AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar zhongmu-4 / Msa0797620


Find 73 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 168 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
chr5_3 gene 9859408 9860652 9859408 ID=Msa0797620;Name=Msa0797620
chr5_3 mRNA 9859408 9860652 9859408 ID=Msa0797620-mRNA-1;Parent=Msa0797620;Name=Msa0797620-mRNA-1;_AED=0.00;_eAED=0.00;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|414
chr5_3 exon 9859408 9860652 9859408 ID=Msa0797620-mRNA-1:exon:4216;Parent=Msa0797620-mRNA-1
chr5_3 CDS 9859408 9860652 9859408 ID=Msa0797620-mRNA-1:cds;Parent=Msa0797620-mRNA-1
Gene Sequence

>Msa0797620

ATGGAACTGCAATTAGTTGAAAACGCTTTCGATTATGTCCGTAAAAGAAAGAAATGGACCTTAATCTTAGTTTCAATCGGGTTTAGCAGTTACGTTAGTTACCGTGCTTATCACGCACCATTCATAGCTCGAAAGAGAGAGAAAATTTCAAAGCTTCTGTGTTCTTTAGTTTCTGTAGCAGAAGCTGTTTCAGAATCTGCAGACACCATCGGTATTGTCACAAAAGATGTCAAGAATTTTTTGCAATCTGATTCTGATCAAGTTCCTAATAGTTTGAATCAAATTGCGAAATTATCGCGCTCGGAACAGTTTTCGGATTCTTTGGTTAGTGTGACACGTGCTGTGACTGTTGGAATTGTGAATGGTTATCAATCCATGAGCCAGGCTGATGAAAATCAATCCGATTCAAATGTTGCTGACAAGGTGTTTGATAAATTGTTTACACCGGCTGGTTCGGGATTTGCTTCTGTTGTTGTTGGAAGTTTTGCTAGGAATATTGTTCTTGGGTTTTATTCAGATGCTGGTGGTAAATGCAGTGGAGGGTTGGATTCGAGAAGTGGAGAATCGGGTTGTTCTGATTTGGATTCTGGTGTGCCGAAATGGGTTGATGTTGTTTGTAGTGATAAGTGTGGTGAGCTGATTGGGAATTTTGTTCAATTGTTTGTTAGTACATTGGTTGCAGTTTATCTTGATAAGACAATGCATATCAATACTTATGATGAATTCTTTTCTGGATTAACTAACCCGAAACATGAGACTAGGGTTAGAGAAATGTTGGTTGATGTTTGTAATGGCGCTATAGAGAGTCTTGTTAAAACGTCTCATGAGGTGTTTAATAGCTCGAACCCGAATGATAGTTCAGGTTCAGGTTCAGGTTCTTATTTTGATGCTGGAGAAACTCTAAGTTCTGTAGTGACATCGTGTATTGAATCAGAAAGAGATGTTTGTGATAAAGAGGATAAAGGTGGTTGGGTCAGCAAGGTTTCATCCACATTGGCTATTCCTAGTAATAGGAGACTTGTTCTTGATGTGACTGGGAGGGTCACATTTGAGACAGTTAGATCTTTCATGGAGTTTATTTTGCAAACGTTGTGTGGTTCTGTGAGAAGATGTGCTCACAATGTTCACGAGGAAGTGGTTGAGATTATGAGATATGCTGCAGCTAAATTCTCTGTTATTGTTGCAATATGTCTCGCGTTGTGCCTGCACATAATGGATTGCAATTGGGCTTTGGTGCCTGCTTAA

Protein sequence

>Msa0797620

MELQLVENAFDYVRKRKKWTLILVSIGFSSYVSYRAYHAPFIARKREKISKLLCSLVSVAEAVSESADTIGIVTKDVKNFLQSDSDQVPNSLNQIAKLSRSEQFSDSLVSVTRAVTVGIVNGYQSMSQADENQSDSNVADKVFDKLFTPAGSGFASVVVGSFARNIVLGFYSDAGGKCSGGLDSRSGESGCSDLDSGVPKWVDVVCSDKCGELIGNFVQLFVSTLVAVYLDKTMHINTYDEFFSGLTNPKHETRVREMLVDVCNGAIESLVKTSHEVFNSSNPNDSSGSGSGSYFDAGETLSSVVTSCIESERDVCDKEDKGGWVSKVSSTLAIPSNRRLVLDVTGRVTFETVRSFMEFILQTLCGSVRRCAHNVHEEVVEIMRYAAAKFSVIVAICLALCLHIMDCNWALVPA*