AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039601.01

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Find 65 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 487 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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ATTTGTGTGGCACTCTTAAT+TGG 0.312422 7:-66535953 MsG0780039601.01.T01:CDS
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TAAGTATAGGTGATAATGTT+TGG 0.347508 7:-66536050 None:intergenic
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CATTGACATTGACATTGGTT+TGG 0.373119 7:-66529705 MsG0780039601.01.T01:CDS
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GGTACCGATGCTTCTTTATG+AGG 0.380847 7:-66535583 MsG0780039601.01.T01:CDS
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CATCTGCCAAATAAGAAAAT+CGG 0.400642 7:+66535734 None:intergenic
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TGAGTTTGACAGTTGAAAGT+TGG 0.401695 7:-66529440 MsG0780039601.01.T01:CDS
ATGCCAATTGTTAATGTGTT+GGG 0.402032 7:-66535792 MsG0780039601.01.T01:CDS
TTAACAATTGGCATCATAGA+TGG 0.404197 7:+66535801 None:intergenic
CTTGGAAAGTTCTTGGATAC+AGG 0.407914 7:-66529147 MsG0780039601.01.T01:CDS
AATTAGGGGTTAAAGACTCT+TGG 0.436768 7:-66535707 MsG0780039601.01.T01:CDS
AGACAAGACATTGGAAGATT+GGG 0.439304 7:-66529287 MsG0780039601.01.T01:CDS
CTCCCCAACACATTAACAAT+TGG 0.459781 7:+66535789 None:intergenic
CATTGACATTGACATTGGCT+TGG 0.460894 7:-66529747 MsG0780039601.01.T01:CDS
CCTCTTCATTTCTACTTAGG+TGG 0.466608 7:-66535999 MsG0780039601.01.T01:CDS
GATTTGGGGACTGAGACATT+TGG 0.475019 7:-66535858 MsG0780039601.01.T01:CDS
AATTGAATTGAATTTGACAT+TGG 0.483586 7:-66529478 MsG0780039601.01.T01:CDS
ATTGACATTGACATTGGCTT+GGG 0.485006 7:-66529788 MsG0780039601.01.T01:CDS
CATTGACATTGACATTGGCT+TGG 0.489448 7:-66529789 MsG0780039601.01.T01:CDS
CTGTTGTTTCATTCGATTTG+GGG 0.490208 7:-66535872 MsG0780039601.01.T01:CDS
GTGTGGCACTCTTAATTGGT+TGG 0.499667 7:-66535949 MsG0780039601.01.T01:CDS
GGATACAGGTCGTCGTTGCT+AGG 0.501523 7:-66529133 None:intergenic
GAGGGCAATAAAACTTGTAA+AGG 0.501633 7:-66529177 MsG0780039601.01.T01:CDS
TAGAAATGAAGAGGAACAGC+GGG 0.516249 7:+66536008 None:intergenic
ACTTGTAAAGGAAATAGCCT+TGG 0.518107 7:-66529165 MsG0780039601.01.T01:CDS
ATTGACATTGATGTTGACAT+TGG 0.534140 7:-66529656 MsG0780039601.01.T01:CDS
CAACGACGGTCTCTCCAAAG+AGG 0.542969 7:+66529223 None:intergenic
GATGCCAATTGTTAATGTGT+TGG 0.547124 7:-66535793 MsG0780039601.01.T01:CDS
ATTGACATTGACATTGACAT+TGG 0.550317 7:-66529752 MsG0780039601.01.T01:CDS
CCACCTAAGTAGAAATGAAG+AGG 0.563358 7:+66535999 None:intergenic
ATTGACATTGACATTGACAT+TGG 0.564603 7:-66529710 MsG0780039601.01.T01:CDS
ACGTATCGAAACCATGGCTG+AGG 0.565289 7:-66529196 MsG0780039601.01.T01:CDS
CTGGTACTTAGAAGCAGTCA+AGG 0.579521 7:-66535549 MsG0780039601.01.T01:CDS
TTGGCAGATGAAGGAATTAG+GGG 0.580614 7:-66535721 MsG0780039601.01.T01:CDS
ATTGGCATTGACATTGACAT+TGG 0.589240 7:-66529794 MsG0780039601.01.T01:CDS
CATGAAGCTGTGTATTTGTG+TGG 0.595539 7:-66535966 MsG0780039601.01.T01:CDS
CTGTATCCAAGAACTTTCCA+AGG 0.600441 7:+66529148 None:intergenic
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CRISPR-GE

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TACCAACATCTATCAAGAAA+TGG - Chr7:66532197-66532216 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
TAGGATACTATAGTCGTTAT+GGG + Chr7:66531052-66531071 None:intergenic 30.0%
TGAACTCAGATTGTAAAATG+GGG - Chr7:66532009-66532028 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
TGGTAAAAAAGAACCAACAT+AGG + Chr7:66530714-66530733 None:intergenic 30.0%
TGTTGAAGATGAGAGAAAAA+TGG - Chr7:66533471-66533490 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
TTAAAGTGCAAGAAACAAAG+TGG - Chr7:66531771-66531790 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
TTAACAATTGGCATCATAGA+TGG + Chr7:66529371-66529390 None:intergenic 30.0%
TTAAGCCTAGAAATGAATAG+AGG + Chr7:66532784-66532803 None:intergenic 30.0%
TTCAATTTGTATTCCGTTAC+TGG + Chr7:66535220-66535239 None:intergenic 30.0%
