AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480020780.01


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MsG0480020780.01.T01 AT1G56720 39.661 295 162 7 201 488 167 452 1.23e-55 196
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MsG0480020780.01.T01 AT2G20300 39.073 302 152 7 201 489 337 619 4.13e-55 199
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MsG0480020780.01.T01 AT2G47060 35.530 349 152 10 202 493 62 394 2.01e-53 187
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MsG0480020780.01.T01 AT2G05940 37.026 343 168 11 201 517 75 395 4.05e-53 188
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MsG0480020780.01.T01 AT1G55200 39.009 323 174 11 169 486 345 649 6.62e-52 189
MsG0480020780.01.T01 AT1G55200 39.009 323 174 11 169 486 345 649 6.62e-52 189
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MsG0480020780.01.T01 AT3G09010 37.417 302 162 7 197 486 30 316 5.39e-51 181
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MsG0480020780.01.T01 AT3G14350 38.699 292 163 7 197 481 366 648 2.82e-50 185
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MsG0480020780.01.T01 AT2G39660 36.570 309 171 9 198 489 52 352 9.42e-50 177
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MsG0480020780.01.T01 AT1G07570 36.859 312 168 10 197 489 52 353 2.06e-49 177
MsG0480020780.01.T01 AT4G11460 38.944 303 162 9 199 490 332 622 2.07e-49 182
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MsG0480020780.01.T01 AT2G13800 36.964 303 176 7 192 486 137 432 2.16e-49 179
MsG0480020780.01.T01 AT5G58940 35.987 314 176 7 189 489 123 424 2.19e-49 178
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MsG0480020780.01.T01 AT4G02630 34.713 314 174 8 201 499 150 447 2.47e-49 179
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MsG0480020780.01.T01 AT4G35030 37.748 302 176 9 191 486 82 377 1.02e-46 171
MsG0480020780.01.T01 AT4G35030 37.748 302 176 9 191 486 82 377 1.02e-46 171
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MsG0480020780.01.T01 AT1G66150 36.066 305 157 9 206 489 581 868 1.28e-46 176
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MsG0480020780.01.T01 AT4G23140 37.748 302 162 9 199 488 337 624 1.47e-46 174
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MsG0480020780.01.T01 AT1G07650 38.356 292 167 7 201 486 672 956 2.09e-46 176
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MsG0480020780.01.T01 AT5G53890 31.818 440 242 13 64 489 633 1028 7.89e-46 174
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MsG0480020780.01.T01 AT5G54590 32.381 315 175 6 198 499 100 389 2.78e-45 166
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MsG0480020780.01.T01 AT4G23250 35.906 298 178 6 199 490 340 630 4.41e-45 172
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MsG0480020780.01.T01 AT5G01950 35.032 314 167 9 201 496 614 908 5.23e-45 172
MsG0480020780.01.T01 AT5G01950 35.032 314 167 9 201 496 614 908 5.23e-45 172
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MsG0480020780.01.T01 AT1G48210 40.486 247 124 7 197 429 52 289 5.65e-45 162
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MsG0480020780.01.T01 AT4G23270 35.738 305 165 8 199 488 312 600 1.30e-44 168
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MsG0480020780.01.T01 AT2G04300 35.806 310 169 8 200 497 571 862 3.88e-44 169
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MsG0480020780.01.T01 AT4G00340 37.500 304 164 10 197 486 447 738 5.18e-44 168
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MsG0480020780.01.T01 AT4G11480 35.390 308 166 8 199 490 310 600 5.23e-44 167
MsG0480020780.01.T01 AT1G76360 34.675 323 181 9 197 498 147 460 5.34e-44 164
MsG0480020780.01.T01 AT4G32300 36.570 309 174 10 192 491 474 769 5.45e-44 168
MsG0480020780.01.T01 AT1G11300 36.943 314 178 8 180 488 477 775 5.47e-44 168
MsG0480020780.01.T01 AT4G21400 35.625 320 168 9 190 490 339 639 6.12e-44 167
MsG0480020780.01.T01 AT4G00340 37.500 304 164 10 197 486 468 759 6.49e-44 168
MsG0480020780.01.T01 AT1G51940 35.350 314 162 8 201 489 329 626 7.34e-44 166
MsG0480020780.01.T01 AT4G29180 33.432 338 193 7 200 522 554 874 7.48e-44 168
MsG0480020780.01.T01 AT1G66460 35.185 324 186 8 197 501 140 458 8.81e-44 163
MsG0480020780.01.T01 AT1G28440 35.443 316 177 8 193 492 661 965 9.09e-44 168
MsG0480020780.01.T01 AT1G56145 35.294 306 171 7 193 487 667 956 9.37e-44 168
MsG0480020780.01.T01 AT4G11480 34.494 316 166 8 199 490 307 605 1.04e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT4G21410 37.134 307 156 10 203 490 222 510 1.05e-43 164
MsG0480020780.01.T01 AT1G56145 35.294 306 171 7 193 487 564 853 1.09e-43 167
MsG0480020780.01.T01 AT4G21400 35.404 322 171 8 188 490 324 627 1.09e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT4G20140 34.007 297 165 5 203 478 941 1227 1.14e-43 168
