AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480019726.01

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MsG0480019726.01.T01 AT1G67510 32.544 169 106 3 183 346 95 260 4.55e-13 73.9
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MsG0480019726.01.T01 AT2G23950 43.689 103 58 0 363 465 85 187 1.84e-15 80.9
MsG0480019726.01.T01 AT2G23950 34.266 143 80 2 196 326 86 226 7.87e-12 69.3
MsG0480019726.01.T01 AT2G23950 35.294 102 66 0 265 366 83 184 3.81e-11 67.4
MsG0480019726.01.T01 AT2G23950 40.404 99 59 0 244 342 86 184 7.55e-11 66.2
MsG0480019726.01.T01 AT1G66150 28.392 877 468 29 139 942 76 865 8.89e-65 236
MsG0480019726.01.T01 AT1G66150 26.988 415 249 12 62 439 48 445 8.79e-23 105
MsG0480019726.01.T01 AT1G66150 29.249 253 146 9 354 580 66 311 1.23e-12 72.8
MsG0480019726.01.T01 AT1G60800 32.422 512 310 12 453 943 12 508 3.91e-64 227
MsG0480019726.01.T01 AT1G60800 44.545 110 60 1 405 514 12 120 1.07e-12 72.4
MsG0480019726.01.T01 AT4G30520 33.730 504 291 13 462 943 91 573 4.40e-64 229
MsG0480019726.01.T01 AT4G30520 46.602 103 54 1 412 514 89 190 9.91e-16 82.4
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MsG0480019726.01.T01 AT4G39270 28.075 374 194 12 66 425 57 369 3.00e-23 107
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MsG0480019726.01.T01 AT5G63710 36.441 118 61 1 375 492 81 184 9.23e-12 69.3
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MsG0480019726.01.T01 AT1G69990 45.263 95 51 1 375 468 88 182 5.90e-12 70.1
MsG0480019726.01.T01 AT1G69990 34.426 122 79 1 302 422 63 184 7.07e-12 69.7
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MsG0480019726.01.T01 AT5G63710 33.974 156 92 5 22 172 37 186 1.56e-12 72.0
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MsG0480019726.01.T01 AT1G51890 31.410 468 254 12 502 942 347 774 1.75e-52 198
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MsG0480019726.01.T01 AT1G68690 37.671 292 161 6 665 943 367 650 3.60e-51 192
MsG0480019726.01.T01 AT1G10620 37.201 293 164 6 664 943 359 644 4.14e-51 192
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MsG0480019726.01.T01 AT1G71390 30.836 574 332 15 35 598 36 554 8.26e-51 192
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MsG0480019726.01.T01 AT5G27060 31.631 607 307 14 53 562 74 669 2.17e-50 193
MsG0480019726.01.T01 AT5G27060 30.041 486 231 8 185 563 116 599 1.91e-36 149
MsG0480019726.01.T01 AT5G27060 28.755 546 321 17 79 586 362 877 2.99e-28 123
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MsG0480019726.01.T01 AT1G56720 37.801 291 161 7 667 945 171 453 2.67e-50 186
MsG0480019726.01.T01 AT1G56720 37.801 291 161 7 667 945 171 453 2.67e-50 186
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MsG0480019726.01.T01 AT3G24550 34.839 310 181 7 648 943 252 554 2.90e-50 189
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MsG0480019726.01.T01 AT4G00970 33.148 359 213 8 604 946 275 622 3.04e-50 189
MsG0480019726.01.T01 AT1G69270 30.217 460 279 11 505 947 103 537 3.33e-50 186
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MsG0480019726.01.T01 AT4G13820 27.913 412 268 13 79 482 328 718 4.52e-19 93.2
MsG0480019726.01.T01 AT4G13820 26.276 529 309 18 97 555 201 718 5.01e-19 93.2
MsG0480019726.01.T01 AT4G21410 30.749 374 225 7 592 942 144 506 4.49e-50 186
MsG0480019726.01.T01 AT1G53430 36.337 344 193 7 610 943 573 900 7.22e-50 191
MsG0480019726.01.T01 AT1G53430 31.544 298 169 6 237 534 62 324 8.15e-26 115
MsG0480019726.01.T01 AT1G53430 30.372 349 176 6 112 460 42 323 2.05e-24 110
MsG0480019726.01.T01 AT1G53430 28.440 327 169 5 97 423 51 312 2.32e-23 107
MsG0480019726.01.T01 AT1G53430 31.673 281 177 5 300 580 56 321 3.39e-23 107
MsG0480019726.01.T01 AT1G53430 27.734 256 125 5 105 343 130 342 2.85e-14 78.2
MsG0480019726.01.T01 AT4G20450 32.237 456 251 11 502 943 435 846 7.79e-50 191
MsG0480019726.01.T01 AT5G48740 33.061 490 260 19 485 938 416 873 7.94e-50 191
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MsG0480019726.01.T01 AT3G45430 33.429 350 204 9 605 942 280 612 1.37e-49 187
MsG0480019726.01.T01 AT4G21400 36.271 295 165 5 663 942 349 635 1.52e-49 187
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MsG0480019726.01.T01 AT1G53440 38.776 294 162 7 661 943 653 939 3.95e-49 189
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MsG0480019726.01.T01 AT1G53440 28.629 248 131 6 98 343 178 381 1.59e-12 72.4
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MsG0480019726.01.T01 AT3G11010 32.929 577 306 15 67 581 20 577 6.22e-49 188
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MsG0480019726.01.T01 AT1G07550 32.671 453 253 11 502 942 415 827 6.93e-49 187
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MsG0480019726.01.T01 AT3G23110 34.230 409 237 5 186 566 114 518 2.25e-46 179
MsG0480019726.01.T01 AT3G23110 27.174 644 376 18 79 648 208 832 1.40e-36 149
MsG0480019726.01.T01 AT3G23110 33.708 267 170 3 330 596 114 373 3.66e-30 129
MsG0480019726.01.T01 AT5G15730 34.397 282 173 6 662 942 103 373 3.53e-48 178
MsG0480019726.01.T01 AT4G34500 37.543 293 161 8 667 945 137 421 3.70e-48 178
MsG0480019726.01.T01 AT5G60300 32.733 333 203 7 624 947 297 617 4.54e-48 184
MsG0480019726.01.T01 AT1G47890 31.602 693 327 18 18 577 58 736 5.03e-48 186
MsG0480019726.01.T01 AT1G47890 28.014 564 284 14 99 568 391 926 4.77e-31 132
MsG0480019726.01.T01 AT3G11010 32.174 575 289 15 67 581 83 616 5.25e-48 185
MsG0480019726.01.T01 AT3G11010 27.787 601 369 20 79 639 338 913 2.28e-30 129
