AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015374.01


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MsG0380015374.01.T01 AT1G58848 26.740 905 583 24 1 864 1 866 9.33e-77 271
MsG0380015374.01.T01 AT1G59218 26.740 905 583 24 1 864 1 866 9.33e-77 271
MsG0380015374.01.T01 AT1G59218 26.740 905 583 24 1 864 1 866 9.33e-77 271
MsG0380015374.01.T01 AT1G59218 26.740 905 583 24 1 864 1 866 9.33e-77 271
MsG0380015374.01.T01 AT1G58848 26.740 905 583 24 1 864 1 866 9.33e-77 271
MsG0380015374.01.T01 AT1G58602 26.198 897 596 23 1 864 1 864 1.29e-70 254
MsG0380015374.01.T01 AT1G58602 26.198 897 596 23 1 864 1 864 1.29e-70 254
MsG0380015374.01.T01 AT1G10920 29.609 716 458 17 136 825 5 700 1.86e-70 248
MsG0380015374.01.T01 AT1G10920 29.609 716 458 17 136 825 5 700 1.86e-70 248
MsG0380015374.01.T01 AT1G10920 29.609 716 458 17 136 825 5 700 1.86e-70 248
MsG0380015374.01.T01 AT1G58410 25.328 916 617 23 6 907 4 866 2.41e-70 251
MsG0380015374.01.T01 AT1G59620 26.571 764 484 23 168 904 24 737 2.26e-60 220
MsG0380015374.01.T01 AT3G14470 26.978 834 512 35 38 818 46 835 4.74e-56 211
MsG0380015374.01.T01 AT3G14470 26.978 834 512 35 38 818 46 835 4.74e-56 211
MsG0380015374.01.T01 AT3G14460 27.770 695 435 21 34 700 39 694 1.06e-53 204
MsG0380015374.01.T01 AT1G10920 28.177 543 351 14 309 825 1 530 8.52e-43 165
MsG0380015374.01.T01 AT1G10920 28.177 543 351 14 309 825 1 530 8.52e-43 165
MsG0380015374.01.T01 AT4G26090 24.590 732 440 25 171 876 155 800 1.20e-39 159
MsG0380015374.01.T01 AT1G12220 29.328 491 297 20 190 656 53 517 2.33e-39 157
MsG0380015374.01.T01 AT1G12210 27.239 547 303 23 168 680 112 597 3.13e-39 157
MsG0380015374.01.T01 AT1G12210 27.239 547 303 23 168 680 112 597 3.13e-39 157
MsG0380015374.01.T01 AT1G12210 27.239 547 303 23 168 680 154 639 3.51e-39 157
MsG0380015374.01.T01 AT1G12220 29.328 491 297 20 190 656 174 638 4.24e-39 157
MsG0380015374.01.T01 AT1G12220 29.328 491 297 20 190 656 174 638 4.24e-39 157
MsG0380015374.01.T01 AT4G10780 28.494 551 332 19 194 717 175 690 9.51e-39 156
MsG0380015374.01.T01 AT4G10780 28.494 551 332 19 194 717 175 690 1.46e-38 155
MsG0380015374.01.T01 AT1G63350 25.450 833 500 32 56 864 61 796 4.64e-38 154
MsG0380015374.01.T01 AT1G63350 26.786 672 400 25 56 705 61 662 2.15e-37 152
MsG0380015374.01.T01 AT1G63350 26.269 670 406 25 56 705 61 662 2.81e-37 151
MsG0380015374.01.T01 AT1G63350 26.269 670 406 25 56 705 61 662 2.81e-37 151
MsG0380015374.01.T01 AT5G47250 29.381 565 332 24 170 718 156 669 1.34e-35 146
MsG0380015374.01.T01 AT5G63020 24.484 678 437 21 4 656 5 632 2.10e-35 145
MsG0380015374.01.T01 AT5G43730 28.571 581 340 28 159 718 143 669 1.52e-33 139
MsG0380015374.01.T01 AT5G43730 28.571 581 340 28 159 718 143 669 1.52e-33 139
MsG0380015374.01.T01 AT5G43730 28.571 581 340 28 159 718 143 669 1.52e-33 139
MsG0380015374.01.T01 AT5G43730 28.571 581 340 28 159 718 143 669 1.52e-33 139
MsG0380015374.01.T01 AT5G43730 28.571 581 340 28 159 718 143 669 1.52e-33 139
MsG0380015374.01.T01 AT1G61180 24.615 650 393 25 24 638 27 614 3.90e-33 138
MsG0380015374.01.T01 AT1G61180 24.615 650 393 25 24 638 27 614 3.98e-33 138
MsG0380015374.01.T01 AT1G15890 32.653 343 192 15 184 513 6 322 1.57e-32 135
MsG0380015374.01.T01 AT1G62630 25.575 696 416 26 205 864 185 814 3.14e-32 135
MsG0380015374.01.T01 AT1G15890 32.653 343 192 15 184 513 166 482 4.86e-32 134
MsG0380015374.01.T01 AT1G61300 26.584 647 384 24 184 783 53 655 5.62e-32 134
MsG0380015374.01.T01 AT1G12280 25.838 507 313 16 168 656 154 615 7.49e-32 134
MsG0380015374.01.T01 AT1G61310 27.215 474 294 16 194 638 176 627 1.06e-31 134
MsG0380015374.01.T01 AT1G51480 26.612 729 416 36 184 865 165 821 1.16e-31 133
MsG0380015374.01.T01 AT1G63360 28.522 575 327 27 205 739 150 680 1.28e-31 133
MsG0380015374.01.T01 AT1G63360 28.522 575 327 27 205 739 185 715 1.50e-31 133
MsG0380015374.01.T01 AT1G61190 27.221 529 327 16 194 705 175 662 3.55e-31 132
MsG0380015374.01.T01 AT1G61190 27.221 529 327 16 194 705 175 662 3.55e-31 132
MsG0380015374.01.T01 AT4G27190 28.630 489 292 21 195 656 167 625 5.25e-31 132
MsG0380015374.01.T01 AT5G43740 28.958 480 292 19 184 640 163 616 5.30e-31 131
MsG0380015374.01.T01 AT5G43740 28.958 480 292 19 184 640 163 616 5.30e-31 131
MsG0380015374.01.T01 AT5G05400 27.439 492 285 22 194 656 8 456 8.62e-31 130
MsG0380015374.01.T01 AT5G05400 27.439 492 285 22 194 656 8 456 8.62e-31 130
MsG0380015374.01.T01 AT1G61190 27.080 565 350 18 159 705 142 662 1.02e-30 130
MsG0380015374.01.T01 AT5G05400 27.439 492 285 22 194 656 177 625 1.36e-30 130
MsG0380015374.01.T01 AT1G61190 26.376 527 309 15 194 705 175 637 5.24e-30 128
MsG0380015374.01.T01 AT1G61300 25.938 640 372 21 184 783 53 630 2.31e-29 125
MsG0380015374.01.T01 AT1G12290 24.688 721 435 29 4 690 5 651 5.24e-29 125
MsG0380015374.01.T01 AT1G12290 27.322 549 323 23 168 690 111 609 6.23e-29 125
MsG0380015374.01.T01 AT1G12290 27.322 549 323 23 168 690 111 609 6.23e-29 125
MsG0380015374.01.T01 AT1G12290 27.322 549 323 23 168 690 111 609 6.23e-29 125
MsG0380015374.01.T01 AT4G27220 26.901 513 315 22 195 679 145 625 9.58e-29 124
MsG0380015374.01.T01 AT4G27220 26.901 513 315 22 195 679 137 617 1.26e-28 124
