AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038240.01

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MsG0780038240.01.T02 AT4G12560 25.938 320 186 7 21 312 4 300 2.36e-16 80.5
MsG0780038240.01.T02 AT4G12560 25.938 320 186 7 21 312 4 300 2.36e-16 80.5
MsG0780038240.01.T02 AT4G12560 25.938 320 186 7 21 312 4 300 2.36e-16 80.5
MsG0780038240.01.T02 AT1G33530 26.220 328 187 13 4 313 78 368 6.74e-16 79.3
MsG0780038240.01.T02 AT3G18910 31.250 192 108 10 21 199 8 188 1.41e-12 68.9
MsG0780038240.01.T02 AT3G20690 28.033 239 150 10 21 246 6 235 2.01e-12 68.6
MsG0780038240.01.T02 AT1G12870 23.276 348 195 13 6 317 18 329 3.28e-12 68.2
MsG0780038240.01.T02 AT1G13200 26.074 349 177 16 18 317 40 356 3.21e-11 65.1
MsG0780038240.01.T02 AT2G15640 24.818 274 160 13 17 261 2 258 4.37e-11 64.7
MsG0780038240.01.T02 AT3G10430 25.391 256 139 9 21 258 5 226 7.80e-11 63.5
MsG0780038240.01.T05 AT3G06240 27.189 217 110 10 69 262 165 356 9.29e-12 66.2
MsG0780038240.01.T03 AT3G06240 25.937 347 179 14 6 299 35 356 2.49e-18 86.3
MsG0780038240.01.T03 AT3G23880 28.746 327 174 13 1 301 8 301 6.71e-17 81.6
MsG0780038240.01.T03 AT4G12560 25.938 320 186 7 7 298 4 300 2.69e-16 80.1
MsG0780038240.01.T03 AT4G12560 25.938 320 186 7 7 298 4 300 2.69e-16 80.1
MsG0780038240.01.T03 AT4G12560 25.938 320 186 7 7 298 4 300 2.69e-16 80.1
MsG0780038240.01.T03 AT1G33530 26.861 309 173 12 7 299 97 368 9.72e-16 78.6
MsG0780038240.01.T03 AT3G18910 31.250 192 108 10 7 185 8 188 1.19e-12 68.9
MsG0780038240.01.T03 AT3G20690 27.757 263 155 13 7 255 6 247 1.98e-12 68.2
MsG0780038240.01.T03 AT1G12870 23.304 339 188 13 1 303 27 329 1.99e-11 65.5
MsG0780038240.01.T03 AT1G13200 26.074 349 177 16 4 303 40 356 2.08e-11 65.5
MsG0780038240.01.T03 AT2G15640 24.818 274 160 13 3 247 2 258 3.18e-11 65.1
MsG0780038240.01.T03 AT3G10430 25.391 256 139 9 7 244 5 226 6.61e-11 63.5

Find 84 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 152 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACGAGATGTGGTTCCGTTTC+TGG 0.104408 7:-42630137 MsG0780038240.01.T01:CDS
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TGTGATTATTTCACTTGATT+TGG 0.214492 7:-42629812 MsG0780038240.01.T01:CDS
GCCATCTATTTGTCTGTTGA+TGG 0.262898 7:-42629728 MsG0780038240.01.T01:intron
TTCTTCCCAGTGTGAAGTTT+GGG 0.287507 7:+42630346 None:intergenic
GTGATTATTTCACTTGATTT+GGG 0.327469 7:-42629811 MsG0780038240.01.T01:CDS
AGCAAACTCATCTTGTTATA+TGG 0.335526 7:-42629678 MsG0780038240.01.T01:intron
GTTCTTCCCAGTGTGAAGTT+TGG 0.335730 7:+42630345 None:intergenic
TAATTTATCTGATATTGTTC+TGG 0.339921 7:+42630104 None:intergenic
