC+AGG + Chr8:37658559-37658578 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
TAGTCAATGCAGGTATAAAA+AGG + Chr8:37658569-37658588 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
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TCAAAATAAGCCAATCCAAA+CGG - Chr8:37659318-37659337 None:intergenic 30.0%
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TCCAAGAATTTAATGCAAAC+GGG + Chr8:37656658-37656677 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
TGGTGAGTATATAAAGCTAA+TGG + Chr8:37661065-37661084 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
TGTCTTGAATTCCACAAAAT+TGG + Chr8:37655784-37655803 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
TTATGAGATAAGTGATCATG+AGG - Chr8:37658010-37658029 None:intergenic 30.0%
TTCGCATTCAAAGTTAAAGA+TGG + Chr8:37656351-37656370 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
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TTTGATTCCAACGATGAAAT+TGG + Chr8:37656086-37656105 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
! AACACCTTTAAAAAGGCTTA+TGG - Chr8:37659363-37659382 None:intergenic 30.0%
! ACATTTGGGATTAAAATACC+GGG - Chr8:37656972-37656991 None:intergenic 30.0%
! ACTTCCATAAGCCTTTTTAA+AGG + Chr8:37659356-37659375 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
! AGATAGTTGATGTCAATCTA+AGG + Chr8:37656895-37656914 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
! AGTTCCTAATGTGACATTTT+TGG - Chr8:37657626-37657645 None:intergenic 30.0%
! ATGTCTTATTATCCATAGGT+AGG - Chr8:37657749-37657768 None:intergenic 30.0%
! ATTTTGTCTCTTAAGGACAA+TGG - Chr8:37657800-37657819 None:intergenic 30.0%
! GAAGCCTTATATGACTTATA+CGG - Chr8:37657604-37657623 None:intergenic 30.0%
! TAATCAAGTGACCAATTTTG+TGG - Chr8:37655798-37655817 None:intergenic 30.0%
! TAGAAATCCAAGCTTTTGTT+TGG - Chr8:37660278-37660297 None:intergenic 30.0%
! TTACCCAAACACCTTTAAAA+AGG - Chr8:37659370-37659389 None:intergenic 30.0%
! TTGCTACTTGAAATCATTTG+TGG + Chr8:37660888-37660907 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
! TTTAGAACATAGCTTGGAAT+TGG - Chr8:37655752-37655771 None:intergenic 30.0%
! TTTTGTCTCTTAAGGACAAT+GGG - Chr8:37657799-37657818 None:intergenic 30.0%
!! ATGGTTGGTGATTATTGTTT+CGG + Chr8:37659117-37659136 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
!! ATGTTCAATTCACCTTGTTT+TGG - Chr8:37656204-37656223 None:intergenic 30.0%
!! CCATATACCTTGTTTCTTTT+TGG - Chr8:37658662-37658681 None:intergenic 30.0%
!! TATGGTTTGTTAGTTGTCAT+AGG - Chr8:37657653-37657672 None:intergenic 30.0%
!!! AACCCAAAAATTGCTGATTT+TGG + Chr8:37660635-37660654 MsG0880044210.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAGCCTTTTTAAAGGTGTTT+GGG + Chr8:37659364-37659383 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
!!! ATATGACTTTTGGAATCATG+AGG - Chr8:37658432-37658451 None:intergenic 30.0%
!!! GTTGCAAACAAGTGTTTTTT+TGG + Chr8:37659051-37659070 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
!!! TAAATTTTTAGCTTACCCTC+CGG + Chr8:37659448-37659467 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
!!! TAAGCCTTTTTAAAGGTGTT+TGG + Chr8:37659363-37659382 MsG0880044210.01.T01:intron 30.0%
AAAAGTTAAAAAGGGCAACC+CGG - Chr8:37657117-37657136 None:intergenic 35.0%
