AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028176.01


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MsG0580028176.01.T01 AT3G57830 31.416 678 356 22 111 697 1 660 2.35e-78 264
MsG0580028176.01.T01 AT1G67510 31.278 681 320 18 156 696 47 719 4.87e-78 265
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MsG0580028176.01.T01 AT1G31420 32.810 573 333 21 138 691 33 572 1.05e-73 250
MsG0580028176.01.T01 AT2G23950 32.373 590 339 20 118 691 21 566 5.36e-73 249
MsG0580028176.01.T01 AT1G31420 32.810 573 332 22 138 691 33 571 1.46e-72 247
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MsG0580028176.01.T01 AT2G35620 34.518 591 336 21 118 691 13 569 2.78e-72 246
MsG0580028176.01.T01 AT2G35620 34.518 591 336 21 118 691 13 569 2.78e-72 246
MsG0580028176.01.T01 AT5G20690 30.744 618 341 19 157 697 51 658 1.51e-70 243
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MsG0580028176.01.T01 AT3G13380 33.712 528 307 14 204 708 640 1147 2.67e-69 247
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MsG0580028176.01.T01 AT4G30520 30.988 597 351 19 111 690 17 569 3.01e-67 234
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MsG0580028176.01.T01 AT3G49670 35.829 187 105 7 130 304 19 202 1.25e-18 91.3
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MsG0580028176.01.T01 AT4G28650 33.837 529 293 18 204 711 501 993 1.92e-66 237
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MsG0580028176.01.T01 AT5G63930 34.568 162 94 7 156 308 50 208 8.31e-12 69.3
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MsG0580028176.01.T01 AT1G69990 30.521 557 327 18 158 693 46 563 2.06e-63 222
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MsG0580028176.01.T01 AT2G33170 32.264 561 286 20 191 695 579 1101 4.96e-62 225
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MsG0580028176.01.T01 AT5G65700 35.567 194 108 6 130 309 17 207 4.19e-17 86.7
MsG0580028176.01.T01 AT4G22130 28.613 685 387 23 119 709 11 687 4.71e-61 218
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MsG0580028176.01.T01 AT5G10290 29.549 599 362 20 111 691 6 562 1.08e-55 201
MsG0580028176.01.T01 AT1G74360 31.296 540 320 20 182 696 575 1088 1.25e-55 206
MsG0580028176.01.T01 AT1G74360 41.481 135 73 4 195 323 365 499 3.36e-12 70.9
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MsG0580028176.01.T01 AT5G07180 34.021 194 110 8 104 288 2 186 5.87e-12 69.7
MsG0580028176.01.T01 AT5G07180 41.379 116 62 3 182 293 317 430 2.45e-11 67.8
MsG0580028176.01.T01 AT1G09970 32.348 541 278 22 191 699 472 956 3.89e-55 204
MsG0580028176.01.T01 AT5G65240 29.480 519 294 13 186 691 97 556 4.54e-55 199
MsG0580028176.01.T01 AT5G65240 29.480 519 294 13 186 691 97 556 6.56e-55 199
MsG0580028176.01.T01 AT5G61480 30.697 531 307 16 182 697 517 1001 9.08e-55 203
MsG0580028176.01.T01 AT2G13790 30.836 574 295 24 157 691 56 566 1.14e-54 198
MsG0580028176.01.T01 AT5G67280 26.110 743 363 21 118 691 14 739 3.24e-54 199
MsG0580028176.01.T01 AT5G56040 28.746 574 305 17 182 706 532 1050 6.52e-54 201
MsG0580028176.01.T01 AT5G56040 37.815 119 70 2 175 291 455 571 2.99e-12 70.9
MsG0580028176.01.T01 AT1G09970 31.978 541 281 21 191 699 472 957 7.09e-54 201
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MsG0580028176.01.T01 AT1G68690 31.477 413 236 15 308 691 253 647 1.15e-49 186
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MsG0580028176.01.T01 AT1G78530 32.873 362 207 12 338 691 9 342 1.10e-45 167
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MsG0580028176.01.T01 AT5G07620 32.153 339 208 10 369 696 29 356 2.45e-42 157
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MsG0580028176.01.T01 AT2G42960 33.121 314 191 9 410 711 166 472 2.14e-41 158
MsG0580028176.01.T01 AT2G42960 33.121 314 191 9 410 711 166 472 2.14e-41 158
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MsG0580028176.01.T01 AT1G51860 29.303 488 296 17 244 708 406 867 2.10e-40 159
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MsG0580028176.01.T01 AT4G01330 33.333 270 168 7 427 690 167 430 6.71e-40 154
MsG0580028176.01.T01 AT1G79620 34.545 275 161 9 428 693 670 934 7.35e-40 158
MsG0580028176.01.T01 AT1G79620 29.843 191 112 7 118 295 13 194 7.16e-11 66.2
MsG0580028176.01.T01 AT4G01330 33.333 270 168 7 427 690 167 430 7.58e-40 153
MsG0580028176.01.T01 AT1G52290 30.479 397 242 13 314 691 34 415 7.77e-40 154
MsG0580028176.01.T01 AT3G46400 27.559 508 304 17 222 711 406 867 9.73e-40 157
MsG0580028176.01.T01 AT1G79620 34.545 275 161 9 428 693 644 908 9.86e-40 157
MsG0580028176.01.T01 AT1G79620 29.843 191 112 7 118 295 13 194 7.34e-11 66.2
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MsG0580028176.01.T01 AT1G24650 29.888 445 273 15 269 687 386 817 3.54e-38 152
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MsG0580028176.01.T01 AT3G46330 29.429 350 204 10 355 695 499 814 6.81e-34 139
MsG0580028176.01.T01 AT2G19230 29.259 499 277 21 227 709 414 852 7.55e-34 139
MsG0580028176.01.T01 AT4G20450 27.651 481 288 18 227 695 430 862 8.13e-34 139
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MsG0580028176.01.T01 AT2G30730 32.517 286 168 10 427 696 52 328 9.21e-34 132
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MsG0580028176.01.T01 AT3G28690 34.106 302 168 12 427 709 31 320 1.50e-33 133
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MsG0580028176.01.T01 AT3G59350 35.366 246 135 10 423 656 114 347 1.94e-33 132
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MsG0580028176.01.T01 AT4G38830 29.592 392 231 11 314 690 254 615 2.23e-33 137
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MsG0580028176.01.T01 AT2G30730 32.517 286 168 10 427 696 62 338 2.65e-33 131
MsG0580028176.01.T01 AT1G56140 27.143 420 245 14 290 690 581 958 2.67e-33 138
