AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038734.01

Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g060940 66.409 259 61 4 1 236 140 395 7.07e-118 342
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g061010 62.948 251 77 3 1 236 140 389 3.48e-103 304
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g050520 62.109 256 72 6 1 236 141 391 4.63e-102 301
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g050480 61.417 254 73 6 1 234 141 389 3.49e-100 296
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g060960 62.550 251 75 7 1 236 123 369 1.68e-98 291
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g052150 55.985 259 87 7 1 234 143 399 9.88e-92 275
MsG0780038734.01.T01 MTR_8g066440 43.233 266 109 8 2 233 143 400 3.33e-63 202
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g033495 43.820 267 111 8 1 236 148 406 3.72e-60 196
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g080370 43.929 280 108 8 2 233 138 416 4.87e-60 196
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g442850 45.977 261 106 9 1 233 121 374 3.26e-58 189
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056737 46.957 230 102 5 2 212 140 368 6.94e-58 189
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g061090 45.525 257 108 8 2 233 155 404 1.24e-57 188
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g065510 42.529 261 117 9 2 233 73 329 1.82e-57 186
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056003 42.125 273 114 9 2 235 141 408 1.12e-56 186
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g055210 40.210 286 117 8 2 236 139 421 1.84e-56 186
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056290 41.045 268 116 8 2 233 158 419 2.84e-56 185
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066850 43.284 268 113 9 2 233 139 403 2.99e-56 186
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g061060 46.581 234 103 8 2 215 138 369 2.26e-55 182
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g030830 42.697 267 113 7 5 236 134 395 3.81e-55 181
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056717 45.418 251 112 7 2 233 140 384 3.94e-55 181
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g061050 44.706 255 111 9 2 233 135 382 4.18e-55 181
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g043400 41.111 270 114 7 2 233 154 416 4.82e-55 182
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g011660 40.288 278 117 8 1 233 143 416 8.76e-55 181
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g043410 40.520 269 116 8 2 233 154 415 1.13e-54 181
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g027820 60.127 158 58 4 83 236 146 302 1.37e-54 177
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g091630 39.716 282 120 7 1 233 149 429 2.10e-54 180
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056390 39.925 268 119 8 2 233 154 415 2.46e-54 180
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g028660 42.366 262 110 9 3 233 126 377 4.95e-54 178
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056503 40.449 267 118 8 1 233 137 396 5.05e-54 179
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g055987 50.562 178 72 5 1 166 140 313 6.54e-54 177
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g129190 42.007 269 115 10 3 233 123 388 1.37e-53 177
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g006360 43.952 248 113 7 2 233 124 361 1.39e-53 176
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g055977 42.562 242 108 6 2 215 125 363 3.75e-53 176
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g057270 41.107 253 113 6 1 217 145 397 4.38e-53 177
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056710 43.083 253 115 9 2 233 135 379 1.91e-52 174
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g031020 42.751 269 111 10 2 233 164 426 3.05e-52 174
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g030980 42.222 270 111 11 2 233 164 426 3.32e-52 174
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g034860 42.739 241 105 6 4 212 152 391 3.47e-52 174
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066840 39.382 259 127 8 2 233 141 396 1.23e-51 172
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g113500 39.179 268 127 8 1 233 114 380 1.26e-51 172
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g056020 39.929 283 118 7 2 233 138 419 1.61e-51 174