AAAATAAGCCAATCCAAACG+GGG - Chr8:37659316-37659335 None:intergenic 35.0%
ACATAGACAATTTAACGTGG+TGG + Chr8:37656562-37656581 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
ACTCATCAACAATTGAGCTA+AGG - Chr8:37657419-37657438 None:intergenic 35.0%
AGAAAAGTGGCAAAGTGTAT+TGG + Chr8:37656226-37656245 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
AGATCTTGAAGATGACTTCA+AGG + Chr8:37658827-37658846 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
AGCTTGGATTTCTACCTATT+TGG + Chr8:37660284-37660303 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
ATCAATCTTGGAAGCAACTA+TGG + Chr8:37658878-37658897 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
ATCCAAAAACCGGACATAAT+TGG + Chr8:37656115-37656134 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
ATCTAATTTATAGAGGAGGG+CGG - Chr8:37657449-37657468 None:intergenic 35.0%
ATCTAATTTATCGAGGAGGA+CGG - Chr8:37657173-37657192 None:intergenic 35.0%
ATGAGTGTTTGAGCATTTGA+GGG + Chr8:37658361-37658380 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
ATTTAACGTGGTGGTTTGAA+CGG + Chr8:37656571-37656590 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
CAAAATAAGCCAATCCAAAC+GGG - Chr8:37659317-37659336 None:intergenic 35.0%
CAGGTATAAAAAGGTGGATA+TGG + Chr8:37658578-37658597 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
CGAAAAAGAATCTGCTAGAT+TGG + Chr8:37660489-37660508 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
CTAATATCAATACACCACTG+TGG + Chr8:37655824-37655843 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
CTCATCAACAATTGAGCTAA+GGG - Chr8:37657418-37657437 None:intergenic 35.0%
CTGGATGTGAATTCTATTCA+TGG + Chr8:37656682-37656701 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
CTTTGCAGTCACCTTATAAA+CGG - Chr8:37658946-37658965 None:intergenic 35.0%
GAAGCATGGTTTATGCAAAT+GGG - Chr8:37657236-37657255 None:intergenic 35.0%
GAATTCGACAAAAGATGTTC+AGG + Chr8:37656704-37656723 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
GATATGACATCAGACATTGT+TGG - Chr8:37661183-37661202 None:intergenic 35.0%
GATCGTCCACTAAATCTAAT+AGG + Chr8:37660939-37660958 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
GATCTTGAAGATGACTTCAA+GGG + Chr8:37658828-37658847 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
GCTTCCAAAAATGTCACATT+AGG + Chr8:37657619-37657638 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
GGAGGGTAAGCTAAAAATTT+AGG - Chr8:37659449-37659468 None:intergenic 35.0%
GGCGAAGAGTAAATGATTAT+TGG - Chr8:37655946-37655965 None:intergenic 35.0%
GTCGTAAAACAAAAGGACTT+AGG - Chr8:37660070-37660089 None:intergenic 35.0%
GTTGCATTCATGAAGAAGAA+AGG + Chr8:37660231-37660250 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
GTTGGAAGAAAGACATTTGA+GGG + Chr8:37661258-37661277 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
GTTGGAATCAAAACATCTGT+GGG - Chr8:37656078-37656097 None:intergenic 35.0%
TACATATGTTGAACATTCGC+CGG - Chr8:37656294-37656313 None:intergenic 35.0%
TATCACTAGATTACTCTGGT+AGG + Chr8:37655890-37655909 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
TATGAGTGTTTGAGCATTTG+AGG + Chr8:37658360-37658379 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
