AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003917.01

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Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0180003917.01.T01 AT3G06240 27.013 385 201 16 6 340 33 387 6.40e-22 97.1
MsG0180003917.01.T01 AT3G23880 25.543 368 210 18 9 357 14 336 4.87e-17 82.0

Find 94 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 121 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCCAGGTGTTTCTACGTTAA+TGG 0.185616 1:-70114474 MsG0180003917.01.T01:CDS
AGAGAATTGCCCGTTCTTTC+TGG 0.203647 1:+70114261 None:intergenic
TTTGTTTCCGTAATAGTATT+TGG 0.243422 1:-70114742 MsG0180003917.01.T01:CDS
AACGGGCAATTCTCTATAAT+TGG 0.248238 1:-70114253 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATTTGAATTCCACTCTTAAT+TGG 0.251921 1:-70114643 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATATGGAAGATGACAAAATT+TGG 0.276695 1:-70114407 MsG0180003917.01.T01:CDS
AAGAGATGTGGCTCCGTATC+TGG 0.279670 1:-70114919 MsG0180003917.01.T01:CDS
AATTCCACTCTTAATTGGTT+AGG 0.291462 1:-70114638 MsG0180003917.01.T01:CDS
GGGAAGGGGTCCCACCATTT+TGG 0.297860 1:+70113831 None:intergenic
TAATTCAACCGAAACTTATA+AGG 0.304783 1:-70114813 MsG0180003917.01.T01:CDS
TGTGACAAGTCCAGAGAAAT+TGG 0.305849 1:+70114524 None:intergenic
CGCCACAACCTTATAAGTTT+CGG 0.316764 1:+70114805 None:intergenic
GCGATGTTCGGATACTAAAT+AGG 0.336064 1:+70115114 None:intergenic
TGCTAATCGTTTGCAATGTT+GGG 0.346661 1:-70114855 MsG0180003917.01.T01:CDS
CATCTTCCATATAACAAAAT+CGG 0.365721 1:+70114418 None:intergenic
AAAATGGTGGGACCCCTTCC+CGG 0.367539 1:-70113829 MsG0180003917.01.T01:CDS
GTGCTAATCGTTTGCAATGT+TGG 0.376998 1:-70114856 MsG0180003917.01.T01:CDS
CAATGTTGGGAGTTTATGTT+TGG 0.381839 1:-70114842 MsG0180003917.01.T01:CDS
GTTTAACCGTAAGCCATGAT+AGG 0.385235 1:+70115239 None:intergenic
TATTTCTCCAAATACTATTA+CGG 0.386644 1:+70114735 None:intergenic
TTGTTTCTATCATGATTTCA+AGG 0.388985 1:-70114444 MsG0180003917.01.T01:CDS
TCTGATATTGTCCTGGTGGC+GGG 0.389008 1:+70114893 None:intergenic
TTCGTACCTTTCTCTGTTCG+TGG 0.392263 1:-70115079 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATGTTCAATCTTTATATGAA+TGG 0.404218 1:-70114308 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATGATATCGTCGGGGAAGAC+TGG 0.416274 1:+70115271 None:intergenic
TCTGCCACCTCCAATTTCTC+TGG 0.416354 1:-70114534 MsG0180003917.01.T01:CDS
ACTGCAATCATCGCGATGTT+CGG 0.420524 1:+70115102 None:intergenic
ATCTGATATTGTCCTGGTGG+CGG 0.422192 1:+70114892 None:intergenic
TAAGGTTGTGGCGTTATATC+CGG 0.424642 1:-70114795 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATTCCACTCTTAATTGGTTA+GGG 0.427196 1:-70114637 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATGCGTACAATACACCAAAA+TGG 0.429160 1:-70113845 MsG0180003917.01.T01:CDS
CAATTGATAGTAAGGATCCT+TGG 0.435632 1:+70115027 None:intergenic
GCATACGCAGGGTCCGGGAA+GGG 0.438816 1:+70113816 None:intergenic
CATACGCAGGGTCCGGGAAG+GGG 0.441791 1:+70113817 None:intergenic
TTGTCAATCAATTGATAGTA+AGG 0.445873 1:+70115019 None:intergenic