MsG0580028176.01.T01 AT4G23280 29.226 349 218 10 359 691 277 612 2.75e-33 136
MsG0580028176.01.T01 AT5G01020 31.879 298 173 12 415 693 60 346 2.77e-33 133
MsG0580028176.01.T01 AT5G59260 29.124 388 214 14 316 691 284 622 2.78e-33 137
MsG0580028176.01.T01 AT4G23270 32.103 271 171 7 428 691 332 596 2.82e-33 136
MsG0580028176.01.T01 AT4G04490 27.865 384 227 12 320 690 257 603 2.96e-33 136
MsG0580028176.01.T01 AT4G23130 28.035 346 209 10 357 691 294 610 3.03e-33 136
MsG0580028176.01.T01 AT3G13690 32.971 276 170 8 423 691 412 679 3.70e-33 137
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MsG0580028176.01.T01 AT3G13690 32.971 276 170 8 423 691 412 679 3.70e-33 137
MsG0580028176.01.T01 AT5G02800 32.721 272 170 9 427 690 78 344 3.84e-33 132
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MsG0580028176.01.T01 AT3G28690 34.106 302 168 12 427 709 80 369 4.85e-33 132
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MsG0580028176.01.T01 AT2G28990 26.994 489 292 18 227 695 405 848 1.40e-32 135
MsG0580028176.01.T01 AT3G18810 32.432 296 174 11 414 693 324 609 1.51e-32 134
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MsG0580028176.01.T01 AT5G01950 30.201 298 182 8 423 708 627 910 1.82e-32 135
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MsG0580028176.01.T01 AT5G18910 30.921 304 177 11 403 690 168 454 1.95e-32 132
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MsG0580028176.01.T01 AT5G20480 28.442 552 297 25 189 697 501 997 2.55e-32 135
MsG0580028176.01.T01 AT5G20480 37.349 166 93 5 137 294 30 192 7.60e-20 95.5
MsG0580028176.01.T01 AT5G38210 30.986 284 181 11 416 691 364 640 2.72e-32 134
MsG0580028176.01.T01 AT5G38210 30.986 284 181 11 416 691 346 622 3.00e-32 133

Find 159 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 336 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTTCAAACAACATAGGAAAC+AGG 0.330568 5:+76185236 MsG0580028176.01.T01:intron
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ATTATTCCAGTTCAATCTTA+AGG 0.340293 5:-76183743 None:intergenic
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CTAACAACTTCATCCATTGT+TGG 0.363838 5:-76185775 None:intergenic
TAATGTATCTAAAGCTATTC+CGG 0.363948 5:-76180352 None:intergenic
CCAATCCATGAAGTGCAAAT+AGG 0.370871 5:-76183772 None:intergenic
AACAAATTGTTCTTCTTTGA+GGG 0.371771 5:+76184495 MsG0580028176.01.T01:CDS
GGAATAGATAGAATGTTAGA+TGG 0.372109 5:-76183946 None:intergenic
TTGAGCTTTAATAACTTGAA+TGG 0.375666 5:+76184120 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATGAAGCTTAGAAGAAGAAA+TGG 0.377507 5:-76183637 None:intergenic
TTATGACATTAGTTTCATTT+CGG 0.383493 5:-76183807 None:intergenic
GGAGAGTATAAGAGAATTCA+AGG 0.384437 5:-76183714 None:intergenic
AAGAGATAGAAGAAGGGATT+AGG 0.384621 5:-76184011 None:intergenic
TGTCAAAGGTGGTAGATAAT+AGG 0.384802 5:+76185752 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTCCAACAAAAGAAGTTAAA+GGG 0.386933 5:-76184170 None:intergenic
TTAGAAACATAGTGGAAATT+AGG 0.393353 5:+76185794 MsG0580028176.01.T01:CDS
AAGGAAGAACTCCATTAAAC+TGG 0.394903 5:+76185263 MsG0580028176.01.T01:CDS
GAGCCCTTTAATCCAATTCC+CGG 0.397316 5:-76183841 None:intergenic
CTTCATTCAAATGAACTTAG+TGG 0.398395 5:+76183916 MsG0580028176.01.T01:CDS
GCTCTAAGTGGTATGACATT+AGG 0.400476 5:-76184714 None:intergenic
TGACCTTGAAGACTTGTTGA+AGG 0.402250 5:+76184533 MsG0580028176.01.T01:CDS
GATGTATTCTTCTTCAACTC+AGG 0.402549 5:-76185820 None:intergenic
GAACAAATTGTTCTTCTTTG+AGG 0.402938 5:+76184494 MsG0580028176.01.T01:CDS
AAGCCTTCAACAAGTCTTCA+AGG 0.407580 5:-76184536 None:intergenic
ATCTAGTGCTTGCTCACCAT+TGG 0.407838 5:+76180073 MsG0580028176.01.T01:CDS
AAATCAAACAATATTATAGA+AGG 0.408257 5:+76180048 MsG0580028176.01.T01:CDS
CACTAAGTTCATTTGAATGA+AGG 0.408310 5:-76183915 None:intergenic
CTCCCGGGAATTGGATTAAA+GGG 0.408347 5:+76183838 MsG0580028176.01.T01:CDS
TAGGCTGCTGTTGTTTGGAA+TGG 0.409282 5:-76183863 None:intergenic
AGAAGTTGTGGTCGGAAAGA+AGG 0.409321 5:+76184647 MsG0580028176.01.T01:CDS
TCAAGTATGTTAGCATAGTA+AGG 0.410822 5:-76184095 None:intergenic
CTTACAGGGAAGATTCCATT+AGG 0.414527 5:+76185568 MsG0580028176.01.T01:CDS
GTTGGAAACTCTCTCTTATG+TGG 0.415692 5:+76184186 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTGATCTTCCAAGGTGGGTT+AGG 0.421733 5:+76185617 MsG0580028176.01.T01:CDS
GGAGGTCCAAAATTTATTCA+TGG 0.430466 5:+76185346 MsG0580028176.01.T01:CDS
TCATAACCAGAATATCCTAA+TGG 0.431223 5:-76185583 None:intergenic
GGTTGATAAGGTGTTCATAA+GGG 0.432729 5:-76185440 None:intergenic
CTTCAACACAATAATTTCTC+AGG 0.433041 5:+76183988 MsG0580028176.01.T01:CDS
TGGTTGATAAGGTGTTCATA+AGG 0.433897 5:-76185441 None:intergenic
AAGGCTTCAGCTGAAGTACT+TGG 0.433907 5:+76184552 MsG0580028176.01.T01:CDS
AGCGGCGATCTTCCTTGATT+CGG 0.435629 5:-76185500 None:intergenic
AGGTGGAGAGTATGTTGAAG+AGG 0.438635 5:+76185693 MsG0580028176.01.T01:CDS
CCTATTTGCACTTCATGGAT+TGG 0.440698 5:+76183772 MsG0580028176.01.T01:CDS
CTCATAACACAAGAACTTGA+TGG 0.445725 5:+76185391 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTGGCCCTTGAAATCATTAG+TGG 0.447116 5:+76180092 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATAGCTTTAGATACATTAGA+AGG 0.449230 5:+76180357 MsG0580028176.01.T01:CDS
GAGGTGACTAAGCCTATGTT+TGG 0.451061 5:-76180330 None:intergenic
CTCTTCAAAACTCATTGCGT+TGG 0.455999 5:+76184029 MsG0580028176.01.T01:CDS
GTGGATGGAAGCAATTCCTT+TGG 0.458033 5:-76185317 None:intergenic
AGTTAAAGGGAAGTGATTGA+TGG 0.460409 5:-76184157 None:intergenic
GAGATCCACTAATGATTTCA+AGG 0.471746 5:-76180097 None:intergenic
TGTCATAAGCATCCATCTCC+CGG 0.472103 5:+76183822 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTAATCCAATTCCCGGGAGA+TGG 0.480242 5:-76183834 None:intergenic
CTTGTTTATGACTACATGCT+AGG 0.481743 5:+76184765 MsG0580028176.01.T01:CDS
AGAAGGAGAAGGAGATGGAG+AGG 0.482653 5:-76184241 None:intergenic
GTTCATTTGAATGAAGGCTC+AGG 0.483090 5:-76183909 None:intergenic
