AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040498.01


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MsG0780040498.01.T01 AT1G63350 25.197 381 248 9 15 383 284 639 5.46e-20 94.7
MsG0780040498.01.T01 AT1G61190 23.826 575 356 18 15 532 285 834 7.98e-20 94.4
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MsG0780040498.01.T01 AT5G05400 25.798 376 237 12 13 380 115 456 8.94e-20 94.0
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MsG0780040498.01.T01 AT5G43470 24.247 631 367 25 13 554 293 901 1.01e-19 94.0
MsG0780040498.01.T01 AT5G43470 24.247 631 367 25 13 554 293 901 1.01e-19 94.0
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MsG0780040498.01.T01 AT5G05400 25.798 376 237 12 13 380 284 625 1.55e-19 93.2
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MsG0780040498.01.T01 AT1G10920 26.053 380 240 14 64 415 57 423 2.22e-19 92.0
MsG0780040498.01.T01 AT5G44510 23.883 582 367 22 11 533 344 908 2.30e-19 93.2
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MsG0780040498.01.T01 AT5G44510 31.034 261 169 7 277 533 679 932 5.75e-16 82.0
MsG0780040498.01.T01 AT5G44510 23.883 582 367 22 11 533 344 908 2.81e-19 92.8
MsG0780040498.01.T01 AT5G44510 31.034 261 169 7 277 533 679 932 6.56e-16 82.0
MsG0780040498.01.T01 AT5G44510 23.883 582 367 22 11 533 344 908 2.91e-19 92.8
MsG0780040498.01.T01 AT5G44510 31.034 261 169 7 277 533 679 932 6.50e-16 82.0
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MsG0780040498.01.T01 AT4G10780 26.166 386 247 12 15 388 285 644 3.58e-19 92.0
MsG0780040498.01.T01 AT1G12280 23.960 601 342 19 13 528 286 856 4.91e-19 91.7
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MsG0780040498.01.T01 AT1G63360 26.425 386 242 11 13 380 247 608 5.65e-19 91.7
MsG0780040498.01.T01 AT1G10920 26.053 380 240 14 64 415 227 593 5.89e-19 91.3
MsG0780040498.01.T01 AT1G10920 26.053 380 240 14 64 415 227 593 5.89e-19 91.3
MsG0780040498.01.T01 AT1G10920 26.053 380 240 14 64 415 227 593 5.89e-19 91.3
MsG0780040498.01.T01 AT2G14080 24.867 563 355 18 14 533 232 769 8.31e-19 91.3
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MsG0780040498.01.T01 AT2G14080 27.972 286 183 7 268 535 756 1036 6.48e-14 75.5
MsG0780040498.01.T01 AT2G14080 31.224 237 153 6 291 525 733 961 6.40e-11 65.9
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MsG0780040498.01.T01 AT1G61190 23.715 603 360 20 15 552 285 852 5.26e-18 88.6
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MsG0780040498.01.T01 AT1G61190 23.801 584 347 18 15 533 285 835 6.10e-18 88.2
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MsG0780040498.01.T01 AT1G12290 24.551 334 221 8 13 336 243 555 1.62e-17 87.0
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MsG0780040498.01.T01 AT5G43730 24.873 394 229 14 13 380 281 633 1.51e-16 84.0
MsG0780040498.01.T01 AT5G43730 24.873 394 229 14 13 380 281 633 1.51e-16 84.0
MsG0780040498.01.T01 AT5G43730 24.873 394 229 14 13 380 281 633 1.51e-16 84.0
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MsG0780040498.01.T01 AT3G25510 30.612 245 158 5 296 535 523 760 1.52e-16 84.0