MsG0480019726.01.T01 AT2G17220 37.624 303 154 9 666 944 78 369 5.57e-48 177
MsG0480019726.01.T01 AT5G59670 30.736 462 258 12 502 943 415 834 5.76e-48 185
MsG0480019726.01.T01 AT5G59670 30.736 462 258 12 502 943 415 834 5.76e-48 185
MsG0480019726.01.T01 AT2G17220 37.624 303 154 9 666 944 77 368 5.76e-48 177
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MsG0480019726.01.T01 AT2G27060 29.021 286 169 11 680 942 736 1010 4.10e-19 93.6
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MsG0480019726.01.T01 AT5G01020 36.014 286 165 6 672 943 66 347 2.01e-45 169
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MsG0480019726.01.T01 AT1G61490 31.594 345 211 7 603 933 419 752 2.07e-45 176
MsG0480019726.01.T01 AT1G61490 31.594 345 211 7 603 933 419 752 2.07e-45 176
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MsG0480019726.01.T01 AT4G23270 34.589 292 168 6 665 942 316 598 2.52e-45 174
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MsG0480019726.01.T01 AT4G21400 33.127 323 165 6 663 942 311 625 2.11e-44 172
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MsG0480019726.01.T01 AT4G04510 32.172 373 215 9 588 946 262 610 2.37e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT2G11520 36.364 308 167 8 651 942 203 497 2.38e-44 169
MsG0480019726.01.T01 AT5G35370 29.921 381 221 10 603 947 438 808 2.73e-44 173
MsG0480019726.01.T01 AT5G39000 32.787 366 209 10 608 944 438 795 3.36e-44 173
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 44.928 207 109 2 671 876 636 838 3.55e-44 173
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 34.783 276 173 4 186 460 100 369 4.45e-28 122
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 38.571 210 105 2 376 562 122 330 7.33e-27 118
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 28.228 333 199 7 110 441 105 398 2.29e-25 114
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 29.450 309 206 5 233 538 99 398 4.18e-22 103
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 37.342 158 97 2 412 569 110 265 7.93e-18 89.4
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 29.851 201 131 2 97 297 140 330 1.04e-14 79.3
MsG0480019726.01.T01 AT1G29730 35.338 133 82 3 462 592 112 242 1.20e-11 69.3
MsG0480019726.01.T01 AT5G60280 34.014 294 173 7 662 945 326 608 3.60e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT2G23450 35.802 324 185 9 635 943 306 621 3.82e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT2G23450 35.802 324 185 9 635 943 306 621 3.82e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT1G07870 34.364 291 166 8 664 938 92 373 3.95e-44 166
MsG0480019726.01.T01 AT1G21590 34.589 292 169 7 665 943 399 681 4.19e-44 172
MsG0480019726.01.T01 AT1G21590 34.471 293 168 8 665 943 359 641 4.20e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT4G23150 32.646 291 174 5 665 942 326 607 4.23e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT1G24030 32.131 305 177 9 661 944 60 355 4.36e-44 164
MsG0480019726.01.T01 AT4G05200 32.982 285 173 4 665 938 355 632 4.38e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT1G61420 30.986 355 204 9 603 933 269 606 4.41e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT2G18470 39.655 232 133 4 651 880 259 485 4.46e-44 168
MsG0480019726.01.T01 AT1G61400 30.702 342 210 6 607 933 433 762 4.60e-44 172
MsG0480019726.01.T01 AT4G05200 32.982 285 173 4 665 938 337 614 4.60e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT4G32000 33.798 287 175 3 665 942 162 442 4.84e-44 166
MsG0480019726.01.T01 AT2G29220 33.043 345 185 9 610 943 303 612 5.16e-44 170
MsG0480019726.01.T01 AT5G56790 37.241 290 165 6 664 943 379 661 5.23e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT4G04570 35.889 287 167 7 668 946 341 618 5.36e-44 170
MsG0480019726.01.T01 AT1G61420 30.986 355 204 9 603 933 419 756 5.81e-44 172
MsG0480019726.01.T01 AT1G61500 31.304 345 210 8 604 933 403 735 7.24e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT2G23200 37.201 293 163 8 663 943 476 759 7.53e-44 172
MsG0480019726.01.T01 AT1G06840 33.908 348 197 11 614 944 565 896 8.29e-44 172
MsG0480019726.01.T01 AT1G06840 32.095 296 165 4 108 402 88 348 3.17e-27 119
MsG0480019726.01.T01 AT1G06840 31.228 285 188 4 182 460 81 363 3.16e-25 113
MsG0480019726.01.T01 AT1G06840 34.074 270 146 8 340 580 95 361 4.09e-25 113
MsG0480019726.01.T01 AT1G06840 31.034 290 186 7 257 536 84 369 1.03e-24 111
MsG0480019726.01.T01 AT1G06840 35.758 165 104 2 401 564 84 247 1.83e-18 91.7
MsG0480019726.01.T01 AT1G06840 29.720 286 180 7 66 342 63 336 1.14e-17 89.0
MsG0480019726.01.T01 AT1G61420 30.812 357 204 9 603 933 269 608 8.34e-44 170
MsG0480019726.01.T01 AT1G64210 28.927 522 305 16 465 943 81 579 8.78e-44 169
MsG0480019726.01.T01 AT1G64210 39.823 113 66 1 377 489 89 199 9.41e-13 72.4
MsG0480019726.01.T01 AT1G64210 32.386 176 114 3 278 450 61 234 2.69e-11 67.8
MsG0480019726.01.T01 AT1G64210 35.659 129 81 1 201 329 81 207 3.55e-11 67.4
MsG0480019726.01.T01 AT3G23750 35.106 282 160 6 670 935 573 847 8.79e-44 172
MsG0480019726.01.T01 AT3G23750 27.972 429 238 13 61 465 45 426 1.79e-25 114
MsG0480019726.01.T01 AT3G23750 26.203 374 247 7 210 563 63 427 6.59e-19 92.8
MsG0480019726.01.T01 AT1G61500 31.304 345 210 8 604 933 421 753 9.09e-44 171
MsG0480019726.01.T01 AT1G79670 36.585 287 165 5 667 943 376 655 9.17e-44 170
MsG0480019726.01.T01 AT1G61420 30.812 357 204 9 603 933 419 758 9.29e-44 171