MsG0480020780.01.T01 AT1G16120 34.384 349 191 7 181 514 394 719 1.27e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT4G23310 33.762 311 167 7 199 490 454 744 1.28e-43 167
MsG0480020780.01.T01 AT4G23310 33.762 311 167 7 199 490 494 784 1.62e-43 167
MsG0480020780.01.T01 AT5G06740 32.558 344 203 9 167 487 282 619 1.72e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT5G06740 32.558 344 203 9 167 487 270 607 1.93e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT4G28650 32.558 301 170 10 216 499 702 986 2.07e-43 167
MsG0480020780.01.T01 AT2G28970 35.390 308 169 8 191 486 424 713 2.18e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT5G16900 37.338 308 163 7 203 498 379 668 2.42e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT4G21410 37.134 307 156 10 203 490 347 635 2.59e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT5G02070 35.806 310 164 8 201 489 351 646 2.61e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT3G14840 34.437 302 170 6 198 486 657 943 2.61e-43 167
MsG0480020780.01.T01 AT3G46290 34.448 299 169 6 200 486 472 755 2.69e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT2G28970 35.390 308 169 8 191 486 459 748 2.75e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT5G61350 35.855 304 161 8 201 486 513 800 2.92e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT3G19300 33.113 302 165 8 200 486 315 594 3.16e-43 164
MsG0480020780.01.T01 AT3G55950 37.618 319 156 10 200 486 483 790 3.24e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT1G61480 33.134 335 192 9 201 521 484 800 3.54e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT1G07570 41.395 215 114 6 280 489 30 237 3.86e-43 156
MsG0480020780.01.T01 AT1G11350 38.356 292 170 7 201 488 500 785 5.43e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT4G00960 34.539 304 178 8 196 488 39 332 5.51e-43 158
MsG0480020780.01.T01 AT4G11900 28.178 472 256 15 36 488 334 741 5.99e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT1G17910 35.185 324 181 5 181 489 419 728 6.19e-43 164
MsG0480020780.01.T01 AT2G26330 36.570 309 161 8 194 488 629 916 6.43e-43 166
MsG0480020780.01.T01 AT2G28940 40.650 246 133 7 277 516 60 298 6.52e-43 157
MsG0480020780.01.T01 AT1G16130 36.735 294 159 5 201 482 404 682 6.54e-43 164
MsG0480020780.01.T01 AT4G23200 35.179 307 166 8 200 490 323 612 7.03e-43 163
MsG0480020780.01.T01 AT1G24650 34.314 306 161 11 196 480 531 817 7.16e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT1G51910 37.458 299 154 10 200 486 562 839 7.93e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT5G35370 33.628 339 197 6 200 516 504 836 9.10e-43 165
MsG0480020780.01.T01 AT4G23150 36.424 302 166 9 199 488 322 609 9.30e-43 163
MsG0480020780.01.T01 AT4G11900 28.178 472 256 15 36 488 403 810 9.73e-43 164
MsG0480020780.01.T01 AT1G74360 37.049 305 160 9 201 490 802 1089 1.04e-42 165
MsG0480020780.01.T01 AT5G55830 35.294 306 165 9 200 488 352 641 1.21e-42 163
MsG0480020780.01.T01 AT3G09010 37.600 250 130 7 197 433 30 266 1.50e-42 155
MsG0480020780.01.T01 AT3G46400 36.824 296 157 8 200 483 565 842 1.64e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT5G63930 36.513 304 158 12 201 486 792 1078 1.64e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT5G16900 37.338 308 163 7 203 498 565 854 1.75e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT5G16900 37.338 308 163 7 203 498 565 854 1.75e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT1G66880 38.235 306 166 11 201 496 336 628 1.88e-42 162
MsG0480020780.01.T01 AT5G63930 36.513 304 158 12 201 486 728 1014 1.89e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT5G03140 37.333 300 162 9 200 486 361 647 1.92e-42 163
MsG0480020780.01.T01 AT1G06840 36.395 294 173 6 201 489 613 897 2.00e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT1G61390 36.177 293 177 6 201 490 340 625 2.14e-42 162
MsG0480020780.01.T01 AT3G24240 34.727 311 170 8 200 489 768 1066 2.75e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT1G11330 35.077 325 199 7 201 519 512 830 2.80e-42 163
MsG0480020780.01.T01 AT1G72300 34.628 309 170 7 205 498 795 1086 2.81e-42 164
MsG0480020780.01.T01 AT1G11330 35.077 325 199 7 201 519 510 828 3.11e-42 163
MsG0480020780.01.T01 AT5G24010 32.653 343 195 7 199 529 475 793 3.44e-42 163

Find 134 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 222 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAGTGTTTAGATGGAGTTTC+TGG 0.136141 4:+48197185 MsG0480020780.01.T01:CDS
CATTCCCACTAGCTTGTTTC+AGG 0.171305 4:+48198242 MsG0480020780.01.T01:CDS
GTATTTGAGTACATGATTAA+TGG 0.210130 4:+48197152 MsG0480020780.01.T01:CDS
CTAGGCTTCTCCTCGTTTAC+TGG 0.212039 4:+48198029 MsG0480020780.01.T01:intron
ACATTCTTCTAGATGAAAAT+TGG 0.241867 4:+48197324 MsG0480020780.01.T01:CDS
CTCTTTAAAAGTAGTCTTGC+AGG 0.248654 4:+48198971 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR
GCACCTGAGTATGCGATTAT+TGG 0.253042 4:+48197663 MsG0480020780.01.T01:CDS
AAGAAGAAAGCCTCGTTATA+TGG 0.254691 4:+48197778 MsG0480020780.01.T01:CDS
GCACTTTCCAGTTCAGTAAA+TGG 0.267158 4:-48196747 None:intergenic
TGGAGTTTCTGGAAAATATA+TGG 0.280881 4:+48197196 MsG0480020780.01.T01:CDS
TCCTTATCTGATGAGAATAT+TGG 0.288769 4:-48196409 None:intergenic
TTCACGCCTGCAACTGCACC+TGG 0.296319 4:+48195679 MsG0480020780.01.T01:CDS
GAATCAGACGTCTTCAGTTT+TGG 0.305303 4:+48197699 MsG0480020780.01.T01:CDS
AAATCATGCAATTGCCGTTC+AGG 0.312467 4:+48195480 MsG0480020780.01.T01:CDS
ATTATATGTACCTCTTCTTC+TGG 0.316748 4:-48198105 None:intergenic
TATGCGCGGCATTCTTCTTT+TGG 0.318187 4:+48195362 None:intergenic
TGCAGTTTCAGCCGAGTATA+TGG 0.323070 4:+48198569 MsG0480020780.01.T01:CDS
TCAATTTCCATTTACTGAAC+TGG 0.323804 4:+48196740 MsG0480020780.01.T01:CDS
AATTTGAGGGAGTGTTTAGA+TGG 0.324456 4:+48197176 MsG0480020780.01.T01:CDS
ATCTACATTTCCACTTGTTT+AGG 0.325622 4:-48195410 None:intergenic
TGTCATTTGGTGCCATTACT+TGG 0.357608 4:+48197087 MsG0480020780.01.T01:CDS
AGAAGAAGAGGTACATATAA+TGG 0.359230 4:+48198107 MsG0480020780.01.T01:CDS
AGCAAAGGAGTGCTTGTTGC+TGG 0.359820 4:+48198137 MsG0480020780.01.T01:CDS
AATGTCCCTTGCATTCTTGC+TGG 0.362329 4:-48197630 None:intergenic
TTACCTGTGATGTGACAAAT+AGG 0.373940 4:-48196517 None:intergenic
TTCTCGGAGCAGCTGCTTCA+TGG 0.377581 4:-48197274 None:intergenic
TAGACTTCATCATTGTCATT+TGG 0.378709 4:+48197074 MsG0480020780.01.T01:intron
GATAACTACAACAACCTTGC+TGG 0.380501 4:-48196296 None:intergenic
TACTTCCGCCTACTCCAATA+AGG 0.398907 4:-48196794 None:intergenic
GCAAGAATGCAAGGGACATT+TGG 0.399957 4:+48197633 MsG0480020780.01.T01:CDS
AATGCTTTCAAGTATTTCTC+CGG 0.401631 4:+48198197 MsG0480020780.01.T01:CDS
TATACCCCAGGTGCAGTTGC+AGG 0.402118 4:-48195685 None:intergenic
AAACATGCAGAGTCTGCTTC+TGG 0.403047 4:-48196888 None:intergenic
ACGATGTTAATTAATGAAAT+CGG 0.406765 4:-48198917 None:intergenic
ACTCGTGTTACGATTGCAAT+TGG 0.414276 4:+48197227 MsG0480020780.01.T01:CDS
GGAACTATCAGCACATCATT+AGG 0.423910 4:+48196256 MsG0480020780.01.T01:intron
ACATCTCTATGAAGAATTCT+CGG 0.428923 4:-48197290 None:intergenic
GGGAAGTTTCCTTTCAATTG+TGG 0.429040 4:-48198084 None:intergenic
CATCCTATCCATAAAACTAC+TGG 0.432461 4:+48197753 MsG0480020780.01.T01:CDS
TTACCATCTACTGCCACTTC+GGG 0.434598 4:-48195642 None:intergenic
TTATATGTACCTCTTCTTCT+GGG 0.435324 4:-48198104 None:intergenic
CTCATGGTTGGTCGAGTGTC+CGG 0.439970 4:-48198162 None:intergenic
CATGATTAATGGAAATTTGA+GGG 0.442689 4:+48197163 MsG0480020780.01.T01:CDS
GGAGTGCTTGTTGCTGGATC+CGG 0.456355 4:+48198143 MsG0480020780.01.T01:CDS
AGAAGAAAGCCTCGTTATAT+GGG 0.457828 4:+48197779 MsG0480020780.01.T01:CDS
GTTGGTAGCGGAAAAGTTAT+CGG 0.460794 4:-48196772 None:intergenic
TTCCTGTCCTATGACTGATT+AGG 0.462531 4:-48196456 None:intergenic
ATCACATATGCAAGTCCATA+TGG 0.462974 4:-48195607 None:intergenic
TGCCACTTCGGGAAATCCAT+TGG 0.462988 4:-48195631 None:intergenic
ACCAATATTCTCATCAGATA+AGG 0.465388 4:+48196408 MsG0480020780.01.T01:CDS
TTGGTAAGTCATCAGATCTC+AGG 0.468646 4:-48197593 None:intergenic
CCACCAACCTAATCAGTCAT+AGG 0.469190 4:+48196449 MsG0480020780.01.T01:CDS
TTTCCCGAAGTGGCAGTAGA+TGG 0.471536 4:+48195639 MsG0480020780.01.T01:CDS
GGACAGTAGACGAGTAATAT+CGG 0.472066 4:+48198050 MsG0480020780.01.T01:CDS
TTTCTGGAAAATATATGGAT+TGG 0.472467 4:+48197201 MsG0480020780.01.T01:CDS
CATTTCCACTTGTTTAGGAC+AGG 0.476195 4:-48195405 None:intergenic
CTGAAGAGGGTGCATCCATA+TGG 0.476274 4:+48195592 MsG0480020780.01.T01:CDS
AATTGGAGCAGCAAGGGGCT+TGG 0.476675 4:+48197244 MsG0480020780.01.T01:CDS
AAATTGCAGATCACTGATCT+TGG 0.481620 4:+48197558 MsG0480020780.01.T01:intron
ACAATAAATAGCATTATTCA+AGG 0.485402 4:-48198720 None:intergenic
CCTATGACTGATTAGGTTGG+TGG 0.495084 4:-48196449 None:intergenic
GGATACTGCTTAGAATCAAA+AGG 0.496323 4:+48197108 MsG0480020780.01.T01:CDS
GTTCTTCTCGAGCTTATCAC+TGG 0.496547 4:+48197726 MsG0480020780.01.T01:CDS
GACTCTCCAGCAAGAATGCA+AGG 0.503727 4:+48197624 MsG0480020780.01.T01:CDS
ATCGATCACAATCCATGTGT+TGG 0.505633 4:+48198525 MsG0480020780.01.T01:CDS
ATTACCATCTACTGCCACTT+CGG 0.508101 4:-48195643 None:intergenic
GCCACTTCGGGAAATCCATT+GGG 0.510026 4:-48195630 None:intergenic
GTTGGTGGTACTACCACTAC+TGG 0.514035 4:-48196434 None:intergenic
ACATGATTAATGGAAATTTG+AGG 0.514930 4:+48197162 MsG0480020780.01.T01:CDS
TCACGCCTGCAACTGCACCT+GGG 0.526922 4:+48195680 MsG0480020780.01.T01:CDS
TCTCCTATTTGTCACATCAC+AGG 0.530041 4:+48196514 MsG0480020780.01.T01:CDS
TACCGTGGTCGGCTAAAAGA+TGG 0.530688 4:+48196825 MsG0480020780.01.T01:CDS
AACAAAATTGCATACCTGAA+CGG 0.537961 4:-48195494 None:intergenic
ATGCTTTCAAGTATTTCTCC+GGG 0.540086 4:+48198198 MsG0480020780.01.T01:CDS
GATTGCAATTGGAGCAGCAA+GGG 0.541198 4:+48197238 MsG0480020780.01.T01:CDS
ATACACCTGTCCTAAACAAG+TGG 0.542659 4:+48195400 MsG0480020780.01.T01:CDS
CACGCCTGCAACTGCACCTG+GGG 0.543810 4:+48195681 MsG0480020780.01.T01:CDS