TGGACCTCCCTCTTTGTGGA+TGG 0.487107 5:-76185332 None:intergenic
ATACTTGCATTAGCAATTGG+AGG 0.490737 5:+76184318 MsG0580028176.01.T01:CDS
CAAAACTATGAGAGATAGAA+AGG 0.491962 5:-76184346 None:intergenic
GTACTTGGAAAAGGAAGCTA+TGG 0.492696 5:+76184567 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTCTGGAGCACGGTATCCGT+TGG 0.495434 5:-76185473 None:intergenic
GGATCTTGACATGGTTGATA+AGG 0.495779 5:-76185452 None:intergenic
GTGAAGTGTTGGAGCGTGAA+AGG 0.504133 5:+76184472 MsG0580028176.01.T01:CDS
GAGCAACAGATGGAGGTTGT+TGG 0.505084 5:+76184675 MsG0580028176.01.T01:CDS
TCAGCTGAAGTACTTGGAAA+AGG 0.506408 5:+76184558 MsG0580028176.01.T01:CDS
GAAGGAGAAGGAGATGGAGA+GGG 0.510300 5:-76184240 None:intergenic
TCTCTATAAGCAACCTTCTA+GGG 0.514144 5:+76180118 MsG0580028176.01.T01:CDS
AAACTAAAGTTTCCAAACAT+AGG 0.514717 5:+76180318 MsG0580028176.01.T01:CDS
CACATGCCTTAAGATTGAAC+TGG 0.517700 5:+76183737 MsG0580028176.01.T01:CDS
GCACATGCTTCAGATTGCAT+TGG 0.517723 5:+76185723 MsG0580028176.01.T01:CDS
GACGGAGAAGGAGAAGGAGA+TGG 0.518205 5:-76184246 None:intergenic
ATTCCAAACAACAGCAGCCT+AGG 0.520447 5:+76183865 MsG0580028176.01.T01:CDS
GATGGTTGCATCGCTGATGT+TGG 0.521241 5:+76185409 MsG0580028176.01.T01:CDS
CTCCAGAAGTAACCGAATCA+AGG 0.525803 5:+76185488 MsG0580028176.01.T01:CDS
GTAGTTGACGGAGAAGGAGA+AGG 0.528421 5:-76184252 None:intergenic
AACATAGGCTTAGTCACCTC+CGG 0.528480 5:+76180333 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTCAAGAATGAAGATTGCGC+TGG 0.532295 5:+76185288 MsG0580028176.01.T01:CDS
TCCAAGGTGGGTTAGGTCGG+TGG 0.532910 5:+76185624 MsG0580028176.01.T01:CDS
AGCATAGTAAGGTTGAATAC+AGG 0.533814 5:-76184084 None:intergenic
TGAAGTTGTTAGAAACATAG+TGG 0.535485 5:+76185786 MsG0580028176.01.T01:CDS
CAGTTCAATCTTAAGGCATG+TGG 0.535626 5:-76183736 None:intergenic
GGAGTTTGAGCAACAGATGG+AGG 0.542233 5:+76184668 MsG0580028176.01.T01:CDS
TGCATTGGCTTGTGTGTCAA+AGG 0.542829 5:+76185738 MsG0580028176.01.T01:CDS
TCCCTGTAAGCATTTCAAGA+AGG 0.544487 5:-76185555 None:intergenic
GATGAGGAGATGATTAGAGG+TGG 0.549214 5:+76185676 MsG0580028176.01.T01:CDS
AACATAGGAAACAGGGGTGA+AGG 0.552948 5:+76185244 MsG0580028176.01.T01:intron
AGATTAACATATTGAAGTGA+AGG 0.554284 5:-76183967 None:intergenic
TAAAAGGTTAAGAGAAGTTG+TGG 0.556166 5:+76184635 MsG0580028176.01.T01:CDS
GAAGGAGTTTGAGCAACAGA+TGG 0.559471 5:+76184665 MsG0580028176.01.T01:CDS
AACATACAAGGCTAAATTGG+AGG 0.559738 5:+76184593 MsG0580028176.01.T01:CDS
GGTCGGTGGTTCATGAGGAA+TGG 0.561529 5:+76185638 MsG0580028176.01.T01:CDS
ACCACCGACCTAACCCACCT+TGG 0.561666 5:-76185625 None:intergenic
GGTTAGGTCGGTGGTTCATG+AGG 0.562224 5:+76185633 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATGTATTCTTCTTCAACTCA+GGG 0.571443 5:-76185819 None:intergenic
AGGTTAAGAGAAGTTGTGGT+CGG 0.572116 5:+76184639 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATGACATGGTTGATCTTCCA+AGG 0.575467 5:+76185608 MsG0580028176.01.T01:CDS
TCTTCCAAGGTGGGTTAGGT+CGG 0.578417 5:+76185621 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTCAAACAACATAGGAAACA+GGG 0.583515 5:+76185237 MsG0580028176.01.T01:intron
AGAGTATGTTGAAGAGGAGA+TGG 0.584039 5:+76185699 MsG0580028176.01.T01:CDS
CATGGTTGATCTTCCAAGGT+GGG 0.585573 5:+76185612 MsG0580028176.01.T01:CDS
AGCCCTTTAATCCAATTCCC+GGG 0.586579 5:-76183840 None:intergenic
GTCATAAGCATCCATCTCCC+GGG 0.586758 5:+76183823 MsG0580028176.01.T01:CDS
AGATCCACTAATGATTTCAA+GGG 0.589163 5:-76180096 None:intergenic
TCCTTCTTGAAATGCTTACA+GGG 0.589513 5:+76185554 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATTCGGTTACTTCTGGAGCA+CGG 0.591881 5:-76185483 None:intergenic
TCAAGAATGAAGATTGCGCT+GGG 0.592227 5:+76185289 MsG0580028176.01.T01:CDS
GAAAGGAAAGACGAAGAATG+AGG 0.594365 5:+76184425 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATGAAGGCTCAGGATTCTAA+GGG 0.599481 5:-76183899 None:intergenic
CTAATGATTTCAAGGGCCAA+TGG 0.602340 5:-76180089 None:intergenic
TACAAGGCTAAATTGGAGGA+AGG 0.604737 5:+76184597 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATTGCGCTGGGAGCTGCCAA+AGG 0.605298 5:+76185301 MsG0580028176.01.T01:CDS
GTTGATAAGGTGTTCATAAG+GGG 0.606660 5:-76185439 None:intergenic
AAGCTATGGAACAACATACA+AGG 0.609906 5:+76184581 MsG0580028176.01.T01:CDS
GGTGGTTCATGAGGAATGGA+CGG 0.611867 5:+76185642 MsG0580028176.01.T01:CDS
GGTAGATAATAGGCCAACAA+TGG 0.612307 5:+76185762 MsG0580028176.01.T01:CDS
ATTGCTTCCATCCACAAAGA+GGG 0.615260 5:+76185325 MsG0580028176.01.T01:CDS
GGAGGAAGGACTGACAATTG+TGG 0.621278 5:+76184611 MsG0580028176.01.T01:CDS
GTATCCGTTGGATCTTGACA+TGG 0.623935 5:-76185461 None:intergenic
GAATAGTAATAAGCTCTAAG+TGG 0.625802 5:-76184726 None:intergenic
AGTTCAATCTTAAGGCATGT+GGG 0.628516 5:-76183735 None:intergenic
ATTGGCTTGTGTGTCAAAGG+TGG 0.633249 5:+76185741 MsG0580028176.01.T01:CDS
TTCTTGTGTTATGAGTACAT+TGG 0.636497 5:-76185383 None:intergenic
TCAACCATGTCAAGATCCAA+CGG 0.642301 5:+76185457 MsG0580028176.01.T01:CDS
AATTGCTTCCATCCACAAAG+AGG 0.642461 5:+76185324 MsG0580028176.01.T01:CDS
AGCAGTGATGATATACCGAA+AGG 0.650566 5:+76184408 MsG0580028176.01.T01:CDS
GCTTCCATCCACAAAGAGGG+AGG 0.663048 5:+76185328 MsG0580028176.01.T01:CDS
ACATGGTTGATCTTCCAAGG+TGG 0.670902 5:+76185611 MsG0580028176.01.T01:CDS
GTTTATGACTACATGCTAGG+TGG 0.672096 5:+76184768 MsG0580028176.01.T01:CDS
TCAAACAACATAGGAAACAG+GGG 0.679069 5:+76185238 MsG0580028176.01.T01:intron
TTCTGGTTATGATCATGACA+TGG 0.685994 5:+76185594 MsG0580028176.01.T01:CDS
TGTATCTAAAGCTATTCCGG+AGG 0.707211 5:-76180349 None:intergenic
GTAAACATCACTCTTCTGAG+CGG 0.740542 5:-76185518 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GAAAAATTTATTAATTGTTT+AGG + Chr5:76181446-76181465 MsG0580028176.01.T01:intron 10.0%
!!! ACAATATATCTTTTTAAATT+AGG + Chr5:76182619-76182638 MsG0580028176.01.T01:intron 10.0%
!!! ATTTTTTTATGGTTAAATTA+TGG - Chr5:76180509-76180528 None:intergenic 10.0%