TTCACTCTCAATTTACTCTT+GGG + Chr7:66535322-66535341 None:intergenic 30.0%
TTCCATTTCTTGATAGATGT+TGG + Chr7:66532202-66532221 None:intergenic 30.0%
TTGGAATTGAAATTGGAGAT+TGG - Chr7:66535551-66535570 MsG0780039601.01.T01:CDS 30.0%
TTGGAGATTGTCATTGAAAT+TGG - Chr7:66535532-66535551 MsG0780039601.01.T01:CDS 30.0%
TTGTAAAATGGGGATTAAAG+GGG - Chr7:66532019-66532038 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
TTGTGTTGGAATTGTTTGAA+TGG - Chr7:66533255-66533274 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
TTTAACAAGATACCCATTGA+GGG - Chr7:66535247-66535266 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
TTTCCACATCACCTATAAAT+AGG + Chr7:66533588-66533607 None:intergenic 30.0%
TTTGACATGAGATTGAAACA+AGG - Chr7:66534197-66534216 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! AAAAAACAGTTAAAAGGCAC+AGG - Chr7:66532412-66532431 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! AGGTATGTATATTGGTTGTT+CGG + Chr7:66532812-66532831 None:intergenic 30.0%
! ATTAACATTTGCACTGCTTT+TGG - Chr7:66534516-66534535 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! CCTATTTAAGTTTCTTTGTC+CGG - Chr7:66534444-66534463 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! GAAAATAGACATGACCATTT+TGG - Chr7:66535292-66535311 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! GAAAGTAAGTTCCTCTTTTA+TGG - Chr7:66529795-66529814 MsG0780039601.01.T01:CDS 30.0%
! GATTAAAATGAGTTGAATGC+AGG - Chr7:66534261-66534280 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! GGTCATGTCTATTTTCAAAT+CGG + Chr7:66535288-66535307 None:intergenic 30.0%
! GTCATGTCTATTTTCAAATC+GGG + Chr7:66535287-66535306 None:intergenic 30.0%
! TACGTTTGAACCTTTTAAAC+CGG - Chr7:66530931-66530950 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! TGAATTTTTATGCCCTATGT+TGG - Chr7:66530698-66530717 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
! TGTTTCTAAATTCCTACACA+AGG + Chr7:66530050-66530069 None:intergenic 30.0%
! TTTGGGTCTTTTAAATTGGT+TGG + Chr7:66534230-66534249 None:intergenic 30.0%
!! ACATTTTTGAGAGAGAACTA+CGG + Chr7:66531259-66531278 None:intergenic 30.0%
!! CATTTTCGCTATGTTTTTGT+GGG + Chr7:66531907-66531926 None:intergenic 30.0%
!! CTCTGTTTTATCTTGGTTTT+CGG - Chr7:66530893-66530912 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
!! GGATTTTGAAGAATAGAAAG+AGG - Chr7:66531314-66531333 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
!! TAAACAAAACTTGCTGTAAC+CGG + Chr7:66530618-66530637 None:intergenic 30.0%
!! TAAGATATCACCGGTTTAAA+AGG + Chr7:66530944-66530963 None:intergenic 30.0%
!! TCATTTTCGCTATGTTTTTG+TGG + Chr7:66531908-66531927 None:intergenic 30.0%
!! TCTGTTTTATCTTGGTTTTC+GGG - Chr7:66530894-66530913 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTCTTATTTGGCAGATGA+AGG - Chr7:66529439-66529458 MsG0780039601.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATCTCTTGTTTTGTATTCCT+TGG + Chr7:66534738-66534757 None:intergenic 30.0%
!!! CGGATTAACTTTTTTCCTTA+TGG - Chr7:66530157-66530176 MsG0780039601.01.T01:intron 30.0%
AAAAGACTAAAATGCCCCTA+GGG - Chr7:66533971-66533990 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AAATGACTAAAATGCCCCTA+GGG - Chr7:66534128-66534147 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AACTGTTCTTTGGATTGAAC+TGG - Chr7:66534885-66534904 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AAGAAACAAAGTGGAAATGG+AGG - Chr7:66531780-66531799 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AAGTAAGGTACAAAAGTCCT+AGG - Chr7:66531721-66531740 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AAGTTGAGTAGTGAAAATGG+TGG - Chr7:66533311-66533330 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AATTAGGGGTTAAAGACTCT+TGG - Chr7:66529462-66529481 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGTAAAGGAAATAGCCT+TGG - Chr7:66536004-66536023 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