TCAATGCAGGTATAAAAAGG+TGG + Chr8:37658572-37658591 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
TCATCAACAATTGAGCTAAG+GGG - Chr8:37657417-37657436 None:intergenic 35.0%
TCCCGTTTGCATTAAATTCT+TGG - Chr8:37656662-37656681 None:intergenic 35.0%
TGAAGTATAGGATTAGGGTT+TGG + Chr8:37658473-37658492 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
TGCTTCCAAGATTGATGTAA+AGG - Chr8:37658874-37658893 None:intergenic 35.0%
TGTTGGAAGAAAGACATTTG+AGG + Chr8:37661257-37661276 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
TTAACTCCCAATTTCATCGT+TGG - Chr8:37656096-37656115 None:intergenic 35.0%
TTCAACAACTTCACCCAAAT+GGG + Chr8:37656019-37656038 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAAGAAAGACATTTGAG+GGG + Chr8:37661259-37661278 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGAGTTAATCCAAAAAC+CGG + Chr8:37656105-37656124 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTTCCAACATAGAATGC+TGG - Chr8:37661249-37661268 None:intergenic 35.0%
TTTGCAGTCACCTTATAAAC+GGG - Chr8:37658945-37658964 None:intergenic 35.0%
! AGAAGCATGGTTTATGCAAA+TGG - Chr8:37657237-37657256 None:intergenic 35.0%
! AGGGATGTCTTATTATCCAT+AGG - Chr8:37657753-37657772 None:intergenic 35.0%
! GTGAAAAAGTGCATTCATGT+TGG + Chr8:37661123-37661142 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
! TCCAAGCTATGTTCTAAACA+AGG + Chr8:37655754-37655773 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
! TCCGAATATCTTTTACACCT+TGG + Chr8:37656731-37656750 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
! TTCACCAAGGTGTAATTTGT+TGG - Chr8:37656762-37656781 None:intergenic 35.0%
! TTGAGGGTATAGTTTCTCTT+TGG + Chr8:37658377-37658396 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
! TTGGTATATCCTCCCATTTT+TGG - Chr8:37656494-37656513 None:intergenic 35.0%
!! ATAATTGGTCACTGGTTTCA+GGG + Chr8:37656130-37656149 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
!! GGAATAAGCTAGGTTAGTTT+AGG - Chr8:37657722-37657741 None:intergenic 35.0%
!! GGGTGAATTTAGTCTTGAAT+GGG + Chr8:37656176-37656195 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAAAGCAATGGACTATTCG+AGG + Chr8:37656263-37656282 MsG0880044210.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCTTTTGTTTTACGACTTCA+GGG + Chr8:37660074-37660093 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
!!! GGCTTATTTTGAGCTTATGT+GGG + Chr8:37659326-37659345 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
!!! TACCTTGTTTCTTTTTGGCT+AGG - Chr8:37658657-37658676 None:intergenic 35.0%
!!! TCCTTTTGTTTTACGACTTC+AGG + Chr8:37660073-37660092 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
!!! TGGCTTATTTTGAGCTTATG+TGG + Chr8:37659325-37659344 MsG0880044210.01.T01:intron 35.0%
AACCAGTGACCAATTATGTC+CGG - Chr8:37656127-37656146 None:intergenic 40.0%
ACTCCTTCCATTGCATATTC+TGG - Chr8:37660831-37660850 None:intergenic 40.0%
ACTCCTTTGCTAGAAACTTC+GGG + Chr8:37656156-37656175 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
ACTTAAATTAAGGCCCCGTT+TGG + Chr8:37659300-37659319 MsG0880044210.01.T01:intron 40.0%
AGAAGACCAGCATTCTATGT+TGG + Chr8:37661240-37661259 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
CACTTGTTTGCAACATAAGC+TGG - Chr8:37659045-37659064 None:intergenic 40.0%