GGAGTTGTTGGTTCCTGCAA+TGG 0.446832 1:-70114986 MsG0180003917.01.T01:CDS
TTCCCGGACCCTGCGTATGC+GGG 0.454460 1:-70113813 MsG0180003917.01.T01:CDS
ACTCCCGCATACGCAGGGTC+CGG 0.460401 1:+70113810 None:intergenic
AAGGACTGTCCTGGAGTTGT+TGG 0.460580 1:-70114998 MsG0180003917.01.T01:CDS
TGGTGGCGGGGTTCCAGATA+CGG 0.467931 1:+70114906 None:intergenic
CAAGCAGACCAATCCATTGC+AGG 0.470850 1:+70114973 None:intergenic
TGTTGGTTCCTGCAATGGAT+TGG 0.475690 1:-70114981 MsG0180003917.01.T01:CDS
CTCCCGCATACGCAGGGTCC+GGG 0.479445 1:+70113811 None:intergenic
AATTGATAGTAAGGATCCTT+GGG 0.482876 1:+70115028 None:intergenic
CTTCCCGGACCCTGCGTATG+CGG 0.488315 1:-70113814 MsG0180003917.01.T01:CDS
AACCGAAACTTATAAGGTTG+TGG 0.489177 1:-70114807 MsG0180003917.01.T01:CDS
AATGGATTGGTCTGCTTGAG+TGG 0.499656 1:-70114968 MsG0180003917.01.T01:CDS
CGCATACGCAGGGTCCGGGA+AGG 0.499824 1:+70113815 None:intergenic
ATCAAACCACGAACAGAGAA+AGG 0.501969 1:+70115073 None:intergenic
GAGAACTGAAGAAGCCTCGC+AGG 0.505843 1:+70114701 None:intergenic
TGTAGATGACCAGAAAGAAC+GGG 0.508567 1:-70114270 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATTTCGACGATGATATCGTC+GGG 0.509116 1:+70115262 None:intergenic
TTGATTGACAAGGACTGTCC+TGG 0.518247 1:-70115007 MsG0180003917.01.T01:CDS
AGCGAAATAATCACAAATTG+AGG 0.518594 1:+70114587 None:intergenic
CTGCTTGAGTGGTGCTGTTG+CGG 0.518841 1:-70114957 MsG0180003917.01.T01:CDS
CGAAATCCTATCATGGCTTA+CGG 0.519518 1:-70115245 MsG0180003917.01.T01:CDS
CAACTTATCTGATATTGTCC+TGG 0.531967 1:+70114886 None:intergenic
GTATCTGGAACCCCGCCACC+AGG 0.544731 1:-70114904 MsG0180003917.01.T01:CDS
AAGGTGTCACATGCAAAGCC+AGG 0.551404 1:-70114491 MsG0180003917.01.T01:CDS
TCATCGTCGAAATCCTATCA+TGG 0.552478 1:-70115252 MsG0180003917.01.T01:CDS
CTTAAGATGAACTTGAAACC+TGG 0.559459 1:-70114338 MsG0180003917.01.T01:CDS
CTGATATTGTCCTGGTGGCG+GGG 0.559501 1:+70114894 None:intergenic
TTGCAGGAACCAACAACTCC+AGG 0.561086 1:+70114989 None:intergenic
AGTAAAATGACAACAGAGGT+GGG 0.570751 1:-70114770 MsG0180003917.01.T01:CDS
TTGTAGATGACCAGAAAGAA+CGG 0.571733 1:-70114271 MsG0180003917.01.T01:CDS
ACTAAAACTCCCGCATACGC+AGG 0.575456 1:+70113804 None:intergenic
CGTACAATACACCAAAATGG+TGG 0.580425 1:-70113842 MsG0180003917.01.T01:CDS
GATAGTAAGGATCCTTGGGA+AGG 0.593386 1:+70115032 None:intergenic
TAGTAAAATGACAACAGAGG+TGG 0.596623 1:-70114771 MsG0180003917.01.T01:CDS
AAGTCCAGAGAAATTGGAGG+TGG 0.600757 1:+70114530 None:intergenic
AGTAATAGAACGTTGTATGC+TGG 0.603546 1:-70114671 MsG0180003917.01.T01:CDS
CCGTTCAATCACCCTTCCCA+AGG 0.604576 1:-70115044 MsG0180003917.01.T01:CDS
CTTGTCACATGCTTTACAGA+AGG 0.604591 1:-70114510 MsG0180003917.01.T01:CDS
AATTTGGAGATGAAAAGTCG+TGG 0.607695 1:-70114391 MsG0180003917.01.T01:CDS
CCTTGGGAAGGGTGATTGAA+CGG 0.607764 1:+70115044 None:intergenic
TGGTGCTGTTGCGGATGATG+AGG 0.617043 1:-70114948 MsG0180003917.01.T01:CDS
AAACCCTAACCAATTAAGAG+TGG 0.618213 1:+70114634 None:intergenic
AGATTGAACATTGAGATACC+AGG 0.622244 1:+70114320 None:intergenic