Find 174 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 215 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGAAACATTGTGAAGCTTTA+TGG 0.134733 4:-25912695 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTAAGCCAAATTCACCTATT+TGG 0.145535 4:-25912406 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATGATCCAAGGTTTCCAATT+TGG 0.148330 4:+25913422 None:intergenic
CTTTCTACAAATTATCTTAA+TGG 0.156349 4:-25914492 MsG0480019726.01.T01:CDS
GATTGACTTCAAAGAAATTT+TGG 0.161071 4:-25912065 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGGGTGGAAATAAGCTTTC+TGG 0.174768 4:-25913601 MsG0480019726.01.T01:CDS
GAAGCTCATGTCTCAGATTT+TGG 0.181103 4:-25912443 MsG0480019726.01.T01:CDS
GGCACAATTCCTTTCCAAAT+TGG 0.183924 4:-25913436 MsG0480019726.01.T01:CDS
GGTCGATTACCAAACGAAAT+AGG 0.192145 4:-25914300 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGAGTTACAATTCAATTTC+AGG 0.196342 4:-25913382 MsG0480019726.01.T01:CDS
CACAGTGCCATTTAGGTTAT+TGG 0.203455 4:+25914098 None:intergenic
GAAGTCCAAATAGGTGAATT+TGG 0.206673 4:+25912401 None:intergenic
GGACAGTTTCTAAGACTTAT+TGG 0.208711 4:+25913931 None:intergenic
GGTCCTATTCCTTCATCTTT+AGG 0.210120 4:-25914228 MsG0480019726.01.T01:CDS
CAAATTTAAATTCAGCAAAT+TGG 0.216913 4:+25913477 None:intergenic
TTGAAGTACCAAATTGAAAA+TGG 0.219805 4:+25912935 None:intergenic
GGCTCTCCATTTCTAGAAAC+TGG 0.225586 4:+25911924 None:intergenic
GGCACTGTGCCACAAGAATT+TGG 0.227603 4:-25914084 MsG0480019726.01.T01:CDS
GGTTACGCAGATCAAGATTT+TGG 0.230517 4:-25913868 MsG0480019726.01.T01:CDS
GGTAAGGTGCCAATTGAAAT+TGG 0.230619 4:-25913580 MsG0480019726.01.T01:CDS
GAAATGTATGCTTATGATTA+TGG 0.236077 4:+25914877 None:intergenic
GGGGAAATTCCTTCTAATAT+TGG 0.239011 4:-25913361 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATTTGGAAACCTTTCATCTT+TGG 0.242408 4:-25914067 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATTCCTTGTTTATGAGTATA+TGG 0.247115 4:-25912648 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATTCCTATAGTTGCTTCTTT+AGG 0.247160 4:-25913058 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGTAGAAAGATCAAGAAAT+TGG 0.254586 4:+25914505 None:intergenic
GAGGAATAGTTCCTGATAAT+TGG 0.254761 4:+25913662 None:intergenic
AAACGGTTTGAGATTGTTAA+AGG 0.268436 4:-25912563 MsG0480019726.01.T01:CDS
AACAACCAATTCTTGATTCA+TGG 0.275095 4:-25914749 MsG0480019726.01.T01:CDS
TAACCTTTCTTACAATCATT+TGG 0.300976 4:-25913242 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATCATAAACTTGGCATATAC+TGG 0.301617 4:-25914648 MsG0480019726.01.T01:CDS
TACCAAATTGAAAATGGATT+TGG 0.306115 4:+25912941 None:intergenic
CTTCTTTCATTGGTAATTGT+TGG 0.307866 4:-25913025 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAGGTGGTTTATCTTCTAAA+TGG 0.310728 4:-25913798 MsG0480019726.01.T01:CDS
AGTTCCTGATAATTGGTTAT+AGG 0.312203 4:+25913669 None:intergenic
TTTCTAAGACTTATTGGAAT+TGG 0.314973 4:+25913937 None:intergenic
GGTACTGATAAGCCCAGTTC+TGG 0.326784 4:-25914369 MsG0480019726.01.T01:CDS
TGCATTGGCGAAGGCGCGTT+TGG 0.333694 4:-25912854 MsG0480019726.01.T01:CDS
CCTATTTGGACTTCATTTGC+TGG 0.334279 4:-25912392 MsG0480019726.01.T01:CDS
AATTTGAAAATGCCACTCTT+AGG 0.343502 4:+25913208 None:intergenic
TTTGAAGCATTTGCAATTTG+TGG 0.345757 4:+25913640 None:intergenic
AAACTTGCAATACCTGAGTT+TGG 0.348010 4:-25913764 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTAGCATTTGAGATTCTAAC+AGG 0.350442 4:-25912139 MsG0480019726.01.T01:CDS
CTTGTGGCACAGTGCCATTT+AGG 0.350558 4:+25914091 None:intergenic
ACTTCATTTGCTGGCACATA+TGG 0.353384 4:-25912383 MsG0480019726.01.T01:CDS
CTATCCTATAACCAATTATC+AGG 0.354441 4:-25913673 MsG0480019726.01.T01:CDS
GAAAGCTTACCAATATTAGA+AGG 0.354563 4:+25913352 None:intergenic
AAATCCATGTAAGTAAGATT+TGG 0.365798 4:+25913838 None:intergenic
CCTCCAAATGATTGTAAGAA+AGG 0.370260 4:+25913239 None:intergenic
AGGTGGTTTATCTTCTAAAT+GGG 0.370450 4:-25913797 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATGATCCATGAATCAAGAAT+TGG 0.370673 4:+25914744 None:intergenic
GATCTGCGTAACCGGTTAAC+TGG 0.371864 4:+25913878 None:intergenic
TGGACCGGTGAAACTGTTAA+AGG 0.372967 4:+25913957 None:intergenic
CTTGCTGAGAACAATTTCAT+TGG 0.375278 4:-25914033 MsG0480019726.01.T01:CDS
CCACCTCAAGTTTGCAAAAG+TGG 0.378933 4:-25914003 MsG0480019726.01.T01:CDS
ACCAACAAAGTAGCTTGAAT+TGG 0.379827 4:+25914855 None:intergenic
GACCGCCCAAAAGGGTATCT+TGG 0.381289 4:+25914319 None:intergenic
AACATTCCACTAATTTCATT+AGG 0.382482 4:+25913280 None:intergenic
TATGCTTATGATTATGGTTA+AGG 0.388267 4:+25914883 None:intergenic
TCATAGTAGGTCTGGATTGA+GGG 0.393446 4:+25911957 None:intergenic
GAAAGCTTTCCAATTTCAAT+TGG 0.393700 4:+25913571 None:intergenic
GTCGATTACCAAACGAAATA+GGG 0.394247 4:-25914299 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGGTAATCGACCGCCCAAA+AGG 0.398210 4:+25914310 None:intergenic
ATACTTATTGTCAAAATTGT+TGG 0.398321 4:+25912877 None:intergenic
GTTCTGGGCTTATCAGTATC+AGG 0.399425 4:-25914353 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAATGTTTACAAAGCCAAAC+TGG 0.400571 4:-25912831 MsG0480019726.01.T01:CDS
TCCAATTCAAGCTACTTTGT+TGG 0.401957 4:-25914856 MsG0480019726.01.T01:CDS
CCTTTCCAAATTGGAAACCT+TGG 0.404474 4:-25913427 MsG0480019726.01.T01:CDS
TATGGATCGCGGGACTTTAG+AGG 0.409454 4:-25912630 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTTATGTTCCCTATTTCGTT+TGG 0.409668 4:+25914291 None:intergenic
GATACTGATAAGCCCAGAAC+TGG 0.414912 4:+25914356 None:intergenic
CTTGAATACAACCAGTTAAC+CGG 0.415013 4:-25913889 MsG0480019726.01.T01:CDS
GCTCTATGCCAAATCACTTC+AGG 0.417831 4:-25914819 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAAATCTTGATCTGCGTAAC+CGG 0.417918 4:+25913870 None:intergenic
TGTAGCCCAGTTTCTAGAAA+TGG 0.418688 4:-25911930 MsG0480019726.01.T01:CDS
