AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041316.01


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MsG0780041316.01.T01 AT3G10720 60.494 324 128 0 24 347 294 617 1.98e-147 429
MsG0780041316.01.T01 AT5G04970 60.802 324 127 0 24 347 299 622 5.67e-146 426
MsG0780041316.01.T01 AT3G10720 63.077 260 96 0 87 346 1 260 7.38e-127 364
MsG0780041316.01.T01 AT2G45220 57.530 332 125 6 15 345 195 511 1.07e-126 373
MsG0780041316.01.T01 AT3G43270 54.192 334 144 4 15 347 202 527 5.21e-125 369
MsG0780041316.01.T01 AT2G26440 55.591 313 136 1 33 345 238 547 1.11e-122 364
MsG0780041316.01.T01 AT1G11580 54.573 328 143 3 15 341 231 553 6.97e-120 357
MsG0780041316.01.T01 AT4G33220 53.313 332 145 3 15 345 80 402 1.02e-119 352
MsG0780041316.01.T01 AT1G11580 54.573 328 143 3 15 341 252 574 1.12e-119 357
MsG0780041316.01.T01 AT5G53370 56.190 315 133 3 33 345 274 585 8.26e-119 355
MsG0780041316.01.T01 AT3G60730 53.074 309 144 1 35 342 208 516 1.48e-118 352
MsG0780041316.01.T01 AT4G33220 53.313 332 145 3 15 345 201 523 1.75e-118 352
MsG0780041316.01.T01 AT5G53370 56.190 315 133 3 33 345 310 621 3.22e-118 355
MsG0780041316.01.T01 AT5G51490 54.062 320 143 4 29 345 218 536 3.54e-118 352
MsG0780041316.01.T01 AT3G49220 51.297 347 151 5 1 345 266 596 6.63e-116 348
MsG0780041316.01.T01 AT3G05620 53.355 313 134 2 35 347 243 543 8.32e-116 346
MsG0780041316.01.T01 AT3G49220 51.297 347 151 5 1 345 311 641 1.40e-115 349
MsG0780041316.01.T01 AT4G02300 51.212 330 154 3 17 342 203 529 1.21e-114 343
MsG0780041316.01.T01 AT1G23200 52.537 335 144 5 12 345 234 554 1.41e-113 341
MsG0780041316.01.T01 AT1G53840 51.045 335 144 6 9 339 263 581 3.59e-113 341
MsG0780041316.01.T01 AT5G51500 50.000 346 163 4 3 345 202 540 4.93e-113 339
MsG0780041316.01.T01 AT5G04960 50.305 328 151 4 15 341 244 560 7.43e-113 339
MsG0780041316.01.T01 AT1G53830 53.571 336 146 3 11 345 261 587 9.14e-113 340
MsG0780041316.01.T01 AT3G05610 48.193 332 167 2 15 346 240 566 6.67e-112 340
MsG0780041316.01.T01 AT4G00190 52.280 329 148 6 18 345 154 474 1.82e-111 333
MsG0780041316.01.T01 AT4G02320 50.147 339 161 4 8 345 187 518 2.34e-111 334
MsG0780041316.01.T01 AT3G14310 52.083 336 151 3 11 345 266 592 1.38e-110 334
MsG0780041316.01.T01 AT2G26450 50.154 325 154 4 15 338 287 604 3.92e-110 334
MsG0780041316.01.T01 AT2G43050 49.412 340 152 5 11 347 196 518 1.16e-109 330
MsG0780041316.01.T01 AT3G59010 50.742 337 147 6 11 346 211 529 6.39e-109 328
MsG0780041316.01.T01 AT3G10710 49.245 331 157 4 15 345 242 561 2.29e-107 325
MsG0780041316.01.T01 AT5G27870 47.416 329 162 3 15 341 239 558 3.25e-107 330
MsG0780041316.01.T01 AT4G33230 47.720 329 164 4 11 338 278 599 4.60e-103 315
MsG0780041316.01.T01 AT3G47400 48.673 339 164 5 12 345 261 594 6.90e-100 307
