AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029555.01


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MsG0580029555.01.T01 AT2G26290 53.443 305 136 3 52 355 70 369 2.20e-117 348
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MsG0580029555.01.T01 AT3G09830 42.857 357 189 5 13 359 22 373 1.37e-93 287
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MsG0580029555.01.T01 AT2G18470 39.937 318 174 5 57 370 271 575 3.60e-71 235
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MsG0580029555.01.T01 AT1G09440 41.000 300 159 7 58 353 145 430 1.63e-69 227
MsG0580029555.01.T01 AT1G70450 41.528 301 159 5 58 353 37 325 1.85e-69 224
MsG0580029555.01.T01 AT4G34500 40.635 315 165 8 56 365 131 428 2.39e-69 226
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MsG0580029555.01.T01 AT1G51830 37.356 348 194 9 17 359 343 671 1.95e-63 216
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MsG0580029555.01.T01 AT4G00340 38.801 317 170 9 46 353 460 761 2.44e-59 207
MsG0580029555.01.T01 AT4G33430 38.487 304 170 7 55 353 274 565 2.57e-59 203
MsG0580029555.01.T01 AT4G11530 36.508 315 175 6 58 364 340 637 3.34e-59 204
MsG0580029555.01.T01 AT1G51870 39.490 314 169 6 40 351 557 851 3.45e-59 207
MsG0580029555.01.T01 AT1G51880 38.585 311 172 6 43 351 559 852 3.84e-59 207
MsG0580029555.01.T01 AT1G51880 38.585 311 172 6 43 351 541 834 4.05e-59 207
MsG0580029555.01.T01 AT4G23240 38.854 314 169 8 58 364 323 620 4.35e-59 204
MsG0580029555.01.T01 AT1G51880 38.585 311 172 6 43 351 567 860 4.45e-59 207
MsG0580029555.01.T01 AT5G01560 38.926 298 162 6 58 351 351 632 4.50e-59 204
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MsG0580029555.01.T01 AT1G29730 44.672 244 116 6 57 295 627 856 3.63e-56 199
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MsG0580029555.01.T01 AT4G29990 38.796 299 164 6 56 352 562 843 3.81e-56 198
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MsG0580029555.01.T01 AT1G53730 36.789 299 169 6 51 344 397 680 5.03e-56 196
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MsG0580029555.01.T01 AT4G11900 36.859 312 176 7 58 364 456 751 5.94e-56 197
MsG0580029555.01.T01 AT2G47060 45.532 235 118 6 128 354 2 234 7.49e-56 184
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MsG0580029555.01.T01 AT1G61420 37.574 338 182 11 33 361 457 774 7.60e-56 197
MsG0580029555.01.T01 AT1G11300 36.119 335 191 6 48 380 472 785 7.79e-56 197
MsG0580029555.01.T01 AT1G07550 37.338 308 172 8 56 360 548 837 7.99e-56 197
MsG0580029555.01.T01 AT2G01950 37.994 329 169 10 50 357 818 1132 8.51e-56 198
MsG0580029555.01.T01 AT1G11300 36.119 335 191 6 48 380 487 800 1.01e-55 197
MsG0580029555.01.T01 AT4G23220 36.336 333 175 11 45 364 313 621 1.01e-55 194
MsG0580029555.01.T01 AT5G01550 38.176 296 164 7 60 351 369 649 1.14e-55 195
MsG0580029555.01.T01 AT4G23310 36.422 313 178 8 58 364 456 753 1.14e-55 196
MsG0580029555.01.T01 AT4G11900 36.859 312 176 7 58 364 525 820 1.17e-55 197
MsG0580029555.01.T01 AT1G61490 36.970 330 186 9 41 364 310 623 1.36e-55 194
MsG0580029555.01.T01 AT4G23190 35.030 334 192 8 37 364 245 559 1.49e-55 193
MsG0580029555.01.T01 AT4G23190 35.030 334 192 8 37 364 245 559 1.49e-55 193
MsG0580029555.01.T01 AT4G23310 36.422 313 178 8 58 364 496 793 1.53e-55 196
