AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880043155.01

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MsG0880043155.01.T07 AT3G06240 24.186 430 237 18 1 383 34 421 1.19e-15 78.6
MsG0880043155.01.T07 AT3G16210 25.729 377 205 16 2 363 4 320 2.30e-14 74.3
MsG0880043155.01.T07 AT3G49980 23.242 327 198 15 3 311 5 296 4.13e-12 67.4
MsG0880043155.01.T07 AT3G49980 23.242 327 198 15 3 311 6 297 4.83e-12 67.4
MsG0880043155.01.T07 AT2G27520 25.926 405 204 20 3 380 6 341 1.18e-11 65.9
MsG0880043155.01.T03 AT3G06240 24.777 448 240 20 4 399 19 421 8.89e-18 85.1
MsG0880043155.01.T03 AT5G10340 24.524 420 249 18 11 395 59 445 2.48e-17 84.0
MsG0880043155.01.T03 AT1G33530 24.198 343 206 11 3 334 75 374 7.21e-16 79.3
MsG0880043155.01.T03 AT3G16210 26.455 378 205 17 17 379 1 320 1.86e-15 77.8
MsG0880043155.01.T03 AT4G38870 25.310 403 235 15 1 378 36 397 1.04e-12 69.7
MsG0880043155.01.T03 AT3G49980 24.906 265 160 12 21 275 5 240 1.66e-11 65.9
MsG0880043155.01.T03 AT3G49980 24.906 265 160 12 21 275 6 241 1.70e-11 65.9
MsG0880043155.01.T03 AT5G47300 24.324 333 180 17 21 328 46 331 2.49e-11 65.5
MsG0880043155.01.T03 AT2G27520 24.020 408 208 19 21 397 6 342 3.33e-11 64.7
MsG0880043155.01.T06 AT5G10340 24.879 414 240 18 2 380 68 445 1.34e-16 81.6
MsG0880043155.01.T06 AT3G06240 24.186 430 238 17 1 384 34 421 4.00e-16 80.1
MsG0880043155.01.T06 AT3G16210 25.936 374 209 16 2 364 4 320 9.46e-15 75.5
MsG0880043155.01.T06 AT1G33530 24.074 324 193 11 3 319 97 374 2.93e-14 74.3
MsG0880043155.01.T06 AT3G49980 23.547 327 198 15 3 312 6 297 1.34e-12 68.9
MsG0880043155.01.T06 AT3G49980 23.547 327 198 15 3 312 5 296 1.41e-12 68.9
MsG0880043155.01.T06 AT2G17310 25.610 410 231 21 1 382 1 364 2.09e-11 65.5
MsG0880043155.01.T06 AT2G27520 24.757 412 201 20 3 381 6 341 4.24e-11 64.3
MsG0880043155.01.T09 AT3G06240 24.667 300 168 12 33 316 164 421 7.13e-11 63.2
MsG0880043155.01.T01 AT3G06240 25.753 299 160 13 33 310 164 421 6.01e-12 66.2
MsG0880043155.01.T08 AT5G10340 25.061 411 240 18 2 377 68 445 5.91e-17 82.4
MsG0880043155.01.T08 AT3G06240 24.711 433 229 20 1 381 34 421 1.94e-15 77.8
MsG0880043155.01.T08 AT3G16210 26.400 375 203 17 2 361 4 320 5.11e-15 76.3
MsG0880043155.01.T08 AT1G33530 23.988 321 194 10 3 316 97 374 1.54e-14 75.1
MsG0880043155.01.T08 AT4G38870 25.000 384 225 14 2 360 52 397 4.00e-12 67.8
MsG0880043155.01.T08 AT3G49980 22.840 324 201 14 3 309 5 296 1.15e-11 66.2
MsG0880043155.01.T08 AT3G49980 22.840 324 201 14 3 309 6 297 1.18e-11 66.2
MsG0880043155.01.T08 AT5G47300 24.324 333 180 17 3 310 46 331 2.03e-11 65.5