AGACAAACAACTGAAGTCTA+TGG - Chr7:66534608-66534627 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AGACAAGACATTGGAAGATT+GGG - Chr7:66535882-66535901 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGCAGATGAAGGAATT+AGG - Chr7:66529446-66529465 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGTGTGGCACTCTTAAT+TGG - Chr7:66529216-66529235 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
CAAAAGAATCAAAGAACGAG+AGG + Chr7:66533149-66533168 None:intergenic 35.0%
CAATGACAATTTACCCTCAA+TGG + Chr7:66535263-66535282 None:intergenic 35.0%
CATACCCTAGATACATTCTA+TGG - Chr7:66531669-66531688 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
CATGAGATTTAGAAAAGGTG+AGG - Chr7:66531346-66531365 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
CATGATCAAGAATGACTCAA+TGG + Chr7:66530861-66530880 None:intergenic 35.0%
CCGGACAAAGAAACTTAAAT+AGG + Chr7:66534447-66534466 None:intergenic 35.0%
CGGAATACAAATTGAAAGTC+TGG - Chr7:66535224-66535243 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
GAACTCGTATGAAATTGTGT+TGG - Chr7:66533241-66533260 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
GAATGCTTGAAATGCATGAT+TGG - Chr7:66535827-66535846 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
GAGGGCAATAAAACTTGTAA+AGG - Chr7:66535992-66536011 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
GAGTGCATCAATGATTGATT+TGG - Chr7:66530534-66530553 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
GATGCCAATTGTTAATGTGT+TGG - Chr7:66529376-66529395 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
GCATGTTTAGATGTATGGTT+AGG + Chr7:66531567-66531586 None:intergenic 35.0%
GCTTCGAATTGACATTGAAT+TGG - Chr7:66535579-66535598 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
GTGATGAATACTAGTGGTTA+TGG - Chr7:66533288-66533307 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
GTTCCTCTTCATTTCTACTT+AGG - Chr7:66529167-66529186 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
GTTTAACAAGATACCCATTG+AGG - Chr7:66535246-66535265 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TAAGCTTTCAACGTAAACCT+TGG + Chr7:66529762-66529781 None:intergenic 35.0%
TAATTCTATACTGTGGTGCT+CGG - Chr7:66529736-66529755 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAAATACGAGATGGTGA+CGG - Chr7:66532942-66532961 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TCATGATATGTGATGTTGTG+AGG + Chr7:66532175-66532194 None:intergenic 35.0%
TGACCTATTTATAGGTGATG+TGG - Chr7:66533582-66533601 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TGAGTTTGACAGTTGAAAGT+TGG - Chr7:66535729-66535748 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
TGCAAGAAACAAAGTGGAAA+TGG - Chr7:66531777-66531796 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TGCCAATTGTTAATGTGTTG+GGG - Chr7:66529378-66529397 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TGCCTATATGTCTATGTTTC+CGG + Chr7:66534799-66534818 None:intergenic 35.0%
TGCTTATATACCTATGCTTC+CGG + Chr7:66535158-66535177 None:intergenic 35.0%
TGGAAGTTGAGTAGTGAAAA+TGG - Chr7:66533308-66533327 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TGGTGAAGAAAGTTAGTTAG+AGG - Chr7:66533447-66533466 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TTATGAGGATGATGATACAC+TGG - Chr7:66529601-66529620 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TTGTTTGAATGGATGAACGT+TGG - Chr7:66533266-66533285 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
TTTGGCAGATGAAGGAATTA+GGG - Chr7:66529447-66529466 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGGGTACAAGTTGTTCTT+TGG - Chr7:66534694-66534713 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
! AAATAGCCTTGGAAAGTTCT+TGG - Chr7:66536015-66536034 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
! AAATAGGTCAAAGTTGGTCA+AGG + Chr7:66533572-66533591 None:intergenic 35.0%
! AAGGGCATGAGATTTAGAAA+AGG - Chr7:66531341-66531360 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
! AAGGGTACAAGTTGTTCTTT+GGG - Chr7:66534695-66534714 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
! ATGCTTTGTTATCAGTCAGA+CGG + Chr7:66535090-66535109 None:intergenic 35.0%