MsG0780040498.01.T01 AT3G25510 27.863 262 155 7 276 531 596 829 1.01e-11 68.6
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MsG0780040498.01.T01 AT1G15890 26.887 212 137 6 13 215 123 325 1.50e-15 80.5
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MsG0780040498.01.T01 AT3G04220 22.744 554 348 20 13 533 371 877 5.67e-15 79.0
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MsG0780040498.01.T01 AT3G44630 24.739 574 322 23 13 533 401 917 7.86e-15 78.6
MsG0780040498.01.T01 AT3G44630 24.739 574 322 23 13 533 401 917 7.86e-15 78.6
MsG0780040498.01.T01 AT3G44630 24.739 574 322 23 13 533 401 917 1.11e-14 78.2
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MsG0780040498.01.T01 AT5G43740 26.196 397 225 17 13 382 280 635 6.70e-14 75.5
MsG0780040498.01.T01 AT5G43740 26.196 397 225 17 13 382 280 635 6.70e-14 75.5
MsG0780040498.01.T01 AT1G63730 23.971 559 323 25 13 533 319 813 1.08e-13 74.7
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MsG0780040498.01.T01 AT5G66900 23.614 559 326 21 15 540 298 788 3.19e-13 73.2
MsG0780040498.01.T01 AT5G38350 23.186 565 340 25 13 535 160 672 6.21e-12 68.9
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MsG0780040498.01.T01 AT5G38340 24.007 554 343 23 13 533 160 668 7.99e-12 68.9
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MsG0780040498.01.T01 AT5G38340 24.007 554 343 23 13 533 366 874 1.13e-11 68.6
MsG0780040498.01.T01 AT5G45050 22.059 544 347 18 14 533 131 621 1.75e-11 67.8
MsG0780040498.01.T01 AT5G66910 23.562 539 312 18 15 530 300 761 2.04e-11 67.4
MsG0780040498.01.T01 AT5G45050 22.059 544 347 18 14 533 270 760 2.50e-11 67.4
MsG0780040498.01.T01 AT5G46260 23.201 556 351 19 13 533 320 834 8.27e-11 65.5
MsG0780040498.01.T01 AT5G38850 21.415 537 348 23 13 534 309 786 9.09e-11 65.5

Find 93 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 119 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATTATTAGAGTTTGTAAATT+TGG 0.109003 7:-78410975 None:intergenic
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TACTGTTCCTTCATATGTTT+TGG 0.207795 7:+78409804 MsG0780040498.01.T01:CDS
AGTCATTTCAACGACATTAA+AGG 0.225198 7:-78410154 None:intergenic
TAAAATAGTTCTTACACTTT+TGG 0.232388 7:-78410469 None:intergenic
ATATCGCAGGTATTTATAAT+TGG 0.240011 7:-78410547 None:intergenic
GACATTAAAGGTATAGTCTT+TGG 0.242586 7:-78410142 None:intergenic
TTTCCAATCTCTACTAGATT+TGG 0.253416 7:-78409901 None:intergenic
CCTGAAGCATCTTCAGGTTT+TGG 0.257144 7:+78410833 MsG0780040498.01.T01:CDS
CAACATTGACTCATCTTAAA+AGG 0.257692 7:+78411192 MsG0780040498.01.T01:CDS
GTTGAAACATTTGTTTATTA+GGG 0.291037 7:+78411058 MsG0780040498.01.T01:CDS
CCTCACGGCCCTTGAAGATT+TGG 0.304108 7:+78411268 MsG0780040498.01.T01:CDS
GGATTAGTTCAATCCATAAA+TGG 0.325643 7:+78410195 MsG0780040498.01.T01:CDS
TTTGTCTCTGTTTGTGAAAT+GGG 0.340448 7:+78409849 MsG0780040498.01.T01:CDS
GAAACATTGCCAAGAGGATT+AGG 0.340641 7:+78410738 MsG0780040498.01.T01:CDS
TATTAACCTGAAGCATCTTC+AGG 0.350825 7:+78410827 MsG0780040498.01.T01:CDS