MsG0580029555.01.T01 AT1G61420 37.500 336 181 11 35 361 457 772 1.69e-55 196
MsG0580029555.01.T01 AT5G11410 41.667 228 130 2 124 351 14 238 1.78e-55 183
MsG0580029555.01.T01 AT1G70110 37.248 298 174 5 58 354 332 617 1.87e-55 194
MsG0580029555.01.T01 AT4G11490 33.634 333 197 7 36 364 294 606 2.35e-55 193
MsG0580029555.01.T01 AT4G23130 40.530 264 133 6 18 278 302 544 2.44e-55 192
MsG0580029555.01.T01 AT1G70530 45.982 224 108 4 57 278 310 522 3.18e-55 191
MsG0580029555.01.T01 AT4G21400 37.725 334 178 11 41 364 323 636 3.33e-55 193
MsG0580029555.01.T01 AT2G25220 44.487 263 125 7 55 312 82 328 4.38e-55 187
MsG0580029555.01.T01 AT5G60320 39.865 296 155 9 58 348 336 613 4.58e-55 193
MsG0580029555.01.T01 AT4G21400 38.413 315 167 10 60 364 351 648 5.93e-55 193
MsG0580029555.01.T01 AT3G45860 34.242 330 192 8 43 364 325 637 7.12e-55 192
MsG0580029555.01.T01 AT2G25220 44.487 263 125 7 55 312 131 377 7.18e-55 187
MsG0580029555.01.T01 AT1G61490 36.970 330 186 9 41 364 434 747 7.51e-55 194
MsG0580029555.01.T01 AT1G61490 36.970 330 186 9 41 364 434 747 7.51e-55 194
MsG0580029555.01.T01 AT2G13790 36.842 304 175 7 55 353 279 570 7.68e-55 191
MsG0580029555.01.T01 AT4G23190 35.030 334 192 8 37 364 323 637 7.75e-55 192
MsG0580029555.01.T01 AT1G61400 36.624 314 180 7 55 364 485 783 8.50e-55 194
MsG0580029555.01.T01 AT3G59700 37.500 296 171 6 58 351 326 609 9.60e-55 192
MsG0580029555.01.T01 AT1G61490 36.970 330 186 9 41 364 460 773 1.03e-54 194
MsG0580029555.01.T01 AT1G61490 36.970 330 186 9 41 364 460 773 1.03e-54 194
MsG0580029555.01.T01 AT1G61490 36.970 330 186 9 41 364 460 773 1.03e-54 194
MsG0580029555.01.T01 AT1G61490 36.970 330 186 9 41 364 460 773 1.03e-54 194
MsG0580029555.01.T01 AT4G21410 37.855 317 166 10 60 364 222 519 1.18e-54 190
MsG0580029555.01.T01 AT1G21230 37.954 303 173 6 54 354 392 681 1.26e-54 192
MsG0580029555.01.T01 AT5G59670 38.387 310 172 7 53 359 549 842 1.50e-54 194
MsG0580029555.01.T01 AT5G59670 38.387 310 172 7 53 359 549 842 1.50e-54 194
MsG0580029555.01.T01 AT1G61500 37.538 333 182 10 40 364 442 756 1.71e-54 193
MsG0580029555.01.T01 AT1G61440 35.583 326 189 8 55 375 468 777 2.10e-54 193
MsG0580029555.01.T01 AT1G61440 35.583 326 189 8 55 375 463 772 2.20e-54 192
MsG0580029555.01.T01 AT1G61500 37.538 333 182 10 40 364 465 779 2.21e-54 193
MsG0580029555.01.T01 AT1G61500 37.538 333 182 10 40 364 460 774 2.59e-54 192
MsG0580029555.01.T01 AT1G11303 36.709 316 175 6 53 364 492 786 2.69e-54 192
MsG0580029555.01.T01 AT3G15890 34.783 299 180 5 56 351 25 311 3.44e-54 184
MsG0580029555.01.T01 AT4G00970 34.921 315 172 10 60 362 334 627 3.58e-54 191

Find 100 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 189 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTGTGGCCTTGAAAACTTTC+TGG 0.085917 5:-98499948 None:intergenic
TTCTGGTTTAAGCTTCTTAA+TGG 0.182611 5:-98499931 None:intergenic
GATTCCTCAACAAGTTTATT+TGG 0.193706 5:+98498889 MsG0580029555.01.T01:CDS
CCAACTTCACCATGAAAATT+TGG 0.205973 5:+98500096 MsG0580029555.01.T01:CDS
TGATTATCAGTTCCGGATTT+TGG 0.213306 5:-98501165 None:intergenic
TGTTATATATCGTGATTTAA+AGG 0.230929 5:+98500447 MsG0580029555.01.T01:CDS
AATGCAAATCTTTCTGATTT+CGG 0.244091 5:+98500581 MsG0580029555.01.T01:CDS
CATGTTTCAACTAGAATTAT+TGG 0.264174 5:+98500638 MsG0580029555.01.T01:CDS
ATCCGTGTCATCCAGGAAAT+TGG 0.266417 5:-98500367 None:intergenic
