AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880043828.01


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MsG0880043828.01.T01 AT1G56145 42.059 340 159 5 264 573 674 1005 5.74e-75 258
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MsG0880043828.01.T01 AT3G09010 44.291 289 156 4 270 557 39 323 6.21e-74 242
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MsG0880043828.01.T01 AT1G70530 34.783 460 257 12 58 483 76 526 2.25e-73 244
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MsG0880043828.01.T01 AT3G16030 61.081 185 72 0 259 443 530 714 1.40e-68 236
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MsG0880043828.01.T01 AT1G68690 37.736 371 207 6 186 552 301 651 1.40e-67 233
MsG0880043828.01.T01 AT1G26150 44.366 284 150 4 273 552 426 705 2.57e-67 233
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MsG0880043828.01.T01 AT4G11900 54.545 220 92 1 241 452 493 712 2.70e-67 233
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MsG0880043828.01.T01 AT1G29730 54.091 220 98 2 264 483 627 843 1.57e-66 234
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MsG0880043828.01.T01 AT1G56720 41.034 290 167 3 270 558 172 458 2.06e-65 222
MsG0880043828.01.T01 AT1G56720 41.034 290 167 3 270 558 172 458 2.06e-65 222
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MsG0880043828.01.T01 AT1G52290 40.138 289 158 5 270 550 136 417 4.14e-64 219
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MsG0880043828.01.T01 AT1G34210 43.667 300 162 6 260 555 288 584 6.35e-63 219
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MsG0880043828.01.T01 AT1G55200 41.463 287 163 4 270 555 372 654 1.89e-62 218
MsG0880043828.01.T01 AT1G55200 41.463 287 163 4 270 555 372 654 1.89e-62 218
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MsG0880043828.01.T01 AT5G10290 42.525 301 164 6 260 555 273 569 2.96e-61 214
MsG0880043828.01.T01 AT3G09010 49.282 209 102 3 270 477 39 244 3.27e-61 205
MsG0880043828.01.T01 AT1G60800 42.140 299 167 5 260 555 284 579 3.64e-61 214
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MsG0880043828.01.T01 AT1G52290 47.887 213 107 3 270 482 136 344 4.95e-61 207
MsG0880043828.01.T01 AT4G32710 43.403 288 152 5 270 550 382 665 4.99e-61 216
MsG0880043828.01.T01 AT4G02630 38.832 291 173 3 267 555 152 439 5.95e-61 210
MsG0880043828.01.T01 AT1G07870 38.182 330 196 7 264 588 90 416 6.88e-61 211
MsG0880043828.01.T01 AT3G13690 38.323 334 196 7 270 597 404 733 7.09e-61 216
MsG0880043828.01.T01 AT3G13690 38.323 334 196 7 270 597 404 733 7.09e-61 216
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MsG0880043828.01.T01 AT4G01330 38.621 290 174 3 267 555 152 438 7.16e-61 209
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MsG0880043828.01.T01 AT1G06700 37.700 313 186 3 245 550 36 346 1.83e-56 194
MsG0880043828.01.T01 AT5G47070 38.310 355 179 13 222 558 46 378 1.94e-56 196
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MsG0880043828.01.T01 AT3G45420 40.214 281 163 4 270 550 343 618 2.58e-56 201
MsG0880043828.01.T01 AT1G69730 37.419 310 187 5 270 577 440 744 2.68e-56 203
MsG0880043828.01.T01 AT5G01020 36.842 361 201 11 199 550 4 346 3.09e-56 195
MsG0880043828.01.T01 AT2G17220 40.850 306 156 6 261 550 70 366 4.00e-56 195
MsG0880043828.01.T01 AT2G17220 40.850 306 156 6 261 550 71 367 4.14e-56 195
MsG0880043828.01.T01 AT5G15080 38.170 317 167 8 252 550 117 422 4.31e-56 197
MsG0880043828.01.T01 AT2G23200 37.421 318 183 7 264 578 475 779 4.37e-56 203
MsG0880043828.01.T01 AT5G60270 39.274 303 172 8 270 567 334 629 5.54e-56 201
MsG0880043828.01.T01 AT2G32800 40.000 320 161 8 274 565 114 430 7.60e-56 202
MsG0880043828.01.T01 AT2G32800 35.664 286 175 6 273 550 528 812 1.76e-42 164
MsG0880043828.01.T01 AT3G01300 39.799 299 151 8 270 550 129 416 9.26e-56 196
MsG0880043828.01.T01 AT1G01540 42.797 236 125 4 267 495 144 376 1.03e-55 193
MsG0880043828.01.T01 AT5G48740 39.510 286 159 5 270 550 601 877 1.07e-55 202
MsG0880043828.01.T01 AT1G16130 38.267 277 168 2 270 546 409 682 1.07e-55 201
MsG0880043828.01.T01 AT2G39660 38.361 305 173 5 270 562 60 361 1.09e-55 193
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT2G30740 36.422 313 190 3 245 550 39 349 1.24e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT4G34500 37.037 297 177 5 270 563 138 427 1.52e-55 194
MsG0880043828.01.T01 AT4G29050 43.262 282 151 7 273 550 340 616 1.83e-55 199
MsG0880043828.01.T01 AT4G29050 43.262 282 151 7 273 550 354 630 1.85e-55 199
