AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680031021.01

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MsG0680031021.01.T01 AT2G18470 41.053 285 153 5 106 375 272 556 1.54e-62 213
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MsG0680031021.01.T01 AT3G46370 41.135 282 146 5 105 371 476 752 1.12e-61 213
MsG0680031021.01.T01 AT1G24030 40.339 295 152 8 94 368 56 346 1.15e-61 204
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MsG0680031021.01.T01 AT1G51820 39.643 280 153 5 105 371 305 581 1.73e-61 210
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MsG0680031021.01.T01 AT4G31110 43.056 288 149 5 106 378 441 728 2.52e-61 213
MsG0680031021.01.T01 AT5G28680 42.907 289 145 9 100 371 502 787 2.69e-61 213
MsG0680031021.01.T01 AT5G28680 42.907 289 145 9 100 371 502 787 2.69e-61 213
MsG0680031021.01.T01 AT1G30570 35.859 396 214 13 2 380 423 795 2.76e-61 213
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MsG0680031021.01.T01 AT1G79670 41.319 288 154 6 106 379 409 695 3.62e-61 211
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MsG0680031021.01.T01 AT1G51850 40.569 281 149 7 105 371 547 823 4.19e-61 213
MsG0680031021.01.T01 AT1G51890 41.071 280 148 6 105 371 559 834 4.90e-61 213
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MsG0680031021.01.T01 AT4G23320 40.138 289 156 6 99 371 164 451 1.28e-59 202
MsG0680031021.01.T01 AT5G59700 43.636 275 140 7 111 371 475 748 1.29e-59 208
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MsG0680031021.01.T01 AT3G09830 38.944 303 161 6 100 378 66 368 2.16e-59 199
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MsG0680031021.01.T01 AT4G01330 37.102 283 158 6 106 371 150 429 2.52e-58 198
MsG0680031021.01.T01 AT5G47850 42.140 299 142 9 103 371 428 725 2.53e-58 204
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MsG0680031021.01.T01 AT4G23270 37.415 294 167 5 99 376 307 599 6.12e-58 201
MsG0680031021.01.T01 AT4G29180 36.601 306 165 6 100 380 548 849 6.14e-58 204
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MsG0680031021.01.T01 AT1G16260 38.621 290 165 4 106 382 378 667 7.01e-58 202
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MsG0680031021.01.T01 AT4G23190 38.832 291 159 5 99 371 253 542 8.46e-58 199
MsG0680031021.01.T01 AT4G32000 38.384 297 168 6 90 371 100 396 9.10e-58 195
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MsG0680031021.01.T01 AT1G61420 37.584 298 168 6 89 371 319 613 1.06e-57 201
MsG0680031021.01.T01 AT4G11460 37.801 291 164 5 102 376 330 619 1.20e-57 201
MsG0680031021.01.T01 AT4G32000 34.037 379 227 9 7 371 69 438 1.22e-57 196
MsG0680031021.01.T01 AT4G32000 39.427 279 156 4 106 371 117 395 1.28e-57 195
MsG0680031021.01.T01 AT4G27290 38.768 276 154 5 111 371 458 733 1.38e-57 202
MsG0680031021.01.T01 AT5G45780 38.028 284 157 6 105 371 244 525 1.49e-57 198
MsG0680031021.01.T01 AT4G23290 38.538 301 166 8 95 378 297 595 1.66e-57 200
MsG0680031021.01.T01 AT4G27290 38.768 276 154 5 111 371 504 779 1.66e-57 202
MsG0680031021.01.T01 AT4G23130 37.419 310 178 7 82 376 309 617 2.02e-57 200
MsG0680031021.01.T01 AT1G60800 36.825 315 168 8 86 371 258 570 2.02e-57 199
MsG0680031021.01.T01 AT1G07870 39.576 283 154 5 106 371 91 373 2.03e-57 194
MsG0680031021.01.T01 AT4G23220 38.596 285 157 8 104 372 323 605 2.10e-57 200
MsG0680031021.01.T01 AT5G10530 35.906 298 173 5 91 373 311 605 2.16e-57 199
MsG0680031021.01.T01 AT4G23280 37.755 294 166 5 99 376 325 617 2.22e-57 200
MsG0680031021.01.T01 AT4G21410 37.748 302 158 9 94 372 209 503 2.26e-57 197
MsG0680031021.01.T01 AT1G61490 38.333 300 163 7 89 371 313 607 2.31e-57 199
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MsG0680031021.01.T01 AT1G61500 37.584 298 168 6 89 371 469 763 6.87e-57 200
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MsG0680031021.01.T01 AT1G61490 38.333 300 163 7 89 371 437 731 7.67e-57 200