CATCACTCCTCAGTGTTAAA+TGG 0.278573 5:-98500840 None:intergenic
TTAATCGGGGAAGGAGGGTT+TGG 0.302794 5:+98499837 MsG0580029555.01.T01:CDS
GAAAAGAACAAACCACAAAT+TGG 0.305274 5:-98501338 None:intergenic
ACCATGGTTGGTCTATGTTT+AGG 0.327485 5:-98501087 None:intergenic
TGATTATCAGTTCCAGATTT+CGG 0.329059 5:-98501207 None:intergenic
GCTGAAGGACTTAACATCTT+TGG 0.341482 5:-98499769 None:intergenic
ATGTTTCAACTAGAATTATT+GGG 0.344666 5:+98500639 MsG0580029555.01.T01:CDS
GCTACTACAATTCCATTTCC+TGG 0.347415 5:-98499909 None:intergenic
TTCCGGCAAGAAAATTTAAT+CGG 0.353548 5:+98499822 MsG0580029555.01.T01:CDS
TGCTTATGCATTCCAATTTG+TGG 0.361138 5:+98501326 MsG0580029555.01.T01:three_prime_UTR
GAAAATTTGGTGAAGCTCAT+TGG 0.364442 5:+98500109 MsG0580029555.01.T01:CDS
CAGGCAGAAGTCAATTATCT+AGG 0.382648 5:+98500073 MsG0580029555.01.T01:intron
TTTATTACTTACTTCTGAAC+AGG 0.387082 5:-98500201 None:intergenic
AGGAGGCAGCTAGGAACTTC+CGG 0.387922 5:+98499805 MsG0580029555.01.T01:CDS
AAGGTGTTCAACCAATTTCC+TGG 0.388322 5:+98500356 MsG0580029555.01.T01:CDS
GTCCCTAGGACACCGAAATC+TGG 0.392896 5:+98501195 MsG0580029555.01.T01:CDS
TGTGTTATGATTATCAGTTC+CGG 0.399096 5:-98501172 None:intergenic
GTTCCAGATTTCGGTGTCCT+AGG 0.419321 5:-98501198 None:intergenic
GTTGAGGAATCATGACAAAC+TGG 0.423104 5:-98498877 None:intergenic
GTCTTGTTAGAGTTACTAAC+AGG 0.428777 5:+98500880 MsG0580029555.01.T01:CDS
TATAAATTAAATGAATATAA+TGG 0.439189 5:-98501464 None:intergenic
TTCCAACATCCTACTTGATT+CGG 0.443972 5:+98500471 MsG0580029555.01.T01:CDS
GTTTATGCAGAAAGGAAGTC+TGG 0.444490 5:+98500171 MsG0580029555.01.T01:CDS
GCTCCTACAAAACCAGGAAA+TGG 0.444780 5:+98499897 MsG0580029555.01.T01:CDS
CTTCAGCTTCAATGATCTAA+AGG 0.446745 5:+98499785 MsG0580029555.01.T01:CDS
AGGAGTGATGTATACAGTTT+CGG 0.447573 5:+98500853 MsG0580029555.01.T01:CDS
CAGAAGAATATTGAGAATCA+TGG 0.452998 5:+98500984 MsG0580029555.01.T01:CDS
AGAATCATGGATACAAAGTT+AGG 0.453790 5:+98500997 MsG0580029555.01.T01:CDS
TCCGGCAAGAAAATTTAATC+GGG 0.460948 5:+98499823 MsG0580029555.01.T01:CDS
TTTCCTTGGGAATGAATTTG+AGG 0.467199 5:-98501142 None:intergenic
CGGAAGAAACATTGGTCGAT+TGG 0.478033 5:+98500938 MsG0580029555.01.T01:CDS
AAAGAATAACACTTTCATCA+TGG 0.478800 5:+98498837 MsG0580029555.01.T01:exon
GGAAGAAACATTGGTCGATT+GGG 0.484735 5:+98500939 MsG0580029555.01.T01:CDS
ACTAGAATTATTGGGACTCA+TGG 0.490900 5:+98500647 MsG0580029555.01.T01:CDS
TTCCAGATTTCGGTGTCCTA+GGG 0.499546 5:-98501197 None:intergenic
AAATCTTTCTGATTTCGGCT+TGG 0.503939 5:+98500586 MsG0580029555.01.T01:CDS
GACTCATGGTTATGCCGCCC+CGG 0.504365 5:+98500661 MsG0580029555.01.T01:CDS
TTGGATTCGTCTACAAAGGA+TGG 0.505113 5:+98499856 MsG0580029555.01.T01:CDS
GTACCTGTGGCTACATACTC+CGG 0.506121 5:-98500680 None:intergenic
TTAGCTGTCTTAGACAGCTA+TGG 0.507827 5:+98501411 MsG0580029555.01.T01:three_prime_UTR
AGAACATGAAATTGTTCACT+TGG 0.512998 5:-98501370 None:intergenic
TTCCCAAGGAAACCAAAATC+CGG 0.513233 5:+98501153 MsG0580029555.01.T01:CDS
TACCTGTGGCTACATACTCC+GGG 0.514262 5:-98500679 None:intergenic
AAGAATAACACTTTCATCAT+GGG 0.516291 5:+98498838 MsG0580029555.01.T01:exon
TTGGCAAGAGATGGTCCAAC+GGG 0.517158 5:+98500605 MsG0580029555.01.T01:CDS
AATATTGATCCGTGTCATCC+AGG 0.517596 5:-98500374 None:intergenic
GTTTATGAGTTTATGCAGAA+AGG 0.518452 5:+98500163 MsG0580029555.01.T01:CDS