MsG0880043828.01.T01 AT1G76360 39.661 295 163 5 267 550 153 443 1.94e-55 195
MsG0880043828.01.T01 AT3G46760 38.667 300 170 6 269 567 42 328 2.38e-55 191
MsG0880043828.01.T01 AT1G07570 39.159 309 159 8 261 550 52 350 2.69e-55 193
MsG0880043828.01.T01 AT1G07570 39.159 309 159 8 261 550 52 350 2.69e-55 193
MsG0880043828.01.T01 AT1G07570 39.159 309 159 8 261 550 52 350 2.69e-55 193
MsG0880043828.01.T01 AT3G59740 40.071 282 162 4 273 550 329 607 3.22e-55 198
MsG0880043828.01.T01 AT5G55830 37.578 322 193 6 270 586 358 676 5.17e-55 198
MsG0880043828.01.T01 AT1G48210 37.627 295 175 3 262 550 53 344 5.20e-55 191
MsG0880043828.01.T01 AT1G48210 37.627 295 175 3 262 550 53 344 5.20e-55 191
MsG0880043828.01.T01 AT1G48210 37.627 295 175 3 262 550 53 344 5.20e-55 191
MsG0880043828.01.T01 AT1G48210 37.627 295 175 3 262 550 53 344 5.20e-55 191
MsG0880043828.01.T01 AT3G59750 40.502 279 162 3 273 550 299 574 5.43e-55 197
MsG0880043828.01.T01 AT5G11020 36.333 300 185 3 252 550 55 349 5.92e-55 191
MsG0880043828.01.T01 AT1G07570 39.159 309 159 8 261 550 63 361 8.67e-55 192
MsG0880043828.01.T01 AT1G79680 36.677 319 194 5 270 587 426 737 9.60e-55 199
MsG0880043828.01.T01 AT5G11020 36.333 300 185 3 252 550 78 372 9.61e-55 191
MsG0880043828.01.T01 AT5G11020 36.333 300 185 3 252 550 82 376 1.41e-54 191
MsG0880043828.01.T01 AT5G35580 41.156 294 154 9 267 550 81 365 1.56e-54 193
MsG0880043828.01.T01 AT5G35580 41.156 294 154 9 267 550 69 353 1.73e-54 193
MsG0880043828.01.T01 AT5G11020 36.333 300 185 3 252 550 116 410 1.86e-54 191
MsG0880043828.01.T01 AT3G05140 36.176 340 189 7 219 550 90 409 2.25e-54 192
MsG0880043828.01.T01 AT3G05140 36.176 340 189 7 219 550 138 457 2.73e-54 192
MsG0880043828.01.T01 AT1G72300 36.972 284 173 4 267 547 791 1071 2.77e-54 199
MsG0880043828.01.T01 AT1G70110 40.283 283 160 6 273 552 340 616 3.18e-54 196
MsG0880043828.01.T01 AT2G02800 40.132 304 161 9 270 560 76 371 4.84e-54 190
MsG0880043828.01.T01 AT2G02800 40.132 304 161 9 270 560 76 371 4.84e-54 190
MsG0880043828.01.T01 AT5G16500 39.929 283 162 6 273 550 70 349 4.95e-54 194
MsG0880043828.01.T01 AT5G61350 39.583 288 166 3 265 547 513 797 5.84e-54 197
MsG0880043828.01.T01 AT5G18910 37.457 291 172 6 270 559 185 466 6.68e-54 192
MsG0880043828.01.T01 AT1G52540 36.877 301 185 3 251 550 11 307 7.01e-54 187
MsG0880043828.01.T01 AT2G28930 37.954 303 171 7 261 550 53 351 7.08e-54 189
MsG0880043828.01.T01 AT2G30730 36.246 309 188 3 249 550 29 335 7.74e-54 187
MsG0880043828.01.T01 AT2G28930 37.954 303 171 7 261 550 56 354 7.76e-54 189
MsG0880043828.01.T01 AT1G16120 38.628 277 167 2 270 546 422 695 7.94e-54 196
MsG0880043828.01.T01 AT1G16150 38.628 277 167 2 270 546 417 690 9.15e-54 196
MsG0880043828.01.T01 AT1G54820 38.851 296 159 7 270 550 140 428 1.11e-53 190
MsG0880043828.01.T01 AT2G28930 37.954 303 171 7 261 550 64 362 1.26e-53 189
MsG0880043828.01.T01 AT2G07180 37.855 317 181 8 243 550 58 367 1.54e-53 189
MsG0880043828.01.T01 AT2G07180 37.855 317 181 8 243 550 58 367 1.54e-53 189
MsG0880043828.01.T01 AT1G24030 36.806 288 172 6 270 550 1 285 2.71e-53 184
MsG0880043828.01.T01 AT1G16260 37.184 277 171 2 270 546 374 647 2.71e-53 194
MsG0880043828.01.T01 AT1G16260 37.184 277 171 2 270 546 383 656 2.76e-53 194
MsG0880043828.01.T01 AT1G16260 37.184 277 171 2 270 546 383 656 2.76e-53 194
MsG0880043828.01.T01 AT2G30730 36.246 309 188 3 249 550 19 325 2.89e-53 185
MsG0880043828.01.T01 AT1G52540 37.895 285 172 3 267 550 30 310 3.03e-53 186
MsG0880043828.01.T01 AT1G67720 38.947 285 165 5 265 547 596 873 3.52e-53 196
MsG0880043828.01.T01 AT5G37450 37.793 299 177 4 267 563 418 709 4.34e-53 194
MsG0880043828.01.T01 AT5G53890 37.586 290 173 4 270 558 747 1029 4.80e-53 196
MsG0880043828.01.T01 AT1G30570 41.197 284 158 7 267 547 510 787 5.27e-53 194
MsG0880043828.01.T01 AT3G15890 32.597 362 231 5 239 597 3 354 6.39e-53 185
MsG0880043828.01.T01 AT3G55450 37.415 294 168 5 270 550 54 344 6.73e-53 186
MsG0880043828.01.T01 AT1G24030 36.770 291 174 6 267 550 52 339 7.09e-53 185
MsG0880043828.01.T01 AT1G34300 36.486 296 180 5 270 563 479 768 7.09e-53 194
MsG0880043828.01.T01 AT3G53840 38.328 287 166 4 270 548 347 630 7.92e-53 191
MsG0880043828.01.T01 AT2G43690 37.805 328 186 10 276 595 296 613 8.73e-53 191

Find 113 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 206 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTTGTTGAATTACAGTTAA+AGG 0.232780 8:+31280704 None:intergenic