GTTTGTCTCTGTTTGTGAAA+TGG 0.350892 7:+78409848 MsG0780040498.01.T01:CDS
ACCAACTTAGCAATTGATTT+AGG 0.352812 7:-78410603 None:intergenic
CTTCAGGATTTCAAGGACTT+TGG 0.353255 7:+78410279 MsG0780040498.01.T01:CDS
TTCAGGATTTCAAGGACTTT+GGG 0.363354 7:+78410280 MsG0780040498.01.T01:CDS
ACATTCAAGATCATTGCTTC+AGG 0.368705 7:+78410263 MsG0780040498.01.T01:CDS
TTGGTGCACCTGCGTGTTCT+CGG 0.380121 7:+78410621 MsG0780040498.01.T01:CDS
ATCATTGCTTCAGGATTTCA+AGG 0.381064 7:+78410272 MsG0780040498.01.T01:CDS
CGAAAATTTAAGCCACAATC+TGG 0.382709 7:+78411317 MsG0780040498.01.T01:CDS
TATACAAAGACAATGTTTCC+AGG 0.384518 7:-78410914 None:intergenic
ACATTGCCTGGTTGGATTGA+AGG 0.398623 7:+78411098 MsG0780040498.01.T01:CDS
ACATTAAAGGTATAGTCTTT+GGG 0.400785 7:-78410141 None:intergenic
GCCTAAATCAATTGCTAAGT+TGG 0.402282 7:+78410602 MsG0780040498.01.T01:CDS
TGTAAAGTGGTAAGGAATCT+AGG 0.403042 7:-78410947 None:intergenic
CTTAAAAGGCTACATATTGT+TGG 0.403745 7:+78411206 MsG0780040498.01.T01:CDS
CAAAATTTGATTTAGATAAG+TGG 0.409462 7:+78409989 MsG0780040498.01.T01:CDS
TCGTAAGAGACCATGAGATA+TGG 0.419858 7:+78410016 MsG0780040498.01.T01:CDS
GCATTTATCAATTGTTGAAA+AGG 0.421189 7:+78410416 MsG0780040498.01.T01:CDS
CCAAAACCTGAAGATGCTTC+AGG 0.421566 7:-78410833 None:intergenic
TATCCAAATCTAGTAGAGAT+TGG 0.424834 7:+78409898 MsG0780040498.01.T01:CDS
TGAGAAAGCGTCGTTAGATT+AGG 0.434301 7:-78411161 None:intergenic
TCCTCGTGCTAGATGATGTA+TGG 0.444295 7:+78409700 None:intergenic
TGCAATGTATGTTGCAAAAG+AGG 0.449120 7:+78410344 MsG0780040498.01.T01:CDS
TATTGGAAAGTCAAGAGATC+AGG 0.456250 7:+78411379 MsG0780040498.01.T01:CDS
GTTTGTGAAATGGGCATTCA+AGG 0.460123 7:+78409858 MsG0780040498.01.T01:CDS
TAACTCATGTATATATTCTC+TGG 0.470582 7:-78410241 None:intergenic
CAATGACAGAACTGATTGTT+TGG 0.471126 7:-78410796 None:intergenic
CTTCGATGACCAAATCTTCA+AGG 0.475626 7:-78411277 None:intergenic
ATGAAACATTGTTGAATACA+TGG 0.484332 7:+78410520 MsG0780040498.01.T01:CDS
AGCCACAATCTGGTGAGTAC+TGG 0.489228 7:+78411327 MsG0780040498.01.T01:CDS
TCAACAATGTTTCATTGTCA+AGG 0.491582 7:-78410512 None:intergenic
TTGGAAGACTAATTAGTTGA+GGG 0.493380 7:-78411232 None:intergenic
CAACTCAGTTGCTTCCATGA+TGG 0.494946 7:+78409780 MsG0780040498.01.T01:CDS
ACCATCTTGCCTAATCCTCT+TGG 0.498148 7:-78410747 None:intergenic
GGTATAGTCTTTGGGATACA+AGG 0.500753 7:-78410133 None:intergenic
AACTCAGTTGCTTCCATGAT+GGG 0.500898 7:+78409781 MsG0780040498.01.T01:CDS
TGCAAAAGAGGAGTTTGTAA+TGG 0.504256 7:+78410356 MsG0780040498.01.T01:CDS
AAGCATTGTCTCAAATAAGA+TGG 0.511553 7:-78410099 None:intergenic
CCAGGCAATGTCAAAAGCCC+TGG 0.516242 7:-78411086 None:intergenic
TTATTTCCTGTCGAAGGAGT+GGG 0.518603 7:+78410489 MsG0780040498.01.T01:CDS
ACATTGTCTTTGTATAAATG+TGG 0.526215 7:+78410921 MsG0780040498.01.T01:CDS
GTTCTAAATTCCATATCTCA+TGG 0.530352 7:-78410026 None:intergenic
TTTATTTCCTGTCGAAGGAG+TGG 0.532277 7:+78410488 MsG0780040498.01.T01:CDS
TGAAGGAACAGTACCCATCA+TGG 0.532450 7:-78409794 None:intergenic
AGACCTTCCAAAACATATGA+AGG 0.533582 7:-78409811 None:intergenic
TCAAGGCCCACTCCTTCGAC+AGG 0.538139 7:-78410495 None:intergenic