MsG0880043155.01.T08 AT2G27520 24.020 408 208 19 3 379 6 342 2.33e-11 65.1
MsG0880043155.01.T02 AT3G06240 23.642 313 170 12 16 296 146 421 9.64e-11 62.4

Find 91 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 109 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTCAAGAAAGTTAGAATTTC+CGG 0.165884 8:-19842346 MsG0880043155.01.T10:CDS
ATAATTATTGGTTTCGTATA+TGG 0.175253 8:-19843155 MsG0880043155.01.T10:CDS
ATAAGGGGTATCATAATTAT+TGG 0.212896 8:-19843167 MsG0880043155.01.T10:CDS
AGAAAACTCAATTTGTTATA+TGG 0.214740 8:-19842567 MsG0880043155.01.T10:CDS
GCCAACCCTTCAAGTTCTTT+TGG 0.225909 8:-19842617 MsG0880043155.01.T10:CDS
AATCCGTCCATAACTGTTTC+TGG 0.254055 8:-19843273 MsG0880043155.01.T10:CDS
CTGAGACATACATGCAATTA+TGG 0.268409 8:-19842675 MsG0880043155.01.T10:CDS
AAAGTTTGATTTCAACTAAT+TGG 0.276747 8:-19842294 MsG0880043155.01.T10:CDS
ATTTGAGTGGCACTATTTAC+TGG 0.302466 8:-19842789 MsG0880043155.01.T10:CDS
CTTATCTCTCCATTTAATAA+TGG 0.303357 8:-19842817 MsG0880043155.01.T10:CDS
AAATACACACCATTATTAAA+TGG 0.317249 8:+19842808 None:intergenic
ACATTGTCGATGTTCCTTCC+TGG 0.321524 8:-19843504 MsG0880043155.01.T03:CDS
TCAGATCTTGCTCCAGTGGC+AGG 0.333055 8:+19843129 None:intergenic
GGAGCAAGATCTGAAGCATT+TGG 0.333523 8:-19843120 MsG0880043155.01.T10:CDS
ATACGCCTATAAGCATAAAA+AGG 0.349893 8:+19842742 None:intergenic
GGTTGTTTGAAGTTCACTTT+TGG 0.353247 8:-19842991 MsG0880043155.01.T10:intron
GAAGGAACATCGACAATGTT+AGG 0.358386 8:+19843508 None:intergenic
AATGCATAACCTTCGAATTA+CGG 0.362312 8:-19842476 MsG0880043155.01.T10:CDS
AGTTTGGATGTCAAGAATCT+TGG 0.379586 8:-19842534 MsG0880043155.01.T10:CDS
CCATTGTACCTTTCTGAGAA+TGG 0.380124 8:-19842436 MsG0880043155.01.T10:CDS
ATATGGCAAATGAAAGAGTT+TGG 0.387827 8:-19842550 MsG0880043155.01.T10:CDS
TTTGGGATATATCATGACTA+TGG 0.391490 8:-19843102 MsG0880043155.01.T10:CDS
AATCAAACTTTCCACGTAAG+AGG 0.393369 8:+19842306 None:intergenic
AAAGCATAACAATCCGTTGC+AGG 0.403486 8:+19843206 None:intergenic
GCCTTCAGCTACGCGGTTTG+AGG 0.407859 8:-19843080 MsG0880043155.01.T10:intron
AACAAGTGACAGGGAGAGAT+TGG 0.420931 8:+19843304 None:intergenic
CACGCATTTGAGTCGGAGAA+TGG 0.422042 8:+19843440 None:intergenic
GAGCAAGATCTGAAGCATTT+GGG 0.423318 8:-19843119 MsG0880043155.01.T10:CDS
CATTGTCGATGTTCCTTCCT+GGG 0.424205 8:-19843503 MsG0880043155.01.T03:CDS
ATGCAATTATGGCTGCCTTC+TGG 0.426634 8:-19842664 MsG0880043155.01.T10:CDS
TCAGTTTGAGTGATGATTGT+TGG 0.429230 8:-19842870 MsG0880043155.01.T10:CDS
AACCGTAGGCGGTCTCTGTT+AGG 0.430976 8:-19843012 MsG0880043155.01.T10:intron
GGGGAACCGACATAGTTTGC+CGG 0.463814 8:+19842327 None:intergenic