TTACTATAGTTTGAAGGATA+AGG 0.342118 7:-42630226 MsG0780038240.01.T01:CDS
AACTTATGATGCACTCATAT+TGG 0.347699 7:-42629533 MsG0780038240.01.T01:intron
TCTGATATTGTTCTGGTAGC+AGG 0.366334 7:+42630111 None:intergenic
ATATGGAAGATGACAGATTA+TGG 0.370718 7:-42629661 MsG0780038240.01.T01:intron
TATGTTGTTGGTTCCTGTAA+TGG 0.371533 7:-42630195 MsG0780038240.01.T01:CDS
GAACAATATCAGATAAATTA+GGG 0.389031 7:-42630101 MsG0780038240.01.T01:CDS
TAAATCAAAAGATACTTATA+AGG 0.394637 7:-42630031 MsG0780038240.01.T01:CDS
GGATCGTTGGTAAGGGTAAT+CGG 0.399855 7:+42630249 None:intergenic
AAGGATTGTCGTTATGTTGT+TGG 0.402142 7:-42630207 MsG0780038240.01.T01:CDS
TAGTGGTATTGTTAATTACT+TGG 0.403580 7:-42629896 MsG0780038240.01.T01:CDS
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CAAACATATCAATCCATTAC+AGG 0.409941 7:+42630182 None:intergenic
AGGTGCGACTTGACGAATAA+AGG 0.426137 7:+42630387 None:intergenic
AGCAGGACCTCAGTCGCATA+AGG 0.440476 7:+42630439 None:intergenic
GTTGGTAAGGGTAATCGGTT+TGG 0.441320 7:+42630254 None:intergenic
CCTTGCAATCATACGAAGAA+TGG 0.441755 7:+42629854 None:intergenic
ATTATGGAGTTCAAGAGTCT+TGG 0.455445 7:-42629645 MsG0780038240.01.T01:intron
CGATCCTTACTATAGTTTGA+AGG 0.461001 7:-42630232 MsG0780038240.01.T01:CDS
TATAGTAAGGATCGTTGGTA+AGG 0.462815 7:+42630241 None:intergenic
TTAGTCTGGGTGATAATGCT+TGG 0.467707 7:-42629978 MsG0780038240.01.T01:CDS
CAAGAACTATTCTGAAAGCT+TGG 0.467995 7:-42629413 MsG0780038240.01.T01:intron
AGTTCGTCAGGGAGGATTGT+CGG 0.469064 7:+42630498 None:intergenic
CTGATATTGTTCTGGTAGCA+GGG 0.479711 7:+42630112 None:intergenic
TCAAATTATAGATTATAACT+TGG 0.493191 7:-42629599 MsG0780038240.01.T01:intron
TCTCTCAAATTATAGACAAC+GGG 0.496598 7:+42629490 None:intergenic
TTATCCTTCAAACTATAGTA+AGG 0.499695 7:+42630228 None:intergenic
TCCATCAACAGACAAATAGA+TGG 0.502123 7:+42629727 None:intergenic
TGGTAGCAGGGTTCCAGAAA+CGG 0.514905 7:+42630124 None:intergenic
TAAGAAACGATCAAAGGAGA+TGG 0.516173 7:+42630293 None:intergenic
CTTGCAATCATACGAAGAAT+GGG 0.519036 7:+42629855 None:intergenic
CAAATAGATGGCTTAATACA+TGG 0.529657 7:+42629739 None:intergenic
GCAGGACCTCAGTCGCATAA+GGG 0.538162 7:+42630440 None:intergenic
AAATGTCAAATCAAAAGTGT+AGG 0.539140 7:+42630062 None:intergenic
GAGGATTGTCGGCGAAGACA+TGG 0.542272 7:+42630509 None:intergenic
TGTCGGCGAAGACATGGAGC+TGG 0.545850 7:+42630515 None:intergenic
GGGAAGAACACTTAGTATAG+AGG 0.548457 7:-42630331 MsG0780038240.01.T01:CDS
AATGTCAAATCAAAAGTGTA+GGG 0.549230 7:+42630063 None:intergenic
ACAAAACCCAAACTTCACAC+TGG 0.550340 7:-42630352 MsG0780038240.01.T01:CDS
CGAATAAAGGATCGGACATG+AGG 0.551030 7:+42630400 None:intergenic
CCATTCTTCGTATGATTGCA+AGG 0.556356 7:-42629854 MsG0780038240.01.T01:CDS