MsG0680031021.01.T01 AT4G00960 35.473 296 172 7 94 371 32 326 8.13e-57 192
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MsG0680031021.01.T01 AT1G61490 38.333 300 163 7 89 371 463 757 9.99e-57 200
MsG0680031021.01.T01 AT1G61490 38.333 300 163 7 89 371 463 757 9.99e-57 200
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MsG0680031021.01.T01 AT5G49760 38.217 314 179 6 81 380 594 906 1.44e-56 201
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MsG0680031021.01.T01 AT2G28940 38.511 309 162 7 106 386 90 398 8.25e-56 191
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MsG0680031021.01.T01 AT1G09440 35.106 282 165 6 106 371 145 424 1.74e-55 191
MsG0680031021.01.T01 AT4G11470 35.640 289 169 5 104 376 325 612 1.75e-55 194
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MsG0680031021.01.T01 AT2G28250 37.500 304 161 7 102 378 194 495 1.83e-55 192
MsG0680031021.01.T01 AT2G28250 37.500 304 161 7 102 378 194 495 1.83e-55 192
MsG0680031021.01.T01 AT2G28250 37.500 304 161 7 102 378 194 495 1.83e-55 192
MsG0680031021.01.T01 AT2G28250 37.500 304 161 7 102 378 194 495 1.83e-55 192
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MsG0680031021.01.T01 AT5G03320 37.179 312 172 6 91 378 54 365 2.34e-55 189
MsG0680031021.01.T01 AT4G21400 37.542 301 158 8 94 372 328 620 2.47e-55 194
MsG0680031021.01.T01 AT2G14510 40.860 279 154 6 105 373 552 829 2.48e-55 197
MsG0680031021.01.T01 AT4G11460 36.395 294 167 5 102 376 330 622 2.91e-55 194
MsG0680031021.01.T01 AT1G07570 33.144 353 203 7 53 379 9 354 3.27e-55 188
MsG0680031021.01.T01 AT1G07570 33.144 353 203 7 53 379 9 354 3.27e-55 188
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MsG0680031021.01.T01 AT5G49770 38.585 311 178 5 81 378 597 907 3.29e-55 197
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MsG0680031021.01.T01 AT2G28930 33.832 334 181 7 90 384 41 373 4.84e-54 185
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MsG0680031021.01.T01 AT1G34210 36.842 285 161 6 105 371 292 575 4.96e-53 187
MsG0680031021.01.T01 AT2G11520 35.849 318 182 8 92 388 194 510 4.98e-53 185
MsG0680031021.01.T01 AT1G66880 37.829 304 166 9 102 387 574 872 5.01e-53 191
MsG0680031021.01.T01 AT1G70450 36.513 304 156 8 95 371 26 319 5.12e-53 182
MsG0680031021.01.T01 AT3G21630 32.800 375 211 12 11 368 233 583 5.29e-53 187
MsG0680031021.01.T01 AT1G29750 35.473 296 173 6 92 371 640 933 6.12e-53 191
MsG0680031021.01.T01 AT4G22130 31.043 393 244 8 11 381 288 675 6.40e-53 188
MsG0680031021.01.T01 AT2G25220 45.370 216 113 3 106 316 85 300 6.52e-53 181
MsG0680031021.01.T01 AT1G29750 35.473 296 173 6 92 371 655 948 6.84e-53 191
MsG0680031021.01.T01 AT3G45420 36.364 297 174 6 94 377 326 620 7.07e-53 187
MsG0680031021.01.T01 AT1G66880 37.829 304 166 9 102 387 953 1251 7.29e-53 191
MsG0680031021.01.T01 AT1G61360 38.194 288 162 5 100 371 399 686 7.39e-53 188
MsG0680031021.01.T01 AT1G61360 38.194 288 162 5 100 371 399 686 7.39e-53 188
MsG0680031021.01.T01 AT1G61360 38.194 288 162 5 100 371 399 686 7.39e-53 188
MsG0680031021.01.T01 AT2G43690 33.628 339 205 7 102 425 285 618 9.42e-53 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G35620 36.237 287 163 6 102 373 288 569 1.07e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G35620 36.237 287 163 6 102 373 288 569 1.07e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G35620 36.237 287 163 6 102 373 288 569 1.07e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G35620 36.237 287 163 6 102 373 288 569 1.07e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT1G61440 36.634 303 171 7 85 371 448 745 1.15e-52 188
MsG0680031021.01.T01 AT2G25220 45.370 216 113 3 106 316 134 349 1.16e-52 182
MsG0680031021.01.T01 AT4G23250 36.713 286 164 5 104 373 345 629 1.19e-52 187
MsG0680031021.01.T01 AT2G43690 34.218 339 203 8 102 425 321 654 1.19e-52 187
MsG0680031021.01.T01 AT2G43690 34.218 339 203 8 102 425 321 654 1.19e-52 187
