AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038354.01

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTATTCAAAAGACACTTATA+AGG 0.411589 7:+44927435 MsG0780038354.01.T01:CDS
AGGTGCAACTTGACGAAGAA+AGG 0.435738 7:-44927082 None:intergenic
TCTCTCAAATTATAGACAAC+TGG 0.439014 7:-44927973 None:intergenic
AGTGTCTTACACGTCTCCTT+TGG 0.441922 7:+44927163 MsG0780038354.01.T01:CDS
CACTTCGTACTTGGCGCACT+AGG 0.444169 7:+44927127 MsG0780038354.01.T01:CDS
CAAGAATTATGCTGAAAGCT+TGG 0.444525 7:+44928050 MsG0780038354.01.T01:CDS
CAAATTATAGATTATAACTT+GGG 0.447635 7:+44927865 MsG0780038354.01.T01:CDS
ACTTCTGCAATAAGTTCGTC+GGG 0.450626 7:-44926983 None:intergenic
ATTATGGAGTTCAAGAGTCT+TGG 0.455445 7:+44927818 MsG0780038354.01.T01:CDS
CCGGTGATAGGGCTAAATTT+TGG 0.457908 7:+44928921 MsG0780038354.01.T01:CDS
TGAAGTGCTGTTCTAAATCC+TGG 0.458890 7:+44927041 MsG0780038354.01.T01:CDS
CAACTTGACGAAGAAAGGTT+TGG 0.459083 7:-44927077 None:intergenic
TAATTTATCTGATATTGTCC+TGG 0.466480 7:-44927362 None:intergenic
TTAGTCTGGGAGATAATGCT+TGG 0.480532 7:+44927488 MsG0780038354.01.T01:CDS
TATGTTGTTGGTTCATGCCA+TGG 0.481748 7:+44927271 MsG0780038354.01.T01:CDS
ACAAATTATAGATTATAACT+TGG 0.487307 7:+44927864 MsG0780038354.01.T01:CDS
CGAAGAAAGGTTTGGACATG+AGG 0.490505 7:-44927069 None:intergenic
GGAAGCTGCGACTTCTGTGG+TGG 0.506211 7:-44926929 None:intergenic
CACTTCTGCAATAAGTTCGT+CGG 0.506909 7:-44926984 None:intergenic
GAGATTAGGTGCCGGTGATA+GGG 0.506956 7:+44928910 MsG0780038354.01.T01:CDS
GCACTTCAGCAAAACCTTGA+GGG 0.511354 7:-44927702 None:intergenic
TTGTCCTTCAAATCATAGTA+AGG 0.514270 7:-44927238 None:intergenic
TGTGATGGTGTGTATTTGAA+TGG 0.514303 7:+44927553 MsG0780038354.01.T01:CDS
TAAGTAAATCATCGATTTGG+TGG 0.514637 7:+44928819 MsG0780038354.01.T01:CDS
ACTAGAGTTATCAATGGTAA+AGG 0.516668 7:+44928012 MsG0780038354.01.T01:CDS
TTGAGGTTAAAATCTGGCCC+TGG 0.517458 7:+44928857 MsG0780038354.01.T01:CDS
TGTTGGTTCATGCCATGGAT+TGG 0.521941 7:+44927276 MsG0780038354.01.T01:CDS
CGCAGCTTCCACCCAACTCT+AGG 0.525984 7:+44926942 MsG0780038354.01.T01:CDS
ATCGGCGATGACCTAGAGTT+GGG 0.527933 7:-44926953 None:intergenic
AGTTCACGAGCAGATTCGTC+TGG 0.529566 7:-44928793 None:intergenic
TAAATCATCGATTTGGTGGA+GGG 0.544758 7:+44928823 MsG0780038354.01.T01:CDS
ACACACCATCACAACTTAGC+TGG 0.546762 7:-44927543 None:intergenic
CTGATATTGTCCTGGTGGCG+AGG 0.547350 7:-44927354 None:intergenic
GAGTTATCAATGGTAAAGGC+TGG 0.548285 7:+44928016 MsG0780038354.01.T01:CDS
TATCGGCGATGACCTAGAGT+TGG 0.554050 7:-44926954 None:intergenic
AAGAGAACTAGAGTTATCAA+TGG 0.555305 7:+44928006 MsG0780038354.01.T01:CDS
CAAATCATAGTAAGGATCGT+TGG 0.557429 7:-44927230 None:intergenic
GGAGGGATGTGTCAAATTTG+AGG 0.559555 7:+44928840 MsG0780038354.01.T01:CDS
CCAAAATTTAGCCCTATCAC+CGG 0.561712 7:-44928921 None:intergenic
AGGATCGTTGGAAAGAGTGA+TGG 0.570375 7:-44927218 None:intergenic
GTAAATCATCGATTTGGTGG+AGG 0.570726 7:+44928822 MsG0780038354.01.T01:CDS
TATTTCACTTGATCTTGGAA+CGG 0.572047 7:+44927657 MsG0780038354.01.T01:CDS