ATATATAACATTTGCGTCAA+GGG 0.518964 5:-98500434 None:intergenic
CTCATTGGTTACTGTTCAGA+AGG 0.520085 5:+98500124 MsG0580029555.01.T01:CDS
GCTAGAACATTTACCATGGT+TGG 0.526353 5:-98501099 None:intergenic
GGTAAATGTTCTAGCCGCAT+TGG 0.527575 5:+98501107 MsG0580029555.01.T01:CDS
TACCGAATCAAGTAGGATGT+TGG 0.529085 5:-98500473 None:intergenic
AAAATTTAATCGGGGAAGGA+GGG 0.532191 5:+98499832 MsG0580029555.01.T01:CDS
GAAAATTTAATCGGGGAAGG+AGG 0.532647 5:+98499831 MsG0580029555.01.T01:CDS
GGCGGTCAATACTCAAAGAA+AGG 0.538836 5:+98501018 MsG0580029555.01.T01:CDS
ATGATCTAAAGGAGGCAGCT+AGG 0.551009 5:+98499796 MsG0580029555.01.T01:CDS
CTTTAGATCATTGAAGCTGA+AGG 0.556389 5:-98499784 None:intergenic
TGTAGTCGAAGATGATAGAC+AGG 0.558413 5:+98500909 MsG0580029555.01.T01:CDS
GATTTCGGCTTGGCAAGAGA+TGG 0.559711 5:+98500596 MsG0580029555.01.T01:CDS
CTGTCTTAGACAGCTATGGA+TGG 0.568860 5:+98501415 MsG0580029555.01.T01:three_prime_UTR
GATATATAACATTTGCGTCA+AGG 0.576579 5:-98500435 None:intergenic
GCCCCGGAGTATGTAGCCAC+AGG 0.577351 5:+98500677 MsG0580029555.01.T01:CDS
ATATTCTTCTGCTGTCACTC+AGG 0.583401 5:-98500972 None:intergenic
CTGACCAAATAAACTTGTTG+AGG 0.583594 5:-98498893 None:intergenic
CACATACAAGCCATTCCTTG+TGG 0.584440 5:-98499965 None:intergenic
ACTCCTCAAATTCATTCCCA+AGG 0.584655 5:+98501139 MsG0580029555.01.T01:CDS
AACCAATTTCCTGGATGACA+CGG 0.585762 5:+98500365 MsG0580029555.01.T01:CDS
CAAGAAAATTTAATCGGGGA+AGG 0.591971 5:+98499828 MsG0580029555.01.T01:CDS
GGGTTTGGATTCGTCTACAA+AGG 0.592727 5:+98499852 MsG0580029555.01.T01:CDS
GGTATACACGGAAGAAACAT+TGG 0.599178 5:+98500930 MsG0580029555.01.T01:CDS
CTTCTGCTGTCACTCAGGAA+AGG 0.607494 5:-98500967 None:intergenic
ATGATGATGACTAGAATGCT+TGG 0.612748 5:-98501238 None:intergenic
ACATGAGTGTTATCTCCCGT+TGG 0.617847 5:-98500620 None:intergenic
ACTGGTGCTCCTACAAAACC+AGG 0.627345 5:+98499891 MsG0580029555.01.T01:CDS
CTTGGCAAGAGATGGTCCAA+CGG 0.629271 5:+98500604 MsG0580029555.01.T01:CDS
ATAATCATAACACAGTCCCT+AGG 0.630222 5:+98501181 MsG0580029555.01.T01:CDS
ACACGGATCAATATTGCGAT+CGG 0.634793 5:+98500382 MsG0580029555.01.T01:CDS
ATTGCGATCGGTGTAGCAAG+AGG 0.635731 5:+98500394 MsG0580029555.01.T01:CDS
TCCTAAACATAGACCAACCA+TGG 0.642044 5:+98501086 MsG0580029555.01.T01:CDS
TGTAACATACCGAATCAAGT+AGG 0.645038 5:-98500480 None:intergenic
CAGCTTCAATGATCTAAAGG+AGG 0.652971 5:+98499788 MsG0580029555.01.T01:CDS
CCGGCAAGAAAATTTAATCG+GGG 0.667440 5:+98499824 MsG0580029555.01.T01:CDS
TGTTAGAGTTACTAACAGGA+CGG 0.671165 5:+98500884 MsG0580029555.01.T01:CDS
TGCGGCTAGAACATTTACCA+TGG 0.681536 5:-98501103 None:intergenic
GGATGGATAGATGAGAACAC+TGG 0.688471 5:+98499873 MsG0580029555.01.T01:CDS
ATCATGGATACAAAGTTAGG+CGG 0.688883 5:+98501000 MsG0580029555.01.T01:CDS
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ACCTGTGGCTACATACTCCG+GGG 0.710250 5:-98500678 None:intergenic
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GGAGTGTAATGCTTCCAATG+CGG 0.756713 5:-98501121 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! TAAATTTGAAACTTAAATCA+TGG - Chr5:98499275-98499294 None:intergenic 15.0%
!!! TAAATTTGGTTGATAAAAAA+TGG + Chr5:98499181-98499200 MsG0580029555.01.T01:intron 15.0%
!!! TACATTTTTTAATTATGTTG+AGG + Chr5:98500727-98500746 MsG0580029555.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTTTTCTAATTGGTAT+TGG + Chr5:98500009-98500028 MsG0580029555.01.T01:intron 15.0%