MsG0380015374.01.T01 AT1G12280 23.913 506 291 17 168 656 116 544 2.29e-22 103
MsG0380015374.01.T01 AT5G47260 24.516 465 297 21 194 638 171 601 3.05e-22 103
MsG0380015374.01.T01 AT4G33300 23.065 659 378 27 194 802 202 781 2.24e-17 87.8
MsG0380015374.01.T01 AT4G33300 23.065 659 378 27 194 802 202 781 2.24e-17 87.8
MsG0380015374.01.T01 AT5G04720 26.444 329 182 12 144 454 147 433 6.59e-15 79.7
MsG0380015374.01.T01 AT4G36140 23.993 546 333 20 195 728 420 895 3.65e-12 71.2
MsG0380015374.01.T01 AT4G36140 23.993 546 333 20 195 728 605 1080 5.27e-12 70.9
MsG0380015374.01.T01 AT5G66900 22.917 624 384 25 190 777 185 747 6.17e-12 70.1
MsG0380015374.01.T01 AT5G66900 22.917 624 384 25 190 777 233 795 8.01e-12 69.7
MsG0380015374.01.T01 AT1G27170 24.618 719 423 32 194 857 213 867 1.18e-11 69.7
MsG0380015374.01.T01 AT1G27170 24.618 719 423 32 194 857 213 867 1.24e-11 69.3
MsG0380015374.01.T01 AT5G17680 23.121 346 220 11 171 511 185 489 1.30e-11 69.3
MsG0380015374.01.T01 AT5G17680 23.121 346 220 11 171 511 186 490 1.35e-11 69.3
MsG0380015374.01.T01 AT5G36930 27.762 353 192 16 171 511 191 492 4.75e-11 67.4
MsG0380015374.01.T01 AT5G36930 27.762 353 192 16 171 511 188 489 5.04e-11 67.4
MsG0380015374.01.T01 AT5G36930 27.762 353 192 16 171 511 188 489 5.04e-11 67.4
MsG0380015374.01.T01 AT5G36930 27.762 353 192 16 171 511 188 489 5.68e-11 67.4
MsG0380015374.01.T01 AT5G66910 21.908 566 344 24 182 680 175 709 6.33e-11 67.0

Find 165 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 188 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCTTCTATCAGCATCTTTA+AGG 0.115890 3:+69204166 None:intergenic
AAAGATTGTTGTTCATTTAA+AGG 0.142105 3:+69203295 None:intergenic
TGGAGCATGCCAATGGATTT+TGG 0.143278 3:+69202437 None:intergenic
AAGTCATGCTTGTTGTATTT+TGG 0.144810 3:-69203001 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGCTTGAAGTTCTCCTAATT+TGG 0.189476 3:-69201683 MsG0380015374.01.T01:CDS
ACGCTACGTTATGTTAATTT+AGG 0.190925 3:-69202266 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATCAAACTTCCCAACTCTTT+TGG 0.232984 3:+69202506 None:intergenic
TTTAAATGAACAACAATCTT+TGG 0.237713 3:-69203293 MsG0380015374.01.T01:CDS
ACTGTCTTTGATTCAGTTAA+AGG 0.254733 3:-69202318 MsG0380015374.01.T01:CDS
CCACTTGAAGTATTTAAGTT+TGG 0.256829 3:-69202483 MsG0380015374.01.T01:CDS
GATTTAACTTCATAATCTTC+TGG 0.264035 3:+69202971 None:intergenic
CAACTTGCATACTCCAAATT+AGG 0.269178 3:+69201670 None:intergenic
GGTCGTGCCACTTAGCATTC+TGG 0.289659 3:+69203845 None:intergenic
TCTATAGGCGTTGGTGCTTA+TGG 0.290709 3:-69201885 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATATGGCTTCCAACGCTCTA+TGG 0.307203 3:-69203896 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATACTTGCACCAAGCTTCTA+TGG 0.313408 3:+69202849 None:intergenic
CTGAAGCAGATAAAGGATTT+GGG 0.324010 3:-69202203 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTAGTGAAGGAGTCAAAATA+TGG 0.324264 3:-69204119 MsG0380015374.01.T01:CDS
CACTTGAAGTATTTAAGTTT+GGG 0.326553 3:-69202482 MsG0380015374.01.T01:CDS
CCAACTACTTCCACTGTTAA+GGG 0.337255 3:-69204265 MsG0380015374.01.T01:CDS
GCTGAAGCAGATAAAGGATT+TGG 0.337667 3:-69202204 MsG0380015374.01.T01:CDS
ACCAACTACTTCCACTGTTA+AGG 0.340231 3:-69204266 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTAAGCTTGCTAATCTCCTT+TGG 0.357553 3:+69202368 None:intergenic
TTGTTGTGTTTGATGATGTT+TGG 0.364772 3:-69203456 MsG0380015374.01.T01:CDS
GATCCAAGGTCTCTAGGTTC+TGG 0.365550 3:+69202417 None:intergenic
ATTCAGTTAAAGGATGGTAT+TGG 0.366172 3:-69202308 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTATCTTCGGTTAGAGTTGA+TGG 0.370963 3:-69202830 MsG0380015374.01.T01:CDS
GCTATATCAATGAGCTCCTT+TGG 0.378704 3:+69203223 None:intergenic
TGCAAGCATATTAGTGAAGA+TGG 0.379871 3:-69202734 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAAGACTCAAATGGCAGAAA+TGG 0.382937 3:-69204307 None:intergenic
TTTGACAACAAGAATGTCAT+TGG 0.385192 3:-69203661 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGGAAAGCTGAAGCAGATAA+AGG 0.385378 3:-69202210 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTAGATGTAATTAAAGAGTT+AGG 0.388334 3:-69202230 MsG0380015374.01.T01:CDS
TTTGGAGTTGTTCAATAAGA+AGG 0.390993 3:-69203275 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGAACTGTTCATTGGATCTT+CGG 0.395774 3:-69201817 MsG0380015374.01.T01:CDS
TAACATAACGTAGCGTTTGT+AGG 0.396114 3:+69202273 None:intergenic
CAGAAGTGGTTGTTATTGAT+AGG 0.405235 3:+69202681 None:intergenic
AAAGAGACATGTTGATTGAT+TGG 0.415796 3:-69203768 MsG0380015374.01.T01:CDS
ACTCTCCCGAGGATTGGAAT+TGG 0.417206 3:-69201632 MsG0380015374.01.T01:CDS
CCACTAGCTATTGTTGCCAT+TGG 0.417675 3:-69203169 MsG0380015374.01.T01:CDS
TCTCAATCATATACTGTTGA+AGG 0.419980 3:-69203607 MsG0380015374.01.T01:CDS
GACACTTTGATTGTCGTGTA+TGG 0.430001 3:-69203639 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAACTAAAAGAACTGTTCAT+TGG 0.437138 3:-69201825 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTAGCTATTGTTGCCATTGG+TGG 0.439248 3:-69203166 MsG0380015374.01.T01:CDS
CCTTTAGATCCAAGGTCTCT+AGG 0.439979 3:+69202411 None:intergenic
CCCTTAACAGTGGAAGTAGT+TGG 0.443691 3:+69204265 None:intergenic
ATGAAAGATACACATCTAGT+TGG 0.443997 3:-69203073 MsG0380015374.01.T01:CDS
TTGAATGTTCCAAAAGAGTT+GGG 0.447972 3:-69202515 MsG0380015374.01.T01:CDS