GAAAGGTGCATTGGCAACCA+CGG 0.583744 7:-44927904 None:intergenic
GGATCGTTGGAAAGAGTGAT+GGG 0.586841 7:-44927217 None:intergenic
GGTAGTGAATTTATATGGAG+AGG 0.587493 7:+44927456 MsG0780038354.01.T01:CDS
GAAGCTGCGACTTCTGTGGT+GGG 0.587820 7:-44926928 None:intergenic
CTTTAAAGTCTGGAGAGATG+TGG 0.590794 7:+44927317 MsG0780038354.01.T01:CDS
AATCTGGCCCTGGAACAGAC+TGG 0.594602 7:+44928867 MsG0780038354.01.T01:CDS
ATTATAGATTATAACTTGGG+GGG 0.597040 7:+44927868 MsG0780038354.01.T01:CDS
GGGGAAAATTTGATAATCCG+TGG 0.597832 7:+44927887 MsG0780038354.01.T01:CDS
AGTCGCATAAGAGATTTCAC+AGG 0.599408 7:-44927019 None:intergenic
GATCACCAGCTAAGTTGTGA+TGG 0.600070 7:+44927538 MsG0780038354.01.T01:CDS
TTACTATGATTTGAAGGACA+AGG 0.600309 7:+44927240 MsG0780038354.01.T01:CDS
AAATTATAGATTATAACTTG+GGG 0.601166 7:+44927866 MsG0780038354.01.T01:CDS
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GGCACTTCAGCAAAACCTTG+AGG 0.604089 7:-44927703 None:intergenic
CACTTCAGCAAAACCTTGAG+GGG 0.613714 7:-44927701 None:intergenic
CATAGCGATGGCTTAACACA+TGG 0.615551 7:-44927724 None:intergenic
CGAGCAGACATACCAATCCA+TGG 0.617105 7:-44927288 None:intergenic
CTTAGCTGGTGATCCTCCAC+CGG 0.619676 7:-44927529 None:intergenic
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AATTATAGATTATAACTTGG+GGG 0.625753 7:+44927867 MsG0780038354.01.T01:CDS
GGTGGAAGCTGCGACTTCTG+TGG 0.626259 7:-44926932 None:intergenic
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TTTATCTGATATTGTCCTGG+TGG 0.634591 7:-44927359 None:intergenic
TTCACCAACATACATAGCGA+TGG 0.636495 7:-44927736 None:intergenic
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GGCGATGACCTAGAGTTGGG+TGG 0.651281 7:-44926950 None:intergenic
ACTCTCTATCAATCGACCAA+AGG 0.652741 7:-44927179 None:intergenic
AGTGCGCCAAGTACGAAGTG+AGG 0.653645 7:-44927124 None:intergenic
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GCATAAGAGATTTCACAGGA+AGG 0.676128 7:-44927015 None:intergenic
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CTTCTGCAATAAGTTCGTCG+GGG 0.744269 7:-44926982 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! TGGATTTTATTTTATTATTT+TGG + Chr7:44928157-44928176 MsG0780038354.01.T01:intron 10.0%
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!! AAACAACATATAAGAATTAA+CGG - Chr7:44928124-44928143 None:intergenic 15.0%
!! AAATTATAGATTATAACTTG+GGG + Chr7:44927866-44927885 MsG0780038354.01.T01:CDS 15.0%
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!!! AACAGTTTTAATTTTACATT+TGG + Chr7:44927406-44927425 MsG0780038354.01.T01:CDS 15.0%
!!! CAAAATTTTAAAATCAGATA+TGG + Chr7:44928762-44928781 MsG0780038354.01.T01:intron 15.0%
!!! TCTTTTGCTTTTTATATTTA+AGG + Chr7:44928220-44928239 MsG0780038354.01.T01:intron 15.0%
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!! CAAAAAGCTAAATAATGAAA+TGG + Chr7:44928312-44928331 MsG0780038354.01.T01:intron 20.0%
!! TATAAGGTAGTGAATTTATA+TGG + Chr7:44927451-44927470 MsG0780038354.01.T01:CDS 20.0%