TCTCAACTTCAAAGACATCA+AGG 0.557625 7:-42628552 MsG0780038240.01.T01:CDS
AAGGTAGTGAACTTATACCG+AGG 0.566251 7:-42630012 MsG0780038240.01.T01:CDS
ATCTCTCAAATTATAGACAA+CGG 0.566772 7:+42629489 None:intergenic
CAAAACCCAAACTTCACACT+GGG 0.567564 7:-42630351 MsG0780038240.01.T01:CDS
AAGAAACGATCAAAGGAGAT+GGG 0.569835 7:+42630294 None:intergenic
GACGCTGCGACTTCTGTGGT+CGG 0.572494 7:+42630541 None:intergenic
AATGGATTGATATGTTTGCT+CGG 0.574304 7:-42630177 MsG0780038240.01.T01:CDS
GAGAGAACTAGAATTATCAA+TGG 0.578256 7:-42629457 MsG0780038240.01.T01:intron
GGAGTTCCACGATTTACAGC+AGG 0.579343 7:+42630422 None:intergenic
GTCGGCGAAGACATGGAGCT+GGG 0.587426 7:+42630516 None:intergenic
ATAGTAAGGATCGTTGGTAA+GGG 0.590031 7:+42630242 None:intergenic
AACGATCAAAGGAGATGGGT+AGG 0.590687 7:+42630298 None:intergenic
AAAGGAGATGGGTAGGACAC+TGG 0.591026 7:+42630305 None:intergenic
AGGTAGTGAACTTATACCGA+GGG 0.591575 7:-42630011 MsG0780038240.01.T01:CDS
CAAACTATAGTAAGGATCGT+TGG 0.598243 7:+42630236 None:intergenic
GATCATCAGCTAAGTTGTGA+TGG 0.600070 7:-42629928 MsG0780038240.01.T01:CDS
TATTTCACTTGATTTGGGCA+CGG 0.612849 7:-42629806 MsG0780038240.01.T01:CDS
TTATCAATGGCGAACGCTGG+TGG 0.614298 7:-42629444 MsG0780038240.01.T01:intron
GAATTATCAATGGCGAACGC+TGG 0.614818 7:-42629447 MsG0780038240.01.T01:intron
GAATAAAGGATCGGACATGA+GGG 0.617415 7:+42630401 None:intergenic
CTTAGCTGATGATCCTCCAC+CGG 0.621935 7:+42629937 None:intergenic
TGAAAACCCTTATGCGACTG+AGG 0.634312 7:-42630446 MsG0780038240.01.T02:CDS
ACTCTCTAAGAAACGATCAA+AGG 0.635312 7:+42630287 None:intergenic
GTACTTCAACAAAACCTCGA+GGG 0.636346 7:+42629761 None:intergenic
TACTTCAACAAAACCTCGAG+GGG 0.639585 7:+42629762 None:intergenic
GGTGGACGCTGCGACTTCTG+TGG 0.643553 7:+42630537 None:intergenic
TGAGGTCCTGCTGTAAATCG+TGG 0.644274 7:-42630428 MsG0780038240.01.T02:CDS
CGACTTGACGAATAAAGGAT+CGG 0.669143 7:+42630392 None:intergenic
CTTCTACTATAAGTTCGTCA+GGG 0.673272 7:+42630487 None:intergenic
GGCGAAGACATGGAGCTGGG+TGG 0.684132 7:+42630519 None:intergenic
CTACTATAAGTTCGTCAGGG+AGG 0.687030 7:+42630490 None:intergenic
GGTACTTCAACAAAACCTCG+AGG 0.702246 7:+42629760 None:intergenic
TGATTGCAAGGATCTTACTG+TGG 0.726006 7:-42629842 MsG0780038240.01.T01:CDS
ACTTCAACAAAACCTCGAGG+GGG 0.746432 7:+42629763 None:intergenic
GGTAGTGAACTTATACCGAG+GGG 0.750571 7:-42630010 MsG0780038240.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! GATGTATTTTATATTTTATA+TGG - Chr7:42629787-42629806 MsG0780038240.01.T01:CDS 10.0%
!! TAAATCAAAAGATACTTATA+AGG - Chr7:42629063-42629082 MsG0780038240.01.T01:intron 15.0%