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g010920 39.286 280 119 9 2 233 147 423 2.08e-51 172
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g019990 39.695 262 124 6 5 236 133 390 2.40e-51 171
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g016285 41.901 284 114 9 2 236 138 419 7.78e-51 171
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g072470 39.179 268 120 7 2 232 154 415 1.36e-50 170
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g013180 39.858 281 117 9 2 233 125 402 1.72e-50 171
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g047878 42.979 235 122 7 3 233 136 362 1.74e-50 168
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g017305 40.824 267 121 8 3 233 15 280 2.13e-50 166
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g086920 41.135 282 114 10 2 233 189 468 2.15e-50 171
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g068040 42.586 263 119 10 1 233 119 379 3.34e-50 168
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g464500 40.076 262 118 8 5 233 146 401 3.76e-50 169
MsG0780038734.01.T01 MTR_0707s0020 40.449 267 123 7 2 233 177 442 4.89e-50 169
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g013185 40.637 251 111 6 2 216 149 397 4.97e-50 169
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g009265 40.441 272 117 8 3 233 55 322 6.20e-50 166
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g062060 40.385 260 118 8 2 233 148 398 8.52e-50 167
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056760 39.847 261 128 8 1 233 144 403 9.00e-50 167
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g088385 41.132 265 122 5 2 233 54 317 1.08e-49 165
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g078840 40.613 261 109 7 2 216 143 403 2.78e-49 167
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g013175 40.945 254 106 7 2 216 149 397 3.07e-49 167
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g010950 39.552 268 125 8 2 233 137 403 3.90e-49 166
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g069930 40.873 252 127 9 1 233 127 375 4.82e-49 165
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g047892 39.062 256 128 9 3 233 143 395 6.34e-49 165
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g058620 39.560 273 119 8 8 235 11 282 9.15e-49 162
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g058870 39.560 273 119 8 8 235 11 282 9.15e-49 162
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g069760 41.833 251 123 11 1 233 123 368 1.07e-48 164
MsG0780038734.01.T01 MTR_0128s0070 40.392 255 128 8 1 234 145 396 1.69e-48 164
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g017280 40.530 264 120 9 3 233 127 386 2.68e-48 163
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g011350 54.545 154 57 3 2 144 95 246 3.05e-48 159
MsG0780038734.01.T01 MTR_0128s0020 40.784 255 127 8 1 234 142 393 6.09e-48 162
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056797 42.085 259 123 8 1 233 144 401 6.36e-48 163
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g008790 40.329 243 101 6 3 215 188 416 7.14e-48 164
MsG0780038734.01.T01 MTR_0649s0020 40.076 262 124 9 3 233 127 386 8.18e-48 162
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g071010 40.385 260 122 9 1 233 132 385 1.01e-47 162
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066100 40.590 271 115 9 2 233 129 392 1.23e-47 162
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g464470 39.695 262 119 8 5 233 123 378 1.38e-47 161
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g055953 42.174 230 101 8 30 233 90 313 1.57e-47 159
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066000 40.449 267 126 7 2 236 139 404 2.87e-47 161
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g092560 40.520 269 117 9 3 233 131 394 8.67e-47 160
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g096710 37.838 259 129 7 1 233 145 397 1.05e-46 159
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g062100 40.234 256 121 8 4 233 146 395 1.09e-46 159
MsG0780038734.01.T01 MTR_0128s0010 37.548 261 130 6 1 233 141 396 1.13e-46 159
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g042600 39.149 235 91 3 2 230 132 320 2.21e-46 159
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g112010 42.857 245 113 8 5 236 96 326 2.35e-46 157