AGAGAGCATTGGAACTTGAT+TGG 0.423223 4:-25912589 MsG0480019726.01.T01:CDS
AGATCGAGACGAAGAAGGTT+AGG 0.424502 4:+25914585 None:intergenic
CAACACAAACACCATGTTCA+TGG 0.425109 4:-25914707 MsG0480019726.01.T01:CDS
TCTTAATCACTTAAACTTGT+CGG 0.426746 4:-25914613 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGGTCAATTTGCCAATACT+TGG 0.427401 4:+25914144 None:intergenic
TTTCCTAAAGATGAAGGAAT+AGG 0.432442 4:+25914225 None:intergenic
TTGAATGAAAACCAATTCTC+TGG 0.434177 4:-25914177 MsG0480019726.01.T01:CDS
TATTTGACCTCCTTCCAGTT+TGG 0.437393 4:+25912817 None:intergenic
CCAGCAAATGAAGTCCAAAT+AGG 0.442103 4:+25912392 None:intergenic
AGGCGCGCTTCTTCTTTCAT+TGG 0.445051 4:-25913035 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATCTCAAACAACAATTTGTC+AGG 0.445448 4:-25913310 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGGCATATACTGGACTTGA+AGG 0.445555 4:-25914639 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGAGTAACAATCACTTGAA+TGG 0.446207 4:-25913457 MsG0480019726.01.T01:CDS
CTCATAGTAGGTCTGGATTG+AGG 0.446398 4:+25911956 None:intergenic
TTGGCTGGTAATTCAGTGAA+TGG 0.448241 4:-25913745 MsG0480019726.01.T01:CDS
CATGGATTTCAGCTATAATA+CGG 0.449751 4:-25913824 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTATCCAAATCTTACTTACA+TGG 0.449995 4:-25913842 MsG0480019726.01.T01:CDS
CTTATGATTATGGTTAAGGT+TGG 0.450823 4:+25914887 None:intergenic
CAAATACCTAATGAAATTAG+TGG 0.452359 4:-25913286 MsG0480019726.01.T01:CDS
CCTCCTAAAGAAGCAACTAT+AGG 0.452682 4:+25913055 None:intergenic
CTTGATGCAAACAATTTCTC+TGG 0.455943 4:-25914249 MsG0480019726.01.T01:CDS
TACACTTCTCATAGTAGGTC+TGG 0.456594 4:+25911949 None:intergenic
TGACCAACCTAACCGATGTA+AGG 0.456835 4:-25914128 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGTCACTTCCTCCATCACT+TGG 0.457488 4:+25913094 None:intergenic
AATTTGAAGCCTTGTTAAAG+TGG 0.457612 4:-25914788 MsG0480019726.01.T01:CDS
AGGTCTATGTGGTAGTTTCA+AGG 0.462384 4:-25913149 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTTTCACGAAACGACGTGTC+TGG 0.463926 4:-25914420 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTGGTATTGAGCCAGAGAAT+TGG 0.464883 4:+25914166 None:intergenic
TGAGTTACAATTCAATTTCA+GGG 0.465728 4:-25913381 MsG0480019726.01.T01:CDS
GGAGAAATTCCGATTCAGAT+AGG 0.468705 4:-25913508 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAATGTGATGTCTTCAGCTT+TGG 0.474754 4:-25912166 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTCAATTTGCCAATACTTGG+TGG 0.476666 4:+25914147 None:intergenic
AATCAAGAATTGGTTGTTGA+GGG 0.477766 4:+25914754 None:intergenic
CCTTTCTTACAATCATTTGG+AGG 0.480138 4:-25913239 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTGTCAGTCCTGAAGTGATT+TGG 0.480673 4:+25914811 None:intergenic
TTACAGTTTCCTAAAGATGA+AGG 0.480895 4:+25914219 None:intergenic
TTTGACAATAAGTATTGCAT+TGG 0.481036 4:-25912869 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTCAAATTAGCTATAGAAAG+AGG 0.481058 4:+25914462 None:intergenic
TGGAACTTGATTGGTCTAAA+CGG 0.485154 4:-25912580 MsG0480019726.01.T01:CDS
CCTATAGTTGCTTCTTTAGG+AGG 0.487146 4:-25913055 MsG0480019726.01.T01:CDS
GAACAATCACCTATCTGAAT+CGG 0.488260 4:+25913499 None:intergenic
TTGCAATACCTGAGTTTGGC+TGG 0.494554 4:-25913760 MsG0480019726.01.T01:CDS
CCAAGGTTTCCAATTTGGAA+AGG 0.498373 4:+25913427 None:intergenic
GGTCTATGTGGTAGTTTCAA+GGG 0.502090 4:-25913148 MsG0480019726.01.T01:CDS
TGGTAATCGACCGCCCAAAA+GGG 0.507558 4:+25914311 None:intergenic
TGGAAATAAGCTTTCTGGTA+AGG 0.509879 4:-25913596 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAGACTTATTGGAATTGGAC+CGG 0.513946 4:+25913942 None:intergenic
GTACTGATAAGCCCAGTTCT+GGG 0.519564 4:-25914368 MsG0480019726.01.T01:CDS
CTTTCTTACAATCATTTGGA+GGG 0.524418 4:-25913238 MsG0480019726.01.T01:CDS
GACCGTCGTTTGTTTCCTGA+TGG 0.528746 4:-25914390 MsG0480019726.01.T01:CDS
AGTCTAACTCTATACAAAGA+AGG 0.530621 4:+25913910 None:intergenic
GAAAGGTTTCCAAATTCTTG+TGG 0.531010 4:+25914075 None:intergenic
GCATCCTTTAACAGTTTCAC+CGG 0.532921 4:-25913961 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAAAGTCTTGTAATGATCCA+AGG 0.535592 4:+25913410 None:intergenic
TGGGCTACACTTCTCATAGT+AGG 0.538524 4:+25911944 None:intergenic
GGCTCAATACCACCAAGTAT+TGG 0.540125 4:-25914156 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATATCTCTATGAATCAAAGC+TGG 0.540281 4:+25912500 None:intergenic
GGTATCACTTGTGATTCTAA+AGG 0.542096 4:-25914681 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAACCTTACATCGGTTAGGT+TGG 0.546796 4:+25914125 None:intergenic
CTTGACTTGAGCAACAATCA+AGG 0.550555 4:-25913169 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATGTAAGAAACAAGATCACC+AGG 0.557026 4:+25912109 None:intergenic
CTGAATTACCAGCCAAACTC+AGG 0.559384 4:+25913752 None:intergenic
GAATCAAGAATTGGTTGTTG+AGG 0.561714 4:+25914753 None:intergenic
CTGGGCTTATCAGTACCATC+AGG 0.561750 4:+25914375 None:intergenic
TTTATGAGTATATGGATCGC+GGG 0.563060 4:-25912640 MsG0480019726.01.T01:CDS
AAGTGTTACAATCATAAACT+TGG 0.566912 4:-25914658 MsG0480019726.01.T01:CDS
ACATATGGTTATGCTGCTCC+AGG 0.567183 4:-25912368 MsG0480019726.01.T01:intron
TCGCTTGATGAAACATTACA+AGG 0.572148 4:+25913118 None:intergenic
TTCAGCTATAATACGGTCCA+AGG 0.572988 4:-25913817 MsG0480019726.01.T01:CDS
GAAGCATTTGCAATTTGTGG+AGG 0.579426 4:+25913643 None:intergenic
CTCAAAACAAACAATCTCAC+CGG 0.589730 4:-25914564 MsG0480019726.01.T01:CDS
GATTGATGATAAGAGAGCAT+TGG 0.592424 4:-25912600 MsG0480019726.01.T01:CDS
GAGGGTAATGTTCCTAAGAG+TGG 0.598188 4:-25913220 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTAAAACAACCAAAGATGAA+AGG 0.601448 4:+25914058 None:intergenic