CCTAGAGACCTTGGATCTAA+AGG 0.451405 3:-69202411 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAGGCATTCAGATTTGACTA+TGG 0.451812 3:-69203256 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGAAATTACATGTTAAATCA+AGG 0.451896 3:-69202112 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTTGAATGTTCCAAAAGAGT+TGG 0.452003 3:-69202516 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAGCTTGGTGCAAGTATCTT+CGG 0.452588 3:-69202843 MsG0380015374.01.T01:CDS
CAGAGATTTAGTGAAAATCT+AGG 0.460304 3:-69203106 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGTTTGGGTTATGTAACAAC+AGG 0.464063 3:-69202467 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGAAAACTAAGACATCTTAT+CGG 0.467860 3:-69202347 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGAGTTGATGGTAAAGCTAA+AGG 0.471677 3:-69202818 MsG0380015374.01.T01:CDS
CAACAAAATACAGGTGGTTG+AGG 0.479282 3:-69202565 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATTGAGGAAGCTGAAGTTGT+CGG 0.481309 3:-69203802 MsG0380015374.01.T01:CDS
GATGGACAATCATACTTAAG+TGG 0.481659 3:-69202716 MsG0380015374.01.T01:CDS
TACAAGACAACACAACATCT+AGG 0.481697 3:+69203353 None:intergenic
TTGATTGATTGGATGGTAAA+GGG 0.482207 3:-69203757 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAGCATGACTTGAGAGAGTA+AGG 0.483364 3:+69203013 None:intergenic
AAGGAAAGAAGTGAAAGATA+TGG 0.484511 3:-69203913 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTTCAAGCTTCTCTAAGTGT+TGG 0.487936 3:+69201697 None:intergenic
TACTGTTGAAGGGTTGTTGA+GGG 0.489620 3:-69203596 MsG0380015374.01.T01:CDS
CACTTGTTGATCCTCTCTAT+AGG 0.489855 3:-69201900 MsG0380015374.01.T01:CDS
TTCAAAATCTTGTTGTGTTG+AGG 0.492327 3:-69201977 MsG0380015374.01.T01:CDS
AACATAACGTAGCGTTTGTA+GGG 0.492960 3:+69202274 None:intergenic
GTTGATTGATTGGATGGTAA+AGG 0.497073 3:-69203758 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTGTTGCATTTCATTGATTG+AGG 0.497234 3:+69202139 None:intergenic
TTGATCCTCTCTATAGGCGT+TGG 0.497719 3:-69201894 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTCGTCTGTTCGTGAGATCA+AGG 0.498102 3:-69203932 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTAAGACATCTTATCGGCAC+TGG 0.498776 3:-69202341 MsG0380015374.01.T01:CDS
GAGTCGATGGAAAGATTGTT+CGG 0.502485 3:-69201575 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGGGTTCGTGAAGGAGGAAA+GGG 0.504198 3:-69202918 MsG0380015374.01.T01:CDS
TGAAAGATACACATCTAGTT+GGG 0.507095 3:-69203072 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATGATCCAATTCCAATCCTC+GGG 0.510067 3:+69201627 None:intergenic
AACAAAATACAGGTGGTTGA+GGG 0.511808 3:-69202564 MsG0380015374.01.T01:CDS
GGAGGAAAGGGGAAAGACGT+TGG 0.513125 3:-69202906 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATTCGACAGTGGGTGGCTGA+AGG 0.513759 3:-69202938 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGAAGAGCTGCAACAGCTAA+AGG 0.514413 3:-69204150 MsG0380015374.01.T01:CDS
CGCACGGTAATTTCTGTAGT+AGG 0.515749 3:-69203724 MsG0380015374.01.T01:CDS
GGTAATTTCTGTAGTAGGCA+TGG 0.516651 3:-69203719 MsG0380015374.01.T01:CDS
GGTAAATTCCCAAAATCCAT+TGG 0.518450 3:-69202446 MsG0380015374.01.T01:CDS
GGAGAATTCCAACAAAATAC+AGG 0.520128 3:-69202574 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGACAACATCCTCATGATCC+TGG 0.521637 3:-69204030 MsG0380015374.01.T01:CDS
ACGTTATGTTAATTTAGGTA+TGG 0.522926 3:-69202261 MsG0380015374.01.T01:CDS
CATGATCCAATTCCAATCCT+CGG 0.522965 3:+69201626 None:intergenic
CATGAGGATGTTGTCTCACA+TGG 0.524424 3:+69204037 None:intergenic
CGAGGATTGGAATTGGATCA+TGG 0.525551 3:-69201625 MsG0380015374.01.T01:CDS
CCAAACTTAAATACTTCAAG+TGG 0.527861 3:+69202483 None:intergenic
AGCAAAACTCTCCCGAGGAT+TGG 0.528851 3:-69201638 MsG0380015374.01.T01:CDS
CGACTCTAGAAATTTCTACA+AGG 0.529249 3:+69201592 None:intergenic
GTAGAAATTTCTAGAGTCGA+TGG 0.530425 3:-69201588 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAGGGTTCGTGAAGGAGGAA+AGG 0.531853 3:-69202919 MsG0380015374.01.T01:CDS
TCTATCAGCATCTTTAAGGA+AGG 0.532332 3:+69204170 None:intergenic
GAAAGATTGTTCGGAACTCA+AGG 0.539885 3:-69201566 MsG0380015374.01.T01:CDS
GCTCCAGAACCTAGAGACCT+TGG 0.540813 3:-69202420 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTATTGAAAGTTCACATGTT+CGG 0.541037 3:-69202643 MsG0380015374.01.T01:CDS
TATGTTAATTTAGGTATGGA+AGG 0.542741 3:-69202257 MsG0380015374.01.T01:CDS
TGTTGGAATTCTCCTTGCAA+AGG 0.542759 3:+69202583 None:intergenic
GAAACTACTTGCGGCAAAAG+AGG 0.543044 3:-69203483 MsG0380015374.01.T01:CDS
GGCTGAAGGGTTCGTGAAGG+AGG 0.543931 3:-69202924 MsG0380015374.01.T01:CDS
TGGAGTAAAGATACACATCC+AGG 0.544096 3:+69204012 None:intergenic
AAAGAGATTGATTCGACAGT+GGG 0.550646 3:-69202948 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGCGGCTGCTCTTTACATTG+AGG 0.551074 3:-69203818 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATTCATATGTATCCTTTGCA+AGG 0.556854 3:-69202595 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGACATGTTGATTGATTGGA+TGG 0.558765 3:-69203764 MsG0380015374.01.T01:CDS
AATCAATGAAATGCAACACT+TGG 0.559694 3:-69202135 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGCGATATTATTATCGACAA+AGG 0.562472 3:-69201786 MsG0380015374.01.T01:CDS
GGGTTCGTGAAGGAGGAAAG+GGG 0.563657 3:-69202917 MsG0380015374.01.T01:CDS
TCTAATCTGAAGAATATCAC+TGG 0.566683 3:-69201723 MsG0380015374.01.T01:CDS