MsG0680031021.01.T01 AT1G61360 38.194 288 162 5 100 371 480 767 1.47e-52 188
MsG0680031021.01.T01 AT1G61370 37.956 274 150 6 115 371 347 617 1.66e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT3G08870 37.455 275 161 4 105 368 355 629 1.76e-52 187
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT2G30740 36.735 294 163 6 107 378 60 352 1.82e-52 180
MsG0680031021.01.T01 AT4G23210 37.591 274 159 4 104 366 346 618 1.86e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G30730 35.238 315 176 7 91 378 15 328 1.89e-52 179
MsG0680031021.01.T01 AT3G09010 42.180 211 115 3 106 309 34 244 1.89e-52 178
MsG0680031021.01.T01 AT2G43700 36.620 284 168 4 102 373 296 579 1.95e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G43700 36.620 284 168 4 102 373 296 579 1.95e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G43700 36.620 284 168 4 102 373 296 579 1.95e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G43700 36.620 284 168 4 102 373 296 579 1.95e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT2G43700 36.620 284 168 4 102 373 320 603 2.02e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT4G32300 36.620 284 164 7 104 373 481 762 2.19e-52 188
MsG0680031021.01.T01 AT2G30730 35.238 315 176 7 91 378 25 338 2.20e-52 179
MsG0680031021.01.T01 AT4G23250 36.713 286 164 5 104 373 340 624 2.22e-52 187
MsG0680031021.01.T01 AT3G08870 37.455 275 161 4 105 368 376 650 2.27e-52 187
MsG0680031021.01.T01 AT1G78530 32.564 390 204 12 3 379 5 348 2.29e-52 179
MsG0680031021.01.T01 AT5G59270 36.014 286 161 7 105 373 336 616 2.30e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT5G59270 36.014 286 161 7 105 373 339 619 2.38e-52 186
MsG0680031021.01.T01 AT1G56720 34.859 284 163 7 106 371 167 446 2.50e-52 182
MsG0680031021.01.T01 AT1G56720 34.859 284 163 7 106 371 167 446 2.50e-52 182
MsG0680031021.01.T01 AT1G56720 34.859 284 163 7 106 371 167 446 2.50e-52 182
MsG0680031021.01.T01 AT1G56720 34.859 284 163 7 106 371 167 446 2.50e-52 182

Find 104 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 352 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCTGAGTAGGTTGCTGATTT+TGG 0.150264 6:-12960330 MsG0680031021.01.T01:intron
AATGGTTCGTCAAACTAATT+TGG 0.183789 6:-12963883 MsG0680031021.01.T01:CDS
TTTATGAGTATTCAACCTTC+TGG 0.235228 6:+12965242 None:intergenic
TGAACACAATTACTCCAATA+TGG 0.236644 6:-12959319 MsG0680031021.01.T01:three_prime_UTR
CCTATTGAAGGTCTTCTCTT+AGG 0.237104 6:+12959511 None:intergenic
AGCATTTACATTAGATTAGA+TGG 0.257785 6:+12959241 None:intergenic
AGATTTGATGGTCGAAATTC+TGG 0.258309 6:-12960291 MsG0680031021.01.T01:CDS
GAATTCTCTCTCCCCTTGTT+TGG 0.269284 6:+12962584 None:intergenic
GGTCGAAATTCTGGTCTTAA+AGG 0.276746 6:-12960282 MsG0680031021.01.T01:CDS
CCAGGTCCATTTGTTCGTAT+TGG 0.295170 6:+12963729 None:intergenic
CTTGGATATTGTGTAGATAA+AGG 0.302637 6:-12961473 MsG0680031021.01.T01:CDS
AGAGCCATCTAGCAATATAT+TGG 0.304427 6:+12960784 None:intergenic
CAGGTCCATTTGTTCGTATT+GGG 0.314979 6:+12963730 None:intergenic
TGTTCATACAGTTTCTTTGA+TGG 0.320464 6:+12959336 None:intergenic
GGTTTGTTCCTCTGCTGATT+TGG 0.341184 6:-12965169 MsG0680031021.01.T01:intron
GATTATTCCACCAAGTGAAA+TGG 0.342207 6:+12963631 None:intergenic
GACCGGTTTGCTTCAGCATC+AGG 0.354697 6:-12963600 MsG0680031021.01.T01:CDS
CAAGCAAATTTACAAGATTA+CGG 0.378287 6:+12961492 None:intergenic
TCTGGTCTTAAAGGTACATA+TGG 0.386189 6:-12960273 MsG0680031021.01.T01:CDS
CAACTTGTCGATCTTCTAAT+CGG 0.390196 6:+12959383 None:intergenic
GAACACAATTACTCCAATAT+GGG 0.391388 6:-12959318 MsG0680031021.01.T01:three_prime_UTR
AAGAGTGACATATACAGTTT+TGG 0.392059 6:-12960207 MsG0680031021.01.T01:CDS
CGTAATCTTGTAAATTTGCT+TGG 0.395075 6:-12961491 MsG0680031021.01.T01:CDS
ACCTTGGGACAAGGATCATT+TGG 0.395264 6:-12962672 MsG0680031021.01.T01:CDS
ATCTGACCTTGTTGTGCCTA+TGG 0.395832 6:+12963671 None:intergenic
ATGAAGAAAAGAAGTTAAGC+TGG 0.399595 6:-12960983 MsG0680031021.01.T01:CDS
TTATGAGTATTCAACCTTCT+GGG 0.402314 6:+12965243 None:intergenic