MsG0780041316.01.T01 AT3G14300 50.000 328 142 7 15 336 649 960 7.64e-99 313
MsG0780041316.01.T01 AT3G27980 48.089 314 157 3 33 345 189 497 4.72e-98 299
MsG0780041316.01.T01 AT4G03930 48.408 314 156 3 33 345 216 524 6.40e-98 300
MsG0780041316.01.T01 AT3G06830 46.526 331 171 3 13 342 240 565 5.61e-97 298
MsG0780041316.01.T01 AT1G11590 48.408 314 156 3 33 345 216 524 5.71e-97 297
MsG0780041316.01.T01 AT5G49180 48.089 314 159 2 29 341 256 566 9.44e-97 298
MsG0780041316.01.T01 AT5G20860 45.455 319 164 4 30 345 227 538 1.43e-96 296
MsG0780041316.01.T01 AT4G15980 45.161 310 166 2 33 341 392 698 7.14e-85 271
MsG0780041316.01.T01 AT5G09760 45.223 314 159 7 29 333 237 546 7.63e-85 267
MsG0780041316.01.T01 AT5G09760 45.223 314 159 7 29 333 263 572 9.44e-85 267
MsG0780041316.01.T01 AT4G15980 45.161 310 166 2 33 341 402 708 1.43e-84 270
MsG0780041316.01.T01 AT5G64640 44.062 320 159 7 33 338 289 602 3.57e-83 264
MsG0780041316.01.T01 AT1G11370 50.000 244 119 1 33 276 46 286 3.68e-83 254
MsG0780041316.01.T01 AT5G20860 40.523 306 144 3 30 332 227 497 2.69e-76 243
MsG0780041316.01.T01 AT2G47030 41.562 320 180 4 29 345 273 588 7.75e-74 239
MsG0780041316.01.T01 AT2G47040 41.250 320 181 4 29 345 280 595 6.19e-73 237
MsG0780041316.01.T01 AT3G62170 40.909 308 175 4 35 339 279 582 3.63e-69 227
MsG0780041316.01.T01 AT5G19730 36.129 310 170 6 36 334 89 381 6.06e-54 182
MsG0780041316.01.T01 AT2G21610 33.227 313 189 6 32 344 50 342 5.83e-52 176
MsG0780041316.01.T01 AT2G21610 33.227 313 189 6 32 344 55 347 8.61e-52 176
MsG0780041316.01.T01 AT2G36700 33.766 308 184 5 32 334 41 333 1.50e-51 174
MsG0780041316.01.T01 AT1G05310 32.945 343 195 7 10 334 63 388 5.17e-51 174
MsG0780041316.01.T01 AT2G36710 34.603 315 185 6 32 339 90 390 1.12e-50 174
MsG0780041316.01.T01 AT3G29090 36.332 289 156 8 32 308 6 278 3.88e-50 170
MsG0780041316.01.T01 AT5G07430 32.515 326 199 6 13 334 47 355 1.51e-48 167
MsG0780041316.01.T01 AT3G17060 30.312 320 194 7 25 335 38 337 1.57e-45 159
MsG0780041316.01.T01 AT5G18990 34.483 290 157 7 33 308 29 299 2.07e-42 150
MsG0780041316.01.T01 AT2G19150 30.960 323 203 7 24 341 32 339 4.64e-42 149
MsG0780041316.01.T01 AT3G24130 32.680 306 170 8 17 308 21 304 4.45e-41 147
MsG0780041316.01.T01 AT5G47500 30.000 320 189 8 30 334 58 357 1.02e-40 146
MsG0780041316.01.T01 AT5G55590 30.818 318 191 7 29 334 78 378 4.64e-39 142
MsG0780041316.01.T01 AT5G07420 28.571 329 214 6 10 334 44 355 1.22e-38 141
MsG0780041316.01.T01 AT1G44980 43.085 188 101 3 12 199 60 241 2.62e-38 137
MsG0780041316.01.T01 AT1G69940 28.267 329 212 9 11 334 46 355 1.50e-37 138
MsG0780041316.01.T01 AT5G61680 30.421 309 191 8 32 334 68 358 4.44e-37 137