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!!! ATTATTTTGGCTATTGTTAA+CGG + Chr7:44928170-44928189 MsG0780038354.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTTATAAGGTAACAAAGA+AGG + Chr7:44928565-44928584 MsG0780038354.01.T01:intron 20.0%
!!! GTGTATCATAATTTTTAGAA+AGG - Chr7:44927924-44927943 None:intergenic 20.0%
! AGGACAATATCAGATAAATT+AGG + Chr7:44927364-44927383 MsG0780038354.01.T01:CDS 25.0%
! ATTATAGATTATAACTTGGG+GGG + Chr7:44927868-44927887 MsG0780038354.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCAAATAAATCATCGAAG+AGG - Chr7:44928099-44928118 None:intergenic 25.0%
! CTTGCAATCATAAATAATAC+TGG - Chr7:44927611-44927630 None:intergenic 25.0%
! GAATGGTATTGTTAATTACT+TGG + Chr7:44927570-44927589 MsG0780038354.01.T01:CDS 25.0%
! GGACAATATCAGATAAATTA+GGG + Chr7:44927365-44927384 MsG0780038354.01.T01:CDS 25.0%
! GTTGTTTGATTGTTATATGA+TGG + Chr7:44928137-44928156 MsG0780038354.01.T01:intron 25.0%
! TAAATAATGAAATGGTGCTT+TGG + Chr7:44928320-44928339 MsG0780038354.01.T01:intron 25.0%
! TAATTTATCTGATATTGTCC+TGG - Chr7:44927365-44927384 None:intergenic 25.0%
! TATGCTAACACTGTTAAATT+CGG + Chr7:44928510-44928529 MsG0780038354.01.T01:intron 25.0%
! TTACTTATGAAGACATGTTA+TGG + Chr7:44928737-44928756 MsG0780038354.01.T01:intron 25.0%
!! TCAAATTTGAGGTTAAAATC+TGG + Chr7:44928851-44928870 MsG0780038354.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGAAGGTTTTGAATGTAT+TGG + Chr7:44928580-44928599 MsG0780038354.01.T01:intron 25.0%
!!! AGGAAACTGATTTTGTTATA+TGG + Chr7:44927785-44927804 MsG0780038354.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGCTTTTTATTGGTTAGTT+GGG + Chr7:44928616-44928635 MsG0780038354.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTGTTTAACTTAACCCTTT+TGG + Chr7:44928694-44928713 MsG0780038354.01.T01:intron 25.0%
!!! GATAAATTAGGGCATTTTTA+TGG + Chr7:44927376-44927395 MsG0780038354.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAATTTTTAGAAAGGTGCAT+TGG - Chr7:44927916-44927935 None:intergenic 25.0%
AAGAGAACTAGAGTTATCAA+TGG + Chr7:44928006-44928025 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
ACTAGAGTTATCAATGGTAA+AGG + Chr7:44928012-44928031 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
AGCAAAAGAAATTCATTCGA+TGG - Chr7:44928209-44928228 None:intergenic 30.0%
AGTTGTCTATAATTTGAGAG+AGG + Chr7:44927975-44927994 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
ATATGGAAGATGACAGATTA+TGG + Chr7:44927802-44927821 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
CATGTTGTTAAGAAGAGATT+AGG + Chr7:44928896-44928915 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
GTGATTATTTCACTTGATCT+TGG + Chr7:44927652-44927671 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
TATTTCACTTGATCTTGGAA+CGG + Chr7:44927657-44927676 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
TCATGAATATTCAAGAGAGA+AGG - Chr7:44928267-44928286 None:intergenic 30.0%
TCTCTCAAATTATAGACAAC+TGG - Chr7:44927976-44927995 None:intergenic 30.0%
TGACAACATGAGAAAAACAA+AGG - Chr7:44927765-44927784 None:intergenic 30.0%