CATTGTCTTTGTATAAATGT+GGG 0.540524 7:+78410922 MsG0780040498.01.T01:CDS
GGAACAACAACTCATTTCCC+TGG 0.542285 7:+78410896 MsG0780040498.01.T01:CDS
CCGCTGGCTGTGAGAACGGT+AGG 0.550957 7:+78409952 MsG0780040498.01.T01:CDS
TGGTTATAAACAAATGTTGA+AGG 0.552901 7:-78410773 None:intergenic
AAAGTCAAGAGATCAGGAAG+AGG 0.553531 7:+78411385 MsG0780040498.01.T01:CDS
ATACAAAGACAATGTTTCCA+GGG 0.554897 7:-78410913 None:intergenic
TTATGGATTGAACTAATCCA+AGG 0.557829 7:-78410191 None:intergenic
CTTGGAAGACTAATTAGTTG+AGG 0.557913 7:-78411233 None:intergenic
CATTAAAATCTACATATCGC+AGG 0.567765 7:-78410560 None:intergenic
AGTTCCGCTGGCTGTGAGAA+CGG 0.568674 7:+78409948 MsG0780040498.01.T01:CDS
GTGAAATGGGCATTCAAGGA+TGG 0.569129 7:+78409862 MsG0780040498.01.T01:CDS
TTTGGAAGGTCTTTCGCAAG+AGG 0.569259 7:+78409822 MsG0780040498.01.T01:CDS
ATCATCAAAGTTGGTGCAGT+AGG 0.574756 7:+78409730 MsG0780040498.01.T01:CDS
GCCAAGAGGATTAGGCAAGA+TGG 0.577282 7:+78410746 MsG0780040498.01.T01:CDS
AAAATGTGCTGGAGTTCCGC+TGG 0.579889 7:+78409936 MsG0780040498.01.T01:CDS
GTGAGGTGATACATGTCACT+TGG 0.585907 7:-78411251 None:intergenic
GGCCAGTACTCACCAGATTG+TGG 0.587228 7:-78411329 None:intergenic
TATGGATTGAACTAATCCAA+GGG 0.600194 7:-78410190 None:intergenic
TTCGATGACCAAATCTTCAA+GGG 0.602221 7:-78411276 None:intergenic
TGACAGAACTGATTGTTTGG+TGG 0.604597 7:-78410793 None:intergenic
GGAATGATGATCATCAAAGT+TGG 0.609866 7:+78409721 MsG0780040498.01.T01:CDS
TGAAACATTGTTGAATACAT+GGG 0.618841 7:+78410521 MsG0780040498.01.T01:CDS
AAGTGACATGTATCACCTCA+CGG 0.644270 7:+78411253 MsG0780040498.01.T01:CDS
GAGCTTGAAACATTGCCAAG+AGG 0.658006 7:+78410732 MsG0780040498.01.T01:CDS
AGGAAGTTCATAAATCAGCA+AGG 0.664225 7:-78411141 None:intergenic
GCAGCACCTTCAATCCAACC+AGG 0.675013 7:-78411104 None:intergenic
TTGCAAGTCATGATACTCAG+TGG 0.675051 7:+78410702 MsG0780040498.01.T01:CDS
ATGGATTGAACTAATCCAAG+GGG 0.675163 7:-78410189 None:intergenic
CCAAATCTTCAAGGGCCGTG+AGG 0.685983 7:-78411268 None:intergenic
TCTTGAGACCGAGAACACGC+AGG 0.690179 7:-78410629 None:intergenic
AGCAACTGAGTTGCTACGTG+TGG 0.693887 7:-78409770 None:intergenic
CCTACCGTTCTCACAGCCAG+CGG 0.709127 7:-78409952 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTATTAGAGTTTGTAAATT+TGG - Chr7:78410978-78410997 None:intergenic 15.0%
!! AAATTTGGAAAAATGTAAAG+TGG - Chr7:78410963-78410982 None:intergenic 20.0%
!! GTTGAAACATTTGTTTATTA+GGG + Chr7:78411058-78411077 MsG0780040498.01.T01:CDS 20.0%
!! TAGAGTTTAAAAATAGAATG+AGG - Chr7:78410678-78410697 None:intergenic 20.0%
!!! ATATGAAGTTTTTATTCAGT+AGG + Chr7:78410874-78410893 MsG0780040498.01.T01:CDS 20.0%
!!! CAAAATTTGATTTAGATAAG+TGG + Chr7:78409989-78410008 MsG0780040498.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAAATAGTTCTTACACTTT+TGG - Chr7:78410472-78410491 None:intergenic 20.0%
!!! TATGAAGTTTTTATTCAGTA+GGG + Chr7:78410875-78410894 MsG0780040498.01.T01:CDS 20.0%
! ACATTGTCTTTGTATAAATG+TGG + Chr7:78410921-78410940 MsG0780040498.01.T01:CDS 25.0%
! ATATCGCAGGTATTTATAAT+TGG - Chr7:78410550-78410569 None:intergenic 25.0%