ACATGATCACGGAAAGATTT+AGG 0.250979 8:+31280767 None:intergenic
ACAAAGACAAAGAGAGTTAT+TGG 0.256938 8:-31279802 MsG0880043828.01.T01:CDS
AAATGATATTTACCTGGATT+TGG 0.265672 8:+31281240 None:intergenic
TGAACTTTGATCTTCATTCT+TGG 0.269126 8:+31279133 None:intergenic
TGAAAGTTAAGGCTTGAATT+TGG 0.275137 8:+31280343 None:intergenic
TTAATCCATACCTTGTAAAC+TGG 0.294594 8:+31280632 None:intergenic
CTTGTGTTAGAAATAATTTA+TGG 0.298309 8:-31279611 MsG0880043828.01.T01:CDS
AACCCAGCCATAGCGTATTC+TGG 0.314405 8:+31279671 None:intergenic
AAATTAGGAGAAGGTGGATT+TGG 0.316113 8:-31280656 MsG0880043828.01.T01:CDS
TGACGTTTCTGAAAGCCTTT+TGG 0.316515 8:+31280492 None:intergenic
GAAAGCGAGCAATGTTCTTC+TGG 0.320970 8:-31279893 MsG0880043828.01.T01:CDS
GCTGTGGAACAAAGGTAAAA+TGG 0.323268 8:-31281344 MsG0880043828.01.T01:CDS
AATGCTGGTTGCATGGGTTT+TGG 0.330910 8:+31279173 None:intergenic
AAATGACTCCGAAAAGTTAT+CGG 0.342104 8:+31280679 None:intergenic
AAGGAGGCGATTCAGTTTGC+AGG 0.356130 8:+31281268 None:intergenic
ATCTACTGCTTTCTCAAGTT+CGG 0.359460 8:+31281542 None:intergenic
AGACGGGTGCAGATATTGTT+TGG 0.360106 8:-31281394 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATCGCTCAACGTTGTCCATA+TGG 0.367733 8:-31281687 MsG0880043828.01.T01:CDS
GAACTCTCCCACTGCCCAAT+TGG 0.378802 8:+31281476 None:intergenic
CAAGAAAAGGATTCGTTGAA+TGG 0.383268 8:-31280743 MsG0880043828.01.T01:CDS
CCGTGATCATGTTCAAGAAA+AGG 0.383432 8:-31280756 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATGGCGTCTCGGCTATGATA+TGG 0.394093 8:-31281668 MsG0880043828.01.T01:CDS
TTTGTTGAATTACAGTTAAA+GGG 0.398959 8:+31280705 None:intergenic
AGAGTTATTGGCACCTTGTA+CGG 0.411331 8:-31279790 MsG0880043828.01.T01:CDS
TGAAGAAAATGAAAAGATAC+TGG 0.417341 8:-31280380 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATCTAGGTGAAAGAATAGTT+AGG 0.418637 8:+31279075 None:intergenic
GATTGTCGTGGTGACATAAC+AGG 0.423439 8:-31281750 MsG0880043828.01.T01:CDS
ACCCCGTCATGGAATTTAAC+CGG 0.423638 8:-31281588 MsG0880043828.01.T01:CDS
AGAAACCTTGTGAGACTCTT+GGG 0.424853 8:-31280412 MsG0880043828.01.T01:CDS
CTACAGAAGCTAATTCCAAT+TGG 0.425705 8:-31281491 MsG0880043828.01.T01:CDS
GATGACATGAGGAATTTGAT+AGG 0.431298 8:-31281522 MsG0880043828.01.T01:CDS
ACGTTAGAAACCTTCTTCAA+TGG 0.436026 8:-31281878 MsG0880043828.01.T01:CDS
GCTGCAATTTCGGTCCCATC+TGG 0.444239 8:+31280514 None:intergenic
TAGAAACCTTGTGAGACTCT+TGG 0.447176 8:-31280413 MsG0880043828.01.T01:CDS
TTCCGGTTAAATTCCATGAC+GGG 0.447950 8:+31281586 None:intergenic
TCCACTGTTGTTCGCATGCT+AGG 0.449568 8:-31279215 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATCATAGCCGAGACGCCATA+TGG 0.455313 8:+31281672 None:intergenic
ATATTGTTTGGAAACTATGT+TGG 0.458310 8:-31281382 MsG0880043828.01.T01:CDS
GCTCCAGAATACGCTATGGC+TGG 0.469569 8:-31279674 MsG0880043828.01.T01:CDS
AACGATAATGTCAACTATCT+AGG 0.472221 8:+31279059 None:intergenic
ATCTGCACCCGTCTTTAGTA+AGG 0.474152 8:+31281403 None:intergenic
TGGATTTGGCCCAGTTTACA+AGG 0.474723 8:-31280642 MsG0880043828.01.T01:intron
CGAACAACAGTGGACATCAT+TGG 0.482036 8:+31279224 None:intergenic
AATGATGGTGATGTTGTGTA+TGG 0.483590 8:-31281780 MsG0880043828.01.T01:CDS
TACTGAAAAGGTGAAAGTTA+AGG 0.484020 8:+31280332 None:intergenic
CCTCCTTCGTTGCCAAATCC+AGG 0.484608 8:-31281252 MsG0880043828.01.T01:intron
GAGTTATTGGCACCTTGTAC+GGG 0.487973 8:-31279789 MsG0880043828.01.T01:intron
TCATTTAAATTAGGAGAAGG+TGG 0.490276 8:-31280662 MsG0880043828.01.T01:CDS
CTGTGGAACAAAGGTAAAAT+GGG 0.492413 8:-31281343 MsG0880043828.01.T01:CDS
TTTGTCTAAACATACTGAAA+AGG 0.497570 8:+31280320 None:intergenic
GTTTGCAGACTTGGAAACTC+TGG 0.498662 8:-31279367 MsG0880043828.01.T01:intron
CTTTCAGAAACGTCAGGTCA+AGG 0.505514 8:-31280484 MsG0880043828.01.T01:CDS
CACCGAGAAAAGGTATGGTT+GGG 0.509492 8:-31281442 MsG0880043828.01.T01:CDS
TCTAGGTGAAAGAATAGTTA+GGG 0.509605 8:+31279076 None:intergenic
TCAATTTCCATTCCACAACT+AGG 0.511388 8:+31281309 None:intergenic
TTGAAGAAGGTTTCTAACGT+TGG 0.517245 8:+31281881 None:intergenic
AACTGAAAATGCTGGTTGCA+TGG 0.521478 8:+31279166 None:intergenic
TACAGAAGCTAATTCCAATT+GGG 0.522229 8:-31281490 MsG0880043828.01.T01:CDS
TGTTGCTGTTTATGGCTATG+TGG 0.524913 8:+31281820 None:intergenic
GGACCGAAATTGCAGCCAAA+AGG 0.525192 8:-31280507 MsG0880043828.01.T01:CDS
AACGTCAGGTCAAGGTTTAG+AGG 0.526615 8:-31280476 MsG0880043828.01.T01:CDS
AGCTAATTCCAATTGGGCAG+TGG 0.527005 8:-31281484 MsG0880043828.01.T01:CDS
GGGCAGTGGGAGAGTTCGAT+TGG 0.528743 8:-31281470 MsG0880043828.01.T01:CDS