TTACTATGATTTGAAGGACA+AGG + Chr7:44927240-44927259 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCCTTCAAATCATAGTA+AGG - Chr7:44927241-44927260 None:intergenic 30.0%
! AGAGAGAAGGAATTTCTTTT+TGG - Chr7:44928254-44928273 None:intergenic 30.0%
! CAGTAAGTAAATCATCGATT+TGG + Chr7:44928816-44928835 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
! GAGAGAAGGAATTTCTTTTT+GGG - Chr7:44928253-44928272 None:intergenic 30.0%
!! ACTGCAAAGATGCTTTTTAT+TGG + Chr7:44928607-44928626 MsG0780038354.01.T01:intron 30.0%
!! GATGCTTTTTATTGGTTAGT+TGG + Chr7:44928615-44928634 MsG0780038354.01.T01:intron 30.0%
!! TAAGTAAATCATCGATTTGG+TGG + Chr7:44928819-44928838 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGTTTTTCTCATGTTGTCA+AGG + Chr7:44927765-44927784 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
!!! GAGAAGTATTCAAAGTTTTC+CGG + Chr7:44927510-44927529 MsG0780038354.01.T01:CDS 30.0%
AAGTGGAATAAATCCATCCA+AGG - Chr7:44928420-44928439 None:intergenic 35.0%
ATCTGTAGAGATAAGTGTCA+AGG + Chr7:44928644-44928663 MsG0780038354.01.T01:intron 35.0%
ATTATGGAGTTCAAGAGTCT+TGG + Chr7:44927818-44927837 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
CAAATCATAGTAAGGATCGT+TGG - Chr7:44927233-44927252 None:intergenic 35.0%
CAAGAATTATGCTGAAAGCT+TGG + Chr7:44928050-44928069 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
CATGGAAAATTACCCTCTAT+TGG + Chr7:44928484-44928503 MsG0780038354.01.T01:intron 35.0%
CGATCCTTACTATGATTTGA+AGG + Chr7:44927234-44927253 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
GGTAGTGAATTTATATGGAG+AGG + Chr7:44927456-44927475 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
TACAATTCACGTTGTTGGTA+TGG - Chr7:44928350-44928369 None:intergenic 35.0%
TTTATCTGATATTGTCCTGG+TGG - Chr7:44927362-44927381 None:intergenic 35.0%
! AAGGATTGCTGTTATGTTGT+TGG + Chr7:44927259-44927278 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTATTCAAAGTTTTCCGG+TGG + Chr7:44927513-44927532 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
! TGGATGGATTTATTCCACTT+GGG + Chr7:44928420-44928439 MsG0780038354.01.T01:intron 35.0%
! TGTGATGGTGTGTATTTGAA+TGG + Chr7:44927553-44927572 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGATGGATTTATTCCACT+TGG + Chr7:44928419-44928438 MsG0780038354.01.T01:intron 35.0%
!! ACTTAACCCTTTTGGCTAAA+TGG + Chr7:44928702-44928721 MsG0780038354.01.T01:intron 35.0%
!! CTCGGTTATTCTTTAAAGTC+TGG + Chr7:44927307-44927326 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAATCATCGATTTGGTGGA+GGG + Chr7:44928823-44928842 MsG0780038354.01.T01:CDS 35.0%
ACTCTCTATCAATCGACCAA+AGG - Chr7:44927182-44927201 None:intergenic 40.0%
ACTTCTGCAATAAGTTCGTC+GGG - Chr7:44926986-44927005 None:intergenic 40.0%
AGTCGCATAAGAGATTTCAC+AGG - Chr7:44927022-44927041 None:intergenic 40.0%
CAACTTGACGAAGAAAGGTT+TGG - Chr7:44927080-44927099 None:intergenic 40.0%
CACTTCTGCAATAAGTTCGT+CGG - Chr7:44926987-44927006 None:intergenic 40.0%
CCAAAATTTAGCCCTATCAC+CGG - Chr7:44928924-44928943 None:intergenic 40.0%