GCTCTCCATTTCTAGAAACT+GGG 0.601916 4:+25911925 None:intergenic
TCATCAAGCGAACCAAGTGA+TGG 0.610932 4:-25913106 MsG0480019726.01.T01:CDS
AATAAGTATTGCATTGGCGA+AGG 0.612909 4:-25912863 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTTTATGAGTATATGGATCG+CGG 0.615365 4:-25912641 MsG0480019726.01.T01:CDS
GAGTTACAATTCAATTTCAG+GGG 0.615545 4:-25913380 MsG0480019726.01.T01:CDS
GTTTACAAAGCCAAACTGGA+AGG 0.616490 4:-25912827 MsG0480019726.01.T01:CDS
TACAGAGCTTGCTTACACAA+TGG 0.621895 4:-25912200 MsG0480019726.01.T01:intron
GGTGGTTTATCTTCTAAATG+GGG 0.622111 4:-25913796 MsG0480019726.01.T01:CDS
AGCAACAATCAAGGTCTATG+TGG 0.628905 4:-25913160 MsG0480019726.01.T01:CDS
TCAAGCGAACCAAGTGATGG+AGG 0.629710 4:-25913103 MsG0480019726.01.T01:CDS
ACTTTGTTTCCACTTTAACA+AGG 0.631090 4:+25914779 None:intergenic
ATTTAGAAGATAAACCACCT+TGG 0.632721 4:+25913800 None:intergenic
GTGATACCTCTCCATGAACA+TGG 0.642780 4:+25914696 None:intergenic
TTTGAGGTGAAGGTAAGCGA+GGG 0.643858 4:+25912041 None:intergenic
ATACTGATAAGCCCAGAACT+GGG 0.644030 4:+25914357 None:intergenic
GGAAGGAGGTCAAATATTCG+CGG 0.645344 4:-25912810 MsG0480019726.01.T01:CDS
TACAAAGCCAAACTGGAAGG+AGG 0.650284 4:-25912824 MsG0480019726.01.T01:CDS
ATTCTAACAGGAAAGCACCC+TGG 0.657198 4:-25912127 MsG0480019726.01.T01:CDS
GATCCATATACTCATAAACA+AGG 0.671270 4:+25912645 None:intergenic
AGCTATAATACGGTCCAAGG+TGG 0.677026 4:-25913814 MsG0480019726.01.T01:CDS
CAAACACCATGTTCATGGAG+AGG 0.683788 4:-25914702 MsG0480019726.01.T01:CDS
TTGAAGCTATGACAGAAACA+AGG 0.701065 4:-25912721 MsG0480019726.01.T01:CDS
GGTGTTATACCTGAAAACAT+CGG 0.715286 4:-25914543 MsG0480019726.01.T01:CDS
TGTAAGAAACAAGATCACCA+GGG 0.721217 4:+25912110 None:intergenic
TACCATCAGGAAACAAACGA+CGG 0.762577 4:+25914388 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAAAATAATATTTTGGTATA+TGG + Chr4:25914547-25914566 None:intergenic 10.0%
!!! AAATTTGTATCTTTTAAATT+TGG - Chr4:25913190-25913209 MsG0480019726.01.T01:CDS 10.0%
!!! AATTTGTATCTTTTAAATTT+GGG - Chr4:25913191-25913210 MsG0480019726.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTATATTTGAATTCTTATTT+TGG - Chr4:25914483-25914502 MsG0480019726.01.T01:CDS 10.0%
!!! CAAGAAGAAAAATAATATTT+TGG + Chr4:25914554-25914573 None:intergenic 15.0%
!! ATACTTATTGTCAAAATTGT+TGG + Chr4:25913936-25913955 None:intergenic 20.0%
!! CAAATTTAAATTCAGCAAAT+TGG + Chr4:25913336-25913355 None:intergenic 20.0%
!! CTTTCTACAAATTATCTTAA+TGG - Chr4:25912318-25912337 MsG0480019726.01.T01:intron 20.0%
!! TATAAAAACATTTGAAAGTG+AGG - Chr4:25914066-25914085 MsG0480019726.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATATTTTGGTATATGGTAT+TGG + Chr4:25914541-25914560 None:intergenic 20.0%
!!! TTCAAATGTTTTTATACTCT+CGG + Chr4:25914062-25914081 None:intergenic 20.0%
! AAATCCATGTAAGTAAGATT+TGG + Chr4:25912975-25912994 None:intergenic 25.0%
! AACATTCCACTAATTTCATT+AGG + Chr4:25913533-25913552 None:intergenic 25.0%
! AAGTGTTACAATCATAAACT+TGG - Chr4:25912152-25912171 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
! CAAATACCTAATGAAATTAG+TGG - Chr4:25913524-25913543 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
! CTAAAAATGCATTCATTGAA+AGG + Chr4:25913283-25913302 None:intergenic 25.0%
! GAAAGATAAAAAATATCACC+TGG + Chr4:25914463-25914482 None:intergenic 25.0%
! GAAATGTATGCTTATGATTA+TGG + Chr4:25911936-25911955 None:intergenic 25.0%
! TAACCTTTCTTACAATCATT+TGG - Chr4:25913568-25913587 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
! TATGCTTATGATTATGGTTA+AGG + Chr4:25911930-25911949 None:intergenic 25.0%
! TCTTAATCACTTAAACTTGT+CGG - Chr4:25912197-25912216 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
! TGAGTTACAATTCAATTTCA+GGG - Chr4:25913429-25913448 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
! TTATCCAAATCTTACTTACA+TGG - Chr4:25912968-25912987 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAGTTACAATTCAATTTC+AGG - Chr4:25913428-25913447 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTAGAAAGATCAAGAAAT+TGG + Chr4:25912308-25912327 None:intergenic 25.0%
!! ATTCCTTGTTTATGAGTATA+TGG - Chr4:25914162-25914181 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTTCAATGAATGCATTTTT+AGG - Chr4:25913281-25913300 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!! TACCAAATTGAAAATGGATT+TGG + Chr4:25913872-25913891 None:intergenic 25.0%
!! TTGAAGTACCAAATTGAAAA+TGG + Chr4:25913878-25913897 None:intergenic 25.0%
!! TTGTATCTTTTAAATTTGGG+TGG - Chr4:25913194-25913213 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGACAATAAGTATTGCAT+TGG - Chr4:25913941-25913960 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCAATTTGGTACTTCAA+TGG - Chr4:25913878-25913897 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTTCACCAATAACCTAAA+TGG - Chr4:25912705-25912724 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATTGACTTCAAAGAAATTT+TGG - Chr4:25914745-25914764 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTATGGATTTTGTTGTGAA+GGG - Chr4:25914131-25914150 MsG0480019726.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCTAAGACTTATTGGAAT+TGG + Chr4:25912876-25912895 None:intergenic 25.0%
AAATGTTTACAAAGCCAAAC+TGG - Chr4:25913979-25913998 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
AACAACCAATTCTTGATTCA+TGG - Chr4:25912061-25912080 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
AAGGTGGTTTATCTTCTAAA+TGG - Chr4:25913012-25913031 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
AATCAAGAATTGGTTGTTGA+GGG + Chr4:25912059-25912078 None:intergenic 30.0%
AATTTGAAAATGCCACTCTT+AGG + Chr4:25913605-25913624 None:intergenic 30.0%