GTTAAGCGCCTAAAAGATCA+TGG 0.544424 4:+48196861 MsG0480020780.01.T01:CDS
GCAGATCACTGATCTTGGTA+TGG 0.545629 4:+48197563 MsG0480020780.01.T01:intron
TTAGTTGATCCACAATTGAA+AGG 0.548070 4:+48198075 MsG0480020780.01.T01:CDS
AAATGATTCGAACCGAGGCT+CGG 0.548421 4:-48198661 None:intergenic
CATTTGAACAACCTCGCTCA+TGG 0.556419 4:-48198178 None:intergenic
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TGAACAACCTCGCTCATGGT+TGG 0.566794 4:-48198174 None:intergenic
TACTCCAATAAGGTTGGTAG+CGG 0.567318 4:-48196784 None:intergenic
GCTACCAACCTTATTGGAGT+AGG 0.570333 4:+48196786 MsG0480020780.01.T01:CDS
CGATTGCAATTGGAGCAGCA+AGG 0.573945 4:+48197237 MsG0480020780.01.T01:CDS
GTATTTCTCCGGGAAAATCA+AGG 0.574626 4:+48198208 MsG0480020780.01.T01:CDS
AGGAAACTTCCCAGAAGAAG+AGG 0.574855 4:+48198095 MsG0480020780.01.T01:CDS
TGTCCTATGACTGATTAGGT+TGG 0.577139 4:-48196452 None:intergenic
TAGCTCTCATGCATCAGAAG+AGG 0.579011 4:+48198623 MsG0480020780.01.T01:CDS
GCAACAAGCACTCCTTTGCT+AGG 0.579892 4:-48198134 None:intergenic
AAAGAAACACATTTCCAGCA+AGG 0.580304 4:+48196282 MsG0480020780.01.T01:CDS
AACCTAATCAGTCATAGGAC+AGG 0.586052 4:+48196454 MsG0480020780.01.T01:CDS
AGATGAAAATTGGCAAGCAA+AGG 0.586681 4:+48197334 MsG0480020780.01.T01:CDS
CTACCAATAATCGCATACTC+AGG 0.587192 4:-48197666 None:intergenic
GCTAAAAGATGGCAATATTG+TGG 0.591589 4:+48196836 MsG0480020780.01.T01:CDS
TCCGCCTACTCCAATAAGGT+TGG 0.595932 4:-48196790 None:intergenic
GCTGGAGAGTCTGAACCGCT+TGG 0.600786 4:-48197612 None:intergenic
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CTTCCATGTAGATGCTGAAG+AGG 0.607974 4:+48195578 MsG0480020780.01.T01:intron
ACCAACCTTATTGGAGTAGG+CGG 0.622231 4:+48196789 MsG0480020780.01.T01:CDS
ATTGCAATTGGAGCAGCAAG+GGG 0.625393 4:+48197239 MsG0480020780.01.T01:CDS
TTCCTCACTAAGATATCACA+AGG 0.626576 4:+48198746 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR
AGCGCCTAAAAGATCATGGA+GGG 0.631769 4:+48196865 MsG0480020780.01.T01:CDS
ATGCAAAATGATTCGAACCG+AGG 0.634128 4:-48198666 None:intergenic
TTTACCTGAAACAAGCTAGT+GGG 0.634246 4:-48198246 None:intergenic
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GTTTACCTGAAACAAGCTAG+TGG 0.641577 4:-48198247 None:intergenic
TCGTAGACATAACCGAGCCT+CGG 0.641810 4:+48198649 MsG0480020780.01.T01:CDS
TATAATGGCATACCTAGCAA+AGG 0.641921 4:+48198122 MsG0480020780.01.T01:CDS
CACTCGACCAACCATGAGCG+AGG 0.642214 4:+48198167 MsG0480020780.01.T01:CDS
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CGTCTACTGTCCAGTAAACG+AGG 0.663147 4:-48198039 None:intergenic
TTCCATGTAGATGCTGAAGA+GGG 0.663712 4:+48195579 MsG0480020780.01.T01:intron
TGCATATAACACATATCACT+AGG 0.666616 4:-48196318 None:intergenic
TATACAGCAGCACATAGATG+TGG 0.670237 4:+48198786 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR
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TCCCTTGTGATATCTTAGTG+AGG 0.673874 4:-48198748 None:intergenic
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GGTAGCGGAAAAGTTATCGG+TGG 0.707961 4:-48196769 None:intergenic
TTTAAAGTACCCATATAACG+AGG 0.716405 4:-48197788 None:intergenic
GGAAGTAGTTATGTATACCG+TGG 0.718504 4:+48196810 MsG0480020780.01.T01:CDS
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ATAGACGTAGCATACAGCTG+AGG 0.745065 4:-48196359 None:intergenic
TCCTCACTAAGATATCACAA+GGG 0.747451 4:+48198747 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR
TTTCTCCGGGAAAATCAAGG+AGG 0.764678 4:+48198211 MsG0480020780.01.T01:CDS

CRISPR-GE

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!! AATCAATAACTAATACATAA+TGG - Chr4:48196636-48196655 None:intergenic 15.0%
!! CTAAATTTAATTAGAAGATA+CGG - Chr4:48197885-48197904 None:intergenic 15.0%
!!! ATTAACATCGTATATTTTTT+CGG + Chr4:48198929-48198948 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!!! ATTTTGTTTAATGTTAAATG+AGG + Chr4:48195509-48195528 MsG0480020780.01.T01:intron 15.0%
!! AACACTATAAATATACCTTA+TGG - Chr4:48197517-48197536 None:intergenic 20.0%
!! ACAATAAATAGCATTATTCA+AGG - Chr4:48198723-48198742 None:intergenic 20.0%
!! ACGATGTTAATTAATGAAAT+CGG - Chr4:48198920-48198939 None:intergenic 20.0%
!! ACTCAAAATACCATAAATTA+AGG - Chr4:48196228-48196247 None:intergenic 20.0%
!!! AACATAGACAAAATTGATTT+CGG - Chr4:48196017-48196036 None:intergenic 20.0%
!!! CTTATAAAAAGTTTTGTTTC+TGG - Chr4:48196493-48196512 None:intergenic 20.0%
!!! TTGCTGAATATTTTTCTTTA+TGG + Chr4:48198417-48198436 MsG0480020780.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTAAGTATCCGTAAATAA+CGG - Chr4:48196078-48196097 None:intergenic 20.0%
! AAAGAAAAATATTCAGCAAG+TGG - Chr4:48198416-48198435 None:intergenic 25.0%
! AATACAAATACACTGAAAAG+AGG - Chr4:48196152-48196171 None:intergenic 25.0%
! ACATGATTAATGGAAATTTG+AGG + Chr4:48197162-48197181 MsG0480020780.01.T01:CDS 25.0%
! ACATTCTTCTAGATGAAAAT+TGG + Chr4:48197324-48197343 MsG0480020780.01.T01:CDS 25.0%
! ATACAAATACACTGAAAAGA+GGG - Chr4:48196151-48196170 None:intergenic 25.0%