CATGTCTCCAGAATATGCAA+TGG + Chr8:37660821-37660840 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
CCCTGAAGTCGTAAAACAAA+AGG - Chr8:37660077-37660096 None:intergenic 40.0%
CGTTGGAATCAAAACATCTG+TGG - Chr8:37656079-37656098 None:intergenic 40.0%
CTACCTCTTGTGAAGTAGAA+GGG + Chr8:37661334-37661353 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
CTATGTCCCAACAATTCTGT+TGG - Chr8:37660702-37660721 None:intergenic 40.0%
CTTCAACAACTTCACCCAAA+TGG + Chr8:37656018-37656037 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAATGGGAACCAAAACA+AGG + Chr8:37656189-37656208 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCAAAAACATCCGGACA+AGG + Chr8:37660134-37660153 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
GAAGCCAACAAATTACACCT+TGG + Chr8:37656755-37656774 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
GAAGGAAGGCAATGTCTTTA+TGG - Chr8:37656867-37656886 None:intergenic 40.0%
GAATTCCACAATTCCTTGTC+CGG - Chr8:37660150-37660169 None:intergenic 40.0%
GAATTTAATGCAAACGGGAC+TGG + Chr8:37656663-37656682 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
GACTCCTTTGCTAGAAACTT+CGG + Chr8:37656155-37656174 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGGTAAGAGCAATGATT+TGG + Chr8:37658785-37658804 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
GGCAAAGTGTATTGGAAAAG+TGG + Chr8:37656234-37656253 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
GTTACCGTTGTCTAACATAG+TGG - Chr8:37655992-37656011 None:intergenic 40.0%
TAGCTCGACAATTGAGCTAA+GGG - Chr8:37657145-37657164 None:intergenic 40.0%
TATACGATGGTACCTAACTG+AGG + Chr8:37656380-37656399 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TATTATCCATAGGTAGGAGC+AGG - Chr8:37657743-37657762 None:intergenic 40.0%
TCATAAGCTCCTTGTTAAGC+CGG - Chr8:37659470-37659489 None:intergenic 40.0%
TCTACCTCTTGTGAAGTAGA+AGG + Chr8:37661333-37661352 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCAGAATATGCAATGGA+AGG + Chr8:37660825-37660844 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGCCAACAAAATCAGCT+CGG + Chr8:37656778-37656797 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TGATGGAGGATGCCAAAAAT+GGG + Chr8:37656479-37656498 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TGCCTAGCCAAAAAGAAACA+AGG + Chr8:37658652-37658671 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAGAAAGACATTTGAGG+GGG + Chr8:37661260-37661279 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGTCGTAGAATAGGTGT+CGG - Chr8:37661310-37661329 None:intergenic 40.0%
TTCGACAAAAGATGTTCAGG+TGG + Chr8:37656707-37656726 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAATTCACTGTATCACC+TGG - Chr8:37655733-37655752 None:intergenic 40.0%
TTGGCTAGGCATAAAATGAG+CGG - Chr8:37658643-37658662 None:intergenic 40.0%
TTTAACGTGGTGGTTTGAAC+GGG + Chr8:37656572-37656591 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
TTTACGACTTCAGGGAATCT+TGG + Chr8:37660082-37660101 MsG0880044210.01.T01:intron 40.0%
TTTCCCTTCTACTTCACAAG+AGG - Chr8:37661340-37661359 None:intergenic 40.0%
TTTCTGTCATACATCCACAG+TGG - Chr8:37655841-37655860 None:intergenic 40.0%
! AAGTCTGACGTCTTTAGCTT+TGG + Chr8:37660861-37660880 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