! ATGGACATGGGTTAAGAAAA+GGG - Chr7:66532537-66532556 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
! CAGCTGTTATACCCTAATTT+TGG + Chr7:66534422-66534441 None:intergenic 35.0%
! CATTGACATTGACATTGGTT+TGG - Chr7:66535464-66535483 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
! GAATGAAATCCCTTGAGTTT+TGG + Chr7:66530734-66530753 None:intergenic 35.0%
! GTATCTAGGGTATGATGTAA+AGG + Chr7:66531663-66531682 None:intergenic 35.0%
! TATGGACATGGGTTAAGAAA+AGG - Chr7:66532536-66532555 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
! TCATCCTCATAAAGAAGCAT+CGG + Chr7:66529593-66529612 None:intergenic 35.0%
! TGAACCTTGCATTTTGTAGT+AGG + Chr7:66531948-66531967 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTATTCCTTGGTCAAG+TGG + Chr7:66534730-66534749 None:intergenic 35.0%
!! ATAGACATGACCATTTTGGT+TGG - Chr7:66535296-66535315 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
!! ATATCAAGGTTAAAGCACTG+AGG + Chr7:66530564-66530583 None:intergenic 35.0%
!! ATTGACATTGACATTGGCTT+GGG - Chr7:66535381-66535400 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
!! ATTGGCATTGACATTGACAT+TGG - Chr7:66535375-66535394 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
!! CTGTTGTTTCATTCGATTTG+GGG - Chr7:66529297-66529316 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
!! GAATCTGTTGGTTTAGATCT+AGG + Chr7:66532832-66532851 None:intergenic 35.0%
!! GCTGTTGTTTCATTCGATTT+GGG - Chr7:66529296-66529315 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
!! GGGAAACCGATTTTCTTATT+TGG - Chr7:66529429-66529448 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATAACATGAGTTTGTG+AGG - Chr7:66533072-66533091 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGATACAAGCTGTTTCTT+TGG - Chr7:66534936-66534955 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
!! TCTGTTGAGTTTGAGTTTTC+CGG - Chr7:66532670-66532689 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
!! TGCATGATTGGTTTGTAGTT+TGG - Chr7:66535839-66535858 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
!! TGCTGTTGTTTCATTCGATT+TGG - Chr7:66529295-66529314 MsG0780039601.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAGTCGTTTTAAGCCTCTA+GGG + Chr7:66533831-66533850 None:intergenic 35.0%
!! TTTAGTCGTTTTAAGCCTCT+AGG + Chr7:66533832-66533851 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTTTGCATCTGCTCCTAT+TGG - Chr7:66529954-66529973 MsG0780039601.01.T01:intron 35.0%
AAACTCAACAGAGAAGAAGG+AGG + Chr7:66532662-66532681 None:intergenic 40.0%
AAGAATAGAAAGAGGCCTCA+AGG - Chr7:66531322-66531341 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
AATGACTAAAATGCCCCTAG+GGG - Chr7:66534129-66534148 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
ACAAAGTGGAAATGGAGGAT+AGG - Chr7:66531785-66531804 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
ACCGATAACAAAGCATAAGC+TGG - Chr7:66535036-66535055 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
ACTGATAACAAAGCATGAGC+TGG - Chr7:66535094-66535113 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
ACTTGAACACGAGAAAGAGA+AGG + Chr7:66533001-66533020 None:intergenic 40.0%
AGAATAGAAAGAGGCCTCAA+GGG - Chr7:66531323-66531342 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
AGACGAAGTCTTAGAGTTGA+CGG - Chr7:66534476-66534495 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
AGAGGCCATAGAATGTATCT+AGG + Chr7:66531677-66531696 None:intergenic 40.0%
AGATTATCACCACGTCATGT+GGG - Chr7:66534974-66534993 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
AGCCTAGAAATGAATAGAGG+AGG + Chr7:66532781-66532800 None:intergenic 40.0%
ATAGGTGATGTGGAAATGCT+TGG - Chr7:66533592-66533611 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
ATCTTGCAAAGCAAGCAACT+AGG - Chr7:66532106-66532125 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
ATGATCACATGCGACAGAAA+AGG - Chr7:66532889-66532908 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
CAAAAATACGAGATGGTGAC+GGG - Chr7:66532943-66532962 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