!! TCAAATTATAGATTATAACT+TGG - Chr7:42629495-42629514 MsG0780038240.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTTTATATGGTTTGAATT+TGG - Chr7:42629798-42629817 MsG0780038240.01.T01:CDS 15.0%
!! AGAACAATATCAGATAAATT+AGG - Chr7:42628992-42629011 MsG0780038240.01.T01:intron 20.0%
!! ATACCATTATATTAAGCAAA+TGG - Chr7:42629888-42629907 MsG0780038240.01.T01:CDS 20.0%
!! GAACAAAATACAAGAATTAA+CGG + Chr7:42629755-42629774 None:intergenic 20.0%
!! GAACAATATCAGATAAATTA+GGG - Chr7:42628993-42629012 MsG0780038240.01.T01:intron 20.0%
!! TAATTTATCTGATATTGTTC+TGG + Chr7:42628993-42629012 None:intergenic 20.0%
!! TACCATTATATTAAGCAAAT+GGG - Chr7:42629889-42629908 MsG0780038240.01.T01:CDS 20.0%
! ACCATTATATTAAGCAAATG+GGG - Chr7:42629890-42629909 MsG0780038240.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTCTCAAATTATAGACAA+CGG + Chr7:42629608-42629627 None:intergenic 25.0%
! ATTCAAATAAATCATCGAAG+AGG + Chr7:42629730-42629749 None:intergenic 25.0%
! ATTTACCTCTATTAAGCAAA+TGG - Chr7:42630014-42630033 MsG0780038240.01.T01:CDS 25.0%
! GTGATTATTTCACTTGATTT+GGG - Chr7:42629283-42629302 MsG0780038240.01.T01:intron 25.0%
! TAGTGGTATTGTTAATTACT+TGG - Chr7:42629198-42629217 MsG0780038240.01.T01:intron 25.0%
! TGGAGAAAAAATTTGATTCT+CGG - Chr7:42629515-42629534 MsG0780038240.01.T01:intron 25.0%
! TGTCTATCAAAAGATGAATA+AGG - Chr7:42629962-42629981 MsG0780038240.01.T01:CDS 25.0%
! TGTGATTATTTCACTTGATT+TGG - Chr7:42629282-42629301 MsG0780038240.01.T01:intron 25.0%
! TTACTATAGTTTGAAGGATA+AGG - Chr7:42628868-42628887 MsG0780038240.01.T01:intron 25.0%
! TTATCCTTCAAACTATAGTA+AGG + Chr7:42628869-42628888 None:intergenic 25.0%
! TTGGATGAATCTTTCTTTAA+TGG - Chr7:42629817-42629836 MsG0780038240.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAAATGACTTGTGTTAGAT+TGG + Chr7:42630505-42630524 None:intergenic 25.0%
!! AAATGTCAAATCAAAAGTGT+AGG + Chr7:42629035-42629054 None:intergenic 25.0%
!! AATGTCAAATCAAAAGTGTA+GGG + Chr7:42629034-42629053 None:intergenic 25.0%
!! GAGAAATATTCAAAGTTTTC+CGG - Chr7:42629138-42629157 MsG0780038240.01.T01:intron 25.0%
!!! TACACTTTTGATTTGACATT+TGG - Chr7:42629034-42629053 MsG0780038240.01.T01:intron 25.0%
AACTTATGATGCACTCATAT+TGG - Chr7:42629561-42629580 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
AAGGATAAATTGGGTATGTT+AGG - Chr7:42629931-42629950 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
AGAAAAAATTTGATTCTCGG+TGG - Chr7:42629518-42629537 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
AGATTTATGAACAACTGGAA+GGG - Chr7:42630168-42630187 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
AGTTCAATTTACGTACAGAT+TGG - Chr7:42630081-42630100 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