ATACTTGACAAGCAACTTGT+TGG 0.403150 6:-12959598 MsG0680031021.01.T01:CDS
CAAAATTTCACAACTACCTT+GGG 0.408541 6:-12962687 MsG0680031021.01.T01:CDS
TATTTGTTAATACCTCTGTT+TGG 0.417600 6:+12962562 None:intergenic
CCACCCTCATCAAAATTTGA+TGG 0.418515 6:-12960154 MsG0680031021.01.T01:CDS
ATTATTCCACCAAGTGAAAT+GGG 0.425284 6:+12963632 None:intergenic
TGTGAAACTTCACCTATTGA+AGG 0.434357 6:+12959499 None:intergenic
GAGCCATCTAGCAATATATT+GGG 0.434825 6:+12960785 None:intergenic
AAAATTCCCATTTCACTTGG+TGG 0.438362 6:-12963638 MsG0680031021.01.T01:CDS
ACAAAATTTCACAACTACCT+TGG 0.442966 6:-12962688 MsG0680031021.01.T01:CDS
GTTGAAAGGGTCTGAGTTGG+AGG 0.450759 6:+12965373 None:intergenic
TCTCCCAATATATTGCTAGA+TGG 0.453456 6:-12960788 MsG0680031021.01.T01:CDS
AATGCAATGTTGTAGAAGTA+AGG 0.457719 6:-12959573 MsG0680031021.01.T01:CDS
GTCACCGTTGGTCTGACCCT+TGG 0.461183 6:-12963849 MsG0680031021.01.T01:CDS
CTAAAGTCGATACTTGTTCC+AGG 0.464053 6:+12963711 None:intergenic
TCAAAGGAAGAGAGATTTGA+TGG 0.468878 6:-12960303 MsG0680031021.01.T01:CDS
ACTCTCCCAATACGAACAAA+TGG 0.483058 6:-12963735 MsG0680031021.01.T01:CDS
AGAAGTTAAGCTGGGATGAC+AGG 0.483709 6:-12960974 MsG0680031021.01.T01:CDS
TGCCTGATGCTGAAGCAAAC+CGG 0.493705 6:+12963598 None:intergenic
CCTAAGAGAAGACCTTCAAT+AGG 0.498773 6:-12959511 MsG0680031021.01.T01:CDS
TATCAAGAGAAATTGAAGAA+TGG 0.504905 6:-12963901 MsG0680031021.01.T01:exon
GTTATCATCGGTGTCACCGT+TGG 0.511281 6:-12963861 MsG0680031021.01.T01:CDS
CGGAGAGGTGGTAGCTGTGA+AGG 0.515051 6:-12962622 MsG0680031021.01.T01:CDS
TGAAGAAAAGAAGTTAAGCT+GGG 0.517995 6:-12960982 MsG0680031021.01.T01:CDS
GGAATAATCAAAACAAAGAC+CGG 0.525133 6:-12963617 MsG0680031021.01.T01:CDS
AAGAAGATTGCGAAATGTGA+TGG 0.525245 6:-12959455 MsG0680031021.01.T01:CDS
CTTGGTTGTTAACTTGCTTG+AGG 0.530447 6:+12960227 None:intergenic
TTGCTTGAGGAAATGTATGC+CGG 0.532731 6:+12960240 None:intergenic
CAAACTAATTTGGTTATCAT+CGG 0.532821 6:-12963873 MsG0680031021.01.T01:CDS
GTTTATCAGTTCATGAGCAA+TGG 0.539346 6:-12961437 MsG0680031021.01.T01:CDS
ATGGTACAGAGAACTTCAAA+AGG 0.540080 6:-12962715 MsG0680031021.01.T01:intron
AAAGTTGAAAGGGTCTGAGT+TGG 0.542633 6:+12965370 None:intergenic
CACCTCTCCGGTAGATATTG+TGG 0.543391 6:+12962635 None:intergenic
AAAACTGTATATGTCACTCT+TGG 0.543878 6:+12960209 None:intergenic
TTGTTCCAGGTGTCTCTGCT+AGG 0.548639 6:-12961527 MsG0680031021.01.T01:intron
TTCAAATCACGATGTATGAC+GGG 0.552983 6:+12960812 None:intergenic
GCATCCATCACTAGTTCCAT+AGG 0.553714 6:-12963687 MsG0680031021.01.T01:CDS
GATTAGATGGAAACTTTCCA+TGG 0.556564 6:+12959254 None:intergenic
AAGTTTCACAAGGTATATCA+AGG 0.556998 6:-12959486 MsG0680031021.01.T01:CDS
CACAATATCTACCGGAGAGG+TGG 0.563419 6:-12962634 MsG0680031021.01.T01:CDS
CTTCACAGCTACCACCTCTC+CGG 0.564281 6:+12962623 None:intergenic
CAAATCTCTCTTCCTTTGAG+AGG 0.565474 6:+12960307 None:intergenic
CTAGCAAACAATTCCAAACA+AGG 0.567041 6:-12962597 MsG0680031021.01.T01:CDS
TAAAGGTACATATGGTTACA+TGG 0.567556 6:-12960265 MsG0680031021.01.T01:CDS
AGATAAAGGACAGCGCATAC+TGG 0.571999 6:-12961459 MsG0680031021.01.T01:CDS
CCAATACGAACAAATGGACC+TGG 0.572856 6:-12963729 MsG0680031021.01.T01:CDS
TGCTTGAGGAAATGTATGCC+GGG 0.575697 6:+12960241 None:intergenic
TATAAAGCCACAATATCTAC+CGG 0.578832 6:-12962642 MsG0680031021.01.T01:CDS
CTTCAAATCACGATGTATGA+CGG 0.579434 6:+12960811 None:intergenic
ATTGGGAGAGTTGTCAAACT+AGG 0.581313 6:+12963747 None:intergenic
GGAATAGAGTATCTTCATGA+AGG 0.583253 6:-12960924 MsG0680031021.01.T01:CDS
GGCAAGAAATCAGAATTCCA+AGG 0.587323 6:+12963832 None:intergenic
TTCACAACTACCTTGGGACA+AGG 0.588354 6:-12962681 MsG0680031021.01.T01:CDS
ATCGACAAGTTGAATTAAGT+AGG 0.588683 6:-12959372 MsG0680031021.01.T01:CDS
AGATGGCTCTATGAGAGCTA+AGG 0.598739 6:-12960771 MsG0680031021.01.T01:intron
AAGGCTGCTATGGAACATGA+TGG 0.605542 6:-12959631 MsG0680031021.01.T01:CDS
GCCAAATGATCCTTGTCCCA+AGG 0.607005 6:+12962671 None:intergenic
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CRISPR-GE

