AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380011968.01


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MsG0380011968.01.T01 AT4G27190 25.875 514 292 16 187 656 157 625 2.12e-28 123
MsG0380011968.01.T01 AT1G15890 25.361 485 284 17 191 638 13 456 5.26e-27 118
MsG0380011968.01.T01 AT1G61300 25.676 444 269 16 194 621 63 461 9.20e-27 117
MsG0380011968.01.T01 AT1G61300 26.457 446 288 17 194 621 63 486 1.25e-26 117
MsG0380011968.01.T01 AT1G15890 25.361 485 284 17 191 638 173 616 1.37e-26 117
MsG0380011968.01.T01 AT5G43740 24.855 519 301 18 191 667 170 641 4.47e-26 115
MsG0380011968.01.T01 AT5G43740 24.855 519 301 18 191 667 170 641 4.47e-26 115
MsG0380011968.01.T01 AT5G43730 24.788 472 311 15 191 642 171 618 7.93e-26 115
MsG0380011968.01.T01 AT5G43730 24.788 472 311 15 191 642 171 618 7.93e-26 115
MsG0380011968.01.T01 AT5G43730 24.788 472 311 15 191 642 171 618 7.93e-26 115
MsG0380011968.01.T01 AT5G43730 24.788 472 311 15 191 642 171 618 7.93e-26 115
MsG0380011968.01.T01 AT5G43730 24.788 472 311 15 191 642 171 618 7.93e-26 115
MsG0380011968.01.T01 AT5G05400 25.153 489 300 19 194 656 8 456 1.96e-25 113
MsG0380011968.01.T01 AT5G05400 25.153 489 300 19 194 656 8 456 1.96e-25 113
MsG0380011968.01.T01 AT5G05400 25.577 520 315 22 164 656 151 625 3.25e-25 113
MsG0380011968.01.T01 AT1G12290 25.934 482 292 18 168 617 111 559 4.26e-25 112
MsG0380011968.01.T01 AT1G12290 25.934 482 292 18 168 617 111 559 4.26e-25 112
MsG0380011968.01.T01 AT1G12290 25.934 482 292 18 168 617 111 559 4.26e-25 112
MsG0380011968.01.T01 AT1G12290 25.934 482 292 18 168 617 153 601 6.29e-25 112
MsG0380011968.01.T01 AT1G51480 26.619 278 176 8 199 466 180 439 2.43e-24 110
MsG0380011968.01.T01 AT1G62630 27.578 417 244 17 274 656 250 642 5.91e-24 109
MsG0380011968.01.T01 AT1G63360 25.767 489 314 17 275 739 251 714 1.01e-23 108
MsG0380011968.01.T01 AT1G63360 25.767 489 314 17 275 739 216 679 1.32e-23 107
MsG0380011968.01.T01 AT1G12280 24.017 483 300 15 168 635 116 546 5.36e-23 105
MsG0380011968.01.T01 AT5G47260 23.625 491 300 18 195 656 172 616 1.18e-22 105
MsG0380011968.01.T01 AT5G17680 22.982 731 392 30 194 877 208 814 1.55e-16 85.5
MsG0380011968.01.T01 AT5G17680 22.982 731 392 30 194 877 209 815 1.56e-16 85.5
MsG0380011968.01.T01 AT4G33300 26.062 353 212 13 172 513 182 496 3.99e-16 84.0
MsG0380011968.01.T01 AT4G33300 26.062 353 212 13 172 513 182 496 3.99e-16 84.0
MsG0380011968.01.T01 AT1G27170 27.969 261 167 9 171 428 189 431 4.75e-16 84.0
MsG0380011968.01.T01 AT1G27170 27.969 261 167 9 171 428 189 431 5.13e-16 84.0
MsG0380011968.01.T01 AT5G38850 24.425 696 395 31 170 807 177 799 1.51e-15 82.0
MsG0380011968.01.T01 AT1G63880 21.713 502 312 21 170 638 186 639 3.48e-12 70.9
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 23.951 739 440 29 171 868 181 838 3.57e-12 71.2
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 24.054 740 438 30 171 868 181 838 4.15e-12 71.2
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 23.951 739 440 29 171 868 181 838 4.16e-12 71.2
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 23.951 739 440 29 171 868 181 838 4.16e-12 71.2
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 23.957 743 435 30 171 868 181 838 4.50e-12 70.9
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 23.957 743 435 30 171 868 181 838 4.50e-12 70.9
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 24.054 740 438 30 171 868 181 838 4.51e-12 70.9
MsG0380011968.01.T01 AT1G63880 21.713 502 312 21 170 638 186 639 4.52e-12 70.9
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 23.951 739 440 29 171 868 181 838 4.53e-12 70.9
MsG0380011968.01.T01 AT4G16920 23.951 739 440 29 171 868 181 838 4.53e-12 70.9
MsG0380011968.01.T01 AT4G16890 23.967 484 322 18 171 644 192 639 9.01e-12 70.1
MsG0380011968.01.T01 AT4G16890 23.967 484 322 18 171 644 37 484 1.37e-11 69.3
MsG0380011968.01.T01 AT4G16890 23.967 484 322 18 171 644 183 630 1.51e-11 69.3
MsG0380011968.01.T01 AT4G16890 23.967 484 322 18 171 644 183 630 1.67e-11 69.3
MsG0380011968.01.T01 AT4G16890 23.967 484 322 18 171 644 192 639 1.70e-11 68.9
MsG0380011968.01.T01 AT5G41550 22.181 541 332 22 170 661 185 685 1.76e-11 68.9
MsG0380011968.01.T01 AT1G69550 25.952 289 183 13 170 450 253 518 2.41e-11 68.6
MsG0380011968.01.T01 AT1G56510 24.540 326 199 15 171 484 186 476 2.85e-11 68.2
MsG0380011968.01.T01 AT3G44670 25.076 327 207 13 170 487 267 564 4.10e-11 67.8
MsG0380011968.01.T01 AT3G44670 25.076 327 207 13 170 487 267 564 4.10e-11 67.8
MsG0380011968.01.T01 AT5G66900 25.424 354 238 13 168 517 213 544 4.35e-11 67.0
MsG0380011968.01.T01 AT4G16960 27.132 258 164 9 171 425 187 423 5.58e-11 67.4
MsG0380011968.01.T01 AT5G66900 25.627 359 231 14 168 517 165 496 7.34e-11 66.6
MsG0380011968.01.T01 AT5G36930 25.033 763 418 35 163 889 181 825 8.88e-11 66.6
MsG0380011968.01.T01 AT5G66900 25.905 359 230 15 168 517 213 544 9.41e-11 66.6
MsG0380011968.01.T01 AT5G36930 25.033 763 418 35 163 889 184 828 9.93e-11 66.6

Find 187 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 219 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TATTTATTATATTGGATAAA+TGG 0.122871 3:+8606667 None:intergenic
GAACCATATTCCGAATAATT+TGG 0.129973 3:-8606121 MsG0380011968.01.T01:CDS
CCTACTACCTTTGTTGTTAT+TGG 0.152826 3:+8607001 None:intergenic
AGATAAAATATTTATTATAT+TGG 0.220406 3:+8606659 None:intergenic