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g088120 39.568 278 119 8 2 233 135 409 4.92e-46 158
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g437520 36.803 269 125 8 2 231 161 423 8.73e-46 159
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056173 38.645 251 115 5 21 234 18 266 8.91e-46 155
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g017295 37.282 287 121 7 3 233 65 348 9.81e-46 160
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g047200 41.245 257 118 12 3 233 143 392 1.11e-45 157
MsG0780038734.01.T01 MTR_0464s0020 37.591 274 124 9 1 233 160 427 3.20e-45 156
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g006360 38.750 240 94 5 1 233 81 274 3.69e-45 153
MsG0780038734.01.T01 MTR_0097s0030 40.769 260 120 12 3 233 132 386 5.02e-45 155
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g047240 40.769 260 120 12 3 233 132 386 5.02e-45 155
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g055830 36.525 282 124 9 5 233 76 355 1.24e-44 153
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056260 46.774 186 74 5 2 165 135 317 2.45e-44 151
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g055870 36.014 286 128 9 1 233 140 423 9.07e-44 152
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g078040 36.861 274 121 10 2 227 142 411 1.23e-43 152
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g070830 36.996 273 126 8 5 233 149 419 1.63e-43 152
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056570 41.897 253 117 8 3 233 137 381 1.64e-43 152
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g055930 35.664 286 129 9 1 233 140 423 1.95e-43 151
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g445890 38.462 273 124 8 3 233 111 381 2.20e-43 150
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g078900 37.818 275 127 11 3 233 147 421 3.43e-43 151
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g022600 36.462 277 133 9 1 236 149 423 7.25e-43 150
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g024890 37.838 259 125 10 5 233 131 383 1.71e-42 148
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g043160 40.672 268 120 12 3 233 191 456 2.34e-42 149
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066030 39.852 271 114 11 2 233 141 401 8.70e-42 147
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g047895 38.843 242 109 8 4 217 64 294 2.01e-41 144
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g077910 37.634 279 115 12 3 233 67 334 2.35e-41 144
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g030090 40.299 268 114 10 5 233 138 398 2.48e-41 145
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g070880 35.897 273 129 8 5 233 149 419 4.04e-41 145
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g034310 42.574 202 88 6 31 213 18 210 8.29e-41 139
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g052670 36.170 282 118 10 5 233 151 423 9.49e-41 145
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g079160 36.923 260 110 9 2 216 154 404 1.17e-40 145
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066060 37.262 263 132 7 2 231 145 407 3.08e-40 144
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056200 36.680 259 109 10 5 233 147 380 3.72e-40 142
MsG0780038734.01.T01 MTR_0242s0060 36.719 256 118 9 2 214 134 388 4.22e-40 142
MsG0780038734.01.T01 MTR_0242s0040 36.719 256 118 9 2 214 134 388 4.22e-40 142
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g091640 41.000 200 86 6 1 169 150 348 5.30e-40 141
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g010900 38.596 228 103 8 2 193 103 329 5.96e-40 141
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g069950 45.294 170 83 6 2 166 34 198 1.28e-39 136
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g029650 38.577 267 124 10 3 233 140 402 1.40e-39 141
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g461450 38.075 239 116 8 5 217 125 357 5.16e-39 138
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g013470 37.288 236 109 6 14 216 120 349 6.31e-39 138
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g060555 37.288 236 122 10 1 218 45 272 8.84e-39 136
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g129160 42.640 197 73 7 3 166 143 332 1.14e-38 137
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g030760 38.710 248 129 6 5 236 192 432 1.20e-38 139
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g035295 37.849 251 124 8 3 233 140 378 9.41e-38 136