ATATGGAAGATGACAGATTA+TGG - Chr7:42629433-42629452 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
ATTATATTAAGCAAATGGGG+AGG - Chr7:42629893-42629912 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
CAAACATATCAATCCATTAC+AGG + Chr7:42628915-42628934 None:intergenic 30.0%
CAAATAGATGGCTTAATACA+TGG + Chr7:42629358-42629377 None:intergenic 30.0%
CAAATCCATTTGCTTAATAG+AGG + Chr7:42630022-42630041 None:intergenic 30.0%
GAGAGAACTAGAATTATCAA+TGG - Chr7:42629637-42629656 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
GTAGAAGGATAGACTTTATT+TGG - Chr7:42630140-42630159 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
TCAAAAGATGAATAAGGTCT+TGG - Chr7:42629968-42629987 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
TCCCCATTTGCTTAATATAA+TGG + Chr7:42629894-42629913 None:intergenic 30.0%
TCTCTCAAATTATAGACAAC+GGG + Chr7:42629607-42629626 None:intergenic 30.0%
! AAATATTCAAAGTTTTCCGG+TGG - Chr7:42629141-42629160 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
! AGCAAACTCATCTTGTTATA+TGG - Chr7:42629416-42629435 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
! CTCTATTAAGCAAATGGATT+TGG - Chr7:42630020-42630039 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
! GGAAAATACTGCATTTTAGA+AGG - Chr7:42630203-42630222 MsG0780038240.01.T01:CDS 30.0%
!! AATGGATTGATATGTTTGCT+CGG - Chr7:42628917-42628936 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
!!! AGAAGTGTTTTCTTTACTTC+CGG - Chr7:42628625-42628644 MsG0780038240.01.T01:intron 30.0%
!!! GTGCATCATAAGTTTTAGAA+AGG + Chr7:42629555-42629574 None:intergenic 30.0%
!!! TAAGTTTTAGAAAGGTGCAA+TGG + Chr7:42629547-42629566 None:intergenic 30.0%
AAGAAACGATCAAAGGAGAT+GGG + Chr7:42628803-42628822 None:intergenic 35.0%
AAGGATTGTCGTTATGTTGT+TGG - Chr7:42628887-42628906 MsG0780038240.01.T01:intron 35.0%
ACTTCTACTATAAGTTCGTC+AGG + Chr7:42628611-42628630 None:intergenic 35.0%
AGCGGTTAAATTGCATAGTT+CGG - Chr7:42630105-42630124 MsG0780038240.01.T01:CDS 35.0%
ATTATGGAGTTCAAGAGTCT+TGG - Chr7:42629449-42629468 MsG0780038240.01.T01:intron 35.0%
ATTTACGTACAGATTGGTAG+CGG - Chr7:42630087-42630106 MsG0780038240.01.T01:CDS 35.0%
CAAACTATAGTAAGGATCGT+TGG + Chr7:42628861-42628880 None:intergenic 35.0%
CGATCCTTACTATAGTTTGA+AGG - Chr7:42628862-42628881 MsG0780038240.01.T01:intron 35.0%
CTTCTACTATAAGTTCGTCA+GGG + Chr7:42628610-42628629 None:intergenic 35.0%
CTTGCAATCATACGAAGAAT+GGG + Chr7:42629242-42629261 None:intergenic 35.0%
GAGATTTATGAACAACTGGA+AGG - Chr7:42630167-42630186 MsG0780038240.01.T01:CDS 35.0%
GTTAAATTGCATAGTTCGGA+AGG - Chr7:42630109-42630128 MsG0780038240.01.T01:CDS 35.0%
TAAGAAACGATCAAAGGAGA+TGG + Chr7:42628804-42628823 None:intergenic 35.0%