TGAAATGTGTGAGTAAGTCA+TGG 0.624183 1:-70115204 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATTTGGAGATGAAAAGTCGT+GGG 0.626061 1:-70114390 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATAGTAAGGATCCTTGGGAA+GGG 0.628463 1:+70115033 None:intergenic
CTAAAACTCCCGCATACGCA+GGG 0.630717 1:+70113805 None:intergenic
AGAACTGAAGAAGCCTCGCA+GGG 0.634715 1:+70114702 None:intergenic
GACAAGTCCAGAGAAATTGG+AGG 0.641567 1:+70114527 None:intergenic
GATTTCGACGATGATATCGT+CGG 0.647684 1:+70115261 None:intergenic
GTACAATACACCAAAATGGT+GGG 0.650671 1:-70113841 MsG0180003917.01.T01:CDS
ATATTCAAAGTTTCCCTGCG+AGG 0.655013 1:-70114715 MsG0180003917.01.T01:CDS
TCCATTAACGTAGAAACACC+TGG 0.655716 1:+70114473 None:intergenic
ATGAGGAGTTTGAAGAGATG+TGG 0.656424 1:-70114931 MsG0180003917.01.T01:CDS
CTTATCTGATATTGTCCTGG+TGG 0.656711 1:+70114889 None:intergenic
TTACTATCAATTGATTGACA+AGG 0.670318 1:-70115017 MsG0180003917.01.T01:CDS
TTAGGGTTTATTCAGAACGA+CGG 0.671470 1:-70114620 MsG0180003917.01.T01:CDS
GGATAGTAAAATGACAACAG+AGG 0.719676 1:-70114774 MsG0180003917.01.T01:CDS
TTTCGACGATGATATCGTCG+GGG 0.748959 1:+70115263 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATGTTCAATCTTTATATGAA+TGG - Chr1:70114772-70114791 MsG0180003917.01.T01:CDS 20.0%
!! TATTTCTCCAAATACTATTA+CGG + Chr1:70114348-70114367 None:intergenic 20.0%
!!! ATAACAAAGTTTTGAAGTAA+AGG + Chr1:70114973-70114992 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGAAGTAAAGGAAATAA+CGG + Chr1:70114964-70114983 None:intergenic 20.0%
! ATATGGAAGATGACAAAATT+TGG - Chr1:70114673-70114692 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTGAATTCCACTCTTAAT+TGG - Chr1:70114437-70114456 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
! CATCTTCCATATAACAAAAT+CGG + Chr1:70114665-70114684 None:intergenic 25.0%
! GAGTTAACAAAAAGATATGT+TGG - Chr1:70114875-70114894 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
! GTATACCTATAATGATACAT+GGG - Chr1:70115131-70115150 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
! TAATTCAACCGAAACTTATA+AGG - Chr1:70114267-70114286 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
! TATACCTATAATGATACATG+GGG - Chr1:70115132-70115151 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
! TGTATACCTATAATGATACA+TGG - Chr1:70115130-70115149 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
! TTACTATCAATTGATTGACA+AGG - Chr1:70114063-70114082 MsG0180003917.01.T01:intron 25.0%
! TTTGTTTCCGTAATAGTATT+TGG - Chr1:70114338-70114357 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGTCAATCAATTGATAGTA+AGG + Chr1:70114064-70114083 None:intergenic 25.0%
!!! TTGTTTCTATCATGATTTCA+AGG - Chr1:70114636-70114655 MsG0180003917.01.T01:CDS 25.0%
AAATCATTATGTCGAAAGCT+TGG - Chr1:70114906-70114925 MsG0180003917.01.T01:CDS 30.0%
AACCTCTTGTGTAAATAACA+GGG - Chr1:70115207-70115226 MsG0180003917.01.T01:CDS 30.0%
AATTCCACTCTTAATTGGTT+AGG - Chr1:70114442-70114461 MsG0180003917.01.T01:CDS 30.0%