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g017720 39.241 237 123 8 14 230 61 296 1.65e-37 136
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056820 36.047 258 131 10 2 234 126 374 3.93e-37 134
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g078960 35.531 273 129 11 2 233 19 285 3.98e-37 132
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g078860 36.905 252 126 9 3 222 136 386 4.02e-37 134
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g010935 37.872 235 117 7 17 233 25 248 4.63e-37 130
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g077970 34.364 291 126 12 3 233 135 420 3.04e-36 132
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g077070 34.043 282 136 8 2 233 147 428 3.19e-36 132
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g091610 42.593 162 86 3 77 233 86 245 5.37e-36 128
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g077990 34.728 239 119 7 3 215 143 370 1.32e-35 130
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g037465 35.496 262 139 10 1 236 138 395 8.49e-35 128
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g061940 39.394 198 85 7 32 204 79 266 1.71e-34 124
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g445750 41.176 187 76 3 2 154 145 331 3.69e-34 125
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g015730 35.628 247 112 8 25 233 156 393 1.71e-33 124
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g015740 35.081 248 125 6 5 233 95 325 2.14e-33 123
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066080 34.397 282 131 8 2 233 136 413 3.00e-33 125
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g030110 35.827 254 97 10 5 218 154 381 2.44e-32 121
MsG0780038734.01.T01 MTR_8g030630 44.286 140 74 3 82 217 104 243 1.02e-31 120
MsG0780038734.01.T01 MTR_8g030630 37.209 172 85 4 50 211 282 440 6.40e-26 104
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g030790 40.426 188 83 6 5 168 105 287 1.21e-31 119
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g017270 33.071 254 104 7 3 233 129 339 1.49e-31 118
MsG0780038734.01.T01 MTR_0267s0050 33.462 260 140 8 4 234 128 383 2.16e-31 119
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g437110 34.118 255 133 10 3 233 148 391 2.82e-31 120
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056023 41.463 164 71 5 3 144 113 273 5.72e-31 115
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g020000 34.874 238 128 6 9 219 92 329 6.00e-31 117
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056793 37.619 210 96 6 31 233 49 230 1.60e-30 113
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g013950 33.206 262 140 9 4 234 128 385 1.08e-29 114
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g081280 34.538 249 117 8 17 233 5 239 1.79e-29 110
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g022670 32.743 226 125 6 28 233 131 349 1.61e-28 110
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g050490 76.190 63 14 1 1 63 127 188 2.39e-28 106
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g047490 41.765 170 75 6 2 156 137 297 6.58e-28 108
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g128320 32.283 254 117 8 2 225 42 270 8.74e-28 107
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g070440 35.271 258 130 11 5 233 121 370 5.87e-27 107
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056170 31.615 291 108 10 6 233 196 458 2.30e-26 106
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g055000 40.441 136 69 3 99 233 1 125 3.08e-26 99.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_0128s0110 34.634 205 110 7 50 234 3 203 4.09e-26 101
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g061012 78.689 61 13 0 176 236 108 168 4.52e-26 100
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g037670 33.333 252 107 10 1 233 122 331 6.01e-26 103
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g006350 29.317 249 134 8 5 217 616 858 2.34e-25 104
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g058630 37.975 158 89 5 83 233 23 178 3.12e-25 98.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g060930 59.459 74 22 1 85 150 4 77 1.13e-24 93.6