ACAAACAACAATGATAATGA+TGG 0.529290 8:-31281795 MsG0880043828.01.T01:CDS
GTTCCGGTTAAATTCCATGA+CGG 0.535268 8:+31281585 None:intergenic
CCACTGTTGTTCGCATGCTA+GGG 0.536349 8:-31279214 MsG0880043828.01.T01:CDS
ACACCGAGAAAAGGTATGGT+TGG 0.542615 8:-31281443 MsG0880043828.01.T01:CDS
AAAAGGCTTTCAGAAACGTC+AGG 0.543799 8:-31280490 MsG0880043828.01.T01:CDS
TATTCTGACCACAATACGTC+AGG 0.545612 8:-31281624 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATTGGAGTGACACCGAGAAA+AGG 0.548421 8:-31281452 MsG0880043828.01.T01:CDS
TATTAGGGTACTTTACCAGA+TGG 0.548788 8:-31280529 MsG0880043828.01.T01:intron
ACTTGGAAACTCTGGTGTGA+AGG 0.549176 8:-31279359 MsG0880043828.01.T01:CDS
GAGTCATTTAAATTAGGAGA+AGG 0.552303 8:-31280665 MsG0880043828.01.T01:CDS
AAGTTTCTGCAACCCCGTCA+TGG 0.552871 8:-31281599 MsG0880043828.01.T01:CDS
ACTGAAAATGCTGGTTGCAT+GGG 0.553982 8:+31279167 None:intergenic
ATTAGGGTACTTTACCAGAT+GGG 0.555957 8:-31280528 MsG0880043828.01.T01:intron
CCTGGATTTGGCAACGAAGG+AGG 0.558420 8:+31281252 None:intergenic
GCTAATTCCAATTGGGCAGT+GGG 0.560598 8:-31281483 MsG0880043828.01.T01:CDS
TACAAGAAGACGCGGCAGAT+CGG 0.564706 8:-31279247 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATACTGACCTTACTAAAGAC+GGG 0.568604 8:-31281410 MsG0880043828.01.T01:CDS
AATACTGACCTTACTAAAGA+CGG 0.570096 8:-31281411 MsG0880043828.01.T01:CDS
TAATCCATACCTTGTAAACT+GGG 0.570521 8:+31280633 None:intergenic
TGGTATGACATATGTGTCAT+CGG 0.572035 8:-31281648 MsG0880043828.01.T01:CDS
GTCATGAAGTGTATTCACAT+TGG 0.572670 8:-31279281 MsG0880043828.01.T01:CDS
TCTCTGTGGATTACTCTAAG+TGG 0.572845 8:+31279919 None:intergenic
GAAGGTTTCTAACGTTGGAT+CGG 0.576204 8:+31281886 None:intergenic
TCCTCAGTGCTGTGGAACAA+AGG 0.578478 8:-31281352 MsG0880043828.01.T01:CDS
CTCCAGAATACGCTATGGCT+GGG 0.584422 8:-31279673 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATTACAGTTAAAGGGATCGT+AGG 0.586730 8:+31280713 None:intergenic
TTACCTGGATTTGGCAACGA+AGG 0.592840 8:+31281249 None:intergenic
ACGTTGTCCATATGGCGTCT+CGG 0.594942 8:-31281679 MsG0880043828.01.T01:CDS
TGCTCGCTTTCATATCTCTG+TGG 0.598021 8:+31279905 None:intergenic
CAGTTAAAGGGATCGTAGGA+AGG 0.603103 8:+31280717 None:intergenic
AGGACTTCTATACCTTCATG+AGG 0.607990 8:-31279947 MsG0880043828.01.T01:CDS
AGTGACACCGAGAAAAGGTA+TGG 0.615388 8:-31281447 MsG0880043828.01.T01:CDS
GGTGTCTCCTAGTTGTGGAA+TGG 0.615602 8:-31281316 MsG0880043828.01.T01:CDS
CATGGCTCCAGAATACGCTA+TGG 0.616801 8:-31279678 MsG0880043828.01.T01:CDS
AACAAAGGTAAAATGGGCAG+TGG 0.618749 8:-31281337 MsG0880043828.01.T01:CDS
TTTCTGCCAACTGAAAATGC+TGG 0.618867 8:+31279158 None:intergenic
TAAGTGGAGAATCCTCATGA+AGG 0.626848 8:+31279935 None:intergenic
AACTCCAAAGCTGAAAACAT+CGG 0.629248 8:+31279634 None:intergenic
GATAAAGTTCCTCAGTGCTG+TGG 0.629549 8:-31281360 MsG0880043828.01.T01:CDS
CCCTAGCATGCGAACAACAG+TGG 0.633234 8:+31279214 None:intergenic
TCCGGTTAAATTCCATGACG+GGG 0.633655 8:+31281587 None:intergenic
CTACGACTAAGCATTATCAA+AGG 0.635289 8:-31279979 MsG0880043828.01.T01:CDS
AGAAAGCAGTAGATGACATG+AGG 0.639025 8:-31281533 MsG0880043828.01.T01:CDS
ATTATCAAAGGAATCGCAAG+AGG 0.642508 8:-31279967 MsG0880043828.01.T01:CDS
GCAGTGGTGTCTCCTAGTTG+TGG 0.660690 8:-31281321 MsG0880043828.01.T01:CDS
TATGGTTTCTACGATTGTCG+TGG 0.673424 8:-31281762 MsG0880043828.01.T01:CDS
AGCAACCCAAGAGTCTCACA+AGG 0.706637 8:+31280407 None:intergenic
ACCTTTGTTCCACAGCACTG+AGG 0.720960 8:+31281351 None:intergenic
ATTGTGCGTACAAGAAGACG+CGG 0.749579 8:-31279255 MsG0880043828.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTTATTAATTAGAACTAAAT+CGG + Chr8:31280755-31280774 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTAGTTCTAATTAATAAA+AGG - Chr8:31280755-31280774 MsG0880043828.01.T01:CDS 10.0%
!! ATAATTTATGGAAAAAGAAA+TGG - Chr8:31281410-31281429 MsG0880043828.01.T01:CDS 15.0%
!! ATATAAAGATGAAAGAAAAT+AGG + Chr8:31280719-31280738 None:intergenic 15.0%
!! TACAAGTATAAAACTATATT+TGG + Chr8:31281551-31281570 None:intergenic 15.0%
!! AAACAAATATGGATATTTAG+AGG + Chr8:31281626-31281645 None:intergenic 20.0%
!! AAAGAATCTCTAATATGAAA+AGG - Chr8:31279921-31279940 MsG0880043828.01.T01:CDS 20.0%
!! CTTGTGTTAGAAATAATTTA+TGG - Chr8:31281398-31281417 MsG0880043828.01.T01:CDS 20.0%
!! TCAAAGTTCAAAAAATTCTA+AGG - Chr8:31281889-31281908 MsG0880043828.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGTTGAATTACAGTTAAA+GGG + Chr8:31280307-31280326 None:intergenic 20.0%
!!! AAATAGTGACTTTTTATCAT+AGG + Chr8:31280173-31280192 None:intergenic 20.0%
!!! AATCCAAAAATATCAGATTT+TGG - Chr8:31281150-31281169 MsG0880043828.01.T01:intron 20.0%