!! AAATCAAACAATATTATAGA+AGG + Chr5:76180048-76180067 MsG0580028176.01.T01:CDS 15.0%
!! ATATCATTGAATCTTATAAA+TGG + Chr5:76181137-76181156 MsG0580028176.01.T01:intron 15.0%
!! TAAATAAAGTGAGAATAAAA+TGG - Chr5:76181557-76181576 None:intergenic 15.0%
!! TATCATTGAATCTTATAAAT+GGG + Chr5:76181138-76181157 MsG0580028176.01.T01:intron 15.0%
!! TATTAGAATTATAGAACAAT+AGG - Chr5:76185206-76185225 None:intergenic 15.0%
!!! AATCTTTAAGTTTAACATTT+TGG - Chr5:76184924-76184943 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTTGGTTAAAATATTGA+TGG + Chr5:76182369-76182388 MsG0580028176.01.T01:intron 15.0%
!!! GTGATTAATGAATTTTTTTA+TGG - Chr5:76180520-76180539 None:intergenic 15.0%
!!! TACCTTTTATATATGAAATA+TGG - Chr5:76182241-76182260 None:intergenic 15.0%
!! AAAATTGTAGAATGTTAAAC+AGG + Chr5:76180664-76180683 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!! AATCCTCTAAATATTTGTAA+AGG - Chr5:76180982-76181001 None:intergenic 20.0%
!! AGAAAAAATCTGCTTAAATT+TGG + Chr5:76181607-76181626 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!! ATACTCAAAAACAAATTTGA+AGG - Chr5:76181018-76181037 None:intergenic 20.0%
!! ATCATTGAATCTTATAAATG+GGG + Chr5:76181139-76181158 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!! ATCCTCTAAATATTTGTAAA+GGG - Chr5:76180981-76181000 None:intergenic 20.0%
!! ATGAAAGACAATGATAAAAA+AGG - Chr5:76180845-76180864 None:intergenic 20.0%
!! CTTTCAACTAAAAAAGTAAA+AGG - Chr5:76183079-76183098 None:intergenic 20.0%
!! GAATCAAAATCATAAACATA+AGG - Chr5:76180568-76180587 None:intergenic 20.0%
!! GTCCATATTTCATATATAAA+AGG + Chr5:76182236-76182255 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!! TACTCAAAAACAAATTTGAA+GGG - Chr5:76181017-76181036 None:intergenic 20.0%
!! TGATCAATGAACTTTAATTA+AGG + Chr5:76182669-76182688 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!! TTGACCAAAAAATCAAAATA+AGG + Chr5:76182491-76182510 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!!! AAATATACCCTTAGTTTTAT+TGG + Chr5:76181710-76181729 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!!! ATACACCAATGTTTTAAATT+TGG - Chr5:76185139-76185158 None:intergenic 20.0%
!!! TAACATTCTTTTCATAAAGT+CGG - Chr5:76182837-76182856 None:intergenic 20.0%
!!! TACACCAATGTTTTAAATTT+GGG - Chr5:76185138-76185157 None:intergenic 20.0%
!!! TATTGATTAGATGTGATTTT+CGG + Chr5:76181741-76181760 MsG0580028176.01.T01:intron 20.0%
!!! TGAACCTTATTTTGATTTTT+TGG - Chr5:76182498-76182517 None:intergenic 20.0%
!!! TGATTTTAACAAACATGATT+AGG - Chr5:76180034-76180053 None:intergenic 20.0%
!!! TTATGACATTAGTTTCATTT+CGG - Chr5:76183810-76183829 None:intergenic 20.0%
! AAACTAAAGTTTCCAAACAT+AGG + Chr5:76180318-76180337 MsG0580028176.01.T01:CDS 25.0%
! AAATCAAAATAAGGTTCATG+AGG + Chr5:76182500-76182519 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! AACAAATTGTTCTTCTTTGA+GGG + Chr5:76184495-76184514 MsG0580028176.01.T01:CDS 25.0%
! AAGTCTTCAAAGAAATTCTT+TGG + Chr5:76184285-76184304 MsG0580028176.01.T01:CDS 25.0%
! AATGAGACCAAAAAAATCAA+AGG - Chr5:76181267-76181286 None:intergenic 25.0%
! ACTCAAAAACAAATTTGAAG+GGG - Chr5:76181016-76181035 None:intergenic 25.0%
! AGATTAACATATTGAAGTGA+AGG - Chr5:76183970-76183989 None:intergenic 25.0%
! AGGATTAAGACAAAAGAAAT+TGG + Chr5:76182801-76182820 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! ATAGCAATGTTACACATTAT+GGG - Chr5:76181315-76181334 None:intergenic 25.0%
! ATTATTCCAGTTCAATCTTA+AGG - Chr5:76183746-76183765 None:intergenic 25.0%
! ATTCTTGAATTCCAGTTTAA+TGG - Chr5:76185277-76185296 None:intergenic 25.0%
! ATTGGATCTATATAAGTGTT+TGG + Chr5:76181767-76181786 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! CAAGTACCTTAGAAAATATT+AGG + Chr5:76183301-76183320 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! GAAAATCACATCTAATCAAT+AGG - Chr5:76181742-76181761 None:intergenic 25.0%
! GAACAAAGGATAGTTAAAAA+GGG - Chr5:76182442-76182461 None:intergenic 25.0%
! GATATTAGTCAACAAGAATA+TGG + Chr5:76180612-76180631 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! GATCAATTGAAGTCAAAATT+TGG + Chr5:76183529-76183548 MsG0580028176.01.T01:CDS 25.0%
! GATGAAAAAGAAACACATTA+TGG - Chr5:76184853-76184872 None:intergenic 25.0%
! GGATTAAGACAAAAGAAATT+GGG + Chr5:76182802-76182821 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! GGTTTGAATTTGAAAAATCA+TGG - Chr5:76183499-76183518 None:intergenic 25.0%
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! GTCTTTATTAGACTTCAAAA+TGG - Chr5:76180177-76180196 None:intergenic 25.0%
! TAATTAAGGTCGAATTGATA+AGG + Chr5:76182683-76182702 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! TACATTACATTTATTTCCAC+TGG - Chr5:76182010-76182029 None:intergenic 25.0%
! TATAGCAATGTTACACATTA+TGG - Chr5:76181316-76181335 None:intergenic 25.0%
! TCATTGAATCTTATAAATGG+GGG + Chr5:76181140-76181159 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
! TCTAAAAAATCACGTACATA+TGG - Chr5:76180254-76180273 None:intergenic 25.0%
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! TTTGTCCTTTAATACAATGT+TGG + Chr5:76181963-76181982 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
!! ATCATTATTGTAGCTTTACA+TGG - Chr5:76183241-76183260 None:intergenic 25.0%
!! ATGTTGCCATGAATAAATTT+TGG - Chr5:76185355-76185374 None:intergenic 25.0%
!! ATTGATTAGATGTGATTTTC+GGG + Chr5:76181742-76181761 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
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!! TAAAGTAAATTAGGATTAGC+TGG - Chr5:76181888-76181907 None:intergenic 25.0%
!! TAATGTATCTAAAGCTATTC+CGG - Chr5:76180355-76180374 None:intergenic 25.0%
!! TCAATGTATATACTCTGAAA+AGG - Chr5:76182552-76182571 None:intergenic 25.0%
!! TGATTCTTACGCATAATTTT+AGG + Chr5:76180890-76180909 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