! ATTCTTGTACAAAAAAGCTT+AGG + Chr4:48198849-48198868 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! CATGATTAATGGAAATTTGA+GGG + Chr4:48197163-48197182 MsG0480020780.01.T01:CDS 25.0%
! GATTAAACTTTCCATATACT+CGG - Chr4:48198583-48198602 None:intergenic 25.0%
! GGTAACTGATATAGAAATTT+AGG - Chr4:48195739-48195758 None:intergenic 25.0%
! GTATTTGAGTACATGATTAA+TGG + Chr4:48197152-48197171 MsG0480020780.01.T01:CDS 25.0%
! TACAATTGCACAAATTGAAA+AGG - Chr4:48196584-48196603 None:intergenic 25.0%
! TTTGTTCATGCCTTAATTTA+TGG + Chr4:48196215-48196234 MsG0480020780.01.T01:intron 25.0%
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!! ATCTTGGTTATTCTTTTAGA+TGG + Chr4:48197362-48197381 MsG0480020780.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTCATCTAGAAGAATGT+TGG - Chr4:48197324-48197343 None:intergenic 25.0%
!! TACACATTTTCAATTACTTG+AGG + Chr4:48197389-48197408 MsG0480020780.01.T01:intron 25.0%
!! TTCCATGAAAAGTTTCTTTT+TGG - Chr4:48196713-48196732 None:intergenic 25.0%
!! TTTCTGGAAAATATATGGAT+TGG + Chr4:48197201-48197220 MsG0480020780.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCTTTATGGAAATGCAA+AGG + Chr4:48198428-48198447 MsG0480020780.01.T01:intron 25.0%
!!! AGGCTAAAAATCATTTTTGA+AGG - Chr4:48195906-48195925 None:intergenic 25.0%
!!! GGTTTTTTGGTTCTTTTATT+TGG + Chr4:48198886-48198905 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! TATTAGATTTTGATGTCAAC+AGG - Chr4:48198605-48198624 None:intergenic 25.0%
!!! TTAGTTCTTTTTCTTCATGT+AGG + Chr4:48196654-48196673 MsG0480020780.01.T01:intron 25.0%
!!! TTATTTTTGTTTCCAACACA+TGG - Chr4:48198540-48198559 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTCGGACAAATATACTT+AGG + Chr4:48198944-48198963 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
AAAAGCTCCAAAACAGATTT+AGG - Chr4:48195882-48195901 None:intergenic 30.0%
AACAAAATTGCATACCTGAA+CGG - Chr4:48195497-48195516 None:intergenic 30.0%
AACAAATGTTAGTGTGTGTT+TGG - Chr4:48196043-48196062 None:intergenic 30.0%
ACATCTCTATGAAGAATTCT+CGG - Chr4:48197293-48197312 None:intergenic 30.0%
ACCAATATTCTCATCAGATA+AGG + Chr4:48196408-48196427 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
ATCTACATTTCCACTTGTTT+AGG - Chr4:48195413-48195432 None:intergenic 30.0%
ATTATATGTACCTCTTCTTC+TGG - Chr4:48198108-48198127 None:intergenic 30.0%
CTTGGTAAAACCGTTATTTA+CGG + Chr4:48196065-48196084 MsG0480020780.01.T01:intron 30.0%
GACTGTTAGACAATAAATCT+AGG - Chr4:48195926-48195945 None:intergenic 30.0%
TAGACTTCATCATTGTCATT+TGG + Chr4:48197074-48197093 MsG0480020780.01.T01:intron 30.0%
TCAAAAGGAAACATGTTCAA+AGG + Chr4:48197123-48197142 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
TCAATTTCCATTTACTGAAC+TGG + Chr4:48196740-48196759 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTATCTGATGAGAATAT+TGG - Chr4:48196412-48196431 None:intergenic 30.0%
TCGAAAGAATACTAAATCAC+TGG - Chr4:48196942-48196961 None:intergenic 30.0%
TGCATATAACACATATCACT+AGG - Chr4:48196321-48196340 None:intergenic 30.0%
TTAGTTGATCCACAATTGAA+AGG + Chr4:48198075-48198094 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
TTATATGTACCTCTTCTTCT+GGG - Chr4:48198107-48198126 None:intergenic 30.0%
TTGTACAAAAAAGCTTAGGA+GGG + Chr4:48198853-48198872 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TTGTCTCTCATATTGCATTT+AGG - Chr4:48195829-48195848 None:intergenic 30.0%
TTTCAAAATTTGATGCTTGC+CGG + Chr4:48198333-48198352 MsG0480020780.01.T01:intron 30.0%
! AATGCTTTCAAGTATTTCTC+CGG + Chr4:48198197-48198216 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
! AGAAGAAGAGGTACATATAA+TGG + Chr4:48198107-48198126 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
! AGCCAAAAAGAAACTTTTCA+TGG + Chr4:48196708-48196727 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
! ATTCTAGCCTAAATCTGTTT+TGG + Chr4:48195872-48195891 MsG0480020780.01.T01:intron 30.0%
! GATTTCGGATGAACTAATTT+TGG - Chr4:48196002-48196021 None:intergenic 30.0%
! GTAGATGTTCTTCTTTTGAA+GGG + Chr4:48195427-48195446 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
! TCTCATATTGCATTTAGGTT+TGG - Chr4:48195824-48195843 None:intergenic 30.0%
! TGGAGTTTCTGGAAAATATA+TGG + Chr4:48197196-48197215 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
! TGTAGATGTTCTTCTTTTGA+AGG + Chr4:48195426-48195445 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
! TTTAAAGTACCCATATAACG+AGG - Chr4:48197791-48197810 None:intergenic 30.0%
!! CACACTAACATTTGTTTTCT+TGG + Chr4:48196047-48196066 MsG0480020780.01.T01:intron 30.0%
!! CTTCTTTTCCAGTAGTTTTA+TGG - Chr4:48197764-48197783 None:intergenic 30.0%
!! GTTTGGTGTAGAATAATAAC+TGG - Chr4:48195807-48195826 None:intergenic 30.0%
!!! AGAAAGCCTCTTTTTTGTTT+GGG + Chr4:48196685-48196704 MsG0480020780.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTCCAGTAGTTTTATGGAT+AGG - Chr4:48197759-48197778 None:intergenic 30.0%
AAAGAAACACATTTCCAGCA+AGG + Chr4:48196282-48196301 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