GTCGTTCCAAAAGAACTTGA+AGG 0.480002 8:+19842611 None:intergenic
ATGTCTCAGTTGAAAGATCA+AGG 0.480620 8:+19842689 None:intergenic
CATACTCACACCACCATGTT+GGG 0.486817 8:-19843346 MsG0880043155.01.T08:CDS
TTCTCGAGTAAACAAGTGAC+AGG 0.488865 8:+19843294 None:intergenic
CGTATATGGAACCCTGCCAC+TGG 0.497906 8:-19843141 MsG0880043155.01.T10:CDS
AAGAAAACAAAGACGGTCCA+TGG 0.498027 8:-19842912 MsG0880043155.01.T10:CDS
GGAGAGATAAGAGGAATCAA+AGG 0.499938 8:+19842829 None:intergenic
TCCAAAAGAACTTGAAGGGT+TGG 0.501308 8:+19842616 None:intergenic
ATCAAACTTTCCACGTAAGA+GGG 0.502602 8:+19842307 None:intergenic
TGAAGGGTTGGCTGAGAGCA+TGG 0.505171 8:+19842628 None:intergenic
AAGTGGAACTTACAAGGTCG+TGG 0.506389 8:-19842956 MsG0880043155.01.T10:CDS
ACCTTGATATTAGCATATCA+TGG 0.513135 8:-19842409 MsG0880043155.01.T10:CDS
CAGATCTTGCTCCAGTGGCA+GGG 0.514177 8:+19843130 None:intergenic
TTATTAAATGGAGAGATAAG+AGG 0.525794 8:+19842820 None:intergenic
AGACGGTCCATGGAGAAGTC+AGG 0.538300 8:-19842902 MsG0880043155.01.T10:CDS
GTCGTGGAGTTTCGTGCCAA+AGG 0.545696 8:-19842940 MsG0880043155.01.T10:CDS
TGCTTCAGATCTTGCTCCAG+TGG 0.546137 8:+19843125 None:intergenic
TCCATGATATGCTAATATCA+AGG 0.547985 8:+19842408 None:intergenic
AGGTATCTCCATTCTCAGAA+AGG 0.555904 8:+19842428 None:intergenic
GAGATTGGACAGTCTGCATA+GGG 0.562334 8:+19843319 None:intergenic
ACCTCAAACCGCGTAGCTGA+AGG 0.565091 8:+19843079 None:intergenic
AAGGTTCTTAATTCCTGCAA+CGG 0.568129 8:-19843219 MsG0880043155.01.T10:CDS
GCTTGCTCACGCATTTGAGT+CGG 0.573248 8:+19843433 None:intergenic
TCGTTCCAAAAGAACTTGAA+GGG 0.573272 8:+19842612 None:intergenic
AATAATGGTGTGTATTTGAG+TGG 0.574137 8:-19842802 MsG0880043155.01.T10:CDS
TCATACTCACACCACCATGT+TGG 0.574694 8:-19843347 MsG0880043155.01.T08:CDS
GAGCATGAGGAAGAAGAAGA+AGG 0.577742 8:-19843547 MsG0880043155.01.T03:CDS
TGCAGTTGTCACCACCGTCG+TGG 0.578347 8:+19843241 None:intergenic
TCAAATGCGTGAGCAAGCAA+TGG 0.583387 8:-19843428 MsG0880043155.01.T08:CDS
AGAGATTGGACAGTCTGCAT+AGG 0.584028 8:+19843318 None:intergenic
GAAGGGTTGGCTGAGAGCAT+GGG 0.585061 8:+19842629 None:intergenic
GAATTTCCGGCAAACTATGT+CGG 0.590674 8:-19842333 MsG0880043155.01.T10:CDS
GCAGTTGTCACCACCGTCGT+GGG 0.594676 8:+19843242 None:intergenic
AAAGTCACCAGAAACAGTTA+TGG 0.597065 8:+19843266 None:intergenic
ATGGAAAATCCGTAATTCGA+AGG 0.600283 8:+19842467 None:intergenic
AGGTACAATGGCAACAACAA+TGG 0.602355 8:+19842448 None:intergenic
ATTCTGACCTGACTTCTCCA+TGG 0.606760 8:+19842895 None:intergenic
ATGTCGGTTCCCCTCTTACG+TGG 0.608754 8:-19842317 MsG0880043155.01.T10:CDS
ATTTGAGCGATAAGTTCCCC+AGG 0.609086 8:+19843486 None:intergenic