! ATGAAACATTGTTGAATACA+TGG + Chr7:78410520-78410539 MsG0780040498.01.T01:CDS 25.0%
! CATTGTCTTTGTATAAATGT+GGG + Chr7:78410922-78410941 MsG0780040498.01.T01:CDS 25.0%
! GCATTTATCAATTGTTGAAA+AGG + Chr7:78410416-78410435 MsG0780040498.01.T01:CDS 25.0%
! GGTTGAAACATTTGTTTATT+AGG + Chr7:78411057-78411076 MsG0780040498.01.T01:CDS 25.0%
! TAACTCATGTATATATTCTC+TGG - Chr7:78410244-78410263 None:intergenic 25.0%
! TGAAACATTGTTGAATACAT+GGG + Chr7:78410521-78410540 MsG0780040498.01.T01:CDS 25.0%
! TGGTTATAAACAAATGTTGA+AGG - Chr7:78410776-78410795 None:intergenic 25.0%
!! AATGTTTCAACCTCAATTTT+TGG - Chr7:78411049-78411068 None:intergenic 25.0%
!! ACATTAAAGGTATAGTCTTT+GGG - Chr7:78410144-78410163 None:intergenic 25.0%
!!! CACATCAAAAGTGTTTTTAT+TGG + Chr7:78411362-78411381 MsG0780040498.01.T01:CDS 25.0%
AGTCATTTCAACGACATTAA+AGG - Chr7:78410157-78410176 None:intergenic 30.0%
ATACAAAGACAATGTTTCCA+GGG - Chr7:78410916-78410935 None:intergenic 30.0%
CATTAAAATCTACATATCGC+AGG - Chr7:78410563-78410582 None:intergenic 30.0%
CTTAAAAGGCTACATATTGT+TGG + Chr7:78411206-78411225 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTGTGAAAAAATGTGC+TGG + Chr7:78409925-78409944 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
TATACAAAGACAATGTTTCC+AGG - Chr7:78410917-78410936 None:intergenic 30.0%
TATCCAAATCTAGTAGAGAT+TGG + Chr7:78409898-78409917 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
TCAACAATGTTTCATTGTCA+AGG - Chr7:78410515-78410534 None:intergenic 30.0%
TGGAAAAATGTAAAGTGGTA+AGG - Chr7:78410958-78410977 None:intergenic 30.0%
TTGGAAGACTAATTAGTTGA+GGG - Chr7:78411235-78411254 None:intergenic 30.0%
TTTCCAATCTCTACTAGATT+TGG - Chr7:78409904-78409923 None:intergenic 30.0%
TTTGTCTCTGTTTGTGAAAT+GGG + Chr7:78409849-78409868 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
! AAGCATTGTCTCAAATAAGA+TGG - Chr7:78410102-78410121 None:intergenic 30.0%
! ACCAACTTAGCAATTGATTT+AGG - Chr7:78410606-78410625 None:intergenic 30.0%
! ACTTTTGATGTGAGAAATCA+TGG - Chr7:78411354-78411373 None:intergenic 30.0%
! CAGATTGTGGCTTAAATTTT+CGG - Chr7:78411319-78411338 None:intergenic 30.0%
! CTTTTGATGTGAGAAATCAT+GGG - Chr7:78411353-78411372 None:intergenic 30.0%
! GACATTAAAGGTATAGTCTT+TGG - Chr7:78410145-78410164 None:intergenic 30.0%
! GTTCTAAATTCCATATCTCA+TGG - Chr7:78410029-78410048 None:intergenic 30.0%
! TACTGTTCCTTCATATGTTT+TGG + Chr7:78409804-78409823 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
! TAGCTTTTCACTTCCATTTA+TGG - Chr7:78410211-78410230 None:intergenic 30.0%
! TATGGATTGAACTAATCCAA+GGG - Chr7:78410193-78410212 None:intergenic 30.0%
! TCGTTGAAATGACTATTTTG+TGG + Chr7:78410163-78410182 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTTATTAGGGATTTTCCA+GGG + Chr7:78411069-78411088 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
! TTATGGATTGAACTAATCCA+AGG - Chr7:78410194-78410213 None:intergenic 30.0%
! TTGTTTATTAGGGATTTTCC+AGG + Chr7:78411068-78411087 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
!! ACTATTTTATTTCCTGTCGA+AGG + Chr7:78410483-78410502 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