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!!! CTTTACTTTTAGTGTCATTA+AGG + Chr5:98499019-98499038 MsG0580029555.01.T01:intron 25.0%
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TGTGTTATGATTATCAGTTC+CGG - Chr5:98501175-98501194 None:intergenic 30.0%
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!! AAGTTTTCGAATCGGTTTTT+TGG - Chr5:98499722-98499741 None:intergenic 30.0%
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!! TTCTGGTTTAAGCTTCTTAA+TGG - Chr5:98499934-98499953 None:intergenic 30.0%
!!! TTCTACTGTTTTTTGTTTGC+AGG + Chr5:98500054-98500073 MsG0580029555.01.T01:intron 30.0%
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AAGCTTAGAGTTTGAATTGG+AGG - Chr5:98499352-98499371 None:intergenic 35.0%
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AGATGATAGACAGGTATACA+CGG + Chr5:98500918-98500937 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
AGGAAGCTTAGAGTTTGAAT+TGG - Chr5:98499355-98499374 None:intergenic 35.0%
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ATCATGGATACAAAGTTAGG+CGG + Chr5:98501000-98501019 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
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CAAGAAAATTTAATCGGGGA+AGG + Chr5:98499828-98499847 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
CCAACTTCACCATGAAAATT+TGG + Chr5:98500096-98500115 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
CTTACATTTCATCTACTCAC+AGG + Chr5:98499648-98499667 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
CTTCAGCTTCAATGATCTAA+AGG + Chr5:98499785-98499804 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
CTTTAGATCATTGAAGCTGA+AGG - Chr5:98499787-98499806 None:intergenic 35.0%
GAATTGGATAGTCTAATGGT+TGG + Chr5:98499521-98499540 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
GCGAAAAAGAAAGAAGAAAG+CGG - Chr5:98499600-98499619 None:intergenic 35.0%
GGTAGCTTGAACATAGATAT+AGG - Chr5:98499375-98499394 None:intergenic 35.0%
GGTATGTTACACTGAAAACT+TGG + Chr5:98500492-98500511 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
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TACACTGAAAACTTGGCTAT+TGG + Chr5:98500499-98500518 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
TACATCACTTGTTTCCTCTT+TGG + Chr5:98498941-98498960 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
TCAGTTATGAACCTGAATCA+TGG - Chr5:98499226-98499245 None:intergenic 35.0%
TCCGGCAAGAAAATTTAATC+GGG + Chr5:98499823-98499842 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
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TTAGTTCAATCAGTTAAGCC+GGG + Chr5:98499499-98499518 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
TTCCAACATCCTACTTGATT+CGG + Chr5:98500471-98500490 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
TTTCCTTGGGAATGAATTTG+AGG - Chr5:98501145-98501164 None:intergenic 35.0%
! ATGATGATGACTAGAATGCT+TGG - Chr5:98501241-98501260 None:intergenic 35.0%
! CCAAATTTTCATGGTGAAGT+TGG - Chr5:98500099-98500118 None:intergenic 35.0%
! CTTCTTTTGACCAAACAAAC+AGG + Chr5:98500817-98500836 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
! GAAAATTTGGTGAAGCTCAT+TGG + Chr5:98500109-98500128 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
! GTCTTGTTAGAGTTACTAAC+AGG + Chr5:98500880-98500899 MsG0580029555.01.T01:CDS 35.0%