TGTCTCAGTTGAAAGATCAA+GGG 0.616669 8:+19842690 None:intergenic
AACCTAACAGAGACCGCCTA+CGG 0.628681 8:+19843010 None:intergenic
GAGCGATAAGTTCCCCAGGA+AGG 0.635853 8:+19843490 None:intergenic
CGACGGTGGTGACAACTGCA+AGG 0.636232 8:-19843238 MsG0880043155.01.T10:CDS
GGGACCTCATTAAAACCAGA+AGG 0.637859 8:+19842649 None:intergenic
ATTCCAAGTTGATGAGCATG+AGG 0.641336 8:-19843560 None:intergenic
CCATTCTCAGAAAGGTACAA+TGG 0.642261 8:+19842436 None:intergenic
GGAGATGAAGAAAACAAAGA+CGG 0.644305 8:-19842919 MsG0880043155.01.T10:CDS
ATTGTCGATGTTCCTTCCTG+GGG 0.647508 8:-19843502 MsG0880043155.01.T03:CDS
TCAAACTTTCCACGTAAGAG+GGG 0.649823 8:+19842308 None:intergenic
GACTATGGCCTTCAGCTACG+CGG 0.655408 8:-19843087 MsG0880043155.01.T10:intron
TGCATAGGGTATACCCAACA+TGG 0.662586 8:+19843333 None:intergenic
TCACCAGAAACAGTTATGGA+CGG 0.667261 8:+19843270 None:intergenic
GTTATCGTGACTATAACCGT+AGG 0.690965 8:-19843026 MsG0880043155.01.T10:intron
ATCGTGACTATAACCGTAGG+CGG 0.707419 8:-19843023 MsG0880043155.01.T10:intron
TCTCGAGTAAACAAGTGACA+GGG 0.744601 8:+19843295 None:intergenic
GGTGTGAGTATGAAGCGTGG+CGG 0.745687 8:+19843357 None:intergenic
GGTGGTGTGAGTATGAAGCG+TGG 0.775421 8:+19843354 None:intergenic
ATAGGGTATACCCAACATGG+TGG 0.809725 8:+19843336 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTTTTTGTTCTGATAATAA+GGG - Chr8:19842654-19842673 MsG0880043155.01.T10:CDS 15.0%
!!! TATTTTTTGTTCTGATAATA+AGG - Chr8:19842653-19842672 MsG0880043155.01.T10:CDS 15.0%
!! AAATACACACCATTATTAAA+TGG + Chr8:19843032-19843051 None:intergenic 20.0%
!!! AAAGTTTGATTTCAACTAAT+TGG - Chr8:19843543-19843562 MsG0880043155.01.T03:CDS 20.0%
!!! AGAAAACTCAATTTGTTATA+TGG - Chr8:19843270-19843289 MsG0880043155.01.T10:CDS 20.0%
!!! ATAATTATTGGTTTCGTATA+TGG - Chr8:19842682-19842701 MsG0880043155.01.T10:CDS 20.0%
!!! TTTATCCTTTTTATGCTTAT+AGG - Chr8:19843090-19843109 MsG0880043155.01.T10:intron 20.0%
!!! TTTTTTGTTCTGATAATAAG+GGG - Chr8:19842655-19842674 MsG0880043155.01.T10:CDS 20.0%
! CTTATCTCTCCATTTAATAA+TGG - Chr8:19843020-19843039 MsG0880043155.01.T10:intron 25.0%
! TTATTAAATGGAGAGATAAG+AGG + Chr8:19843020-19843039 None:intergenic 25.0%
!!! ATAAGGGGTATCATAATTAT+TGG - Chr8:19842670-19842689 MsG0880043155.01.T10:CDS 25.0%
AATAATGGTGTGTATTTGAG+TGG - Chr8:19843035-19843054 MsG0880043155.01.T10:intron 30.0%
AATGCATAACCTTCGAATTA+CGG - Chr8:19843361-19843380 MsG0880043155.01.T08:CDS 30.0%
ACCTTGATATTAGCATATCA+TGG - Chr8:19843428-19843447 MsG0880043155.01.T08:CDS 30.0%
ATACGCCTATAAGCATAAAA+AGG + Chr8:19843098-19843117 None:intergenic 30.0%
ATATGGCAAATGAAAGAGTT+TGG - Chr8:19843287-19843306 MsG0880043155.01.T10:CDS 30.0%