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g021150 32.800 250 133 10 5 233 132 367 1.08e-23 98.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066010 33.333 246 95 10 2 213 141 351 1.68e-23 97.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_8g101940 36.667 270 111 13 5 236 122 369 1.86e-23 97.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g070937 40.146 137 47 4 24 125 2 138 4.32e-23 92.0
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g078940 31.502 273 96 10 2 233 178 400 4.72e-23 96.7
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g078880 34.314 204 87 6 41 216 98 282 6.08e-23 96.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g024910 45.133 113 56 2 127 234 154 265 1.10e-21 92.0
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g030040 34.615 234 103 7 3 233 149 335 1.47e-21 91.7
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g445580 45.283 106 55 2 108 212 42 145 1.57e-21 87.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g055070 39.316 117 59 3 99 214 1 106 1.41e-20 85.5
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g050542 31.452 248 145 8 3 233 164 403 5.29e-20 88.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g021155 32.627 236 122 11 6 217 148 370 4.64e-19 86.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g021155 32.051 234 129 12 5 215 711 937 4.60e-15 74.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g097560 29.310 232 138 8 3 226 147 360 5.12e-19 85.1
MsG0780038734.01.T01 MTR_8g101580 30.645 248 145 9 3 233 156 393 6.35e-19 85.1
MsG0780038734.01.T01 MTR_0064s0070 37.226 137 40 3 32 156 11 113 3.69e-18 77.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g029990 31.349 252 133 13 5 233 167 401 5.41e-17 79.7
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g094210 30.279 251 130 10 4 233 171 397 6.33e-17 79.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g014570 31.034 232 125 10 6 213 143 363 1.41e-16 78.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g066830 56.944 72 24 3 2 69 114 182 1.78e-16 75.1
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g070900 33.140 172 54 5 29 169 236 377 3.85e-16 77.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g089830 31.818 132 65 3 91 211 31 148 5.44e-16 72.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g046800 31.474 251 112 13 3 221 158 380 7.22e-16 76.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g094210 32.000 175 91 6 4 163 171 332 7.22e-16 76.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g009240 28.750 240 124 10 1 211 144 365 1.20e-15 75.5
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g036290 30.806 211 130 7 5 209 136 336 1.40e-15 75.1
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g097330 31.100 209 126 7 31 225 153 357 2.77e-15 74.7
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g011200 31.765 255 135 12 5 234 134 374 3.91e-15 73.9
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g061100 44.538 119 47 5 12 113 109 225 5.32e-15 73.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g024130 28.936 235 130 13 5 214 78 300 7.79e-15 72.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g097490 28.384 229 133 8 3 215 160 373 1.12e-14 72.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g011020 29.224 219 108 11 30 217 157 359 1.22e-14 72.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g407070 32.919 161 81 7 30 166 183 340 1.40e-14 72.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g024040 28.916 249 140 12 5 233 140 371 1.58e-14 72.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g046860 30.964 197 114 8 31 211 56 246 2.31e-14 71.6
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g053470 32.796 186 71 6 40 198 145 303 4.47e-14 70.5
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g436150 32.704 159 79 7 30 166 182 334 4.48e-14 71.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g009260 27.953 254 130 12 5 226 152 384 6.10e-14 70.5
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g024110 30.172 232 129 10 5 219 218 433 9.60e-14 70.1
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g062070 33.051 118 71 3 102 212 75 191 1.11e-13 67.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g022420 27.511 229 134 9 4 215 139 352 1.15e-13 69.7
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g046920 30.493 223 133 9 4 211 138 353 1.46e-13 69.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g024150 27.966 236 155 6 6 233 156 384 1.69e-13 69.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g009300 28.384 229 138 9 3 214 119 338 2.10e-13 68.9