AAATTGCAGATCACTGATCT+TGG + Chr4:48197558-48197577 MsG0480020780.01.T01:intron 35.0%
AAGAAGAAAGCCTCGTTATA+TGG + Chr4:48197778-48197797 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGAAAGCCTCGTTATAT+GGG + Chr4:48197779-48197798 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
AGATGAAAATTGGCAAGCAA+AGG + Chr4:48197334-48197353 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
AGTACATCTAAATCACCTTC+AGG - Chr4:48195775-48195794 None:intergenic 35.0%
ATCACATATGCAAGTCCATA+TGG - Chr4:48195610-48195629 None:intergenic 35.0%
CATCCTATCCATAAAACTAC+TGG + Chr4:48197753-48197772 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGCTTATGATATGATTG+AGG + Chr4:48197453-48197472 MsG0480020780.01.T01:intron 35.0%
CTTGTACAAAAAAGCTTAGG+AGG + Chr4:48198852-48198871 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GCTAAAAGATGGCAATATTG+TGG + Chr4:48196836-48196855 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
GGATACTGCTTAGAATCAAA+AGG + Chr4:48197108-48197127 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
GTGTGACATAACTAACATTC+CGG - Chr4:48198355-48198374 None:intergenic 35.0%
TAGGCTAGAATCAATTCTAG+AGG - Chr4:48195863-48195882 None:intergenic 35.0%
TATAATGGCATACCTAGCAA+AGG + Chr4:48198122-48198141 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
TCCTCACTAAGATATCACAA+GGG + Chr4:48198747-48198766 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TCTAAGCAGTATCCAAGTAA+TGG - Chr4:48197102-48197121 None:intergenic 35.0%
TTACCTGTGATGTGACAAAT+AGG - Chr4:48196520-48196539 None:intergenic 35.0%
TTATGGAAATGCAAAGGAAG+CGG + Chr4:48198434-48198453 MsG0480020780.01.T01:intron 35.0%
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TTTACCTGAAACAAGCTAGT+GGG - Chr4:48198249-48198268 None:intergenic 35.0%
! ATGATCTTTTAGGCGCTTAA+CGG - Chr4:48196862-48196881 None:intergenic 35.0%
! ATGCTTTCAAGTATTTCTCC+GGG + Chr4:48198198-48198217 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
! CTCTTTAAAAGTAGTCTTGC+AGG + Chr4:48198971-48198990 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! GAATCATTTTGCATGACAGA+CGG + Chr4:48198675-48198694 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
!! AATTTGAGGGAGTGTTTAGA+TGG + Chr4:48197176-48197195 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTCAAGGAGTGTGTTTTCA+AGG - Chr4:48198708-48198727 None:intergenic 35.0%
!! CTGCAAGACTACTTTTAAAG+AGG - Chr4:48198973-48198992 None:intergenic 35.0%
!! GTGTTGTCACTTTAACCATA+AGG + Chr4:48197499-48197518 MsG0480020780.01.T01:intron 35.0%
!! TGGTATTTTGAGTGATATGC+AGG + Chr4:48196235-48196254 MsG0480020780.01.T01:intron 35.0%
!! TTCAAGGAGTGTGTTTTCAA+GGG - Chr4:48198707-48198726 None:intergenic 35.0%
!!! CAGAAAGCCTCTTTTTTGTT+TGG + Chr4:48196684-48196703 MsG0480020780.01.T01:CDS 35.0%
AAAAAGCTTAGGAGGGCTAT+AGG + Chr4:48198860-48198879 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
AAATCATGCAATTGCCGTTC+AGG + Chr4:48195480-48195499 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
AACCTAATCAGTCATAGGAC+AGG + Chr4:48196454-48196473 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
ACTCGTGTTACGATTGCAAT+TGG + Chr4:48197227-48197246 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGCATATGTGATCCCAA+TGG + Chr4:48195615-48195634 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
AGATCTGATGACTTACCAAG+CGG + Chr4:48197597-48197616 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
AGCGAGCTATATCAGTAATC+GGG - Chr4:48197997-48198016 None:intergenic 40.0%
ATACACCTGTCCTAAACAAG+TGG + Chr4:48195400-48195419 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
ATCCTTCGATATGCAACCTT+AGG + Chr4:48197419-48197438 MsG0480020780.01.T01:intron 40.0%
ATCGATCACAATCCATGTGT+TGG + Chr4:48198525-48198544 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAAAATGATTCGAACCG+AGG - Chr4:48198669-48198688 None:intergenic 40.0%
CAAAGAGAAAGATATACCCC+AGG - Chr4:48195700-48195719 None:intergenic 40.0%
CAGCGAGCTATATCAGTAAT+CGG - Chr4:48197998-48198017 None:intergenic 40.0%
CGGAGAATGCAGAAAAACAA+GGG + Chr4:48198454-48198473 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
CTACCAATAATCGCATACTC+AGG - Chr4:48197669-48197688 None:intergenic 40.0%
GAGTGTTTAGATGGAGTTTC+TGG + Chr4:48197185-48197204 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
GATAACTACAACAACCTTGC+TGG - Chr4:48196299-48196318 None:intergenic 40.0%
GCACTTTCCAGTTCAGTAAA+TGG - Chr4:48196750-48196769 None:intergenic 40.0%
GGAACTATCAGCACATCATT+AGG + Chr4:48196256-48196275 MsG0480020780.01.T01:intron 40.0%
GGAAGTAGTTATGTATACCG+TGG + Chr4:48196810-48196829 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
GGACAGTAGACGAGTAATAT+CGG + Chr4:48198050-48198069 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
GGGAAGTTTCCTTTCAATTG+TGG - Chr4:48198087-48198106 None:intergenic 40.0%
GTAGTTATGTATACCGTGGT+CGG + Chr4:48196814-48196833 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
