AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene42674


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score

Find 0 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
24082 gene 2845 12040 2845 ID=MS.gene42674
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Gene Sequence

>MS.gene42674

GACTTGCTCGGAGATTGAGTGAATGCGGGTTTCCGACGAAGAGGAGAGAATCGGGTTTAGGAGTTGCGGAGAATGTGAGGAAGTGGAAGGAGTTGGCGAAGAAGAAAGAGGAACTTCTTGTTAAGAGTCGTAACCGTGTTGCTTTTGCTTGGACTTTGGTCGCGTTGTGCTGTGGTTCGCATGCTTCGCATATTTTTCATTCTATAGGGATTCACATTGCTCATGGTAATGTTCAAATCAAATATGTGATATTCGTTATTCAGCTCCAAATTTAGGATATGTTTGGATTAAATTGTTTAAACTTATCTATCTCCATAAGCACTTATGAGACAACTTGTGACATGTCCATAACCAAATGTATTTTCATAACCATTGCAGGAGAGCGTATGAAAAACAAATTAAATAGGAAATAGTTTGACTTTATTTTATTTTGCTATAGAAATTGTTATGCACAAATAAGCGCTTATGCTTAAGTGTTCAATTTAGCTGTTTCTCCAAACATTATCTTACTTGAAACACAAGTAAATACAGCAAGTTCATTTTGTAACGAAATTCGGAGACTTGAACATATCTTGCTTTTCCTTTTGTAGGACCGTTTGGGGAATTTCTTCATAATTCATATGTGAAAGGTGGTTTAGCTTTGGGTGCTCTATTGGGACCAGGAAGAGGTTAGTTTGTTTCTCTCCCTTGTTTAAATATACATCTTTGAACAACCATGTTTTTAAGTATTAATTAAAATGCATTTTGCTTCAGTTAAGGGTTTATTAATGTAGTTTCATATCTTAATAGACAAAATAACATTTATTAATGATTTTTGTTTAATACCATTTTAATTACTTCTATAAAAATGAAATTTTATATATTAAAAGTTGTTATTTTTGGTTTTTTAGGGGATTAGTTAGCAAAACAACGTCTTTAAAGTATTAATGTATTTAAAAATTTGAAGAAATTTTAGTTTCGGAGTGTAGTCTTGCCCGAACTGGGATATATTCCTTAATAATTTGAGCTAACCACAGTGTTACAATTTTTTGACCGCACTAAACTCGCGGAAATGTTGCAGATTTACTCTTTGATGGCCTACTTGCTTGTAAGAAAGGATCGCCAAATATGAACTCTCTCGTGGGATTTGGTTCAATAGCTGCTTTCATCAGCTCGCGTGAGATTCTATGTGGGATTTGAGTGTTACAATAAGTTACAAGACACTGAAATTTCGGTTTTTTTTTTTTATTTTTATGTGTTGTTATTCGAACTTCATCTGTGTATAGATCTCACTACTTAACCCCGAGCTGGCATGGGATGCATCATTCTTTGATGAACCGGTGACTTTCTTTACTTTCAAATGTCTCATTATTTTCCATTCGAGAATTTGCTTTTTTAAGTCAAGCAAGAGCAAACTACTTCTCAACTTGGCTAGGGATTTTGTCTGTTTAGATATAATAACCATTAACTTCACCATCTTTACTGCCATTTCAAATATTCATGTTGATAACAAGCTCCTCTATAAGGATTTTGTCTGTTAGCATGCAGGTCATGCTTCTTGGTTTCGTGCTTCTAGGACGTTCTCTAGAAGAAAAGGCTAGGATTCAGGCATCTAGTGATATGAATGAACTTCTTGTAAGTAGCAATGCGGTTCATCTCTTTCGTTTGGTAATATTTCAGGAAATAAGTTTTCAAAAAAATCGTTGCCTTTTATGTATTCTTAGTCTTCTTAGAACATTTTTTAATCTTCTTCCATCTTTTGGCATCCTTATTTTAATAGAAAAGTCTATTTATTGAATATCATAATTGATCTCTTTTCCTAAAAAATATCCCTGTTTCGACTTCTATACCTGATCGTTTGTGATCTGGAACCAATTTTGTGTTTACAAGAACAAATTGTTGCACATTTCGTAGGCACAGTTTGATAGTACATCATTAGGCTGGTTGATGAGACTTGAGTCTTTGGAAGGCTAACTGCTCCAACAATGTTGGGATAAACTGTTGTTCTAATAAGACACTCCCTTTTGATGATTATACGACCTTTGGAAGTCGCAGCATAAATAAGAGATTGTGATGGTGTTCCATTTAAAAAAATTCAATCTCATTTCAACTTTCATTTCTTCCATTTTCTGATAAATCGTTATTTCTCAGAAAATCTTGTAACCCAAGAACTGGAATATTGGTTAAAGGAAAAAAAAAAGGTTTCTATGAGTATTAAGCATCATATTATGGTTTGAATTTAAAGACTAGCAGTGTGTTTTGCGGTCATATTTTATAAGTTGGTTTAATTATTTTGTCTTGCATGAATTTGCTGGGGTGAATGTTTTTCCAGTCGCTAATATCTACTCAGTCAAGACTTGTCATTACATCATCAGAAGGTTCCCCATCTACTGACAGTGTGCTTAGCTCAGACGCATTTGTGTGGAAGTTCCAACTGATGATATTCGAGTAGGAGACTCGGTGTTGGTGTTGCCTGGAGAAACTATCCCTATAGATGTGAGCCTTTCAGACTGTTGGTGAAACTCTGTTTATGTTAATTTATTTAAAGCTATATGTGTGGTACCTGAAATAAGGTTTAAACTTTAAATGCATCTGAAGTACCTACAGTGGGCTCAATCTTCCACCAGTGACCTGTAATATTAGCATTGCCTTAGAAAACTGTAATGCAAACATTTAACTTTGAACATGAGGCATCCCATCATGATTTAAGATGGAATAAATGATGAATCTTGTTGGTTCACACGGTATTGCTTGCTAACATTATAAACTTCTGGACAGGGAAGGGTCATTGCAGGAAGAAGCGTTGTGGACGAATCCATGCTTACAGGAGAATCACTTCCTGTTTTTAAGGAGGAAGGCCTTACAGTTTCAGCAGGAACTATAAACTGGGTAAGACCTTTGAAACCAATATTGAATTTTATGCTGTCTCACTAAATTTACAGGTGGTGCACATCTGACATTTTGGTTTTTGTCCTTTGACTGGGAAGGCAATCATTAATCTATTTCATTTGCCAACAATTTCTATGTCAGGATGGTCCTTTAAGGATTGAATCTTCTTCGACTGGCTCCAACACAATGATATCCAAGATTGTACGCATGGTTAGTATCTCTGTAATGGCCTAGCAACCAACCGTAAATTAAGAAGGCTGGCAACAAGAGAAATAAGGATGGAACCAAGAAATCAGCTTATCCCAAGTTAGTTAGGACTTGTTAGTTAAAAGCAGACCTTTAAAGCTATTAGAGTAGTTAATTAGTTAGGTTGTTATAAATAGAGGCCTGGAGGTAGATGGAGGCATGATGGCCTTTTTGGAAATAGGTTGCCATTTACCACCCTTCCAAACTGCAGCAGTGTGAATACCAATGGCCACTCAACAAATAAGTAACAAAGGAGGTCCTCGAAATAGAGGTTGGAAGCGCCAATTCAAATACACACTTAGTTGGTCAGTCAGTTTAGGGTGGGAGAGACCAGTCTCTCCAATTTCCGGGGAAGAAATCATTGTATTTAATCTCGCTCTCCCTAACTTTGGGATACCCCTGGTCCATTGTTAGAGAAGGATATTCAAATAGATTTCCTAATCTTCATTATGTTGATCTCTATGTCCTCAACCAACATTTTTCAGGATTGTGATGATTATGTTGATATTTTGAGACATGAAAATCAAACATTTGTAGAGAGTTTCTACAATATTACAGCTTTATCTGGTGAAATATAGGTCGAGGATGCTCAATCGCGTGAAGCACCTGTACAAAGGCTTGCAGATTCAATAGCAGGGCCATTTGTATTTAGCATAATGACTCTGTCAGCAGCAACATTTGCATTTTGGTAAGCACTTATATTTACTACAAATTCTTTTAGCTGATCTGGTTATGATTTTGAAGTTGGTCCCAAATGCTGTTGCTTATTTGATATACCCCTAACTAATACTAATTTACTATGACATTATTGATGTAATCCAACTTACGTAGCCCCGCCACTTGAAAAGACAATGAGCTGTGTTCCATGCCTATGTTAGTGGCCAAGCTTCTAGATTCTTGCTGGAATTTATGATTATAATTTTCCCAAGTAGAAAAGTAGAAGATTTACTTGGAAGAAAAAGGATGAAATCTGATTATTATTTCTAATTATTGAAGAAGTACAAATAACAGTTACAATTTTGAGGACGATAAATTTTATTAACTATTCTAGAAGTATGCAAATAAAATCTATCTTAAAACCATAAAATTAAGAAACACAGTTTTGTACATATAACAAGGAAATAAGGAAACGGTACAAATTAATGAGAGAAAACCATGGAAAGAAAATCAGGTAATAATACAATATTTTTCCTCAAGTTGGTCGATGGATATCTTTCATTCCCATCTTACCAATAAGATCTCAAGTTGTTTTTAGGGAAGACCCTTAGTTAAATACATCTGCCAACTAACATATACAAGAACATTTTCCAGGTTGCTATCAAAGAACTTGGAGGAATTAGGTGTTCATTGATAATATTAATTATTATTATTGAATTATAAAATATGCCGCGAAACAAAAAAATTAAAATAAGGAAATAAGGAAACTGTACAAATCAATGAGAAAATCAAGTAATAAAGCAGGCATCGTGGATGGTTCATCTTACCTATTAACGTTAACAAACTTATTGCATTCGTCTCTAGGTATTTTGCTGGAACACACATATTTCCTGATGTTTTGCTCAATGATATTGCGGGCCCAGAAGGAGATCCTCTGCTTTTGAGTTTAAAACTCTCTGTAGATGTTTTGGTAAGTAATTCTAAACTTGGATCCCCTGACTTGTTTTTTGTGCTTCAAGTTTGTGATTAATACTACATGGGTGTGTCTTTCCTTTCCCATTTCTTGAGCATGGAGCACTCCTATTTTACTGGATTTCAGCTTCTGTTGTTGTTCCGGACATGCTGGACAAAACCTTGGCATACCCTTTATCTTAGAAATCTTGAGCTAATGCAAACAGTATCAATTTGGACTTTCAAATCAGCAAAATCTCAGATATTGTGATATAAGT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Protein sequence

>MS.gene42674.t1

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