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g065980 29.508 244 144 10 5 233 127 357 2.79e-13 68.6
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g021580 48.529 68 29 2 1 65 131 195 2.91e-13 68.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g016960 38.835 103 54 2 140 233 152 254 4.00e-13 67.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g010390 29.249 253 144 12 5 233 155 396 4.00e-13 68.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g007150 29.119 261 134 9 6 233 94 336 4.98e-13 67.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g054575 27.823 248 146 9 3 229 161 396 5.08e-13 68.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g021190 31.507 219 110 11 21 215 152 354 6.29e-13 67.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g013770 28.194 227 135 7 5 211 152 370 6.92e-13 67.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g058660 34.862 109 60 2 132 230 103 210 1.22e-12 65.5
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g061340 28.085 235 120 11 4 209 140 354 1.52e-12 66.6
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g009310 27.826 230 141 9 4 217 159 379 1.70e-12 66.6
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g007135 30.601 183 95 7 6 165 149 322 1.97e-12 66.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g030310 31.214 173 98 7 5 165 149 312 2.35e-12 65.9
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g006530 27.049 244 148 9 5 233 167 395 2.36e-12 65.9
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g030320 32.955 176 91 9 5 163 62 227 2.90e-12 65.5
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g004210 27.612 268 135 12 5 231 153 402 5.13e-12 65.1
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g056723 47.945 73 34 2 2 70 60 132 6.06e-12 62.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g046830 30.814 172 106 5 31 191 168 337 7.03e-12 64.7
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g055375 29.020 255 142 14 5 233 124 365 7.58e-12 64.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g007330 30.601 183 96 9 4 165 157 329 9.53e-12 64.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_5g046280 28.249 177 101 8 5 165 22 188 1.03e-11 63.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_1g097370 29.907 214 103 12 32 211 136 336 1.17e-11 64.3
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g047832 27.830 212 117 7 31 211 172 378 1.29e-11 63.9
MsG0780038734.01.T01 MTR_7g013590 30.603 232 131 10 6 215 149 372 1.30e-11 63.9
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g006570 28.346 254 143 13 5 233 136 375 2.44e-11 63.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g055060 29.070 258 134 15 5 233 148 385 2.78e-11 62.8
MsG0780038734.01.T01 MTR_8g467140 30.556 180 96 9 3 160 142 314 3.45e-11 62.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_6g004660 28.800 250 146 10 5 233 141 379 3.45e-11 62.4
MsG0780038734.01.T01 MTR_0760s0010 29.464 224 128 11 5 215 165 371 4.77e-11 62.0
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g132560 26.996 263 139 9 7 233 12 257 4.97e-11 61.2
MsG0780038734.01.T01 MTR_3g010920 30.544 239 139 12 5 233 159 380 5.69e-11 62.0
MsG0780038734.01.T01 MTR_2g021210 30.198 202 107 9 32 215 221 406 6.96e-11 61.6
MsG0780038734.01.T01 MTR_4g031770 30.435 184 97 8 5 165 116 291 9.99e-11 61.2
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score

Find 47 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 56 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAGAGATGTGGTTCCGTTTC+TGG 0.098419 7:+52058508 None:intergenic
AAATTATGATACACTGTTAT+TGG 0.160081 7:+52059121 MsG0780038734.01.T01:CDS
TCATCTTCCATAATACAAAA+TGG 0.228235 7:-52058989 None:intergenic
TCAGATATTGTCCTTGTAGC+TGG 0.297810 7:-52058534 None:intergenic
AGGACAATATCTGATAAATT+AGG 0.315513 7:+52058543 MsG0780038734.01.T01:CDS
CGTTACTGCGACATGTCATT+TGG 0.367605 7:+52058588 MsG0780038734.01.T01:CDS
AAGATTGTTTCACTTGATCT+TGG 0.371724 7:+52058849 MsG0780038734.01.T01:CDS
CAATGATTATGTTGAAAGCT+TGG 0.396178 7:+52059241 MsG0780038734.01.T01:CDS
TCCTCCTGAGTTCGTGCCAT+GGG 0.411451 7:+52059079 MsG0780038734.01.T01:CDS
ATTACCAATGGTGAATGCTT+GGG 0.413607 7:+52059209 MsG0780038734.01.T01:CDS
CAGTAACGTGTGGCAGCATC+AGG 0.416681 7:-52058573 None:intergenic