! ACAAGTGATAGTTTGAAGCC+AGG + Chr8:37655712-37655731 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
! AGGTAAGAGCAATGATTTGG+TGG + Chr8:37658788-37658807 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
! ATTAAAATACCGGGTGATGG+TGG - Chr8:37656963-37656982 None:intergenic 40.0%
! GACCAATTATGTCCGGTTTT+TGG - Chr8:37656120-37656139 None:intergenic 40.0%
! TTAAAATACCGGGTGATGGT+GGG - Chr8:37656962-37656981 None:intergenic 40.0%
! TTTGGTGACTAAACTTGCGA+TGG + Chr8:37658395-37658414 MsG0880044210.01.T01:intron 40.0%
! TTTTCCCCCGAAAACAAGTT+AGG + Chr8:37658903-37658922 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
!! ACATAGAATGCTGGTCTTCT+TGG - Chr8:37661240-37661259 None:intergenic 40.0%
!! CATAATTGGTCACTGGTTTC+AGG + Chr8:37656129-37656148 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
!! CGGGTGAATTTAGTCTTGAA+TGG + Chr8:37656175-37656194 MsG0880044210.01.T01:CDS 40.0%
!! GAATTCCGAGCTGATTTTGT+TGG - Chr8:37656786-37656805 None:intergenic 40.0%
!! GCCTTGTTTAGAACATAGCT+TGG - Chr8:37655758-37655777 None:intergenic 40.0%
!! GTAATTTGTTGGCTTCACCA+AGG - Chr8:37656751-37656770 None:intergenic 40.0%
!! TCAACTATCTAATGGGCTGA+AGG - Chr8:37656885-37656904 None:intergenic 40.0%
!!! TCCCTGTCCTAACTTGTTTT+CGG - Chr8:37658913-37658932 None:intergenic 40.0%
!!! TGATTTTGTTGGCTTCACCA+AGG - Chr8:37656775-37656794 None:intergenic 40.0%
AAAAGGACTTAGGCCCTGTT+TGG - Chr8:37660060-37660079 None:intergenic 45.0%
AAATCAGCTCGGAATTCCCA+TGG + Chr8:37656789-37656808 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
AACATCCGGACAAGGAATTG+TGG + Chr8:37660142-37660161 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
AACCGGACATAATTGGTCAC+TGG + Chr8:37656122-37656141 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
AATTAAGGCCCCGTTTGGAT+TGG + Chr8:37659305-37659324 MsG0880044210.01.T01:intron 45.0%
AATTTATAGAGGAGGGCGGT+TGG - Chr8:37657445-37657464 None:intergenic 45.0%
AATTTATCGAGGAGGACGGT+TGG - Chr8:37657169-37657188 None:intergenic 45.0%
ATTAACAGGCATGGGAGCTA+TGG + Chr8:37661037-37661056 MsG0880044210.01.T01:intron 45.0%
ATTTATAGAGGAGGGCGGTT+GGG - Chr8:37657444-37657463 None:intergenic 45.0%
ATTTATCGAGGAGGACGGTT+GGG - Chr8:37657168-37657187 None:intergenic 45.0%
CCCGAAAACAAGTTAGGACA+GGG + Chr8:37658909-37658928 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
CTTATTCCTGCTCCTACCTA+TGG + Chr8:37657734-37657753 MsG0880044210.01.T01:intron 45.0%
GAAAACAAGTTAGGACAGGG+AGG + Chr8:37658912-37658931 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGAAAGACATTTGAGGG+GGG + Chr8:37661261-37661280 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGCAATGTCTTTATGG+TGG - Chr8:37656864-37656883 None:intergenic 45.0%
GGAGGATATACCAACTTGCA+GGG + Chr8:37656500-37656519 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
GGCAAGAATGTTTACACAGC+AGG + Chr8:37660661-37660680 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
GGGATTAAAATACCGGGTGA+TGG - Chr8:37656966-37656985 None:intergenic 45.0%
GTAGCTCGACAATTGAGCTA+AGG - Chr8:37657146-37657165 None:intergenic 45.0%
GTCGCCACTATGTTAGACAA+CGG + Chr8:37655985-37656004 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