GAGTTATCAATGGTAAAGGC+TGG + Chr7:44928016-44928035 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
GCATAAGAGATTTCACAGGA+AGG - Chr7:44927018-44927037 None:intergenic 40.0%
GGAAAATTACCCTCTATTGG+AGG + Chr7:44928487-44928506 MsG0780038354.01.T01:intron 40.0%
GTTAAGAAGAGATTAGGTGC+CGG + Chr7:44928902-44928921 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
GTTAGCATACCTCCAATAGA+GGG - Chr7:44928499-44928518 None:intergenic 40.0%
TAAGCCATCGCTATGTATGT+TGG + Chr7:44927732-44927751 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
TCGCTTACAATTCACGTTGT+TGG - Chr7:44928355-44928374 None:intergenic 40.0%
TGTAGAGATAAGTGTCAAGG+TGG + Chr7:44928647-44928666 MsG0780038354.01.T01:intron 40.0%
TGTTAGCATACCTCCAATAG+AGG - Chr7:44928500-44928519 None:intergenic 40.0%
TTAGTCTGGGAGATAATGCT+TGG + Chr7:44927488-44927507 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
TTATCAATGGTAAAGGCTGG+TGG + Chr7:44928019-44928038 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
TTCACCAACATACATAGCGA+TGG - Chr7:44927739-44927758 None:intergenic 40.0%
! GGGGAAAATTTGATAATCCG+TGG + Chr7:44927887-44927906 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
! TATTCAAAGTTTTCCGGTGG+AGG + Chr7:44927516-44927535 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
! TCACTGCCATTTAGCCAAAA+GGG - Chr7:44928711-44928730 None:intergenic 40.0%
!! AAGTGTCAAGGTGGTTTGTT+TGG + Chr7:44928656-44928675 MsG0780038354.01.T01:intron 40.0%
!! CTTTAAAGTCTGGAGAGATG+TGG + Chr7:44927317-44927336 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
!! GTAAATCATCGATTTGGTGG+AGG + Chr7:44928822-44928841 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
!! TATGTTGTTGGTTCATGCCA+TGG + Chr7:44927271-44927290 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
!! TGAAGTGCTGTTCTAAATCC+TGG + Chr7:44927041-44927060 MsG0780038354.01.T01:CDS 40.0%
AAGGCAGCCTACTAGTGATA+CGG - Chr7:44928401-44928420 None:intergenic 45.0%
AAGTGACCCGTATCACTAGT+AGG + Chr7:44928391-44928410 MsG0780038354.01.T01:intron 45.0%
ACACACCATCACAACTTAGC+TGG - Chr7:44927546-44927565 None:intergenic 45.0%
ACTTCAGCAAAACCTTGAGG+GGG - Chr7:44927703-44927722 None:intergenic 45.0%
AGGATCGTTGGAAAGAGTGA+TGG - Chr7:44927221-44927240 None:intergenic 45.0%
AGGTGCAACTTGACGAAGAA+AGG - Chr7:44927085-44927104 None:intergenic 45.0%
AGTGTCTTACACGTCTCCTT+TGG + Chr7:44927163-44927182 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
CAAAACCCTCACTTCGTACT+TGG + Chr7:44927118-44927137 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
CACTTCAGCAAAACCTTGAG+GGG - Chr7:44927704-44927723 None:intergenic 45.0%
CATAGCGATGGCTTAACACA+TGG - Chr7:44927727-44927746 None:intergenic 45.0%
CGAAGAAAGGTTTGGACATG+AGG - Chr7:44927072-44927091 None:intergenic 45.0%
CTTCTGCAATAAGTTCGTCG+GGG - Chr7:44926985-44927004 None:intergenic 45.0%
GAGAAAACCAGTCTGTTCCA+GGG - Chr7:44928877-44928896 None:intergenic 45.0%
GAGATAAGTCTTGCTCGGAA+TGG - Chr7:44928460-44928479 None:intergenic 45.0%