!!! AATCCAAAATCTGATATTTT+TGG + Chr8:31281156-31281175 None:intergenic 20.0%
!!! GTTCTATTGATTTTATATAG+TGG - Chr8:31281305-31281324 MsG0880043828.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTTTCGTTCATTTTTATTA+GGG - Chr8:31280465-31280484 MsG0880043828.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTTTCGTTCATTTTTATT+AGG - Chr8:31280464-31280483 MsG0880043828.01.T01:CDS 20.0%
! AAAGATGAAAGAAAATAGGA+AGG + Chr8:31280715-31280734 None:intergenic 25.0%
! AAATGATATTTACCTGGATT+TGG + Chr8:31279772-31279791 None:intergenic 25.0%
! AAATTAGAAAAGAGAGTGAA+AGG + Chr8:31279879-31279898 None:intergenic 25.0%
! ACTTAAAAAAAAACCGTAAC+TGG - Chr8:31280855-31280874 MsG0880043828.01.T01:intron 25.0%
! AGAAACATGTCAAACTTATA+CGG + Chr8:31280440-31280459 None:intergenic 25.0%
! ATATTGTTTGGAAACTATGT+TGG - Chr8:31279627-31279646 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
! ATCAACAAATTGATACTTGA+TGG - Chr8:31281499-31281518 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTGTTGAATTACAGTTAA+AGG + Chr8:31280308-31280327 None:intergenic 25.0%
! GAACTCAAGAAATGTATTTA+TGG - Chr8:31280409-31280428 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
! GTATAAAACTATATTTGGCT+TGG + Chr8:31281546-31281565 None:intergenic 25.0%
! GTTCTAATTAATAAAAGGTC+TGG - Chr8:31280760-31280779 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
! TACATTAGTAAAGGTTGTAA+GGG - Chr8:31280787-31280806 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAGAAAATGAAAAGATAC+TGG - Chr8:31280629-31280648 MsG0880043828.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAGAAATGATATTTACC+TGG + Chr8:31279778-31279797 None:intergenic 25.0%
! TTTGTCTAAACATACTGAAA+AGG + Chr8:31280692-31280711 None:intergenic 25.0%
!! ACAAACAACAATGATAATGA+TGG - Chr8:31279214-31279233 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
!! CATTTCGTTTCTCAATTTTT+AGG + Chr8:31279953-31279972 None:intergenic 25.0%
!! TTTACAAGGTATGGATTAAT+TGG - Chr8:31280381-31280400 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCCTGTTAAAAAGTGAA+TGG - Chr8:31280927-31280946 MsG0880043828.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTCGGAGTCATTTAAATT+AGG - Chr8:31280338-31280357 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATTTTATATAGTGGATACA+TGG - Chr8:31281313-31281332 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGAATTTTAACTCCTTTAGA+GGG - Chr8:31279794-31279813 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGAATTTTAACTCCTTTAG+AGG - Chr8:31279793-31279812 MsG0880043828.01.T01:CDS 25.0%
AAATACATTTCTTGAGTTCC+AGG + Chr8:31280408-31280427 None:intergenic 30.0%
AAATGACTCCGAAAAGTTAT+CGG + Chr8:31280333-31280352 None:intergenic 30.0%
AATACTGACCTTACTAAAGA+CGG - Chr8:31279598-31279617 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
AATGCAAAATGTTCCAGTTA+CGG + Chr8:31280871-31280890 None:intergenic 30.0%
ACAAAGACAAAGAGAGTTAT+TGG - Chr8:31281207-31281226 MsG0880043828.01.T01:intron 30.0%
ACATACTAAGATGATGATCA+TGG + Chr8:31280035-31280054 None:intergenic 30.0%
ACATTAGTAAAGGTTGTAAG+GGG - Chr8:31280788-31280807 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
AGAAAGAACAGGTTAAGTAA+AGG - Chr8:31280103-31280122 MsG0880043828.01.T01:intron 30.0%
ATCTAGGTGAAAGAATAGTT+AGG + Chr8:31281937-31281956 None:intergenic 30.0%
GAGTCATTTAAATTAGGAGA+AGG - Chr8:31280344-31280363 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
GTACATTAGTAAAGGTTGTA+AGG - Chr8:31280786-31280805 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
TAATCCATACCTTGTAAACT+GGG + Chr8:31280379-31280398 None:intergenic 30.0%
TACAGAAGCTAATTCCAATT+GGG - Chr8:31279519-31279538 MsG0880043828.01.T01:intron 30.0%
TACTGAAAAGGTGAAAGTTA+AGG + Chr8:31280680-31280699 None:intergenic 30.0%
TCATTTAAATTAGGAGAAGG+TGG - Chr8:31280347-31280366 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
TCTAGGTGAAAGAATAGTTA+GGG + Chr8:31281936-31281955 None:intergenic 30.0%
TCTGGTATGTACATTAGTAA+AGG - Chr8:31280778-31280797 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAGTTAAGGCTTGAATT+TGG + Chr8:31280669-31280688 None:intergenic 30.0%
TGAACTTTGATCTTCATTCT+TGG + Chr8:31281879-31281898 None:intergenic 30.0%
TTAATCCATACCTTGTAAAC+TGG + Chr8:31280380-31280399 None:intergenic 30.0%
TTTCAATTCAATCCCTCTAA+AGG + Chr8:31279809-31279828 None:intergenic 30.0%
! ATAAAAACTGATTCTGCAAC+AGG - Chr8:31279154-31279173 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