!! TTAGAAACATAGTGGAAATT+AGG + Chr5:76185794-76185813 MsG0580028176.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGAGCTTTAATAACTTGAA+TGG + Chr5:76184120-76184139 MsG0580028176.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCTTTTGTCTTAATCCTT+CGG - Chr5:76182800-76182819 None:intergenic 25.0%
!!! AGTCTTACCTTTGATTTTTT+TGG + Chr5:76181257-76181276 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
!!! ATAGCTTTAGATACATTAGA+AGG + Chr5:76180357-76180376 MsG0580028176.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTGTAGAACAATTTTTGAG+AGG - Chr5:76184216-76184235 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTATGAGTGTTGATTTC+TGG - Chr5:76182594-76182613 None:intergenic 25.0%
!!! CAACTTGTTAGATGATAATA+TGG - Chr5:76183476-76183495 None:intergenic 25.0%
!!! GACTATTTTAGTGAAATACT+TGG + Chr5:76182405-76182424 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
!!! TGATTTTTCAAATTCAAACC+AGG + Chr5:76183499-76183518 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
!!! TTATGATTTTGAGTAGTTGA+CGG - Chr5:76184267-76184286 None:intergenic 25.0%
!!! TTTGGAAACTTTAGTTTTCT+CGG - Chr5:76180315-76180334 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTAGAAGCTAAGAATTG+TGG + Chr5:76180266-76180285 MsG0580028176.01.T01:intron 25.0%
AAAATTTGACCAGATGAGTT+AGG - Chr5:76182726-76182745 None:intergenic 30.0%
AACAACATACAAGGCTAAAT+TGG + Chr5:76184590-76184609 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
AACAAGAAGTTTCTCATCTT+TGG - Chr5:76184751-76184770 None:intergenic 30.0%
AAGAAAAACAGAACTCAAGA+AGG - Chr5:76182903-76182922 None:intergenic 30.0%
AAGATTCCATTAGGATATTC+TGG + Chr5:76185577-76185596 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
AAGTATTCAGTTTGAGTGTT+TGG + Chr5:76183331-76183350 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
AATACTTCTCTTTCTTGTAC+AGG + Chr5:76182153-76182172 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
AGAAAAACAGAACTCAAGAA+GGG - Chr5:76182902-76182921 None:intergenic 30.0%
AGATCCACTAATGATTTCAA+GGG - Chr5:76180099-76180118 None:intergenic 30.0%
AGCGTGACATAAAGTAAATT+AGG - Chr5:76181897-76181916 None:intergenic 30.0%
ATAATTTCTCATACCCTAGA+AGG - Chr5:76180134-76180153 None:intergenic 30.0%
ATATTGAGAAGCTATATGTG+TGG + Chr5:76180733-76180752 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
ATGAAGCTTAGAAGAAGAAA+TGG - Chr5:76183640-76183659 None:intergenic 30.0%
ATGTATTCTTCTTCAACTCA+GGG - Chr5:76185822-76185841 None:intergenic 30.0%
CAAAACTATGAGAGATAGAA+AGG - Chr5:76184349-76184368 None:intergenic 30.0%
CAAGAATATGGTTATTGTCA+TGG + Chr5:76180624-76180643 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
CAAGCTTATAAACATTGAGT+TGG - Chr5:76182305-76182324 None:intergenic 30.0%
CACTAAGTTCATTTGAATGA+AGG - Chr5:76183918-76183937 None:intergenic 30.0%
CACTTCTGTGACAAATAAAA+AGG + Chr5:76180933-76180952 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
CTTCAACACAATAATTTCTC+AGG + Chr5:76183988-76184007 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
CTTCATTCAAATGAACTTAG+TGG + Chr5:76183916-76183935 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
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GAATCACATTGAGACATTTA+GGG - Chr5:76182464-76182483 None:intergenic 30.0%
GACCCTTTACAAATATTTAG+AGG + Chr5:76180976-76180995 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
GCAATCTCCAATAAAACTAA+GGG - Chr5:76181720-76181739 None:intergenic 30.0%
GGAACAAAGGATAGTTAAAA+AGG - Chr5:76182443-76182462 None:intergenic 30.0%
GGAATAGATAGAATGTTAGA+TGG - Chr5:76183949-76183968 None:intergenic 30.0%
GTTTCAAAAACAAGTGAGAT+GGG - Chr5:76182969-76182988 None:intergenic 30.0%
TAAAAGGTTAAGAGAAGTTG+TGG + Chr5:76184635-76184654 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
TAGCTTCTCAATATTATGCA+AGG - Chr5:76180727-76180746 None:intergenic 30.0%
TATACATTGACCTAGTAAGA+TGG + Chr5:76182562-76182581 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
TATTGATGGAATGCTTTCTT+TGG + Chr5:76182383-76182402 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
TCAAGTATGTTAGCATAGTA+AGG - Chr5:76184098-76184117 None:intergenic 30.0%
TCATAACCAGAATATCCTAA+TGG - Chr5:76185586-76185605 None:intergenic 30.0%
TCTATACTTGCATTAGCAAT+TGG + Chr5:76184315-76184334 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
TGAAGTTGTTAGAAACATAG+TGG + Chr5:76185786-76185805 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
TGAATCACATTGAGACATTT+AGG - Chr5:76182465-76182484 None:intergenic 30.0%
TGTTTCAAAAACAAGTGAGA+TGG - Chr5:76182970-76182989 None:intergenic 30.0%
TGTTTGCTTGACTTTATTAG+TGG + Chr5:76182335-76182354 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
TTCAAACAACATAGGAAACA+GGG + Chr5:76185237-76185256 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
TTCAATTGATCTTCATTACC+TGG - Chr5:76183520-76183539 None:intergenic 30.0%
TTCTTGTGTTATGAGTACAT+TGG - Chr5:76185386-76185405 None:intergenic 30.0%
TTTCAAACAACATAGGAAAC+AGG + Chr5:76185236-76185255 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
TTTGAGAATGGTAAGATTGT+CGG - Chr5:76181341-76181360 None:intergenic 30.0%
! ACGATTTTTCCACAATATCA+AGG + Chr5:76185083-76185102 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
! AGTTAAAAGTGAGTTGAATG+TGG + Chr5:76183395-76183414 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
! CCTATGTTGTTTGAAAATTG+AGG - Chr5:76185232-76185251 None:intergenic 30.0%
! CCTCAATTTTCAAACAACAT+AGG + Chr5:76185229-76185248 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
! CTGACCCAAATTTAAAACAT+TGG + Chr5:76185131-76185150 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
! CTTAATCCTTCGGTTTTTAA+GGG - Chr5:76182790-76182809 None:intergenic 30.0%
! CTTTCTATCTCTCATAGTTT+TGG + Chr5:76184347-76184366 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
! GTGGAATCATGAAGTAATTT+TGG + Chr5:76182354-76182373 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
! GTTAGTTCTTTCAATACTTG+AGG - Chr5:76183116-76183135 None:intergenic 30.0%