MsG0780041316.01.T01 AT5G07410 28.267 329 212 9 11 334 46 355 8.12e-37 136
MsG0780041316.01.T01 AT2G47280 30.063 316 188 8 33 336 35 329 2.66e-36 134
MsG0780041316.01.T01 AT5G55590 31.939 263 152 6 29 279 78 325 1.67e-35 132
MsG0780041316.01.T01 AT2G19150 32.197 264 161 6 24 282 32 282 2.64e-35 130
MsG0780041316.01.T01 AT5G26810 31.928 332 187 11 21 334 23 333 1.35e-34 130
MsG0780041316.01.T01 AT3G49220 37.607 117 56 4 1 116 311 411 6.55e-13 69.7

Find 77 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 102 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGTTTACATGCAAACATTTA+TGG 0.129976 7:-89508659 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGGTGCTGTTTCAACATATT+TGG 0.148909 7:-89508710 MsG0780041316.01.T01:CDS
TCGCTAGAAACAGATTTATT+TGG 0.177140 7:+89509994 None:intergenic
ATTAATTAATTAATTAATTA+AGG 0.178203 7:+89508408 None:intergenic
TACAGAGAATGTGACATTTA+TGG 0.181984 7:-89508919 MsG0780041316.01.T01:CDS
GTGGATAGAGGTTACAATTT+TGG 0.190584 7:+89508857 None:intergenic
TATGCTGAGTTTAATAATAC+TGG 0.243616 7:-89508571 MsG0780041316.01.T01:CDS
GGAACAGTAGATTTCATATT+CGG 0.296112 7:-89508898 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATGTATAATTACCGAATGTT+GGG 0.354549 7:+89509815 None:intergenic
GGTGCTGTTTCAACATATTT+GGG 0.357572 7:-89508709 MsG0780041316.01.T01:CDS
AAGCAGTGGCACTTAGAAAC+GGG 0.398121 7:-89509020 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATGTTGCTGGGTGGCGTGCT+TGG 0.401190 7:-89508624 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATTTCTTGCTTGGTGATGAT+TGG 0.405620 7:-89508462 MsG0780041316.01.T01:CDS
GATGTACCTGTGTCTTGGTT+AGG 0.407899 7:+89508781 None:intergenic
GATGATTGGTTGCCTCAAAC+AGG 0.413849 7:-89508448 MsG0780041316.01.T01:CDS
AATGTATAATTACCGAATGT+TGG 0.421859 7:+89509814 None:intergenic
ACGGTGGCAAATTTCTTGCT+TGG 0.445744 7:-89508472 MsG0780041316.01.T01:CDS
GCATTGAATTGTCCACTCAT+TGG 0.449744 7:+89508829 None:intergenic
TGTTGCTGGGTGGCGTGCTT+GGG 0.450946 7:-89508623 MsG0780041316.01.T01:CDS
AATAAATCTGTTTCTAGCGA+TGG 0.450968 7:-89509991 MsG0780041316.01.T01:CDS
TTGCTTTAATTGTACAGTTG+TGG 0.453845 7:+89508755 None:intergenic
CGTTTCTAAGTGCCACTGCT+TGG 0.461010 7:+89509022 None:intergenic
ATGAATGTTGCAGCTGTGGT+TGG 0.462240 7:-89509102 MsG0780041316.01.T01:intron
GTGTAAGACACCCCTGTTTG+AGG 0.465284 7:+89508436 None:intergenic
GATAATGTGATTAATGTTGC+TGG 0.479559 7:-89508637 MsG0780041316.01.T01:CDS
GCTGGGTGGCGTGCTTGGGA+TGG 0.482960 7:-89508619 MsG0780041316.01.T01:CDS
CAAGCAGTGGCACTTAGAAA+CGG 0.489043 7:-89509021 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGTGGTTGGGCAAGGATTCG+TGG 0.498726 7:-89509088 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATCACAGTGTTGTTGATGGC+TGG 0.499298 7:-89509852 MsG0780041316.01.T01:CDS