CAACAAGCAAGATTAAGCTG+AGG + Chr7:66533181-66533200 None:intergenic 40.0%
CAGACAAGACATTGGAAGAT+TGG - Chr7:66535881-66535900 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
CATGAAGCTGTGTATTTGTG+TGG - Chr7:66529203-66529222 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
CCACCTAAGTAGAAATGAAG+AGG + Chr7:66529173-66529192 None:intergenic 40.0%
CCGATAACAAAGCATAAGCT+GGG - Chr7:66535037-66535056 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
CCTCTTCATTTCTACTTAGG+TGG - Chr7:66529170-66529189 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
CTCAAACTCAACAGAGAAGA+AGG + Chr7:66532665-66532684 None:intergenic 40.0%
CTCAGCTTAATCTTGCTTGT+TGG - Chr7:66533179-66533198 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
CTCCCCAACACATTAACAAT+TGG + Chr7:66529383-66529402 None:intergenic 40.0%
CTCCTCCTCTATTCATTTCT+AGG - Chr7:66532776-66532795 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
CTGATAACAAAGCATGAGCT+GGG - Chr7:66535095-66535114 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
CTGTATCCAAGAACTTTCCA+AGG + Chr7:66536024-66536043 None:intergenic 40.0%
CTTGGAAAGTTCTTGGATAC+AGG - Chr7:66536022-66536041 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
GAAAAGACTAAAATGCCCCT+AGG - Chr7:66533970-66533989 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GAAATGACTAAAATGCCCCT+AGG - Chr7:66534127-66534146 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GACAGACACAAACTGTTCTT+TGG - Chr7:66534875-66534894 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GACCGGAAACATAGACATAT+AGG - Chr7:66534794-66534813 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GAGATTTAGAAAAGGTGAGG+TGG - Chr7:66531349-66531368 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GAGGCCATAGAATGTATCTA+GGG + Chr7:66531676-66531695 None:intergenic 40.0%
GATAACATGAGTTTGTGAGG+AGG - Chr7:66533075-66533094 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GGATATGCAACATGTATGCA+CGG - Chr7:66535750-66535769 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
GGCAGATACAAGTTGTTCTT+TGG - Chr7:66534815-66534834 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GGCATTTCATCAAAATCACG+AGG + Chr7:66529350-66529369 None:intergenic 40.0%
GGGTATGATGTAAAGGACAA+TGG + Chr7:66531656-66531675 None:intergenic 40.0%
GGTATATAAGCAGGTACAAG+TGG - Chr7:66535166-66535185 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
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GTAGAAATGAAGAGGAACAG+CGG + Chr7:66529165-66529184 None:intergenic 40.0%
GTGAGATGCTTGAATCGATT+AGG - Chr7:66533038-66533057 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
GTGGATTTGATCCCTTAAAC+GGG + Chr7:66531237-66531256 None:intergenic 40.0%
TAGAAATGAAGAGGAACAGC+GGG + Chr7:66529164-66529183 None:intergenic 40.0%
TAGATTATCACCACGTCATG+TGG - Chr7:66534973-66534992 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
TAGCATCTCTGACATAGCAA+TGG + Chr7:66530279-66530298 None:intergenic 40.0%
TCGCAACAAAACACATGCTT+GGG - Chr7:66532376-66532395 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
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TTCGATACGTCTTTCAACGA+CGG + Chr7:66535963-66535982 None:intergenic 40.0%
TTCGCAACAAAACACATGCT+TGG - Chr7:66532375-66532394 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
TTCTAAATCTCATGCCCTTG+AGG + Chr7:66531340-66531359 None:intergenic 40.0%
TTGAGAGTAGAGACAACAGA+AGG - Chr7:66530348-66530367 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
TTGAGTAGTGAAAATGGTGG+TGG - Chr7:66533314-66533333 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
TTGGCAGATGAAGGAATTAG+GGG - Chr7:66529448-66529467 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
TTTAGTCAGTTTAGCCCCTA+GGG + Chr7:66534146-66534165 None:intergenic 40.0%
TTTGGATCGAACTTGACACT+TGG - Chr7:66534833-66534852 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