GTCAAGAAAGTTAGAATTTC+CGG - Chr8:19843491-19843510 MsG0880043155.01.T08:CDS 30.0%
TCCATGATATGCTAATATCA+AGG + Chr8:19843432-19843451 None:intergenic 30.0%
TCGTCCAAAAACAACTTAAA+AGG - Chr8:19842457-19842476 MsG0880043155.01.T10:CDS 30.0%
! TTTGGGATATATCATGACTA+TGG - Chr8:19842735-19842754 MsG0880043155.01.T10:CDS 30.0%
! TTTGGTTGTGACATTTTAAG+TGG - Chr8:19842864-19842883 MsG0880043155.01.T10:CDS 30.0%
!! CATTTTAAGTGGAACTTACA+AGG - Chr8:19842875-19842894 MsG0880043155.01.T10:CDS 30.0%
!! TTTGTTTTCTTCATCTCCTT+TGG + Chr8:19842916-19842935 None:intergenic 30.0%
!!! AATTTTGGTTCTGAAGCATT+TGG - Chr8:19842783-19842802 MsG0880043155.01.T10:CDS 30.0%
!!! ATTTTGGTTCTGAAGCATTT+GGG - Chr8:19842784-19842803 MsG0880043155.01.T10:CDS 30.0%
!!! TTTAAGTTGTTTTTGGACGA+AGG + Chr8:19842457-19842476 None:intergenic 30.0%
AAAGTCACCAGAAACAGTTA+TGG + Chr8:19842574-19842593 None:intergenic 35.0%
AAGGTTCTTAATTCCTGCAA+CGG - Chr8:19842618-19842637 MsG0880043155.01.T10:CDS 35.0%
AATCAAACTTTCCACGTAAG+AGG + Chr8:19843534-19843553 None:intergenic 35.0%
AGTTTGGATGTCAAGAATCT+TGG - Chr8:19843303-19843322 MsG0880043155.01.T10:CDS 35.0%
ATCAAACTTTCCACGTAAGA+GGG + Chr8:19843533-19843552 None:intergenic 35.0%
ATGGAAAATCCGTAATTCGA+AGG + Chr8:19843373-19843392 None:intergenic 35.0%
ATGTCTCAGTTGAAAGATCA+AGG + Chr8:19843151-19843170 None:intergenic 35.0%
ATTTGAGTGGCACTATTTAC+TGG - Chr8:19843048-19843067 MsG0880043155.01.T10:intron 35.0%
CTGAGACATACATGCAATTA+TGG - Chr8:19843162-19843181 MsG0880043155.01.T10:CDS 35.0%
GGAGATGAAGAAAACAAAGA+CGG - Chr8:19842918-19842937 MsG0880043155.01.T10:CDS 35.0%
TCAGTTTGAGTGATGATTGT+TGG - Chr8:19842967-19842986 MsG0880043155.01.T10:CDS 35.0%
TCGTTCCAAAAGAACTTGAA+GGG + Chr8:19843228-19843247 None:intergenic 35.0%
TGTCTCAGTTGAAAGATCAA+GGG + Chr8:19843150-19843169 None:intergenic 35.0%
!! GGTTGTTTGAAGTTCACTTT+TGG - Chr8:19842846-19842865 MsG0880043155.01.T10:CDS 35.0%
AAAGCATAACAATCCGTTGC+AGG + Chr8:19842634-19842653 None:intergenic 40.0%
AAGAAAACAAAGACGGTCCA+TGG - Chr8:19842925-19842944 MsG0880043155.01.T10:CDS 40.0%
AATCCGTCCATAACTGTTTC+TGG - Chr8:19842564-19842583 MsG0880043155.01.T10:CDS 40.0%
AGGTACAATGGCAACAACAA+TGG + Chr8:19843392-19843411 None:intergenic 40.0%
AGGTATCTCCATTCTCAGAA+AGG + Chr8:19843412-19843431 None:intergenic 40.0%
GAAGGAACATCGACAATGTT+AGG + Chr8:19842332-19842351 None:intergenic 40.0%
GAATTTCCGGCAAACTATGT+CGG - Chr8:19843504-19843523 MsG0880043155.01.T03:CDS 40.0%
GGAGAGATAAGAGGAATCAA+AGG + Chr8:19843011-19843030 None:intergenic 40.0%
GTCGTTCCAAAAGAACTTGA+AGG + Chr8:19843229-19843248 None:intergenic 40.0%