GAACACATTGTTGGAACTTA+TGG 0.227943 3:+8606275 None:intergenic
TCCCCAAATTATTCGGAATA+TGG 0.232858 3:+8606118 None:intergenic
AACCATATTCCGAATAATTT+GGG 0.240646 3:-8606120 MsG0380011968.01.T01:CDS
CTACTACCTTTGTTGTTATT+GGG 0.242595 3:+8607002 None:intergenic
TGCAGCTCACCAACAGATTT+AGG 0.251233 3:+8606042 None:intergenic
AGAATTGACTGGTTGGTTAT+TGG 0.258281 3:-8607366 MsG0380011968.01.T01:CDS
TGATTAATAGAGTAATCTTC+TGG 0.272171 3:+8606576 None:intergenic
GGAAGTGATCATTGGGAAAA+TGG 0.283815 3:-8606376 MsG0380011968.01.T01:CDS
GCCAGCTTGTTTATTTCTCT+TGG 0.284138 3:+8605973 None:intergenic
CTCTTCTATTGCAGCACTTA+AGG 0.290786 3:+8605741 None:intergenic
TTTACGAGACACTCAAGTTT+TGG 0.291886 3:+8605583 None:intergenic
ATTTCAAAATCGTACATGTT+TGG 0.304754 3:+8605154 None:intergenic
ATGCATGGTTTCAAGTAATA+TGG 0.306324 3:+8606618 None:intergenic
ATTTATTATATTGGATAAAT+GGG 0.307534 3:+8606668 None:intergenic
TCTCAACTTCATCGACAAAA+TGG 0.316253 3:+8606337 None:intergenic
TTTCAAAATCGTACATGTTT+GGG 0.316400 3:+8605155 None:intergenic
TTGCAGTTTCCTCGACAAAA+AGG 0.316471 3:+8607414 None:intergenic
CCCTTCTATCTGCATCTTTG+AGG 0.316852 3:+8607771 None:intergenic
CCAAGTTCTTATTCCTTCAT+TGG 0.322840 3:+8607730 None:intergenic
TTTCGTGCCATTCATGGCTT+TGG 0.323146 3:-8606231 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAAGAGAGATTGAGCAGATT+TGG 0.324458 3:+8605502 None:intergenic
CAAATTGTGTTGTTACCTTT+TGG 0.328544 3:+8607258 None:intergenic
TTGTGTAACATCTGCATGAT+AGG 0.329216 3:+8607143 None:intergenic
AACCGTGACGGAATGGAAAA+TGG 0.333962 3:-8606727 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAAAGATTCCCCAAATTATT+CGG 0.341745 3:+8606111 None:intergenic
GCAAAGTTTCATCATCTATA+AGG 0.344566 3:+8605377 None:intergenic
GCACTAGAGAGACAGAAAAT+AGG 0.351386 3:-8607463 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAGAGTTCCCATGCTTTGTT+TGG 0.352067 3:+8606891 None:intergenic
AGAGGGTACCTCCTTCAGTT+GGG 0.353102 3:+8605321 None:intergenic
CAACCAGTCAATTCTTCTCT+TGG 0.365830 3:+8607374 None:intergenic
TCAAATACCTCTTATGTTCC+AGG 0.369204 3:+8607081 None:intergenic
GAGTAGTCTTTCCCTTTGTC+TGG 0.371327 3:+8605223 None:intergenic
ATTGCCCTTGAACACATTGT+TGG 0.382147 3:+8606266 None:intergenic
GGGAAGTGTTTCAACTCCTT+AGG 0.384733 3:-8607871 MsG0380011968.01.T01:CDS
GTGGTAGGAATGGGCGGGCT+CGG 0.388905 3:-8607314 MsG0380011968.01.T01:CDS
AACTGCGGTATCATTGGCCT+TGG 0.391263 3:-8607894 MsG0380011968.01.T01:CDS
ACTGCAATTGTTGGACTTGA+AGG 0.394121 3:-8607398 MsG0380011968.01.T01:CDS
GTCGAGGAAACTGCAATTGT+TGG 0.406911 3:-8607407 MsG0380011968.01.T01:CDS
CAAATGAAGACGCTGAAGTT+GGG 0.410427 3:+8605639 None:intergenic
TGATATTCTTTGATGATGTA+TGG 0.415386 3:-8607061 MsG0380011968.01.T01:CDS
GCCATTCATGGCTTTGGAAA+AGG 0.418573 3:-8606225 MsG0380011968.01.T01:CDS
GGCAGAAACTGCGGTATCAT+TGG 0.421711 3:-8607900 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAGATAAATAGAAGAGAGCA+TGG 0.422265 3:-8605769 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATCTGATGGGAGAAGAACTT+TGG 0.424642 3:-8606511 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCCTCAAAGATGCAGATAGA+AGG 0.426510 3:-8607772 MsG0380011968.01.T01:CDS
GATTACAGAAGTTGCCTGAC+TGG 0.427676 3:-8605609 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTCAAGAAATGAAAATGTTA+AGG 0.428346 3:-8605792 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATGTCATTGATGAATATCTT+TGG 0.434551 3:-8607670 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCAAATGAAGACGCTGAAGT+TGG 0.435448 3:+8605638 None:intergenic
CCTCTGGCAGTTGTGGCCAT+TGG 0.435925 3:-8606774 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTGTGGGACAATTGCTATGA+TGG 0.436782 3:-8605481 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAAATGGACTTTAGCTCTGC+TGG 0.437442 3:+8606828 None:intergenic
TTGAATTGTGTTCAAAGTCT+AGG 0.437790 3:-8606179 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAAGGGTTTGTTAAATCTGA+TGG 0.439793 3:-8606525 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAAGATTTGTTTCTTCCCTA+AGG 0.441916 3:+8607855 None:intergenic
ATCTGCTCAATCTCTCTTTG+TGG 0.443245 3:-8605498 MsG0380011968.01.T01:CDS
AACCAGTCAATTCTTCTCTT+GGG 0.444302 3:+8607375 None:intergenic
CAGTGGCAAATGAATACAAT+AGG 0.444405 3:+8605184 None:intergenic
CCAATAACAACAAAGGTAGT+AGG 0.445254 3:-8607001 MsG0380011968.01.T01:CDS
CAAGTCTTTCAGTGACTGTA+GGG 0.446025 3:+8605525 None:intergenic
ACCTTTGTTGTTATTGGGCA+TGG 0.446043 3:+8607007 None:intergenic
CCAATGAAGGAATAAGAACT+TGG 0.449845 3:-8607730 MsG0380011968.01.T01:CDS
CTGGCAGTTGTGGCCATTGG+TGG 0.449988 3:-8606771 MsG0380011968.01.T01:CDS
ACTGCGGTATCATTGGCCTT+GGG 0.452062 3:-8607893 MsG0380011968.01.T01:CDS
TACTGAGGGAAGTGATCATT+GGG 0.452207 3:-8606383 MsG0380011968.01.T01:CDS
CAGAGGGTACCTCCTTCAGT+TGG 0.454517 3:+8605320 None:intergenic
ATGTCAAGTGTTGGCTTTGA+AGG 0.458862 3:-8606435 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTACTGAGGGAAGTGATCAT+TGG 0.467927 3:-8606384 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGGCATGAGGTCAAACGTCC+TGG 0.468086 3:-8607644 MsG0380011968.01.T01:CDS
CTATTGTATTCATTTGCCAC+TGG 0.468858 3:-8605183 MsG0380011968.01.T01:CDS
GGAAGTGTTTCAACTCCTTA+GGG 0.469546 3:-8607870 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCGGATAGCATCTGAGATAC+AGG 0.476077 3:-8607567 MsG0380011968.01.T01:CDS
GATATCAATACGTGAAATCA+AGG 0.477750 3:-8607537 MsG0380011968.01.T01:CDS
GTGTCTCGTAAAGGTAATGC+TGG 0.480345 3:-8605572 MsG0380011968.01.T01:CDS