GATCACCAGCTAAGTTGTGA+TGG + Chr7:44927538-44927557 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGACTTATCTCTTGGCA+TGG + Chr7:44928466-44928485 MsG0780038354.01.T01:intron 45.0%
GCACTTCAGCAAAACCTTGA+GGG - Chr7:44927705-44927724 None:intergenic 45.0%
GCCAAGAGATAAGTCTTGCT+CGG - Chr7:44928465-44928484 None:intergenic 45.0%
GGAGGGATGTGTCAAATTTG+AGG + Chr7:44928840-44928859 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
GGATCGTTGGAAAGAGTGAT+GGG - Chr7:44927220-44927239 None:intergenic 45.0%
TCCGAGCAAGACTTATCTCT+TGG + Chr7:44928461-44928480 MsG0780038354.01.T01:intron 45.0%
TGAGAAAACCAGTCTGTTCC+AGG - Chr7:44928878-44928897 None:intergenic 45.0%
TGCTCGGAATGGTTTCAGTA+CGG - Chr7:44928449-44928468 None:intergenic 45.0%
TTGAGGTTAAAATCTGGCCC+TGG + Chr7:44928857-44928876 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
TTTGGACATGAGGATGTTCC+AGG - Chr7:44927062-44927081 None:intergenic 45.0%
! AAAGATTTGCTTCCCCCTCA+AGG + Chr7:44927688-44927707 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
! CCGGTGATAGGGCTAAATTT+TGG + Chr7:44928921-44928940 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
! CTCACTGCCATTTAGCCAAA+AGG - Chr7:44928712-44928731 None:intergenic 45.0%
! GAGAGATGTGGTTCCGTTTT+TGG + Chr7:44927329-44927348 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
! GGTTTTGCGAAGAACGTTGA+AGG - Chr7:44927105-44927124 None:intergenic 45.0%
!! CATGGATTGGTATGTCTGCT+CGG + Chr7:44927289-44927308 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTTGGTTCATGCCATGGAT+TGG + Chr7:44927276-44927295 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGAGGCGAGAGTTTTTAGTC+TGG + Chr7:44927474-44927493 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
!!! GAGGCGAGAGTTTTTAGTCT+GGG + Chr7:44927475-44927494 MsG0780038354.01.T01:CDS 45.0%
AGGCAGCCTACTAGTGATAC+GGG - Chr7:44928400-44928419 None:intergenic 50.0%
AGTTCACGAGCAGATTCGTC+TGG - Chr7:44928796-44928815 None:intergenic 50.0%
AGTTCGTCGGGGAGGATTAT+CGG - Chr7:44926974-44926993 None:intergenic 50.0%
ATCGGCGATGACCTAGAGTT+GGG - Chr7:44926956-44926975 None:intergenic 50.0%
CGAGCAGACATACCAATCCA+TGG - Chr7:44927291-44927310 None:intergenic 50.0%
GCTCGGAATGGTTTCAGTAC+GGG - Chr7:44928448-44928467 None:intergenic 50.0%
GGCACTTCAGCAAAACCTTG+AGG - Chr7:44927706-44927725 None:intergenic 50.0%
GTATCACTAGTAGGCTGCCT+TGG + Chr7:44928400-44928419 MsG0780038354.01.T01:intron 50.0%
TATCGGCGATGACCTAGAGT+TGG - Chr7:44926957-44926976 None:intergenic 50.0%
! GAAAGGTGCATTGGCAACCA+CGG - Chr7:44927907-44927926 None:intergenic 50.0%
! TGGTGGCGAGGTTCCAAAAA+CGG - Chr7:44927345-44927364 None:intergenic 50.0%
!! AGAGATTAGGTGCCGGTGAT+AGG + Chr7:44928909-44928928 MsG0780038354.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGATTAGGTGCCGGTGATA+GGG + Chr7:44928910-44928929 MsG0780038354.01.T01:CDS 50.0%
AATCTGGCCCTGGAACAGAC+TGG + Chr7:44928867-44928886 MsG0780038354.01.T01:CDS 55.0%
AGTGCGCCAAGTACGAAGTG+AGG - Chr7:44927127-44927146 None:intergenic 55.0%