! CAGTTTTTATCCATTGAAGA+AGG + Chr8:31279144-31279163 None:intergenic 30.0%
! CTAATTTGTATCTGATGCAT+TGG - Chr8:31279892-31279911 MsG0880043828.01.T01:CDS 30.0%
! TAAGATGATGATCATGGTTT+TGG + Chr8:31280029-31280048 None:intergenic 30.0%
! TACAAAAGGATTTGGAGTTT+GGG - Chr8:31280811-31280830 MsG0880043828.01.T01:intron 30.0%
! TTTGTTGATGAGATGTGATA+AGG + Chr8:31281488-31281507 None:intergenic 30.0%
!! AAAAACAAAGGCATCTAGAT+TGG - Chr8:31281004-31281023 MsG0880043828.01.T01:intron 30.0%
!! ATTTTTCAATAACCCGTACA+AGG + Chr8:31281235-31281254 None:intergenic 30.0%
!!! AACATACGTTTTTTTGTGGA+AGG + Chr8:31281699-31281718 None:intergenic 30.0%
!!! ACATACGTTTTTTTGTGGAA+GGG + Chr8:31281698-31281717 None:intergenic 30.0%
!!! ACTTCCATTCACTTTTTAAC+AGG + Chr8:31280934-31280953 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTGTTTTGTTGCTGTTTA+TGG + Chr8:31279200-31279219 None:intergenic 30.0%
!!! TATCAGATTTTGGATTAGCA+AGG - Chr8:31281160-31281179 MsG0880043828.01.T01:intron 30.0%
!!! TCACAACATACGTTTTTTTG+TGG + Chr8:31281703-31281722 None:intergenic 30.0%
AACTAAATCGGAGCAAGTAA+AGG + Chr8:31280743-31280762 None:intergenic 35.0%
AACTCCAAAGCTGAAAACAT+CGG + Chr8:31281378-31281397 None:intergenic 35.0%
ACATGATCACGGAAAGATTT+AGG + Chr8:31280245-31280264 None:intergenic 35.0%
ACGTTAGAAACCTTCTTCAA+TGG - Chr8:31279131-31279150 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
ATACTGACCTTACTAAAGAC+GGG - Chr8:31279599-31279618 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
ATCTACTGCTTTCTCAAGTT+CGG + Chr8:31279470-31279489 None:intergenic 35.0%
ATTACAGTTAAAGGGATCGT+AGG + Chr8:31280299-31280318 None:intergenic 35.0%
ATTATCAAAGGAATCGCAAG+AGG - Chr8:31281042-31281061 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
CAAGAAAAGGATTCGTTGAA+TGG - Chr8:31280266-31280285 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
CATCATCTTAGTATGTGTAC+TGG - Chr8:31280039-31280058 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
CTACAGAAGCTAATTCCAAT+TGG - Chr8:31279518-31279537 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
CTACGACTAAGCATTATCAA+AGG - Chr8:31281030-31281049 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
CTGTGGAACAAAGGTAAAAT+GGG - Chr8:31279666-31279685 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
GATGACATGAGGAATTTGAT+AGG - Chr8:31279487-31279506 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
GTCATGAAGTGTATTCACAT+TGG - Chr8:31281728-31281747 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
TCAATTTCCATTCCACAACT+AGG + Chr8:31279703-31279722 None:intergenic 35.0%
TCCAAGAGTCTCTCATTTAA+AGG + Chr8:31281591-31281610 None:intergenic 35.0%
TCCAAGTCTGCAAACAAATA+TGG + Chr8:31281637-31281656 None:intergenic 35.0%
TCCATATTTGTTTGCAGACT+TGG - Chr8:31281633-31281652 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
TGGCAGATGAAGAAAAACAA+AGG - Chr8:31280992-31281011 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
TGGTATGACATATGTGTCAT+CGG - Chr8:31279361-31279380 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAGAAGGTTTCTAACGT+TGG + Chr8:31279131-31279150 None:intergenic 35.0%
! AAACTTTTCCTGACGTATTG+TGG + Chr8:31279396-31279415 None:intergenic 35.0%
! AAATCCGATGTTTTCAGCTT+TGG - Chr8:31281371-31281390 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
! AAATTAGGAGAAGGTGGATT+TGG - Chr8:31280353-31280372 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
! AACTGGAACATTTTGCATTG+TGG - Chr8:31280872-31280891 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
! AATGATGGTGATGTTGTGTA+TGG - Chr8:31279229-31279248 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
! ATTAGGGTACTTTACCAGAT+GGG - Chr8:31280481-31280500 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
! CCTTTTCTTGAACATGATCA+CGG + Chr8:31280256-31280275 None:intergenic 35.0%
! GTACAAAAGGATTTGGAGTT+TGG - Chr8:31280810-31280829 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
! TATTAGGGTACTTTACCAGA+TGG - Chr8:31280480-31280499 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
! TTCATGTATGATAGTGTTGC+AGG - Chr8:31279980-31279999 MsG0880043828.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACAAAGCACCGATAACTTTT+CGG - Chr8:31280322-31280341 MsG0880043828.01.T01:intron 35.0%
AAAAGGCTTTCAGAAACGTC+AGG - Chr8:31280519-31280538 MsG0880043828.01.T01:CDS 40.0%
AACAAAGGTAAAATGGGCAG+TGG - Chr8:31279672-31279691 MsG0880043828.01.T01:CDS 40.0%
ACTACTACTGGAGAAAGAAC+AGG - Chr8:31280092-31280111 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