TATAGTAAGGATCGTTGGTA+AGG + Chr7:42628856-42628875 None:intergenic 35.0%
TCCATCAACAGACAAATAGA+TGG + Chr7:42629370-42629389 None:intergenic 35.0%
TCTCAACTTCAAAGACATCA+AGG - Chr7:42630542-42630561 MsG0780038240.01.T02:CDS 35.0%
TGACGAGATTTATGAACAAC+TGG - Chr7:42630163-42630182 MsG0780038240.01.T01:CDS 35.0%
! ACTCTCTAAGAAACGATCAA+AGG + Chr7:42628810-42628829 None:intergenic 35.0%
! ATAGTAAGGATCGTTGGTAA+GGG + Chr7:42628855-42628874 None:intergenic 35.0%
! CAAGAACTATTCTGAAAGCT+TGG - Chr7:42629681-42629700 MsG0780038240.01.T01:intron 35.0%
!! TATGTTGTTGGTTCCTGTAA+TGG - Chr7:42628899-42628918 MsG0780038240.01.T01:intron 35.0%
!! TATTTCACTTGATTTGGGCA+CGG - Chr7:42629288-42629307 MsG0780038240.01.T01:intron 35.0%
AAGGTAGTGAACTTATACCG+AGG - Chr7:42629082-42629101 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
ACAAAACCCAAACTTCACAC+TGG - Chr7:42628742-42628761 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
AGGTAGTGAACTTATACCGA+GGG - Chr7:42629083-42629102 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
ATCATCGTCTCCACAATCAT+GGG + Chr7:42630255-42630274 None:intergenic 40.0%
CAAAACCCAAACTTCACACT+GGG - Chr7:42628743-42628762 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
CACTATAAACGTTGCAAGCA+AGG + Chr7:42629859-42629878 None:intergenic 40.0%
CCATTCTTCGTATGATTGCA+AGG - Chr7:42629240-42629259 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
CCTTGCAATCATACGAAGAA+TGG + Chr7:42629243-42629262 None:intergenic 40.0%
CGACTTGACGAATAAAGGAT+CGG + Chr7:42628705-42628724 None:intergenic 40.0%
CTCCACAATTAAACCTGCAT+TGG + Chr7:42630315-42630334 None:intergenic 40.0%
CTGATATTGTTCTGGTAGCA+GGG + Chr7:42628985-42629004 None:intergenic 40.0%
GAATAAAGGATCGGACATGA+GGG + Chr7:42628696-42628715 None:intergenic 40.0%
GAGACGATGATATGGGTATT+CGG - Chr7:42630264-42630283 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
GATCATCAGCTAAGTTGTGA+TGG - Chr7:42629166-42629185 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
GATTGTGGAGACGATGATAT+GGG - Chr7:42630257-42630276 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
GCCATCTATTTGTCTGTTGA+TGG - Chr7:42629366-42629385 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
GGGAAGAACACTTAGTATAG+AGG - Chr7:42628763-42628782 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
GTACTTCAACAAAACCTCGA+GGG + Chr7:42629336-42629355 None:intergenic 40.0%
TACTTCAACAAAACCTCGAG+GGG + Chr7:42629335-42629354 None:intergenic 40.0%
TATCATCGTCTCCACAATCA+TGG + Chr7:42630256-42630275 None:intergenic 40.0%
TCATGTTTCTCCCATGATTG+TGG - Chr7:42630242-42630261 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