AGAAACATTGTGAAGCTTTA+TGG - Chr4:25914115-25914134 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
AGGTGGTTTATCTTCTAAAT+GGG - Chr4:25913013-25913032 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
AGTCTAACTCTATACAAAGA+AGG + Chr4:25912903-25912922 None:intergenic 30.0%
AGTTCCTGATAATTGGTTAT+AGG + Chr4:25913144-25913163 None:intergenic 30.0%
ATATCTCTATGAATCAAAGC+TGG + Chr4:25914313-25914332 None:intergenic 30.0%
ATCATAAACTTGGCATATAC+TGG - Chr4:25912162-25912181 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
ATCTCAAACAACAATTTGTC+AGG - Chr4:25913500-25913519 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
ATGATCCATGAATCAAGAAT+TGG + Chr4:25912069-25912088 None:intergenic 30.0%
ATTCCTATAGTTGCTTCTTT+AGG - Chr4:25913752-25913771 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
ATTGGTGAAAAACCTTACAT+CGG + Chr4:25912697-25912716 None:intergenic 30.0%
ATTTAGAAGATAAACCACCT+TGG + Chr4:25913013-25913032 None:intergenic 30.0%
ATTTGGAAACCTTTCATCTT+TGG - Chr4:25912743-25912762 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
CATGGATTTCAGCTATAATA+CGG - Chr4:25912986-25913005 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
CTATCCTATAACCAATTATC+AGG - Chr4:25913137-25913156 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
CTTATGATTATGGTTAAGGT+TGG + Chr4:25911926-25911945 None:intergenic 30.0%
CTTTCTTACAATCATTTGGA+GGG - Chr4:25913572-25913591 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
GAAAGCTTACCAATATTAGA+AGG + Chr4:25913461-25913480 None:intergenic 30.0%
GAAAGCTTTCCAATTTCAAT+TGG + Chr4:25913242-25913261 None:intergenic 30.0%
GAGTTACAATTCAATTTCAG+GGG - Chr4:25913430-25913449 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
GATCCATATACTCATAAACA+AGG + Chr4:25914168-25914187 None:intergenic 30.0%
GTAAAACAACCAAAGATGAA+AGG + Chr4:25912755-25912774 None:intergenic 30.0%
GTCAAATTAGCTATAGAAAG+AGG + Chr4:25912351-25912370 None:intergenic 30.0%
TCCAATTGAAAAATCTCACT+AGG + Chr4:25913098-25913117 None:intergenic 30.0%
TTAAGCCAAATTCACCTATT+TGG - Chr4:25914404-25914423 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
TTACAGTTTCCTAAAGATGA+AGG + Chr4:25912594-25912613 None:intergenic 30.0%
TTGAATGAAAACCAATTCTC+TGG - Chr4:25912633-25912652 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
TTGAGTAACAATCACTTGAA+TGG - Chr4:25913353-25913372 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
TTTATGTTCCCTATTTCGTT+TGG + Chr4:25912522-25912541 None:intergenic 30.0%
TTTCCTAAAGATGAAGGAAT+AGG + Chr4:25912588-25912607 None:intergenic 30.0%
! AAAAGTCTTGTAATGATCCA+AGG + Chr4:25913403-25913422 None:intergenic 30.0%
! AAACGGTTTGAGATTGTTAA+AGG - Chr4:25914247-25914266 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
! ACCTCAAAAGAACATTTTGA+AGG - Chr4:25914784-25914803 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTTGTTTCCACTTTAACA+AGG + Chr4:25912034-25912053 None:intergenic 30.0%
! CTTCTTTCATTGGTAATTGT+TGG - Chr4:25913785-25913804 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
! TCCTTCAAAATGTTCTTTTG+AGG + Chr4:25914788-25914807 None:intergenic 30.0%
! TGCCAAATCCATTTTCAATT+TGG - Chr4:25913867-25913886 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
! TGGATCATTACAAGACTTTT+TGG - Chr4:25913403-25913422 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
! TTAGCATTTGAGATTCTAAC+AGG - Chr4:25914671-25914690 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAAGCATTTGCAATTTG+TGG + Chr4:25913173-25913192 None:intergenic 30.0%
!! AAAGAACATTTTGAAGGAGT+TGG - Chr4:25914790-25914809 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
!! AATTTGAAGCCTTGTTAAAG+TGG - Chr4:25912022-25912041 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
!! CTTTATGGATTTTGTTGTGA+AGG - Chr4:25914130-25914149 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
!! TCCTAGTGAGATTTTTCAAT+TGG - Chr4:25913094-25913113 MsG0480019726.01.T01:CDS 30.0%
!! TGGTATATGGTATTGGTAAA+TGG + Chr4:25914534-25914553 None:intergenic 30.0%
!!! AAAATGTTCTTTTGAGGTGA+AGG + Chr4:25914782-25914801 None:intergenic 30.0%
AAAATCTTGATCTGCGTAAC+CGG + Chr4:25912943-25912962 None:intergenic 35.0%
AAACTTGCAATACCTGAGTT+TGG - Chr4:25913046-25913065 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
AAATGTGATGTCTTCAGCTT+TGG - Chr4:25914644-25914663 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
AAGACTTATTGGAATTGGAC+CGG + Chr4:25912871-25912890 None:intergenic 35.0%
ACCAACAAAGTAGCTTGAAT+TGG + Chr4:25911958-25911977 None:intergenic 35.0%
AGGAAGTGACAAAAAAAAGG+TGG - Chr4:25913727-25913746 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
ATGATCCAAGGTTTCCAATT+TGG + Chr4:25913391-25913410 None:intergenic 35.0%
ATGTAAGAAACAAGATCACC+AGG + Chr4:25914704-25914723 None:intergenic 35.0%
CCTCCAAATGATTGTAAGAA+AGG + Chr4:25913574-25913593 None:intergenic 35.0%
CCTTTCTTACAATCATTTGG+AGG - Chr4:25913571-25913590 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
CTCAAAACAAACAATCTCAC+CGG - Chr4:25912246-25912265 MsG0480019726.01.T01:intron 35.0%
CTTGAATACAACCAGTTAAC+CGG - Chr4:25912921-25912940 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
CTTGATGCAAACAATTTCTC+TGG - Chr4:25912561-25912580 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCTGAGAACAATTTCAT+TGG - Chr4:25912777-25912796 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGGTTTCCAAATTCTTG+TGG + Chr4:25912738-25912757 None:intergenic 35.0%
GAACAATCACCTATCTGAAT+CGG + Chr4:25913314-25913333 None:intergenic 35.0%
GAAGTCCAAATAGGTGAATT+TGG + Chr4:25914412-25914431 None:intergenic 35.0%
GAATCAAGAATTGGTTGTTG+AGG + Chr4:25912060-25912079 None:intergenic 35.0%