!! CAACATTGACTCATCTTAAA+AGG + Chr7:78411192-78411211 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
!! GGATTAGTTCAATCCATAAA+TGG + Chr7:78410195-78410214 MsG0780040498.01.T01:CDS 30.0%
!! TCAACCTCAATTTTTGGATT+GGG - Chr7:78411043-78411062 None:intergenic 30.0%
!! TCATAGCTTAATTTTAGTGC+AGG - Chr7:78410072-78410091 None:intergenic 30.0%
!! TTCAACCTCAATTTTTGGAT+TGG - Chr7:78411044-78411063 None:intergenic 30.0%
AAAGCCCAATCCAAAAATTG+AGG + Chr7:78411036-78411055 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
ACATTCAAGATCATTGCTTC+AGG + Chr7:78410263-78410282 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
AGACCTTCCAAAACATATGA+AGG - Chr7:78409814-78409833 None:intergenic 35.0%
AGGAAGTTCATAAATCAGCA+AGG - Chr7:78411144-78411163 None:intergenic 35.0%
ATCATTGCTTCAGGATTTCA+AGG + Chr7:78410272-78410291 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
CAATGACAGAACTGATTGTT+TGG - Chr7:78410799-78410818 None:intergenic 35.0%
CGAAAATTTAAGCCACAATC+TGG + Chr7:78411317-78411336 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGAAGACTAATTAGTTG+AGG - Chr7:78411236-78411255 None:intergenic 35.0%
GCCTAAATCAATTGCTAAGT+TGG + Chr7:78410602-78410621 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
GGAATGATGATCATCAAAGT+TGG + Chr7:78409721-78409740 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGTCTCTGTTTGTGAAA+TGG + Chr7:78409848-78409867 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
TATTGGAAAGTCAAGAGATC+AGG + Chr7:78411379-78411398 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
TGCAAAAGAGGAGTTTGTAA+TGG + Chr7:78410356-78410375 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
TGCAATGTATGTTGCAAAAG+AGG + Chr7:78410344-78410363 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
TGTAAAGTGGTAAGGAATCT+AGG - Chr7:78410950-78410969 None:intergenic 35.0%
TTCAGGATTTCAAGGACTTT+GGG + Chr7:78410280-78410299 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
TTCGATGACCAAATCTTCAA+GGG - Chr7:78411279-78411298 None:intergenic 35.0%
! AGTTCTTACACTTTTGGACT+TGG - Chr7:78410466-78410485 None:intergenic 35.0%
! ATGGATTGAACTAATCCAAG+GGG - Chr7:78410192-78410211 None:intergenic 35.0%
! GTTCTTACACTTTTGGACTT+GGG - Chr7:78410465-78410484 None:intergenic 35.0%
! TATTAACCTGAAGCATCTTC+AGG + Chr7:78410827-78410846 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
! TTAAATTTTCGGCACAACTC+AGG - Chr7:78411308-78411327 None:intergenic 35.0%
!! GTTCCTTCATATGTTTTGGA+AGG + Chr7:78409808-78409827 MsG0780040498.01.T01:CDS 35.0%
AAAGTCAAGAGATCAGGAAG+AGG + Chr7:78411385-78411404 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
AACTCAGTTGCTTCCATGAT+GGG + Chr7:78409781-78409800 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
AAGTGACATGTATCACCTCA+CGG + Chr7:78411253-78411272 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
CTTCAGGATTTCAAGGACTT+TGG + Chr7:78410279-78410298 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
CTTCGATGACCAAATCTTCA+AGG - Chr7:78411280-78411299 None:intergenic 40.0%
GAAACATTGCCAAGAGGATT+AGG + Chr7:78410738-78410757 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