TAATTCGACGGATACTTATA+AGG 0.418490 7:+52058617 MsG0780038734.01.T01:CDS
GCCATCTCTATGTATGTTGA+TGG 0.437904 7:+52058932 MsG0780038734.01.T01:CDS
TCTCTCAAATTATAGACAAC+TGG 0.443860 7:-52059164 None:intergenic
CATCTTCCATAATACAAAAT+GGG 0.444756 7:-52058988 None:intergenic
TCCTGTCAATTATTACGTAA+AGG 0.453700 7:+52058710 MsG0780038734.01.T01:CDS
CAGATATTGTCCTTGTAGCT+GGG 0.456499 7:-52058533 None:intergenic
AATTACCAATGGTGAATGCT+TGG 0.464886 7:+52059208 MsG0780038734.01.T01:CDS
ATTGTGGAGTTGAAGAGTCT+TGG 0.473859 7:+52059015 MsG0780038734.01.T01:CDS
GTCAATTATTACGTAAAGGC+TGG 0.474574 7:+52058714 MsG0780038734.01.T01:CDS
TTAGTTTGGGCGATAATGCT+TGG 0.491996 7:+52058670 MsG0780038734.01.T01:CDS
TGTTTCACTTGATCTTGGTA+AGG 0.508352 7:+52058854 MsG0780038734.01.T01:CDS
TTGTAGCTGGGTTCCAGAAA+CGG 0.512422 7:-52058521 None:intergenic
GGAACCCATGGCACGAACTC+AGG 0.519314 7:-52059083 None:intergenic
AACAATCTTAAATTGCTCAA+TGG 0.521452 7:-52058835 None:intergenic
GCCTTTACGTAATAATTGAC+AGG 0.522246 7:-52058711 None:intergenic
TTCCTCCTGAGTTCGTGCCA+TGG 0.523774 7:+52059078 MsG0780038734.01.T01:CDS
GTTTCTGGAACCCAGCTACA+AGG 0.533321 7:+52058523 MsG0780038734.01.T01:CDS
CATAGAGATGGCTCAATATG+TGG 0.542314 7:-52058921 None:intergenic
GGTAATTCTAGTTCTCTCTA+CGG 0.558041 7:-52059192 None:intergenic
GATCCCCAAGCATTCACCAT+TGG 0.558701 7:-52059213 None:intergenic
GTTGTCTATAATTTGAGAGA+TGG 0.558940 7:+52059167 MsG0780038734.01.T01:CDS
AGGTAGTGAACTTACATCGA+GGG 0.576768 7:+52058637 MsG0780038734.01.T01:CDS
TTACCAATGGTGAATGCTTG+GGG 0.601415 7:+52059210 MsG0780038734.01.T01:CDS
TCCATCAACATACATAGAGA+TGG 0.604731 7:-52058933 None:intergenic
TTATGGAAGATGACAGATTG+TGG 0.605977 7:+52058999 MsG0780038734.01.T01:CDS
GAAAGGTGCAATGGAACCCA+TGG 0.611282 7:-52059095 None:intergenic
CACTTGAACAAAACCTCGAG+GGG 0.625532 7:-52058898 None:intergenic
ATTTGGCTATGATAATTCGA+CGG 0.634529 7:+52058605 MsG0780038734.01.T01:CDS
GCACTTGAACAAAACCTCGA+GGG 0.635285 7:-52058899 None:intergenic
ACCCATGGCACGAACTCAGG+AGG 0.639299 7:-52059080 None:intergenic
GGTAGTGAACTTACATCGAG+GGG 0.657739 7:+52058638 MsG0780038734.01.T01:CDS
GAGAGAACTAGAATTACCAA+TGG 0.660025 7:+52059197 MsG0780038734.01.T01:CDS
TGACATGTCGCAGTAACGTG+TGG 0.660474 7:-52058583 None:intergenic
GGCACTTGAACAAAACCTCG+AGG 0.694037 7:-52058900 None:intergenic
AAGGTAGTGAACTTACATCG+AGG 0.707625 7:+52058636 MsG0780038734.01.T01:CDS
ACTTGAACAAAACCTCGAGG+GGG 0.745104 7:-52058897 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATTATGATACACTGTTAT+TGG + Chr7:52059121-52059140 MsG0780038734.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTGTATCATAATTTTTAGAA+AGG - Chr7:52059115-52059134 None:intergenic 20.0%
! AACAATCTTAAATTGCTCAA+TGG - Chr7:52058838-52058857 None:intergenic 25.0%
! AGGACAATATCTGATAAATT+AGG + Chr7:52058543-52058562 MsG0780038734.01.T01:CDS 25.0%
! CATCTTCCATAATACAAAAT+GGG - Chr7:52058991-52059010 None:intergenic 25.0%
! TCATCTTCCATAATACAAAA+TGG - Chr7:52058992-52059011 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTAGAGGTACTGTTAAT+TGG + Chr7:52058742-52058761 MsG0780038734.01.T01:intron 25.0%
!!! TAATTTTTAGAAAGGTGCAA+TGG - Chr7:52059107-52059126 None:intergenic 25.0%
AAGATTGTTTCACTTGATCT+TGG + Chr7:52058849-52058868 MsG0780038734.01.T01:CDS 30.0%
ATTTGGCTATGATAATTCGA+CGG + Chr7:52058605-52058624 MsG0780038734.01.T01:CDS 30.0%
CAATGATTATGTTGAAAGCT+TGG + Chr7:52059241-52059260 MsG0780038734.01.T01:CDS 30.0%
GTTGTCTATAATTTGAGAGA+TGG + Chr7:52059167-52059186 MsG0780038734.01.T01:CDS 30.0%
TAATTCGACGGATACTTATA+AGG + Chr7:52058617-52058636 MsG0780038734.01.T01:CDS 30.0%
TCCTGTCAATTATTACGTAA+AGG + Chr7:52058710-52058729 MsG0780038734.01.T01:CDS 30.0%
TCTCTCAAATTATAGACAAC+TGG - Chr7:52059167-52059186 None:intergenic 30.0%
! AGCAAACCCATTTTGTATTA+TGG + Chr7:52058982-52059001 MsG0780038734.01.T01:CDS 30.0%
AATTACCAATGGTGAATGCT+TGG + Chr7:52059208-52059227 MsG0780038734.01.T01:CDS 35.0%
ATTACCAATGGTGAATGCTT+GGG + Chr7:52059209-52059228 MsG0780038734.01.T01:CDS 35.0%
CGACAACATGAGAAAAACAA+AGG - Chr7:52058962-52058981 None:intergenic 35.0%
GAGAGAACTAGAATTACCAA+TGG + Chr7:52059197-52059216 MsG0780038734.01.T01:CDS 35.0%
GCCTTTACGTAATAATTGAC+AGG - Chr7:52058714-52058733 None:intergenic 35.0%
GTCAATTATTACGTAAAGGC+TGG + Chr7:52058714-52058733 MsG0780038734.01.T01:CDS 35.0%
TCCATCAACATACATAGAGA+TGG - Chr7:52058936-52058955 None:intergenic 35.0%