TCTTTGATTCAGTTAAAGGA+TGG 0.567084 3:-69202314 MsG0380015374.01.T01:CDS
GCATTCAGATTTGACTATGG+TGG 0.567138 3:-69203253 MsG0380015374.01.T01:CDS
GAAGAAGCAAATCTGCTAAG+AGG 0.567180 3:-69204243 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTAGTAGGCATGGGAGGGCA+AGG 0.567548 3:-69203709 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTCAATGAAGTCATCAGAAG+TGG 0.568135 3:+69202667 None:intergenic
TAGGTTCTGGAGCATGCCAA+TGG 0.569509 3:+69202430 None:intergenic
TTTGGAACATTCAACAATCG+AGG 0.569686 3:+69202524 None:intergenic
GTGCGTAGCCTTTAGATCCA+AGG 0.570550 3:+69202403 None:intergenic
TTCGACAGTGGGTGGCTGAA+GGG 0.571480 3:-69202937 MsG0380015374.01.T01:CDS
TGCAGACATAAGACCACCAA+TGG 0.571941 3:+69203153 None:intergenic
TGAAGCTCTAAAATCCACTC+TGG 0.574271 3:+69201996 None:intergenic
ATCCTTGTTCCATAGAGCGT+TGG 0.575190 3:+69203887 None:intergenic
AGAGTTGATCCATAGAAGCT+TGG 0.575276 3:-69202858 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTTCGAAAACTTACACTACG+TGG 0.579888 3:-69202035 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATTTCTGTAGTAGGCATGGG+AGG 0.581296 3:-69203715 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATGTAAAGAGCAGCCGCTCG+AGG 0.581358 3:+69203823 None:intergenic
TAGTGAAGGAGTCAAAATAT+GGG 0.581941 3:-69204118 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATACTGTTGAAGGGTTGTTG+AGG 0.585259 3:-69203597 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAAGGAGACAACACTAGTGA+AGG 0.587646 3:-69204132 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAACGAAGAAGATCCTCCTA+AGG 0.588796 3:-69203548 MsG0380015374.01.T01:CDS
GTAATTTCTGTAGTAGGCAT+GGG 0.589234 3:-69203718 MsG0380015374.01.T01:CDS
TGTAAAGAGCAGCCGCTCGA+GGG 0.591358 3:+69203824 None:intergenic
TGAAGCAGATAAAGGATTTG+GGG 0.596289 3:-69202202 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTCAATCATATACTGTTGAA+GGG 0.598280 3:-69203606 MsG0380015374.01.T01:CDS
ATAGGCGTTGGTGCTTATGG+AGG 0.598819 3:-69201882 MsG0380015374.01.T01:CDS
GAGATTGATTCGACAGTGGG+TGG 0.604591 3:-69202945 MsG0380015374.01.T01:CDS
GACTCTAGAAATTTCTACAA+GGG 0.605404 3:+69201593 None:intergenic
GCACGTTAGTGAGTTGCCAA+AGG 0.613703 3:-69202384 MsG0380015374.01.T01:CDS
AGCTACTGAAGTTGCCAGAG+TGG 0.615288 3:-69202010 MsG0380015374.01.T01:CDS
CTATGGTGGTTGTTGTCCAA+AGG 0.616800 3:-69203239 MsG0380015374.01.T01:CDS
GGTGGCTGAAGGGTTCGTGA+AGG 0.629178 3:-69202927 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAGTGGTTGTTATTGATAGG+CGG 0.631905 3:+69202684 None:intergenic
GATACACATCCAGGATCATG+AGG 0.633886 3:+69204021 None:intergenic
TTTGCTTCTTCCCTTAACAG+TGG 0.633930 3:+69204255 None:intergenic
TCTGCTAAGAGGTGTTCACA+AGG 0.636210 3:-69204232 MsG0380015374.01.T01:CDS
ACTCTAGAAATTTCTACAAG+GGG 0.637257 3:+69201594 None:intergenic
TTCCAACGCTCTATGGAACA+AGG 0.638194 3:-69203889 MsG0380015374.01.T01:CDS
ACGTTGGAAGACGTTGCTGA+AGG 0.639299 3:-69202890 MsG0380015374.01.T01:CDS
CAAAGAGATTGATTCGACAG+TGG 0.639627 3:-69202949 MsG0380015374.01.T01:CDS
TTCGAAAACTTACACTACGT+GGG 0.644866 3:-69202034 MsG0380015374.01.T01:CDS
CAAGGATCAAGCAATTCTAG+AGG 0.646730 3:-69203871 MsG0380015374.01.T01:CDS
AAGCACCAACGCCTATAGAG+AGG 0.646991 3:+69201889 None:intergenic
TTTGCAGCAAAACTCTCCCG+AGG 0.665458 3:-69201643 MsG0380015374.01.T01:CDS
TTTCTGTAGTAGGCATGGGA+GGG 0.670907 3:-69203714 MsG0380015374.01.T01:CDS
GAGGAAGCCAGAATGCTAAG+TGG 0.674654 3:-69203852 MsG0380015374.01.T01:CDS
CAGATGCTATTCGACGACGA+GGG 0.679139 3:+69203971 None:intergenic
TCAGATGCTATTCGACGACG+AGG 0.687408 3:+69203970 None:intergenic
ATGAAGTGAGAAACTACTTG+CGG 0.690038 3:-69203492 MsG0380015374.01.T01:CDS
GAATTCCAACAAAATACAGG+TGG 0.692470 3:-69202571 MsG0380015374.01.T01:CDS
CCAATGGCAACAATAGCTAG+TGG 0.701622 3:+69203169 None:intergenic
AAAGGGAAGAGATGAACGCA+CGG 0.703109 3:-69203740 MsG0380015374.01.T01:CDS
TAAGTGGCACGACCCTCGAG+CGG 0.713964 3:-69203836 MsG0380015374.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GAAATTGTTAAAAAATGTAA+TGG - Chr3:69202661-69202680 MsG0380015374.01.T01:CDS 15.0%
!! AGAAATTACATGTTAAATCA+AGG - Chr3:69203745-69203764 MsG0380015374.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTAAATGAACAACAATCTT+TGG - Chr3:69202564-69202583 MsG0380015374.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAGATTGTTGTTCATTTAA+AGG + Chr3:69202565-69202584 None:intergenic 20.0%
!!! TTAAATCCTCAAATTTTTCA+AGG + Chr3:69203098-69203117 None:intergenic 20.0%
! AAACTAAAAGAACTGTTCAT+TGG - Chr3:69204032-69204051 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
! ACGTTATGTTAATTTAGGTA+TGG - Chr3:69203596-69203615 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAAACTAAGACATCTTAT+CGG - Chr3:69203510-69203529 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTGAAAAATATCCTTAGG+AGG + Chr3:69202325-69202344 None:intergenic 25.0%
! CTAAAAATGCTTCAGTTATA+CGG - Chr3:69204107-69204126 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
! GTAGATGTAATTAAAGAGTT+AGG - Chr3:69203627-69203646 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
! TATGATCCTTGAAAAATTTG+AGG - Chr3:69203089-69203108 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
! TATGTTAATTTAGGTATGGA+AGG - Chr3:69203600-69203619 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