GTGATGAAGCGATTGTGAAG+AGG - Chr8:37658132-37658151 None:intergenic 45.0%
GTGATTGCAAGGTGAGATGT+TGG + Chr8:37656613-37656632 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
TAACCTCCTTCGATTCTCTC+TGG + Chr8:37659497-37659516 MsG0880044210.01.T01:intron 45.0%
TACATCAATGATGCAGGGAG+TGG - Chr8:37657260-37657279 None:intergenic 45.0%
TGGACTATTCGAGGACATTC+CGG + Chr8:37656272-37656291 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
TGGCTAGGCATAAAATGAGC+GGG - Chr8:37658642-37658661 None:intergenic 45.0%
TTCAGGGAATCTTGGCAACA+GGG + Chr8:37660090-37660109 MsG0880044210.01.T01:intron 45.0%
TTTCCTGAAACACCTCACCA+GGG - Chr8:37656527-37656546 None:intergenic 45.0%
! GTGATGGAGGATGCCAAAAA+TGG + Chr8:37656478-37656497 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
! TGGTGAGGTGTTTCAGGAAA+AGG + Chr8:37656527-37656546 MsG0880044210.01.T01:CDS 45.0%
! TTTTCCTGAAACACCTCACC+AGG - Chr8:37656528-37656547 None:intergenic 45.0%
!! CTATCTAATGGGCTGAAGGA+AGG - Chr8:37656881-37656900 None:intergenic 45.0%
!! GAATGCTGGTCTTCTTGGTA+AGG - Chr8:37661235-37661254 None:intergenic 45.0%
!! TCACCCGAAGTTTCTAGCAA+AGG - Chr8:37656162-37656181 None:intergenic 45.0%
!!! CCCTGTCCTAACTTGTTTTC+GGG - Chr8:37658912-37658931 None:intergenic 45.0%
!!! CCTGTCCTAACTTGTTTTCG+GGG - Chr8:37658911-37658930 None:intergenic 45.0%
!!! CTGTCCTAACTTGTTTTCGG+GGG - Chr8:37658910-37658929 None:intergenic 45.0%
!!! TATAATTAAAATATATGTTT+TGG - Chr8:37659533-37659552 None:intergenic 5.0%
!!! TTTTATTTTTATTTTTTTGA+AGG + Chr8:37659633-37659652 MsG0880044210.01.T01:intron 5.0%
AAGCTCCTTGTTAAGCCGGA+GGG - Chr8:37659466-37659485 None:intergenic 50.0%
AAGTTAGGACAGGGAGGCTA+TGG + Chr8:37658918-37658937 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
ACGATGGTACCTAACTGAGG+AGG + Chr8:37656383-37656402 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
AGGCTATGGGCCCGTTTATA+AGG + Chr8:37658932-37658951 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
AGGGGGGAACAACTTCCAAA+GGG + Chr8:37661277-37661296 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
AGTTAGGACAGGGAGGCTAT+GGG + Chr8:37658919-37658938 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
ATTTCCGGACCCTGCATATG+CGG + Chr8:37657078-37657097 MsG0880044210.01.T01:intron 50.0%
CATAGTGGCGACAGTGTTGT+TGG - Chr8:37655977-37655996 None:intergenic 50.0%
CCCCGAAAACAAGTTAGGAC+AGG + Chr8:37658908-37658927 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
CGATGGTACCTAACTGAGGA+GGG + Chr8:37656384-37656403 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
CTTCAGGGAATCTTGGCAAC+AGG + Chr8:37660089-37660108 MsG0880044210.01.T01:intron 50.0%
GATCCAGAGAGAATCGAAGG+AGG - Chr8:37659503-37659522 None:intergenic 50.0%
GATGGTACCTAACTGAGGAG+GGG + Chr8:37656385-37656404 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
GCATGGGAGCTATGGAATGA+TGG + Chr8:37661045-37661064 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
GGGAGGATATACCAACTTGC+AGG + Chr8:37656499-37656518 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
GGTAGGAGCAGGAATAAGCT+AGG - Chr8:37657732-37657751 None:intergenic 50.0%
GTGGATCCAGAGAGAATCGA+AGG - Chr8:37659506-37659525 None:intergenic 50.0%