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TATGTTCGGTAGATAGTTAA+TGG + Chr6:12964795-12964814 None:intergenic 30.0%
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TGAAGAAAAGAAGTTAAGCT+GGG - Chr6:12963596-12963615 MsG0680031021.01.T01:CDS 30.0%
TGATACCATATTATGAACCA+AGG + Chr6:12961570-12961589 None:intergenic 30.0%
TGCTCTTTCATCTTGAATTA+GGG - Chr6:12964486-12964505 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
TGGCTATGAAGTTATGTTAA+CGG - Chr6:12964745-12964764 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
TGTAAAATGACTTTCCAACA+TGG - Chr6:12964025-12964044 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
TGTTCATACAGTTTCTTTGA+TGG + Chr6:12965245-12965264 None:intergenic 30.0%
TTATGAGTATTCAACCTTCT+GGG + Chr6:12959338-12959357 None:intergenic 30.0%
TTCACATAACATGTAGATAG+TGG + Chr6:12960104-12960123 None:intergenic 30.0%
TTCAGTGTAATTACAAGTGT+CGG + Chr6:12959898-12959917 None:intergenic 30.0%
TTTATGAGTATTCAACCTTC+TGG + Chr6:12959339-12959358 None:intergenic 30.0%
! AAGAGTGACATATACAGTTT+TGG - Chr6:12964371-12964390 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
! AGTCTTTAAGAACTTTGGAA+CGG + Chr6:12962160-12962179 None:intergenic 30.0%
! ATCGACAAGTTGAATTAAGT+AGG - Chr6:12965206-12965225 MsG0680031021.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
! CGGTTCAGTTTTTAAATCAT+TGG - Chr6:12963391-12963410 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
! CGTAATCTTGTAAATTTGCT+TGG - Chr6:12963087-12963106 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
! TAAAGGTACATATGGTTACA+TGG - Chr6:12964313-12964332 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
! TGCTTTCACATTAGTTTAGA+TGG - Chr6:12961743-12961762 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
! TGTTAACGGTTAATGAGTTT+TGG - Chr6:12964759-12964778 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
! TTTTAACATGACATTGTTCC+AGG - Chr6:12963038-12963057 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
! TTTTTGCGACAACTTTTAAG+CGG + Chr6:12964845-12964864 None:intergenic 30.0%
!! ATTTCTTGCCTCCTATTTTT+CGG - Chr6:12960759-12960778 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
!! GATTATGAGGTTTGTTATAG+GGG - Chr6:12959779-12959798 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
!! GGATTATGAGGTTTGTTATA+GGG - Chr6:12959778-12959797 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
!! TGGATTATGAGGTTTGTTAT+AGG - Chr6:12959777-12959796 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTTTTTGGATTTGGGTTTG+TGG - Chr6:12959467-12959486 MsG0680031021.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAATGTTTTAAAAACTGCAC+CGG - Chr6:12963232-12963251 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
!!! GGTGCAGTTTTTAAAACATT+GGG + Chr6:12963233-12963252 None:intergenic 30.0%
!!! GTATGTGGGTTTTTTGTTTA+AGG - Chr6:12959431-12959450 MsG0680031021.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTTTTTGGATTTGGATTTG+TGG - Chr6:12959574-12959593 MsG0680031021.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGAAGCTTGTATTTTCAAGT+TGG - Chr6:12964111-12964130 MsG0680031021.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTAACTTCACCCCATAT+TGG + Chr6:12965276-12965295 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTTGGATTTGGGTTTGT+GGG - Chr6:12959468-12959487 MsG0680031021.01.T01:CDS 30.0%
AAAACTATGAAGCACGGATA+CGG + Chr6:12959982-12960001 None:intergenic 35.0%
AAAATTCCCATTTCACTTGG+TGG - Chr6:12960940-12960959 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
AACTTCAAGATATCCTGAGT+AGG - Chr6:12964235-12964254 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
AACTTCTTTAGCCACGAATT+TGG - Chr6:12964639-12964658 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
AAGAAGATTGCGAAATGTGA+TGG - Chr6:12965123-12965142 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
ACATTATCAATCGTGGATCA+TGG + Chr6:12962928-12962947 None:intergenic 35.0%