GCATTCAGATTTGAGCATGA+TGG 0.482082 3:-8606858 MsG0380011968.01.T01:CDS
CTCAGATGCTATCCGATGAC+GGG 0.483331 3:+8607574 None:intergenic
AAGTTCCAACAATGTGTTCA+AGG 0.484234 3:-8606271 MsG0380011968.01.T01:CDS
CATTCAGATTTGAGCATGAT+GGG 0.486753 3:-8606857 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGAATTGATTCATAGAAGCT+TGG 0.486873 3:-8606463 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCTGCTCAATCTCTCTTTGT+GGG 0.486932 3:-8605497 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGGGAAAGTTACAGCATGTC+AGG 0.494978 3:-8606415 MsG0380011968.01.T01:CDS
GCAAGTCTTTCAGTGACTGT+AGG 0.495378 3:+8605524 None:intergenic
GATTAATAGAGTAATCTTCT+GGG 0.499784 3:+8606577 None:intergenic
AATCTAAAACCGTGACGGAA+TGG 0.510059 3:-8606734 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAGGGTACCTCCTTCAGTTG+GGG 0.512075 3:+8605322 None:intergenic
GAGGTCAAACGTCCTGGATG+TGG 0.512499 3:-8607638 MsG0380011968.01.T01:CDS
GGGCATTACGTCTCAACTCC+AGG 0.515083 3:+8606688 None:intergenic
CCTTGAGTTTATGCATGGAC+TGG 0.517181 3:+8605293 None:intergenic
CAACTGAAGGAGGTACCCTC+TGG 0.518977 3:-8605319 MsG0380011968.01.T01:CDS
GTATTCATTTGCCACTGGAA+TGG 0.519114 3:-8605178 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCAAATTTCTTATGACTCCT+CGG 0.519592 3:+8605111 None:intergenic
TGTTGAAAATAGACCACCAA+TGG 0.522294 3:+8606758 None:intergenic
GTTGTGAACATGAACTAGAA+AGG 0.524238 3:+8606929 None:intergenic
CTGCGGTATCATTGGCCTTG+GGG 0.526126 3:-8607892 MsG0380011968.01.T01:CDS
GTGATCGCAGTGGTAGGAAT+GGG 0.526159 3:-8607323 MsG0380011968.01.T01:CDS
GGGTTTATTGATAAGCATGA+TGG 0.526307 3:-8607192 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTTATGTGGATGTAGATCAT+GGG 0.529060 3:-8605828 MsG0380011968.01.T01:CDS
TGATGGGAGAAGAACTTTGG+AGG 0.529460 3:-8606508 MsG0380011968.01.T01:CDS
AACTTTGGAGGAAGTTGCAG+AGG 0.531268 3:-8606496 MsG0380011968.01.T01:CDS
AATATCCTTGAGTTTATGCA+TGG 0.535186 3:+8605288 None:intergenic
AGTGATCGCAGTGGTAGGAA+TGG 0.536522 3:-8607324 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATTCAACAATGGATAGCAGA+AGG 0.537143 3:-8606543 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAAGCATTGATCCAGACAAA+GGG 0.537552 3:-8605234 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAACACAATTCAATGATGAA+AGG 0.537726 3:+8606189 None:intergenic
GATACTGAATCTCAGTCGCT+TGG 0.540929 3:-8605416 MsG0380011968.01.T01:CDS
GCTGCATAACTTAGAGACAT+TGG 0.541683 3:-8606025 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAGAAACTGTGATGCAAGCT+CGG 0.542868 3:+8607231 None:intergenic
AAACTTTGACTCCCCGTCAT+CGG 0.543497 3:-8607586 MsG0380011968.01.T01:CDS
CATGGCAAATTCAACTTGGT+CGG 0.544578 3:+8607025 None:intergenic
ACAGCTACCTCTGGCAGTTG+TGG 0.544817 3:-8606781 MsG0380011968.01.T01:CDS
ACCAAGAGAAATAAACAAGC+TGG 0.545250 3:-8605974 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCAATGATGAAAGGATCCAT+TGG 0.552922 3:+8606198 None:intergenic
TGGGCATGGCAAATTCAACT+TGG 0.553013 3:+8607021 None:intergenic
AAAATGCAAACAGCTACCTC+TGG 0.553239 3:-8606790 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATCGCAGTGGTAGGAATGGG+CGG 0.553930 3:-8607320 MsG0380011968.01.T01:CDS
CTTTGGAAAAGGTGGACCAA+TGG 0.558571 3:-8606214 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATTCATGGCTTTGGAAAAGG+TGG 0.559224 3:-8606222 MsG0380011968.01.T01:CDS
GTTGAGAAACCTCTCCCAGT+TGG 0.559878 3:-8606321 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAAACTTGAGTGTCTCGTAA+AGG 0.562268 3:-8605581 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTCAACAATGGATAGCAGAA+GGG 0.562770 3:-8606542 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTGATGAATATCTTTGGCTG+AGG 0.564453 3:-8607664 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGGGTACCTCCTTCAGTTGG+GGG 0.564967 3:+8605323 None:intergenic
TGAACAAGTGAGGAAATACC+TGG 0.569021 3:-8607099 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCTCAGATGCTATCCGATGA+CGG 0.570119 3:+8607573 None:intergenic
TGCGGTATCATTGGCCTTGG+GGG 0.570278 3:-8607891 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAATGAAGACGCTGAAGTTG+GGG 0.570290 3:+8605640 None:intergenic
TCGCAGTGGTAGGAATGGGC+GGG 0.570433 3:-8607319 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAGGGTTTGTTAAATCTGAT+GGG 0.571134 3:-8606524 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAAGACGCTGAAGTTGGGGT+GGG 0.572540 3:+8605644 None:intergenic
TTAAGATACATAAACCTAAG+TGG 0.572735 3:-8606084 MsG0380011968.01.T01:CDS
TGAAGACGCTGAAGTTGGGG+TGG 0.573893 3:+8605643 None:intergenic
GGAAATACCTGGAACATAAG+AGG 0.574819 3:-8607088 MsG0380011968.01.T01:CDS
CCTCAAAGATGCAGATAGAA+GGG 0.575436 3:-8607771 MsG0380011968.01.T01:CDS
GATGAAGCAGACACCAATGA+AGG 0.578114 3:-8607743 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAAAGCATTGATCCAGACAA+AGG 0.578753 3:-8605235 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGTTACAGTGCGAAGCGAGA+AGG 0.579736 3:+8605938 None:intergenic
TTCTCAAACATACACTGTGA+GGG 0.579977 3:-8607213 MsG0380011968.01.T01:CDS
CAAGAGAAGAATTGACTGGT+TGG 0.585026 3:-8607373 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTATGTGGATGTAGATCATG+GGG 0.586303 3:-8605827 MsG0380011968.01.T01:CDS
AACAAAATCTAAAACCGTGA+CGG 0.592074 3:-8606739 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAGAGACAGAAAATAGGAGA+TGG 0.593034 3:-8607457 MsG0380011968.01.T01:CDS
CATACACTTCCTAAATCTGT+TGG 0.593801 3:-8606051 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTTGACTCCAAACAAAGCAT+GGG 0.593807 3:-8606898 MsG0380011968.01.T01:CDS