GTTTGTGAAATGGGCATTCA+AGG + Chr7:78409858-78409877 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
TCGTAAGAGACCATGAGATA+TGG + Chr7:78410016-78410035 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
TGACAGAACTGATTGTTTGG+TGG - Chr7:78410796-78410815 None:intergenic 40.0%
TTATTTCCTGTCGAAGGAGT+GGG + Chr7:78410489-78410508 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
TTGCAAGTCATGATACTCAG+TGG + Chr7:78410702-78410721 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
TTTATTTCCTGTCGAAGGAG+TGG + Chr7:78410488-78410507 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
! ACTATTTTGTGGATACCCCT+TGG + Chr7:78410174-78410193 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCATCAAAGTTGGTGCAGT+AGG + Chr7:78409730-78409749 MsG0780040498.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTATAGTCTTTGGGATACA+AGG - Chr7:78410136-78410155 None:intergenic 40.0%
!! TGAGAAAGCGTCGTTAGATT+AGG - Chr7:78411164-78411183 None:intergenic 40.0%
ACATTGCCTGGTTGGATTGA+AGG + Chr7:78411098-78411117 MsG0780040498.01.T01:CDS 45.0%
ACCATCTTGCCTAATCCTCT+TGG - Chr7:78410750-78410769 None:intergenic 45.0%
CAACTCAGTTGCTTCCATGA+TGG + Chr7:78409780-78409799 MsG0780040498.01.T01:CDS 45.0%
CCAAAACCTGAAGATGCTTC+AGG - Chr7:78410836-78410855 None:intergenic 45.0%
GAGCTTGAAACATTGCCAAG+AGG + Chr7:78410732-78410751 MsG0780040498.01.T01:CDS 45.0%
GGAACAACAACTCATTTCCC+TGG + Chr7:78410896-78410915 MsG0780040498.01.T01:CDS 45.0%
GTGAAATGGGCATTCAAGGA+TGG + Chr7:78409862-78409881 MsG0780040498.01.T01:CDS 45.0%
GTGAGGTGATACATGTCACT+TGG - Chr7:78411254-78411273 None:intergenic 45.0%
TGAAGGAACAGTACCCATCA+TGG - Chr7:78409797-78409816 None:intergenic 45.0%
TTTGGAAGGTCTTTCGCAAG+AGG + Chr7:78409822-78409841 MsG0780040498.01.T01:CDS 45.0%
!! CCTGAAGCATCTTCAGGTTT+TGG + Chr7:78410833-78410852 MsG0780040498.01.T01:CDS 45.0%
AAAATGTGCTGGAGTTCCGC+TGG + Chr7:78409936-78409955 MsG0780040498.01.T01:CDS 50.0%
AGCAACTGAGTTGCTACGTG+TGG - Chr7:78409773-78409792 None:intergenic 50.0%
AGCCACAATCTGGTGAGTAC+TGG + Chr7:78411327-78411346 MsG0780040498.01.T01:CDS 50.0%
GCCAAGAGGATTAGGCAAGA+TGG + Chr7:78410746-78410765 MsG0780040498.01.T01:CDS 50.0%
! GGCTTTTGACATTGCCTGGT+TGG + Chr7:78411090-78411109 MsG0780040498.01.T01:CDS 50.0%
CCAAATCTTCAAGGGCCGTG+AGG - Chr7:78411271-78411290 None:intergenic 55.0%
CCAGGCAATGTCAAAAGCCC+TGG - Chr7:78411089-78411108 None:intergenic 55.0%
CCTCACGGCCCTTGAAGATT+TGG + Chr7:78411268-78411287 MsG0780040498.01.T01:CDS 55.0%
GCAGCACCTTCAATCCAACC+AGG - Chr7:78411107-78411126 None:intergenic 55.0%
GGCCAGTACTCACCAGATTG+TGG - Chr7:78411332-78411351 None:intergenic 55.0%
TCTTGAGACCGAGAACACGC+AGG - Chr7:78410632-78410651 None:intergenic 55.0%
TTGGTGCACCTGCGTGTTCT+CGG + Chr7:78410621-78410640 MsG0780040498.01.T01:CDS 55.0%
! AGTTCCGCTGGCTGTGAGAA+CGG + Chr7:78409948-78409967 MsG0780040498.01.T01:CDS 55.0%
! CCAGGGCTTTTGACATTGCC+TGG + Chr7:78411086-78411105 MsG0780040498.01.T01:CDS 55.0%
CCTACCGTTCTCACAGCCAG+CGG - Chr7:78409955-78409974 None:intergenic 60.0%