GTTGATGGCTGGACCACATT+CGG 0.499631 7:-89509841 MsG0780041316.01.T01:CDS
GGCAATCACAGTGTTGTTGA+TGG 0.508915 7:-89509856 MsG0780041316.01.T01:CDS
GGATTGATGTACCTGTGTCT+TGG 0.509046 7:+89508776 None:intergenic
TTTCATATTCGGAAATGCTA+AGG 0.512250 7:-89508887 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGAATGTTGCAGCTGTGGTT+GGG 0.516948 7:-89509101 MsG0780041316.01.T01:intron
GAGTTTAATAATACTGGGCC+AGG 0.520794 7:-89508565 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATTGTGACGGTTAGTCAAGA+TGG 0.521081 7:-89510060 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATAAATCTGTTTCTAGCGAT+GGG 0.535312 7:-89509990 MsG0780041316.01.T01:CDS
ACATTCGGCTCCCCAACATT+CGG 0.540697 7:-89509826 MsG0780041316.01.T01:intron
CTACCATCAGTGCTAGAGCC+TGG 0.540713 7:+89508547 None:intergenic
TCATTGGAAGACGTGGATAG+AGG 0.541407 7:+89508845 None:intergenic
CGTAAAATTAGCTGCATCCG+TGG 0.542453 7:+89508492 None:intergenic
GTTCTAGAATACTCTTTCCA+TGG 0.544216 7:+89508682 None:intergenic
GTTGCAGCTGTGGTTGGGCA+AGG 0.558786 7:-89509096 MsG0780041316.01.T01:intron
ACGGTTAGTCAAGATGGAAG+TGG 0.570515 7:-89510054 MsG0780041316.01.T01:CDS
GTGGTTGGGCAAGGATTCGT+GGG 0.574159 7:-89509087 MsG0780041316.01.T01:CDS
CAACATATTTGGGAAGACCA+TGG 0.574540 7:-89508699 MsG0780041316.01.T01:CDS
GATGATTTAGCTTCTAGCAA+TGG 0.582638 7:-89508730 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATGCTGAGTTTAATAATACT+GGG 0.583978 7:-89508570 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATTAACAAGACTATTATCAC+TGG 0.586139 7:-89509877 MsG0780041316.01.T01:CDS
GGGCCAGGCTCTAGCACTGA+TGG 0.587768 7:-89508550 MsG0780041316.01.T01:CDS
CTATCATGTGATTAATGCCA+CGG 0.589574 7:-89508509 MsG0780041316.01.T01:CDS
TTTACAGTTGCAGTTTCGAA+GGG 0.589810 7:-89508981 MsG0780041316.01.T01:CDS
TCAAGTTGGTGAGGATGTTG+TGG 0.590169 7:-89510091 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGCTGTGAAGCACCAAGCAG+TGG 0.592757 7:-89509034 MsG0780041316.01.T01:CDS
GATGGTAGAGTGACGTGGCA+AGG 0.596651 7:-89508532 MsG0780041316.01.T01:CDS
GAATGTTGGGGAGCCGAATG+TGG 0.602659 7:+89509828 None:intergenic
ATGACCATTCGTAACACAGC+AGG 0.603116 7:-89509057 MsG0780041316.01.T01:CDS
TCAGAGTGATCAAGTTGGTG+AGG 0.605937 7:-89510100 MsG0780041316.01.T01:CDS
AATGTGTGTATAACGTGTCT+TGG 0.609557 7:+89508956 None:intergenic
CTTCTTCAGAGTGATCAAGT+TGG 0.613368 7:-89510105 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATGGAAAGAGTATTCTAGAA+CGG 0.614937 7:-89508680 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATGATTGGTTGCCTCAAACA+GGG 0.616738 7:-89508447 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGATTGGTTGCCTCAAACAG+GGG 0.618420 7:-89508446 MsG0780041316.01.T01:CDS
TATCCACGTCTTCCAATGAG+TGG 0.622034 7:-89508841 MsG0780041316.01.T01:CDS