AGAAACCTTGTGAGACTCTT+GGG - Chr8:31280597-31280616 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
AGAAAGCAGTAGATGACATG+AGG - Chr8:31279476-31279495 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
AGAGTTATTGGCACCTTGTA+CGG - Chr8:31281219-31281238 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
AGGACTTCTATACCTTCATG+AGG - Chr8:31281062-31281081 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
CATCTTAGTATGTGTACTGG+TGG - Chr8:31280042-31280061 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
CCGTGATCATGTTCAAGAAA+AGG - Chr8:31280253-31280272 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
GAAGGTTTCTAACGTTGGAT+CGG + Chr8:31279126-31279145 None:intergenic 40.0%
GCCTTTAAATGAGAGACTCT+TGG - Chr8:31281587-31281606 MsG0880043828.01.T01:CDS 40.0%
GCTGTGGAACAAAGGTAAAA+TGG - Chr8:31279665-31279684 MsG0880043828.01.T01:CDS 40.0%
GTTCCGGTTAAATTCCATGA+CGG + Chr8:31279427-31279446 None:intergenic 40.0%
TAAGTGGAGAATCCTCATGA+AGG + Chr8:31281077-31281096 None:intergenic 40.0%
TAGAAACCTTGTGAGACTCT+TGG - Chr8:31280596-31280615 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
TATGGTTTCTACGATTGTCG+TGG - Chr8:31279247-31279266 MsG0880043828.01.T01:CDS 40.0%
TATTCTGACCACAATACGTC+AGG - Chr8:31279385-31279404 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
TTCCGGTTAAATTCCATGAC+GGG + Chr8:31279426-31279445 None:intergenic 40.0%
TTTCTGCCAACTGAAAATGC+TGG + Chr8:31281854-31281873 None:intergenic 40.0%
! AACTGAAAATGCTGGTTGCA+TGG + Chr8:31281846-31281865 None:intergenic 40.0%
! AAGGTTGTAAGGGGTACAAA+AGG - Chr8:31280797-31280816 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
! ACTGAAAATGCTGGTTGCAT+GGG + Chr8:31281845-31281864 None:intergenic 40.0%
! AGGTATGGATTAATTGGACC+TGG - Chr8:31280387-31280406 MsG0880043828.01.T01:CDS 40.0%
! ATGCAACCAGCATTTTCAGT+TGG - Chr8:31281845-31281864 MsG0880043828.01.T01:CDS 40.0%
! GTAAGGGGTACAAAAGGATT+TGG - Chr8:31280803-31280822 MsG0880043828.01.T01:intron 40.0%
! TCTCTGTGGATTACTCTAAG+TGG + Chr8:31281093-31281112 None:intergenic 40.0%
!! AAGCCTTTTGGCTGCAATTT+CGG + Chr8:31280508-31280527 None:intergenic 40.0%
!! TGACGTTTCTGAAAGCCTTT+TGG + Chr8:31280520-31280539 None:intergenic 40.0%
!! TGTTGCTGTTTATGGCTATG+TGG + Chr8:31279192-31279211 None:intergenic 40.0%
AACCGGAACCAAAAACACGA+AGG - Chr8:31279438-31279457 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
AACGTCAGGTCAAGGTTTAG+AGG - Chr8:31280533-31280552 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
ACCCCGTCATGGAATTTAAC+CGG - Chr8:31279421-31279440 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
ACTTGGAAACTCTGGTGTGA+AGG - Chr8:31281650-31281669 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
AGACGGGTGCAGATATTGTT+TGG - Chr8:31279615-31279634 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
AGCTAATTCCAATTGGGCAG+TGG - Chr8:31279525-31279544 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
AGTGACACCGAGAAAAGGTA+TGG - Chr8:31279562-31279581 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
ATCGCTCAACGTTGTCCATA+TGG - Chr8:31279322-31279341 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
ATCTGCACCCGTCTTTAGTA+AGG + Chr8:31279609-31279628 None:intergenic 45.0%
ATTGGAGTGACACCGAGAAA+AGG - Chr8:31279557-31279576 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
ATTGTGCGTACAAGAAGACG+CGG - Chr8:31281754-31281773 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
CAGTTAAAGGGATCGTAGGA+AGG + Chr8:31280295-31280314 None:intergenic 45.0%
CGAACAACAGTGGACATCAT+TGG + Chr8:31281788-31281807 None:intergenic 45.0%
CTTTCAGAAACGTCAGGTCA+AGG - Chr8:31280525-31280544 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGCGAGCAATGTTCTTC+TGG - Chr8:31281116-31281135 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
GAATACGATGTTCCTCGACT+TGG - Chr8:31280972-31280991 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
GAGTTATTGGCACCTTGTAC+GGG - Chr8:31281220-31281239 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
GATAAAGTTCCTCAGTGCTG+TGG - Chr8:31279649-31279668 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
GATTGTCGTGGTGACATAAC+AGG - Chr8:31279259-31279278 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
GCTAATTCCAATTGGGCAGT+GGG - Chr8:31279526-31279545 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
GCTGTTCTGTGTACTACTAC+TGG - Chr8:31280080-31280099 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
GTTTGCAGACTTGGAAACTC+TGG - Chr8:31281642-31281661 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