! TCCATTTGAAAAATATCCTT+AGG + Chr3:69202328-69202347 None:intergenic 25.0%
!! CACTTGAAGTATTTAAGTTT+GGG - Chr3:69203375-69203394 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
!! GATTTAACTTCATAATCTTC+TGG + Chr3:69202889-69202908 None:intergenic 25.0%
!!! AAACATTTTAGAGATTGCAT+TGG + Chr3:69203933-69203952 None:intergenic 25.0%
!!! ATATGTATTTTCAAGATGGA+TGG - Chr3:69204003-69204022 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATTTTTCAAATGGATCGA+GGG - Chr3:69202332-69202351 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGAACAGTTCTTTTAGTTT+CGG + Chr3:69204032-69204051 None:intergenic 25.0%
!!! TCACATATGTATTTTCAAGA+TGG - Chr3:69203999-69204018 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCCTAAGGATATTTTTCAAA+TGG - Chr3:69202324-69202343 MsG0380015374.01.T01:CDS 25.0%
AAAAACTTTCTTCGTAAGAG+TGG + Chr3:69202179-69202198 None:intergenic 30.0%
AAGAGAAAAATGTGTTTGAG+TGG - Chr3:69202728-69202747 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
AAGGAAAGAAGTGAAAGATA+TGG - Chr3:69201944-69201963 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
AATCAATGAAATGCAACACT+TGG - Chr3:69203722-69203741 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
ACGCTACGTTATGTTAATTT+AGG - Chr3:69203591-69203610 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
ACTGTCTTTGATTCAGTTAA+AGG - Chr3:69203539-69203558 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
AGCGATATTATTATCGACAA+AGG - Chr3:69204071-69204090 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
ATGAAAGATACACATCTAGT+TGG - Chr3:69202784-69202803 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
ATTCAGTTAAAGGATGGTAT+TGG - Chr3:69203549-69203568 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
ATTCATATGTATCCTTTGCA+AGG - Chr3:69203262-69203281 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
CAGAGATTTAGTGAAAATCT+AGG - Chr3:69202751-69202770 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
CCAAACTTAAATACTTCAAG+TGG + Chr3:69203377-69203396 None:intergenic 30.0%
CTCAATCATATACTGTTGAA+GGG - Chr3:69202251-69202270 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
GCTGTAATTGACAGTAAAAA+TGG - Chr3:69202454-69202473 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
GTATTGAAAGTTCACATGTT+CGG - Chr3:69203214-69203233 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TAGTGAAGGAGTCAAAATAT+GGG - Chr3:69201739-69201758 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TCTAATCTGAAGAATATCAC+TGG - Chr3:69204134-69204153 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TCTCAATCATATACTGTTGA+AGG - Chr3:69202250-69202269 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TCTTTGATTCAGTTAAAGGA+TGG - Chr3:69203543-69203562 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAGATACACATCTAGTT+GGG - Chr3:69202785-69202804 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATGTTCCAAAAGAGTT+GGG - Chr3:69203342-69203361 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TTGATTGATTGGATGGTAAA+GGG - Chr3:69202100-69202119 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
TTTGACAACAAGAATGTCAT+TGG - Chr3:69202196-69202215 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGAGACATGTTGATTGAT+TGG - Chr3:69202089-69202108 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
! ACTCTAGAAATTTCTACAAG+GGG + Chr3:69204266-69204285 None:intergenic 30.0%
! CCACTTGAAGTATTTAAGTT+TGG - Chr3:69203374-69203393 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
! GACTCTAGAAATTTCTACAA+GGG + Chr3:69204267-69204286 None:intergenic 30.0%
! GTTGGGATAAAAGAAGTTTT+AGG - Chr3:69202802-69202821 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
! TTCAAAATCTTGTTGTGTTG+AGG - Chr3:69203880-69203899 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGGAGTTGTTCAATAAGA+AGG - Chr3:69202582-69202601 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGTTTGGAGTGTACATTTT+TGG - Chr3:69202416-69202435 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
!! GATATTTTTCAAATGGATCG+AGG - Chr3:69202331-69202350 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTTTGGAGTGTACATTTTT+GGG - Chr3:69202417-69202436 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGTTGTGTTTGATGATGTT+TGG - Chr3:69202401-69202420 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAGTCATGCTTGTTGTATTT+TGG - Chr3:69202856-69202875 MsG0380015374.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGATCATTGTTTTAATCTTG+TGG + Chr3:69201868-69201887 None:intergenic 30.0%
AACAAAATACAGGTGGTTGA+GGG - Chr3:69203293-69203312 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
AACATAACGTAGCGTTTGTA+GGG + Chr3:69203586-69203605 None:intergenic 35.0%
AGAACTGTTCATTGGATCTT+CGG - Chr3:69204040-69204059 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
AGCTTGAAGTTCTCCTAATT+TGG - Chr3:69204174-69204193 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGTGAGAAACTACTTG+CGG - Chr3:69202365-69202384 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
CAACTTGCATACTCCAAATT+AGG + Chr3:69204190-69204209 None:intergenic 35.0%
CTAGTGAAGGAGTCAAAATA+TGG - Chr3:69201738-69201757 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
CTCTTCTATCAGCATCTTTA+AGG + Chr3:69201694-69201713 None:intergenic 35.0%