TCTGATATTGTTCTGGTAGC+AGG + Chr7:42628986-42629005 None:intergenic 40.0%
TGATTGCAAGGATCTTACTG+TGG - Chr7:42629252-42629271 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
TGATTGTGGAGACGATGATA+TGG - Chr7:42630256-42630275 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
TGCCAATGCAGGTTTAATTG+TGG - Chr7:42630310-42630329 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
TTCTTCCCAGTGTGAAGTTT+GGG + Chr7:42628751-42628770 None:intergenic 40.0%
! ACAACTGGAAGGGATTTTGA+AGG - Chr7:42630178-42630197 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
! AGAGGGCACAAGGATAAATT+GGG - Chr7:42629922-42629941 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
! TAGAGGGCACAAGGATAAAT+TGG - Chr7:42629921-42629940 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
! TATTCAAAGTTTTCCGGTGG+AGG - Chr7:42629144-42629163 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
! TTAGTCTGGGTGATAATGCT+TGG - Chr7:42629116-42629135 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
!! CTGCATTTTAGAAGGAAGTG+TGG - Chr7:42630211-42630230 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTTTAAGTCTGACGAGATG+TGG - Chr7:42628945-42628964 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
!! TGTGATGGTGTGCATTTTAG+TGG - Chr7:42629181-42629200 MsG0780038240.01.T01:intron 40.0%
!! TTTTAGAAGGAAGTGTGGCT+CGG - Chr7:42630216-42630235 MsG0780038240.01.T01:CDS 40.0%
AAATATTTGCTTCCCCCTCG+AGG - Chr7:42629319-42629338 MsG0780038240.01.T01:intron 45.0%
AAATGGGGAGGAGACTTAGA+GGG - Chr7:42629905-42629924 MsG0780038240.01.T01:CDS 45.0%
AACGATCAAAGGAGATGGGT+AGG + Chr7:42628799-42628818 None:intergenic 45.0%
ACTTCAACAAAACCTCGAGG+GGG + Chr7:42629334-42629353 None:intergenic 45.0%
AGGTGCGACTTGACGAATAA+AGG + Chr7:42628710-42628729 None:intergenic 45.0%
CACTGTGTCACATGTAGTAC+AGG - Chr7:42630380-42630399 MsG0780038240.01.T01:CDS 45.0%
CGAATAAAGGATCGGACATG+AGG + Chr7:42628697-42628716 None:intergenic 45.0%
CGATGATATGGGTATTCGGA+TGG - Chr7:42630268-42630287 MsG0780038240.01.T01:CDS 45.0%
CTACTATAAGTTCGTCAGGG+AGG + Chr7:42628607-42628626 None:intergenic 45.0%
GAATTATCAATGGCGAACGC+TGG - Chr7:42629647-42629666 MsG0780038240.01.T01:intron 45.0%
GACTAAAAACTTTCGCCCCT+CGG + Chr7:42629102-42629121 None:intergenic 45.0%
GGTACTTCAACAAAACCTCG+AGG + Chr7:42629337-42629356 None:intergenic 45.0%
GGTAGTGAACTTATACCGAG+GGG - Chr7:42629084-42629103 MsG0780038240.01.T01:intron 45.0%
GTTCTTCCCAGTGTGAAGTT+TGG + Chr7:42628752-42628771 None:intergenic 45.0%
TGAAAACCCTTATGCGACTG+AGG - Chr7:42628648-42628667 MsG0780038240.01.T01:intron 45.0%
! AGTCGCATAAGGGTTTTCAC+CGG + Chr7:42628647-42628666 None:intergenic 45.0%