TAAGCTCCTTGTTAAGCCGG+AGG - Chr8:37659467-37659486 None:intergenic 50.0%
TAATGAGACCCACCATCACC+CGG + Chr8:37656951-37656970 MsG0880044210.01.T01:intron 50.0%
TGGAGGATGCCAAAAATGGG+AGG + Chr8:37656482-37656501 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
! GAGGTGTTTCAGGAAAAGGC+AGG + Chr8:37656531-37656550 MsG0880044210.01.T01:CDS 50.0%
!! ACAGTGTTGTTGGTGGGTTG+AGG - Chr8:37655967-37655986 None:intergenic 50.0%
ACTAGAGCTCCCGCATATGC+AGG - Chr8:37657091-37657110 None:intergenic 55.0%
ACTGAGGAGGGGAGGTTAGT+AGG + Chr8:37656396-37656415 MsG0880044210.01.T01:CDS 55.0%
ATACCAACTTGCAGGGACCC+TGG + Chr8:37656507-37656526 MsG0880044210.01.T01:CDS 55.0%
ATGCAGGGAGTGGAGAAGCA+TGG - Chr8:37657250-37657269 None:intergenic 55.0%
CTAACCTCCCCTCCTCAGTT+AGG - Chr8:37656395-37656414 None:intergenic 55.0%
CTAGAGCTCCCGCATATGCA+GGG - Chr8:37657090-37657109 None:intergenic 55.0%
GAGGGGGGAACAACTTCCAA+AGG + Chr8:37661276-37661295 MsG0880044210.01.T01:CDS 55.0%
GCATATGCAGGGTCCGGAAA+TGG - Chr8:37657079-37657098 None:intergenic 55.0%
GCTTACCCTCCGGCTTAACA+AGG + Chr8:37659458-37659477 MsG0880044210.01.T01:intron 55.0%
GGGAGGTTAGTAGGTGGTGA+TGG + Chr8:37656405-37656424 MsG0880044210.01.T01:CDS 55.0%
TTTCCGGACCCTGCATATGC+GGG + Chr8:37657079-37657098 MsG0880044210.01.T01:intron 55.0%
! AGTGGCGACAGTGTTGTTGG+TGG - Chr8:37655974-37655993 None:intergenic 55.0%
! GTGGCGACAGTGTTGTTGGT+GGG - Chr8:37655973-37655992 None:intergenic 55.0%
AACTTGCAGGGACCCTGGTG+AGG + Chr8:37656512-37656531 MsG0880044210.01.T01:CDS 60.0%
GAGGAGGGGAGGTTAGTAGG+TGG + Chr8:37656399-37656418 MsG0880044210.01.T01:CDS 60.0%
GGTACCTAACTGAGGAGGGG+AGG + Chr8:37656388-37656407 MsG0880044210.01.T01:CDS 60.0%
TCACCAGGGTCCCTGCAAGT+TGG - Chr8:37656513-37656532 None:intergenic 60.0%
! ATGCGGGAGCTCTAGTGCAC+CGG + Chr8:37657095-37657114 MsG0880044210.01.T01:intron 60.0%
! GGACCCTGGTGAGGTGTTTC+AGG + Chr8:37656521-37656540 MsG0880044210.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTGTCGGCGTCTTTCCCTT+TGG - Chr8:37661295-37661314 None:intergenic 60.0%
GCTCCCGCATATGCAGGGTC+CGG - Chr8:37657085-37657104 None:intergenic 65.0%
! TGCGGGAGCTCTAGTGCACC+GGG + Chr8:37657096-37657115 MsG0880044210.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 37655673 37661368 37655673 ID=MsG0880044210.01;Name=MsG0880044210.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0880044210.01.T01

MLWSTSTSICVNATSDSLKPGDTVNSNSKLCSKQGKFCLEFHKIGHLIISANINTPLWMYDRNQPIDIDSAILSLDYSGRLKIEFQNRNLPIIIYSSPQPTNNTVATMLDNGNFVLQQLHPNGTKNILWQSFDYPTDVLIPTMKLGVNPKTGHNWSLVSGLTPLLETSGEFSLEWEPKQGELNIKKSGKVYWKSGKLKSNGLFEDIPANVQHMYQYIIVSIKTEESFAFKVKDGKFIRWYLTEEGRLVGGDGHNDVDIVNADMCYGYNSDGGCQKWEDIPTCRDPGEVFQEKAGRPNIDNLTWWFERDVTYIYSDCKVRCWKNCSCNAFQEFNANGTGCEFYSWNSTKDVQVVPNIFYTLVKPTNYTLVKPTKSARNSHGIKRWIWIGSAIAIALLILCPLILCLAKKKQDKKRKRKEGKSNDLVESYDIKDLEDDFKGHDIKVFTFTSILEATMEFSPENKLGQGGYGPVYKGILATGQEFAVKRLSKTSGQGIVEFKNELVLICELQHTNLVQLLGCCIHEEERILIYEYMPNKSLDFYLFEDCTKKNLLDWKKRFNIIEGIAQGLLYLHKYSRLKIIHRDLKASNILLDENMNPKIADFGMARMFTQQDGYMSPEYAMEGVCSTKSDVFSFGVLLLEIICGRKNNSFYDVDRPLNLIGHAWELWNDGEYIKLMDPTLNDTFVHDEVKKCIHVGLLCVEQYANDRPTMSDVISVLTNKYELTTLPRRPAFYVGRKTFEGGTTSKGKDADTYSTTTISTSCEVEGKYK*