TTTGGATTGAACTGGCTGTT+TGG - Chr7:66534893-66534912 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! ACAGTTAAAAGGCACAGGAA+TGG - Chr7:66532417-66532436 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! AGTTAAAAGGCACAGGAATG+GGG - Chr7:66532419-66532438 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! ATGCTGCAACATTTTCACAG+GGG - Chr7:66535918-66535937 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
! CAGGTACAAGTGGTTCTTTT+CGG - Chr7:66535176-66535195 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! CAGTTAAAAGGCACAGGAAT+GGG - Chr7:66532418-66532437 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! CATGCTGCAACATTTTCACA+GGG - Chr7:66535917-66535936 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
! CATTGACATTGACATTGGCT+TGG - Chr7:66535380-66535399 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! CCCAGCTTATGCTTTGTTAT+CGG + Chr7:66535040-66535059 None:intergenic 40.0%
! CTCTTTCTCGTGTTCAAGTT+CGG - Chr7:66533002-66533021 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! GGAAGCATAGGTATATAAGC+AGG - Chr7:66535157-66535176 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! GGTGGATTTGATCCCTTAAA+CGG + Chr7:66531238-66531257 None:intergenic 40.0%
! GTGAGGATTTTTGCTACTGT+GGG + Chr7:66532158-66532177 None:intergenic 40.0%
! TCATGCTGCAACATTTTCAC+AGG - Chr7:66535916-66535935 MsG0780039601.01.T01:CDS 40.0%
! TGGAGGGAGAAGAAAGTTTT+TGG - Chr7:66531163-66531182 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
! TGTGAGGATTTTTGCTACTG+TGG + Chr7:66532159-66532178 None:intergenic 40.0%
! TTTTAGTCAGTTTAGCCCCT+AGG + Chr7:66534147-66534166 None:intergenic 40.0%
!! ACGTTGGTGATGAATACTAG+TGG - Chr7:66533282-66533301 MsG0780039601.01.T01:intron 40.0%
!! TAGTCGTTTTAAGCCTCTAG+GGG + Chr7:66533830-66533849 None:intergenic 40.0%
!! TTTTTGAGAGAGAACTACGG+TGG + Chr7:66531256-66531275 None:intergenic 40.0%
!!! AAACTTGCTGTAACCGGTTT+TGG + Chr7:66530612-66530631 None:intergenic 40.0%
AAACAGCCCCTGAATGAGTT+TGG + Chr7:66530828-66530847 None:intergenic 45.0%
AAACCACCGCAACAACCAAT+CGG + Chr7:66533101-66533120 None:intergenic 45.0%
AACACGAGAAAGAGAAGGAG+TGG + Chr7:66532996-66533015 None:intergenic 45.0%
AACCCATGTCCATAACCCAT+GGG + Chr7:66532530-66532549 None:intergenic 45.0%
AAGAAAAGAGAGATGGGCCT+AGG - Chr7:66532482-66532501 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
AATGACCAAAATGCCCCTAG+AGG - Chr7:66533814-66533833 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
ACAAACCAGGGGGTAGAAAA+AGG - Chr7:66534676-66534695 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
AGAAATGAAGAGGAACAGCG+GGG + Chr7:66529163-66529182 None:intergenic 45.0%
AGAGTAGAGACAACAGAAGG+AGG - Chr7:66530351-66530370 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
AGCAAAACCCTTGAGAATCG+AGG - Chr7:66530989-66531008 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
AGTAGAGACAACAGAAGGAG+GGG - Chr7:66530353-66530372 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
AGTGATGTGTGTGCATGTGT+CGG - Chr7:66531602-66531621 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
ATGCGTCCAAACTCATTCAG+GGG - Chr7:66530819-66530838 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
ATGGAACCTGTCATGTCACT+GGG - Chr7:66534627-66534646 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
CAAACCAGGGGGTAGAAAAA+GGG - Chr7:66534677-66534696 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
CACAAAGGCAGACAAGACAT+TGG - Chr7:66535873-66535892 MsG0780039601.01.T01:CDS 45.0%
CATCAAAATCACGAGGCAGT+CGG + Chr7:66529343-66529362 None:intergenic 45.0%
CATGTATGCACGGTATAGCA+AGG - Chr7:66535760-66535779 MsG0780039601.01.T01:CDS 45.0%
CGCAACAAAACACATGCTTG+GGG - Chr7:66532377-66532396 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
CTGGTACTTAGAAGCAGTCA+AGG - Chr7:66529620-66529639 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GACGAAGTCTTAGAGTTGAC+GGG - Chr7:66534477-66534496 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GAGTAGAGACAACAGAAGGA+GGG - Chr7:66530352-66530371 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GATGCGTCCAAACTCATTCA+GGG - Chr7:66530818-66530837 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GATTGAACTTGGCACTTGAC+CGG - Chr7:66534777-66534796 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