ACCTAAAATAACAACCCAGA+AGG - Chr6:12959321-12959340 MsG0680031021.01.T01:exon 35.0%
AGAGCCATCTAGCAATATAT+TGG + Chr6:12963797-12963816 None:intergenic 35.0%
AGAGGAACGTCTTTGTTAAA+AGG + Chr6:12963941-12963960 None:intergenic 35.0%
AGCAAACAATTCCAAACAAG+GGG - Chr6:12961983-12962002 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
AGTCGTAAAGTTTACCATGT+TGG + Chr6:12964042-12964061 None:intergenic 35.0%
ATACTTGACAAGCAACTTGT+TGG - Chr6:12964980-12964999 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
ATGGTACAGAGAACTTCAAA+AGG - Chr6:12961863-12961882 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
ATTGCCGTTGATATTTCACA+TGG - Chr6:12963633-12963652 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
CAACTTGTCGATCTTCTAAT+CGG + Chr6:12965198-12965217 None:intergenic 35.0%
CCAAAACAGTTTGATGAAAC+TGG + Chr6:12962622-12962641 None:intergenic 35.0%
CCAACACTGTTGTCAAATAT+CGG - Chr6:12962788-12962807 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
CCACACAAACTTAATGTTGA+TGG - Chr6:12962453-12962472 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
CCATCAACATTAAGTTTGTG+TGG + Chr6:12962456-12962475 None:intergenic 35.0%
CCCGTATTCTTCCAAATAAT+AGG - Chr6:12961623-12961642 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
CGATATTTGACAACAGTGTT+GGG + Chr6:12962790-12962809 None:intergenic 35.0%
CTAGCAAACAATTCCAAACA+AGG - Chr6:12961981-12962000 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
CTTCAAATCACGATGTATGA+CGG + Chr6:12963770-12963789 None:intergenic 35.0%
GAATCTTCTTATAGGCATGA+AGG - Chr6:12964890-12964909 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
GAGCCATCTAGCAATATATT+GGG + Chr6:12963796-12963815 None:intergenic 35.0%
GATTAGATGGAAACTTTCCA+TGG + Chr6:12965327-12965346 None:intergenic 35.0%
GATTATTCCACCAAGTGAAA+TGG + Chr6:12960950-12960969 None:intergenic 35.0%
GCAAGAAATCAGAATTCCAA+GGG + Chr6:12960748-12960767 None:intergenic 35.0%
GTGCTCTTTCATCTTGAATT+AGG - Chr6:12964485-12964504 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
GTTCAACTAGTTGAATTGTC+CGG - Chr6:12963371-12963390 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
GTTGAGAGCTTGAAGAAATA+GGG + Chr6:12961416-12961435 None:intergenic 35.0%
GTTTATCAGTTCATGAGCAA+TGG - Chr6:12963141-12963160 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
TAAGGTAATTAAAGCCAAGG+TGG + Chr6:12962537-12962556 None:intergenic 35.0%
TACACTTCTAGATTCCTAGT+AGG - Chr6:12963971-12963990 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
TAGAGCCTTGGTTCATAATA+TGG - Chr6:12961562-12961581 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
TATCCATTGCCAGAACAATT+TGG + Chr6:12961071-12961090 None:intergenic 35.0%
TATGAGAGCTAAGGTAATGT+TGG - Chr6:12963816-12963835 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
TATGGTATCAAACCCTTTAC+GGG - Chr6:12961580-12961599 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
TCAAAGGAAGAGAGATTTGA+TGG - Chr6:12964275-12964294 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
TCAAATAAGCCAATCCAAAC+AGG + Chr6:12962187-12962206 None:intergenic 35.0%
TCAACACCGGTAATAATTTG+AGG + Chr6:12960439-12960458 None:intergenic 35.0%
TCAATAGGTGAAGTTTCACA+AGG - Chr6:12965082-12965101 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
TCTCCCAATATATTGCTAGA+TGG - Chr6:12963790-12963809 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
TGTGAAACTTCACCTATTGA+AGG + Chr6:12965082-12965101 None:intergenic 35.0%
TGTTCAAATCTACACGTAGT+TGG + Chr6:12964692-12964711 None:intergenic 35.0%
TTATGAACCAAGGCTCTATT+TGG + Chr6:12961560-12961579 None:intergenic 35.0%
TTCAAATCACGATGTATGAC+GGG + Chr6:12963769-12963788 None:intergenic 35.0%
TTTCCAAATTGTTCTGGCAA+TGG - Chr6:12961065-12961084 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
TTTGTTCGAGTGTTTAGCAT+TGG - Chr6:12960276-12960295 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
! AGATTTGATGGTCGAAATTC+TGG - Chr6:12964287-12964306 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