TTCAATGCAATCACTGCACA+AGG 0.625555 7:-89508814 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGTATAATTACCGAATGTTG+GGG 0.625668 7:+89509816 None:intergenic
ATTGCTAGAAGCTAAATCAT+CGG 0.626819 7:+89508732 None:intergenic
AGCACCTGCTGTGTTACGAA+TGG 0.627389 7:+89509053 None:intergenic
ATAATGTGATTAATGTTGCT+GGG 0.635060 7:-89508636 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGTCCACTCATTGGAAGACG+TGG 0.636776 7:+89508838 None:intergenic
CGATTTATGAGTCAGTTAGT+CGG 0.649371 7:-89510134 MsG0780041316.01.T01:CDS
TTTATGAGTCAGTTAGTCGG+AGG 0.663720 7:-89510131 MsG0780041316.01.T01:CDS
ACAGATCCTAACCAAGACAC+AGG 0.667761 7:-89508787 MsG0780041316.01.T01:CDS
TGTGGTGAGAGATATTGTGA+CGG 0.718292 7:-89510073 MsG0780041316.01.T01:CDS
AGCAGTGGCACTTAGAAACG+GGG 0.723770 7:-89509019 MsG0780041316.01.T01:CDS
GCACTGATGGTAGAGTGACG+TGG 0.734964 7:-89508537 MsG0780041316.01.T01:CDS
ATGTGATTAATGTTGCTGGG+TGG 0.776487 7:-89508633 MsG0780041316.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATATATTGATATATTTGA+TGG + Chr7:89508799-89508818 None:intergenic 10.0%
!!! TTTAAGTTTTAGTTTTTTTT+AGG + Chr7:89508858-89508877 None:intergenic 10.0%
!! AATTATTAAATTGAAAACAG+AGG + Chr7:89509019-89509038 None:intergenic 15.0%
!! AGAAATAATTTAACTATTGT+GGG - Chr7:89508916-89508935 MsG0780041316.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATCAAGTAAAGATTTTATAT+AGG - Chr7:89509382-89509401 MsG0780041316.01.T01:intron 15.0%
!! ACACAAAATATATACATTAG+CGG - Chr7:89509257-89509276 MsG0780041316.01.T01:intron 20.0%
!! GAAATAATTTAACTATTGTG+GGG - Chr7:89508917-89508936 MsG0780041316.01.T01:CDS 20.0%
!! GAGAAATAATTTAACTATTG+TGG - Chr7:89508915-89508934 MsG0780041316.01.T01:CDS 20.0%
!! GGTATGTTAAAAAAAATGTT+TGG + Chr7:89509288-89509307 None:intergenic 20.0%
!!! AAACTTAAAGACATTTTTAC+TGG - Chr7:89508869-89508888 MsG0780041316.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGTTTTATAAATAAAGACTG+AGG - Chr7:89509331-89509350 MsG0780041316.01.T01:intron 20.0%
!!! ATCGTTTTTGACATATTTTA+GGG + Chr7:89508984-89509003 None:intergenic 20.0%
!!! TATCGTTTTTGACATATTTT+AGG + Chr7:89508985-89509004 None:intergenic 20.0%
! AATGTATAATTACCGAATGT+TGG + Chr7:89508759-89508778 None:intergenic 25.0%
! ATAATGTGATTAATGTTGCT+GGG - Chr7:89509934-89509953 MsG0780041316.01.T01:CDS 25.0%
! ATGCTGAGTTTAATAATACT+GGG - Chr7:89510000-89510019 MsG0780041316.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATAATTACCGAATGTT+GGG + Chr7:89508758-89508777 None:intergenic 25.0%
! ATTAACAAGACTATTATCAC+TGG - Chr7:89508693-89508712 MsG0780041316.01.T01:CDS 25.0%
! TATGCTGAGTTTAATAATAC+TGG - Chr7:89509999-89510018 MsG0780041316.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATGGAAAAATATAGAAC+TGG + Chr7:89508783-89508802 None:intergenic 25.0%