TACTATTCACTCATCTTCCG+AGG 0.597352 3:-8605128 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTGGTTATGATGTCAAGTGT+TGG 0.603224 3:-8606444 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGTTCCAACAATGTGTTCAA+GGG 0.607268 3:-8606270 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATGGTTTCAAGTAATATGGC+AGG 0.607477 3:+8606622 None:intergenic
ACATGTTTGGGCCATTCCAG+TGG 0.608003 3:+8605167 None:intergenic
TTACAGATTACTCCACATCC+AGG 0.609907 3:+8607626 None:intergenic
TTGACTGGTTGGTTATTGGA+TGG 0.609924 3:-8607362 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCTCAAACATACACTGTGAG+GGG 0.610193 3:-8607212 MsG0380011968.01.T01:CDS
GGCCCAAGAGAAGAATTGAC+TGG 0.611306 3:-8607377 MsG0380011968.01.T01:CDS
CCAGTCCATGCATAAACTCA+AGG 0.613145 3:-8605293 MsG0380011968.01.T01:CDS
TCACTTCCCTCAGTAAGTCA+TGG 0.613310 3:+8606391 None:intergenic
TTGAAGGTACTTGACATGCA+AGG 0.617415 3:-8606153 MsG0380011968.01.T01:CDS
TGTCAAGTGTTGGCTTTGAA+GGG 0.618876 3:-8606434 MsG0380011968.01.T01:CDS
ACCATATTCCGAATAATTTG+GGG 0.619426 3:-8606119 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAATATCACTACAATAGTTG+AGG 0.620064 3:-8605698 MsG0380011968.01.T01:CDS
CGCACAGTGATCGCAGTGGT+AGG 0.620705 3:-8607329 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATAAGAGATTAATTCAACAA+TGG 0.621503 3:-8606554 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATATCTTTGGCTGAGGCATG+AGG 0.624715 3:-8607657 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATACTAATATACAAAATGCA+TGG 0.629210 3:+8606603 None:intergenic
GTCAGGTCCATGACTTACTG+AGG 0.629911 3:-8606398 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGACAAAGGGAAAGACTACT+CGG 0.635706 3:-8605221 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGTGATCATTGGGAAAATGG+AGG 0.636326 3:-8606373 MsG0380011968.01.T01:CDS
TGTCTCGTAAAGGTAATGCT+GGG 0.636556 3:-8605571 MsG0380011968.01.T01:CDS
AGTTACTGATTGAACAAGTG+AGG 0.639215 3:-8607109 MsG0380011968.01.T01:CDS
CAATGAAGGAATAAGAACTT+GGG 0.641519 3:-8607729 MsG0380011968.01.T01:CDS
TGCATGGACTGGATGCCAGA+GGG 0.644321 3:+8605304 None:intergenic
GCCATGCCCAATAACAACAA+AGG 0.650067 3:-8607008 MsG0380011968.01.T01:CDS
AAGACGCTGAAGTTGGGGTG+GGG 0.650117 3:+8605645 None:intergenic
TCAGGTCCATGACTTACTGA+GGG 0.655465 3:-8606397 MsG0380011968.01.T01:CDS
TTTCTCAAACATACACTGTG+AGG 0.657710 3:-8607214 MsG0380011968.01.T01:CDS
GAAGAAACAAATCTTCTGAG+AGG 0.660311 3:-8607848 MsG0380011968.01.T01:CDS
ATGCATGGACTGGATGCCAG+AGG 0.660689 3:+8605303 None:intergenic
AAGTCTTTCAGTGACTGTAG+GGG 0.664766 3:+8605526 None:intergenic
TTTCAACGTTCACAAGCACA+AGG 0.667281 3:-8607494 MsG0380011968.01.T01:CDS
CCAATGGCCACAACTGCCAG+AGG 0.667872 3:+8606774 None:intergenic
AAATCAAGGAAAGAAGTCAG+AGG 0.678742 3:-8607523 MsG0380011968.01.T01:CDS
GATTGAAATGGCAGAAACTG+CGG 0.685502 3:-8607909 None:intergenic
TCAGATGCTATCCGATGACG+GGG 0.697120 3:+8607575 None:intergenic
TGAGCGCACAGTGATCGCAG+TGG 0.741619 3:-8607333 MsG0380011968.01.T01:CDS
TATGTGGATGTAGATCATGG+GGG 0.764237 3:-8605826 MsG0380011968.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTTATTATATTGGATAAAT+GGG + Chr3:8606357-8606376 None:intergenic 10.0%
!! TATTTATTATATTGGATAAA+TGG + Chr3:8606358-8606377 None:intergenic 10.0%
!! ATAAGAGATTAATTCAACAA+TGG - Chr3:8606468-8606487 MsG0380011968.01.T01:CDS 20.0%
!! ATACTAATATACAAAATGCA+TGG + Chr3:8606422-8606441 None:intergenic 20.0%
!! TTCAAGAAATGAAAATGTTA+AGG - Chr3:8607230-8607249 MsG0380011968.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAGTGATATTTAGATTTTCA+AGG + Chr3:8607315-8607334 None:intergenic 20.0%
!!! TCTAGAAAATATCTTTTATG+TGG - Chr3:8607180-8607199 MsG0380011968.01.T01:CDS 20.0%
! AAAAGATTCCCCAAATTATT+CGG + Chr3:8606914-8606933 None:intergenic 25.0%
! AAATATCACTACAATAGTTG+AGG - Chr3:8607324-8607343 MsG0380011968.01.T01:CDS 25.0%
! AACCATATTCCGAATAATTT+GGG - Chr3:8606902-8606921 MsG0380011968.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTCATTGATGAATATCTT+TGG - Chr3:8605352-8605371 MsG0380011968.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTCAAAATCGTACATGTT+TGG + Chr3:8607871-8607890 None:intergenic 25.0%
! GATTAATAGAGTAATCTTCT+GGG + Chr3:8606448-8606467 None:intergenic 25.0%
! TGATTAATAGAGTAATCTTC+TGG + Chr3:8606449-8606468 None:intergenic 25.0%
! TTAAGATACATAAACCTAAG+TGG - Chr3:8606938-8606957 MsG0380011968.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCAAAATCGTACATGTTT+GGG + Chr3:8607870-8607889 None:intergenic 25.0%
!!! TCGAACAATTTCTTTTGAAA+TGG + Chr3:8606213-8606232 None:intergenic 25.0%
!!! TCTTTATTGAGTTTTAGAAC+TGG - Chr3:8607121-8607140 MsG0380011968.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATATTCTTTGATGATGTA+TGG - Chr3:8605961-8605980 MsG0380011968.01.T01:CDS 25.0%
AAGATAAATAGAAGAGAGCA+TGG - Chr3:8607253-8607272 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
AATATCCTTGAGTTTATGCA+TGG + Chr3:8607737-8607756 None:intergenic 30.0%
ACCATATTCCGAATAATTTG+GGG - Chr3:8606903-8606922 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
CAATGAAGGAATAAGAACTT+GGG - Chr3:8605293-8605312 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
GAACACAATTCAATGATGAA+AGG + Chr3:8606836-8606855 None:intergenic 30.0%
GAACCATATTCCGAATAATT+TGG - Chr3:8606901-8606920 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
GATATCAATACGTGAAATCA+AGG - Chr3:8605485-8605504 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