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GCAACAAAACACATGCTTGG+GGG - Chr7:66532378-66532397 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GCACGGTATAGCAAGGTTAT+TGG - Chr7:66535767-66535786 MsG0780039601.01.T01:CDS 45.0%
GCGCGCGTAGAAATTAAAGA+CGG + Chr7:66531081-66531100 None:intergenic 45.0%
GCTGTTCTTGGGATTGAACT+TGG - Chr7:66534766-66534785 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GGCTGGAGACATAGACAAAA+GGG - Chr7:66534914-66534933 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GTGCAGAATGCTACAAGCTT+TGG - Chr7:66530239-66530258 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GTGGAAATGCTTGGACCAAT+GGG - Chr7:66533601-66533620 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GTGGTGATTGAAGGTGGTTA+GGG - Chr7:66533353-66533372 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
GTGTGGCACTCTTAATTGGT+TGG - Chr7:66529220-66529239 MsG0780039601.01.T01:CDS 45.0%
TAACCCATGTCCATAACCCA+TGG + Chr7:66532531-66532550 None:intergenic 45.0%
TACTCTTGGGCCAACCAAAA+TGG + Chr7:66535309-66535328 None:intergenic 45.0%
TATGGAACCTGTCATGTCAC+TGG - Chr7:66534626-66534645 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
TCACAGGGGAAAAACCTCTT+TGG - Chr7:66535932-66535951 MsG0780039601.01.T01:CDS 45.0%
TGATGCGTCCAAACTCATTC+AGG - Chr7:66530817-66530836 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
TGGCTGGAGACATAGACAAA+AGG - Chr7:66534913-66534932 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
TGTGGAAATGCTTGGACCAA+TGG - Chr7:66533600-66533619 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
TTAGTCAGTTTAGCCCCTAG+GGG + Chr7:66534145-66534164 None:intergenic 45.0%
TTGAAGGTGGTGATTGAAGG+TGG - Chr7:66533347-66533366 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
TTGACTGGGTAGACAAACCA+GGG - Chr7:66534664-66534683 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
TTGCCTACGTACCCGTTTAA+GGG - Chr7:66531223-66531242 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
TTGGCAGAGAAGCTTCACAA+AGG - Chr7:66535858-66535877 MsG0780039601.01.T01:CDS 45.0%
! AACCCATGGGTTATGGACAT+GGG - Chr7:66532525-66532544 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! AGGCGCTGTTCTGTTAACAT+GGG + Chr7:66532642-66532661 None:intergenic 45.0%
! CAGAATGCTACAAGCTTTGG+CGG - Chr7:66530242-66530261 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! GATCGAACTTGTCGTTTGTC+CGG - Chr7:66535136-66535155 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! GCGAGCACTCTGTTTTATCT+TGG - Chr7:66530886-66530905 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! GTTAAAAGGCACAGGAATGG+GGG - Chr7:66532420-66532439 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! TGGTGGTTTGTGGTGATTGA+AGG - Chr7:66533331-66533350 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! TGGTTTGTGGTGATTGAAGG+TGG - Chr7:66533334-66533353 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! TTAAAAGGCACAGGAATGGG+GGG - Chr7:66532421-66532440 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
! TTCGAGTCAGTTTTGCCCTA+GGG + Chr7:66533989-66534008 None:intergenic 45.0%
!! GAGGTGGTTAGAGTTTGTTG+TGG - Chr7:66533415-66533434 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
!! GGTACCGATGCTTCTTTATG+AGG - Chr7:66529586-66529605 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
!! GTGAAAATGGTGGTGGTTTG+TGG - Chr7:66533321-66533340 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
!! GTGGTTAGAGTTTGTTGTGG+TGG - Chr7:66533418-66533437 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
!! GTTAGAGTTTGTTGTGGTGG+AGG - Chr7:66533421-66533440 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
!! TGAGTTTGAGTTTTCCGGCA+CGG - Chr7:66532675-66532694 MsG0780039601.01.T01:intron 45.0%
!! TTTCGAGTCAGTTTTGCCCT+AGG + Chr7:66533990-66534009 None:intergenic 45.0%
!!! AGTTTTATTGCCCTCAGCCA+TGG + Chr7:66535987-66536006 None:intergenic 45.0%