TGTTTCACTTGATCTTGGTA+AGG + Chr7:52058854-52058873 MsG0780038734.01.T01:CDS 35.0%
TTATGGAAGATGACAGATTG+TGG + Chr7:52058999-52059018 MsG0780038734.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTAATTCTAGTTCTCTCTA+CGG - Chr7:52059195-52059214 None:intergenic 35.0%
!! TAGAGGTACTGTTAATTGGT+TGG + Chr7:52058746-52058765 MsG0780038734.01.T01:intron 35.0%
AAGGTAGTGAACTTACATCG+AGG + Chr7:52058636-52058655 MsG0780038734.01.T01:CDS 40.0%
AGGTAGTGAACTTACATCGA+GGG + Chr7:52058637-52058656 MsG0780038734.01.T01:CDS 40.0%
ATTGTGGAGTTGAAGAGTCT+TGG + Chr7:52059015-52059034 MsG0780038734.01.T01:CDS 40.0%
CAGATATTGTCCTTGTAGCT+GGG - Chr7:52058536-52058555 None:intergenic 40.0%
CATAGAGATGGCTCAATATG+TGG - Chr7:52058924-52058943 None:intergenic 40.0%
GCCATCTCTATGTATGTTGA+TGG + Chr7:52058932-52058951 MsG0780038734.01.T01:CDS 40.0%
TCAGATATTGTCCTTGTAGC+TGG - Chr7:52058537-52058556 None:intergenic 40.0%
TTACCAATGGTGAATGCTTG+GGG + Chr7:52059210-52059229 MsG0780038734.01.T01:CDS 40.0%
! TTAGTTTGGGCGATAATGCT+TGG + Chr7:52058670-52058689 MsG0780038734.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGAACAAAACCTCGAGG+GGG - Chr7:52058900-52058919 None:intergenic 45.0%
CACTTGAACAAAACCTCGAG+GGG - Chr7:52058901-52058920 None:intergenic 45.0%
CGTTACTGCGACATGTCATT+TGG + Chr7:52058588-52058607 MsG0780038734.01.T01:CDS 45.0%
GCACTTGAACAAAACCTCGA+GGG - Chr7:52058902-52058921 None:intergenic 45.0%
GGTAGTGAACTTACATCGAG+GGG + Chr7:52058638-52058657 MsG0780038734.01.T01:CDS 45.0%
TTGTAGCTGGGTTCCAGAAA+CGG - Chr7:52058524-52058543 None:intergenic 45.0%
! AAGGCTGGTGTGCATTTTAG+AGG + Chr7:52058729-52058748 MsG0780038734.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGGGGCGAGAGTTTTTAGTT+TGG + Chr7:52058656-52058675 MsG0780038734.01.T01:CDS 45.0%
!!! GGGGCGAGAGTTTTTAGTTT+GGG + Chr7:52058657-52058676 MsG0780038734.01.T01:CDS 45.0%
GATCCCCAAGCATTCACCAT+TGG - Chr7:52059216-52059235 None:intergenic 50.0%
GGCACTTGAACAAAACCTCG+AGG - Chr7:52058903-52058922 None:intergenic 50.0%
TGACATGTCGCAGTAACGTG+TGG - Chr7:52058586-52058605 None:intergenic 50.0%
! GAAAGGTGCAATGGAACCCA+TGG - Chr7:52059098-52059117 None:intergenic 50.0%
!! GTTTCTGGAACCCAGCTACA+AGG + Chr7:52058523-52058542 MsG0780038734.01.T01:CDS 50.0%
AAAGAGTTGCTTCCCCCTCG+AGG + Chr7:52058885-52058904 MsG0780038734.01.T01:CDS 55.0%
CAGTAACGTGTGGCAGCATC+AGG - Chr7:52058576-52058595 None:intergenic 55.0%
TCCTCCTGAGTTCGTGCCAT+GGG + Chr7:52059079-52059098 MsG0780038734.01.T01:CDS 55.0%
TTCCTCCTGAGTTCGTGCCA+TGG + Chr7:52059078-52059097 MsG0780038734.01.T01:CDS 55.0%
ACCCATGGCACGAACTCAGG+AGG - Chr7:52059083-52059102 None:intergenic 60.0%
GGAACCCATGGCACGAACTC+AGG - Chr7:52059086-52059105 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 52058513 52059277 52058513 ID=MsG0780038734.01;Name=MsG0780038734.01
Chr7 mRNA 52058513 52059277 52058513 ID=MsG0780038734.01.T01;Parent=MsG0780038734.01;Name=MsG0780038734.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|236
Chr7 exon 52058513 52058750 52058513 ID=MsG0780038734.01.T01:exon:8256;Parent=MsG0780038734.01.T01
Chr7 exon 52058805 52059277 52058805 ID=MsG0780038734.01.T01:exon:8257;Parent=MsG0780038734.01.T01
Chr7 CDS 52058513 52058750 52058513 ID=MsG0780038734.01.T01:cds;Parent=MsG0780038734.01.T01
Chr7 CDS 52058805 52059277 52058805 ID=MsG0780038734.01.T01:cds;Parent=MsG0780038734.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038734.01.T01

ATGTGGTTCCGTTTCTGGAACCCAGCTACAAGGACAATATCTGATAAATTAGGACACTATCCTGATGCTGCCACACGTTACTGCGACATGTCATTTGGCTATGATAATTCGACGGATACTTATAAGGTAGTGAACTTACATCGAGGGGCGAGAGTTTTTAGTTTGGGCGATAATGCTTGGAGAAATATTCAAAGTTTTCCTGTCAATTATTACGTAAAGGCTGGTGTGCATTTTAGAGATGATTATTATGATTGTGATTATATTACTACCATTGAGCAATTTAAGATTGTTTCACTTGATCTTGGTAAGGAGACATACAAAGAGTTGCTTCCCCCTCGAGGTTTTGTTCAAGTGCCACATATTGAGCCATCTCTATGTATGTTGATGGAATGCCTTTGTTTTTCTCATGTTGTCGAGCAAACCCATTTTGTATTATGGAAGATGACAGATTGTGGAGTTGAAGAGTCTTGGACTCAATTAATTAAGATTAATTTTCAAATTATGAAAAAATTTCCTCCTGAGTTCGTGCCATGGGTTCCATTGCACCTTTCTAAAAATTATGATACACTGTTATTGGAAAACAATCTTGAAGACACACCAGTTGTCTATAATTTGAGAGATGGTACCGTAGAGAGAACTAGAATTACCAATGGTGAATGCTTGGGGATCTATATCAATGATTATGTTGAAAGCTTGGTTTTGAGTCATTGA
Protein sequence

>MsG0780038734.01.T01

MWFRFWNPATRTISDKLGHYPDAATRYCDMSFGYDNSTDTYKVVNLHRGARVFSLGDNAWRNIQSFPVNYYVKAGVHFRDDYYDCDYITTIEQFKIVSLDLGKETYKELLPPRGFVQVPHIEPSLCMLMECLCFSHVVEQTHFVLWKMTDCGVEESWTQLIKINFQIMKKFPPEFVPWVPLHLSKNYDTLLLENNLEDTPVVYNLRDGTVERTRITNGECLGIYINDYVESLVLSH*