! ATCAATTTTGTGCCCGTAAA+GGG + Chr6:12961595-12961614 None:intergenic 35.0%
! CCAGTTTCATCAAACTGTTT+TGG - Chr6:12962619-12962638 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
! GACTTTGAGTTACATTCTTG+AGG - Chr6:12964058-12964077 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
! GCCAAAGTCTTTAAGAACTT+TGG + Chr6:12962165-12962184 None:intergenic 35.0%
! GGAATAGAGTATCTTCATGA+AGG - Chr6:12963654-12963673 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
! GGTAGTTGTGAAATTTTGTG+TGG + Chr6:12961889-12961908 None:intergenic 35.0%
! TATCAATTTTGTGCCCGTAA+AGG + Chr6:12961596-12961615 None:intergenic 35.0%
!! GTTGAGTTTTGTGGATTATG+AGG - Chr6:12959766-12959785 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGATTGATTTAGCTTGGT+GGG - Chr6:12959741-12959760 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
!! GTTTGTGGGTTGTTTAGTTT+TGG - Chr6:12959482-12959501 MsG0680031021.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTGGTCTTAAAGGTACATA+TGG - Chr6:12964305-12964324 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
!! TGGTGTTGATTGATTTAGCT+TGG - Chr6:12959737-12959756 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
!! TGTTGATTGATTTAGCTTGG+TGG - Chr6:12959740-12959759 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
!!! ACCTTCTGGGTTGTTATTTT+AGG + Chr6:12959325-12959344 None:intergenic 35.0%
!!! CAGAGTTTTGAAATGAAGCA+CGG - Chr6:12959847-12959866 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
!!! CGGTGCAGTTTTTAAAACAT+TGG + Chr6:12963234-12963253 None:intergenic 35.0%
!!! GTGCTTCATAGTTTTGATAG+AGG - Chr6:12959987-12960006 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
!!! TCATAGTTTTGATAGAGGAG+TGG - Chr6:12959992-12960011 MsG0680031021.01.T01:intron 35.0%
AAAGTTGAAAGGGTCTGAGT+TGG + Chr6:12959211-12959230 None:intergenic 40.0%
AATCGTACCTATGAGACCTT+TGG - Chr6:12963256-12963275 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
ACCACCTTATGCCGAAAAAT+AGG + Chr6:12960773-12960792 None:intergenic 40.0%
ACCTTATGCCGAAAAATAGG+AGG + Chr6:12960770-12960789 None:intergenic 40.0%
ACTCTCCCAATACGAACAAA+TGG - Chr6:12960843-12960862 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
AGACACTGATACATCAACAC+CGG + Chr6:12960452-12960471 None:intergenic 40.0%
AGTAGGTGGTTGACTATGTT+CGG + Chr6:12964809-12964828 None:intergenic 40.0%
AGTTTAGATGGCGAAAGCAA+AGG - Chr6:12961755-12961774 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
ATCGTACCTATGAGACCTTT+GGG - Chr6:12963257-12963276 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
ATTAATCACGTCCAAGTTCG+TGG - Chr6:12964725-12964744 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
ATTGCCACGCTTTAACCATA+GGG - Chr6:12961679-12961698 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
ATTGGGAGAGTTGTCAAACT+AGG + Chr6:12960834-12960853 None:intergenic 40.0%
CAAATCTCTCTTCCTTTGAG+AGG + Chr6:12964274-12964293 None:intergenic 40.0%
CAACTAGTTGAACCATGAAC+AGG + Chr6:12963364-12963383 None:intergenic 40.0%
CAGGTCCATTTGTTCGTATT+GGG + Chr6:12960851-12960870 None:intergenic 40.0%
CCACCCTCATCAAAATTTGA+TGG - Chr6:12964424-12964443 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
CCGATATTTGACAACAGTGT+TGG + Chr6:12962791-12962810 None:intergenic 40.0%
CCTAAGAGAAGACCTTCAAT+AGG - Chr6:12965067-12965086 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
CCTATTGAAGGTCTTCTCTT+AGG + Chr6:12965070-12965089 None:intergenic 40.0%
CTAAAGTCGATACTTGTTCC+AGG + Chr6:12960870-12960889 None:intergenic 40.0%
CTTAAAGACTTTGGCCTGTT+TGG - Chr6:12962170-12962189 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
GAAGTGTACTAACTAGACAG+AGG + Chr6:12963959-12963978 None:intergenic 40.0%
GGCAAGAAATCAGAATTCCA+AGG + Chr6:12960749-12960768 None:intergenic 40.0%
GGTTGAGAGCTTGAAGAAAT+AGG + Chr6:12961417-12961436 None:intergenic 40.0%
GTTAACCATGTCCAAATTCG+TGG + Chr6:12964653-12964672 None:intergenic 40.0%
GTTAATGCACTTCAAGTAGG+TGG + Chr6:12964823-12964842 None:intergenic 40.0%