GTATTTCTCCGGGAAAATCA+AGG + Chr4:48198208-48198227 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
GTTAAGCGCCTAAAAGATCA+TGG + Chr4:48196861-48196880 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
GTTTACCTGAAACAAGCTAG+TGG - Chr4:48198250-48198269 None:intergenic 40.0%
TATACAGCAGCACATAGATG+TGG + Chr4:48198786-48198805 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TCAGATAAGGAAACCAGTAG+TGG + Chr4:48196421-48196440 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
TCCCTTGTGATATCTTAGTG+AGG - Chr4:48198751-48198770 None:intergenic 40.0%
TCTCCTATTTGTCACATCAC+AGG + Chr4:48196514-48196533 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
TGTATGCTACGTCTATCGAA+GGG + Chr4:48196366-48196385 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
TGTCCTATGACTGATTAGGT+TGG - Chr4:48196455-48196474 None:intergenic 40.0%
TTCCATGTAGATGCTGAAGA+GGG + Chr4:48195579-48195598 MsG0480020780.01.T01:intron 40.0%
TTCCTGTCCTATGACTGATT+AGG - Chr4:48196459-48196478 None:intergenic 40.0%
TTCGTTCTCATTGTGAAGTG+CGG + Chr4:48196106-48196125 MsG0480020780.01.T01:intron 40.0%
TTGGCTCCCAAACAAAAAAG+AGG - Chr4:48196694-48196713 None:intergenic 40.0%
TTGGTAAGTCATCAGATCTC+AGG - Chr4:48197596-48197615 None:intergenic 40.0%
! AGCAGACTCTGCATGTTTTA+AGG + Chr4:48196893-48196912 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
! ATTACCATCTACTGCCACTT+CGG - Chr4:48195646-48195665 None:intergenic 40.0%
! CATTTCCACTTGTTTAGGAC+AGG - Chr4:48195408-48195427 None:intergenic 40.0%
! GAATCAGACGTCTTCAGTTT+TGG + Chr4:48197699-48197718 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
! GCAAGCAAAGGTATGAATCT+TGG + Chr4:48197346-48197365 MsG0480020780.01.T01:intron 40.0%
! TTTTCCGCTACCAACCTTAT+TGG + Chr4:48196780-48196799 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGGTAGCGGAAAAGTTAT+CGG - Chr4:48196775-48196794 None:intergenic 40.0%
!! TACTCCAATAAGGTTGGTAG+CGG - Chr4:48196787-48196806 None:intergenic 40.0%
!! TGTCATTTGGTGCCATTACT+TGG + Chr4:48197087-48197106 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
!!! AGACTCTGCATGTTTTAAGG+AGG + Chr4:48196896-48196915 MsG0480020780.01.T01:CDS 40.0%
AAACATGCAGAGTCTGCTTC+TGG - Chr4:48196891-48196910 None:intergenic 45.0%
AAATGATTCGAACCGAGGCT+CGG - Chr4:48198664-48198683 None:intergenic 45.0%
AAGCGCCTAAAAGATCATGG+AGG + Chr4:48196864-48196883 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
AATGTCCCTTGCATTCTTGC+TGG - Chr4:48197633-48197652 None:intergenic 45.0%
ACCAACCTTATTGGAGTAGG+CGG + Chr4:48196789-48196808 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
ACTCTCCAGCAAGAATGCAA+GGG + Chr4:48197625-48197644 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
AGCGCCTAAAAGATCATGGA+GGG + Chr4:48196865-48196884 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
AGGAAACTTCCCAGAAGAAG+AGG + Chr4:48198095-48198114 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
ATAGACGTAGCATACAGCTG+AGG - Chr4:48196362-48196381 None:intergenic 45.0%
ATTGCAATTGGAGCAGCAAG+GGG + Chr4:48197239-48197258 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
CATTTGAACAACCTCGCTCA+TGG - Chr4:48198181-48198200 None:intergenic 45.0%
CCACCAACCTAATCAGTCAT+AGG + Chr4:48196449-48196468 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
CCTTCAGGAAACAACGACTA+TGG - Chr4:48195760-48195779 None:intergenic 45.0%
CGATTACTGATATAGCTCGC+TGG + Chr4:48197996-48198015 MsG0480020780.01.T01:intron 45.0%
CTCCTAAGGTTGCATATCGA+AGG - Chr4:48197424-48197443 None:intergenic 45.0%
CTCGCTGGAATTTCTGTTCT+AGG + Chr4:48198011-48198030 MsG0480020780.01.T01:intron 45.0%
CTCTTCAGCATCTACATGGA+AGG - Chr4:48195580-48195599 None:intergenic 45.0%
CTGTATGCTACGTCTATCGA+AGG + Chr4:48196365-48196384 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
CTTCCATGTAGATGCTGAAG+AGG + Chr4:48195578-48195597 MsG0480020780.01.T01:intron 45.0%
GATTGCAATTGGAGCAGCAA+GGG + Chr4:48197238-48197257 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGAATGCAAGGGACATT+TGG + Chr4:48197633-48197652 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
GCACCTGAGTATGCGATTAT+TGG + Chr4:48197663-48197682 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
GCAGATCACTGATCTTGGTA+TGG + Chr4:48197563-48197582 MsG0480020780.01.T01:intron 45.0%
GCGGAGAATGCAGAAAAACA+AGG + Chr4:48198453-48198472 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
GCTACCAACCTTATTGGAGT+AGG + Chr4:48196786-48196805 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
GTTCTTCTCGAGCTTATCAC+TGG + Chr4:48197726-48197745 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
TACTTCCGCCTACTCCAATA+AGG - Chr4:48196797-48196816 None:intergenic 45.0%
TAGCTCTCATGCATCAGAAG+AGG + Chr4:48198623-48198642 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
TGCAGTTTCAGCCGAGTATA+TGG + Chr4:48198569-48198588 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTCCGGGAAAATCAAGG+AGG + Chr4:48198211-48198230 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