GCAAAGTTTCATCATCTATA+AGG + Chr3:8607648-8607667 None:intergenic 30.0%
TTGAATTGTGTTCAAAGTCT+AGG - Chr3:8606843-8606862 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
TTTATGTGGATGTAGATCAT+GGG - Chr3:8607194-8607213 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
! AACAAAATCTAAAACCGTGA+CGG - Chr3:8606283-8606302 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
! ACTCAAGGATATTTTCTTCA+CGG - Chr3:8607744-8607763 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
! AGAATTGATTCATAGAAGCT+TGG - Chr3:8606559-8606578 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
! ATGCATGGTTTCAAGTAATA+TGG + Chr3:8606407-8606426 None:intergenic 30.0%
! GAAATTTTGCATTTTCAGCA+TGG - Chr3:8607565-8607584 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
! TATGTACTTTTGTACCACTT+AGG + Chr3:8606955-8606974 None:intergenic 30.0%
! TTTTATGTGGATGTAGATCA+TGG - Chr3:8607193-8607212 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGGGTTTGTTAAATCTGAT+GGG - Chr3:8606498-8606517 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
!! CAAATTGTGTTGTTACCTTT+TGG + Chr3:8605767-8605786 None:intergenic 30.0%
!! CTACTACCTTTGTTGTTATT+GGG + Chr3:8606023-8606042 None:intergenic 30.0%
!! TTCAAAGTCTAGGATTTTGA+AGG - Chr3:8606853-8606872 MsG0380011968.01.T01:CDS 30.0%
AAAACTTGAGTGTCTCGTAA+AGG - Chr3:8607441-8607460 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
AAAGAGAGATTGAGCAGATT+TGG + Chr3:8607523-8607542 None:intergenic 35.0%
AAATCAAGGAAAGAAGTCAG+AGG - Chr3:8605499-8605518 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
AACCAGTCAATTCTTCTCTT+GGG + Chr3:8605650-8605669 None:intergenic 35.0%
AAGTTCCAACAATGTGTTCA+AGG - Chr3:8606751-8606770 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAAAGGAAAGACAATCG+AGG + Chr3:8605597-8605616 None:intergenic 35.0%
ACCAAGAGAAATAAACAAGC+TGG - Chr3:8607048-8607067 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
AGTTCCAACAATGTGTTCAA+GGG - Chr3:8606752-8606771 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
ATTCAACAATGGATAGCAGA+AGG - Chr3:8606479-8606498 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGGCAAATGAATACAAT+AGG + Chr3:8607841-8607860 None:intergenic 35.0%
CATACACTTCCTAAATCTGT+TGG - Chr3:8606971-8606990 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAGATTTGAGCATGAT+GGG - Chr3:8606165-8606184 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
CCAAGTTCTTATTCCTTCAT+TGG + Chr3:8605295-8605314 None:intergenic 35.0%
CCAATAACAACAAAGGTAGT+AGG - Chr3:8606021-8606040 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
CCAATGAAGGAATAAGAACT+TGG - Chr3:8605292-8605311 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
CTATTGTATTCATTTGCCAC+TGG - Chr3:8607839-8607858 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
GAACACATTGTTGGAACTTA+TGG + Chr3:8606750-8606769 None:intergenic 35.0%
GAAGAAACAAATCTTCTGAG+AGG - Chr3:8605174-8605193 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
GGGTTTATTGATAAGCATGA+TGG - Chr3:8605830-8605849 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTGAACATGAACTAGAA+AGG + Chr3:8606096-8606115 None:intergenic 35.0%
TCAAATACCTCTTATGTTCC+AGG + Chr3:8605944-8605963 None:intergenic 35.0%
TCAATGATGAAAGGATCCAT+TGG + Chr3:8606827-8606846 None:intergenic 35.0%
TCCCCAAATTATTCGGAATA+TGG + Chr3:8606907-8606926 None:intergenic 35.0%
TCTCAACTTCATCGACAAAA+TGG + Chr3:8606688-8606707 None:intergenic 35.0%
TGTTGAAAATAGACCACCAA+TGG + Chr3:8606267-8606286 None:intergenic 35.0%
TTATGTGGATGTAGATCATG+GGG - Chr3:8607195-8607214 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
TTCAACAATGGATAGCAGAA+GGG - Chr3:8606480-8606499 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCAAACATACACTGTGA+GGG - Chr3:8605809-8605828 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
TTGATGAATATCTTTGGCTG+AGG - Chr3:8605358-8605377 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTTATGATGTCAAGTGT+TGG - Chr3:8606578-8606597 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGTAACATCTGCATGAT+AGG + Chr3:8605882-8605901 None:intergenic 35.0%
TTTCTCAAACATACACTGTG+AGG - Chr3:8605808-8605827 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
TTTGACTCCAAACAAAGCAT+GGG - Chr3:8606124-8606143 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
! AGAATTGACTGGTTGGTTAT+TGG - Chr3:8605656-8605675 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
! AGTTACTGATTGAACAAGTG+AGG - Chr3:8605913-8605932 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
! ATGCTTTTGACGAATTCAGT+TGG + Chr3:8607775-8607794 None:intergenic 35.0%
! ATGGTTTCAAGTAATATGGC+AGG + Chr3:8606403-8606422 None:intergenic 35.0%
! ATTGTCTTTCCTTTTTGTCG+AGG - Chr3:8605599-8605618 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
! ATTTTGCATTTTCAGCATGG+AGG - Chr3:8607568-8607587 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGATTTGTTTCTTCCCTA+AGG + Chr3:8605170-8605189 None:intergenic 35.0%
! TTTACGAGACACTCAAGTTT+TGG + Chr3:8607442-8607461 None:intergenic 35.0%
! TTTTGCATTTTCAGCATGGA+GGG - Chr3:8607569-8607588 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAAGCATTGATCCAGACAA+AGG - Chr3:8607787-8607806 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAGCATTGATCCAGACAAA+GGG - Chr3:8607788-8607807 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
!! AGCATGATGGAAGAATTTTG+TGG - Chr3:8605843-8605862 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTACTACCTTTGTTGTTAT+TGG + Chr3:8606024-8606043 None:intergenic 35.0%