TAACTTCATAGCCACGAACT+TGG + Chr6:12964739-12964758 None:intergenic 40.0%
TACATATGGTTACATGGACC+CGG - Chr6:12964319-12964338 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
TGCTTATCCAAATAGAGCCT+TGG - Chr6:12961550-12961569 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
TTGCTTGAGGAAATGTATGC+CGG + Chr6:12964341-12964360 None:intergenic 40.0%
TTTAGCCACGAATTTGGACA+TGG - Chr6:12964645-12964664 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
! CGTTTTACTAGGCGTGTTAT+CGG + Chr6:12961207-12961226 None:intergenic 40.0%
! CTGTTGTCAAATATCGGCTA+TGG - Chr6:12962794-12962813 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
! CTTTTACTTCAAGGCTGCTA+TGG - Chr6:12964937-12964956 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
! TCTGTACCATGTAAAGCATC+AGG + Chr6:12961853-12961872 None:intergenic 40.0%
! TTGTAGTTCACAAGGTACCA+TGG - Chr6:12965307-12965326 MsG0680031021.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
! TTTGAAATGAAGCACGGACA+CGG - Chr6:12959853-12959872 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
!! AAGCACTTGTGAGAGTGTTT+GGG - Chr6:12961345-12961364 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
!! ATAGAGGAGTGGAAAGTGTT+GGG - Chr6:12960003-12960022 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
!! CAAATTTTGATGAGGGTGGA+TGG + Chr6:12964423-12964442 None:intergenic 40.0%
!! CCATCAAATTTTGATGAGGG+TGG + Chr6:12964427-12964446 None:intergenic 40.0%
!! CTTGGTTGTTAACTTGCTTG+AGG + Chr6:12964354-12964373 None:intergenic 40.0%
!! GGTCGAAATTCTGGTCTTAA+AGG - Chr6:12964296-12964315 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
!! GTAATTACAAGTGTCGGTGT+CGG + Chr6:12959892-12959911 None:intergenic 40.0%
!! TAAGCACTTGTGAGAGTGTT+TGG - Chr6:12961344-12961363 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
!! TCCTATTTTTCGGCATAAGG+TGG - Chr6:12960769-12960788 MsG0680031021.01.T01:intron 40.0%
AAGGCTGCTATGGAACATGA+TGG - Chr6:12964947-12964966 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
AATTCCAAGGGTCAGACCAA+CGG + Chr6:12960736-12960755 None:intergenic 45.0%
ACCTTGGGACAAGGATCATT+TGG - Chr6:12961906-12961925 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
AGAAGTTAAGCTGGGATGAC+AGG - Chr6:12963604-12963623 MsG0680031021.01.T01:CDS 45.0%
AGACTTTGGCCTGTTTGGAT+TGG - Chr6:12962175-12962194 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
AGATAAAGGACAGCGCATAC+TGG - Chr6:12963119-12963138 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
CAGGTAACGATTATCCACCT+TGG - Chr6:12962520-12962539 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
CATTGCCACGCTTTAACCAT+AGG - Chr6:12961678-12961697 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
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CCAATACGAACAAATGGACC+TGG - Chr6:12960849-12960868 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
CCAGGTCCATTTGTTCGTAT+TGG + Chr6:12960852-12960871 None:intergenic 45.0%
CTAGTTCCATAGGCACAACA+AGG - Chr6:12960901-12960920 MsG0680031021.01.T01:intron 45.0%
GAATTCTCTCTCCCCTTGTT+TGG + Chr6:12961997-12962016 None:intergenic 45.0%
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! AATCACGATGTATGACGGGA+GGG + Chr6:12963765-12963784 None:intergenic 45.0%
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!! GTTATCATCGGTGTCACCGT+TGG - Chr6:12960717-12960736 MsG0680031021.01.T01:intron 50.0%
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!! GTCAGTGTCCGTGTCGTTTC+CGG - Chr6:12959947-12959966 MsG0680031021.01.T01:intron 55.0%
ACGGATACGGACACGGACAC+CGG + Chr6:12959969-12959988 None:intergenic 60.0%
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CGGAGAGGTGGTAGCTGTGA+AGG - Chr6:12961956-12961975 MsG0680031021.01.T01:intron 60.0%
! GTCACCGTTGGTCTGACCCT+TGG - Chr6:12960729-12960748 MsG0680031021.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 12959206 12965394 12959206 ID=MsG0680031021.01;Name=MsG0680031021.01
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