CACTAGTAGGCTGCCTTGGA+TGG + Chr7:44928404-44928423 MsG0780038354.01.T01:intron 55.0%
CACTTCGTACTTGGCGCACT+AGG + Chr7:44927127-44927146 MsG0780038354.01.T01:CDS 55.0%
CTGCAATAAGTTCGTCGGGG+AGG - Chr7:44926982-44927001 None:intergenic 55.0%
CTTAGCTGGTGATCCTCCAC+CGG - Chr7:44927532-44927551 None:intergenic 55.0%
GAAGCTGCGACTTCTGTGGT+GGG - Chr7:44926931-44926950 None:intergenic 55.0%
GTGCGCCAAGTACGAAGTGA+GGG - Chr7:44927126-44927145 None:intergenic 55.0%
TTTCAGTACGGGCTCCCAAG+TGG - Chr7:44928437-44928456 None:intergenic 55.0%
! CTGATATTGTCCTGGTGGCG+AGG - Chr7:44927357-44927376 None:intergenic 55.0%
!!! GTTTTTGGAACCTCGCCACC+AGG + Chr7:44927344-44927363 MsG0780038354.01.T01:CDS 55.0%
CGCAGCTTCCACCCAACTCT+AGG + Chr7:44926942-44926961 MsG0780038354.01.T01:CDS 60.0%
GGAAGCTGCGACTTCTGTGG+TGG - Chr7:44926932-44926951 None:intergenic 60.0%
GGCGATGACCTAGAGTTGGG+TGG - Chr7:44926953-44926972 None:intergenic 60.0%
GGTGGAAGCTGCGACTTCTG+TGG - Chr7:44926935-44926954 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 44926920 44928955 44926920 ID=MsG0780038354.01;Name=MsG0780038354.01
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Chr7 exon 44926920 44928071 44926920 ID=MsG0780038354.01.T01:exon:4951;Parent=MsG0780038354.01.T01
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Chr7 CDS 44926920 44928071 44926920 ID=MsG0780038354.01.T01:cds;Parent=MsG0780038354.01.T01
Chr7 CDS 44928779 44928955 44928779 ID=MsG0780038354.01.T01:cds;Parent=MsG0780038354.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038354.01.T01

ATGATTCTCCCACCACAGAAGTCGCAGCTTCCACCCAACTCTAGGTCATCGCCGATAATCCTCCCCGACGAACTTATTGCAGAAGTGCTTTCATTCCTTCCTGTGAAATCTCTTATGCGACTGAAGTGCTGTTCTAAATCCTGGAACATCCTCATGTCCAAACCTTTCTTCGTCAAGTTGCACCTTCAACGTTCTTCGCAAAACCCTCACTTCGTACTTGGCGCACTAGGTCTAGATTATAATAGTGTCTTACACGTCTCCTTTGGTCGATTGATAGAGAGTTCGCGTTCGTTGAAGCCCATCACTCTTTCCAACGATCCTTACTATGATTTGAAGGACAAGGATTGCTGTTATGTTGTTGGTTCATGCCATGGATTGGTATGTCTGCTCGGTTATTCTTTAAAGTCTGGAGAGATGTGGTTCCGTTTTTGGAACCTCGCCACCAGGACAATATCAGATAAATTAGGGCATTTTTATGGCATAGATAACAGTTTTAATTTTACATTTGGTTATGATTATTCAAAAGACACTTATAAGGTAGTGAATTTATATGGAGAGGCGAGAGTTTTTAGTCTGGGAGATAATGCTTGGAGAAGTATTCAAAGTTTTCCGGTGGAGGATCACCAGCTAAGTTGTGATGGTGTGTATTTGAATGGTATTGTTAATTACTTGGCAATTCGCAATTACTCCAGTATTATTTATGATTGCAAGAATATTATTGTTGAGCAGTTTGTGATTATTTCACTTGATCTTGGAACGGAAACATACAAAGATTTGCTTCCCCCTCAAGGTTTTGCTGAAGTGCCATGTGTTAAGCCATCGCTATGTATGTTGGTGAATTGCCTTTGTTTTTCTCATGTTGTCAAGGAAACTGATTTTGTTATATGGAAGATGACAGATTATGGAGTTCAAGAGTCTTGGACTCAATTACTTAAGATAAATCTACAAATTATAGATTATAACTTGGGGGGAAAATTTGATAATCCGTGGTTGCCAATGCACCTTTCTAAAAATTATGATACACTCATATTGGGAAACTATCTTGAACAGCTGCCAGTTGTCTATAATTTGAGAGAGGATAGTGTAAAGAGAACTAGAGTTATCAATGGTAAAGGCTGGTGGCACTGTATCAAGAATTATGCTGAAAGCTTGATATGGAAATCTGTCCAGACGAATCTGCTCGTGAACTCAGTAAGTAAATCATCGATTTGGTGGAGGGATGTGTCAAATTTGAGGTTAAAATCTGGCCCTGGAACAGACTGGTTTTCTCATGTTGTTAAGAAGAGATTAGGTGCCGGTGATAGGGCTAAATTTTGGCACGATTTATAG
Protein sequence

>MsG0780038354.01.T01

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