GAGGAATAGTTCCTGATAAT+TGG + Chr4:25913151-25913170 None:intergenic 35.0%
GGGGAAATTCCTTCTAATAT+TGG - Chr4:25913449-25913468 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
GGTATCACTTGTGATTCTAA+AGG - Chr4:25912129-25912148 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
GGTGGTTTATCTTCTAAATG+GGG - Chr4:25913014-25913033 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
GTCGATTACCAAACGAAATA+GGG - Chr4:25912511-25912530 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
GTTTATGAGTATATGGATCG+CGG - Chr4:25914169-25914188 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
TCGCTTGATGAAACATTACA+AGG + Chr4:25913695-25913714 None:intergenic 35.0%
TGGAGGAAGTGACAAAAAAA+AGG - Chr4:25913724-25913743 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
TGTAAGAAACAAGATCACCA+GGG + Chr4:25914703-25914722 None:intergenic 35.0%
TTGAAGCTATGACAGAAACA+AGG - Chr4:25914089-25914108 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTCAATTTGCCAATACT+TGG + Chr4:25912669-25912688 None:intergenic 35.0%
TTTATGAGTATATGGATCGC+GGG - Chr4:25914170-25914189 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
! AATAAGTATTGCATTGGCGA+AGG - Chr4:25913947-25913966 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTTTCCAAGATACCCTTT+TGG - Chr4:25912485-25912504 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTTCCAAGATACCCTTTT+GGG - Chr4:25912486-25912505 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
! GATTGATGATAAGAGAGCAT+TGG - Chr4:25914210-25914229 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
! GGTGTTATACCTGAAAACAT+CGG - Chr4:25912267-25912286 MsG0480019726.01.T01:intron 35.0%
! TCCAATTCAAGCTACTTTGT+TGG - Chr4:25911954-25911973 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
! TGAAAAACCTTACATCGGTT+AGG + Chr4:25912692-25912711 None:intergenic 35.0%
! TGGAAATAAGCTTTCTGGTA+AGG - Chr4:25913214-25913233 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
!! CAGGTATTGCAAGTTTTTAC+AGG + Chr4:25913042-25913061 None:intergenic 35.0%
!! GGACAGTTTCTAAGACTTAT+TGG + Chr4:25912882-25912901 None:intergenic 35.0%
!! TGGAACTTGATTGGTCTAAA+CGG - Chr4:25914230-25914249 MsG0480019726.01.T01:CDS 35.0%
!!! GATGTTTTCAGGTATAACAC+CGG + Chr4:25912268-25912287 None:intergenic 35.0%
AGCAACAATCAAGGTCTATG+TGG - Chr4:25913650-25913669 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
AGGTCTATGTGGTAGTTTCA+AGG - Chr4:25913661-25913680 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
ATACTGATAAGCCCAGAACT+GGG + Chr4:25912456-25912475 None:intergenic 40.0%
CAACACAAACACCATGTTCA+TGG - Chr4:25912103-25912122 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
CCAAGGTTTCCAATTTGGAA+AGG + Chr4:25913386-25913405 None:intergenic 40.0%
CCAGCAAATGAAGTCCAAAT+AGG + Chr4:25914421-25914440 None:intergenic 40.0%
CCTATAGTTGCTTCTTTAGG+AGG - Chr4:25913755-25913774 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
CCTATTTGGACTTCATTTGC+TGG - Chr4:25914418-25914437 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
CCTCCTAAAGAAGCAACTAT+AGG + Chr4:25913758-25913777 None:intergenic 40.0%
CCTTTCCAAATTGGAAACCT+TGG - Chr4:25913383-25913402 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
GCATCCTTTAACAGTTTCAC+CGG - Chr4:25912849-25912868 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
GGAGAAATTCCGATTCAGAT+AGG - Chr4:25913302-25913321 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
GGCACAATTCCTTTCCAAAT+TGG - Chr4:25913374-25913393 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
GGTCCTATTCCTTCATCTTT+AGG - Chr4:25912582-25912601 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
GGTCGATTACCAAACGAAAT+AGG - Chr4:25912510-25912529 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
GGTCTATGTGGTAGTTTCAA+GGG - Chr4:25913662-25913681 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
GTCAATTTGCCAATACTTGG+TGG + Chr4:25912666-25912685 None:intergenic 40.0%
GTTTACAAAGCCAAACTGGA+AGG - Chr4:25913983-25914002 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
TACACTTCTCATAGTAGGTC+TGG + Chr4:25914864-25914883 None:intergenic 40.0%
TACCATCAGGAAACAAACGA+CGG + Chr4:25912425-25912444 None:intergenic 40.0%
TATTTGACCTCCTTCCAGTT+TGG + Chr4:25913996-25914015 None:intergenic 40.0%
TCATAGTAGGTCTGGATTGA+GGG + Chr4:25914856-25914875 None:intergenic 40.0%
TTCAGCTATAATACGGTCCA+AGG - Chr4:25912993-25913012 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
TTGGCATATACTGGACTTGA+AGG - Chr4:25912171-25912190 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
TTGGCTGGTAATTCAGTGAA+TGG - Chr4:25913065-25913084 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGTGGAAATAAGCTTTC+TGG - Chr4:25913209-25913228 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
! AAACCTTACATCGGTTAGGT+TGG + Chr4:25912688-25912707 None:intergenic 40.0%
! ACTTCATTTGCTGGCACATA+TGG - Chr4:25914427-25914446 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGACTTGAGCAACAATCA+AGG - Chr4:25913641-25913660 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
! GAAAGAACACCGATGTTTTC+AGG + Chr4:25912279-25912298 None:intergenic 40.0%
! GAAGCATTTGCAATTTGTGG+AGG + Chr4:25913170-25913189 None:intergenic 40.0%
! GAAGCTCATGTCTCAGATTT+TGG - Chr4:25914367-25914386 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
! GCTCTCCATTTCTAGAAACT+GGG + Chr4:25914888-25914907 None:intergenic 40.0%
! GGTAAGGTGCCAATTGAAAT+TGG - Chr4:25913230-25913249 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
! GGTTACGCAGATCAAGATTT+TGG - Chr4:25912942-25912961 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