! TCTTAATCCTTCGGTTTTTA+AGG - Chr5:76182791-76182810 None:intergenic 30.0%
! TTTGAAATGCGAGAAAATGT+TGG - Chr5:76180230-76180249 None:intergenic 30.0%
!! AAAAGTTTTGTGTTGGTACT+TGG - Chr5:76183572-76183591 None:intergenic 30.0%
!! AGCTTGTTTTCATTACTTCA+TGG + Chr5:76184792-76184811 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
!! CAATGTTTTAAATTTGGGTC+AGG - Chr5:76185133-76185152 None:intergenic 30.0%
!! GAATAGTAATAAGCTCTAAG+TGG - Chr5:76184729-76184748 None:intergenic 30.0%
!! TGGTGATAAAAGTTTTGTGT+TGG - Chr5:76183579-76183598 None:intergenic 30.0%
!! TTCCCTTTAACTTCTTTTGT+TGG + Chr5:76184168-76184187 MsG0580028176.01.T01:CDS 30.0%
!! TTCTAGGGTATGAGAAATTA+TGG + Chr5:76180133-76180152 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
!! TTCTTGAGTTCTGTTTTTCT+TGG + Chr5:76182902-76182921 MsG0580028176.01.T01:intron 30.0%
!!! AGTTTTGAAGAGATAGAAGA+AGG - Chr5:76184021-76184040 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTTGAAGAGATAGAAGAA+GGG - Chr5:76184020-76184039 None:intergenic 30.0%
AACATACAAGGCTAAATTGG+AGG + Chr5:76184593-76184612 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGTGATGTTTACAGCTT+TGG + Chr5:76185526-76185545 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
AAGCTATGGAACAACATACA+AGG + Chr5:76184581-76184600 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAAGAACTCCATTAAAC+TGG + Chr5:76185263-76185282 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAATGTTTCATGGACAT+AGG + Chr5:76180403-76180422 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
AGAACATCACATTCACATCA+TGG + Chr5:76181365-76181384 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
AGACTTACTTATGGCATGTT+TGG + Chr5:76180193-76180212 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
AGCATAGTAAGGTTGAATAC+AGG - Chr5:76184087-76184106 None:intergenic 35.0%
AGCTCCAAAGAAAGAGTTAA+AGG - Chr5:76184061-76184080 None:intergenic 35.0%
AGTTAAAAAGGGATGCAGAT+GGG - Chr5:76182431-76182450 None:intergenic 35.0%
AGTTAAAGGGAAGTGATTGA+TGG - Chr5:76184160-76184179 None:intergenic 35.0%
AGTTCAATCTTAAGGCATGT+GGG - Chr5:76183738-76183757 None:intergenic 35.0%
ATACTTGCATTAGCAATTGG+AGG + Chr5:76184318-76184337 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
ATCCTTCTTGAAATGCTTAC+AGG + Chr5:76185553-76185572 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
ATTACACAGATAGATGCCTT+AGG + Chr5:76180692-76180711 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
CTAACAACTTCATCCATTGT+TGG - Chr5:76185778-76185797 None:intergenic 35.0%
CTCATAACACAAGAACTTGA+TGG + Chr5:76185391-76185410 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
CTTGTTTATGACTACATGCT+AGG + Chr5:76184765-76184784 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
GACTCTGATAATCTTGAGTT+TGG - Chr5:76182762-76182781 None:intergenic 35.0%
GACTGACAATTGTGGTTAAA+AGG + Chr5:76184619-76184638 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
GAGATCCACTAATGATTTCA+AGG - Chr5:76180100-76180119 None:intergenic 35.0%
GATGTATTCTTCTTCAACTC+AGG - Chr5:76185823-76185842 None:intergenic 35.0%
GGAGGTCCAAAATTTATTCA+TGG + Chr5:76185346-76185365 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
GGCAATCTCCAATAAAACTA+AGG - Chr5:76181721-76181740 None:intergenic 35.0%
GTATCACATCAAATGAGTTG+AGG - Chr5:76182192-76182211 None:intergenic 35.0%
GTATCTTTCTTCATACAGAG+TGG - Chr5:76180807-76180826 None:intergenic 35.0%
TAGTTAAAAAGGGATGCAGA+TGG - Chr5:76182432-76182451 None:intergenic 35.0%
TCAAACAACATAGGAAACAG+GGG + Chr5:76185238-76185257 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
TCATTCTTCGTCTTTCCTTT+CGG - Chr5:76184426-76184445 None:intergenic 35.0%
TCCTTCTTGAAATGCTTACA+GGG + Chr5:76185554-76185573 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
TCTCTATAAGCAACCTTCTA+GGG + Chr5:76180118-76180137 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
TGTCAAAGGTGGTAGATAAT+AGG + Chr5:76185752-76185771 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
TTCCACAATATCAAGGATAG+TGG + Chr5:76185090-76185109 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
TTGAATGAGCTAGATGAGAA+TGG + Chr5:76180462-76180481 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
TTGAGACATTTAGGGAACAA+AGG - Chr5:76182456-76182475 None:intergenic 35.0%
! AGGTAAAGTTTTCCATCTGA+TGG - Chr5:76183059-76183078 None:intergenic 35.0%
! AGTTGGGAAATTCTTTGAGA+TGG - Chr5:76183161-76183180 None:intergenic 35.0%
! GGAGAGTATAAGAGAATTCA+AGG - Chr5:76183717-76183736 None:intergenic 35.0%
! GGTAAAGTTTTCCATCTGAT+GGG - Chr5:76183058-76183077 None:intergenic 35.0%
! GTTGATAAGGTGTTCATAAG+GGG - Chr5:76185442-76185461 None:intergenic 35.0%
! TAAGGGAATCAAGTTTTCCT+AGG - Chr5:76183885-76183904 None:intergenic 35.0%
! TTCTGGTTATGATCATGACA+TGG + Chr5:76185594-76185613 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAGAACTAACTTGCTTCAC+TGG + Chr5:76183125-76183144 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
!! CTTCATTGATGATGCTTCTT+TGG - Chr5:76183599-76183618 None:intergenic 35.0%
!! GGTTGATAAGGTGTTCATAA+GGG - Chr5:76185443-76185462 None:intergenic 35.0%
!! TGGTTGATAAGGTGTTCATA+AGG - Chr5:76185444-76185463 None:intergenic 35.0%
!! TTTGTCACAGAAGTGTTCAT+TGG - Chr5:76180928-76180947 None:intergenic 35.0%
!!! AAGTTTTGAGAGTGAAGTGT+TGG + Chr5:76184461-76184480 MsG0580028176.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGATGTGATTTTCGGGTTAT+TGG + Chr5:76181749-76181768 MsG0580028176.01.T01:intron 35.0%
!!! ATGTAGCAGGTTTTGAAGTT+GGG - Chr5:76183177-76183196 None:intergenic 35.0%
!!! GATGTTCTGAGTTTTGAGAA+TGG - Chr5:76181353-76181372 None:intergenic 35.0%
AAACAAGTGAGATGGGAGAT+TGG - Chr5:76182962-76182981 None:intergenic 40.0%
AACAAGTGAGATGGGAGATT+GGG - Chr5:76182961-76182980 None:intergenic 40.0%
AAGCCTTCAACAAGTCTTCA+AGG - Chr5:76184539-76184558 None:intergenic 40.0%
AAGGTTGAGTGACTTCTTTG+TGG + Chr5:76180762-76180781 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