TCCGGTTAAATTCCATGACG+GGG + Chr8:31279425-31279444 None:intergenic 45.0%
TGCTCGCTTTCATATCTCTG+TGG + Chr8:31281107-31281126 None:intergenic 45.0%
TGGATTTGGCCCAGTTTACA+AGG - Chr8:31280367-31280386 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
TTACCTGGATTTGGCAACGA+AGG + Chr8:31279763-31279782 None:intergenic 45.0%
TTGGCCCAGTTTACAAGGTA+TGG - Chr8:31280372-31280391 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTTCATCTGCCAAGTCG+AGG + Chr8:31280987-31281006 None:intergenic 45.0%
! ACACCGAGAAAAGGTATGGT+TGG - Chr8:31279566-31279585 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
! ACTTACTAGCTTCCTTGCCA+GGG - Chr8:31280195-31280214 MsG0880043828.01.T01:intron 45.0%
! CACCCAACCATACCTTTTCT+CGG + Chr8:31279572-31279591 None:intergenic 45.0%
! CACCGAGAAAAGGTATGGTT+GGG - Chr8:31279567-31279586 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
! GGTTGAGTCCTTCGTGTTTT+TGG + Chr8:31279449-31279468 None:intergenic 45.0%
! TGATAGTGTTGCAGGCAAAC+AGG - Chr8:31279988-31280007 MsG0880043828.01.T01:CDS 45.0%
!! AATGCTGGTTGCATGGGTTT+TGG + Chr8:31281839-31281858 None:intergenic 45.0%
!!! GTCCTTCGTGTTTTTGGTTC+CGG + Chr8:31279443-31279462 None:intergenic 45.0%
AACCCAGCCATAGCGTATTC+TGG + Chr8:31281341-31281360 None:intergenic 50.0%
AAGGAGGCGATTCAGTTTGC+AGG + Chr8:31279744-31279763 None:intergenic 50.0%
AAGTTTCTGCAACCCCGTCA+TGG - Chr8:31279410-31279429 MsG0880043828.01.T01:intron 50.0%
ACCTTTGTTCCACAGCACTG+AGG + Chr8:31279661-31279680 None:intergenic 50.0%
ACGTTGTCCATATGGCGTCT+CGG - Chr8:31279330-31279349 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
AGCAACCCAAGAGTCTCACA+AGG + Chr8:31280605-31280624 None:intergenic 50.0%
AGTGTTGCAGGCAAACAGGA+CGG - Chr8:31279992-31280011 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
ATCATAGCCGAGACGCCATA+TGG + Chr8:31279340-31279359 None:intergenic 50.0%
ATGGCGTCTCGGCTATGATA+TGG - Chr8:31279341-31279360 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
CATGGCTCCAGAATACGCTA+TGG - Chr8:31281331-31281350 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
CCACTGTTGTTCGCATGCTA+GGG - Chr8:31281795-31281814 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
CTCCAGAATACGCTATGGCT+GGG - Chr8:31281336-31281355 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
GGACCGAAATTGCAGCCAAA+AGG - Chr8:31280502-31280521 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
GGTGTCTCCTAGTTGTGGAA+TGG - Chr8:31279693-31279712 MsG0880043828.01.T01:intron 50.0%
TACAAGAAGACGCGGCAGAT+CGG - Chr8:31281762-31281781 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
TCCACTGTTGTTCGCATGCT+AGG - Chr8:31281794-31281813 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
TCCTCAGTGCTGTGGAACAA+AGG - Chr8:31279657-31279676 MsG0880043828.01.T01:CDS 50.0%
! CTTACTAGCTTCCTTGCCAG+GGG - Chr8:31280196-31280215 MsG0880043828.01.T01:intron 50.0%
! GACTTACTAGCTTCCTTGCC+AGG - Chr8:31280194-31280213 MsG0880043828.01.T01:intron 50.0%
! TTACTAGCTTCCTTGCCAGG+GGG - Chr8:31280197-31280216 MsG0880043828.01.T01:intron 50.0%
!!! CTGGTTGCATGGGTTTTGGA+AGG + Chr8:31281835-31281854 None:intergenic 50.0%
CCCTAGCATGCGAACAACAG+TGG + Chr8:31281798-31281817 None:intergenic 55.0%
CCTCCTTCGTTGCCAAATCC+AGG - Chr8:31279757-31279776 MsG0880043828.01.T01:intron 55.0%
CCTGGATTTGGCAACGAAGG+AGG + Chr8:31279760-31279779 None:intergenic 55.0%
GAACTCTCCCACTGCCCAAT+TGG + Chr8:31279536-31279555 None:intergenic 55.0%
GCAGTGGTGTCTCCTAGTTG+TGG - Chr8:31279688-31279707 MsG0880043828.01.T01:intron 55.0%
GCTCCAGAATACGCTATGGC+TGG - Chr8:31281335-31281354 MsG0880043828.01.T01:CDS 55.0%
GCTGCAATTTCGGTCCCATC+TGG + Chr8:31280498-31280517 None:intergenic 55.0%
GTGTTGCAGGCAAACAGGAC+GGG - Chr8:31279993-31280012 MsG0880043828.01.T01:CDS 55.0%
TGTTGCAGGCAAACAGGACG+GGG - Chr8:31279994-31280013 MsG0880043828.01.T01:CDS 55.0%
CAACAGCAAACCCCCTGGCA+AGG + Chr8:31280210-31280229 None:intergenic 60.0%
GGGCAGTGGGAGAGTTCGAT+TGG - Chr8:31279539-31279558 MsG0880043828.01.T01:intron 60.0%
GTCCTCAACAGCAAACCCCC+TGG + Chr8:31280215-31280234 None:intergenic 60.0%
!! TGCCAGGGGGTTTGCTGTTG+AGG - Chr8:31280210-31280229 MsG0880043828.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 31279073 31281958 31279073 ID=MsG0880043828.01;Name=MsG0880043828.01
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Gene Sequence

>MsG0880043828.01.T01

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Protein sequence

>MsG0880043828.01.T01

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