!! GAAGGGTTTGTTAAATCTGA+TGG - Chr3:8606497-8606516 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGACTCCAAACAAAGCA+TGG - Chr3:8606123-8606142 MsG0380011968.01.T01:CDS 35.0%
AAAATGCAAACAGCTACCTC+TGG - Chr3:8606232-8606251 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
AAATGAAGACGCTGAAGTTG+GGG + Chr3:8607385-8607404 None:intergenic 40.0%
AAGTCTTTCAGTGACTGTAG+GGG + Chr3:8607499-8607518 None:intergenic 40.0%
ACTGCAATTGTTGGACTTGA+AGG - Chr3:8605624-8605643 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
AGACAAAGGGAAAGACTACT+CGG - Chr3:8607801-8607820 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
AGTGATCATTGGGAAAATGG+AGG - Chr3:8606649-8606668 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
ATCTGATGGGAGAAGAACTT+TGG - Chr3:8606511-8606530 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
ATCTGCTCAATCTCTCTTTG+TGG - Chr3:8607524-8607543 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCCCTTGAACACATTGT+TGG + Chr3:8606759-8606778 None:intergenic 40.0%
CAAATGAAGACGCTGAAGTT+GGG + Chr3:8607386-8607405 None:intergenic 40.0%
CAACCAGTCAATTCTTCTCT+TGG + Chr3:8605651-8605670 None:intergenic 40.0%
CAAGAGAAGAATTGACTGGT+TGG - Chr3:8605649-8605668 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
CAAGTCTTTCAGTGACTGTA+GGG + Chr3:8607500-8607519 None:intergenic 40.0%
CATGGCAAATTCAACTTGGT+CGG + Chr3:8606000-8606019 None:intergenic 40.0%
CCTCAAAGATGCAGATAGAA+GGG - Chr3:8605251-8605270 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
CTCTTCTATTGCAGCACTTA+AGG + Chr3:8607284-8607303 None:intergenic 40.0%
GAGAGACAGAAAATAGGAGA+TGG - Chr3:8605565-8605584 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
GCACTAGAGAGACAGAAAAT+AGG - Chr3:8605559-8605578 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
GCATTCAGATTTGAGCATGA+TGG - Chr3:8606164-8606183 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
GCTGCATAACTTAGAGACAT+TGG - Chr3:8606997-8607016 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
GGAAATACCTGGAACATAAG+AGG - Chr3:8605934-8605953 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGTGATCATTGGGAAAA+TGG - Chr3:8606646-8606665 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
GGTGAGTAAAAATCTGAACC+TGG - Chr3:8606316-8606335 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
GTATTCATTTGCCACTGGAA+TGG - Chr3:8607844-8607863 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TACTATTCACTCATCTTCCG+AGG - Chr3:8607894-8607913 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TACTGAGGGAAGTGATCATT+GGG - Chr3:8606639-8606658 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TATGTGGATGTAGATCATGG+GGG - Chr3:8607196-8607215 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TCAAATGAAGACGCTGAAGT+TGG + Chr3:8607387-8607406 None:intergenic 40.0%
TCCTCAAAGATGCAGATAGA+AGG - Chr3:8605250-8605269 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TCTCAAACATACACTGTGAG+GGG - Chr3:8605810-8605829 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TCTGCTCAATCTCTCTTTGT+GGG - Chr3:8607525-8607544 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TGAAAAAATCCCCCAACTGA+AGG - Chr3:8607690-8607709 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TGAACAAGTGAGGAAATACC+TGG - Chr3:8605923-8605942 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TGTCTCGTAAAGGTAATGCT+GGG - Chr3:8607451-8607470 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TTACAGATTACTCCACATCC+AGG + Chr3:8605399-8605418 None:intergenic 40.0%
TTACTGAGGGAAGTGATCAT+TGG - Chr3:8606638-8606657 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TTGCAGTTTCCTCGACAAAA+AGG + Chr3:8605611-8605630 None:intergenic 40.0%
TTGGCTGTCAAAAACTAGCT+TGG + Chr3:8605748-8605767 None:intergenic 40.0%
TTGTGGGACAATTGCTATGA+TGG - Chr3:8607541-8607560 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
TTTCAACGTTCACAAGCACA+AGG - Chr3:8605528-8605547 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
! AAGAGTTCCCATGCTTTGTT+TGG + Chr3:8606134-8606153 None:intergenic 40.0%
! AATCTAAAACCGTGACGGAA+TGG - Chr3:8606288-8606307 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTTTTCCAAAGCCATGAA+TGG + Chr3:8606801-8606820 None:intergenic 40.0%
! ACTGGTGTGCTGATGAAAAA+AGG - Chr3:8607139-8607158 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
! GCCAGCTTGTTTATTTCTCT+TGG + Chr3:8607052-8607071 None:intergenic 40.0%
! GTCAAAAACTAGCTTGGCAA+GGG + Chr3:8605742-8605761 None:intergenic 40.0%
! TGTCAAAAACTAGCTTGGCA+AGG + Chr3:8605743-8605762 None:intergenic 40.0%
! TTGACTGGTTGGTTATTGGA+TGG - Chr3:8605660-8605679 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!! ACCTTTGTTGTTATTGGGCA+TGG + Chr3:8606018-8606037 None:intergenic 40.0%
!! ATGTCAAGTGTTGGCTTTGA+AGG - Chr3:8606587-8606606 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTCATGGCTTTGGAAAAGG+TGG - Chr3:8606800-8606819 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!! GGAAGTGTTTCAACTCCTTA+GGG - Chr3:8605152-8605171 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!! TCACATTTTCGTGCCATTCA+TGG - Chr3:8606785-8606804 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTCAAGTGTTGGCTTTGAA+GGG - Chr3:8606588-8606607 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGAAGGTACTTGACATGCA+AGG - Chr3:8606869-8606888 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!!! AGTCGTCTAGTTTTTCCAAC+TGG + Chr3:8606719-8606738 None:intergenic 40.0%