AATGAAGGCTCAGGATTCTA+AGG - Chr5:76183903-76183922 None:intergenic 40.0%
AATTGCTTCCATCCACAAAG+AGG + Chr5:76185324-76185343 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
AGAGTATGTTGAAGAGGAGA+TGG + Chr5:76185699-76185718 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
AGATAGATGCCTTAGGACAT+TGG + Chr5:76180699-76180718 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
AGCAGTGATGATATACCGAA+AGG + Chr5:76184408-76184427 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
AGGTTAAGAGAAGTTGTGGT+CGG + Chr5:76184639-76184658 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
AGGTTGAGTGACTTCTTTGT+GGG + Chr5:76180763-76180782 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
ATGAAGGCTCAGGATTCTAA+GGG - Chr5:76183902-76183921 None:intergenic 40.0%
ATGACATGGTTGATCTTCCA+AGG + Chr5:76185608-76185627 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAGGTTGTTGGAAGAAT+TGG + Chr5:76184684-76184703 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCTTCCATCCACAAAGA+GGG + Chr5:76185325-76185344 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGGTAAGACTGTCAGAT+CGG - Chr5:76181250-76181269 None:intergenic 40.0%
CAACTTCAAAACCTGCTACA+TGG + Chr5:76183176-76183195 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
CAAGGAGAAGGAATGTTTCA+TGG + Chr5:76180396-76180415 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
CACATGCCTTAAGATTGAAC+TGG + Chr5:76183737-76183756 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
CACTTTCCCTTAAAAACCGA+AGG + Chr5:76182781-76182800 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
CAGCTTGCACATGTATTTAG+GGG - Chr5:76181424-76181443 None:intergenic 40.0%
CAGTTCAATCTTAAGGCATG+TGG - Chr5:76183739-76183758 None:intergenic 40.0%
CATCAAAAGCCCTGATATCA+CGG - Chr5:76185010-76185029 None:intergenic 40.0%
CCAATCCATGAAGTGCAAAT+AGG - Chr5:76183775-76183794 None:intergenic 40.0%
CCTATTTGCACTTCATGGAT+TGG + Chr5:76183772-76183791 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
CTAATGATTTCAAGGGCCAA+TGG - Chr5:76180092-76180111 None:intergenic 40.0%
CTCTCTATAAGCAACCTTCT+AGG + Chr5:76180117-76180136 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
CTCTTCAAAACTCATTGCGT+TGG + Chr5:76184029-76184048 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
CTGGTCATTTCCATCTTACT+AGG - Chr5:76182575-76182594 None:intergenic 40.0%
CTTACAGGGAAGATTCCATT+AGG + Chr5:76185568-76185587 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGGAAAGACGAAGAATG+AGG + Chr5:76184425-76184444 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
GCAGCTTGCACATGTATTTA+GGG - Chr5:76181425-76181444 None:intergenic 40.0%
GCTATATGTGTGGTTGTTCA+AGG + Chr5:76180743-76180762 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
GGGAAGTGATTGATGGAAAA+TGG - Chr5:76184153-76184172 None:intergenic 40.0%
GGTAGATAATAGGCCAACAA+TGG + Chr5:76185762-76185781 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
GTAAACATCACTCTTCTGAG+CGG - Chr5:76185521-76185540 None:intergenic 40.0%
GTACTTGGAAAAGGAAGCTA+TGG + Chr5:76184567-76184586 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
GTTCATTTGAATGAAGGCTC+AGG - Chr5:76183912-76183931 None:intergenic 40.0%
GTTGGAAACTCTCTCTTATG+TGG + Chr5:76184186-76184205 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
GTTTATGACTACATGCTAGG+TGG + Chr5:76184768-76184787 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
TACAAGGCTAAATTGGAGGA+AGG + Chr5:76184597-76184616 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
TCAACCATGTCAAGATCCAA+CGG + Chr5:76185457-76185476 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
TCAAGAATGAAGATTGCGCT+GGG + Chr5:76185289-76185308 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
TCCCTGTAAGCATTTCAAGA+AGG - Chr5:76185558-76185577 None:intergenic 40.0%
TCCTCTATCAATCAAGGAGA+AGG + Chr5:76180384-76180403 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
TCCTTCTCCTTGATTGATAG+AGG - Chr5:76180388-76180407 None:intergenic 40.0%
TGCAGCTTGCACATGTATTT+AGG - Chr5:76181426-76181445 None:intergenic 40.0%
TGCCACTATCCTTGATATTG+TGG - Chr5:76185095-76185114 None:intergenic 40.0%
TTCAAGAATGAAGATTGCGC+TGG + Chr5:76185288-76185307 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
TTCGATGAGGAGATGATTAG+AGG + Chr5:76185673-76185692 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
TTGGCCCTTGAAATCATTAG+TGG + Chr5:76180092-76180111 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
TTTCAACTGCAACTAACCAG+TGG + Chr5:76181991-76182010 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
! CATAGGATCTGTGACTTTTG+TGG + Chr5:76180420-76180439 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
! GATATCAGGGCTTTTGATGT+CGG + Chr5:76185011-76185030 MsG0580028176.01.T01:intron 40.0%
! GCTCTAAGTGGTATGACATT+AGG - Chr5:76184717-76184736 None:intergenic 40.0%
! GGATCTTGACATGGTTGATA+AGG - Chr5:76185455-76185474 None:intergenic 40.0%
! TAATCTTGAGTTTGGCTCAG+AGG - Chr5:76182754-76182773 None:intergenic 40.0%
! TCAGCTGAAGTACTTGGAAA+AGG + Chr5:76184558-76184577 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
! TGTATCTAAAGCTATTCCGG+AGG - Chr5:76180352-76180371 None:intergenic 40.0%
!! TGACCTTGAAGACTTGTTGA+AGG + Chr5:76184533-76184552 MsG0580028176.01.T01:CDS 40.0%
!! TTCCTTGATTCGGTTACTTC+TGG - Chr5:76185493-76185512 None:intergenic 40.0%
!! TTTTGAGTAGTTGACGGAGA+AGG - Chr5:76184261-76184280 None:intergenic 40.0%
!!! CATGTAGCAGGTTTTGAAGT+TGG - Chr5:76183178-76183197 None:intergenic 40.0%
!!! GGAAACTTTAGTTTTCTCGG+TGG - Chr5:76180312-76180331 None:intergenic 40.0%
AACATAGGAAACAGGGGTGA+AGG + Chr5:76185244-76185263 MsG0580028176.01.T01:intron 45.0%
AACATAGGCTTAGTCACCTC+CGG + Chr5:76180333-76180352 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
ACACATGCTTACCATGTAGC+AGG - Chr5:76183190-76183209 None:intergenic 45.0%