! TATGACAGTGTTGTTAGAAC+CGG + Chr5:98499471-98499490 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
! TCATAGAAAGCCAAGGATTT+TGG - Chr5:98499144-98499163 None:intergenic 35.0%
! TGAGCTTCACCAAATTTTCA+TGG - Chr5:98500108-98500127 None:intergenic 35.0%
! TGATTATCAGTTCCGGATTT+TGG - Chr5:98501168-98501187 None:intergenic 35.0%
!! CTGACCAAATAAACTTGTTG+AGG - Chr5:98498896-98498915 None:intergenic 35.0%
!! TTCTAGTGGCTGTTTGTTTT+TGG + Chr5:98499624-98499643 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTCCATTTCCTGGTTTTGT+AGG - Chr5:98499903-98499922 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTTTCCTGTTTCTGCAGA+AGG + Chr5:98500337-98500356 MsG0580029555.01.T01:intron 35.0%
AAACAGGCCATTTAACACTG+AGG + Chr5:98500833-98500852 MsG0580029555.01.T01:intron 40.0%
AACACTTAGTGTCACCAAAG+AGG - Chr5:98498958-98498977 None:intergenic 40.0%
AACCAATTTCCTGGATGACA+CGG + Chr5:98500365-98500384 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
AATATTGATCCGTGTCATCC+AGG - Chr5:98500377-98500396 None:intergenic 40.0%
AATCAACGACAGTTGAACTG+CGG - Chr5:98499573-98499592 None:intergenic 40.0%
ACACGGATCAATATTGCGAT+CGG + Chr5:98500382-98500401 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
ACTCCTCAAATTCATTCCCA+AGG + Chr5:98501139-98501158 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
AGAAGGTAAAAACAGGCTTC+TGG + Chr5:98500141-98500160 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
AGATGAGACATAGGTTCTTC+TGG + Chr5:98500302-98500321 MsG0580029555.01.T01:intron 40.0%
ATATTCTTCTGCTGTCACTC+AGG - Chr5:98500975-98500994 None:intergenic 40.0%
CAGCTTCAATGATCTAAAGG+AGG + Chr5:98499788-98499807 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
CAGGCAGAAGTCAATTATCT+AGG + Chr5:98500073-98500092 MsG0580029555.01.T01:intron 40.0%
CATCACTCCTCAGTGTTAAA+TGG - Chr5:98500843-98500862 None:intergenic 40.0%
CCATTAGACTATCCAATTCC+CGG - Chr5:98499520-98499539 None:intergenic 40.0%
CCGGCAAGAAAATTTAATCG+GGG + Chr5:98499824-98499843 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
CTCATCACATTTAGAAAGCG+TGG - Chr5:98500768-98500787 None:intergenic 40.0%
GAAAATTTAATCGGGGAAGG+AGG + Chr5:98499831-98499850 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
GAAGAACCTATGTCTCATCT+CGG - Chr5:98500302-98500321 None:intergenic 40.0%
GCTACTACAATTCCATTTCC+TGG - Chr5:98499912-98499931 None:intergenic 40.0%
GCTAGAACATTTACCATGGT+TGG - Chr5:98501102-98501121 None:intergenic 40.0%
GCTGAAGGACTTAACATCTT+TGG - Chr5:98499772-98499791 None:intergenic 40.0%
GGAAGAAACATTGGTCGATT+GGG + Chr5:98500939-98500958 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
GGTATACACGGAAGAAACAT+TGG + Chr5:98500930-98500949 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGGAATCATGACAAAC+TGG - Chr5:98498880-98498899 None:intergenic 40.0%
GTTTATGCAGAAAGGAAGTC+TGG + Chr5:98500171-98500190 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
TACCGAATCAAGTAGGATGT+TGG - Chr5:98500476-98500495 None:intergenic 40.0%
TCCTAAACATAGACCAACCA+TGG + Chr5:98501086-98501105 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGTCGAAGATGATAGAC+AGG + Chr5:98500909-98500928 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
TTAGCTGTCTTAGACAGCTA+TGG + Chr5:98501411-98501430 MsG0580029555.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TTCCCAAGGAAACCAAAATC+CGG + Chr5:98501153-98501172 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