AGCGAAATAATCACAAATTG+AGG + Chr1:70114496-70114515 None:intergenic 30.0%
ATACCTATAATGATACATGG+GGG - Chr1:70115133-70115152 MsG0180003917.01.T01:CDS 30.0%
ATTCCACTCTTAATTGGTTA+GGG - Chr1:70114443-70114462 MsG0180003917.01.T01:CDS 30.0%
! AATTGATAGTAAGGATCCTT+GGG + Chr1:70114055-70114074 None:intergenic 30.0%
!! AGGAAACCGATTTTGTTATA+TGG - Chr1:70114656-70114675 MsG0180003917.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCTGTTGTCATTTTACTATC+CGG + Chr1:70114307-70114326 None:intergenic 30.0%
AAACCCTAACCAATTAAGAG+TGG + Chr1:70114449-70114468 None:intergenic 35.0%
AACCGAAACTTATAAGGTTG+TGG - Chr1:70114273-70114292 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
AACGGGCAATTCTCTATAAT+TGG - Chr1:70114827-70114846 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
AATTTGGAGATGAAAAGTCG+TGG - Chr1:70114689-70114708 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
AGATTGAACATTGAGATACC+AGG + Chr1:70114763-70114782 None:intergenic 35.0%
AGTAAAATGACAACAGAGGT+GGG - Chr1:70114310-70114329 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
AGTAATAGAACGTTGTATGC+TGG - Chr1:70114409-70114428 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
ATGCGTACAATACACCAAAA+TGG - Chr1:70115235-70115254 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGAGATGAAAAGTCGT+GGG - Chr1:70114690-70114709 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
CAACCTCTTGTGTAAATAAC+AGG - Chr1:70115206-70115225 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
CAACTTATCTGATATTGTCC+TGG + Chr1:70114197-70114216 None:intergenic 35.0%
CAATGTTGGGAGTTTATGTT+TGG - Chr1:70114238-70114257 MsG0180003917.01.T01:intron 35.0%
CAATTACAATACACCCATGA+TGG - Chr1:70115087-70115106 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
CATCATGGGTGTATTGTAAT+TGG + Chr1:70115089-70115108 None:intergenic 35.0%
CTAGACAAGAAATTCAAGTC+AGG + Chr1:70115015-70115034 None:intergenic 35.0%
CTTAAGATGAACTTGAAACC+TGG - Chr1:70114742-70114761 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
CTTGTGTAAATAACAGGGTA+AGG - Chr1:70115212-70115231 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
GGATAGTAAAATGACAACAG+AGG - Chr1:70114306-70114325 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
GTACAATACACCAAAATGGT+GGG - Chr1:70115239-70115258 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
TAGTAAAATGACAACAGAGG+TGG - Chr1:70114309-70114328 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
TGAAATGTGTGAGTAAGTCA+TGG - Chr1:70113876-70113895 MsG0180003917.01.T01:intron 35.0%
TGCTAATCGTTTGCAATGTT+GGG - Chr1:70114225-70114244 MsG0180003917.01.T01:intron 35.0%
TTAGGGTTTATTCAGAACGA+CGG - Chr1:70114460-70114479 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
TTGTAGATGACCAGAAAGAA+CGG - Chr1:70114809-70114828 MsG0180003917.01.T01:CDS 35.0%
! CAATTGATAGTAAGGATCCT+TGG + Chr1:70114056-70114075 None:intergenic 35.0%
! TACCCTGTTATTTACACAAG+AGG + Chr1:70115212-70115231 None:intergenic 35.0%
ATAACCCTCCAAAACCATCA+TGG + Chr1:70115104-70115123 None:intergenic 40.0%