TCAAGGCCCACTCCTTCGAC+AGG - Chr7:78410498-78410517 None:intergenic 60.0%
! CCGCTGGCTGTGAGAACGGT+AGG + Chr7:78409952-78409971 MsG0780040498.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 78409715 78411412 78409715 ID=MsG0780040498.01;Name=MsG0780040498.01
Chr7 mRNA 78409715 78411412 78409715 ID=MsG0780040498.01.T01;Parent=MsG0780040498.01;Name=MsG0780040498.01.T01;_AED=0.38;_eAED=0.38;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|565
Chr7 exon 78409715 78411412 78409715 ID=MsG0780040498.01.T01:exon:204;Parent=MsG0780040498.01.T01
Chr7 CDS 78409715 78411412 78409715 ID=MsG0780040498.01.T01:cds;Parent=MsG0780040498.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780040498.01.T01

ATGTATGGAATGATGATCATCAAAGTTGGTGCAGTAGGAAGTAAAATTATAGTCACCACACGTAGCAACTCAGTTGCTTCCATGATGGGTACTGTTCCTTCATATGTTTTGGAAGGTCTTTCGCAAGAGGATTGTTTGTCTCTGTTTGTGAAATGGGCATTCAAGGATGGAGAAGAAGAAAAATATCCAAATCTAGTAGAGATTGGAAAAGAAATTGTGAAAAAATGTGCTGGAGTTCCGCTGGCTGTGAGAACGGTAGGAAGTTCTCTGTTCTCAAAATTTGATTTAGATAAGTGGTTATTCGTAAGAGACCATGAGATATGGAATTTAGAACAGAAGAAAGATGATATTCTACCTGCACTAAAATTAAGCTATGATCAAATGCCATCTTATTTGAGACAATGCTTTGCTTGTTTTGCCTTGTATCCCAAAGACTATACCTTTAATGTCGTTGAAATGACTATTTTGTGGATACCCCTTGGATTAGTTCAATCCATAAATGGAAGTGAAAAGCTAGAGTATATTGCCAGAGAATATATACATGAGTTACATTCAAGATCATTGCTTCAGGATTTCAAGGACTTTGGGTACATCTGTGAGTTCAGAGTGCATGATTTGATACATGATCTTGCAATGTATGTTGCAAAAGAGGAGTTTGTAATGGTAGTATCACATACTCGAAATATATCTGATCAAGCAAAGCATTTATCAATTGTTGAAAAGGATTCTCTTGACAAAGTTTTGTTTCCCAAGTCCAAAAGTGTAAGAACTATTTTATTTCCTGTCGAAGGAGTGGGCCTTGACAATGAAACATTGTTGAATACATGGGTATCCAATTATAAATACCTGCGATATGTAGATTTTAATGATTCTTTGTTTGAGACTCTGCCTAAATCAATTGCTAAGTTGGTGCACCTGCGTGTTCTCGGTCTCAAGAATAACAGCAAAATCAAAAGACTTCCTCATTCTATTTTTAAACTCTATAACTTGCAAGTCATGATACTCAGTGGATGCACAGAGCTTGAAACATTGCCAAGAGGATTAGGCAAGATGGTCAGCCTTCAACATTTGTTTATAACCACCAAACAATCAGTTCTGTCATTGACTGAATTTATTAACCTGAAGCATCTTCAGGTTTTGGCTTTTAATCATTGTAAAAATATGAAGTTTTTATTCAGTAGGGAACAACAACTCATTTCCCTGGAAACATTGTCTTTGTATAAATGTGGGAGCCTAGATTCCTTACCACTTTACATTTTTCCAAATTTACAAACTCTAATAATTATAGACTGCAAGATGTTAAATTTGTCGTTGAACAACGAAAGCCCAATCCAAAAATTGAGGTTGAAACATTTGTTTATTAGGGATTTTCCAGGGCTTTTGACATTGCCTGGTTGGATTGAAGGTGCTGCAGAAACTTTAGAGACCTTGCTGATTTATGAACTTCCTAATCTAACGACGCTTTCTCAGTCTCTGACAACATTGACTCATCTTAAAAGGCTACATATTGTTGGTTGCCCTCAACTAATTAGTCTTCCAAGTGACATGTATCACCTCACGGCCCTTGAAGATTTGGTCATCGAAGATTGTCCTGAGTTGTGCCGAAAATTTAAGCCACAATCTGGTGAGTACTGGCCCATGATTTCTCACATCAAAAGTGTTTTTATTGGAAAGTCAAGAGATCAGGAAGAGGAATGA

Protein sequence

>MsG0780040498.01.T01

MYGMMIIKVGAVGSKIIVTTRSNSVASMMGTVPSYVLEGLSQEDCLSLFVKWAFKDGEEEKYPNLVEIGKEIVKKCAGVPLAVRTVGSSLFSKFDLDKWLFVRDHEIWNLEQKKDDILPALKLSYDQMPSYLRQCFACFALYPKDYTFNVVEMTILWIPLGLVQSINGSEKLEYIAREYIHELHSRSLLQDFKDFGYICEFRVHDLIHDLAMYVAKEEFVMVVSHTRNISDQAKHLSIVEKDSLDKVLFPKSKSVRTILFPVEGVGLDNETLLNTWVSNYKYLRYVDFNDSLFETLPKSIAKLVHLRVLGLKNNSKIKRLPHSIFKLYNLQVMILSGCTELETLPRGLGKMVSLQHLFITTKQSVLSLTEFINLKHLQVLAFNHCKNMKFLFSREQQLISLETLSLYKCGSLDSLPLYIFPNLQTLIIIDCKMLNLSLNNESPIQKLRLKHLFIRDFPGLLTLPGWIEGAAETLETLLIYELPNLTTLSQSLTTLTHLKRLHIVGCPQLISLPSDMYHLTALEDLVIEDCPELCRKFKPQSGEYWPMISHIKSVFIGKSRDQEEE*