CTGAAGCAGATAAAGGATTT+GGG - Chr3:69203654-69203673 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
GAATTCCAACAAAATACAGG+TGG - Chr3:69203286-69203305 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
GATGGACAATCATACTTAAG+TGG - Chr3:69203141-69203160 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
GGAGAATTCCAACAAAATAC+AGG - Chr3:69203283-69203302 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAATTCCCAAAATCCAT+TGG - Chr3:69203411-69203430 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
GTAATTTCTGTAGTAGGCAT+GGG - Chr3:69202139-69202158 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
GTTGAATGTTCCAAAAGAGT+TGG - Chr3:69203341-69203360 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
GTTGATTGATTGGATGGTAA+AGG - Chr3:69202099-69202118 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
TAACATAACGTAGCGTTTGT+AGG + Chr3:69203587-69203606 None:intergenic 35.0%
TACAAGACAACACAACATCT+AGG + Chr3:69202507-69202526 None:intergenic 35.0%
TGAAGCAGATAAAGGATTTG+GGG - Chr3:69203655-69203674 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
TGCAAGCATATTAGTGAAGA+TGG - Chr3:69203123-69203142 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
TTCGAAAACTTACACTACGT+GGG - Chr3:69203823-69203842 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
! AAGGCATTCAGATTTGACTA+TGG - Chr3:69202601-69202620 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTGGTTGTTATTGATAGG+CGG + Chr3:69203176-69203195 None:intergenic 35.0%
! AGACATGTTGATTGATTGGA+TGG - Chr3:69202093-69202112 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
! AGTTTGGGTTATGTAACAAC+AGG - Chr3:69203390-69203409 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
! ATCAAACTTCCCAACTCTTT+TGG + Chr3:69203354-69203373 None:intergenic 35.0%
! CAGAAGTGGTTGTTATTGAT+AGG + Chr3:69203179-69203198 None:intergenic 35.0%
! CGACTCTAGAAATTTCTACA+AGG + Chr3:69204268-69204287 None:intergenic 35.0%
! GTAAGTTTTCGAAGCTTAGT+TGG + Chr3:69203816-69203835 None:intergenic 35.0%
! GTGTTGCATTTCATTGATTG+AGG + Chr3:69203721-69203740 None:intergenic 35.0%
! TCTATCAGCATCTTTAAGGA+AGG + Chr3:69201690-69201709 None:intergenic 35.0%
! TTTGGAACATTCAACAATCG+AGG + Chr3:69203336-69203355 None:intergenic 35.0%
!! AAAGAGATTGATTCGACAGT+GGG - Chr3:69202909-69202928 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
!! AGAGTTGATGGTAAAGCTAA+AGG - Chr3:69203039-69203058 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
!! GTAGAAATTTCTAGAGTCGA+TGG - Chr3:69204269-69204288 MsG0380015374.01.T01:CDS 35.0%
AAACGAAGAAGATCCTCCTA+AGG - Chr3:69202309-69202328 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
AAAGGAGACAACACTAGTGA+AGG - Chr3:69201725-69201744 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
AAGCATGACTTGAGAGAGTA+AGG + Chr3:69202847-69202866 None:intergenic 40.0%
ACCAACTACTTCCACTGTTA+AGG - Chr3:69201591-69201610 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
AGGAAAGCTGAAGCAGATAA+AGG - Chr3:69203647-69203666 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
ATACTGTTGAAGGGTTGTTG+AGG - Chr3:69202260-69202279 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
ATACTTGCACCAAGCTTCTA+TGG + Chr3:69203011-69203030 None:intergenic 40.0%
ATGATCCAATTCCAATCCTC+GGG + Chr3:69204233-69204252 None:intergenic 40.0%
ATTGAGGAAGCTGAAGTTGT+CGG - Chr3:69202055-69202074 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
CAACAAAATACAGGTGGTTG+AGG - Chr3:69203292-69203311 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
CAAGGATCAAGCAATTCTAG+AGG - Chr3:69201986-69202005 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
CATGATCCAATTCCAATCCT+CGG + Chr3:69204234-69204253 None:intergenic 40.0%
CCAACTACTTCCACTGTTAA+GGG - Chr3:69201592-69201611 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
CTCAATGAAGTCATCAGAAG+TGG + Chr3:69203193-69203212 None:intergenic 40.0%
CTTCAAGCTTCTCTAAGTGT+TGG + Chr3:69204163-69204182 None:intergenic 40.0%
CTTCGAAAACTTACACTACG+TGG - Chr3:69203822-69203841 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGATTGTTCGGAACTCA+AGG - Chr3:69204291-69204310 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GAAGAAGCAAATCTGCTAAG+AGG - Chr3:69201614-69201633 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GACACTTTGATTGTCGTGTA+TGG - Chr3:69202218-69202237 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GAGTCGATGGAAAGATTGTT+CGG - Chr3:69204282-69204301 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GCATTCAGATTTGACTATGG+TGG - Chr3:69202604-69202623 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GCTATATCAATGAGCTCCTT+TGG + Chr3:69202637-69202656 None:intergenic 40.0%
GCTGAAGCAGATAAAGGATT+TGG - Chr3:69203653-69203672 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GGTAATTTCTGTAGTAGGCA+TGG - Chr3:69202138-69202157 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
GTATCTTCGGTTAGAGTTGA+TGG - Chr3:69203027-69203046 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
TACTGTTGAAGGGTTGTTGA+GGG - Chr3:69202261-69202280 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
TGGAGTAAAGATACACATCC+AGG + Chr3:69201848-69201867 None:intergenic 40.0%
TGTTGGAATTCTCCTTGCAA+AGG + Chr3:69203277-69203296 None:intergenic 40.0%
TTTGCTTCTTCCCTTAACAG+TGG + Chr3:69201605-69201624 None:intergenic 40.0%