ATAGTAAGGATCCTTGGGAA+GGG + Chr1:70114050-70114069 None:intergenic 40.0%
ATATTCAAAGTTTCCCTGCG+AGG - Chr1:70114365-70114384 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
ATCAAACCACGAACAGAGAA+AGG + Chr1:70114010-70114029 None:intergenic 40.0%
ATGAGGAGTTTGAAGAGATG+TGG - Chr1:70114149-70114168 MsG0180003917.01.T01:intron 40.0%
ATTTCGACGATGATATCGTC+GGG + Chr1:70113821-70113840 None:intergenic 40.0%
CGAAATCCTATCATGGCTTA+CGG - Chr1:70113835-70113854 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
CGCCACAACCTTATAAGTTT+CGG + Chr1:70114278-70114297 None:intergenic 40.0%
CGTACAATACACCAAAATGG+TGG - Chr1:70115238-70115257 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
CTTATCTGATATTGTCCTGG+TGG + Chr1:70114194-70114213 None:intergenic 40.0%
CTTGTCACATGCTTTACAGA+AGG - Chr1:70114570-70114589 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTAAAGGAAATAACGGC+TGG + Chr1:70114960-70114979 None:intergenic 40.0%
GATTTCGACGATGATATCGT+CGG + Chr1:70113822-70113841 None:intergenic 40.0%
GCGATGTTCGGATACTAAAT+AGG + Chr1:70113969-70113988 None:intergenic 40.0%
GTGCTAATCGTTTGCAATGT+TGG - Chr1:70114224-70114243 MsG0180003917.01.T01:intron 40.0%
GTTTAACCGTAAGCCATGAT+AGG + Chr1:70113844-70113863 None:intergenic 40.0%
TAACCCTCCAAAACCATCAT+GGG + Chr1:70115103-70115122 None:intergenic 40.0%
TAAGGTTGTGGCGTTATATC+CGG - Chr1:70114285-70114304 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
TCATCGTCGAAATCCTATCA+TGG - Chr1:70113828-70113847 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
TCCATTAACGTAGAAACACC+TGG + Chr1:70114610-70114629 None:intergenic 40.0%
TGTAGATGACCAGAAAGAAC+GGG - Chr1:70114810-70114829 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
TGTGACAAGTCCAGAGAAAT+TGG + Chr1:70114559-70114578 None:intergenic 40.0%
! CAATACACCCATGATGGTTT+TGG - Chr1:70115093-70115112 MsG0180003917.01.T01:CDS 40.0%
AAGTCCAGAGAAATTGGAGG+TGG + Chr1:70114553-70114572 None:intergenic 45.0%
ACTGCAATCATCGCGATGTT+CGG + Chr1:70113981-70114000 None:intergenic 45.0%
AGAGAATTGCCCGTTCTTTC+TGG + Chr1:70114822-70114841 None:intergenic 45.0%
ATCTGATATTGTCCTGGTGG+CGG + Chr1:70114191-70114210 None:intergenic 45.0%
GACAAGTCCAGAGAAATTGG+AGG + Chr1:70114556-70114575 None:intergenic 45.0%
GATAGTAAGGATCCTTGGGA+AGG + Chr1:70114051-70114070 None:intergenic 45.0%
GCTCCCCCATGTATCATTAT+AGG + Chr1:70115139-70115158 None:intergenic 45.0%
TTCGTACCTTTCTCTGTTCG+TGG - Chr1:70114001-70114020 MsG0180003917.01.T01:intron 45.0%
TTGATTGACAAGGACTGTCC+TGG - Chr1:70114073-70114092 MsG0180003917.01.T01:intron 45.0%
TTTCGACGATGATATCGTCG+GGG + Chr1:70113820-70113839 None:intergenic 45.0%
! GCCAGGTGTTTCTACGTTAA+TGG - Chr1:70114606-70114625 MsG0180003917.01.T01:CDS 45.0%
!! AATGGATTGGTCTGCTTGAG+TGG - Chr1:70114112-70114131 MsG0180003917.01.T01:intron 45.0%
!! TGTTGGTTCCTGCAATGGAT+TGG - Chr1:70114099-70114118 MsG0180003917.01.T01:intron 45.0%
!!! ACACCCATGATGGTTTTGGA+GGG - Chr1:70115097-70115116 MsG0180003917.01.T01:CDS 45.0%