ACATGGTTGATCTTCCAAGG+TGG + Chr5:76185611-76185630 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
ACTACGAAGCCTAACTCATC+TGG + Chr5:76182714-76182733 MsG0580028176.01.T01:intron 45.0%
AGAAGTTGTGGTCGGAAAGA+AGG + Chr5:76184647-76184666 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
AGCCCTTTAATCCAATTCCC+GGG - Chr5:76183843-76183862 None:intergenic 45.0%
ATCTAGTGCTTGCTCACCAT+TGG + Chr5:76180073-76180092 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCAAACAACAGCAGCCT+AGG + Chr5:76183865-76183884 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
CAATTGTGGCCGTGATATCA+GGG + Chr5:76184998-76185017 MsG0580028176.01.T01:intron 45.0%
CACTTTAGTCTCCCATCAGA+TGG + Chr5:76183044-76183063 MsG0580028176.01.T01:intron 45.0%
CATGGTTGATCTTCCAAGGT+GGG + Chr5:76185612-76185631 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
CGACTCCTATTTGCACTTCA+TGG + Chr5:76183767-76183786 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
CTCCAGAAGTAACCGAATCA+AGG + Chr5:76185488-76185507 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
CTCCCGGGAATTGGATTAAA+GGG + Chr5:76183838-76183857 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGAGTTTGAGCAACAGA+TGG + Chr5:76184665-76184684 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
GAGCCCTTTAATCCAATTCC+CGG - Chr5:76183844-76183863 None:intergenic 45.0%
GAGGTGACTAAGCCTATGTT+TGG - Chr5:76180333-76180352 None:intergenic 45.0%
GATGAGGAGATGATTAGAGG+TGG + Chr5:76185676-76185695 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
GCACATGCTTCAGATTGCAT+TGG + Chr5:76185723-76185742 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGTCCTCTATCAATCA+AGG + Chr5:76180378-76180397 MsG0580028176.01.T01:intron 45.0%
GTATCCGTTGGATCTTGACA+TGG - Chr5:76185464-76185483 None:intergenic 45.0%
GTGGATGGAAGCAATTCCTT+TGG - Chr5:76185320-76185339 None:intergenic 45.0%
TCTCCCGGGAATTGGATTAA+AGG + Chr5:76183837-76183856 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
TGAGATGGGAGATTGGGAAA+AGG - Chr5:76182955-76182974 None:intergenic 45.0%
TGTCATAAGCATCCATCTCC+CGG + Chr5:76183822-76183841 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
TTAATCCAATTCCCGGGAGA+TGG - Chr5:76183837-76183856 None:intergenic 45.0%
TTTCCTAGGCTGCTGTTGTT+TGG - Chr5:76183871-76183890 None:intergenic 45.0%
! AAGGCTTCAGCTGAAGTACT+TGG + Chr5:76184552-76184571 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
! AGGTGGAGAGTATGTTGAAG+AGG + Chr5:76185693-76185712 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
! ATTTTGGACCTCCCTCTTTG+TGG - Chr5:76185339-76185358 None:intergenic 45.0%
! TAGGCTGCTGTTGTTTGGAA+TGG - Chr5:76183866-76183885 None:intergenic 45.0%
! TTGATCTTCCAAGGTGGGTT+AGG + Chr5:76185617-76185636 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTCGGTTACTTCTGGAGCA+CGG - Chr5:76185486-76185505 None:intergenic 45.0%
!! ATTGGCTTGTGTGTCAAAGG+TGG + Chr5:76185741-76185760 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
!! TGCATTGGCTTGTGTGTCAA+AGG + Chr5:76185738-76185757 MsG0580028176.01.T01:CDS 45.0%
AAGACTGTCAGATCGGTGCA+TGG - Chr5:76181243-76181262 None:intergenic 50.0%
ACAGTCTGCGACAGCAATTG+TGG + Chr5:76184984-76185003 MsG0580028176.01.T01:intron 50.0%
AGAAGGAGAAGGAGATGGAG+AGG - Chr5:76184244-76184263 None:intergenic 50.0%
AGACTGTCAGATCGGTGCAT+GGG - Chr5:76181242-76181261 None:intergenic 50.0%
AGCGGCGATCTTCCTTGATT+CGG - Chr5:76185503-76185522 None:intergenic 50.0%
GAAGGAGAAGGAGATGGAGA+GGG - Chr5:76184243-76184262 None:intergenic 50.0%
GAGCAACAGATGGAGGTTGT+TGG + Chr5:76184675-76184694 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
GATGGTTGCATCGCTGATGT+TGG + Chr5:76185409-76185428 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
GCAATTGTGGCCGTGATATC+AGG + Chr5:76184997-76185016 MsG0580028176.01.T01:intron 50.0%
GGAGGAAGGACTGACAATTG+TGG + Chr5:76184611-76184630 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
GGAGTTTGAGCAACAGATGG+AGG + Chr5:76184668-76184687 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
GGTGGTTCATGAGGAATGGA+CGG + Chr5:76185642-76185661 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
GTAGTTGACGGAGAAGGAGA+AGG - Chr5:76184255-76184274 None:intergenic 50.0%
GTCATAAGCATCCATCTCCC+GGG + Chr5:76183823-76183842 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
TGGGAGATTGGGAAAAGGCA+TGG - Chr5:76182950-76182969 None:intergenic 50.0%
! ACTTGCTTCACTGGTCTCAC+TGG + Chr5:76183134-76183153 MsG0580028176.01.T01:intron 50.0%
! GACGGCTGAAGTTTTCGATG+AGG + Chr5:76185660-76185679 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
! TGCAAGGCACCAATGTCCTA+AGG - Chr5:76180711-76180730 None:intergenic 50.0%
!! GTGAAGTGTTGGAGCGTGAA+AGG + Chr5:76184472-76184491 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
!! TCTTCCAAGGTGGGTTAGGT+CGG + Chr5:76185621-76185640 MsG0580028176.01.T01:CDS 50.0%
AGCATCCATCTCCCGGGAAT+TGG + Chr5:76183829-76183848 MsG0580028176.01.T01:CDS 55.0%
GACGGAGAAGGAGAAGGAGA+TGG - Chr5:76184249-76184268 None:intergenic 55.0%
GACTGTCAGATCGGTGCATG+GGG - Chr5:76181241-76181260 None:intergenic 55.0%
GCTTCCATCCACAAAGAGGG+AGG + Chr5:76185328-76185347 MsG0580028176.01.T01:CDS 55.0%
GGTCGGTGGTTCATGAGGAA+TGG + Chr5:76185638-76185657 MsG0580028176.01.T01:CDS 55.0%
GGTTAGGTCGGTGGTTCATG+AGG + Chr5:76185633-76185652 MsG0580028176.01.T01:CDS 55.0%
TGGACCTCCCTCTTTGTGGA+TGG - Chr5:76185335-76185354 None:intergenic 55.0%
!! TTCTGGAGCACGGTATCCGT+TGG - Chr5:76185476-76185495 None:intergenic 55.0%
ACCACCGACCTAACCCACCT+TGG - Chr5:76185628-76185647 None:intergenic 60.0%
ATTGCGCTGGGAGCTGCCAA+AGG + Chr5:76185301-76185320 MsG0580028176.01.T01:CDS 60.0%
!! TCCAAGGTGGGTTAGGTCGG+TGG + Chr5:76185624-76185643 MsG0580028176.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 76180014 76185867 76180014 ID=MsG0580028176.01;Name=MsG0580028176.01
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