! TTTATACGTTTATGCACAAA+AGG - Chr7:89509197-89509216 MsG0780041316.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGACTTTTTTGATGATGAT+TGG - Chr7:89508663-89508682 MsG0780041316.01.T01:CDS 25.0%
ATTGCTAGAAGCTAAATCAT+CGG + Chr7:89509841-89509860 None:intergenic 30.0%
GATAATGTGATTAATGTTGC+TGG - Chr7:89509933-89509952 MsG0780041316.01.T01:CDS 30.0%
GGAACAGTAGATTTCATATT+CGG - Chr7:89509672-89509691 MsG0780041316.01.T01:intron 30.0%
GGTTTACATGCAAACATTTA+TGG - Chr7:89509911-89509930 MsG0780041316.01.T01:CDS 30.0%
TACAGAGAATGTGACATTTA+TGG - Chr7:89509651-89509670 MsG0780041316.01.T01:intron 30.0%
TCGCTAGAAACAGATTTATT+TGG + Chr7:89508579-89508598 None:intergenic 30.0%
TGTATAATTACCGAATGTTG+GGG + Chr7:89508757-89508776 None:intergenic 30.0%
TTGCTTTAATTGTACAGTTG+TGG + Chr7:89509818-89509837 None:intergenic 30.0%
TTTCATATTCGGAAATGCTA+AGG - Chr7:89509683-89509702 MsG0780041316.01.T01:intron 30.0%
! TTTTTGATCTATGTTACTGC+TGG - Chr7:89508606-89508625 MsG0780041316.01.T01:CDS 30.0%
!! AATAAATCTGTTTCTAGCGA+TGG - Chr7:89508579-89508598 MsG0780041316.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAAATCTGTTTCTAGCGAT+GGG - Chr7:89508580-89508599 MsG0780041316.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGGAAAGAGTATTCTAGAA+CGG - Chr7:89509890-89509909 MsG0780041316.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTGATGATGATTGGAGA+TGG - Chr7:89508669-89508688 MsG0780041316.01.T01:CDS 30.0%
AATGTGTGTATAACGTGTCT+TGG + Chr7:89509617-89509636 None:intergenic 35.0%
CGATTTATGAGTCAGTTAGT+CGG - Chr7:89508436-89508455 MsG0780041316.01.T01:CDS 35.0%
CTATCATGTGATTAATGCCA+CGG - Chr7:89510061-89510080 MsG0780041316.01.T01:CDS 35.0%
TTTACAGTTGCAGTTTCGAA+GGG - Chr7:89509589-89509608 MsG0780041316.01.T01:intron 35.0%
! GATGATTTAGCTTCTAGCAA+TGG - Chr7:89509840-89509859 MsG0780041316.01.T01:CDS 35.0%
! GTGGATAGAGGTTACAATTT+TGG + Chr7:89509716-89509735 None:intergenic 35.0%
! TTTTACAGTTGCAGTTTCGA+AGG - Chr7:89509588-89509607 MsG0780041316.01.T01:intron 35.0%
! TTTTATGAATGTTGCAGCTG+TGG - Chr7:89509464-89509483 MsG0780041316.01.T01:intron 35.0%
!! ATTTCTTGCTTGGTGATGAT+TGG - Chr7:89510108-89510127 MsG0780041316.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTGCTGTTTCAACATATTT+GGG - Chr7:89509861-89509880 MsG0780041316.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTCTAGAATACTCTTTCCA+TGG + Chr7:89509891-89509910 None:intergenic 35.0%
!! TGGTGCTGTTTCAACATATT+TGG - Chr7:89509860-89509879 MsG0780041316.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGATTAATGTTGCTGGG+TGG - Chr7:89509937-89509956 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