GTTATCGTGACTATAACCGT+AGG - Chr8:19842811-19842830 MsG0880043155.01.T10:CDS 40.0%
TCAAACTTTCCACGTAAGAG+GGG + Chr8:19843532-19843551 None:intergenic 40.0%
TCACCAGAAACAGTTATGGA+CGG + Chr8:19842570-19842589 None:intergenic 40.0%
TCCAAAAGAACTTGAAGGGT+TGG + Chr8:19843224-19843243 None:intergenic 40.0%
TCTCGAGTAAACAAGTGACA+GGG + Chr8:19842545-19842564 None:intergenic 40.0%
TTCTCGAGTAAACAAGTGAC+AGG + Chr8:19842546-19842565 None:intergenic 40.0%
! CCATTCTCAGAAAGGTACAA+TGG + Chr8:19843404-19843423 None:intergenic 40.0%
! CCATTGTACCTTTCTGAGAA+TGG - Chr8:19843401-19843420 MsG0880043155.01.T08:CDS 40.0%
! GAGCAAGATCTGAAGCATTT+GGG - Chr8:19842718-19842737 MsG0880043155.01.T10:CDS 40.0%
! TTTTCACGTCAAGGAGTGAT+AGG + Chr8:19842377-19842396 None:intergenic 40.0%
!!! AGTTGTTTTTGGACGAAGGT+CGG + Chr8:19842453-19842472 None:intergenic 40.0%
!!! GCGGCCTTTTAAGTTGTTTT+TGG + Chr8:19842464-19842483 None:intergenic 40.0%
AACAAGTGACAGGGAGAGAT+TGG + Chr8:19842536-19842555 None:intergenic 45.0%
AAGTGGAACTTACAAGGTCG+TGG - Chr8:19842881-19842900 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
ACATTGTCGATGTTCCTTCC+TGG - Chr8:19842333-19842352 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
AGAGATTGGACAGTCTGCAT+AGG + Chr8:19842522-19842541 None:intergenic 45.0%
ATAGGGTATACCCAACATGG+TGG + Chr8:19842504-19842523 None:intergenic 45.0%
ATCGTGACTATAACCGTAGG+CGG - Chr8:19842814-19842833 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
ATGCAATTATGGCTGCCTTC+TGG - Chr8:19843173-19843192 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
ATTCTGACCTGACTTCTCCA+TGG + Chr8:19842945-19842964 None:intergenic 45.0%
ATTGTCGATGTTCCTTCCTG+GGG - Chr8:19842335-19842354 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
ATTTGAGCGATAAGTTCCCC+AGG + Chr8:19842354-19842373 None:intergenic 45.0%
CATACTCACACCACCATGTT+GGG - Chr8:19842491-19842510 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
CATTGTCGATGTTCCTTCCT+GGG - Chr8:19842334-19842353 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
GAGATTGGACAGTCTGCATA+GGG + Chr8:19842521-19842540 None:intergenic 45.0%
GAGCATGAGGAAGAAGAAGA+AGG - Chr8:19842290-19842309 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
GGGACCTCATTAAAACCAGA+AGG + Chr8:19843191-19843210 None:intergenic 45.0%
TCAAATGCGTGAGCAAGCAA+TGG - Chr8:19842409-19842428 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
TCATACTCACACCACCATGT+TGG - Chr8:19842490-19842509 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
TGCATAGGGTATACCCAACA+TGG + Chr8:19842507-19842526 None:intergenic 45.0%