!!! GCTAGTTTTTGACAGCCAAA+AGG - Chr3:8605749-8605768 MsG0380011968.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGGGAGTCAAAGTTTTGATT+AGG + Chr3:8605431-8605450 None:intergenic 40.0%
!!! GTCGTCTAGTTTTTCCAACT+GGG + Chr3:8606718-8606737 None:intergenic 40.0%
!!! TCAAGTTTTGGAATCCAGTC+AGG + Chr3:8607430-8607449 None:intergenic 40.0%
AAAAATCCCCCAACTGAAGG+AGG - Chr3:8607693-8607712 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
AAACTTTGACTCCCCGTCAT+CGG - Chr3:8605436-8605455 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
AGGGAAAGTTACAGCATGTC+AGG - Chr3:8606607-8606626 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
ATATCTTTGGCTGAGGCATG+AGG - Chr3:8605365-8605384 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
CCAGTCCATGCATAAACTCA+AGG - Chr3:8607729-8607748 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
CCCTTCTATCTGCATCTTTG+AGG + Chr3:8605254-8605273 None:intergenic 45.0%
CCTTGAGTTTATGCATGGAC+TGG + Chr3:8607732-8607751 None:intergenic 45.0%
GAGAAACTGTGATGCAAGCT+CGG + Chr3:8605794-8605813 None:intergenic 45.0%
GAGTAGTCTTTCCCTTTGTC+TGG + Chr3:8607802-8607821 None:intergenic 45.0%
GATACTGAATCTCAGTCGCT+TGG - Chr3:8607606-8607625 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
GATGAAGCAGACACCAATGA+AGG - Chr3:8605279-8605298 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
GATTACAGAAGTTGCCTGAC+TGG - Chr3:8607413-8607432 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGTCTTTCAGTGACTGT+AGG + Chr3:8607501-8607520 None:intergenic 45.0%
GCCATGCCCAATAACAACAA+AGG - Chr3:8606014-8606033 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
GTCGAGGAAACTGCAATTGT+TGG - Chr3:8605615-8605634 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
GTGTCTCGTAAAGGTAATGC+TGG - Chr3:8607450-8607469 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
TCACTTCCCTCAGTAAGTCA+TGG + Chr3:8606634-8606653 None:intergenic 45.0%
TCAGGTCCATGACTTACTGA+GGG - Chr3:8606625-8606644 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
TCTCAGATGCTATCCGATGA+CGG + Chr3:8605452-8605471 None:intergenic 45.0%
TGATGGGAGAAGAACTTTGG+AGG - Chr3:8606514-8606533 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
TGCAGCTCACCAACAGATTT+AGG + Chr3:8606983-8607002 None:intergenic 45.0%
TGGGCATGGCAAATTCAACT+TGG + Chr3:8606004-8606023 None:intergenic 45.0%
! AAAAACTAGCTTGGCAAGGG+TGG + Chr3:8605739-8605758 None:intergenic 45.0%
! AACCGTGACGGAATGGAAAA+TGG - Chr3:8606295-8606314 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
! AACTTTGGAGGAAGTTGCAG+AGG - Chr3:8606526-8606545 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
! CACCATTTTCCATTCCGTCA+CGG + Chr3:8606300-8606319 None:intergenic 45.0%
! CTTTGGAAAAGGTGGACCAA+TGG - Chr3:8606808-8606827 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
! TCGGATAGCATCTGAGATAC+AGG - Chr3:8605455-8605474 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
! TTTCGTGCCATTCATGGCTT+TGG - Chr3:8606791-8606810 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
!! CTAGTTTTTCCAACTGGGAG+AGG + Chr3:8606713-8606732 None:intergenic 45.0%
!! GAAATGGACTTTAGCTCTGC+TGG + Chr3:8606197-8606216 None:intergenic 45.0%
!! GCCATTCATGGCTTTGGAAA+AGG - Chr3:8606797-8606816 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
!! GGGAAGTGTTTCAACTCCTT+AGG - Chr3:8605151-8605170 MsG0380011968.01.T01:CDS 45.0%
!! AGATAAAATATTTATTATAT+TGG + Chr3:8606366-8606385 None:intergenic 5.0%
ACATGTTTGGGCCATTCCAG+TGG + Chr3:8607858-8607877 None:intergenic 50.0%
AGTGATCGCAGTGGTAGGAA+TGG - Chr3:8605698-8605717 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
AGTTACAGTGCGAAGCGAGA+AGG + Chr3:8607087-8607106 None:intergenic 50.0%
CTCAGATGCTATCCGATGAC+GGG + Chr3:8605451-8605470 None:intergenic 50.0%
GAGTTGAAACACTTCCCCCA+AGG + Chr3:8605148-8605167 None:intergenic 50.0%
GGCAGAAACTGCGGTATCAT+TGG - Chr3:8605122-8605141 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
GGCCCAAGAGAAGAATTGAC+TGG - Chr3:8605645-8605664 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
GTCAGGTCCATGACTTACTG+AGG - Chr3:8606624-8606643 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
GTGATCGCAGTGGTAGGAAT+GGG - Chr3:8605699-8605718 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
GTTGAGAAACCTCTCCCAGT+TGG - Chr3:8606701-8606720 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
TCAGATGCTATCCGATGACG+GGG + Chr3:8605450-8605469 None:intergenic 50.0%
! AACTGCGGTATCATTGGCCT+TGG - Chr3:8605128-8605147 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
!! ACTGCGGTATCATTGGCCTT+GGG - Chr3:8605129-8605148 MsG0380011968.01.T01:CDS 50.0%
!! AGAGGGTACCTCCTTCAGTT+GGG + Chr3:8607704-8607723 None:intergenic 50.0%
AAGACGCTGAAGTTGGGGTG+GGG + Chr3:8607380-8607399 None:intergenic 55.0%
ACAGCTACCTCTGGCAGTTG+TGG - Chr3:8606241-8606260 MsG0380011968.01.T01:CDS 55.0%
AGGCATGAGGTCAAACGTCC+TGG - Chr3:8605378-8605397 MsG0380011968.01.T01:CDS 55.0%
ATCGCAGTGGTAGGAATGGG+CGG - Chr3:8605702-8605721 MsG0380011968.01.T01:CDS 55.0%
GAAGACGCTGAAGTTGGGGT+GGG + Chr3:8607381-8607400 None:intergenic 55.0%
GAGGTCAAACGTCCTGGATG+TGG - Chr3:8605384-8605403 MsG0380011968.01.T01:CDS 55.0%
GGGCATTACGTCTCAACTCC+AGG + Chr3:8606337-8606356 None:intergenic 55.0%
TGAAGACGCTGAAGTTGGGG+TGG + Chr3:8607382-8607401 None:intergenic 55.0%
! AGGGTACCTCCTTCAGTTGG+GGG + Chr3:8607702-8607721 None:intergenic 55.0%
!! ATGCATGGACTGGATGCCAG+AGG + Chr3:8607722-8607741 None:intergenic 55.0%