! AGAGTTGATCCATAGAAGCT+TGG - Chr3:69202999-69203018 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
! AGTTTTCGAAGCTTAGTTGG+CGG + Chr3:69203813-69203832 None:intergenic 40.0%
! CACTTGTTGATCCTCTCTAT+AGG - Chr3:69203957-69203976 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
! CTCAACCACCTGTATTTTGT+TGG + Chr3:69203294-69203313 None:intergenic 40.0%
!! AAGCTTGGTGCAAGTATCTT+CGG - Chr3:69203014-69203033 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAGAGATTGATTCGACAG+TGG - Chr3:69202908-69202927 MsG0380015374.01.T01:CDS 40.0%
!! CTAAGCTTGCTAATCTCCTT+TGG + Chr3:69203492-69203511 None:intergenic 40.0%
!! TGAAGCTCTAAAATCCACTC+TGG + Chr3:69203864-69203883 None:intergenic 40.0%
AAAGGGAAGAGATGAACGCA+CGG - Chr3:69202117-69202136 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
AGAAGAGCTGCAACAGCTAA+AGG - Chr3:69201707-69201726 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
AGACAACATCCTCATGATCC+TGG - Chr3:69201827-69201846 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
ATATGGCTTCCAACGCTCTA+TGG - Chr3:69201961-69201980 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
ATCCTTGTTCCATAGAGCGT+TGG + Chr3:69201973-69201992 None:intergenic 45.0%
ATTTCTGTAGTAGGCATGGG+AGG - Chr3:69202142-69202161 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
CATGAGGATGTTGTCTCACA+TGG + Chr3:69201823-69201842 None:intergenic 45.0%
CCAATGGCAACAATAGCTAG+TGG + Chr3:69202691-69202710 None:intergenic 45.0%
CCACTAGCTATTGTTGCCAT+TGG - Chr3:69202688-69202707 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
CCCTTAACAGTGGAAGTAGT+TGG + Chr3:69201595-69201614 None:intergenic 45.0%
CCTAGAGACCTTGGATCTAA+AGG - Chr3:69203446-69203465 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
CCTTTAGATCCAAGGTCTCT+AGG + Chr3:69203449-69203468 None:intergenic 45.0%
CGAGGATTGGAATTGGATCA+TGG - Chr3:69204232-69204251 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
CGCACGGTAATTTCTGTAGT+AGG - Chr3:69202133-69202152 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
CTAAGACATCTTATCGGCAC+TGG - Chr3:69203516-69203535 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
CTAGCTATTGTTGCCATTGG+TGG - Chr3:69202691-69202710 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
CTATGGTGGTTGTTGTCCAA+AGG - Chr3:69202618-69202637 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
GAAACTACTTGCGGCAAAAG+AGG - Chr3:69202374-69202393 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
GATACACATCCAGGATCATG+AGG + Chr3:69201839-69201858 None:intergenic 45.0%
TGCAGACATAAGACCACCAA+TGG + Chr3:69202707-69202726 None:intergenic 45.0%
TTCCAACGCTCTATGGAACA+AGG - Chr3:69201968-69201987 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
TTGATCCTCTCTATAGGCGT+TGG - Chr3:69203963-69203982 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTGTAGTAGGCATGGGA+GGG - Chr3:69202143-69202162 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
!! GGAGCATGCCAATGGATTTT+GGG + Chr3:69203422-69203441 None:intergenic 45.0%
!! TCTATAGGCGTTGGTGCTTA+TGG - Chr3:69203972-69203991 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTGCTAAGAGGTGTTCACA+AGG - Chr3:69201625-69201644 MsG0380015374.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGAGCATGCCAATGGATTT+TGG + Chr3:69203423-69203442 None:intergenic 45.0%
AAGCACCAACGCCTATAGAG+AGG + Chr3:69203971-69203990 None:intergenic 50.0%
AAGGGTTCGTGAAGGAGGAA+AGG - Chr3:69202938-69202957 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
ACGTTGGAAGACGTTGCTGA+AGG - Chr3:69202967-69202986 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
ACTCTCCCGAGGATTGGAAT+TGG - Chr3:69204225-69204244 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
AGCAAAACTCTCCCGAGGAT+TGG - Chr3:69204219-69204238 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
AGCGGCTGCTCTTTACATTG+AGG - Chr3:69202039-69202058 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
AGCTACTGAAGTTGCCAGAG+TGG - Chr3:69203847-69203866 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
AGGGTTCGTGAAGGAGGAAA+GGG - Chr3:69202939-69202958 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
CAGATGCTATTCGACGACGA+GGG + Chr3:69201889-69201908 None:intergenic 50.0%
GAGGAAGCCAGAATGCTAAG+TGG - Chr3:69202005-69202024 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
GATCCAAGGTCTCTAGGTTC+TGG + Chr3:69203443-69203462 None:intergenic 50.0%
GCACGTTAGTGAGTTGCCAA+AGG - Chr3:69203473-69203492 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
GTCGTCTGTTCGTGAGATCA+AGG - Chr3:69201925-69201944 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
GTGCGTAGCCTTTAGATCCA+AGG + Chr3:69203457-69203476 None:intergenic 50.0%
TCAGATGCTATTCGACGACG+AGG + Chr3:69201890-69201909 None:intergenic 50.0%
TTTGCAGCAAAACTCTCCCG+AGG - Chr3:69204214-69204233 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
!! ATAGGCGTTGGTGCTTATGG+AGG - Chr3:69203975-69203994 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGATTGATTCGACAGTGGG+TGG - Chr3:69202912-69202931 MsG0380015374.01.T01:CDS 50.0%
!! TAGGTTCTGGAGCATGCCAA+TGG + Chr3:69203430-69203449 None:intergenic 50.0%
ATGTAAAGAGCAGCCGCTCG+AGG + Chr3:69202037-69202056 None:intergenic 55.0%
ATTCGACAGTGGGTGGCTGA+AGG - Chr3:69202919-69202938 MsG0380015374.01.T01:CDS 55.0%