!!! TACACCCATGATGGTTTTGG+AGG - Chr1:70115096-70115115 MsG0180003917.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGATGTGGCTCCGTATC+TGG - Chr1:70114161-70114180 MsG0180003917.01.T01:intron 50.0%
AAGGACTGTCCTGGAGTTGT+TGG - Chr1:70114082-70114101 MsG0180003917.01.T01:intron 50.0%
AATGATACATGGGGGAGCCT+TGG - Chr1:70115141-70115160 MsG0180003917.01.T01:CDS 50.0%
ACAACTTTATCGTCGCGCCA+AGG + Chr1:70115161-70115180 None:intergenic 50.0%
ACTAAAACTCCCGCATACGC+AGG + Chr1:70115279-70115298 None:intergenic 50.0%
AGAACTGAAGAAGCCTCGCA+GGG + Chr1:70114381-70114400 None:intergenic 50.0%
ATGATATCGTCGGGGAAGAC+TGG + Chr1:70113812-70113831 None:intergenic 50.0%
CAAGCAGACCAATCCATTGC+AGG + Chr1:70114110-70114129 None:intergenic 50.0%
CCTTGGGAAGGGTGATTGAA+CGG + Chr1:70114039-70114058 None:intergenic 50.0%
CTAAAACTCCCGCATACGCA+GGG + Chr1:70115278-70115297 None:intergenic 50.0%
TCTGATATTGTCCTGGTGGC+GGG + Chr1:70114190-70114209 None:intergenic 50.0%
TCTGCCACCTCCAATTTCTC+TGG - Chr1:70114546-70114565 MsG0180003917.01.T01:CDS 50.0%
TTGCAGGAACCAACAACTCC+AGG + Chr1:70114094-70114113 None:intergenic 50.0%
! AAGGTGTCACATGCAAAGCC+AGG - Chr1:70114589-70114608 MsG0180003917.01.T01:CDS 50.0%
!! GGAGTTGTTGGTTCCTGCAA+TGG - Chr1:70114094-70114113 MsG0180003917.01.T01:intron 50.0%
CCGTTCAATCACCCTTCCCA+AGG - Chr1:70114036-70114055 MsG0180003917.01.T01:intron 55.0%
GAGAACTGAAGAAGCCTCGC+AGG + Chr1:70114382-70114401 None:intergenic 55.0%
! AAAATGGTGGGACCCCTTCC+CGG - Chr1:70115251-70115270 MsG0180003917.01.T01:CDS 55.0%
! CTGATATTGTCCTGGTGGCG+GGG + Chr1:70114189-70114208 None:intergenic 55.0%
!! CTGCTTGAGTGGTGCTGTTG+CGG - Chr1:70114123-70114142 MsG0180003917.01.T01:intron 55.0%
!! TGCGGGAGTTTTAGTGCACC+AGG - Chr1:70115284-70115303 MsG0180003917.01.T01:CDS 55.0%
!! TGGTGCTGTTGCGGATGATG+AGG - Chr1:70114132-70114151 MsG0180003917.01.T01:intron 55.0%
! GGGAAGGGGTCCCACCATTT+TGG + Chr1:70115252-70115271 None:intergenic 60.0%
!! TGGTGGCGGGGTTCCAGATA+CGG + Chr1:70114177-70114196 None:intergenic 60.0%
ACTCCCGCATACGCAGGGTC+CGG + Chr1:70115273-70115292 None:intergenic 65.0%
CATACGCAGGGTCCGGGAAG+GGG + Chr1:70115266-70115285 None:intergenic 65.0%
CTTCCCGGACCCTGCGTATG+CGG - Chr1:70115266-70115285 MsG0180003917.01.T01:CDS 65.0%
GCATACGCAGGGTCCGGGAA+GGG + Chr1:70115267-70115286 None:intergenic 65.0%
TTCCCGGACCCTGCGTATGC+GGG - Chr1:70115267-70115286 MsG0180003917.01.T01:CDS 65.0%
! GTATCTGGAACCCCGCCACC+AGG - Chr1:70114176-70114195 MsG0180003917.01.T01:intron 65.0%
CGCATACGCAGGGTCCGGGA+AGG + Chr1:70115268-70115287 None:intergenic 70.0%
CTCCCGCATACGCAGGGTCC+GGG + Chr1:70115272-70115291 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 70113791 70115311 70113791 ID=MsG0180003917.01;Name=MsG0180003917.01
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Chr1 exon 70114241 70115311 70114241 ID=MsG0180003917.01.T01:exon:6100;Parent=MsG0180003917.01.T01
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