!! CAACTGAAGGAGGTACCCTC+TGG - Chr3:8607703-8607722 MsG0380011968.01.T01:CDS 55.0%
!! CAGAGGGTACCTCCTTCAGT+TGG + Chr3:8607705-8607724 None:intergenic 55.0%
!! CTGCGGTATCATTGGCCTTG+GGG - Chr3:8605130-8605149 MsG0380011968.01.T01:CDS 55.0%
!! GAGGGTACCTCCTTCAGTTG+GGG + Chr3:8607703-8607722 None:intergenic 55.0%
!! TGCATGGACTGGATGCCAGA+GGG + Chr3:8607721-8607740 None:intergenic 55.0%
!! TGCGGTATCATTGGCCTTGG+GGG - Chr3:8605131-8605150 MsG0380011968.01.T01:CDS 55.0%
CCAATGGCCACAACTGCCAG+AGG + Chr3:8606251-8606270 None:intergenic 60.0%
CCTCTGGCAGTTGTGGCCAT+TGG - Chr3:8606248-8606267 MsG0380011968.01.T01:CDS 60.0%
CGCACAGTGATCGCAGTGGT+AGG - Chr3:8605693-8605712 MsG0380011968.01.T01:CDS 60.0%
CTGGCAGTTGTGGCCATTGG+TGG - Chr3:8606251-8606270 MsG0380011968.01.T01:CDS 60.0%
TCGCAGTGGTAGGAATGGGC+GGG - Chr3:8605703-8605722 MsG0380011968.01.T01:CDS 60.0%
TGAGCGCACAGTGATCGCAG+TGG - Chr3:8605689-8605708 MsG0380011968.01.T01:CDS 60.0%
! GTGGTAGGAATGGGCGGGCT+CGG - Chr3:8605708-8605727 MsG0380011968.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 8605120 8607924 8605120 ID=MsG0380011968.01;Name=MsG0380011968.01
Chr3 mRNA 8605120 8607924 8605120 ID=MsG0380011968.01.T01;Parent=MsG0380011968.01;Name=MsG0380011968.01.T01;_AED=0.08;_eAED=0.08;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|934
Chr3 exon 8605120 8607924 8605120 ID=MsG0380011968.01.T01:exon:1032;Parent=MsG0380011968.01.T01
Chr3 CDS 8605120 8607924 8605120 ID=MsG0380011968.01.T01:cds;Parent=MsG0380011968.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380011968.01.T01

ATGGCAGAAACTGCGGTATCATTGGCCTTGGGGGAAGTGTTTCAACTCCTTAGGGAAGAAACAAATCTTCTGAGAGGTGTAAACAAAGTTTTTTTAGATATCAAAGATGAATTAGAAAGCATTCAAGTGTTCCTCAAAGATGCAGATAGAAGGGCAGCAGATGAAGCAGACACCAATGAAGGAATAAGAACTTGGGTGAAGCAAATGAGAGAAGCATCATTTCGTATTGAAGATGTCATTGATGAATATCTTTGGCTGAGGCATGAGGTCAAACGTCCTGGATGTGGAGTAATCTGTAAGATTGCAAACCTAATCAAAACTTTGACTCCCCGTCATCGGATAGCATCTGAGATACAGGACATCAAGATATCAATACGTGAAATCAAGGAAAGAAGTCAGAGGTATGACTTTCAACGTTCACAAGCACAAGGATCAACAAGCACTAGAGAGACAGAAAATAGGAGATGGCGTGATCCTCGATTGTCTTTCCTTTTTGTCGAGGAAACTGCAATTGTTGGACTTGAAGGCCCAAGAGAAGAATTGACTGGTTGGTTATTGGATGGTGTGTCTGAGCGCACAGTGATCGCAGTGGTAGGAATGGGCGGGCTCGGAAAAACCACCCTTGCCAAGCTAGTTTTTGACAGCCAAAAGGTAACAACACAATTTGATTGCCGAGCTTGCATCACAGTTTCTCAAACATACACTGTGAGGGGTTTATTGATAAGCATGATGGAAGAATTTTGTGGAGAAACTGAAAAACCTATCATGCAGATGTTACACAAAATAGATGACAAGTTACTGATTGAACAAGTGAGGAAATACCTGGAACATAAGAGGTATTTGATATTCTTTGATGATGTATGGCATGAAGATTTTTCCGACCAAGTTGAATTTGCCATGCCCAATAACAACAAAGGTAGTAGGATCATAATCACAACTAGAAAGATGCAAGCTGCAGATTTTTTCAAGAAATCCTTTCTAGTTCATGTTCACAACTTGCAACTTTTGACTCCAAACAAAGCATGGGAACTCTTCTGCAAGAAAGCATTCAGATTTGAGCATGATGGGCATTGTCCAGCAGAGCTAAAGTCCATTTCAAAAGAAATTGTTCGAAAATGCAAACAGCTACCTCTGGCAGTTGTGGCCATTGGTGGTCTATTTTCAACAAAATCTAAAACCGTGACGGAATGGAAAATGGTGAGTAAAAATCTGAACCTGGAGTTGAGACGTAATGCCCATTTATCCAATATAATAAATATTTTATCTCTTAGTTATGATGACCTGCCATATTACTTGAAACCATGCATTTTGTATATTAGTATATACCCAGAAGATTACTCTATTAATCATAAGAGATTAATTCAACAATGGATAGCAGAAGGGTTTGTTAAATCTGATGGGAGAAGAACTTTGGAGGAAGTTGCAGAGGAGTACTTGTTAGAATTGATTCATAGAAGCTTGGTTATGATGTCAAGTGTTGGCTTTGAAGGGAAAGTTACAGCATGTCAGGTCCATGACTTACTGAGGGAAGTGATCATTGGGAAAATGGAGGATTTAAGTTTCTGCCATTTTGTCGATGAAGTTGAGAAACCTCTCCCAGTTGGAAAAACTAGACGACTATCTATTTCCATAAGTTCCAACAATGTGTTCAAGGGCAATAAGAACTCACATTTTCGTGCCATTCATGGCTTTGGAAAAGGTGGACCAATGGATCCTTTCATCATTGAATTGTGTTCAAAGTCTAGGATTTTGAAGGTACTTGACATGCAAGGCACGTCAATGAACCATATTCCGAATAATTTGGGGAATCTTTTTCACTTAAGATACATAAACCTAAGTGGTACAAAAGTACATACACTTCCTAAATCTGTTGGTGAGCTGCATAACTTAGAGACATTGGATTTAAGAGAAACACTTGTGCATGAGATACCAAGAGAAATAAACAAGCTGGCAAAGCTAAGAAACCTTCTCGCTTCGCACTGTAACTATGATGCAATGTATTCTTTATTGAGTTTTAGAACTGGTGTGCTGATGAAAAAAGGTATTAAAAAGTTGACTTCTCTAGAAAATATCTTTTATGTGGATGTAGATCATGGGGGCGTTGATCTCATTCAAGAAATGAAAATGTTAAGGAAGATAAATAGAAGAGAGCATGGAAATTCCTTAAGTGCTGCAATAGAAGAGATGAAACACCTTGAAAATCTAAATATCACTACAATAGTTGAGGATGAAATCATTGACTTGAACTTTATATCATCCCCACCCCAACTTCAGCGTCTTCATTTGAAAGCTAGATTACAGAAGTTGCCTGACTGGATTCCAAAACTTGAGTGTCTCGTAAAGGTAATGCTGGGTTTTTCTATGTTGAAAGATGATCCCCTACAGTCACTGAAAGACTTGCCAAATCTGCTCAATCTCTCTTTGTGGGACAATTGCTATGATGGTGAAATTTTGCATTTTCAGCATGGAGGGTTTCTAAAATTGACGATACTGAATCTCAGTCGCTTGGAAAGAGTAAATTCAGTCCTTATAGATGATGAAACTTTGCTCTCTATTAAACATCTTACACTTGAAAAAATCCCCCAACTGAAGGAGGTACCCTCTGGCATCCAGTCCATGCATAAACTCAAGGATATTTTCTTCACGGATATGCCAACTGAATTCGTCAAAAGCATTGATCCAGACAAAGGGAAAGACTACTCGGTTATCAAGCATGTTCCTATTGTATTCATTTGCCACTGGAATGGCCCAAACATGTACGATTTTGAAATTCGTACTATTCACTCATCTTCCGAGGAGTCATAA

Protein sequence

>MsG0380011968.01.T01

MAETAVSLALGEVFQLLREETNLLRGVNKVFLDIKDELESIQVFLKDADRRAADEADTNEGIRTWVKQMREASFRIEDVIDEYLWLRHEVKRPGCGVICKIANLIKTLTPRHRIASEIQDIKISIREIKERSQRYDFQRSQAQGSTSTRETENRRWRDPRLSFLFVEETAIVGLEGPREELTGWLLDGVSERTVIAVVGMGGLGKTTLAKLVFDSQKVTTQFDCRACITVSQTYTVRGLLISMMEEFCGETEKPIMQMLHKIDDKLLIEQVRKYLEHKRYLIFFDDVWHEDFSDQVEFAMPNNNKGSRIIITTRKMQAADFFKKSFLVHVHNLQLLTPNKAWELFCKKAFRFEHDGHCPAELKSISKEIVRKCKQLPLAVVAIGGLFSTKSKTVTEWKMVSKNLNLELRRNAHLSNIINILSLSYDDLPYYLKPCILYISIYPEDYSINHKRLIQQWIAEGFVKSDGRRTLEEVAEEYLLELIHRSLVMMSSVGFEGKVTACQVHDLLREVIIGKMEDLSFCHFVDEVEKPLPVGKTRRLSISISSNNVFKGNKNSHFRAIHGFGKGGPMDPFIIELCSKSRILKVLDMQGTSMNHIPNNLGNLFHLRYINLSGTKVHTLPKSVGELHNLETLDLRETLVHEIPREINKLAKLRNLLASHCNYDAMYSLLSFRTGVLMKKGIKKLTSLENIFYVDVDHGGVDLIQEMKMLRKINRREHGNSLSAAIEEMKHLENLNITTIVEDEIIDLNFISSPPQLQRLHLKARLQKLPDWIPKLECLVKVMLGFSMLKDDPLQSLKDLPNLLNLSLWDNCYDGEILHFQHGGFLKLTILNLSRLERVNSVLIDDETLLSIKHLTLEKIPQLKEVPSGIQSMHKLKDIFFTDMPTEFVKSIDPDKGKDYSVIKHVPIVFICHWNGPNMYDFEIRTIHSSSEES*