CAACATATTTGGGAAGACCA+TGG - Chr7:89509871-89509890 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTTCAGAGTGATCAAGT+TGG - Chr7:89508465-89508484 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTTAATAATACTGGGCC+AGG - Chr7:89510005-89510024 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
GCATTGAATTGTCCACTCAT+TGG + Chr7:89509744-89509763 None:intergenic 40.0%
TGTGGTGAGAGATATTGTGA+CGG - Chr7:89508497-89508516 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
TTCAATGCAATCACTGCACA+AGG - Chr7:89509756-89509775 MsG0780041316.01.T01:intron 40.0%
TTTATGAGTCAGTTAGTCGG+AGG - Chr7:89508439-89508458 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
! ATGATTGGTTGCCTCAAACA+GGG - Chr7:89510123-89510142 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGTGACGGTTAGTCAAGA+TGG - Chr7:89508510-89508529 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
! CACGGATGCAGCTAATTTTA+CGG - Chr7:89510079-89510098 MsG0780041316.01.T01:CDS 40.0%
AAGCAGTGGCACTTAGAAAC+GGG - Chr7:89509550-89509569 MsG0780041316.01.T01:intron 45.0%
ACAGATCCTAACCAAGACAC+AGG - Chr7:89509783-89509802 MsG0780041316.01.T01:intron 45.0%
ACGGTGGCAAATTTCTTGCT+TGG - Chr7:89510098-89510117 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
ATGAATGTTGCAGCTGTGGT+TGG - Chr7:89509468-89509487 MsG0780041316.01.T01:intron 45.0%
ATGACCATTCGTAACACAGC+AGG - Chr7:89509513-89509532 MsG0780041316.01.T01:intron 45.0%
ATTGTGGGGCTCACACATAA+TGG - Chr7:89508931-89508950 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
CAAGCAGTGGCACTTAGAAA+CGG - Chr7:89509549-89509568 MsG0780041316.01.T01:intron 45.0%
CGTAAAATTAGCTGCATCCG+TGG + Chr7:89510081-89510100 None:intergenic 45.0%
GATGTACCTGTGTCTTGGTT+AGG + Chr7:89509792-89509811 None:intergenic 45.0%
GGATTGATGTACCTGTGTCT+TGG + Chr7:89509797-89509816 None:intergenic 45.0%
TATCCACGTCTTCCAATGAG+TGG - Chr7:89509729-89509748 MsG0780041316.01.T01:intron 45.0%
TCATTGGAAGACGTGGATAG+AGG + Chr7:89509728-89509747 None:intergenic 45.0%
TGAATGTTGCAGCTGTGGTT+GGG - Chr7:89509469-89509488 MsG0780041316.01.T01:intron 45.0%
! ACGGTTAGTCAAGATGGAAG+TGG - Chr7:89508516-89508535 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
! GATGATTGGTTGCCTCAAAC+AGG - Chr7:89510122-89510141 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
! GGATGCAGCTAATTTTACGG+TGG - Chr7:89510082-89510101 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
! GGCAATCACAGTGTTGTTGA+TGG - Chr7:89508714-89508733 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
! TGATTGGTTGCCTCAAACAG+GGG - Chr7:89510124-89510143 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
!! ATCACAGTGTTGTTGATGGC+TGG - Chr7:89508718-89508737 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
!! TCAAGTTGGTGAGGATGTTG+TGG - Chr7:89508479-89508498 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