! GGAGAATGGTTTTCACGTCA+AGG + Chr8:19842386-19842405 None:intergenic 45.0%
! GGAGCAAGATCTGAAGCATT+TGG - Chr8:19842717-19842736 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
!! CGCGGTTTGAGGTTCAATTT+TGG - Chr8:19842768-19842787 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
!! GCCAACCCTTCAAGTTCTTT+TGG - Chr8:19843220-19843239 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
!!! GCTGCCTTCTGGTTTTAATG+AGG - Chr8:19843184-19843203 MsG0880043155.01.T10:CDS 45.0%
AACCTAACAGAGACCGCCTA+CGG + Chr8:19842830-19842849 None:intergenic 50.0%
CACGCATTTGAGTCGGAGAA+TGG + Chr8:19842400-19842419 None:intergenic 50.0%
GCTTGCTCACGCATTTGAGT+CGG + Chr8:19842407-19842426 None:intergenic 50.0%
TGCTTCAGATCTTGCTCCAG+TGG + Chr8:19842715-19842734 None:intergenic 50.0%
! TCTGGTGACTTTTCCCACGA+CGG - Chr8:19842582-19842601 MsG0880043155.01.T10:CDS 50.0%
AACCGTAGGCGGTCTCTGTT+AGG - Chr8:19842825-19842844 MsG0880043155.01.T10:CDS 55.0%
ACCTCAAACCGCGTAGCTGA+AGG + Chr8:19842761-19842780 None:intergenic 55.0%
AGACGGTCCATGGAGAAGTC+AGG - Chr8:19842935-19842954 MsG0880043155.01.T10:CDS 55.0%
CAGATCTTGCTCCAGTGGCA+GGG + Chr8:19842710-19842729 None:intergenic 55.0%
CGTATATGGAACCCTGCCAC+TGG - Chr8:19842696-19842715 MsG0880043155.01.T10:CDS 55.0%
GACTATGGCCTTCAGCTACG+CGG - Chr8:19842750-19842769 MsG0880043155.01.T10:CDS 55.0%
GAGCGATAAGTTCCCCAGGA+AGG + Chr8:19842350-19842369 None:intergenic 55.0%
GGTGGTGTGAGTATGAAGCG+TGG + Chr8:19842486-19842505 None:intergenic 55.0%
GGTGTGAGTATGAAGCGTGG+CGG + Chr8:19842483-19842502 None:intergenic 55.0%
GTCGTGGAGTTTCGTGCCAA+AGG - Chr8:19842897-19842916 MsG0880043155.01.T10:CDS 55.0%
TCAGATCTTGCTCCAGTGGC+AGG + Chr8:19842711-19842730 None:intergenic 55.0%
! GGGGAACCGACATAGTTTGC+CGG + Chr8:19843513-19843532 None:intergenic 55.0%
!! ATGTCGGTTCCCCTCTTACG+TGG - Chr8:19843520-19843539 MsG0880043155.01.T03:CDS 55.0%
!! GAAGGGTTGGCTGAGAGCAT+GGG + Chr8:19843211-19843230 None:intergenic 55.0%
!! TGAAGGGTTGGCTGAGAGCA+TGG + Chr8:19843212-19843231 None:intergenic 55.0%
CGACGGTGGTGACAACTGCA+AGG - Chr8:19842599-19842618 MsG0880043155.01.T10:CDS 60.0%
GCAGTTGTCACCACCGTCGT+GGG + Chr8:19842598-19842617 None:intergenic 60.0%
GCCTTCAGCTACGCGGTTTG+AGG - Chr8:19842757-19842776 MsG0880043155.01.T10:CDS 60.0%
TGCAGTTGTCACCACCGTCG+TGG + Chr8:19842599-19842618 None:intergenic 60.0%
! GGTGACTTTTCCCACGACGG+TGG - Chr8:19842585-19842604 MsG0880043155.01.T10:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 19842288 19843571 19842288 ID=MsG0880043155.01;Name=MsG0880043155.01
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