! GGATCGTTGGTAAGGGTAAT+CGG + Chr7:42628848-42628867 None:intergenic 45.0%
! GTTGGTAAGGGTAATCGGTT+TGG + Chr7:42628843-42628862 None:intergenic 45.0%
! TTTAGAAGGAAGTGTGGCTC+GGG - Chr7:42630217-42630236 MsG0780038240.01.T01:CDS 45.0%
!! ACTGGAAGGGATTTTGAAGG+TGG - Chr7:42630181-42630200 MsG0780038240.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGGAAGGGATTTTGAAGGT+GGG - Chr7:42630182-42630201 MsG0780038240.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTTTTGTGTAGAACGCTGA+AGG + Chr7:42628730-42628749 None:intergenic 45.0%
!!! AGGGGCGAAAGTTTTTAGTC+TGG - Chr7:42629102-42629121 MsG0780038240.01.T01:intron 45.0%
!!! GGGGCGAAAGTTTTTAGTCT+GGG - Chr7:42629103-42629122 MsG0780038240.01.T01:intron 45.0%
AAAGGAGATGGGTAGGACAC+TGG + Chr7:42628792-42628811 None:intergenic 50.0%
ACGAGATGTGGTTCCGTTTC+TGG - Chr7:42628957-42628976 MsG0780038240.01.T01:intron 50.0%
AGTTCGTCAGGGAGGATTGT+CGG + Chr7:42628599-42628618 None:intergenic 50.0%
CAAATGGGGAGGAGACTTAG+AGG - Chr7:42629904-42629923 MsG0780038240.01.T01:CDS 50.0%
CCTAGACAAGTTGCCAATGC+AGG - Chr7:42630299-42630318 MsG0780038240.01.T01:CDS 50.0%
CGGAAGGTGAAAGCTGTAGA+AGG - Chr7:42630125-42630144 MsG0780038240.01.T01:CDS 50.0%
CTTAGCTGATGATCCTCCAC+CGG + Chr7:42629160-42629179 None:intergenic 50.0%
GGAGTTCCACGATTTACAGC+AGG + Chr7:42628675-42628694 None:intergenic 50.0%
TGAGGTCCTGCTGTAAATCG+TGG - Chr7:42628666-42628685 MsG0780038240.01.T01:intron 50.0%
TGGTAGCAGGGTTCCAGAAA+CGG + Chr7:42628973-42628992 None:intergenic 50.0%
TTATCAATGGCGAACGCTGG+TGG - Chr7:42629650-42629669 MsG0780038240.01.T01:intron 50.0%
! CCTGCATTGGCAACTTGTCT+AGG + Chr7:42630302-42630321 None:intergenic 50.0%
AGCAGGACCTCAGTCGCATA+AGG + Chr7:42628658-42628677 None:intergenic 55.0%
GAGGATTGTCGGCGAAGACA+TGG + Chr7:42628588-42628607 None:intergenic 55.0%
GCAGGACCTCAGTCGCATAA+GGG + Chr7:42628657-42628676 None:intergenic 55.0%
! GAGGAGACTTAGAGGGCACA+AGG - Chr7:42629912-42629931 MsG0780038240.01.T01:CDS 55.0%
GACGCTGCGACTTCTGTGGT+CGG + Chr7:42628556-42628575 None:intergenic 60.0%
GTCGGCGAAGACATGGAGCT+GGG + Chr7:42628581-42628600 None:intergenic 60.0%
TGTCGGCGAAGACATGGAGC+TGG + Chr7:42628582-42628601 None:intergenic 60.0%
GGCGAAGACATGGAGCTGGG+TGG + Chr7:42628578-42628597 None:intergenic 65.0%
GGTGGACGCTGCGACTTCTG+TGG + Chr7:42628560-42628579 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 42628545 42630571 42628545 ID=MsG0780038240.01;Name=MsG0780038240.01
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Chr7 exon 42629399 42630571 42629399 ID=MsG0780038240.01.T02:exon:8229;Parent=MsG0780038240.01.T02
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