GCTCCAGAACCTAGAGACCT+TGG - Chr3:69203437-69203456 MsG0380015374.01.T01:CDS 55.0%
GGAGGAAAGGGGAAAGACGT+TGG - Chr3:69202951-69202970 MsG0380015374.01.T01:CDS 55.0%
GGGTTCGTGAAGGAGGAAAG+GGG - Chr3:69202940-69202959 MsG0380015374.01.T01:CDS 55.0%
TGTAAAGAGCAGCCGCTCGA+GGG + Chr3:69202036-69202055 None:intergenic 55.0%
TTCGACAGTGGGTGGCTGAA+GGG - Chr3:69202920-69202939 MsG0380015374.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTCGTGCCACTTAGCATTC+TGG + Chr3:69202015-69202034 None:intergenic 55.0%
GGCTGAAGGGTTCGTGAAGG+AGG - Chr3:69202933-69202952 MsG0380015374.01.T01:CDS 60.0%
GGTGGCTGAAGGGTTCGTGA+AGG - Chr3:69202930-69202949 MsG0380015374.01.T01:CDS 60.0%
GTAGTAGGCATGGGAGGGCA+AGG - Chr3:69202148-69202167 MsG0380015374.01.T01:CDS 60.0%
TAAGTGGCACGACCCTCGAG+CGG - Chr3:69202021-69202040 MsG0380015374.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 69201560 69204319 69201560 ID=MsG0380015374.01;Name=MsG0380015374.01
Chr3 mRNA 69201560 69204319 69201560 ID=MsG0380015374.01.T01;Parent=MsG0380015374.01;Name=MsG0380015374.01.T01;_AED=0.14;_eAED=0.14;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|919
Chr3 exon 69201560 69204319 69201560 ID=MsG0380015374.01.T01:exon:289;Parent=MsG0380015374.01.T01
Chr3 CDS 69201560 69204319 69201560 ID=MsG0380015374.01.T01:cds;Parent=MsG0380015374.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380015374.01.T01

ATGGCAGAAATGGCAGTGTCTCTAGTAATTGACCAACTACTTCCACTGTTAAGGGAAGAAGCAAATCTGCTAAGAGGTGTTCACAAGGAATTTTCAGATATTAAAGATGAACTTGAAAGCATTCAAGCCTTCCTTAAAGATGCTGATAGAAGAGCTGCAACAGCTAAAGGAGACAACACTAGTGAAGGAGTCAAAATATGGGTGAAACAAGTTAGAGAAGCAGCTTTTCGCATAGAAGATATCATCGATGATTATTTGATCCATGTGAGACAACATCCTCATGATCCTGGATGTGTATCTTTACTCCACAAGATTAAAACAATGATCCCTCGTCGTCGAATAGCATCTGAGATTCAAGACATTAAGTCGTCTGTTCGTGAGATCAAGGAAAGAAGTGAAAGATATGGCTTCCAACGCTCTATGGAACAAGGATCAAGCAATTCTAGAGGAAGCCAGAATGCTAAGTGGCACGACCCTCGAGCGGCTGCTCTTTACATTGAGGAAGCTGAAGTTGTCGGCTATGAAACACAAAGAGACATGTTGATTGATTGGATGGTAAAGGGAAGAGATGAACGCACGGTAATTTCTGTAGTAGGCATGGGAGGGCAAGGTAAAACCACTCTTACGAAGAAAGTTTTTGACAACAAGAATGTCATTGGACACTTTGATTGTCGTGTATGGATCATAGTGTCTCAATCATATACTGTTGAAGGGTTGTTGAGGGACATGTTGCTAAAGTTTTACAAACAAAACGAAGAAGATCCTCCTAAGGATATTTTTCAAATGGATCGAGGGTCATTGACTGATGAAGTGAGAAACTACTTGCGGCAAAAGAGGTATGTTGTTGTGTTTGATGATGTTTGGAGTGTACATTTTTGGGATGATATTGAATTTGCTGTAATTGACAGTAAAAATGGAAGTAAGATATTTATCACAACAAGAAACCTAGATGTTGTGTTGTCTTGTAAAAAATCTTCTTATATTGAAGTGCTTGAGTTGCAACCTTTAAATGAACAACAATCTTTGGAGTTGTTCAATAAGAAGGCATTCAGATTTGACTATGGTGGTTGTTGTCCAAAGGAGCTCATTGATATAGCTTATGAAATTGTTAAAAAATGTAATGGTTTACCACTAGCTATTGTTGCCATTGGTGGTCTTATGTCTGCAAAAGAGAAAAATGTGTTTGAGTGGCAGAGATTTAGTGAAAATCTAGGATTAGAGCTAATGAAAGATACACATCTAGTTGGGATAAAAGAAGTTTTAGGCTTAAGTTACGATGATTTGCCTTACTCTCTCAAGTCATGCTTGTTGTATTTTGGAATGTATCCAGAAGATTATGAAGTTAAATCAAAGAGATTGATTCGACAGTGGGTGGCTGAAGGGTTCGTGAAGGAGGAAAGGGGAAAGACGTTGGAAGACGTTGCTGAAGGATATTTAACAGAGTTGATCCATAGAAGCTTGGTGCAAGTATCTTCGGTTAGAGTTGATGGTAAAGCTAAAGGTTGTCGTGTTCATGATCTAATACGCGATATGATCCTTGAAAAATTTGAGGATTTAAATTTTTGCAAGCATATTAGTGAAGATGGACAATCATACTTAAGTGGAACATTTCGCCGCCTATCAATAACAACCACTTCTGATGACTTCATTGAGCGTATTGAAAGTTCACATGTTCGGTCAATACTTGTTATTACAAATGAAGATTCATATGTATCCTTTGCAAGGAGAATTCCAACAAAATACAGGTGGTTGAGGGTTCTTGATTATCAATTTCCTCGATTGTTGAATGTTCCAAAAGAGTTGGGAAGTTTGATCCACTTGAAGTATTTAAGTTTGGGTTATGTAACAACAGGTAAATTCCCAAAATCCATTGGCATGCTCCAGAACCTAGAGACCTTGGATCTAAAGGCTACGCACGTTAGTGAGTTGCCAAAGGAGATTAGCAAGCTTAGAAAACTAAGACATCTTATCGGCACTGGACTGTCTTTGATTCAGTTAAAGGATGGTATTGGAGAGATGACATCCCTACAAACGCTACGTTATGTTAATTTAGGTATGGAAGGAACTGTAGATGTAATTAAAGAGTTAGGAAAGCTGAAGCAGATAAAGGATTTGGGGTTGCTTAATGTTTGTAGAGAAGATTACAACATTCTATCTTCCTCAATCAATGAAATGCAACACTTGGAGAAATTACATGTTAAATCAAGGTCAACAGATAACGATGAATTCATTGATTTGAATTTGATTTCACCGCCAACTAAGCTTCGAAAACTTACACTACGTGGGAAGCTACTGAAGTTGCCAGAGTGGATTTTAGAGCTTCAAAATCTTGTTGTGTTGAGGTTGAAGCTCTCTTGTTTAACTAAAGATCCAATGCAATCTCTAAAATGTTTGCAACACTTGTTGATCCTCTCTATAGGCGTTGGTGCTTATGGAGGTTCACATATGTATTTTCAAGATGGATGGTTTCCGAAACTAAAAGAACTGTTCATTGGATCTTCGGATGAATTGAGCGATATTATTATCGACAAAGGAGCACTGTCTTCTCTAAAAATGCTTCAGTTATACGGACTCTCTAATCTGAAGAATATCACTGGCATCCAACACTTAGAGAAGCTTGAAGTTCTCCTAATTTGGAGTATGCAAGTTGATTGTTTGCAGCAAAACTCTCCCGAGGATTGGAATTGGATCATGGAGCATGTGCCCCTTGTAGAAATTTCTAGAGTCGATGGAAAGATTGTTCGGAACTCAAGGAATTAG

Protein sequence

>MsG0380015374.01.T01

MAEMAVSLVIDQLLPLLREEANLLRGVHKEFSDIKDELESIQAFLKDADRRAATAKGDNTSEGVKIWVKQVREAAFRIEDIIDDYLIHVRQHPHDPGCVSLLHKIKTMIPRRRIASEIQDIKSSVREIKERSERYGFQRSMEQGSSNSRGSQNAKWHDPRAAALYIEEAEVVGYETQRDMLIDWMVKGRDERTVISVVGMGGQGKTTLTKKVFDNKNVIGHFDCRVWIIVSQSYTVEGLLRDMLLKFYKQNEEDPPKDIFQMDRGSLTDEVRNYLRQKRYVVVFDDVWSVHFWDDIEFAVIDSKNGSKIFITTRNLDVVLSCKKSSYIEVLELQPLNEQQSLELFNKKAFRFDYGGCCPKELIDIAYEIVKKCNGLPLAIVAIGGLMSAKEKNVFEWQRFSENLGLELMKDTHLVGIKEVLGLSYDDLPYSLKSCLLYFGMYPEDYEVKSKRLIRQWVAEGFVKEERGKTLEDVAEGYLTELIHRSLVQVSSVRVDGKAKGCRVHDLIRDMILEKFEDLNFCKHISEDGQSYLSGTFRRLSITTTSDDFIERIESSHVRSILVITNEDSYVSFARRIPTKYRWLRVLDYQFPRLLNVPKELGSLIHLKYLSLGYVTTGKFPKSIGMLQNLETLDLKATHVSELPKEISKLRKLRHLIGTGLSLIQLKDGIGEMTSLQTLRYVNLGMEGTVDVIKELGKLKQIKDLGLLNVCREDYNILSSSINEMQHLEKLHVKSRSTDNDEFIDLNLISPPTKLRKLTLRGKLLKLPEWILELQNLVVLRLKLSCLTKDPMQSLKCLQHLLILSIGVGAYGGSHMYFQDGWFPKLKELFIGSSDELSDIIIDKGALSSLKMLQLYGLSNLKNITGIQHLEKLEVLLIWSMQVDCLQQNSPEDWNWIMEHVPLVEISRVDGKIVRNSRN*