! CCATAGTCGTTGTTTCCTGA+AGG + Chr4:48195757-48195776 MsG0480020780.01.T01:intron 45.0%
! CTTCTCCTCCTTGATTTTCC+CGG - Chr4:48198219-48198238 None:intergenic 45.0%
! TTACCATCTACTGCCACTTC+GGG - Chr4:48195645-48195664 None:intergenic 45.0%
!! CATTCCCACTAGCTTGTTTC+AGG + Chr4:48198242-48198261 MsG0480020780.01.T01:CDS 45.0%
!! CCTATGACTGATTAGGTTGG+TGG - Chr4:48196452-48196471 None:intergenic 45.0%
!!! GGGCTATAGGTGAGGTTTTT+TGG + Chr4:48198873-48198892 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CACCCTCTTCAGCATCTACA+TGG - Chr4:48195584-48195603 None:intergenic 50.0%
CCAAGTCGCAAAGACTCCTA+AGG - Chr4:48197438-48197457 None:intergenic 50.0%
CCTTAGGAGTCTTTGCGACT+TGG + Chr4:48197435-48197454 MsG0480020780.01.T01:intron 50.0%
CGATTGCAATTGGAGCAGCA+AGG + Chr4:48197237-48197256 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
CGTCTACTGTCCAGTAAACG+AGG - Chr4:48198042-48198061 None:intergenic 50.0%
CTAGGCTTCTCCTCGTTTAC+TGG + Chr4:48198029-48198048 MsG0480020780.01.T01:intron 50.0%
GACTCTCCAGCAAGAATGCA+AGG + Chr4:48197624-48197643 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
GCAACAAGCACTCCTTTGCT+AGG - Chr4:48198137-48198156 None:intergenic 50.0%
GCCACTTCGGGAAATCCATT+GGG - Chr4:48195633-48195652 None:intergenic 50.0%
TACCGTGGTCGGCTAAAAGA+TGG + Chr4:48196825-48196844 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
TCCGCCTACTCCAATAAGGT+TGG - Chr4:48196793-48196812 None:intergenic 50.0%
TCGTAGACATAACCGAGCCT+CGG + Chr4:48198649-48198668 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
TGAACAACCTCGCTCATGGT+TGG - Chr4:48198177-48198196 None:intergenic 50.0%
TTTCCCGAAGTGGCAGTAGA+TGG + Chr4:48195639-48195658 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
! CTGAAGAGGGTGCATCCATA+TGG + Chr4:48195592-48195611 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
! CTGGCCCTCCATGATCTTTT+AGG - Chr4:48196872-48196891 None:intergenic 50.0%
! TCCCAATGGATTTCCCGAAG+TGG + Chr4:48195629-48195648 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
! TGCCACTTCGGGAAATCCAT+TGG - Chr4:48195634-48195653 None:intergenic 50.0%
! TGCCATCTTTTAGCCGACCA+CGG - Chr4:48196830-48196849 None:intergenic 50.0%
!! AGACGTCTTCAGTTTTGGCG+TGG + Chr4:48197704-48197723 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
!! AGCAAAGGAGTGCTTGTTGC+TGG + Chr4:48198137-48198156 MsG0480020780.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTAGCGGAAAAGTTATCGG+TGG - Chr4:48196772-48196791 None:intergenic 50.0%
!! GTTGGTGGTACTACCACTAC+TGG - Chr4:48196437-48196456 None:intergenic 50.0%
AATTGGAGCAGCAAGGGGCT+TGG + Chr4:48197244-48197263 MsG0480020780.01.T01:CDS 55.0%
GCTTAGGAGGGCTATAGGTG+AGG + Chr4:48198865-48198884 MsG0480020780.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
TATACCCCAGGTGCAGTTGC+AGG - Chr4:48195688-48195707 None:intergenic 55.0%
TTCTCGGAGCAGCTGCTTCA+TGG - Chr4:48197277-48197296 None:intergenic 55.0%
! CTCATGGTTGGTCGAGTGTC+CGG - Chr4:48198165-48198184 None:intergenic 55.0%
! GGAGTGCTTGTTGCTGGATC+CGG + Chr4:48198143-48198162 MsG0480020780.01.T01:CDS 55.0%
CACTCGACCAACCATGAGCG+AGG + Chr4:48198167-48198186 MsG0480020780.01.T01:CDS 60.0%
GCTGGAGAGTCTGAACCGCT+TGG - Chr4:48197615-48197634 None:intergenic 60.0%
TCACGCCTGCAACTGCACCT+GGG + Chr4:48195680-48195699 MsG0480020780.01.T01:CDS 60.0%
TTCACGCCTGCAACTGCACC+TGG + Chr4:48195679-48195698 MsG0480020780.01.T01:CDS 60.0%
CACGCCTGCAACTGCACCTG+GGG + Chr4:48195681-48195700 MsG0480020780.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 48195363 48199027 48195363 ID=MsG0480020780.01;Name=MsG0480020780.01
Chr4 mRNA 48195363 48199027 48195363 ID=MsG0480020780.01.T01;Parent=MsG0480020780.01;Name=MsG0480020780.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|0.85|0.75|1|1|1|8|317|592
Chr4 exon 48195363 48195501 48195363 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28167;Parent=MsG0480020780.01.T01
Chr4 exon 48195589 48195702 48195589 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28168;Parent=MsG0480020780.01.T01
Chr4 exon 48196257 48196535 48196257 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28169;Parent=MsG0480020780.01.T01
Chr4 exon 48196676 48196917 48196676 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28170;Parent=MsG0480020780.01.T01
Chr4 exon 48197077 48197355 48197077 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28171;Parent=MsG0480020780.01.T01
Chr4 exon 48197567 48197800 48197567 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28172;Parent=MsG0480020780.01.T01
Chr4 exon 48198033 48198263 48198033 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28173;Parent=MsG0480020780.01.T01
Chr4 exon 48198450 48199027 48198450 ID=MsG0480020780.01.T01:exon:28174;Parent=MsG0480020780.01.T01
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