!!! TTAAGCCTCTAGGGGCATTT+TGG + Chr7:66533822-66533841 None:intergenic 45.0%
!!! ATAATTAAAAAAAGATTTTT+TGG - Chr7:66533502-66533521 MsG0780039601.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTAAAAATTTTAAAAAC+CGG - Chr7:66530666-66530685 MsG0780039601.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTAAAATTTTTAAAAAC+AGG + Chr7:66530665-66530684 None:intergenic 5.0%
AACCCTTGAGAATCGAGGTC+CGG - Chr7:66530994-66531013 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
AAGGTGGTTAGGGTGGTTGA+AGG - Chr7:66533363-66533382 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
ACCAATGGGAGTAGGACATG+TGG - Chr7:66533615-66533634 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
ACCTGGCACTTGACCAGTAA+CGG - Chr7:66535204-66535223 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
ACGTATCGAAACCATGGCTG+AGG - Chr7:66535973-66535992 MsG0780039601.01.T01:CDS 50.0%
AGAGAGATGGGCCTAGGTTA+TGG - Chr7:66532488-66532507 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
AGATGGGTGCAAGCTGTTCT+TGG - Chr7:66534754-66534773 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
ATGCTTGGACCAATGGGAGT+AGG - Chr7:66533607-66533626 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
ATGGGCCTAGGTTATGGGTA+TGG - Chr7:66532494-66532513 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
CCTAGGTTATGGGTATGGAG+CGG - Chr7:66532499-66532518 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
CGAGTTCACTCTCATGTTGC+TGG + Chr7:66533228-66533247 None:intergenic 50.0%
CGTATCGAAACCATGGCTGA+GGG - Chr7:66535974-66535993 MsG0780039601.01.T01:CDS 50.0%
CTTAAACGGGTACGTAGGCA+AGG + Chr7:66531224-66531243 None:intergenic 50.0%
CTTGCCTACGTACCCGTTTA+AGG - Chr7:66531222-66531241 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
GAAATGAAGAGGAACAGCGG+GGG + Chr7:66529162-66529181 None:intergenic 50.0%
GACTTCGTCTCTTGACTCTC+CGG + Chr7:66534466-66534485 None:intergenic 50.0%
GAGAGATGGGCCTAGGTTAT+GGG - Chr7:66532489-66532508 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
GATCCCTTAAACGGGTACGT+AGG + Chr7:66531229-66531248 None:intergenic 50.0%
GATGGGTGCAAGCTGTTCTT+GGG - Chr7:66534755-66534774 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
GATTGAACTGGCTGTTTGGC+TGG - Chr7:66534897-66534916 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
GGCGCTGTTCTGTTAACATG+GGG + Chr7:66532641-66532660 None:intergenic 50.0%
GGTGGTGATTGAAGGTGGTT+AGG - Chr7:66533352-66533371 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
GTAGAGACAACAGAAGGAGG+GGG - Chr7:66530354-66530373 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
GTGATTGAAGGTGGTTAGGG+TGG - Chr7:66533356-66533375 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
GTTGACTGGGTAGACAAACC+AGG - Chr7:66534663-66534682 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
TATCACCACGTCATGTGGGA+AGG - Chr7:66534978-66534997 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
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TCGAACTAGCCACTTGACCA+AGG - Chr7:66534718-66534737 MsG0780039601.01.T01:intron 50.0%
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! TGTACCCTTTTTCTACCCCC+TGG + Chr7:66534684-66534703 None:intergenic 50.0%
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!! GAGGCGCTGTTCTGTTAACA+TGG + Chr7:66532643-66532662 None:intergenic 50.0%
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CATGTCACTGGGGATTCAGG+TGG - Chr7:66534638-66534657 MsG0780039601.01.T01:intron 55.0%
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GACTGGGTAGACAAACCAGG+GGG - Chr7:66534666-66534685 MsG0780039601.01.T01:intron 55.0%
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!! CCGGGAGTTGTTTTCGCTAC+GGG - Chr7:66531013-66531032 MsG0780039601.01.T01:intron 55.0%
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Chromosome Type Strat End Strand Name
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Protein sequence

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