TTGGATTCGTCTACAAAGGA+TGG + Chr5:98499856-98499875 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGTGTTCAACCAATTTCC+TGG + Chr5:98500356-98500375 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
! CCCCGATTAAATTTTCTTGC+CGG - Chr5:98499827-98499846 None:intergenic 40.0%
! CTCATTGGTTACTGTTCAGA+AGG + Chr5:98500124-98500143 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
! GAGATGCTTTTCTACTTGTG+TGG + Chr5:98501298-98501317 MsG0580029555.01.T01:exon 40.0%
! TTGTGGCCTTGAAAACTTTC+TGG - Chr5:98499951-98499970 None:intergenic 40.0%
!! ACCATGGTTGGTCTATGTTT+AGG - Chr5:98501090-98501109 None:intergenic 40.0%
!! AGAAAGTTTTCAAGGCCACA+AGG + Chr5:98499950-98499969 MsG0580029555.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGTGTTGTGTACTTTTCTC+AGG + Chr5:98498797-98498816 MsG0580029555.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
!!! TTCCGGATTTTGGTTTCCTT+GGG - Chr5:98501158-98501177 None:intergenic 40.0%
!!! TTCGAATCGGTTTTTTGGTC+AGG - Chr5:98499717-98499736 None:intergenic 40.0%
ACATGAGTGTTATCTCCCGT+TGG - Chr5:98500623-98500642 None:intergenic 45.0%
ACTGATTGAACTAACCCGTC+CGG - Chr5:98499493-98499512 None:intergenic 45.0%
AGGCTTCTTTGCCATGATTC+AGG + Chr5:98499212-98499231 MsG0580029555.01.T01:intron 45.0%
AGTTGAACTGCGGTTCAAAC+CGG - Chr5:98499563-98499582 None:intergenic 45.0%
ATCCGTGTCATCCAGGAAAT+TGG - Chr5:98500370-98500389 None:intergenic 45.0%
ATGATCTAAAGGAGGCAGCT+AGG + Chr5:98499796-98499815 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
CAATCAGTTAAGCCGGGAAT+TGG + Chr5:98499505-98499524 MsG0580029555.01.T01:intron 45.0%
CACATACAAGCCATTCCTTG+TGG - Chr5:98499968-98499987 None:intergenic 45.0%
CCGGGAATTGGATAGTCTAA+TGG + Chr5:98499517-98499536 MsG0580029555.01.T01:intron 45.0%
CGGAAGAAACATTGGTCGAT+TGG + Chr5:98500938-98500957 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCTTAGACAGCTATGGA+TGG + Chr5:98501415-98501434 MsG0580029555.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GCTCCTACAAAACCAGGAAA+TGG + Chr5:98499897-98499916 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTGTAATGCTTCCAATG+CGG - Chr5:98501124-98501143 None:intergenic 45.0%
GGATGGATAGATGAGAACAC+TGG + Chr5:98499873-98499892 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
GGCGGTCAATACTCAAAGAA+AGG + Chr5:98501018-98501037 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
GGGTTTGGATTCGTCTACAA+AGG + Chr5:98499852-98499871 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
GGTAAATGTTCTAGCCGCAT+TGG + Chr5:98501107-98501126 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
TGAACACCTTCTGCAGAAAC+AGG - Chr5:98500346-98500365 None:intergenic 45.0%
TGCGGCTAGAACATTTACCA+TGG - Chr5:98501106-98501125 None:intergenic 45.0%
TTTGTGCCGAGATGAGACAT+AGG + Chr5:98500293-98500312 MsG0580029555.01.T01:intron 45.0%
! ACAGTGTTGTTAGAACCGGA+CGG + Chr5:98499475-98499494 MsG0580029555.01.T01:intron 45.0%
!! GTTTTCAAGGCCACAAGGAA+TGG + Chr5:98499955-98499974 MsG0580029555.01.T01:CDS 45.0%
!! TTCCAGATTTCGGTGTCCTA+GGG - Chr5:98501200-98501219 None:intergenic 45.0%
!!! GTTCCGGATTTTGGTTTCCT+TGG - Chr5:98501159-98501178 None:intergenic 45.0%
!! AAAACAATAATTAAAATTTA+AGG - Chr5:98499060-98499079 None:intergenic 5.0%
!! ATAATTAAAAAATGTAAAAA+TGG - Chr5:98500723-98500742 None:intergenic 5.0%