! TACAGAGCTTGCTTACACAA+TGG - Chr4:25914610-25914629 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
! TGTAGCCCAGTTTCTAGAAA+TGG - Chr4:25914880-25914899 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
!! AGAGAGCATTGGAACTTGAT+TGG - Chr4:25914221-25914240 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
!! CACAGTGCCATTTAGGTTAT+TGG + Chr4:25912715-25912734 None:intergenic 40.0%
!! CATTTTGAAGGAGTTGGCAT+TGG - Chr4:25914796-25914815 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
!! TCTCAGATTTTGGTACTGCA+AGG - Chr4:25914377-25914396 MsG0480019726.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGCCACTTTTGCAAACTTG+AGG + Chr4:25912813-25912832 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTGAGATCGAGACGAAGA+AGG + Chr4:25912233-25912252 None:intergenic 40.0%
ACATATGGTTATGCTGCTCC+AGG - Chr4:25914442-25914461 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
AGATCGAGACGAAGAAGGTT+AGG + Chr4:25912228-25912247 None:intergenic 45.0%
AGCTATAATACGGTCCAAGG+TGG - Chr4:25912996-25913015 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
CAAACACCATGTTCATGGAG+AGG - Chr4:25912108-25912127 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
CCACCTCAAGTTTGCAAAAG+TGG - Chr4:25912807-25912826 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
CTCATAGTAGGTCTGGATTG+AGG + Chr4:25914857-25914876 None:intergenic 45.0%
CTGAATTACCAGCCAAACTC+AGG + Chr4:25913061-25913080 None:intergenic 45.0%
GAGGGTAATGTTCCTAAGAG+TGG - Chr4:25913590-25913609 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
GATACTGATAAGCCCAGAAC+TGG + Chr4:25912457-25912476 None:intergenic 45.0%
GCTCTATGCCAAATCACTTC+AGG - Chr4:25911991-25912010 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGAGGTCAAATATTCG+CGG - Chr4:25914000-25914019 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
GGCTCAATACCACCAAGTAT+TGG - Chr4:25912654-25912673 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
GTGATACCTCTCCATGAACA+TGG + Chr4:25912117-25912136 None:intergenic 45.0%
GTGTCAGTCCTGAAGTGATT+TGG + Chr4:25912002-25912021 None:intergenic 45.0%
TACAAAGCCAAACTGGAAGG+AGG - Chr4:25913986-25914005 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
TCATCAAGCGAACCAAGTGA+TGG - Chr4:25913704-25913723 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
TGACCAACCTAACCGATGTA+AGG - Chr4:25912682-25912701 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
TGGACCGGTGAAACTGTTAA+AGG + Chr4:25912856-25912875 None:intergenic 45.0%
TGGGCTACACTTCTCATAGT+AGG + Chr4:25914869-25914888 None:intergenic 45.0%
TTGCAATACCTGAGTTTGGC+TGG - Chr4:25913050-25913069 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
! GGCTCTCCATTTCTAGAAAC+TGG + Chr4:25914889-25914908 None:intergenic 45.0%
! GTACTGATAAGCCCAGTTCT+GGG - Chr4:25912442-25912461 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
! GTGGTATTGAGCCAGAGAAT+TGG + Chr4:25912647-25912666 None:intergenic 45.0%
! GTTCTGGGCTTATCAGTATC+AGG - Chr4:25912457-25912476 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
! TTCCAAGATACCCTTTTGGG+CGG - Chr4:25912489-25912508 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTCACTTCCTCCATCACT+TGG + Chr4:25913719-25913738 None:intergenic 45.0%
! TTTGAGGTGAAGGTAAGCGA+GGG + Chr4:25914772-25914791 None:intergenic 45.0%
!! ATTCTAACAGGAAAGCACCC+TGG - Chr4:25914683-25914702 MsG0480019726.01.T01:CDS 45.0%
!! CCACTTTTGCAAACTTGAGG+TGG + Chr4:25912810-25912829 None:intergenic 45.0%
!!! TTTTGAGGTGAAGGTAAGCG+AGG + Chr4:25914773-25914792 None:intergenic 45.0%
AGGCGCGCTTCTTCTTTCAT+TGG - Chr4:25913775-25913794 MsG0480019726.01.T01:CDS 50.0%
CTGGGCTTATCAGTACCATC+AGG + Chr4:25912438-25912457 None:intergenic 50.0%
GACCGTCGTTTGTTTCCTGA+TGG - Chr4:25912420-25912439 MsG0480019726.01.T01:CDS 50.0%
GATCTGCGTAACCGGTTAAC+TGG + Chr4:25912935-25912954 None:intergenic 50.0%
GGCACTGTGCCACAAGAATT+TGG - Chr4:25912726-25912745 MsG0480019726.01.T01:CDS 50.0%
GTTTCACGAAACGACGTGTC+TGG - Chr4:25912390-25912409 MsG0480019726.01.T01:CDS 50.0%
TATGGATCGCGGGACTTTAG+AGG - Chr4:25914180-25914199 MsG0480019726.01.T01:CDS 50.0%
TCAAGCGAACCAAGTGATGG+AGG - Chr4:25913707-25913726 MsG0480019726.01.T01:CDS 50.0%
TGGTAATCGACCGCCCAAAA+GGG + Chr4:25912502-25912521 None:intergenic 50.0%
! TTGGTAATCGACCGCCCAAA+AGG + Chr4:25912503-25912522 None:intergenic 50.0%
!! CTTGTGGCACAGTGCCATTT+AGG + Chr4:25912722-25912741 None:intergenic 50.0%
!! GGTACTGATAAGCCCAGTTC+TGG - Chr4:25912441-25912460 MsG0480019726.01.T01:CDS 50.0%
!! GACCGCCCAAAAGGGTATCT+TGG + Chr4:25912494-25912513 None:intergenic 55.0%
! TGCATTGGCGAAGGCGCGTT+TGG - Chr4:25913956-25913975 MsG0480019726.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 25911919 25914913 25911919 ID=MsG0480019726.01;Name=MsG0480019726.01
Chr4 mRNA 25911919 25914913 25911919 ID=MsG0480019726.01.T01;Parent=MsG0480019726.01;Name=MsG0480019726.01.T01;_AED=0.16;_eAED=0.17;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|947
Chr4 exon 25912369 25914913 25912369 ID=MsG0480019726.01.T01:exon:5508;Parent=MsG0480019726.01.T01
Chr4 exon 25911919 25912217 25911919 ID=MsG0480019726.01.T01:exon:5507;Parent=MsG0480019726.01.T01
Chr4 CDS 25912369 25914913 25912369 ID=MsG0480019726.01.T01:cds;Parent=MsG0480019726.01.T01
Chr4 CDS 25911919 25912217 25911919 ID=MsG0480019726.01.T01:cds;Parent=MsG0480019726.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480019726.01.T01

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Protein sequence

>MsG0480019726.01.T01

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