!! TCAGAGTGATCAAGTTGGTG+AGG - Chr7:89508470-89508489 MsG0780041316.01.T01:CDS 45.0%
!!! TTTTTTTTATAATATTTTTC+AGG + Chr7:89509309-89509328 None:intergenic 5.0%
ACATTCGGCTCCCCAACATT+CGG - Chr7:89508744-89508763 MsG0780041316.01.T01:CDS 50.0%
AGCACCTGCTGTGTTACGAA+TGG + Chr7:89509520-89509539 None:intergenic 50.0%
AGCAGTGGCACTTAGAAACG+GGG - Chr7:89509551-89509570 MsG0780041316.01.T01:intron 50.0%
GTGTAAGACACCCCTGTTTG+AGG + Chr7:89510137-89510156 None:intergenic 50.0%
TGTCCACTCATTGGAAGACG+TGG + Chr7:89509735-89509754 None:intergenic 50.0%
! CGTTTCTAAGTGCCACTGCT+TGG + Chr7:89509551-89509570 None:intergenic 50.0%
! TGGGGCTCACACATAATGGA+GGG - Chr7:89508935-89508954 MsG0780041316.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTGATGGCTGGACCACATT+CGG - Chr7:89508729-89508748 MsG0780041316.01.T01:CDS 50.0%
CTACCATCAGTGCTAGAGCC+TGG + Chr7:89510026-89510045 None:intergenic 55.0%
GAATGTTGGGGAGCCGAATG+TGG + Chr7:89508745-89508764 None:intergenic 55.0%
GATGGTAGAGTGACGTGGCA+AGG - Chr7:89510038-89510057 MsG0780041316.01.T01:CDS 55.0%
GTGGGGCTCACACATAATGG+AGG - Chr7:89508934-89508953 MsG0780041316.01.T01:CDS 55.0%
GTGGTTGGGCAAGGATTCGT+GGG - Chr7:89509483-89509502 MsG0780041316.01.T01:intron 55.0%
TGTGGTTGGGCAAGGATTCG+TGG - Chr7:89509482-89509501 MsG0780041316.01.T01:intron 55.0%
! GCACTGATGGTAGAGTGACG+TGG - Chr7:89510033-89510052 MsG0780041316.01.T01:CDS 55.0%
! TGCTGTGAAGCACCAAGCAG+TGG - Chr7:89509536-89509555 MsG0780041316.01.T01:intron 55.0%
ATGTTGCTGGGTGGCGTGCT+TGG - Chr7:89509946-89509965 MsG0780041316.01.T01:CDS 60.0%
GTTGCAGCTGTGGTTGGGCA+AGG - Chr7:89509474-89509493 MsG0780041316.01.T01:intron 60.0%
TGTTGCTGGGTGGCGTGCTT+GGG - Chr7:89509947-89509966 MsG0780041316.01.T01:CDS 60.0%
! GGGCCAGGCTCTAGCACTGA+TGG - Chr7:89510020-89510039 MsG0780041316.01.T01:CDS 65.0%
GCTGGGTGGCGTGCTTGGGA+TGG - Chr7:89509951-89509970 MsG0780041316.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 89508417 89510175 89508417 ID=MsG0780041316.01;Name=MsG0780041316.01
Chr7 mRNA 89508417 89510175 89508417 ID=MsG0780041316.01.T01;Parent=MsG0780041316.01;Name=MsG0780041316.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|347
Chr7 exon 89509827 89510175 89509827 ID=MsG0780041316.01.T01:exon:15661;Parent=MsG0780041316.01.T01
Chr7 exon 89508417 89509111 89508417 ID=MsG0780041316.01.T01:exon:15660;Parent=MsG0780041316.01.T01
Chr7 CDS 89509827 89510175 89509827 ID=MsG0780041316.01.T01:cds;Parent=MsG0780041316.01.T01
Chr7 CDS 89508417 89509111 89508417 ID=MsG0780041316.01.T01:cds;Parent=MsG0780041316.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780041316.01.T01

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Protein sequence

>MsG0780041316.01.T01

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