ACTGGTGCTCCTACAAAACC+AGG + Chr5:98499891-98499910 MsG0580029555.01.T01:CDS 50.0%
ATTGCGATCGGTGTAGCAAG+AGG + Chr5:98500394-98500413 MsG0580029555.01.T01:CDS 50.0%
CTTCTGCTGTCACTCAGGAA+AGG - Chr5:98500970-98500989 None:intergenic 50.0%
CTTGGCAAGAGATGGTCCAA+CGG + Chr5:98500604-98500623 MsG0580029555.01.T01:CDS 50.0%
GCCAATGGCAAATGTACCTG+TGG - Chr5:98500696-98500715 None:intergenic 50.0%
GCCACAGGTACATTTGCCAT+TGG + Chr5:98500692-98500711 MsG0580029555.01.T01:intron 50.0%
GTACCTGTGGCTACATACTC+CGG - Chr5:98500683-98500702 None:intergenic 50.0%
TACCTGTGGCTACATACTCC+GGG - Chr5:98500682-98500701 None:intergenic 50.0%
TTAATCGGGGAAGGAGGGTT+TGG + Chr5:98499837-98499856 MsG0580029555.01.T01:CDS 50.0%
TTGGCAAGAGATGGTCCAAC+GGG + Chr5:98500605-98500624 MsG0580029555.01.T01:CDS 50.0%
! CAGTGTTGTTAGAACCGGAC+GGG + Chr5:98499476-98499495 MsG0580029555.01.T01:intron 50.0%
!! GATTTCGGCTTGGCAAGAGA+TGG + Chr5:98500596-98500615 MsG0580029555.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTCCAGATTTCGGTGTCCT+AGG - Chr5:98501201-98501220 None:intergenic 50.0%
ACCTGTGGCTACATACTCCG+GGG - Chr5:98500681-98500700 None:intergenic 55.0%
AGGAGGCAGCTAGGAACTTC+CGG + Chr5:98499805-98499824 MsG0580029555.01.T01:CDS 55.0%
GTCCCTAGGACACCGAAATC+TGG + Chr5:98501195-98501214 MsG0580029555.01.T01:CDS 55.0%
! GCGGTTCAAACCGGCTCTAA+GGG - Chr5:98499554-98499573 None:intergenic 55.0%
! TGCGGTTCAAACCGGCTCTA+AGG - Chr5:98499555-98499574 None:intergenic 55.0%
!! CGGTTCAAACCGGCTCTAAG+GGG - Chr5:98499553-98499572 None:intergenic 55.0%
!! TGGTTCTAGCCCCTTAGAGC+CGG + Chr5:98499541-98499560 MsG0580029555.01.T01:intron 55.0%
GACTCATGGTTATGCCGCCC+CGG + Chr5:98500661-98500680 MsG0580029555.01.T01:CDS 60.0%
TGTGGCTACATACTCCGGGG+CGG - Chr5:98500678-98500697 None:intergenic 60.0%
GCCCCGGAGTATGTAGCCAC+AGG + Chr5:98500677-98500696 MsG0580029555.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 98498793 98501485 98498793 ID=MsG0580029555.01;Name=MsG0580029555.01
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Chr5 exon 98500356 98500492 98500356 ID=MsG0580029555.01.T01:exon:30380;Parent=MsG0580029555.01.T01
Chr5 exon 98500076 98500211 98500076 ID=MsG0580029555.01.T01:exon:30379;Parent=MsG0580029555.01.T01
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Chr5 exon 98498793 98498910 98498793 ID=MsG0580029555.01.T01:exon:30377;Parent=MsG0580029555.01.T01
Chr5 five_prime_UTR 98498793 98498855 98498793 ID=MsG0580029555.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0580029555.01.T01
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Chr5 three_prime_UTR 98501300 98501485 98501300 ID=MsG0580029555.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0580029555.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580029555.01.T01

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Protein sequence

>MsG0580029555.01.T01

MGNTCRKPVCHDSSTSLFGSTKTQSNTNQTSNSPDQKTDSKTSSSNDDKSIAKDVKSFSFNDLKEAARNFRQENLIGEGGFGFVYKGWIDENTGAPTKPGNGIVVAIKKLKPESFQGHKEWLAEVNYLGQLHHENLVKLIGYCSEGKNRLLVYEFMQKGSLENHLFRKGVQPISWMTRINIAIGVARGLAFLHSLDANVIYRDLKASNILLDSDFNANLSDFGLARDGPTGDNTHVSTRIIGTHGYAAPEYVATGHLTLRSDVYSFGVVLLELLTGRRVVEDDRQVYTEETLVDWAMPFLSDSRRILRIMDTKLGGQYSKKGAQAAAALVLKCLNTDPKHRPTMVNVLAALEALHSSNSFPRKPKSGTDNHNTVPRTPKSGTDNHHATKHSSHHHSHKSITNNTRKH*